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        YAP基因外顯子SNP與不明原因復(fù)發(fā)性流產(chǎn)的相關(guān)性

        2022-08-25 09:11:58李瑞英宋安娜孔俏俏
        關(guān)鍵詞:研究

        李 靜 程 蕾 李瑞英 宋安娜 孔俏俏 劉 濤

        1. 泰安市中心醫(yī)院生殖遺傳科,山東 泰安 271000;2. 山東大學(xué)附屬生殖醫(yī)院生殖實驗室,山東 濟南 250000

        復(fù)發(fā)性流產(chǎn)(recurrent spontaneous abortion,RSA)指的是妊娠20周前與同一性伴侶連續(xù)發(fā)生2次及2次以上的自然流產(chǎn)[1-2],可引起各種并發(fā)癥甚至不孕[3]。RSA的危險因素有很多,如遺傳、免疫、感染、解剖、內(nèi)分泌、環(huán)境及精神心理因素等,但仍有40%~60%的患者病因不明,歸為不明原因的復(fù)發(fā)性流產(chǎn)(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)[3-6]。

        YAP(Yes-associated protein)是Hippo 信號通路下游的主要效應(yīng)分子,Hippo 信號通路是參與胚胎正常發(fā)育、控制器官大小、維持干細(xì)胞全能性的信號傳導(dǎo)通路[6-9],推測YAP 可能與URSA 的發(fā)生相關(guān)。正常妊娠是由胚胎或胎兒與母體之間相互調(diào)節(jié)的結(jié)果,由多種因子介導(dǎo),如細(xì)胞因子、組織相容性抗原、激素和血管生成因子[10-12],這些因子的遺傳多態(tài)性可能與RSA 發(fā)生風(fēng)險有關(guān)。本研究通過Sanger 雙脫氧終止測序法,檢測URSA 患者與可孕婦女YAP基因的外顯子序列,旨在探討YAP基因外顯子基因多態(tài)性與URSA的關(guān)系。

        1 資料與方法

        1.1 研究對象

        選取2016年1月—2019年12月在泰安市中心醫(yī)院就診的72 例URSA 患者為URSA 組,年齡為19~40歲,平均(30.0±5.8)歲,妊娠20周前發(fā)生自然流產(chǎn)2 次以上,其中流產(chǎn)2、3、4、5、6、7 次的分別有19、28、14、6、1、1 例。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)夫婦雙方均為漢族人,既往體健,無家族遺傳病史;(2)女性為生育期婦女,常規(guī)行超聲、內(nèi)分泌、抗卵磷脂抗體、抗子宮內(nèi)膜抗體、染色體、傳染病檢査結(jié)果均正常,符合URSA 診斷標(biāo)準(zhǔn);(3)男性行精液常規(guī)、精液DNA碎片分析、傳染病檢查結(jié)果均正常。對照組為同期于泰安市中心醫(yī)院正常分娩的產(chǎn)婦,共20 例,年齡為20 ~40 歲,平均(28.0±3.2)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)夫婦雙方均為漢族人,既往體健,無家族遺傳病史;(2)女性為生育期婦女,成功分娩1 胎以上,無自然流產(chǎn)史,常規(guī)行超聲、內(nèi)分泌、抗卵磷脂抗體、抗子宮內(nèi)膜抗體、染色體、傳染病檢查結(jié)果均正常;(3)男性無傳染性疾病。研究對象均簽署知情同意書。本研究經(jīng)泰安市中心醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)。

        1.2 研究方法

        1.2.1 外周血和胎盤絨毛組織DNA抽提 使用核酸提取試劑[安諾優(yōu)達基因科技(北京)有限公司]提取外周血和絨毛組織樣本中的DNA,之后使用分光光度計定量,瓊脂糖凝膠電泳質(zhì)檢,質(zhì)檢合格的DNA調(diào)濃度至50 mg/L,-80 ℃儲存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 引物設(shè)計合成及PCR擴增 通過Genebank查找人YAP1 基因全外顯子區(qū)域序列,設(shè)計引物并合成備用,各引物序列詳見表1。PCR反應(yīng)體系:2×Phata Max Buffer 25 μL,dNTP Mix 1 μL,10 mmol/L dNTP Mix 1 μL,10 μmol/L 上下游引物各2 μL,50 mg/L DNA 1 μL,2.5 × 106U/L Taq DNA Polymerase 0.5 μL,用去離子三蒸水補齊至50 μL。PCR 反應(yīng)條件:預(yù)變性95 ℃3 min,94 ℃變性15 s,56 ℃退火15 s,72 ℃延伸60 s,35 個循環(huán)后72 ℃延伸5 min。反應(yīng)條件因引物、擴增片段長度不同,退火溫度及延伸時間等有差別。每對引物均要摸索最佳反應(yīng)條件。取PCR 產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳確定目的片段,PCR 產(chǎn)物純化備用,送樣品至安諾優(yōu)達基因科技(北京)有限公司進行雙脫氧終止測序。測序結(jié)果用DNAMAN軟件與標(biāo)準(zhǔn)序列進行比對,篩查與標(biāo)準(zhǔn)序列不一致的核苷酸位點,獲得SNP位點。

        表1 外顯子擴增引物序列

        2 結(jié) 果

        2.1 引物設(shè)計和PCR擴增

        Genebank 數(shù)據(jù)庫查到人類編碼YAP 蛋白的基因為YAP1,共有9 個外顯子區(qū),總共5 401 bp,分別設(shè)計9 對引物,擴增產(chǎn)物純化后用于測序,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,顯示所有引物均得到了有效目的片段(圖1)。

        圖1 不同外顯子PCR產(chǎn)物電泳圖

        2.2 SNP分析與確定

        所有測序結(jié)果用DNAMAN軟件與標(biāo)準(zhǔn)序列進行比對,URSA組72例和對照組20例中,外周血和絨毛組織YAP1基因的9個外顯子均未檢測到位點突變。

        圖2分別為URSA組和對照組第三外顯子測序結(jié)果的序列對比圖,由圖可知,條帶清晰明顯,各個峰型良好,沒有重疊峰,測序結(jié)果可靠,兩組測序得出的序列無差異,均與Genebank中標(biāo)準(zhǔn)序列一致。

        圖2 第三外顯子部分測序結(jié)果

        3 討論

        隨著生殖醫(yī)學(xué)的發(fā)展,URSA 受到越來越多的關(guān)注。研究表明,免疫系統(tǒng)功能異常[13]、胎盤血供異常[14]及精子異常因素[15]等是引起URSA 的重要因素,但對其發(fā)病機制尚未完全闡明。妊娠的成功離不開母胎間免疫平衡的存在和維持,決定妊娠成功與否的免疫學(xué)機制主要取決于胎盤滋養(yǎng)細(xì)胞與蛻膜層免疫微環(huán)境的相互作用,Th1/Th2平衡向Th1 偏移,Th17/Treg 平衡異常[16],蛻膜組織中CD56+、CD16+亞型表達升高[17]與URSA 的發(fā)生有一定相關(guān)性。研究發(fā)現(xiàn),相當(dāng)一部分URSA 的發(fā)生與胎盤中血管增生平衡紊亂、內(nèi)皮細(xì)胞增殖和胎兒血液供應(yīng)不足等密切相關(guān)[18]。VEGF 介導(dǎo)血管生成和調(diào)節(jié)內(nèi)皮細(xì)胞增殖,因此,子宮內(nèi)膜VEGF 及其受體基因表達的改變和血清VEGF 的變化可能在URSA 的發(fā)病中起重要作用[19]。一項Meta 分析研究表明,RSA 組男性的精子形態(tài)和DNA 碎片指數(shù)與RSA 相關(guān)[15,22]。

        Hippo-YAP信號通路中YAP/TAZ-TEAD介導(dǎo)的接觸抑制對胚胎發(fā)育至關(guān)重要,YAP/TAZ介導(dǎo)的細(xì)胞信號在血管生成[20-21]和內(nèi)穩(wěn)態(tài)[22-23]中發(fā)揮重要作用,YAP/TAZ 缺失會導(dǎo)致血管功能受損和胚胎死亡[24]。此外,YAP 缺失會阻礙小鼠心肌細(xì)胞的增殖,導(dǎo)致心肌發(fā)育不良和胚胎死亡[25]。研究發(fā)現(xiàn),YAP 全身性敲除的小鼠在胚胎發(fā)育第8.5 天死亡[9]。YAP 直接與許多干細(xì)胞相關(guān)基因的啟動子結(jié)合并促進其表達,YAP 敲除可導(dǎo)致胚胎干細(xì)胞多能性喪失[26]。Hippo/YAP 級聯(lián)信號在滋養(yǎng)層和內(nèi)細(xì)胞團細(xì)胞系特異性中起著關(guān)鍵作用,特別是對于滋養(yǎng)層細(xì)胞特異性基因表達,如Cdx2[27]。此外,本團隊證明人巨細(xì)胞病毒通過抑制YAP 的表達降低滋養(yǎng)細(xì)胞(EVTs)的侵襲和增殖(待發(fā)表),表明YAP 在滋養(yǎng)細(xì)胞侵襲和增殖中也發(fā)揮關(guān)鍵作用。以上研究證明了YAP 在胚胎發(fā)育中的關(guān)鍵性調(diào)控作用,YAP 可能與URSA 的發(fā)生存在聯(lián)系,因此,本研究從YAP 基因多態(tài)性入手,研究與其URSA 的相關(guān)性,旨在為URSA 提供一項新的潛在遺傳標(biāo)志物。

        目前基因多態(tài)性在URSA發(fā)病機制中的作用已被深入研究,涉及免疫應(yīng)答、血栓形成、胎盤功能以及性激素受體相關(guān)的基因[28]。免疫應(yīng)答相關(guān)基因TNF rs1800629的A等位基因和IL-6 rs1800795的C 等位基因與URSA發(fā)生有關(guān)[29-30]。血栓形成有關(guān)的基因多態(tài)性也參與RSA發(fā)生,包括PAI-1 rs1799889[31-32]以及MTHFR 的rs1801131 和rs1801133[28]。VEGFA、NOS3和Tp53 的某些遺傳變異都通過調(diào)節(jié)胎盤功能與RSA 顯 著 相 關(guān)[28]。CYP17 rs743542、CYP1A1 rs1048943 和CYP2D6 rs3892097 可 作為RSA 的 潛在生物標(biāo)志物,CYP17 可調(diào)控雄激素和雌激素水平[33],CYP1A1和CYPA2D6可以保護子宮胎盤環(huán)境免受過度氧化應(yīng)激的影響[34-35]。

        本研究對URSA 患者和可孕婦女YAP1 基因9 個外顯子進行SNP 篩查,并分析這些位點突變與URSA的相關(guān)性。通過對YAP基因全部9個外顯子進行測序比對后,URSA 組和對照組的外周血和絨毛組織YAP 基因的9 個外顯子均沒有檢測到位點突變,初步判斷YAP 基因外顯子突變與URSA 發(fā)生無直接關(guān)系。但是并不排除在基因外顯子以外的功能區(qū)存在變異位點并參與URSA發(fā)生,如啟動子、內(nèi)含子及UTR等。一項Meta分析發(fā)現(xiàn),ACE基因第16 內(nèi)含子的插入或缺失突變與RSA 有關(guān)[36],NOS3基因第4 內(nèi)含子的27 bp VNTR 多態(tài)性與RSA 的相關(guān)性成為研究熱點[28]。另外,樣本量小或者研究人群的差異也可能造成目前的結(jié)果。研究表明,針對不同人群進行的基因多態(tài)性研究結(jié)果通常不一致[28]。此外,URSA與YAP基因在分子及蛋白水平的相關(guān)性研究也在進行中,相信分子和蛋白水平的研究將取得非常有效的結(jié)果。為更好的了解URSA的致病機制,未來還需要探討YAP基因其他非外顯子功能區(qū)SNP以及分子和蛋白水平與URSA發(fā)生的關(guān)系。

        利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

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