吳學(xué)敏 汪翊靈 陳如敬 陳秋勇 王隆柏 車勇良 嚴(yán) 山 劉玉濤 周倫江*
(1.福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所/福建省畜禽疫病防治工程技術(shù)研究中心 福州 350013;2.閩侯縣農(nóng)業(yè)農(nóng)村局畜牧獸醫(yī)站 福建閩侯 350100)
偽狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)是一種神經(jīng)性皰疹病毒,可感染多種哺乳動(dòng)物,包括反芻動(dòng)物、食肉動(dòng)物和嚙齒動(dòng)物,導(dǎo)致易感動(dòng)物中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病[1-2]。豬是PRV的天然宿主,偽狂犬?。≒seudorabies,PR)對(duì)養(yǎng)豬業(yè)危害性大,具有高度隱性感染的特點(diǎn),可引起持續(xù)性感染,特別是耐過的母豬呈長期帶毒生產(chǎn)[3]。2011年以來,我國許多規(guī)模化豬場(chǎng)暴發(fā)了PR,主要表現(xiàn)為豬群PRV-gE抗體陽性率顯著升高,普遍出現(xiàn)母豬流產(chǎn)、仔豬神經(jīng)癥狀和病死率高等臨床情況,近幾年還相繼發(fā)現(xiàn)免疫PR疫苗的養(yǎng)豬場(chǎng)發(fā)生偽狂犬病,并分離到新的PRV流行毒株[4-6],相關(guān)研究表明,新分離的PRV毒株出現(xiàn)了變異,而經(jīng)典毒株的疫苗未能完全保護(hù)新型強(qiáng)毒力PRV的感染[7-10]。PRV已發(fā)現(xiàn)16種囊膜蛋白,其中11種功能性囊膜蛋白,gD(US6)為糖基化蛋白,是PRV的主要免疫原之一,在病毒感染細(xì)胞至復(fù)制生長過程中起著重要的作用,也最先被機(jī)體免疫系統(tǒng)識(shí)別引起免疫應(yīng)答[11-12]。研究表明,gD蛋白抗體是主要中和抗體之一,能夠充分中和PRV,且不存在補(bǔ)體時(shí)也能有效中和[13]。本研究對(duì)福建省閩侯縣發(fā)生疑似PR的豬場(chǎng)進(jìn)行PRV分離鑒定,再對(duì)新分離PRV毒株gD基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,通過測(cè)序比對(duì)分析,探究豬偽狂犬病病毒gD基因的遺傳進(jìn)化規(guī)律,為PR預(yù)防和控制提供理論依據(jù)。
1.1 細(xì)胞與病毒 PK-15細(xì)胞由本研究室保存,用于病毒分離和傳代培養(yǎng);偽狂犬病病毒參考毒株Fa株由本研究室保存。
1.2 病料與病毒分離 從福建省閩侯縣某豬場(chǎng)采集疑似PRV感染豬的腦、肺、脾臟和肝臟組織,參考文獻(xiàn)[7]的方法,處理病料并接種于PK-15細(xì)胞,將發(fā)生病變的細(xì)胞傳至3~4代,待細(xì)胞70%發(fā)生病變時(shí)收獲病毒液,凍存于-80℃,備用。
1.3 主要試劑 病毒核酸提取試劑盒、PCR擴(kuò)增高保真酶Mix、GC Buffer等均購自北京全式金公司;DMEM培養(yǎng)基和胰酶購自HyClone公司;犢牛血清購自杭州四季青公司;瓊脂糖、10×TAE緩沖液購自北京索萊寶公司。
1.4 引物設(shè)計(jì)合成 參考GenBank中PRV基因序列(NC_006151),設(shè)計(jì)擴(kuò)增gE基因保守序列的引物和gD基因的引物,序列分別為gE-F:5'-AACTATGGCATGACCGCCAA-3',gE-R:5'-GTGGAGAAGAAGAGTCCGGC-3';引物gD-F:5'-ATGATGATGGTGGCGCGCGAC-3',gD-R:5'-TTATTGTTCTTCTGCGATGGTGGCGAG-3'。引物由鉑尚生物技術(shù)公司合成,兩對(duì)引物預(yù)計(jì)擴(kuò)增的片段大小分別為612 bp和1 100 bp。
1.5 PCR檢測(cè)鑒定 按照病毒核酸提取試劑盒說明書提取組織上清液和病毒培養(yǎng)液的病毒DNA作為模板,以Fa株的核酸作為陽性對(duì)照,用gE引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳觀察鑒定。
1.6 gD基因擴(kuò)增 以分離的病毒DNA為模板,用gD引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,58℃復(fù)性45 s,72℃延伸45 s,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10 min。反應(yīng)結(jié)束,取5μL于1%瓊脂糖凝膠電泳觀察結(jié)果,并將目的條帶膠回收,送上海鉑尚生物技術(shù)公司測(cè)序。
1.7 gD基因序列及氨基酸序列分析 將測(cè)序結(jié)果用DNAStar軟件中SeqBulider程序推導(dǎo)對(duì)應(yīng)的氨基酸序列,挑選GenBank中登錄的具有代表性的15個(gè)毒株使用MEGA 5.05和MegAlign軟件進(jìn)行同源性比對(duì)分析,并構(gòu)建遺傳進(jìn)化分析樹,探究它們的親緣關(guān)系。選取的毒株為Fa株(AY196984)、Min-A株(AY169694)、La株(AY174090)、SA215株(DQ367438)、FZ株(EF645837)、TJ株(KJ789182)、LC株(MF434034)、FJ-Y21株(MK922107)、HNXY株(MN003373)、Anhui-ZJ1株(MK922121)、Kaplan株(AJ271966)、Becker株(AY368490)、NiA3株(KU900059)、Yangsan株(AY217094)和疫苗毒Bartha株(KY398733)。
2.1 病毒分離鑒定 于PK-15細(xì)胞上穩(wěn)定傳代的病毒,待接種48 h后可見細(xì)胞變圓,出現(xiàn)合胞體,約70%細(xì)胞出現(xiàn)病變時(shí)收起,進(jìn)行PCR檢測(cè)鑒定,以Fa株作為陽性對(duì)照,結(jié)果見圖1,分離到的病毒與陽性對(duì)照在600 bp處出現(xiàn)明顯條帶,并對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,與GenBank中PRV-gD基因序列一致,表明分離的病毒為PRV,命名為FJMH1907b。
圖1 PCR鑒定電泳圖
2.2 gD基因擴(kuò)增結(jié)果 以分離的病毒FJMH1907b株和Fa株核酸為模板,PCR擴(kuò)增gD基因,結(jié)果見圖2,均在1 100 bp處出現(xiàn)預(yù)期條帶,將條帶回收送檢測(cè)序。
圖2 gD基因PCR擴(kuò)增電泳圖
2.3 gD核苷酸序列比對(duì)分析 將FJMH1907b株gD基因片段擴(kuò)增測(cè)序結(jié)果,與GenBank中收錄的15株P(guān)RV對(duì)應(yīng)核苷酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,由構(gòu)建的遺傳進(jìn)化樹可見,新分離FJMH1907b毒株與國外Kaplan毒株及疫苗毒Bartha株不屬于一個(gè)大的分支上,與國內(nèi)FJ-Y21株、Anhui-ZJ1株、LC株及TJ株同屬一個(gè)小分支上(見圖3)。
圖3 PRV-gD基因核苷酸序列遺傳進(jìn)化樹
2.4 gD基因推導(dǎo)氨基酸序列比較 將gD基因推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行比較分析,結(jié)果顯示(見圖4)推導(dǎo)出對(duì)應(yīng)氨基酸共369aa,差異較大的區(qū)域集中在aa278~aa282,存在連續(xù)氨基酸缺失或增加,另aa287、aa341存在A-V和P-Q互換;部分毒株個(gè)別氨基酸也存在突變,主要變化有A105V、I121V、R276K、F323L、S355P,其中疫苗毒Bartha株的aa81存在N突變成S,新分離FJMH1907b株的aa271存在R突變成Q。
圖4 gD基因推導(dǎo)氨基酸序列比較
2.5 gD基因推導(dǎo)氨基酸序列比對(duì)分析 將gD基因推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)分析,構(gòu)建的遺傳進(jìn)化樹顯示(見圖5),與核苷酸序列的比對(duì)結(jié)果相似,新分離FJMH1907b毒株處于相對(duì)獨(dú)立分支,與國外Kaplan毒株及疫苗毒Bartha株不屬于一個(gè)大的分支上,與國外Becker毒株、NiA3株也不在一個(gè)分支上,與國內(nèi)Fa株、FZ株、FJ-Y21株、Anhui-ZJ1株、LC株及TJ株同屬一個(gè)較小分支上。
圖5 PRV-gD氨基酸序列遺傳進(jìn)化樹
2.6 gD氨基酸同源性比較分析 根據(jù)推測(cè)的氨基酸序列,采用MAGE軟件比對(duì)獲得PRV gD蛋白氨基酸同源性比對(duì)矩陣,結(jié)果顯示(見圖6):新分離FJMH1907b毒株與其它參考毒株的同源性為87.7%~100%,與國外毒株的同源性為87.7%~99.7%,其中與疫苗毒Bartha株的同源性僅87.7%、韓國Yangsan株為99.7%;與國內(nèi)Fa株、FJ-Y21株、TJ株、Anhui-ZJ1株及LC株同源性為100%。
圖6 gD氨基酸序列同源性矩陣
PRV為線性雙股DNA病毒,基因全長約150 kb,其中G+C含量高達(dá)73%,編碼的囊膜蛋白中有11種是糖偶聯(lián)蛋白,包括gL、gH、gB、gC、gN、gD、gI和gE蛋白等,大部分與病毒的入侵感染和復(fù)制生長增殖密切相關(guān),部分也直接參與宿主的免疫反應(yīng),產(chǎn)生相應(yīng)的抗體[1,2,14-15]。gD蛋白也是主要免疫原性糖蛋白之一,是病毒感染過程所必需的,具有高度保守性,是機(jī)體中和抗體的目標(biāo)蛋白之一[11]。gD蛋白氨基酸序列分析和蛋白空間構(gòu)象研究表明,gD蛋白具有跨膜區(qū)、細(xì)胞膜結(jié)合位點(diǎn)和信號(hào)肽區(qū)的典型免疫活性特性[16]。自2011年以來,我國出現(xiàn)新的PRV流行毒株,陸續(xù)相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)新毒株毒力基因和抗原保護(hù)性基因均出現(xiàn)一定的變異,也給該病的防控帶來新的挑戰(zhàn)[17]。部分規(guī)模化豬場(chǎng)的豬群PRV-gE抗體陽性率顯著升高,出現(xiàn)母豬流產(chǎn)、仔豬神經(jīng)癥狀和死亡率升高等情況,甚至還發(fā)現(xiàn)部分免疫PR疫苗的豬場(chǎng)發(fā)生偽狂犬病,并分離到新的PRV流行毒株。相關(guān)研究表明,新分離的PRV毒株出現(xiàn)了變異,而經(jīng)典毒株的疫苗未能完全保護(hù)新型強(qiáng)毒力PRV的感染[8-10]。
本研究對(duì)新分離的PRV毒株FJMH1907b株的gD基因核苷酸序列和對(duì)應(yīng)氨基酸序列與參考毒株進(jìn)行對(duì)比分析,結(jié)果顯示福建新分離FJMH1907b毒株與疫苗毒Bartha株不屬于一個(gè)大的分支上,且兩者對(duì)應(yīng)的氨基酸序列同源性為87.7%,這可能是導(dǎo)致該豬場(chǎng)偽狂犬病免疫失敗而發(fā)病的原因之一,或PRV經(jīng)典毒株疫苗對(duì)新型毒株不能提供完全保護(hù)。PRV gD蛋白具有高度保守性,氨基酸序列比對(duì)分析結(jié)果顯示,不同地域分離的毒株具有一定差異,主要集中在aa278~aa282位置存在連續(xù)氨基酸缺失或增加,以及在aa276、aa287、aa341存在R-K、A-V和P-Q互換,新分離FJMH1907b株gD蛋白氨基酸也存在上述變化,同時(shí)在aa271存在R突變成Q。因此,本研究對(duì)PRV gD基因核苷酸序列和對(duì)應(yīng)氨基酸序列進(jìn)行對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),gD蛋白較保守,但存在一定地域差異性,與徐志文等研究結(jié)果一致[16];與國外Bartha株存在較大的差異,兔源gD蛋白多抗血清對(duì)不同PRV毒株交叉中和效價(jià)差異不顯著[18],或許PRV gD蛋白個(gè)別氨基酸的突變不會(huì)引起其抗原性重大改變,但新分離FJMH1907b株gD基因及對(duì)應(yīng)氨基酸序列的比對(duì)分析結(jié)果,結(jié)合目前豬場(chǎng)PRV的流行情況,對(duì)該病的防控應(yīng)因地制宜,定期做好病原學(xué)和血清學(xué)監(jiān)測(cè),合理安排疫苗免疫。