檀 振,劉意億,張厚澤,王靖雯,農(nóng)旭華*
(1.熱帶藥用資源化學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/海南師范大學(xué) 化學(xué)與化工學(xué)院,海南 ???571158;2.熱帶藥用植物化學(xué)海南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/海南師范大學(xué) 化學(xué)與化工學(xué)院,海南 海口 571158)
海洋沉積物腐殖質(zhì)含量豐富,是海洋微生物重要的棲息地之一。從海洋沉積物來(lái)源微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物中尋找結(jié)構(gòu)新穎的活性化合物是藥物先導(dǎo)分子發(fā)現(xiàn)的重要途徑。海洋放線(xiàn)菌分布廣泛,種類(lèi)多樣,其活性次級(jí)代謝產(chǎn)物具有較強(qiáng)的藥用潛力[1]。從現(xiàn)有的研究報(bào)道來(lái)看,海洋沉積物中的放線(xiàn)菌大多為鏈霉菌屬。近年來(lái),從海洋沉積物來(lái)源鏈霉菌中分離鑒定出生物堿、大環(huán)內(nèi)酯、肽類(lèi)等多種類(lèi)型的次級(jí)代謝產(chǎn)物,表現(xiàn)出抗菌、抗炎、抗腫瘤、抗病毒等顯著的生物活性[2]。
植物病原真菌是農(nóng)作物主要的病害,常常引起農(nóng)作物發(fā)生枯萎病、炭疽病等,造成農(nóng)作物減產(chǎn)[3]。目前的防控措施主要是通過(guò)使用化學(xué)農(nóng)藥來(lái)控制,如氟、砷等殺蟲(chóng)劑及滴滴涕等。然而,長(zhǎng)期使用化學(xué)農(nóng)藥不僅使病原真菌產(chǎn)生耐藥性,還引起嚴(yán)重的食品安全和環(huán)境污染問(wèn)題[4]。因此,尋找高效安全的綠色替代農(nóng)藥是當(dāng)前需要解決的問(wèn)題,也是實(shí)現(xiàn)農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的必然選擇。海洋放線(xiàn)菌長(zhǎng)期生活在高鹽和低溫等復(fù)雜環(huán)境,形成自身獨(dú)特的代謝調(diào)控途徑,次級(jí)代謝產(chǎn)物表現(xiàn)出結(jié)構(gòu)多樣性和顯著的生物活性,是研制高效、環(huán)境友好型農(nóng)藥的寶貴資源[5]。本文以一株海洋沉積物來(lái)源放線(xiàn)菌為研究對(duì)象,從其次級(jí)代謝產(chǎn)物中分離鑒定10 個(gè)單體化合物,分別為cyclo-(trans-4-OH-D-Pro-D-Phe)(1),cyclo-(D-Pro-D-Phe)(2),cyclo-(L-Ala-L-Phe)(3),cyclo-(L-leucine-L-proline)(4),cyclo-(L-Leu-trans-4-hydroxy-L-Pro)(5),cyclo-(D-Pro-DIle)(6),trans-2-methylcinnamic acid(7),indole-3-carboxaldehyde(8),2-pyrrolecarboxylic acid(9),2-hydroxy phenyl acetic acid(10)(圖1)。應(yīng)用濾紙片擴(kuò)散法對(duì)4 株植物病原真菌展開(kāi)活性篩選,發(fā)現(xiàn)化合物10 在100μg/disc下對(duì)水稻稻瘟真菌Pyricularia oryzaeHNM 1003具有微弱的抑制活性,抑制圈直徑為8 mm。
圖1 化合物1~10的化學(xué)結(jié)構(gòu)Figure 1 Chemical structures of compounds 1~10
核磁共振儀Bruker AV-400MHz,瑞士Bruker 公司;旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀EYELA N-1001,日本東京理化;冷卻水循環(huán)裝置EYELA COOLACE CA-IIII,日本東京理化;真空泵EYELA A-10000S,日本東京理化;制備高效液相色譜儀Agilent 1260 系列,色譜柱Agilent Eclipse XDB-C18 column(250 mm×9.4 mm,5μm),美國(guó)安捷倫公司;硅膠(200~400目),青島海洋化工廠(chǎng)產(chǎn)品。提取分離用甲醇、丙酮、乙酸乙酯、石油醚、氯仿等均為工業(yè)用化學(xué)純產(chǎn)品,重蒸后使用,高效液相制備流動(dòng)相的甲醇為色譜級(jí)。
1.2.1 菌種材料
菌株從連云港市海州灣-15 cm深海岸帶(34.944°N 119.210°E)沉積物樣品中分離得到,并通過(guò)16S序列比對(duì)進(jìn)行菌種鑒定。
1.2.2 菌種發(fā)酵培養(yǎng)基
可溶性淀粉2%,葡萄糖1%,細(xì)菌學(xué)蛋白胨0.5%,酵母提取物0.5%,NaCl 0.4%,K2HPO40.05%,MgSO4·7H2O 0.05%,CaCO30.2%。
1.2.3 浸膏的提取發(fā)酵液經(jīng)4 000 r/min離心得到菌液和菌體,菌液使用等體積的乙酸乙酯萃取3次得到浸膏;菌體使用丙酮萃取3次,再用乙酸乙酯反萃,得到浸膏;二者合并。
1.2.4 化合物的分離
浸膏5 g 用氯仿和甲醇溶解,過(guò)正相色譜柱,石油醚-乙酸乙酯兩相體系作為洗脫液(V/V,10%,20%,30%,50%,100%),再用氯仿-甲醇體系(V/V,10%~30%)洗脫,經(jīng)TLC 分析合并得到9個(gè)餾分(Fr.1~Fr.9)。餾分Fr.5(301 mg)過(guò)正相色譜柱,石油醚-乙酸乙酯為洗脫液(V/V,10%,20%,30%,50%,100%),經(jīng)TLC分析合并得到3 個(gè)亞餾分(Fr.5-1~Fr.5-3);亞餾分Fr.5-2 通過(guò)RP-HPLC 制備(流動(dòng)相MeOH∶H2O = 55∶45,2 mL/min)得到化合物9(11mg,tR= 4.8 min);亞餾分Fr.5-3 重結(jié)晶得到化合物10(151 mg)。餾分Fr.6(243 mg)過(guò)正相色譜柱,石油醚-乙酸乙酯體系洗脫(20%、30%、50%、100%),結(jié)合TLC分析合并得到4個(gè)亞餾分(Fr.6-1~Fr.6-4);亞餾分Fr.6-2經(jīng)RP-HPLC 制備(流動(dòng)相MeOH∶H2O=45∶55,2 mL/min)得到化合物7(10 mg,tR=30 min);亞餾分Fr.6-4經(jīng)RP-HPLC 制備(流動(dòng)相MeOH∶H2O=55∶45,2 mL/min)得到化合物8(20 mg,tR=2.4 min)。餾分Fr.8(1.83 g)過(guò)正相色譜柱,石油醚-乙酸乙酯體系洗脫(30%~100%),經(jīng)TLC分析合并得到3個(gè)亞餾分(Fr.8-1~Fr.8-3);亞餾分Fr.8-1由RP-HPLC 制備(流動(dòng)相MeOH∶H2O=35∶65,2 mL/min)得到化合物6(27 mg,tR=5.2 min),4(116 mg,tR=10.3 min)和2(12 mg,tR=12.5 min);亞餾分Fr.8-2重結(jié)晶得到化合物5(45 mg)。餾分Fr.9(2.13g)過(guò)正相色譜柱,氯仿-甲醇體系洗脫(V/V,10%~30%),經(jīng)TLC分析合并得到4個(gè)亞餾分(Fr.9-1~Fr.9-4);亞餾分Fr.9-2經(jīng)RP-HPLC 制備(流動(dòng)相MeOH∶H2O=27∶73,2 mL/min)得到化合物3(8 mg,tR=25 min)和1(50 mg,tR=27 min)。
按照文獻(xiàn)[6]采用濾紙片擴(kuò)散法,使用涂布棒把水稻稻瘟真菌Pyricularia oryzaeHNM 1003、芒果炭疽病菌Colletotrichum asianumHNM 408、橡膠樹(shù)炭疽病菌Colletotrichum acutatumHNMRC 178 和香蕉枯萎病菌Fusarium oxysporumHNM 1003 孢子均勻涂布在含PDA 培養(yǎng)基平板上。將單體化合物樣品用DMSO 配制為20 mg/mL,待用。用打孔器將濾紙制成直徑為6 mm的無(wú)菌小圓紙片,貼于準(zhǔn)備好的含指示菌PDA培養(yǎng)基平板中。用定量移液槍吸取5μL待測(cè)化合物樣品滴加在濾紙片上,置于28 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24~48 h,觀察是否產(chǎn)生抑菌圈。重復(fù)3次,同時(shí)以多菌靈為陽(yáng)性對(duì)照,DMSO為空白對(duì)照。
以所提取的總DNA 為模板,利用通用引物27F(5′-GAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1525R(5′-AGAAAGGAGGTGATCCAGCC-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增得到其16S rDNA序列,經(jīng)純化測(cè)序后,菌株Streptomycessp.XC2026的16S rDNA序列長(zhǎng)度為1 517 bp(基因登錄號(hào)為CP064057.1),通過(guò)比較基因序列的同源性,發(fā)現(xiàn)與Streptomycessp.ZJ306(基因登錄號(hào)為KF954540.1)序列99%吻合,故鑒定為Streptomyces(圖2)。
圖2 放線(xiàn)菌Streptomyces sp.AHMU XC 2026的形態(tài)學(xué)特征Figure 2 Specific morphological characteristics of Streptomyces sp.AHMU XC 2026
化合物1:白色無(wú)定性粉末,ESI-MS數(shù)據(jù)為m/z283.1([M+Na]+),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:7.29(5H,m,Ph),4.41(1H,m,H-4),4.32(1H,dd,J=6.4,11.2 Hz,H-6),4.20(1H,dd,J=4.8,5.2 Hz,H-9),3.53(1H,dd,J=4.8,12.4 Hz,H-3α),3.18(1H,d,J=12.4 Hz,H-3β),3.10(1H,dd,J=5.2,14.4 Hz,H-10a),3.03(1H,dd,J=4.8,14.4 Hz,H-10b),1.96(1H,dd,J=6.4,12.8 Hz,H-5a),1.53(1H,m,H-5b);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:169.6(C,C-1),165.3(C,C-7),137.3(C,C-11),129.9(CH,C-12,C-16),128.1(CH,C-13,C-15),126.4(CH,C-14),66.8(CH,C-4),57.0(CH,C-6),55.7(CH,C-9),53.9(CH2,C-3),37.3(CH2,C-5),35.3(CH2,C-10)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[7]的基本一致,故鑒定該化合物為cyclo-(trans-4-OH-D-Pro-D-Phe)。
化合物2:白色無(wú)定性粉末,ESI-MS數(shù)據(jù)為m/z243.0([M-H]-),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:7.26(5H,m,Ph),4.36(1H,t,J=5.2 Hz,H-9),4.00(1H,dd,J=6.8,9.6 Hz,H-6),3.39(1H,m,H-3a),3.35(1H,m,H-3b),3.09(1H,dd,J=5.2,14.4 Hz,H-10a),3.09(1H,dd,J=5.2,14.4 Hz,H-10b),2.03(1H,m,H-5a),1.75(1H,m,H-5b),1.71(1H,m,H-4a),1.44(1H,m,H-4b);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:169.0(C,C-1),165.1(C,C-7),137.2(C,C-11),129.9(CH,C-13,C-15),128.0(CH,C-12,C-16),126.4(CH,C-14),58.4(CH,C-6),55.7(CH,C-9),44.6(CH2,C-3),35.4(CH2,C-10),27.8(CH2,C-5),21.9(CH2,C-4)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[7]的基本一致,故鑒定該化合物為cyclo-(D-Pro-D-Phe)。
化合物3:白色無(wú)定性粉末,ESI-MS 數(shù)據(jù)為m/z219.1([M+H]+),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH7.29(5H,m,Ph),4.18(1H,m,H-3),3.63(1H,m,H-6),3.14(1H,dd,J=3.6,13.6 Hz,H-7a),2.87(1H,dd,J=4.8,13.6 Hz,H-7b),0.45(3H,d,J=7.2 Hz,H-14);
13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:167.7(C,C-1),165.8(C,C-4),136.0(C,C-8),130.4(CH,C-9,C-13),128.1(CH,C-10,C-12),126.7(CH,C-11),55.3(CH,C-3),49.7(CH,C-6),38.3(CH2,C-7),19.7(CH3,C-14)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[8]的基本一致,故鑒定該化合物為cyclo-(L-Ala-L-Phe)。
化合物4:白色無(wú)定性粉末,ESI-MS 數(shù)據(jù)為m/z211.2([M+H]+),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:4.20(1H,t,J=8.0 Hz,H-6),4.01(1H,dd,J=5.6,6.4 Hz,H-9),3.39(2H,m,H-3),2.15(1H,m,H-5a),1.94(1H,m,H-5b),1.85(2H,m,H-4),1.81(2H,m,H-10),1.38(1H,m,H-11),0.87(3H,d,J= 6.4 Hz,H-12),0.86(3H,d,J=6.4 Hz,H-13);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:170.5(C,C-1),166.7(C,C-7),58.5(CH,C-6),52.7(CH,C-9),44.9(CH2,C-3),37.8(CH2,C-10),27.5(CH2,C-5),24.1(CH,C-11),22.9(CH2,C-4),22.5(CH3,C-12),22.0(CH3,C-13)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[7]的基本一致,故鑒定該化合物為cyclo-(L-leucine-L-proline)。
化合物5:白色無(wú)定性粉末,ESI-MS數(shù)據(jù)為m/z249.1([M+Na]+),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:8.00(1H,s,NH),5.12(1H,s,4-OH),4.41(1H,dd,J=3.5,10.8 Hz,H-6),4.29(1H,m,H-4),4.06(1H,t,J=6.0 Hz,H-9),3.50(1H,dd,J=4.4,12.4 Hz,H-3a),3.24(1H,d,J=12.4 Hz,H-3b),2.07(1H,dd,J=6.8,13.2 Hz,H-5a),1.96(1H,m,H-5b),1.87(1H,m,H-11),1.80(1H,m,H-10a),1.38(1H,m,H-10b),0.87(3H,d,J=6.4 Hz,H-12),0.86(3H,d,J=6.4 Hz,H-13);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:170.8(C,C-7),166.6(C,C-1),67.1(CH,C-4),57.1(CH,C-6),53.7(CH2,C-3),52.6(CH,C-9),37.8(CH2,C-10),36.7(CH2,C-5),24.1(CH,C-11),22.8(CH3,C-12),21.9(CH3,C-13)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[9]的基本一致,故鑒定該化合物為cyclo-[L-Leu-trans-4-hydroxy-L-Pro]。
化合物6:白色無(wú)定性粉末,ESI-MS 數(shù)據(jù)為m/z219.1([M+H]+),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:4.13(1H,dd,J=1.6,7.2 Hz,H-6),3.91(1H,brs,H-9),3.60(1H,m,H-3a),3.37(1H,m,H-3b),2.37(1H,m,H-10),2.16(1H,m,H-5a),1.88(1H,m,H-5b),1.82(2H,m,H-4),1.01(3H,d,J=7.2 Hz,H-11),0.85(3H,d,J= 7.2 Hz,H-12);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:170.3(C,C-1),165.3(C,C-7),59.5(CH,C-9),58.3(CH,C-6),44.7(CH2,C-3),27.9(CH,C-10),27.8(CH2,C-5),22.1(CH2,C-4),18.4(CH3,C-11),16.4(CH3,C-12)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[7]的基本一致,故鑒定該化合物為cyclo-(D-Pro-DIle)。
化合物7:白色粉末,ESI-MS 數(shù)據(jù)為m/z162.2([M+H]+),1H NMR(400 MHZ,DMSO-d6)δH:7.66(1H,d,J=15.6 Hz,H-3),7.54(1H,J=1.6,8.0 Hz,H-5),7.28(1H,overlapped,H-7),7.25(1H,overlapped,H-6),7.23(1H,overlapped,H-8),6.53(1H,d,J=15.6 Hz,H-2),2.36(3H,s,H3-10);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:166.7(C,C-1),136.7(C,C-5),136.5(CH,C-3),133.7(C,C-4),130.6(CH,C-6),129.1(CH,C-7),126.3(CH,C-8),125.9(CH,C-9),123.5(CH,C-2),19.3(CH3,C-10)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[10]比對(duì),鑒定該化合物為trans-2-methylcinnamic acid(反式-2-甲基-肉桂酸)。
化合物8:白色粉末,ESI-MS 數(shù)據(jù)為m/z151.1([M-H]-),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:6.99(1H,td,J=1.6,7.6 Hz,H-7),6.92(1H,dd,J=1.6,7.6 Hz,H-8),6.65(1H,t,J=7.6 Hz,H-6),6.61(1H,d,J=7.6 Hz,H-5),3.19(2H,s,H-2);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:176.2(C,C-1),158.1(C,C-4),130.1(CH,C-8),127.1(CH,C-6),124.9(C,C-3),117.9(CH,C-7),117.0(CH,C-5),44.3(CH2,C-2)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[11]的基本一致,故鑒定該化合物為2-hydroxy phenyl acetic acid(2-羥基苯乙酸)。
化合物9:白色無(wú)定形粉末,ESI-MS 數(shù)據(jù)為m/z146.0([M+H]+),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:9.92(1H,s,H-8),8.28(1H,s,H-2),8.09(1H,d,J=7.6 Hz,H-4),7.53(1H,d,J=7.6 Hz,H-7),7.27(2H,overlapped,H-5,H-6);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:184.9(C,C-8),138.6(CH,C-2),137.1(C,C-7a),124.1(C,C-3a),123.4(CH,C-6),122.1(CH,C-5),120.8(CH,C-4),118.1(C,C-3),112.5(CH,C-7)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[11]的基本一致,故鑒定該化合物為indole-3-carboxaldehyde(3-吲哚甲醛)。
化合物10:無(wú)色粉末,ESI-MS 數(shù)據(jù)為m/z110.2([M-H]-),1H NMR(400 MHz,DMSO-d6)δH:11.64(1H,s,NH),6.94(1H,dd,J=2.4,4.5 Hz,H-3),6.79(1H,br m,H-4),6.13(1H,J=2.4,8.4 Hz,H-5);13C NMR(100 MHz,DMSO-d6)δC:162.7(C,C-6),123.9(CH,C-5),123.5(C,C-2),115.4(CH,C-3),110.0(CH,C-4)。以上數(shù)據(jù)與文獻(xiàn)報(bào)道[12]的基本一致,故鑒定該化合物為2-pyrrolecarboxylic acid(2-吡咯甲酸)。
抗菌結(jié)果顯示化合物10在100μg/disc條件下能夠抑制Pyricularia oryzaeHNM 1003的生長(zhǎng),其抑制圈直徑為8 mm,在相同條件下陽(yáng)性對(duì)照多菌靈抑制直徑為30 mm,DMSO 溶劑作為陰性對(duì)照未顯示任何抑制活性。
本文從海洋沉積物來(lái)源的放線(xiàn)菌Streptomycessp.AHMU XC 2026次級(jí)代謝產(chǎn)物中分離到10個(gè)單體化合物,包括6 個(gè)二酮哌嗪(1~6),反式-2-甲基-肉桂酸(7),2-羥基苯乙酸(8),3-吲哚甲醛(9)和2-吡咯甲酸(10),其中化合物7為首次從自然界中分離到的天然產(chǎn)物。對(duì)這些化合物的抗植物病原真菌活性篩選表明,化合物10對(duì)水稻稻瘟真菌Pyricularia oryzaeHNM 1003具有微弱的抑制活性,以它為模板修飾結(jié)構(gòu)進(jìn)而提高抗真菌活性還有挖掘的空間。同時(shí),化合物10為該菌株主要的次級(jí)代謝產(chǎn)物之一,含量較高(3%以上),暗示著該化合物可能還有其它化學(xué)生態(tài)學(xué)功能。