吳鐘解,唐 佳,蔡文啟,唐 凱,閆智聰,陳石泉,周 智
(1.海南大學(xué) 海洋學(xué)院 海南省水產(chǎn)種業(yè)工程研究中心 海口 570228;2.海南省海洋與漁業(yè)科學(xué)院 海洋生態(tài)研究所 ???571126)
抗生素在醫(yī)療以及農(nóng)業(yè)生產(chǎn)(如水產(chǎn)養(yǎng)殖)中已被廣泛應(yīng)用[1-3]。由于濫用抗生素及抗生素的處理不當(dāng)和去除效率低等原因,造成抗生素及其代謝物隨污水排放進(jìn)入河流、湖泊及海洋等水環(huán)境中。目前,從水環(huán)境中檢測到的抗生素濃度通常為每升水幾納克到幾百微克不等[4],環(huán)境中殘留的抗生素能夠誘導(dǎo)抗生素耐藥菌(Antibiotic Resistance Bacteria, ARB)和 抗 生 素 抗 性 基 因(Antibiotic Resistance Genes,ARGs)的產(chǎn)生[5]。目前在醫(yī)院廢水、養(yǎng)殖廢水、天然水體、空氣和土壤等環(huán)境中均已檢測到ARGs[6]。ARGs已成為一種新型環(huán)境污染物[7],具有傳播性和持久性的特點(diǎn)[8],對生物健康和生態(tài)環(huán)境產(chǎn)生不利影響[9]。例如,ARGs能夠通過水平基因轉(zhuǎn)移(Horizontal Gene Transfer,HGT)促使未接觸過抗生素的病原菌獲得一種或者多種耐藥性,這些具有耐藥性的病原菌可能導(dǎo)致人類疾病治療失效、治療周期延長和死亡 率 增 加[10-11]。 因 此 , 抗 生 素 耐 藥 性 (主 要 是ARB和ARG)已被世界衛(wèi)生組織納入21世紀(jì)以來嚴(yán)重威脅人類健康的挑戰(zhàn)之一[12],相關(guān)研究已發(fā)展成全球關(guān)注的熱點(diǎn)問題。
珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)是海洋生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,具有極高的初級生產(chǎn)力和生物多樣性,也因其較高的生態(tài)服務(wù)價(jià)值而備受關(guān)注,但全球氣候變化和人類活動已嚴(yán)重威脅到珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)的健康狀況[13-14],其中,抗生素也已成為珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)的潛在威脅因素之一。文獻(xiàn)[15-16]的研究結(jié)果表明,南海珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中存在多種類型的抗生素(磺胺類、四環(huán)素類、喹諾酮類、大環(huán)內(nèi)酯類、氯霉素類等)污染,總濃度最高可達(dá)441 ng·L-1。室內(nèi)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步揭示抗生素能擾亂珊瑚中微生態(tài)的平衡,對珊瑚的生長具有負(fù)面影響[17]。LIU等[16]也檢測到南海北部礁區(qū)海水中的ARGs(sul1、sul2、cfr、cmla、floR、qnrA,qnrD和qnrS)污染,總豐度為 2.11×104~8.00×106copies·L-1。由此可見,珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)已面臨ARGs污染的威脅。此外,人類食用的魚類中約10%產(chǎn)自珊瑚礁區(qū),珊瑚礁區(qū)的潛水觀光是濱海旅游區(qū)最受歡迎的項(xiàng)目之一,這些均能夠增加人類直接或間接感染ARGs的風(fēng)險(xiǎn)。綜上,查明珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中ARGs的賦存特征具有重大意義。
我國珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)屬于印度-太平洋區(qū)系,占全球珊瑚礁總面積的2.57%,主要分布在南海諸島和海南島周邊海域[18]。本研究選取海南島東海岸8個(gè)珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng),測定了礁區(qū)海水中磺胺類、喹諾酮類和氯霉素類共3類7種ARGs(sul1、sul2、qnrB、qnrS、cmlA1-01,cmlA1-02和cmx(A))的豐度和12種水質(zhì)參數(shù)(鹽度、5種營養(yǎng)鹽和7種金屬離子濃度),旨在闡明海南島東海岸珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中ARGs的賦存特征,以期揭示人類活動對海南島近岸生態(tài)系統(tǒng)中ARGs分布和傳播的影響,并為當(dāng)?shù)卣贫p少ARGs污染和保護(hù)珊瑚礁的對策提供理論依據(jù)。
1.1 樣品采集于 2019 年 10 月選擇海南島東海岸8個(gè)礁區(qū)(東郊、銅鼓嶺、長圮港、龍灣、加井島、分界洲、后海和鹿回頭)作為采樣站點(diǎn)(圖1),其中,銅鼓嶺、分界洲、加井島、后海和鹿回頭是著名的旅游景點(diǎn);加井島和分界洲遠(yuǎn)離海岸,受陸地污染較?。婚L圮港和東郊靠近河流匯集地,易受到生活污水與農(nóng)業(yè)廢水等陸源污染物影響,在長圮港附近還分布著大片養(yǎng)殖高位池[19-20]。
圖1 采樣站點(diǎn)
在每個(gè)采樣站點(diǎn)選擇3個(gè)不同深度(分別為3、6和9 m),采用有機(jī)玻璃采水器(北京普力特儀器有限公司,中國)采集2 L底層海水。立即用0.2 μm 聚碳酸酯膜(Merck Millipore公司,美國)過濾1 L海水,然后將濾膜置于凍存管中并置于干冰中保存,待用于后續(xù)的DNA提取和ARGs定量。剩余1 L海水的固定和運(yùn)輸方法具體參照《海洋監(jiān)測規(guī)范》(GB 17378.4—2007)[21]。
1.2 海水水質(zhì)的檢測本實(shí)驗(yàn)中檢測的海水水質(zhì)指標(biāo)包括:鹽度、NH3--N、NO2--N、NO3--N、PO43--P、Hg、As、Cu、Pb、Zn,Cd 和 Cr。上述指標(biāo)的測定按照《海洋監(jiān)測規(guī)范》(GB 17378.4—2007)和《海洋監(jiān)測技術(shù)規(guī)程》(HY/T 147.1—2013)開展[21-22],各檢測指標(biāo)的分析方法詳見表1。
1.3 海水 ARGs 豐度的測定在超凈工作臺中將濾膜剪碎后,采用 DNA Clean & Concentrator試劑盒(Zymo Research,美國)提取濾膜上的海水總DNA[23],接著采用Nanodrop微量紫外分光光度計(jì)(Maestrogen,中國)和瓊脂糖凝膠電泳法測定海水總DNA的濃度、純度及完整性,將檢測合格的DNA樣品置于-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.1 構(gòu)建含有 ARGs片段的質(zhì)粒擴(kuò)增 ARGs片段,擴(kuò)增體系:2.5 μL 10×PCR Buffer(Mg2+plus),2 μL dNTP(2.5 mmol·L-1), 1 μL 正 向 引 物 (10 μmol·L-1),1 μL 反向引物(10 μmol·L-1),1 μL DNA模板(所有海水總 DNA 的混合液),0.15 μL rTaq,17.35 μL DEPC 水;擴(kuò)增條件:94 ℃ 5 min,35 個(gè)循環(huán)(94 ℃ 30 s、退火溫度 30 s、72 ℃ 1 min),72 ℃10 min,最后 4 ℃ 儲存;ARGs的引物序列及其退火溫度參考LU等[24]的研究,具體參數(shù)如表2所示。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,采用SanPrep柱式DNA膠回收試劑盒(生工生物工程有限公司,中國)進(jìn)行目的片段的回收純化。將目的片段連接到pMD19-T載體[寶生物工程(大連)有限公司,中國]中并轉(zhuǎn)化至Trans5α感受態(tài)細(xì)胞(全式金生物技術(shù)有限公司,中國)。每種轉(zhuǎn)化中挑選至少3個(gè)單克隆菌落經(jīng)PCR鑒定并測序驗(yàn)證。選擇驗(yàn)證正確的陽性單克隆菌液過夜培養(yǎng),按照SanPrep柱式DNA小量抽提試劑盒(生工生物工程有限公司,中國)說明書提取含有ARGs片段的質(zhì)粒。采用Nanodrop微量紫外分光光度計(jì)測定提取質(zhì)粒的濃度,并根據(jù)以下公式計(jì)算ARGs的拷貝數(shù)[25]。
表 1 海水樣品檢測項(xiàng)目分析方法
表 2 引物序列及 PCR 反應(yīng)條件
式中,C代表質(zhì)粒濃度(ng·μL-1);M=(載體片段堿基對+目的基因堿基對)×660,本研究所用pMD19-T 載體的長度為 2 692 bp。
1.3.2 檢測 ARGs的拷貝數(shù)采用 SYBR Green熒光定量PCR方法[16]檢測海水DNA中3類7種ARGs的拷貝數(shù),包括磺胺類(sul1,sul2)、喹諾酮類(qnrB,qnrS)和氯霉素類 [cmlA1-01,cmlA1-02和cmx(A)]的 ARGs[12,24]。使用經(jīng)準(zhǔn)確定量濃度的質(zhì)粒制備含梯度濃度 ARGs(108~103copies·μL-1)的標(biāo)準(zhǔn)液DNA,最后采用熒光定量PCR儀(朗基Q2000B型,中國)定量標(biāo)準(zhǔn)液和海水DNA中的ARGs拷貝數(shù),同時(shí)為確保反應(yīng)無污染設(shè)定空白對照(以DEPC水代替DNA模板,NTC)。反應(yīng)體系和反應(yīng)條件參考廠家說明書進(jìn)行設(shè)置,反應(yīng)體系:10 μL TB Green Premix Ex Taq Ⅱ(Takara,日本 or寶生物工程(大連)有限公司,中國 ),0.8 μL 正向引物(10 μmol·L-1),0.8 μL 反向引物(10 μmol·L-1),2 μL DNA 模板(總量 < 100 ng),6.4 μL DEPC 水;反應(yīng)條件:95 ℃ 30 s,40 個(gè)循環(huán)(95 ℃ 30 s,退火溫度 30 s),溶解曲線的溫度從 60 ℃升高至95 ℃。待反應(yīng)完成后,通過儀器自帶的軟件判定引物擴(kuò)增特異性(溶解曲線呈現(xiàn)單峰)。根據(jù)Ct值(每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達(dá)設(shè)定的域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù),Ct值 < 33為陽性)與標(biāo)準(zhǔn)液DNA中ARGs拷貝數(shù)的對數(shù)值成反比線性關(guān)系,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(R2> 0.99),并計(jì)算待測海水 DNA 中的 ARGs拷貝數(shù)。
1.4 統(tǒng)計(jì)分析所有數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示,統(tǒng)計(jì)分析在 IBM SPSS Statistics 20 軟件中完成。采用Spearman相關(guān)性分析探索海水中ARGs的拷貝數(shù)和水質(zhì)參數(shù)間的相關(guān)性,以P< 0.05為差異。
2.1 水質(zhì)參數(shù)海水鹽度、營養(yǎng)鹽和金屬離子濃度見表3。各采樣地點(diǎn)海水中的平均Pb離子含量在 1.09~3.21 μg·L-1內(nèi),符合Ⅱ類水質(zhì)設(shè)置的范圍(1~5 μg·L-1)。此外,鹿回頭礁區(qū)海水中的平均Zn 離子濃度為 20.59 μg·L-1,其數(shù)值在Ⅱ類水質(zhì)規(guī)定的閾值范圍內(nèi)(20~50 μg·L-1)。在 8 個(gè)珊瑚礁礁區(qū)中,銅鼓嶺、分界洲島和加井島礁區(qū)的水質(zhì)優(yōu)于其他站點(diǎn),長圮港礁區(qū)中的營養(yǎng)鹽含量較高,而東郊、龍灣和鹿回頭礁區(qū)中部分金屬離子濃度較高。
表 3 不同珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中的水質(zhì)參數(shù)
2.2 海水中 ARGs 的豐度海南島東海岸珊瑚礁區(qū)海水中ARGs的豐度如圖2-A所示,在8個(gè)取樣站點(diǎn)均檢測到3類7種ARGs(sul1、sul2、qnrB、qnrS、cmlA1-01,cmlA1-02和cmx(A)),各站點(diǎn)ARGs的總拷貝數(shù)為 5.51×107~1.71×109copies·L-1。其中,長圮港具有最高的ARGs總拷貝數(shù)(1.71×109copies·L-1),分界洲次之(1.92×108copies·L-1),鹿回 頭 (5.74×107copies·L-1)和 加 井 島 (5.51×107copies·L-1)具有相對較低的 ARGs拷貝數(shù)。進(jìn)一步分析可知,sul2是所有取樣站點(diǎn)中占比最高的ARG,拷貝數(shù)范圍為 3.96×107~1.65×109copies·L-1,占各站點(diǎn)ARGs總拷貝數(shù)的68.99%~96.35%。cmx(A)的拷貝數(shù)在各站點(diǎn)中均為最低(2.08×105~3.48×106copies·L-1),低于各站點(diǎn) ARGs總拷貝數(shù)的 1.21%(圖2)。
圖2 海南島東海岸珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中抗生素抗性基因的分布特征
2.3 ARGs拷貝數(shù)和水質(zhì)參數(shù)的相關(guān)性礁區(qū)海水中3類7種ARGs的豐度和水質(zhì)指標(biāo)的相關(guān)性分析如圖3所示,sul1、cmlA1-01、cmlA1-02、qnrS和cmx(A)與鹽度均呈顯著(P< 0.05)負(fù)相關(guān)性,相關(guān)系數(shù)(ρ)分別為-0.50、-0.54、-0.47、-0.48和-0.59。cmlA1-01和qnrS與NO2--N 顯著(P< 0.05)正相關(guān),ρ分別為0.49和0.41。此外,磺胺類ARGsul1和銅離子濃度顯著正相關(guān)(ρ=0.41,P< 0.05),喹諾酮類ARGqnrB和鎘離子濃度顯著正相關(guān)(ρ=0.48,P< 0.05)。
圖3 礁區(qū)海水中抗性基因的豐度和水質(zhì)指標(biāo)間的相關(guān)性分析
ARGs對海洋生物健康和生態(tài)環(huán)境造成的負(fù)面影響不容小覷。然而,珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中ARGs污染的相關(guān)研究卻鮮有報(bào)道[16,26]。本研究調(diào)查了海南島東海岸8個(gè)岸礁生態(tài)系統(tǒng)中3類7種ARGs的分布,以及ARGs豐度與海水水質(zhì)指標(biāo)的聯(lián)系。
本研究發(fā)現(xiàn)磺胺類、喹諾酮類和氯霉素類的ARGs普遍存在于海南島東海岸珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)的海水中。與之類似,在海南東寨港、外伶仃島、廟灣島和大鵬灣區(qū)域的海水也檢測到上述類型的ARGs[16,27-28]。各研究中檢測的 ARGs 種類存在差異,因此很難比較ARGs的總拷貝數(shù)。在本研究中,長圮港中ARGs總拷貝數(shù)最高,分界洲次之,而鹿回頭和加井島較低。長圮港的高ARGs豐度可能與其所處區(qū)域現(xiàn)存的大量水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)密切相關(guān)。集約化養(yǎng)殖導(dǎo)致水產(chǎn)養(yǎng)殖疾病頻發(fā),促使抗生素使用增加[29-30],從而造成嚴(yán)重的 ARGs污染。加井島和分界洲島均離岸較遠(yuǎn),加井島屬于無人島,而分界洲島是著名的旅游景點(diǎn),分界洲島比加井島居住著更多的居民和游客,人類和動物醫(yī)學(xué)中使用的抗生素通過廢水排放到海水中造成ARGs污染[31]。導(dǎo)致兩島ARGs總拷貝數(shù)出現(xiàn)差異的主要原因可能是生活污水的排放量不同。鹿回頭的珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)位于國家級珊瑚礁保護(hù)區(qū)內(nèi),附近酒店和游客數(shù)目相對較少,這也許是其低的ARGs總拷貝數(shù)的原因。在本研究中,海南島東海岸珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中存在多種類型的ARGs污染,ARGs的分布可能和水產(chǎn)養(yǎng)殖和生活污水排放等人類活動密切相關(guān)。
sul2是海南島東海岸珊瑚礁海水中占比最高的 ARGs,最高豐度為 1.65×109copies·L-1,其最高豐度值與海南島東寨港海水中的sul2豐度(5.13×108copies·L-1)相近[27],低于長江下游水體中的 sul2豐度(3.30×108copies·mL-1)[32]。磺胺類抗生素已廣泛應(yīng)用于人類和動物醫(yī)學(xué),其理化特征(低螯合能力、低結(jié)合常數(shù)、高水溶性和穩(wěn)定性)導(dǎo)致在水環(huán)境中易產(chǎn)生相應(yīng)的ARB,進(jìn)而促使磺胺類ARGs成為水環(huán)境中的主導(dǎo)類型[33]。本研究中cmx(A)含量較低的原因可能是這些地區(qū)氯霉素抗生素的污染水平較低??傮w而言,珊瑚礁海區(qū)存在較高豐度的磺胺類ARGs,筆者推測長期高濃度的sul2污染可能會對珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)健康產(chǎn)生不利影響。
珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中的ARGs能夠通過食物鏈以及潛水活動等方式進(jìn)入人體,威脅人類健康[34]。因此,積極探索影響ARGs的豐度及其傳播的環(huán)境因子顯得尤為重要。在本研究中,Spearman相關(guān)性分析表明,大部分ARGs(包括sul1、cmlA1-01、cmlA1-02、qnrS和cmx(A))的豐度與海水鹽度顯著負(fù)相關(guān)。高鹽能夠抑制攜帶ARGs細(xì)菌的生長(通過影響細(xì)胞結(jié)構(gòu)和生理功能),進(jìn)而減少環(huán)境中ARGs的豐度[35]。同時(shí),低鹽度的礁區(qū)可能與生活污水或河流注入有關(guān),其中含有人類或動物醫(yī)學(xué)產(chǎn)生的抗生素可能誘導(dǎo)了高豐度的ARB和ARGs。BERGERON等[36]對沼澤樣品的研究表明,ARGs的豐度在低鹽條件下(6 PSU)多于在高鹽(12 PSU)條件下的。LIU 等[16]和阮孫蘭[25]的研究也表明部分ARGs的豐度和鹽度顯著負(fù)相關(guān)。室內(nèi)研究也表明高鹽能夠?qū)е滤w中ARGs豐度降低約50%[37]。此外,本研究揭示部分ARGs拷貝數(shù)與NO2--N,Cu和Cr離子濃度顯著正相關(guān)。ARGs豐度的變化可能和水體營養(yǎng)鹽成分的變化相關(guān),富營養(yǎng)化的水體有利于ARB的生長,進(jìn)而促進(jìn)ARGs的傳播[4]。然而,阮孫蘭[25]的研究表明亞硝酸鹽和大多數(shù)目標(biāo)抗性基因成負(fù)相關(guān),造成該差異的具體機(jī)理還需要進(jìn)一步研究。作為抗生素的替代品,金屬化合物(例如CuSO4)被廣泛應(yīng)用于飼料添加劑中,用以預(yù)防疾病和促進(jìn)生物生長[37]。目前,已有多項(xiàng)研究表明重金屬對于抗生素抗性基因的分布和傳播具有重要作用[38]。金屬化合物能夠在環(huán)境中普遍并持續(xù)存在,金屬抗性基因通常與ARGs位于同一可移動遺傳元件(Mobile Genetic Element,MGE)上,促使重金屬在 ARGs增殖和傳播中起關(guān)鍵作用[39]。HU等[40]的研究也表明Cu離子濃度增加能夠促使環(huán)境中形成高豐度的ARGs。WARDWELL等[41]研究表明,泥沼樣品中Hg含量不僅能夠增強(qiáng)細(xì)菌對Hg的抗性,也能夠增加細(xì)菌的多重抗藥性。綜上所述,多種環(huán)境壓力的共同選擇,尤其是鹽度、營養(yǎng)鹽和金屬離子濃度的選擇及其誘導(dǎo)的細(xì)菌群落變化是ARGs在礁區(qū)海水中傳播的主要驅(qū)動因素。污水處理廠可通過嚴(yán)格控制這些環(huán)境因子,來減少礁區(qū)中抗性基因的輸入量。
本研究結(jié)果表明,海南島東海岸珊瑚礁生態(tài)系統(tǒng)中存在ARGs污染,且水產(chǎn)養(yǎng)殖附近的礁區(qū)海水中ARGs污染程度最高。此外,ARGs的分布和海水鹽度、營養(yǎng)鹽和金屬離子濃度含量顯著相關(guān)。因此,通過調(diào)整環(huán)境中的鹽度、營養(yǎng)鹽和金屬離子濃度可影響礁區(qū)ARGs的傳播。