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        Rab20在結(jié)直腸癌中高表達(dá)并調(diào)控結(jié)直腸腫瘤細(xì)胞的增殖與干性*

        2022-08-15 01:43:02張國飛胡大遷覃吉超李陽坤
        關(guān)鍵詞:分析

        張國飛,胡大遷,覃吉超,李陽坤

        華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬同濟(jì)醫(yī)院胃腸外科,武漢 430030

        結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是人類消化系統(tǒng)常見的惡性腫瘤之一,而且發(fā)病率呈上升趨勢[1-2]。盡管結(jié)直腸癌的早期診斷與聯(lián)合治療取得一定的進(jìn)展,但其預(yù)后仍不理想[3]。因此深入探究結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制,對治療結(jié)直腸癌有極大幫助。Ras信號通路失調(diào)是癌癥常見表現(xiàn)[4],Rab20蛋白是Ras蛋白家族(Ras,Rho/Rac/Cdc42,Ran,Sar/Arf,Rab)的成員之一,調(diào)控細(xì)胞物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn),參與胞吞胞吐、核內(nèi)體形成、囊泡的形成和運(yùn)輸?shù)冗^程[5-7],并在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起重要作用[8-9],然而目前Rab20在結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用尚不清楚。本研究分析了Rab20在結(jié)直腸腫瘤組織及正常組織的表達(dá),探討Rab20對結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖及干性的影響,并進(jìn)一步揭示可能的調(diào)控機(jī)制。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        人結(jié)直腸癌細(xì)胞SW620細(xì)胞系購自中國科學(xué)院細(xì)胞庫,人正常結(jié)直腸上皮細(xì)胞由正常結(jié)直腸原代組織分離,XhCRC細(xì)胞由人結(jié)直腸癌移植瘤模型分離[10]。DMEM、DMEM/F12細(xì)胞培養(yǎng)液、胎牛血清(FBS)、細(xì)胞因子B27、牛血清蛋白(BSA)、人重組表皮生長因子(hEGF)購自美國Gibco公司,外源Wnt3a蛋白、CCK-8試劑購自美國MCE公司,psPAX2、pMD2G、pLKO.1-NC和pLKO.1-shRab20質(zhì)粒購自武漢奧科生物有限公司;ts045-VSVG-EGFP質(zhì)粒購自美國Addgene生物有限公司,Western blot試劑購自上海碧云天公司,BCA試劑盒及Turbofect轉(zhuǎn)染試劑購自美國Thermo Fisher公司,抗體β-actin、GAPDH、Rab20購自武漢ABclonal生物有限公司,抗體β-catenin、Cyclin D1購自美國Cell Signaling Technology公司,抗體8G5F11購自美國Kerafast公司,辣根過氧化物酶標(biāo)記的羊抗兔/鼠抗體購自武漢啟動(dòng)子生物有限公司。

        1.2 病毒包裝與敲減細(xì)胞系的構(gòu)建

        對數(shù)生長期的293T細(xì)胞接種于6孔板,達(dá)到70%~80%的細(xì)胞密度后,使用Turbofect轉(zhuǎn)染試劑,將pLKO.1-NC/shRab20∶psPAX2∶pMD2G按2∶2∶1混合,每孔加5 μg質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染6孔板細(xì)胞,8 h后更換新鮮培養(yǎng)液,40 h后收集含有病毒的細(xì)胞上清。對數(shù)生長期的XhCRC細(xì)胞、SW620細(xì)胞接種于12孔板,達(dá)到30%~50%的細(xì)胞密度后,加入400~800 μL含病毒上清,24 h后更換新鮮培養(yǎng)液,40 h后加入2 μg/mL嘌呤霉素篩選成功轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,并使用Western blot驗(yàn)證。

        1.3 結(jié)直腸癌細(xì)胞囊泡運(yùn)輸檢測

        使用Turbofect轉(zhuǎn)染試劑,將2 μg的ts045-VSVG-EGFP質(zhì)粒轉(zhuǎn)染于6孔板內(nèi)對數(shù)生長期的XhCRC細(xì)胞、SW620細(xì)胞,8 h后更換新鮮培養(yǎng)液,并置于含5%CO2、40℃的細(xì)胞培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)36 h,使ts045-VSVG-EGFP在細(xì)胞中表達(dá)并滯留于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,隨后將細(xì)胞換至含5%CO2、32℃的細(xì)胞培養(yǎng)箱培養(yǎng),使ts045-VSVG-EGFP由內(nèi)質(zhì)網(wǎng)開始向細(xì)胞膜運(yùn)輸[11],繼續(xù)培養(yǎng)45 min后,使用4%多聚甲醛固定,加入抗體8G5F11特異性識別細(xì)胞膜表面蛋白VSVG,使用熒光顯微鏡進(jìn)行檢測。

        1.4 結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖能力檢測

        對數(shù)生長期的實(shí)驗(yàn)組和對照組細(xì)胞按照2×103個(gè)/100 μL標(biāo)準(zhǔn)接種96孔板,分別培養(yǎng)0、24、48、72 h后,每孔加入10 μL的CCK-8試劑,繼續(xù)孵育2 h后,用酶標(biāo)儀于450 nm波長下測定吸光度值,繪制細(xì)胞增殖曲線,縱坐標(biāo)為相對吸光度,橫坐標(biāo)為時(shí)間。

        1.5 結(jié)直腸癌細(xì)胞球體形成能力檢測

        對數(shù)生長期的XhCRC細(xì)胞、SW620細(xì)胞以5000個(gè)/孔接種于24孔超低吸附板中,加入干細(xì)胞培養(yǎng)液,于含5%CO2、37℃的細(xì)胞培養(yǎng)箱繼續(xù)培養(yǎng)5~7 d,顯微鏡下觀察并記錄直徑≥50 μm的細(xì)胞球體個(gè)數(shù),計(jì)算細(xì)胞球體形成率。

        1.6 Western blot檢測

        處理后的細(xì)胞,加入NP40裂解液充分裂解,提取蛋白質(zhì),經(jīng)BCA試劑定量檢測,通過SDS-PAGE電泳分離,轉(zhuǎn)至PVDF膜,室溫下用含5%脫脂奶粉的TBST封閉1 h,先后加入相應(yīng)一抗于4℃孵育過夜、二抗于室溫孵育1 h后,曝光顯影。

        1.7 基于生物信息學(xué)分析Rab20在結(jié)直腸癌組織的表達(dá)

        使用TIMER2(http://timer.cistrome.org/)和GEPIA2(http://gepia2.cancer-pku.cn/)數(shù)據(jù)庫分析Rab20在結(jié)直腸癌及正常組織的表達(dá)差異,設(shè)定閾值log2FC=1,P<0.01,納入數(shù)據(jù)庫中正常結(jié)直腸組織與結(jié)直腸癌組織數(shù)據(jù)即可得到基因表達(dá)圖。

        1.8 Rab20相關(guān)基因富集分析

        使用STRING(https://string-db.org/)數(shù)據(jù)庫對Rab20蛋白進(jìn)行分析,設(shè)定閾值最低交互分?jǐn)?shù)為0.150,并選擇數(shù)據(jù)來源為已發(fā)表文獻(xiàn),且得到經(jīng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的與Rab20相結(jié)合的蛋白。使用GEPIA2(http://gepia2.cancer-pku.cn/)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行相關(guān)基因檢測,根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫腫瘤組織和正常組織的數(shù)據(jù),獲得與Rab20表達(dá)相關(guān)的基因。結(jié)合兩組數(shù)據(jù),使用DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)數(shù)據(jù)庫對Rab20相關(guān)基因進(jìn)行京都基因與基因組百科全書信號途徑分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和基因本體富集分析(the Gene Ontology,GO)。統(tǒng)計(jì)偏差的截止標(biāo)準(zhǔn)為P<0.05。

        1.9 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        所有實(shí)驗(yàn)均獨(dú)立并重復(fù)進(jìn)行3次。使用SPSS 20.0統(tǒng)計(jì)軟件對各組所得的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,兩組間均數(shù)比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),多組間均數(shù)比較采用單因素方差分析。以P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 Rab20在人結(jié)直腸腫瘤組織及細(xì)胞系中高表達(dá)

        TIMER2和GEPIA2數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示結(jié)直腸腫瘤組織中Rab20含量高于鄰近正常組織(圖1A、1B)。Western blot檢測顯示結(jié)直腸癌細(xì)胞系SW620和XhCRC細(xì)胞中Rab20的表達(dá)水平顯著高于人正常腸上皮細(xì)胞(圖1C)。為進(jìn)一步驗(yàn)證Rab20蛋白在結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用,對XhCRC細(xì)胞和SW620細(xì)胞Rab20基因進(jìn)行敲減,shRab20組細(xì)胞的Rab20表達(dá)量顯著低于對照shNC組細(xì)胞(圖1D),提示敲減成功,可以進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

        A:TIMER2分析Rab20在直腸癌(READ)中的表達(dá),*P<0.05;B:GEPIA2分析Rab20在結(jié)腸癌(COAD)中的表達(dá),**P<0.01;C:Western blot檢測Rab20的表達(dá),Nor為人正常結(jié)直腸黏膜上皮細(xì)胞;D:Western blot驗(yàn)證Rab20的敲減圖1 Rab20在人結(jié)直腸腫瘤組織及結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的表達(dá)Fig.1 The expression of Rab20 in human colorectal tumor tissues and cell lines

        2.2 Rab20相關(guān)基因的富集分析

        為分析Rab20在結(jié)直腸癌中的相關(guān)作用,篩選出Rab20結(jié)合蛋白與Rab20表達(dá)相關(guān)基因進(jìn)行富集分析?;赟TRING工具,獲得10個(gè)經(jīng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的Rab20結(jié)合蛋白(圖2A)。利用GEPIA2工具結(jié)合TCGA的腫瘤表達(dá)數(shù)據(jù),得到了與Rab20基因表達(dá)相關(guān)的64個(gè)基因,分析顯示,在大多數(shù)癌癥類型中,Rab20基因的表達(dá)與FCGRT、FUCA1、MVP、PRR13和TNFSF13等基因呈正相關(guān)(圖2B)。結(jié)合這兩組數(shù)據(jù)進(jìn)行KEGG(圖2C)和GO(圖2D)分析,表明Rab20與細(xì)胞抗原加工呈遞、移植物抗宿主反應(yīng)等通路有關(guān),與細(xì)胞囊泡、細(xì)胞內(nèi)吞、物質(zhì)運(yùn)輸?shù)壬飳W(xué)行為密切相關(guān)。

        A:STRING數(shù)據(jù)庫分析Rab20結(jié)合蛋白;B:GEPIA2數(shù)據(jù)庫分析Rab20相關(guān)基因,Rab20的表達(dá)與FCGRT、FUCA1、MVP、PRR13和TNFSF13基因呈正相關(guān);C:Rab20相關(guān)基因的KEGG分析;D:Rab20相關(guān)基因的GO分析圖2 Rab20相關(guān)基因富集分析Fig.2 Gene set enrichment analysis of Rab20-related genes

        2.3 Rab20調(diào)控結(jié)直腸癌細(xì)胞的囊泡運(yùn)輸

        進(jìn)一步驗(yàn)證Rab20在結(jié)直腸癌細(xì)胞囊泡運(yùn)輸中的作用,分別在XhCRC-shNC和XhCRC-shRab20細(xì)胞中轉(zhuǎn)染ts045-VSVG-EGFP質(zhì)粒,使用8G5F11抗體識別運(yùn)輸至細(xì)胞膜表面的VSVG蛋白,通過追蹤VSVG熒光蛋白位置及細(xì)胞膜表面分布,示蹤囊泡運(yùn)輸[11]。熒光顯微鏡觀察(圖3A),并計(jì)算細(xì)胞膜表面VSVG/總VSVG比值(圖3B)。結(jié)果顯示,敲減Rab20顯著抑制XhCRC細(xì)胞的囊泡運(yùn)輸功能。

        A:免疫熒光檢測XhCRC-shNC和XhCRC-shRab20細(xì)胞的囊泡運(yùn)輸能力(比例尺為50μm);B:統(tǒng)計(jì)0 min和45 min時(shí),細(xì)胞膜表面VSVG/總VSVG比值;與shNC組比較,**P<0.01圖3 Rab20敲減對XhCRC細(xì)胞囊泡運(yùn)輸?shù)挠绊慒ig.3 Effect of Rab20 knockdown on the vesicle traffic of XhCRC cells

        2.4 敲減Rab20抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖與干性

        為探討Rab20與結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖及干性表型的關(guān)系,分別在XhCRC-shNC和XhCRC-shRab20細(xì)胞中進(jìn)行CCK-8實(shí)驗(yàn)和細(xì)胞球體形成實(shí)驗(yàn)。CCK-8實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示在48 h和72 h后,shRab20組細(xì)胞增殖能力顯著低于shNC組(圖4A)。球體形成實(shí)驗(yàn)表明,shRab20組細(xì)胞球體形成數(shù)量顯著低于shNC組,細(xì)胞球體形成率顯著降低(圖4B)。提示敲減Rab20能夠抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖與干性。

        A:細(xì)胞增殖曲線;B:細(xì)胞球體形成實(shí)驗(yàn)(比例尺為200 μm);與shNC組比較,**P<0.01圖4 Rab20敲減對XhCRC細(xì)胞增殖和干性的影響Fig.4 Effect of Rab20 knockdown on proliferation and stemness of XhCRC cells

        2.5 Rab20抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖與干性的機(jī)制

        Western blot檢測結(jié)果顯示,Rab20敲減后,β-catenin、Cyclin D1的蛋白表達(dá)顯著降低,提示Rab20可能調(diào)控Wnt通路影響結(jié)直腸癌細(xì)胞;加入外源Wnt3a蛋白后,能夠明顯逆轉(zhuǎn)降低的β-catenin、Cyclin D1蛋白表達(dá)(圖5)。

        與shNC組比較,*P<0.05,**P<0.01;與shRab20組比較,##P<0.01圖5 Rab20敲減及外源性Wnt3a處理對XhCRC細(xì)胞Wnt/β-catenin信號通路的影響Fig.5 Effect of Rab20 knockdown and Wnt3a on Wnt/β-catenin pathway in XhCRC cells

        同時(shí)外源Wnt3a蛋白處理shRab20組細(xì)胞后,CCK-8實(shí)驗(yàn)和細(xì)胞球體形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示敲減Rab20抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖與干性的作用被顯著逆轉(zhuǎn)(圖6)。以上結(jié)果提示Rab20可能通過調(diào)控Wnt/β-catenin通路,影響結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖與干性。

        A:細(xì)胞增殖曲線;B:細(xì)胞球體形成實(shí)驗(yàn)(比例尺為200 μm);與shNC組比較,**P<0.01;與shRab20組比較,##P<0.01圖6 外源性Wnt3a處理對敲減Rab20后XhCRC細(xì)胞增殖和干性的影響Fig.6 Effect of Wnt3a on proliferation and stemness of Rab20-knockdown XhCRC cells

        3 討論

        結(jié)直腸癌是臨床常見的腫瘤,在全世界范圍表現(xiàn)出較高的發(fā)病率與死亡率[12]。目前結(jié)直腸癌的診療逐步完善,然而仍有較大部分患者出現(xiàn)不良結(jié)局[2-3]。因此,測定結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展的標(biāo)志細(xì)胞因子,研究其可能的作用機(jī)制,對結(jié)直腸癌的診斷與治療極為重要。

        Rab蛋白是高度保守的囊泡運(yùn)輸調(diào)控因子,通過結(jié)合GFP與下游網(wǎng)格蛋白和細(xì)胞骨架相互作用,觸發(fā)細(xì)胞的物質(zhì)運(yùn)輸[13],并參與調(diào)控腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移、代謝和分泌等過程[14]。Rab20是Rab家族成員,在胰腺癌、陰莖鱗癌、膀胱癌等多種實(shí)體瘤中高表達(dá),促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖[15-18],在肝細(xì)胞癌中Rab20調(diào)控肝癌細(xì)胞外泌體分泌,調(diào)控肝癌發(fā)生[19]。Rab20基因在結(jié)直腸腺瘤中高度擴(kuò)增,與結(jié)腸腺瘤復(fù)發(fā)和不良結(jié)局相關(guān)[8]。然而Rab20在結(jié)直腸癌中的作用尚不清楚。本研究發(fā)現(xiàn)Rab20在結(jié)直腸癌組織與細(xì)胞中的表達(dá)顯著高于正常結(jié)直腸組織與上皮細(xì)胞?;蚋患治霭l(fā)現(xiàn)Rab20與胞吞胞吐、囊泡運(yùn)輸和核內(nèi)體形成等生物過程密切相關(guān)。進(jìn)一步敲減Rab20,實(shí)驗(yàn)組XhCRC細(xì)胞的囊泡運(yùn)輸能力明顯受損,表明Rab20具有促進(jìn)結(jié)直腸癌細(xì)胞囊泡運(yùn)輸?shù)淖饔谩?/p>

        Wnt信號通路的異常活化是癌癥常見表現(xiàn)[20],其中Wnt配體通過自分泌或旁分泌發(fā)揮作用,激活Wnt/β-catenin通路,調(diào)控腫瘤干性、增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移等過程[21]。基于Rab20在細(xì)胞囊泡運(yùn)輸與分泌中的作用,我們的研究進(jìn)一步探討了Rab20對Wnt信號通路的影響。敲減Rab20后,實(shí)驗(yàn)組XhCRC細(xì)胞增殖能力和細(xì)胞球體形成能力顯著低于對照組細(xì)胞,提示Rab20具有增強(qiáng)結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖及干性的作用。敲減Rab20組細(xì)胞β-catenin、Cyclin D1表達(dá)水平明顯降低,而加入外源Wnt3a處理能顯著抵消降低效果。外源Wnt3a處理敲減Rab20組細(xì)胞,能顯著逆轉(zhuǎn)敲減Rab20對結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖及干性的抑制作用。上述結(jié)果表明,Rab20在結(jié)直腸癌中高表達(dá),調(diào)控囊泡運(yùn)輸功能,并可能通過調(diào)節(jié)Wnt/β-catenin信號通路增強(qiáng)結(jié)直腸癌細(xì)胞的增殖和干性。

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