龍 瑩,李 偉,潘 軍,馮作山,3
(1. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所,湖北 武漢 430062;2. 湖北嘉博文生物科技有限公司,湖北 武漢 430071;3. 北京嘉博文生物科技有限公司,北京 100015)
根際是指圍繞在植物根系附近的土體[1],此類土體理化性質(zhì)易受植物生長(zhǎng)影響。根際微生物即根際區(qū)域內(nèi)微生物,在受到植物根系影響的同時(shí),也能介導(dǎo)植物生理和代謝調(diào)節(jié)[2]。根際微生物通過(guò)與植物根系相互作用,對(duì)植物生長(zhǎng)[3]、根系養(yǎng)份吸收[4]、植物抗病[5]、次生代謝物生產(chǎn)[1]、土壤污染治理[6]等方面起關(guān)鍵作用。正確調(diào)控根際微生物能促進(jìn)植物宿主營(yíng)養(yǎng)吸收、提高對(duì)病蟲害等生物脅迫和環(huán)境脅迫的適應(yīng)能力[7],研究根際微生物與植物互作對(duì)于農(nóng)業(yè)發(fā)展具有重要意義。依據(jù)CNKI 數(shù)據(jù)庫(kù)顯示,從1988—2021年間,國(guó)內(nèi)目前針對(duì)于該領(lǐng)域研究相關(guān)期刊文獻(xiàn)僅有500 余篇,相較農(nóng)業(yè)其他領(lǐng)域而言其研究基礎(chǔ)相對(duì)薄弱。筆者通過(guò)梳理國(guó)內(nèi)外研究發(fā)展趨勢(shì)、研究熱點(diǎn)、高產(chǎn)研究機(jī)構(gòu)及作者等關(guān)鍵指標(biāo),可對(duì)該領(lǐng)域研究進(jìn)行全面認(rèn)知。
文獻(xiàn)計(jì)量法是指通過(guò)數(shù)學(xué)與統(tǒng)計(jì)學(xué)方法,對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行定量化分析[8],通過(guò)數(shù)據(jù)分析可從中找出變化規(guī)律,進(jìn)而預(yù)測(cè)其未來(lái)的發(fā)展趨勢(shì)[9],目前已廣泛應(yīng)用于農(nóng)學(xué)、醫(yī)學(xué)、社會(huì)學(xué)、廣告學(xué)等[10-16]諸多領(lǐng)域。王晴等基于Web of Science 數(shù)據(jù)庫(kù),用文獻(xiàn)計(jì)量法分析了1990—2020 年有機(jī)污染土壤和地下水生物修復(fù)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)及趨勢(shì)[17]。范利超等對(duì)中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)(CNKI)和Web of Science 核心合集數(shù)據(jù)庫(kù)中關(guān)于土壤微塑料研究領(lǐng)域的國(guó)內(nèi)外文獻(xiàn)進(jìn)行計(jì)量分析,了解了微塑料在土壤環(huán)境中的研究狀況[18]。筆者利用Web of Science 核心數(shù)據(jù)庫(kù),收集1991 年1 月—2021 年8 月期間根際微生物與植物相關(guān)研究文獻(xiàn),借助Web of Science 數(shù)據(jù)庫(kù)自帶分析工具、CiteSpace 知識(shí)圖譜分析軟件、VOSviwer 可視化分析軟件、SPSS統(tǒng)計(jì)分析軟件、Excel 作圖等對(duì)文獻(xiàn)進(jìn)行全面分析[19-27],可了解根際微生物與植物互作的研究現(xiàn)狀與未來(lái)趨勢(shì),以期為根際微生物與植物互作相關(guān)的研究提供參考與指導(dǎo)。
數(shù)據(jù)來(lái)源于Web of Science 數(shù)據(jù)庫(kù)核心合集,檢索時(shí)間為1991 年1 月—2021 年8 月,主題定義為“Rhizosphere microorganism*”AND “Plant* interaction*”,文獻(xiàn)類型設(shè)置為“Article Review”,語(yǔ)言設(shè)置為“English”,共計(jì)獲得微生物與植物互作的相關(guān)文獻(xiàn)1 134 篇,文獻(xiàn)以“其他格式”進(jìn)行下載并保存以待分析。
利用WOS 自帶數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析功能,分析近30年來(lái)(1991 年1 月—2021 年8 月)土壤微生物與植物互作相關(guān)的文章,對(duì)研究作者、研究機(jī)構(gòu)、國(guó)家、各時(shí)間段發(fā)表篇幅、發(fā)表刊物等進(jìn)行計(jì)量分析。結(jié)合VOSviewer 1.6.16、CiteSpace 5.7.R5W、SPSS 19.0 和Excel 2019 等工具進(jìn)行圖表繪制及統(tǒng)計(jì)分析。
發(fā)文量可以從某一程度反映相關(guān)研究在科學(xué)領(lǐng)域受關(guān)注的程度和熱度,也能反映該研究領(lǐng)域的發(fā)展速度和研究前景。從WoS 數(shù)據(jù)庫(kù)檢索獲取的近30 a 來(lái)土壤微生物與植物互作相關(guān)的年度發(fā)文分布情況看,1991—2005 年每年文獻(xiàn)量均不超過(guò)20 篇,年發(fā)文量較平穩(wěn),處于起步研究階段;2006—2017 年間年發(fā)文量雖有波動(dòng)但整體處于緩慢上升階段,2006 年的年發(fā)文量為24 篇,2017 年的年發(fā)文量增至80 篇;2017年以來(lái)為快速發(fā)展階段,2017—2020 年的發(fā)文量平均增長(zhǎng)率為28.03%。從發(fā)文量來(lái)看,人們對(duì)根際微生物和植物互作的關(guān)注度越來(lái)越高。采用SPPS 19.0 時(shí)間序列預(yù)測(cè)法,預(yù)測(cè)2021 年發(fā)文量達(dá)192 篇。
從數(shù)據(jù)中提取國(guó)家的發(fā)文量可以看出此國(guó)家對(duì)該領(lǐng)域的重視程度及技術(shù)需求。表1 顯示排名前10 位發(fā)文量的國(guó)家依次為中國(guó)、美國(guó)、德國(guó)、法國(guó)、印度、意大利、荷蘭、加拿大、西班牙和澳大利亞,占世界總發(fā)文量的88.71%。前3 位的中國(guó)、美國(guó)、德國(guó)占世界總發(fā)文量的49.21%。從首次發(fā)文時(shí)間來(lái)看,美國(guó)、法國(guó)相關(guān)研究較早,中國(guó)最晚。通過(guò)CiteSpace 對(duì)文量前10 位發(fā)的國(guó)家間合作關(guān)系網(wǎng)分析,如圖1 所示,整體而言,各國(guó)家間均存在不同層次合作關(guān)系,其中,美國(guó)、德國(guó)、新西蘭、加拿大4 國(guó)與其余9 國(guó)均有合作關(guān)系。中介中心位代表對(duì)該研究領(lǐng)域的影響度大小,中心位值越大影響越大,聚類圖中圓點(diǎn)越大。由表1及圖1 可看出,德國(guó)影響度最高,其次為美國(guó),再次為法國(guó),最后為中國(guó),由此可知,我國(guó)發(fā)文量雖最多但影響力并不強(qiáng)。
表1 前10 位累計(jì)發(fā)文量國(guó)家
圖1 發(fā)文量前10 位的國(guó)家間合作關(guān)系
近30 a 來(lái)本領(lǐng)域涉及研究機(jī)構(gòu)有1 378 家,其中發(fā)文量前10 位的有29 家,占總發(fā)文量40%。如表2所示,發(fā)文量前5 位的機(jī)構(gòu)有中國(guó)科學(xué)院、西班牙國(guó)家研究委員會(huì)、哥廷根大學(xué)、西澳大利利亞大學(xué)、美國(guó)農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究局、法國(guó)國(guó)家農(nóng)業(yè)研究科學(xué)院、加利福尼亞大學(xué)伯克利分校、俄羅斯科學(xué)院、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國(guó)科學(xué)院大學(xué)、瓦格寧根大學(xué)共計(jì)11 家,發(fā) 文 量 分 別 為57、32、22、19、19、19、16、16、16、16、16 篇。其中美國(guó)農(nóng)業(yè)部農(nóng)業(yè)研究局相關(guān)研究最早,中國(guó)科學(xué)院研究最晚。
表2 前10 位發(fā)文量的研究機(jī)構(gòu)
經(jīng)VOSviewer 對(duì)發(fā)文量第一的中國(guó)科學(xué)院做合作網(wǎng)絡(luò)分析,結(jié)點(diǎn)間距離越短表明兩單位合作越緊密,由圖2 可知,中國(guó)科學(xué)院與中國(guó)科學(xué)院大學(xué)、科隆大學(xué)、法國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院、瓦格寧根大學(xué)、亥姆霍茲環(huán)境研究中心、哥廷根大學(xué)、霍恩海姆大學(xué)、俄羅斯科學(xué)院、圣保羅大學(xué)、西澳大利亞大學(xué)、西班牙國(guó)家研究委員會(huì)、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)和西北農(nóng)林大學(xué)這14 家單位合作密切。
圖2 中國(guó)科學(xué)院合作單位網(wǎng)絡(luò)
研究作者數(shù)量可以反應(yīng)某一領(lǐng)域研究現(xiàn)狀,核心作者則能體現(xiàn)其對(duì)領(lǐng)域貢獻(xiàn)力。本領(lǐng)域研究作者有5 014 位,依據(jù)普萊斯核心作者定律M=0.749×(nmax)(1/2),M 值為3.35 即發(fā)文4 篇以上的為核心作者,總計(jì)有77 位。居前5 位的作者分別為Yakov kuzyakov(哥廷根大學(xué))、R Azcon(西班牙國(guó)家研究委員會(huì))、林文雄(福建農(nóng)林大學(xué));Berg Gabriele(格拉茨技術(shù)大學(xué))和Larsen John(墨西哥國(guó)立自治大學(xué)),發(fā)文量分別為20、12、11、9 和9 篇。
通過(guò)VOSviewer 對(duì)77 位核心作者間合作關(guān)系分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)僅有18 位作者存在合作關(guān)系,且形成4個(gè)核心合作團(tuán)體,具體結(jié)果見(jiàn)圖3。第一合作團(tuán)隊(duì)以Kuzyakov yakov 為核心,第二合作團(tuán)隊(duì)以Richardson alane 為核心,第三合作團(tuán)隊(duì)以Zhou Jinzhong 為核心,第四合作團(tuán)隊(duì)以Lemanceau philippe 為核心。
圖3 核心作者間合作網(wǎng)
期刊分布分析有助于檢索者快速獲取該研究領(lǐng)域的核心期刊,從而更快捷獲取研究相關(guān)文獻(xiàn),了解研究現(xiàn)狀。表3 為發(fā)文量排名前10 位的期刊。其中前5 位期刊占總發(fā)文量的23.19%。影響因子最高的期刊為New Phytologist,影響因子為10.151,刊文量17 篇,排名第9 位,占總發(fā)文量的1.5%。發(fā)文量與被引量均靠前則能表明某一期刊對(duì)該領(lǐng)域的持續(xù)性關(guān)注度越高、貢獻(xiàn)也越大。由表3 可以看出,Plant and Soil,Soil Biology & Biochemistry,F(xiàn)ems Microbiology Ecology 3 大期刊在發(fā)文量及引文量均在前5 位,其中Plant and Soil 兩者均排第1 位,表明此刊物為微生物與植物互作研究領(lǐng)域主流研究期刊。
表3 發(fā)文量前10 位的期刊
關(guān)鍵詞是對(duì)文章主要內(nèi)容的凝練與總結(jié),精煉準(zhǔn)確地反映了文章的核心。關(guān)鍵詞出現(xiàn)的頻率及被引次數(shù)越高,說(shuō)明該關(guān)鍵詞相關(guān)主題受關(guān)注度越高。通過(guò)VOSviewer 分析,獲取了關(guān)鍵詞的被引次數(shù),前10 位的高頻關(guān)鍵詞列于表4。由表可看出,前3 位高頻詞為“根際”“多樣性”“土壤“,分別被引464、192、191 次。土壤微生物多樣性、植物根際效應(yīng)、植物生長(zhǎng)等為該領(lǐng)域研究高關(guān)注詞。以“氮” “植物修復(fù)” “植物與微生物互作”等關(guān)鍵詞相關(guān)研究關(guān)注度也很高。
表4 高頻關(guān)鍵詞
1991—2021 年以6 a 為一個(gè)切片,經(jīng)CiteSpace中LLR 聚類分析后,30 a 間已形10 個(gè)主題(圖4),主要分布在4 個(gè)時(shí)間段,分別為:1991—1995 年,此階段出現(xiàn)4 個(gè)主題,研究熱點(diǎn)為根際細(xì)菌、氮素、叢枝菌根;1996—2001 年,此階段出現(xiàn)5 個(gè)主題,依次為叢枝菌根、草原、溶磷、生物防控、根際;2007—2011 年,此階段以擬南芥為研究主題;2017—2021年,出現(xiàn)一個(gè)“共生網(wǎng)絡(luò)”主題。由此可見(jiàn),本領(lǐng)域隨時(shí)間推移已從單一功能研究逐漸向全方位網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理研究轉(zhuǎn)移。此外,結(jié)合高被引文獻(xiàn)分析可以看出,作者Hodge Angela、Jones DL、Larsen J 與Gianninazzipearson V 對(duì)“叢枝菌根”類主題類研究貢獻(xiàn)大;作者Barea J M 對(duì)“溶磷根細(xì)菌”類主題研究貢獻(xiàn)大;Mawdsley J L 對(duì)“草坪”類主題研究貢獻(xiàn)大,Picard C 對(duì)“生物防控”主題研究貢獻(xiàn)大;Davide Bulgarelli 對(duì)“擬南芥”為主題類研究貢獻(xiàn)大;Sasse Joelle與R Core Team對(duì)“共生網(wǎng)絡(luò)”主題類研究貢獻(xiàn)大。
圖4 主題發(fā)展趨勢(shì)
從該領(lǐng)域各年份總發(fā)文量來(lái)看,2017 年前處于緩慢發(fā)展階段,2017 年后是領(lǐng)域快速上升階段,表明當(dāng)前是此領(lǐng)域發(fā)展優(yōu)勢(shì)期。我國(guó)在此領(lǐng)域發(fā)文量最多但影響力排名則為第4 位,說(shuō)明其影響力并不高。前10 位研究機(jī)構(gòu)有28 家,其中,國(guó)內(nèi)研究機(jī)構(gòu)有中國(guó)科學(xué)院、中國(guó)科學(xué)院大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、福建農(nóng)林大學(xué)、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院6 家,美國(guó)有5 家,德國(guó)有4 家,荷蘭有4 家,這4 國(guó)研究機(jī)構(gòu)合計(jì)占總機(jī)構(gòu)量67%,說(shuō)明這4 國(guó)研究機(jī)構(gòu)為該領(lǐng)域貢獻(xiàn)主體。
Yakovkuzyakov(哥廷根大學(xué))、R Azcon(西班牙國(guó)家研究委員會(huì))、林文雄(福建農(nóng)林大學(xué))為本領(lǐng)域發(fā)文量最多的前3 位核心作者。而Roeland L Berendsen等[28]發(fā)表的題為“The rhizosphere microbiome and plant health”與Harsh P Bais 等[29]發(fā)表的題為“The role of root exudates in rhizosphere in the ractions with plantd and other organisms”2 篇綜述文章引用率最高,對(duì)領(lǐng)域發(fā)展概況具有較好指導(dǎo)意義。
“根際”“多樣性”以及“土壤”為該領(lǐng)域高頻關(guān)鍵詞,而“共生網(wǎng)絡(luò)關(guān)系”研究則是近年來(lái)熱點(diǎn)研究主題。當(dāng)前領(lǐng)域主要學(xué)科方向?yàn)檗r(nóng)學(xué)、植物學(xué)、微生物學(xué)、環(huán)境生態(tài)學(xué)、生物應(yīng)用微生物學(xué)等。從發(fā)文量與被引頻次綜合來(lái)看,“Plant and Soil”“Soil Biology& Biochemistry”“Fems Microbiology Ecology”屬于該領(lǐng)域綜合力靠前刊物。
根際微生物和植物互作的相關(guān)研究雖有一定的成果,但目前仍處于操控植物根際微生物的早期階段[30-31]?,F(xiàn)階段,不少研究主要分析單驅(qū)動(dòng)因子對(duì)根際微生物的影響,還不足以闡明高度復(fù)雜的根際微生物組作用機(jī)制[32-33]。依據(jù)CiteSpace 突顯分析,未來(lái)將以“植物微生物群” “細(xì)菌”“生態(tài)學(xué)”“多樣性”“豐度”“脅迫”“次生代謝物”“高通量測(cè)序”為核心詞展開(kāi)相關(guān)研究,利用生物信息學(xué)、基因組學(xué)、分子學(xué)、宏基因組學(xué)、宏轉(zhuǎn)錄組、宏蛋白質(zhì)組學(xué)及群落代謝組學(xué)等[34]學(xué)科研究技術(shù)手段綜合闡述根際微生物宏觀調(diào)控機(jī)制。結(jié)合模式植物和模式微生物群落可能會(huì)更快地揭示其互作機(jī)制。通過(guò)充分認(rèn)識(shí)根際微生物組裝配過(guò)程的驅(qū)動(dòng)因素,探索其與植物宿主間的互作關(guān)系,方能更好地解決農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和土壤健康等問(wèn)題。