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        基于網(wǎng)絡藥理學研究燈盞花素抗胰腺癌的分子機制研究

        2022-07-15 07:44:38戰(zhàn)楚婷張境豐陳夢池劉江華
        嶺南急診醫(yī)學雜志 2022年3期
        關(guān)鍵詞:分析研究

        戰(zhàn)楚婷 張境豐 陳夢池 劉江華

        燈盞細辛,為菊科植物短葶飛蓬的干燥全草,主要分布在我國云貴高原。燈盞花素(Breviscapine,BVP)是燈盞細辛主要成分之一,屬于黃酮類化合物,臨床上主要用于治療心腦血管系統(tǒng)[1]等疾病。胰腺癌(Pancreatic cancer,PC)惡性程度高,5年生存率極低,其診斷與治療一直是難點[2]。研究證實,BVP 有關(guān)抗腫瘤中作用,例如在胃癌中通過調(diào)控PTEN/PI3K 通路抑制上皮細胞-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化[3],在非小細胞肺癌[4]中改善耐藥。而BVP 在PC 中鮮有研究。本研究利用網(wǎng)絡藥理學結(jié)合實驗的模式,探討治療PC 的潛在靶點和初步機制,為中醫(yī)藥防治PC 提供理論和實踐基礎。

        1 臨床資料

        1.1 靶點篩選、藥物-作用靶點-通路網(wǎng)絡的構(gòu)建和富集分析通過SwissTargetPrediction 等數(shù)據(jù)庫獲得BVP 靶點;利用Gencard 等數(shù)據(jù)庫獲得PC 相關(guān)靶點。將相關(guān)靶點導入Cytoscpe3.7.2 構(gòu)建藥物-靶點-通路圖(見圖3)。將圖2 中得到的靶點導入STRING(https://string?db.org/)數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用(protein?protein interaction,PPI)網(wǎng)絡;使用Metascape(https://Metascape.ncifcrf.gov/)對共同靶點進行對共同靶點進行基因本體(Gene Ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes.,KEGG)富集分析。

        1.2 細胞培養(yǎng)人胰腺癌BXPC?3 細胞培養(yǎng)在溫度:37℃,5%CO2,用10%胎牛血清、1%青鏈霉素混合液的RIPM?1640 培養(yǎng),正常培養(yǎng)細胞為對照組;而相同條件下用BVP 濃度為800 μmol/L 干預BXPC?3 細胞為實驗組。

        1.3 透射電鏡觀察細胞超微結(jié)構(gòu)收集培養(yǎng)48小時對數(shù)生長期對照組與實驗組細胞,經(jīng)入固定液4℃固定過夜,用1%的鋨酸4℃下固定2 h,磷酸緩沖液PBS(PH7.4)漂洗3 次,經(jīng)梯度脫水、滲透、包埋、切片、染色,最后置于電鏡觀察,采集圖像下并分析。

        1.4 流式細胞術(shù)檢測凋亡收集培養(yǎng)48 小時對數(shù)生長期對照組與實驗組細胞,各約5*105個/管。根據(jù)試劑盒說明書染色,孵育30 min。過濾后,上機檢測。

        1.5 WB 檢測凋亡相關(guān)蛋白的表達取培養(yǎng)48小時對數(shù)生長期對照組與實驗組細胞六孔板細胞,棄上清,PBS 洗滌,加入裂解液置于冰上,30 min后,超聲、離心留上清、BCA 法檢測濃度。經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉、一抗、二抗孵育,收集圖像信息。

        1.6 統(tǒng)計學分析采用SPSS 26.0 進行數(shù)據(jù)分析,符合正態(tài)分布的連續(xù)數(shù)值型變量用(±s)表示,兩組間比較采用t檢驗;以P<0.05 表示差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 BVP的化學結(jié)構(gòu)式 見圖1。

        圖1 BVP 化學結(jié)構(gòu)式(3D)

        2.2 BVP靶點和PC 靶點 共獲得49 個BVP 作用基因靶點,4146 個PC 相關(guān)基因靶點信,利用veny 網(wǎng)站對共同靶點取交集后得到共同靶點30個,見圖2。

        圖2 BVP 抗PC 韋恩圖

        2.3 構(gòu)建藥物-靶點-通路圖及PPI蛋白作用網(wǎng)絡 使用Cytoscape 3.7.2 構(gòu)建藥物-靶點-通路網(wǎng)絡,見圖3;對“2.2”中得到的靶點構(gòu)建PPI 網(wǎng)絡(見圖4)。

        圖3 BVP-靶點-通路圖

        圖4 蛋白相互作用網(wǎng)絡圖

        2.4 共同靶點的富集分析本使用METASCAPE對靶點進行GO 富集分析和KEGG 通路富集分析,GO 富集分析使用氣泡圖進行可視化(圖5),KEGG通路富集分析使用柱狀圖進行可視化(圖6)。

        圖5 共同靶點GO 富集分析

        圖6 共同靶點KEGG 通路富集分析

        2.5 透射電鏡觀察結(jié)果電鏡下對照組細胞形態(tài)規(guī)則,細胞膜完整,細胞核較大、核膜完整、核仁清晰,線粒體結(jié)構(gòu)清晰。實驗組組細胞排列松散,細胞膜表面微絨毛消失,細胞核呈畸形改變,線粒體嚴重腫脹、嵴減少,可見的凋亡小體。(見圖7)

        圖7 藥物處理后BXPC-3 的超微結(jié)構(gòu)(注:A 對照組,B 實驗組)

        2.6 流式細胞術(shù)細胞凋亡分析結(jié)果示對照組和實驗組BXPC?3 細胞凋亡比率分別為(2.47±0.23)%、(58.81.84±10.01)% ;兩組相比,有顯著差異(P<0.05)。(見圖8)。

        圖8 BVP 作用BXPC?3 細胞凋亡情況(圖8a 對照組凋亡;圖8b 實驗組凋亡)

        2.7 WB檢測凋亡相關(guān)蛋白 與對照組相比,經(jīng)BVP 處理48 h 后實驗組BXPC?3 細胞抗凋亡蛋白Bcl?2 顯著降低,TNF?α 表達顯著升高,均有差異(P<0.05)(見圖9)。

        圖9 Bcl?2、TNF?α 蛋白表達

        3 討 論

        PC 惡性程度高,5 年生存率極低[5]。目前早期PC 治療以手術(shù)為主,但多數(shù)患者被確診時已喪失手術(shù)機會或治療效果不佳[7]。有研究顯示中草藥在PC 治療中發(fā)揮著延長患者中位生存時間等優(yōu)勢[8]。

        BVP 是一種天然黃酮類化合物。研究顯示BVP 具有抗癌作用[9-11]。本研究共篩選出BVP 的共同靶點30 個;通過GO 富集分析共同基因靶點在生物學過程、細胞組分和分子功能這三個方面富集的條目分別是14、6、7,可能參與免疫反應、凋亡過程、蛋白質(zhì)結(jié)合、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、酶的結(jié)合等多個方面;KEGG 通路富集分析顯示共同靶點富集在6 個KEGG 信號通路,包括癌癥通路、PI3K?AKT、HIF?1、MAPK、NF?κB、P53 等信號通路,其中PI3K?AKT 通路表現(xiàn)出較高程度的富集,表明BVP 在抗PC 中起著重要作用。有研究提示PI3K?AKT 的異常激活狀態(tài),會導致腫瘤更易發(fā)生侵襲和凋亡[15-16]。

        研究顯示PI3K?AKT 通路的異常激活與PC 發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),沉默該通路的下游基因Girdin可降低p?AKT 和p?PI3K 水平,增加PC 細胞凋亡并誘導細胞周期停滯[17]。PI3K?AKT 通路異常也被證實與PC 患者總生存期較差有關(guān)[19]。越來越多的證據(jù)顯示,PI3K?AKT 通路參與調(diào)控細胞周期和凋亡[20]。本研究關(guān)注BVP 是否對PC 發(fā)揮抗腫瘤效應,基于網(wǎng)絡藥理學基礎進一步驗證:首先電鏡下觀察發(fā)現(xiàn),給藥后細胞體積變小,細胞膜微絨毛消失,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、線粒體等細胞器均發(fā)生改變,可見凋亡小體。應用流式細胞術(shù)結(jié)果顯示BVP 干預后,可明顯誘導凋亡。最后又通過WB 發(fā)現(xiàn)BVP處理后能夠下調(diào)BXPC?3 細胞抗凋亡蛋白Bcl?2 表達。目前已證實:PI3K/AKT 信號傳導通路可調(diào)控Bcl?2 家族;AKT 磷酸化Bad ,引起B(yǎng)ad 與14?3?3 蛋白結(jié)合,阻止其與抗凋亡蛋白Bcl?2 和Bcl?XL 的相互作用,發(fā)揮促進凋亡作用[20];也有研究證實:體外條件下TNF?α 能夠誘導胃癌細胞[21]的凋亡,在本研究中BVP 處理后BXPC?3 細胞發(fā)生凋亡,同時TNF?α 表達上調(diào),二者之間可能存在某種聯(lián)系,需進一步驗證。綜合以上,提示BVP 可能是通過抑制PI3K?AKT 信號通路發(fā)揮抗腫瘤效應。

        總之,本研究從網(wǎng)絡藥理學和體外實驗的角度,篩選BVP 治療PC 的相關(guān)靶點及信號通路。已初步闡明了BVP 的關(guān)鍵靶點,推測BVP 可能通過調(diào)控PI3K?AKT 通路發(fā)揮抗腫瘤效應,下一步研究中將對體內(nèi)實驗加以驗證,為BVP 治療PC 提供更多可靠的理論依據(jù)。

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