藍康澍 雷柞 何祎雯 高龍鑫 潘傳英 王勇勝*

（1，西北農(nóng)林科技大學動物醫(yī)學院 712100；2，西北農(nóng)林科技大學圖書館 712100；3，西北農(nóng)林科技大學動物科技學院 712100）

微小RNA（microRNA，miRNA）是一種內(nèi)源性、長度為18～25 個核苷酸的非編碼單鏈RNA。1993 年Lee 等首次在其研究中提到Lin-4（miRNA 的一種），由此拉開了對miRNA 研究的序幕[1]。近年來，miRNA 被證實與多種癌癥有關(guān)[2]，因此，逐漸引起人們的重視。miRNA 的出現(xiàn)使得對癌癥早期診斷和治療成為可能，因此，近年來，miRNA 一直是癌癥相關(guān)研究的熱點，關(guān)于miRNA 與癌癥發(fā)生機制的研究層出不窮[3]。但目前對miRNA 的研究只是冰山一角，對其作用機制還存在許多未知，加快對miRNA 的研究有助于進一步了解腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程及其治療手段。

文獻計量學（Bibliometrics）是一門采用數(shù)學、統(tǒng)計學方法對研究文獻等計量指標進行分析，以對某個領(lǐng)域進行有效可視化，進而幫助科研人員分析領(lǐng)域整體趨勢，為該領(lǐng)域的后續(xù)發(fā)展提供不同見解的學科[4]。文獻計量學最早的應(yīng)用可追溯到18世紀，科研人員利用文獻計量學完成對某一領(lǐng)域的基礎(chǔ)文獻統(tǒng)計。隨著文獻計量學在越來越多的領(lǐng)域應(yīng)用，以及使用越趨成熟，文獻計量學的內(nèi)容已從簡單的數(shù)理統(tǒng)計發(fā)展為使用可視化軟件對計量指標進行分析以達到解析研究熱點和預(yù)測發(fā)展趨勢[5,6]。

目前，國內(nèi)外尚未有學者對miRNA 相關(guān)論文發(fā)表進行系統(tǒng)分析，因此，miRNA 相關(guān)研究趨勢及論文發(fā)表情況仍不明確。本文從文獻計量學的角度，基于Web of science（WOS）和中國知網(wǎng)（CNKI）數(shù)據(jù)庫，首次對20 世紀以來miRNA 的相關(guān)論文進行分析，結(jié)合Excel 2019、Citespace 5.6[7]和GraphPad Prism 9.3.0[8]等軟件，從論文發(fā)表量、國家、作者、研究領(lǐng)域等方面進行動態(tài)分析，旨在為未來miRNA 相關(guān)研究提供全新方向及思路。

1 數(shù)據(jù)來源及研究方法

國際miRNA 論文發(fā)表概況分析以WOS 數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ)，對20 世紀以來發(fā)表的相關(guān)文獻進行可視化分析；國內(nèi)miRNA論文發(fā)表概況則以CNKI 數(shù)據(jù)庫為基礎(chǔ)，同樣以2000～2021 年作分析區(qū)間，將miRNA 研究概況具體化。

1.1 國際論文數(shù)據(jù)來源

數(shù)據(jù)源于WOS 核心合集（Web of Science Core Collection），檢索方式為高級檢索-檢索式：TI=（miRNA OR microRNA），索引日期為：2000-01-01 至2021-12-31，檢索日期為2022 年2 月5 日，共檢索出56284 條SCI 論文，其中有23939 篇來自國內(nèi)（通過添加國際/地區(qū)篩選條件）。對論文發(fā)表的國家/地區(qū)和發(fā)表論文質(zhì)量進行進一步分析。

1.2 國內(nèi)論文數(shù)據(jù)來源

由于WOS 數(shù)據(jù)庫不太收錄中文論文，而我國部分論文都發(fā)表在中文期刊，因此，對CNKI 數(shù)據(jù)庫上的論文進行分析，有助于我們更進一步了解國內(nèi)miRNA 相關(guān)研究進展。

在知網(wǎng)中進行專業(yè)檢索，檢索式為：TI=‘miRNA’ +‘microRNA’+‘微小RNA’+‘微RNA’，檢索區(qū)間與WOS 中檢索區(qū)間一致，為2000-01-01 至2021-12-31，檢索日期為2022 年2 月5 日，共檢索出論文25541 篇，對結(jié)果進行可視化分析，進一步得出結(jié)論。

1.3 分析及研究方法

在Web of Science 和中國知網(wǎng)上對相關(guān)關(guān)鍵詞進行檢索，使用網(wǎng)站的可視化分析功能對文章發(fā)表情況（如發(fā)表主題、國家等）進行初步分析，再將數(shù)據(jù)導(dǎo)出至Excel 2019 軟件中進行整理。通過網(wǎng)站輸出的數(shù)據(jù)，利用Citespace 5.6 軟件進行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類分析：從Web of Science 中導(dǎo)出數(shù)據(jù)（文件格式為txt）后，將Citespace 界面的node types 選定為“Keyword”，時間區(qū)間設(shè)為“2000～2021”，時間切片設(shè)為1。在進行正式分析前對數(shù)據(jù)進行預(yù)試驗分析，界面中Top N%（表示每個時間切片引用次數(shù)最多的前N%）設(shè)定為10.0，由于文獻數(shù)量太多，分析結(jié)果的節(jié)點過大且圖譜雜亂交錯，最終選定適宜設(shè)定值為1.0。

2 結(jié)果

2.1 國際發(fā)表論文概況

分析結(jié)果顯示，自20 世紀以來，miRNA 相關(guān)SCI 論文發(fā)表趨勢是先上升后下降。2001～2019 年，miRNA 相關(guān)論文的發(fā)表數(shù)量大幅度提升；但在2019 年后，miRNA 相關(guān)論文的發(fā)表數(shù)量明顯下降，如圖1。

圖1 WOS 數(shù)據(jù)庫20 世紀以來miRNA 相關(guān)論文發(fā)表量變化

從研究方向看，腫瘤學以12146 篇相關(guān)論文在所有miRNA 相關(guān)SCI 論文中占比最大（21.58%），遠超于第二名生物化學/分子生物學（相關(guān)論文7985，占總發(fā)表論文數(shù)的14.187%）和第三名細胞生物學（相關(guān)論文7266 篇，占總發(fā)表論文數(shù)12.91%）。

在miRNA 相關(guān)論文發(fā)表的國家中，中國以23939 篇占總發(fā)表論文的42.53%，遠超于第二名的美國（發(fā)表論文14445篇，占總發(fā)表論文的25.66%）和第三名的德國（發(fā)表論文2841篇，占總發(fā)表論文的5.09%），見表1；此外，在發(fā)表miRNA相關(guān)論文的作者中，發(fā)表論文數(shù)前十名都來自我國；在基金資助機構(gòu)方面，我國國家自然科學基金委員會資助相關(guān)論文10500 篇，占所有論文數(shù)的18.66%，見表2。

表1 國際miRNA 相關(guān)論文發(fā)表數(shù)Top 10 國家

表2 國際miRNA 相關(guān)論文發(fā)表數(shù)Top 5 基金資助機構(gòu)

論文發(fā)表數(shù)量不能作為單一衡量指標，所發(fā)表論文的質(zhì)量也需要受到重視。為更準確衡量國家之間miRNA 發(fā)表論文的質(zhì)量，筆者通過添加“高被引論文or 熱點論文”和“國家/地區(qū)”條件進行進一步分析，發(fā)現(xiàn)我國發(fā)表的文章篇均被引頻次為207.52 次，h 因子（h-index，h 因子為N 則表示有N 篇論文分別被引用了至少N 次）達99，與其他兩個論文發(fā)表數(shù)前三的國家相比仍有一定差距；美國發(fā)表miRNA 相關(guān)SCI 論文篇均被引頻次為364.82，h 因子為127；德國發(fā)表miRNA 相關(guān)SCI 論文篇均被引頻次為370.38，h 因子為42。

2.2 國內(nèi)發(fā)表論文概況

根據(jù)CNKI 數(shù)據(jù)庫可視化分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)，2006 年以前，我國miRNA 有關(guān)中文論文發(fā)表數(shù)量較少，每年發(fā)表數(shù)量均在100 篇以下，2006 年以后論文發(fā)表數(shù)進入增長期，2018 年論文發(fā)表數(shù)出現(xiàn)短暫下降，但總體保持穩(wěn)定；2019 年后，論文發(fā)表數(shù)量明顯下降，參見圖2。由此可見，基于CNKI 數(shù)據(jù)庫論文可視化的分析，我國發(fā)表在中文期刊的miRNA 相關(guān)論文數(shù)量變化趨勢與國際miRNA 相關(guān)SCI 論文發(fā)表變化趨勢大致一致。

圖2 20 世紀以來中文期刊miRNA 相關(guān)論文發(fā)表數(shù)量趨勢

從論文主要主題分布情況看，除去miRNA 本身名稱主題（miRNA、miRNAs、微RNAs 等），我國對miRNA 的研究主題主要為靶基因、差異表達、細胞凋亡、細胞增殖等；“靶基因”關(guān)鍵詞占比較高的原因是近年來許多研究人員都開始將重點放在具體miRNA 的靶基因預(yù)測和挖掘上，如梁學振等[9]和張寧芳等[10]的研究，以及高陽[11]對miR-202 的靶基因預(yù)測以進一步miR-202 對早期胚胎影響的研究?！安町惐磉_”主題體現(xiàn)了miRNA 的差異表達對細胞生理過程及疾病過程的影響，如曲蕾對miR-202 差異表達的研究[12]。而“細胞凋亡”“細胞增殖”等代表miRNA 通過調(diào)節(jié)不同靶基因表達而形成的影響。

從學科分布看，發(fā)表在中文期刊的miRNA 相關(guān)論文大多都與腫瘤學相關(guān)，腫瘤學以10435 篇論文處于絕對數(shù)量優(yōu)勢，甚至超過其他前五名學科發(fā)表論文數(shù)的總和（心血管系統(tǒng)疾病相關(guān)論文2310 篇，生物學相關(guān)論文2196 篇，基礎(chǔ)醫(yī)學相關(guān)論文1678 篇，婦產(chǎn)科學相關(guān)論文1385 篇），而且其他學科分布相對均勻，如婦產(chǎn)科學、泌尿科學、消化系統(tǒng)疾病等，參見圖3。這與miRNA 參與各系統(tǒng)器官腫瘤調(diào)控有密切關(guān)系，如Sun等[13]和巫夢雪[14]等對miRNA 與卵巢癌關(guān)系的研究，李亞男等[15]和李杰[16]等對消化系統(tǒng)癌癥的研究。

圖3 20 世紀以來中文期刊miRNA 相關(guān)論文學科分布Top 20（來源：中國知網(wǎng)）

2.3 關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類分析

筆者進一步使用Citesapce 軟件對國外miRNA 相關(guān)發(fā)表論文進行關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類分析，根據(jù)Citespace 分析結(jié)果得出出現(xiàn)頻率最高的前十個關(guān)鍵詞，見表3。

表3 Citespace 分析得出出現(xiàn)頻率最高的關(guān)鍵詞前10

在關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜中，節(jié)點大小與該詞出現(xiàn)的頻數(shù)成正比，圖譜中關(guān)鍵詞“expression”出現(xiàn)的頻數(shù)最多，結(jié)合miRNA 功能分析得出miRNA 的差異表達仍是國際miRNA 相關(guān)研究的重點，miRNA 在癌癥中的差異表達（過表達或者表達下調(diào)）可以調(diào)控癌癥的發(fā)生發(fā)展。關(guān)鍵詞“proliferation”出現(xiàn)的高頻率很可能與miRNA 對癌癥的增殖擴散作用有關(guān)，這一點也可與關(guān)鍵詞“cancer”的高頻出現(xiàn)相聯(lián)系，見圖4。綜合可得，miRNA 相關(guān)研究的重點仍與癌癥緊密相關(guān)。

圖4 miRNA 相關(guān)論文關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析圖譜

用關(guān)鍵詞聚類分析以對聯(lián)系緊密的關(guān)鍵詞進行聚類，共得出7 個聚類。聚類圖譜的聚類模塊值（Q 值）為0.3674，聚類結(jié)構(gòu)顯著[17]。由聚類圖譜可得，#0 上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT）是最主要的研究方向，EMT 也與癌癥緊密相關(guān)（EMT 與腫瘤轉(zhuǎn)移機制有關(guān)）。此外，#2 再灌注損傷也是miRNA 相關(guān)研究的熱點之一，說明miRNA 在除腫瘤、癌癥外的其他機體疾病、損傷過程也有重要的調(diào)控功能[18]，見圖5。

圖5 關(guān)鍵詞聚類圖譜

3 總結(jié)與展望

本研究利用文獻計量學的方法對20 世紀以來國際和國內(nèi)miRNA 相關(guān)發(fā)表論文趨勢進行梳理，從發(fā)文量、基金資助機構(gòu)、發(fā)文作者和發(fā)文作者等角度進行深入分析，為將來miRNA 研究趨勢提供參考。通過分析得出以下結(jié)論。

從國際和國內(nèi)miRNA 發(fā)表論文的趨勢看，miRNA 的研究熱度處于總體上升的趨勢，由于miRNA 能調(diào)控靶基因的表達，在細胞生理過程和疾病過程中扮演重要角色，人們逐漸重視對miRNA 的研究。國內(nèi)miRNA 相關(guān)研究的不斷發(fā)展離不開國家基金的支持，從論文基金支持機構(gòu)看，我國國家自然科學基金共資助10500 篇miRNA 相關(guān)研究的論文發(fā)表，占總論文發(fā)表數(shù)的18.656%。2010 年，國家自然科學基金成立了“非編碼RNA 與腫瘤發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)歸”的重點項目立項領(lǐng)域[19]，這極大程度推動了國內(nèi)miRNA 研究領(lǐng)域的發(fā)展。國內(nèi)許多miRNA 相關(guān)項目受到資助后[20,21]，相關(guān)研究人員開始對miRNA 進行進一步研究，miRNA 的生理功能及其作用機理被不斷挖掘。有學者對國家自然科學基金在中醫(yī)內(nèi)科學領(lǐng)域立項項目的研究熱點進行分析，發(fā)現(xiàn)在1997～2019 年國家自然科學基金在中醫(yī)內(nèi)科學領(lǐng)域中立項的1751 項項目中，主題詞miRNA 以155 次的出現(xiàn)頻率位居第二，僅次于信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路(791次)[22]。相較于美國等發(fā)達國家，我國科研起步雖然相對較晚，但通過后續(xù)發(fā)展過程中的基金資助及研究人員的不斷努力，我國在各領(lǐng)域的研究均已處于領(lǐng)先地位，在miRNA 相關(guān)領(lǐng)域，我國論文發(fā)表情況現(xiàn)已位居第一。

2019 年之后miRNA 相關(guān)研究出現(xiàn)了相對滯后的現(xiàn)象，推測為2019 年爆發(fā)的新冠肺炎疫情對各領(lǐng)域都帶來了重大沖擊，包括科研領(lǐng)域，何禮邦等[23]對國際山羊相關(guān)論文發(fā)表態(tài)勢的分析中也提到，由于疫情影響，相關(guān)領(lǐng)域的研究論文呈下降態(tài)勢。但這在后疫情時代的不斷調(diào)整后會有所改善，筆者預(yù)測，在今后幾年，miRNA 相關(guān)研究發(fā)展趨勢會逐步回歸正軌。值得一提的是，我國在國際上發(fā)表的miRNA 相關(guān)論文數(shù)最多。此外，在miRNA 發(fā)表論文的基金資助機構(gòu)中，中國國家自然科學基金資助力度最大，說明我國對miRNA 研究的重視。但在論文水平上，從熱點文章被引頻次和h 因子看，我國相對其他發(fā)達國家（如美國和德國）仍有一定差距，只有后續(xù)不斷提高研究和論文質(zhì)量，我國在國際miRNA 相關(guān)領(lǐng)域中才能更具有話語權(quán)。在研究主題方面，國內(nèi)外miRNA 研究側(cè)重點各不相同，國外研究更側(cè)重于研究miRNA 在各類腫瘤、癌癥中的調(diào)控作用；而國內(nèi)則側(cè)重于miRNA 調(diào)控機理，如探究其“靶基因”，引起“細胞凋亡”、“細胞增殖”等。對miRNA 機理的探究固然對深入全面了解miRNA 有重要意義，但也要注意綜合其機理及其內(nèi)涵、應(yīng)用，防止出現(xiàn)對領(lǐng)域內(nèi)涵理解不深刻，盲目追求研究熱點，過度強調(diào)細胞信號通路等微觀分子機制問題[22]。在國內(nèi)研究方面，miRNA 研究學科分布較廣，miRNA 在各系統(tǒng)的研究都有涉及。此外，通過關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析和聚類分析可知，miRNA 相關(guān)研究熱點仍與腫瘤、癌癥相關(guān)，說明未來miRNA 相關(guān)研究重點可能仍與腫瘤和癌癥相關(guān)，miRNA 很可能通過相似的機制對腫瘤、癌癥的發(fā)生發(fā)展進行調(diào)控，研究miRNA 部分調(diào)控機制，可以為miRNA 在其他疾病的研究提供可靠思路。此外，根據(jù)關(guān)鍵詞聚類分析結(jié)果，再灌注損傷作為現(xiàn)階段miRNA 相關(guān)研究的熱點之一（僅次于腫瘤），很可能在未來發(fā)展為miRNA 主要的研究主題。

目前，國內(nèi)外對miRNA 的研究大部分還停留在理論層面，在實踐應(yīng)用方面還有待進一步的提升。只有將miRNA 相關(guān)研究理論應(yīng)用到實踐，為疾病診斷和治療提供新技術(shù)，才能深化miRNA 相關(guān)的研究意義，進一步造福人類。