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        使用信噪比正則化LightGBM的腹部源胎兒心電信號提取方法

        2022-09-17 13:50:46蔡文濤蒲秀娟羅統(tǒng)軍
        電子學(xué)報 2022年8期
        關(guān)鍵詞:信號實驗評價

        韓 亮,蔡文濤,蒲秀娟,羅統(tǒng)軍,黃 謙

        (1.重慶大學(xué)微電子與通信工程學(xué)院,重慶 400044;2.生物感知與智能信息處理重慶市重點實驗室,重慶 400044)

        1 引言

        胎兒電子監(jiān)護能反映胎兒健康狀況,便于各類胎兒疾病的早期診斷與及時治療,從而降低圍產(chǎn)兒的發(fā)病率[1].目前在臨床中使用最多的胎兒電子監(jiān)護技術(shù)是胎心宮縮圖[2],但利用胎心宮縮圖難以獲取可靠的瞬時胎兒心率變異信息[3].胎兒心電信號(Fetal Electro-CardioGram,F(xiàn)ECG)能無創(chuàng)地對胎兒健康狀況進行長期連續(xù)監(jiān)護,并實時提供高精度的胎兒心率信息,具有廣闊應(yīng)用前景.

        非侵入式FECG 采集方法置電極于孕婦體表,能長期連續(xù)監(jiān)護胎兒健康狀況[4].但采用該方法從母體腹壁獲得的FECG 受到以母體心電(Maternal ElectroCardioGram,MECG)成分為主的各種干擾的污染[5].FECG和MECG 成分在時域和頻域都大部分重疊在一起,且MECG 成分的時域幅度和頻域能量均遠大于FECG,因此,如何從母體腹壁混合信號中有效抑制MECG 成分是一個巨大挑戰(zhàn).

        基于非侵入式采集方法的FECG 信號提取方法分為組合源方法和腹部源方法[6].組合源方法需置電極于母體胸部和腹部,主要包括自適應(yīng)濾波[7]、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)[8]、支持向量機[9]等.腹部源方法僅需置電極于母體腹部,便于臨床應(yīng)用,主要包括模版相減法[10]、卡爾曼濾波[11]、小波變換[12]、盲源分離[13]等.

        應(yīng)用于FECG 提取的機器學(xué)習(xí)方法通常使用均方誤差(Mean Squared Error,MSE)損失函數(shù)作為目標(biāo)函數(shù),將輸出信號與目標(biāo)信號差值作為FECG.但是,MSE損失函數(shù)僅表示輸出信號與目標(biāo)信號之間的均方誤差最小,并不意味著FECG 的質(zhì)量最好.LightGBM[14,15]是一種基于梯度提升決策樹的集成學(xué)習(xí)模型,常用于分類和回歸等機器學(xué)習(xí)任務(wù).Outram[16]將互相關(guān)分析用于估計FECG 的信噪比,其信噪比越高,說明FECG 質(zhì)量越好.為此,本文提出一種使用信噪比正則化Light-GBM 的FECG 提取方法.針對原始母體腹壁混合信號,先使用傳統(tǒng)濾波方法進行噪聲抑制;再使用FastICA 從中分離得到MECG 估計和FECG估計;構(gòu)建信噪比正則化LightGBM 模型并使用該模型估計殘留于FECG 估計中的MECG 成分,將其抑制后最終獲得高質(zhì)量的FECG.

        2 腹部源FECG提取基本原理

        2.1 FECG采集

        基于非侵入式采集方法的FECG 提取方法分為組合源方法和腹部源方法,如圖1所示.

        圖1 FECG采集示意圖

        其中,腹部源方法僅需采集母體腹壁混合信號,主要分為兩類:一類是模版相減法,針對心電信號在時域中的特點,利用母體腹壁混合信號的相關(guān)信息生成其中包含的MECG 成分模板,然后將其抑制;另一類是盲源分離法,該方法基于空間技術(shù),通過使用相關(guān)源信號的空間分布信息提取FECG.針對原始母體腹壁混合信號,運用這兩大類腹部源方法能夠提取FECG,但其中仍殘留有MECG成分等噪聲.

        2.2 FECG提取原理

        為從母體腹壁混合信號中提取高質(zhì)量的FECG,本文提出一種使用信噪比正則化LightGBM 的FECG 提取方法,如圖2所示.

        圖2 使用信噪比正則化LightGBM的FECG提取方法

        2.3 信噪比正則化LightGBM 模型

        LightGBM[14]是對梯度提升決策樹的高效實現(xiàn)框架,在不損失預(yù)測準(zhǔn)確率的前提下具有更快的訓(xùn)練速度、更高的效率和更低的內(nèi)存消耗.LightGBM 用于解決回歸問題,通常采用MSE 損失函數(shù)作為目標(biāo)函數(shù),其定義如下:

        其中,L(θ)表示損失函數(shù),xi表示輸入向量,yi表示相應(yīng)的目標(biāo)值,f(xi;θ)表示在輸入向量xi和網(wǎng)絡(luò)參數(shù)θ條件下的LightGBM網(wǎng)絡(luò)的輸出.

        由2.2 節(jié)的分析可知:MSE 損失函數(shù)不能直接表征提取得到的FECG 的質(zhì)量.為此,本文在傳統(tǒng)LightGBM模型的目標(biāo)函數(shù)中增加FECG 的信噪比作為正則項,構(gòu)建信噪比正則化LightGBM模型,其目標(biāo)函數(shù)優(yōu)化為

        其中,L(θ)為損失函數(shù),本文選擇MSE 損失函數(shù),其定義如式(6)所示;R(θ)為正則項,表示FECG 的信噪比,其定義如式(8),即

        其中,f(xi;θ)表示在輸入向量xi和網(wǎng)絡(luò)參數(shù)θ條件下的LightGBM 網(wǎng)絡(luò)的輸出,(yi-f(xi;θ))表示FECG 估計.λ為加權(quán)系數(shù),用于控制損失項和正則項的權(quán)重.

        根據(jù)式(7)和式(8),信噪比正則化LightGBM 模型優(yōu)化后的目標(biāo)函數(shù)為

        由于胎兒心電信號信噪比越高表示FECG 質(zhì)量越好,所以λ取負(fù)值.改進后的目標(biāo)函數(shù)的最小化同時反映了MECG成分的最優(yōu)估計和FECG的最佳質(zhì)量.

        2.4 FECG信噪比

        FECG信噪比的計算方法如下[18].

        步驟1使用傳統(tǒng)QRS檢測算法[19]確定FECG 的R峰位置.以R峰位置為基準(zhǔn)將FECG 分為等長的L段,每段均含有一個完整的QRS 波群.構(gòu)建一個K行L列的矩陣MK×L,其中,K為每段采樣點數(shù).

        步驟2基于互相關(guān)系數(shù)估計的信噪比如下:

        步驟3基于特征值分析估計的信噪比如下:

        其中,λi是矩陣MTM的特征值,λ1是矩陣MTM的最大特征值.

        SNRcor和SNRsvd越高,說明FECG 質(zhì)量越高.在高信噪比條件下,SNRcor和SNRsvd都具有很高的估計精度,但是,在低信噪比條件下,SNRcor的估計精度要明顯優(yōu)于SNRsvd,這是由于SNRcor估計方法不依賴信號成分的精確估計[16].因此,本文選擇SNRcor作為信噪比正則化LightGBM模型的正則項.

        3 FECG提取方法

        4 實驗結(jié)果與分析

        4.1 實驗數(shù)據(jù)

        本文使用PhysioNet 2013 挑戰(zhàn)賽[20]SET-A 中的7 組真實腹部源心電數(shù)據(jù)進行實驗,每組數(shù)據(jù)中包含4路腹壁混合信號,其采樣頻率為1 000 Hz,采集時間為1 min.在A15中截取一段長為2 000個采樣點(40~42 s)的數(shù)據(jù)繪制于圖3(縱坐標(biāo)表示相對幅度,橫坐標(biāo)表示采樣點).

        圖3 A15(40~42 s)預(yù)處理后數(shù)據(jù)

        在圖3 中,虛線框1~3 分別顯示了MECG 成分與FECG部分重疊、不重疊和完全重疊的情況.

        4.2 性能評價方法

        主觀評價通過觀察FECG 波形是否理想和MECG成分殘留情況來分析FECG提取方法的性能.

        客觀評價方法如下.

        (1)臨床評價指標(biāo)

        使用傳統(tǒng)QRS 檢測算法[19]確定提取得到的FECG的R 峰位置,并依據(jù)PhysioNet 2013 挑戰(zhàn)賽[20]SET-A 給定的FECG 的R 峰的標(biāo)準(zhǔn)位置,計算靈敏度(Se)、陽性預(yù)測值(PPV)和F1分?jǐn)?shù)[21,22]:

        其中,TP(True Positive)、FP(False Positive)和FN(False Negative)分別表示正確檢測的、錯誤檢測的和漏檢的FECG 的R 峰位置個數(shù).靈敏度(Se)、陽性預(yù)測值(PPV)和F1分?jǐn)?shù)的值越高,表示性能越好.

        (2)信噪比指標(biāo)

        采用如2.4 節(jié)所述SNRcor和SNRsvd評價提取得到的FECG質(zhì)量.

        4.3 本文方法的實驗結(jié)果與分析

        本文所有實驗采用的計算機CPU 為Intel Core i7-9700K,CPU主頻為3.60 GHz,內(nèi)存為32 GB,操作系統(tǒng)為Windows 10 專業(yè)版,編程工具為Python和Matlab R2019a,機器學(xué)習(xí)庫使用Scikit-Learn和Lightgbm3.3.0.

        采用第3 節(jié)所述的使用信噪比正則化LightGBM 的FECG 提取方法,對4.1 節(jié)所述真實腹部源心電數(shù)據(jù)進行實驗.首先對原始母體腹壁混合信號進行噪聲抑制,然后使用FastICA 分離得到MECG 估計(t)和FECG估計(t),參數(shù)設(shè)定為源數(shù)量n=4.選取A15第40~42 s的實驗結(jié)果繪制于圖4.

        由圖4 可知,信號經(jīng)FastICA 分解后輸出的獨立成分中,前兩個獨立成分為噪聲,第3 個獨立成分含有較好形態(tài)的MECG,選擇其作為MECG 估計(t),第4 個獨立成分含有較為明顯的FECG,選擇其作為FECG 估計(t).進一步仔細(xì)觀察圖4 中的第4 路信號,可以發(fā)現(xiàn)其中殘留了明顯的MECG 成分和其他噪聲,需要對其進行進一步抑制.

        圖4 A15(40~42 s)經(jīng)FastICA分解得到的獨立成分

        使用信噪比正則化LightGBM 模型進一步抑制FECG 估計(t)中殘留的MECG 成分.使用網(wǎng)格搜索法進行參數(shù)優(yōu)化后確定的模型參數(shù)見表1.選取A15第40~42 s的實驗結(jié)果繪制于圖5.

        圖5 A15(40~42 s)經(jīng)FastICA-信噪比正則化LightGBM提取的FECG

        表1 信噪比正則化LightGBM模型參數(shù)

        由圖5 可知,與FastICA 分離得到的FECG 估計(t)相比,在MECG 成分與FECG 成分部分重疊、不重疊和完全重疊(虛線框1~3)情況下,經(jīng)FastICA-信噪比正則化LightGBM 均能提取得到的清晰完整的FECG,且其中殘留的MECG成分明顯減少,F(xiàn)ECG質(zhì)量更高.

        采用4.2 節(jié)所述客觀評價方法對經(jīng)FastICA和經(jīng)FastICA-信噪比正則化LightGBM 提取得到的FECG 進行計算,結(jié)果分別見表2和表3.

        表2 使用FastICA的FECG提取方法的性能評價

        表3 使用FastICA-信噪比正則化LightGBM的FECG提取方法的性能評價

        由表2和表3 可知,使用FastICA 直接提取的FECG質(zhì)量較低,需進一步抑制其中殘留的MECG 成分和其他噪聲.與使用FastICA 的FECG 提取方法相比,使用FastICA-信噪比正則化LightGBM 提取得到的FECG 的各項性能指標(biāo)均有顯著提升,其中SNRcor平均提高了2.9 dB,SNRsvd平均提高了2.7 dB,PPV 平均提高了10.8%,F(xiàn)1分?jǐn)?shù)平均提高了6.7%,Se 在接近99%的情況下也平均提高了1.3%.這充分表明使用信噪比正則化LightGBM 模型能有效抑制殘留的MECG 成分和其他噪聲,提取高質(zhì)量的FECG.

        綜上所述,主觀和客觀性能評價都充分表明本論文提出的使用信噪比正則化LightGBM 的FECG 提取方法能夠從母體腹壁混合信號中提取得到完整清晰的FECG,且其質(zhì)量明顯高于使用FastICA直接提取的FECG.

        4.4 對比實驗結(jié)果與分析

        為進一步驗證本文提出的使用信噪比正則化LightGBM 的FECG 提取方法,使用4.1 節(jié)所述真實心電數(shù)據(jù)進行實驗,首先對原始母體腹壁混合信號進行噪聲抑制,然后分別進行如下對比實驗.

        實驗1:分別使用TFBSS,TFBSS-LightGBM和TFBSS-信噪比正則化LightGBM 提取FECG,選取A15第40~42 s的實驗結(jié)果繪制于圖6.

        圖6 A15(40~42 s)對比實驗1

        實驗2:分別使用RobustICA,RobustICA-LightGBM和RobustICA-信噪比正則化LightGBM 提取FECG,選取A15第40~42 s的實驗結(jié)果繪制于圖7.

        圖7 A15(40~42 s)對比實驗2

        實驗3:分別使用FastICA,F(xiàn)astICA-LightGBM和FastICA-信噪比正則化LightGBM 提取FECG,選取A15第40~42 s的實驗結(jié)果繪制于圖8.

        其中,TFBSS參數(shù)設(shè)定為n=4,Nf=256,Nt=256,tol=1256,RobustICA 的參數(shù)設(shè)定為prewhi=true,F(xiàn)astICA的參數(shù)設(shè)定為n=4;信噪比正則化LightGBM 的參數(shù)如表1 所示;除不含目標(biāo)函數(shù)加權(quán)系數(shù)λ這個參數(shù)外,傳統(tǒng)LightGBM 的其余參數(shù)與信噪比正則化LightGBM 的參數(shù)一致.

        由圖6~圖8可知:

        圖8 A15(40~42 s)對比實驗3

        (1)使用TFBSS,RobustICA和FastICA 直接提 取FECG,在MECG 成分和FECG 成分部分重疊(虛線框1)的情況下,TFBSS,RobustICA和FastICA 均未能有效抑制MECG成分;

        (2)采用傳統(tǒng)LightGBM 抑制MECG 成分后,在MECG 成分和FECG 成分部分重疊、不重疊和完全重疊(虛線框1~3)情況下,TFBSS-LightGBM,RobustICALightGBM和FastICA-LightGBM 均較為有效地抑制了MECG成分;

        (3)采用信噪比正則化LightGBM 抑制MECG 成分后,在MECG 成分和FECG 成分部分重疊、不重疊和完全重疊(虛線框1~3)情況下,TFBSS-信噪比正則化LightGBM、RobustICA-信噪比正則化LightGBM和FastICA-信噪比正則化LightGBM 均有效抑制了MECG 成分和部分噪聲,且其性能分別優(yōu)于TFBSS-LightGBM,RobustICA-LightGBM和FastICA-LightGBM,這表明信噪比正則化LightGBM 模型比傳統(tǒng)LightGBM 模型更適用于FECG提取.

        采用4.2 節(jié)所述臨床評價指標(biāo)和信噪比指標(biāo)計算方法分別對實驗1~3 提取得到的FECG 進行計算,對每種方法在7 組數(shù)據(jù)集上實驗結(jié)果的客觀性能評價指標(biāo)取平均值,如表4所示.

        由表4可知:

        表4 FECG提取方法性能對比(平均值)

        (1)使用TFBSS,RobustICA和FastICA 直接提取的FECG的客觀評價指標(biāo)均不太高,其質(zhì)量相對較低;

        (2)分別使用TFBSS-LightGBM,RobustICA-LightGBM和FastICA-LightGBM 三種方法提取的FECG,相對于使用TFBSS,RobustICA和FastICA直接提取的FECG,其客觀評價指標(biāo)有所提高,這說明盲源分離方法結(jié)合Light-GBM是有效的,其中,F(xiàn)astICA-LightGBM方法優(yōu)于TFBSS-LightGBM和RobustICA-LightGBM方法;

        (3)分別使用TFBSS-信噪比正則化LightGBM,RobustICA-信噪比正則化LightGBM和FastICA-信噪比正則化LightGBM三種方法提取的FECG,其客觀評價指標(biāo)明顯提高,這說明本論文提出的信噪比正則化LightGBM模型在性能上優(yōu)于傳統(tǒng)LightGBM模型,更適用于FECG提取,其中,F(xiàn)astICA-信噪比正則化LightGBM 提取的FECG 的客觀評價指標(biāo)最高,這說明FastICA-信噪比正則化LightGBM方法的性能優(yōu)于其他FECG提取方法.

        綜上所述,本文提出的使用信噪比正則化Light-GBM 的FECG 提取方法無論在主觀視覺評價還是在客觀性能指標(biāo)上都明顯優(yōu)于其他傳統(tǒng)的FECG提取方法.本文提出的信噪比正則化LightGBM 模型比傳統(tǒng)Light-GBM模型更適用于FECG提取,采用本文提出的信噪比正則化方法有效提高了FECG提取方法的性能.

        5 總結(jié)

        本論文提出一種使用信噪比正則化LightGBM 的FECG 提取方法.針對母體腹壁混合信號,首先使用傳統(tǒng)濾波方法進行噪聲抑制,然后使用FastICA 分離得到MECG 估計和FECG 估計,再使用信噪比正則化Light-GBM 模型擬合MECG 成分與MECG 之間的非線性變換,抑制FECG 估計中殘留的MECG 成分,得到高質(zhì)量的FECG.實驗結(jié)果表明,本文提出的使用信噪比正則化LightGBM 的FECG 提取方法是有效的,且無論在主觀視覺效果還是在臨床評價指標(biāo)和信噪比評價指標(biāo)上,均優(yōu)于基于盲源分離的FECG 提取方法,也優(yōu)于盲源分離結(jié)合傳統(tǒng)LightGBM 的FECG 提取方法.本文提出的FECG 提取方法能夠從母體腹壁混合信號中直接提取FECG,更便于臨床應(yīng)用.

        除LightGBM 模型外,還有大量的機器學(xué)習(xí)模型被廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)信號處理領(lǐng)域,因此,研究如何將本文提出的信噪比正則化方法與其他機器學(xué)習(xí)模型相結(jié)合,提取得到更高質(zhì)量的FECG是下一步研究方向.

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