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        吉林地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌菌種鑒定情況分析

        2022-06-18 14:31:27高菲?周亞麗
        中華養(yǎng)生保健 2022年11期

        高菲?周亞麗

        摘? 要:目的? 了解吉林地區(qū)非結(jié)核分枝桿菌(NTM)病的確診率及各菌種所占比例、地域性特點(diǎn)及分布情況,對(duì)本地區(qū)NTM病的診斷、治療和整體防治規(guī)劃起到至關(guān)重要的作用。方法? 采集2017~2019年吉林地區(qū)的NTM菌株3768株,采用分枝桿菌基因組快速提取試劑盒和獵陣分枝桿菌(16種)菌種鑒定試劑盒(膜芯片法),對(duì)NTM進(jìn)行基因分型,鑒定到分枝桿菌種屬,以便臨床醫(yī)生對(duì)患者更合理用藥進(jìn)行治療,避免耽誤最佳治療時(shí)期。結(jié)果? 2017~2019年吉林地區(qū)NTM病確診率分別為0.68/10萬、0.86/10萬、1.19/10萬;在3768株分枝桿菌中,NTM病所占比例為2.68%(101/3768);將101例NTM病的菌株進(jìn)行菌型鑒定,占比最多的是胞內(nèi)分枝桿菌,為40.59%(41/101),其次為堪薩斯分枝桿菌,為26.73%(27/101);地域分布:2017~2019年農(nóng)村的確診率為3.23/10萬,城市的確診率為1.55/10萬;年齡分布:60歲以上NTM病患者占72.3%(73/101)。結(jié)論? 吉林地區(qū)NTM病確診率近幾年呈上升趨勢(shì),地域性分布特點(diǎn)為農(nóng)村高于城市;感染人群以老年人居多,本地區(qū)NTM病致病菌以胞內(nèi)分枝桿菌和堪薩斯分枝桿菌為主。

        關(guān)鍵詞:非結(jié)核分枝桿菌;菌種鑒定;PCR分子生物學(xué)技術(shù)

        中圖分類號(hào):R446.5 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1009-8011(2022)-11-00-03

        非結(jié)核分枝桿菌(NTM)是指除結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群(包括人型分枝桿菌、牛型分枝桿菌、非洲型分枝桿菌、田鼠型分枝桿菌)和麻風(fēng)分枝桿菌以外的其他分枝桿菌[1]。近年來,NTM病呈快速增多趨勢(shì),并且已經(jīng)成為威脅人類健康的重要公共衛(wèi)生問題。為應(yīng)對(duì)NTM病日益增多的形勢(shì),提高對(duì)NTM病的診斷治療和整體預(yù)防控制水平,減少NTM對(duì)人類生命健康的威脅。中華醫(yī)學(xué)會(huì)結(jié)核病學(xué)分會(huì)于2012年撰寫了《非結(jié)核分枝桿菌病診斷與治療專家共識(shí)》,詳細(xì)介紹了世界各國NTM病的發(fā)病情況和流行趨勢(shì)。我國近年來尚未有大樣本NTM病的流行病學(xué)調(diào)查資料。1990年和2000年全國結(jié)核病抽樣流調(diào)結(jié)果顯示,NTM分別為4.9%和11.1%,在發(fā)現(xiàn)的NTM中具有致病性的就有30余種,我國沿海地區(qū)的NTM發(fā)病率要遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于內(nèi)陸地區(qū),并且致病的NTM種類也不相同[2]。了解本地區(qū)NTM病的確診率及各菌種所占比例及流行趨勢(shì)情況,并對(duì)患者信息進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和分析,得出相應(yīng)結(jié)論,對(duì)本地區(qū)NTM病的診斷、治療、預(yù)防控制及防治規(guī)劃的制定起到至關(guān)重要的作用。本研究對(duì)吉林地區(qū)2017~2019年全部分枝桿菌培養(yǎng)陽性菌株(3768株)進(jìn)行鑒定、基因分型,鑒定到分枝桿菌種屬?,F(xiàn)報(bào)道如下。

        1? 資料與方法

        1.1? 一般資料

        收集吉林地區(qū)2017~2019年保留的分枝桿菌培養(yǎng)陽性菌株,共3768株(來源包括吉林地區(qū)9個(gè)縣市區(qū)結(jié)防所、吉林市結(jié)核病防治研究所全部結(jié)核網(wǎng)報(bào)患者培養(yǎng)陽性菌株),用傳統(tǒng)方法進(jìn)行菌種鑒定,同時(shí)采用結(jié)核分枝桿菌基因組快速提取試劑盒和獵陣分枝桿菌(16種)菌種鑒定試劑盒,進(jìn)行基因分型實(shí)驗(yàn),鑒定NTM到分枝桿菌種屬。

        1.2? 實(shí)驗(yàn)方法

        (1)結(jié)核分枝桿菌基因組快速提取。吸取1 mL已滅菌的菌液加入到裂解管中離心5 min;吸棄上清(吸棄玻璃珠層以上液體,吸棄液體時(shí)不要碰到玻璃珠);在裂解管中加入100 uL裂解液TF(TF每次使用時(shí)要搖勻并即刻取用);恒溫振蕩儀上水平振蕩10 min,95 ℃;離心3 min,上清即為分枝桿菌提取的基因組,可作為聚合酶連反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增模板。2~8 ℃保存。(2)獵陣分枝桿菌(16種)菌種鑒定。①PCR擴(kuò)增:擴(kuò)增體系為20 uL,即將17 uL擴(kuò)增反應(yīng)液和3 uL模版DNA分別加入PCR管中,渦旋離心數(shù)秒備用。擴(kuò)增程序?yàn)?0 ℃、2 min;95 ℃、4 min;(94 ℃、30 s,53 ℃、45 s,72 ℃、20 s)、35個(gè)循環(huán);(94 ℃、30 s,68 ℃、45 s,72 ℃、20 s)、20個(gè)循環(huán);4 ℃,hold。完成擴(kuò)增反應(yīng)后,PCR產(chǎn)物可立即檢測(cè),如果不能立即檢測(cè)則置于-18 ℃以下保存,并且在1周內(nèi)完成檢測(cè)。②分枝桿菌菌種鑒定膜芯片檢測(cè):按照儀器及試劑盒說明書進(jìn)行操作。(3)判讀分枝桿菌的種類。當(dāng)膜芯片上2條陽性質(zhì)控(HC、PC)探針均為陽性,陰性質(zhì)控(NC)探針陰性時(shí),認(rèn)定本次結(jié)果有效。然后將各菌種鑒定探針的顯色斑點(diǎn)位置的結(jié)果與表1進(jìn)行比對(duì)。結(jié)果判讀見表1。

        1.3? 觀察指標(biāo)

        當(dāng)膜芯片上HC、PC探針位置正常顯色,且NC探針位置為陰性時(shí),根據(jù)膜芯片上顯色斑點(diǎn)的位置,讀取相應(yīng)的檢測(cè)結(jié)果。若NTM探針出現(xiàn)顯色位點(diǎn),NTM菌種鑒定探針同時(shí)出現(xiàn)顯色點(diǎn),則說明為相應(yīng)的NTM為陽性。例如:膜芯片上HC、PC探針位置正常顯色,NC探針位置為陰性時(shí),NTM探針位置出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),同時(shí),堪薩斯分枝桿菌探針位置也出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),則可以判定,該NTM菌種鑒定為堪薩斯分枝桿菌。若NTM探針出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),NTM菌種鑒定探針位置沒有出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),則說明可能為檢測(cè)范圍外的其他分枝桿菌。例如:膜芯片上HC、PC探針位置正常顯色,NC探針位置為陰性時(shí),NTM探針位置出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),而NTM菌種鑒定探針沒有出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),則可以判定該患者感染了NTM,并且是檢測(cè)范圍外的其他分支桿菌。若結(jié)核分枝桿菌(MTB)探針出現(xiàn)顯色位點(diǎn),則說明結(jié)核分枝桿菌復(fù)合群陽性。即膜芯片上HC、PC探針位置正常顯色,NC探針位置為陰性時(shí),MTB探針位置出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),則可以判定該患者感染了MTB。若菌種鑒定探針出現(xiàn)多個(gè)顯色位點(diǎn),則說明為多種分枝桿菌陽性。例如:膜芯片上HC、PC探針位置正常顯色,NC探針位置為陰性時(shí),MTB探針位置出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),同時(shí),NTM探針位置出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),并且胞內(nèi)分枝桿菌探針位置也出現(xiàn)顯色斑點(diǎn),則可以判定該患者混合感染了MTB和NTM,并且該NTM菌種鑒定為胞內(nèi)分枝桿菌。通過肉眼判讀膜芯片上的顯色斑點(diǎn)位置,判定NTM菌種類型,分別統(tǒng)計(jì)數(shù)量,計(jì)算出吉林地區(qū)NTM病的確診率及各菌種類型所占比例,并且對(duì)患者信息進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,得出NTM病的地域分布情況及年齡結(jié)構(gòu)情況。

        2? 結(jié)果

        2017~2019年吉林地區(qū)分離培養(yǎng)陽性菌株3768株,對(duì)所有分離培養(yǎng)陽性菌株同時(shí)進(jìn)行傳統(tǒng)方法菌型鑒定和PCR分子生物學(xué)技術(shù)(分枝桿菌菌種鑒定膜芯片法)的菌種鑒定,傳統(tǒng)方法菌型鑒定出的MTB株數(shù)為3661株,NTM株數(shù)為100株,實(shí)驗(yàn)污染為7株;PCR分子生物學(xué)技術(shù)鑒定出的MTB株數(shù)為3772株,NTM株數(shù)為101株,其中5株菌株利用分子生物學(xué)方法檢測(cè)MTB和NTM都存在。經(jīng)重復(fù)試驗(yàn),判定這5株菌株為MTB和NTM混合感染,傳統(tǒng)方法菌型鑒定與PCR分子生物學(xué)技術(shù)鑒定具有較高的一致性。

        將3768株菌株,經(jīng)過分枝桿菌菌種鑒定膜芯片檢測(cè)進(jìn)行菌型鑒定后,NTM株數(shù)為101株,在全部分枝桿菌中,NTM所占比例為2.68%(101/3768),按照年份統(tǒng)計(jì),2017年25例、2018年32例、2019年44例,按照吉林地區(qū)人口370萬、分離出NTM菌株的人數(shù)計(jì)算(NTM病確診率=NTM病培養(yǎng)陽性人數(shù)/總?cè)丝跀?shù)×100000/10萬),2017~2019年吉林地區(qū)NTM病確診率分別為0.68/10萬、0.86/10萬、1.19/10萬。對(duì)比分析得出,2017~2019年吉林地區(qū)NTM病的確診率呈逐年上升趨勢(shì)。

        在101株NTM菌株中,胞內(nèi)分枝桿菌為41株,所占比例為40.59%(41/101);堪薩斯分枝桿菌為27株,所占比例為26.73%(27/101);鳥型分枝桿菌5株,所占比例為4.95%(5/101);恥垢分枝桿菌和膿腫分枝桿菌均為4株,所占比例均為3.96%(4/101);偶然分支桿菌和次要分枝桿菌均為2株,所占比例均為1.99%(2/101);其他NTM(膜芯片法檢測(cè)范圍以外的其他分枝桿菌)為16株,所占比例為15.84%(16/101)。其中5例為混合感染菌株,4例為人型分枝桿菌與胞內(nèi)分枝桿菌混合感染,1例為人型分枝桿菌與膿腫分枝桿菌混合感染。

        將101例NTM病患者的信息進(jìn)行統(tǒng)計(jì),地域分布:2017~2019年農(nóng)村確診率為3.23/10萬(84例患者,260萬人口),城市確診率為1.55/10萬(17例患者,110萬人口),吉林地區(qū)NTM病的地域性分布特點(diǎn)為農(nóng)村人口確診率高于城市人口確診率;年齡分布:60歲以上73例,40~59歲22例,40歲以下6例,吉林地區(qū)NTM病感染人群是老年人多于年輕人。

        3? 討論

        由NTM感染導(dǎo)致的疾病統(tǒng)稱NTM病,NTM病與結(jié)核病有相同或高度相近的病原菌形態(tài)、臨床特點(diǎn)、病理和影像特點(diǎn),在結(jié)核病高負(fù)擔(dān)國家,NTM病誤診成結(jié)核病屢見不鮮[3],甚至因治療效果不佳歸類于耐藥結(jié)核病或致多系統(tǒng)傳播性感染[4-5]。當(dāng)患者出現(xiàn)抗結(jié)核治療效果差,反復(fù)抗酸桿菌檢測(cè)陽性時(shí),醫(yī)生要考慮是NTM的感染,應(yīng)該對(duì)標(biāo)本進(jìn)行分子生物學(xué)方法檢測(cè)[6-8]。

        2017~2019年吉林地區(qū)NTM病確診率分別為0.68/10萬、0.86/10萬、1.19/10萬。目前NTM病是以NTM培養(yǎng)陽性為臨床診斷標(biāo)準(zhǔn),NTM培養(yǎng)陽性患者為確診患者[1,9]。吉林地區(qū)NTM病的確診率呈逐年上升趨勢(shì),分析原因:臨床醫(yī)生對(duì)NTM病的認(rèn)識(shí)提高;實(shí)驗(yàn)方法的改進(jìn)和新技術(shù)的應(yīng)用,尤其是PCR檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用于菌種鑒定,大大提高檢出率;以及高齡人群、艾滋病患者等易感人群的增多使NTM病確診率有所升高[10]。地域不同,NTM菌株流行分布特點(diǎn)不同。我國不同地區(qū)的相關(guān)研究結(jié)果顯示,常見的致病性NTM為鳥-胞

        內(nèi)分枝桿菌復(fù)合體、膿腫分支桿菌、堪薩斯分枝桿菌[11-12]。有研究顯示,我國北方是NTM病的多發(fā)地區(qū),最常見NTM為胞內(nèi)分枝桿菌[13]。本研究中的101株NTM,最多的是胞內(nèi)分枝桿菌,比例為40.59%,其次為堪薩斯分枝桿菌,比例為26.73%,與我國北方菌株流行分布特點(diǎn)一致。對(duì)NTM病患者信息進(jìn)行統(tǒng)計(jì),吉林地區(qū)NTM病的地域性分布特點(diǎn)為農(nóng)村發(fā)病率高于城市,其原因可能與生活習(xí)慣、自然環(huán)境及飲用水有關(guān),使農(nóng)村人口在NTM環(huán)境中的暴露機(jī)會(huì)遠(yuǎn)大于城市人口。NTM病感染人群是以60歲以上的老年人為主,主要是老年人既往有慢性疾病者偏多,或長期應(yīng)用激素致使機(jī)體抵抗力下降,導(dǎo)致一部分條件致病菌感染致病。

        關(guān)于NTM病的治療,以胞內(nèi)分枝桿菌病的治療為例,大多數(shù)一線抗結(jié)核藥物,比如異煙肼和吡嗪酰胺,對(duì)胞內(nèi)分枝桿菌都天然耐藥,藥物對(duì)胞內(nèi)分枝桿菌的體外活性比對(duì)結(jié)核分枝桿菌的體外活性降低10~100倍,而大環(huán)內(nèi)酯類藥物(克拉霉素和阿奇霉素)卻是胞內(nèi)分枝桿菌治療中不可替代的藥物,是胞內(nèi)分枝桿菌病治療的核心藥物[14-15]。2020年新版胞內(nèi)分支桿菌屬肺病診療指南[16]推薦,初治患者采用“克拉霉素+利福霉素+乙胺丁醇”三藥聯(lián)合方案,對(duì)于進(jìn)展性、難治性的耐藥患者可酌情增加氨基糖苷類藥物。也有研究顯示莫西沙星是抗胞內(nèi)分枝桿菌屬作用最強(qiáng)的氟喹諾酮類藥物[17]。NTM病的治療要遵循的重要原則是要在NTM菌種鑒定基礎(chǔ)上選擇合理的治療方案,做到不同的NTM病應(yīng)給予不同的治療方案。

        綜上所述,在重點(diǎn)人群中及時(shí)篩查診斷,選擇適當(dāng)治療方案是降低NTM對(duì)高危人群健康危害的最有效手段。因此,鑒別MTB和NTM,并對(duì)NTM進(jìn)行菌型鑒定,指導(dǎo)臨床醫(yī)生做出準(zhǔn)確的診斷,避免耽誤最佳治療時(shí)期,對(duì)NTM病患者給予準(zhǔn)確治療方案減輕負(fù)擔(dān),以及對(duì)NTM病的防治規(guī)劃制定都起到至關(guān)重要的作用。

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