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        陜西地區(qū)羊源致病性大腸桿菌耐藥性分析與毒力基因檢測

        2022-05-30 06:36:36趙學亮苗永強趙浩宇謝青芳楊增岐
        畜牧獸醫(yī)學報 2022年5期
        關(guān)鍵詞:耐藥檢測

        趙學亮,王 斌,苗永強,趙浩宇,謝青芳,王 娟,楊增岐

        (西北農(nóng)林科技大學動物醫(yī)學院,楊凌 712100)

        陜西省是我國山羊養(yǎng)殖大省,近年來,致病性大腸桿菌(,)已成為養(yǎng)羊業(yè)主要的致病性細菌之一。致病性攜帶多種毒素導致人和動物腹瀉、腦膜炎、流產(chǎn)等一系列臨床癥狀,給養(yǎng)殖業(yè)和公眾健康帶來嚴重威脅。在獸醫(yī)臨床上,隨著抗生素幾十年以來的反復使用、甚至濫用,導致細菌耐藥問題日益嚴峻。與此同時,與動物密切接觸的獸醫(yī)、養(yǎng)殖戶等也常常檢測到相關(guān)耐藥細菌。目前,細菌耐藥已不僅是畜牧養(yǎng)殖領(lǐng)域關(guān)注的重點,同樣是醫(yī)學、生態(tài)等領(lǐng)域共同面臨的挑戰(zhàn)。在“one-health”背景下,人、環(huán)境及動物形成緊密關(guān)聯(lián)的整體,耐藥基因得以在此整體環(huán)境中不斷轉(zhuǎn)移、進化和傳播,形成錯綜復雜的網(wǎng)絡(luò),成為細菌耐藥性快速發(fā)展的遺傳基礎(chǔ)。

        相對于其他動物源細菌耐藥性而言,羊源致病性耐藥性報道較少,而關(guān)于陜西地區(qū)的羊源耐藥性及毒力基因情況未見報道。因此,為加強陜西省羊源致病性耐藥性監(jiān)測,促進規(guī)模化養(yǎng)殖場合理用藥,保障動物源性食品和公共衛(wèi)生安全。本研究對陜西省部分規(guī)模化養(yǎng)殖場進行致病性分離鑒定,并測定其對12種抗生素的耐藥譜、檢測11種耐藥基因以及16種毒力基因,以明確陜西省羊源致病性耐藥譜及毒力基因攜帶情況,為陜西地區(qū)今后臨床合理用藥、有效防控羊源致病性感染提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 菌株來源

        肛門拭子樣品來源于陜西省西安市(15份)、寶雞市(15份)、咸陽市(15份)和渭南市(9份)等地區(qū)10個規(guī)?;B(yǎng)殖場,54份樣品于采集后24 h內(nèi)在4 ℃條件下送至西北農(nóng)林科技大學動物醫(yī)學院傳染病實驗室。

        1.2 主要試劑

        普通營養(yǎng)瓊脂、麥康凱和伊紅美藍等培養(yǎng)基等購自青島高科園海博生物技術(shù)有限公司和英國OXOID公司;12種抗生素購自北京索萊寶科技有限公司;細菌基因組DNA提取試劑盒、DL2000 Marker和2×Mix購自寶生物工程(大連)有限公司。

        1.3 引物設(shè)計

        本研究中所檢測的主要毒力基因:、1、、、、、、、、、、、、、1和2,引物序列參考文獻[5],主要耐藥基因:1、2、3、、、、-、和-1,引物序列參考相關(guān)文獻。引物由西安擎科生物科技有限公司合成。

        1.4 細菌的分離與純化

        將采集的樣品分別放到10 mL的LB營養(yǎng)肉湯液體培養(yǎng)基中,在37 ℃搖床中180 r·min過夜后,在伊紅美藍和麥康凱培養(yǎng)基相互傳代,將純化后的菌落利用16S特異性引物進行鑒定。將鑒定、純化后的細菌保存于西北農(nóng)林科技大學動物醫(yī)學院傳染病實驗室。

        1.5 藥敏試驗

        采用96孔板瓊脂稀釋法對獸醫(yī)和人醫(yī)臨床常用抗感染的大觀霉素、慶大霉素、氨芐西林、頭孢他啶、頭孢噻呋、氟苯尼考、磺胺異噁唑、乙酰甲喹、四環(huán)素、恩諾沙星、多黏菌素和美羅培南12種抗生素進行藥敏試驗。以ATCC 25922作為質(zhì)控菌株,按照美國臨床實驗室標準協(xié)會(Clinical and Laboratory Standards Institute, CLSI)和國家耐抗菌素監(jiān)測系統(tǒng)(National antimicrobial resistance monitoring system, NARMS)推薦標準進行試驗操作和結(jié)果判斷。

        1.6 耐藥基因和毒力基因檢測

        挑單克隆菌落于無菌LB肉湯中200 r·min,37 ℃過夜振蕩培養(yǎng),取1 mL細菌培養(yǎng)液于無菌EP管內(nèi),12 000 r·min離心3 min,棄上清液,利用細菌基因組提取試劑盒制備菌株DNA模板。其反應(yīng)體系為25 μL,其中,2×Mix 12.5 μL、上下游引物各1 μL、DNA模板1 μL,ddHO補足至25 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預變性1 min;94 ℃變性30 s,根據(jù)不同的引物選擇相應(yīng)的退火溫度,72 ℃延伸1 min,30個循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳成像,并進行測序鑒定。

        2 結(jié) 果

        2.1 大腸桿菌分離鑒定及耐藥情況

        54份樣品中共分離鑒定得到50株致病性,總分離率為92.6%(50/54)。12種抗生素的耐藥性結(jié)果顯示,分離株對氨芐西林、氟苯尼考和磺胺異噁唑耐藥率達90%以上,對大觀霉素、慶大霉素、頭孢噻呋、乙酰甲喹、四環(huán)素和恩諾沙星的耐藥率達60%以上,對頭孢他啶和多黏菌素B耐藥率為40%以上,未發(fā)現(xiàn)對美羅培南耐藥的菌株。

        2.2 分離菌株多重耐藥情況

        多重耐藥情況顯示(圖1),在50株羊源致病性中有49株呈現(xiàn)多重耐藥,其中,對11種抗生素耐藥的菌株有14株(28%),對9~10種抗生素耐藥的菌株有13株(26%),對7~8種抗生素耐藥的菌株有11株(22%),對3~6種抗生素耐藥的菌株有11株(22%)。

        圖1 50 株致病性E.coli分離菌株多重耐藥情況檢測

        2.3 分離株耐藥基因分布

        按照細菌基因組DNA提取試劑盒說明書提取50株致病性分離株基因組DNA。然后利用Nanodrop檢測DNA樣品純度和濃度。利用PCR檢測分離菌的耐藥基因,結(jié)果顯示,50株分離菌分別檢測出1~6種耐藥基因,其中,磺胺類耐藥基因2(64%)、四環(huán)素類耐藥基因(34%)、β-內(nèi)酰胺類耐藥基因-(32%)檢出率較高,此外。耐藥基因1、3、、、、和-1檢出率分別為18%(9/50)、14%(7/50)、8%(4/50)、16%(8/50)、22%(11/50)、4%(2/50)和10%(5/50),未檢出β-內(nèi)酰胺類耐藥基因(圖2)。

        圖2 50株致病性E.coli耐藥基因情況檢測

        2.4 分離株毒力基因分布

        根據(jù)攜帶毒力基因的不同可將致病性分為腸外型(extraintestinal pathogenic, EXPEC)、腸黏附型(enteroaggregative, EAEC)、腸侵襲型(enteroinvasive, EIEC)、腸毒素型(enterotoxigenic, ETEC)、腸致病型(enteropathogenic, EPEC)和腸出血型(enterohemorrhagic, EHEC)6種致病型。結(jié)果顯示,6種致病型均被檢出。毒力基因檢測結(jié)果顯示共檢測到11種毒力基因,其中,基因攜帶率最高,為80%(40/50),為36%(18/50),為32%(16/50),為34%(14/50),為26%(13/50),為18%(9/50),為18%(9/50),為6%(3/50),2為4%(2/50),為2%(1/50),為2%(1/50),未檢測到、1、、和s1基因。50株致病性中有49株攜帶至少1種及以上的毒力基因,其中,攜帶1種毒力基因有10株,2種毒力基因14株,3種毒力基因12株,4種毒力基因9株,5種毒力基因4株。

        3 討 論

        致病性作為最重要的人獸共患致病菌之一,可引起人和動物的腹瀉、腸炎等。作為條件性致病菌,可廣泛存在羊、豬、家禽腸道,并可以通過食物鏈傳播,引起人類疾病。本研究從陜西省不同地區(qū)規(guī)?;B(yǎng)羊場采集54份腹瀉羊肛門拭子,共分離到50株,總分離率92.6%,高于其他報道。宋曉莉在江蘇部分地區(qū)75份腹瀉羊肛門拭子樣品分離出56株致病性,分離率為74.7%;劉晨陽從寧夏回族自治區(qū)和青海高原牧區(qū)采集145份羊源樣品,分離出131株,寧夏回族自治區(qū)分離率為91.0%、青海高原牧區(qū)分離率為88.9%。本研究中陜西省羊源分離率較高,其原因可能是飼養(yǎng)模式、養(yǎng)殖規(guī)模和樣本數(shù)量等原因?qū)е虏煌》萘餍谐潭炔煌?/p>

        世界衛(wèi)生組織曾報告,如今每年有70萬人死于抗生素耐藥,到2050年,抗生素耐藥將會導致每年1000萬人死亡,“超級細菌”的出現(xiàn)引人擔憂。在后抗生素時代,耐藥性是全球最緊迫的公共衛(wèi)生問題之一。耐藥基因可通過質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子、整合子、插入序列共同區(qū)和噬菌體等可移動原件進行水平轉(zhuǎn)移。當毒力基因和耐藥基因存在同一可移動原件上時,在抗生素的選擇壓力下,可引起基因共轉(zhuǎn)移,導致耐藥性和致病性增強。本研究分離的50株羊源致病性藥敏試驗結(jié)果顯示,多重耐藥性和交叉耐藥性嚴重,耐藥譜復雜,除美羅培南外,對其他11種抗生素都已產(chǎn)生耐藥性。對氨芐西林、氟苯尼考和磺胺異噁唑耐藥率達90%以上,對大觀霉素、慶大霉素、頭孢噻呋、乙酰甲喹、四環(huán)素和恩諾沙星的耐藥率達60%以上,對頭孢他啶和多黏菌素B耐藥率也達40%以上,這與目前報道的多重耐藥情況一致。劉潤春等對華東華北地區(qū)羊源多重耐藥性檢測發(fā)現(xiàn),該菌對氨芐西林、利福平、克林霉素、阿莫西林、苯唑西林耐藥率都達到90%以上;劉正明等對內(nèi)蒙古地區(qū)108株羊源進行13種抗菌藥物藥敏試驗,結(jié)果發(fā)現(xiàn)對阿莫西林、頭孢噻吩、磺胺甲噁唑、黏菌素的耐藥率均達100.0%。此外,首次在羊源產(chǎn)ESBLs大腸桿菌發(fā)現(xiàn)-1基因。本研究與上述報道的結(jié)果均反映出多重耐藥現(xiàn)象嚴峻,這可能是由于抗生素的長期不合理使用、甚至是濫用的結(jié)果。提示在治療和預防羊源時,應(yīng)篩選高效敏感的藥物進行合理用藥,以提高治愈率,減少耐藥菌株的出現(xiàn)。

        本研究對50株羊源致病性進行毒力基因檢測,結(jié)果顯示在16種毒力基因中共檢測到11種,總檢出率高達98%(49/50),表明攜帶毒力因子的致病性菌株正在陜西省流行和傳播。其中基因攜帶率最高,為80%,Rehman等對青海牦牛源毒力基因調(diào)查發(fā)現(xiàn),基因攜帶率為24.3%。另外檢測到為36%,為32%,為34%,為26%,為18%,為18%,為6%,2為4%,為2%,為2%。寧夏地區(qū)奶牛乳房炎大腸桿菌、、、、5種毒力基因的檢出率分別是20.30%、14.72%、8.12%、2.03%、1.02%。與已報道的相比,本研究分離的致病性毒力基因情況較復雜,不同毒力基因的組合可能是導致羊腹瀉和腸外病變的主要原因。此外,還檢測到較多的和組合,基因編碼外膜蛋白緊密素,參與黏膜細胞產(chǎn)生黏附,基因具有溶血活性、細胞毒性,能夠改變細胞膜的通透性。目前,這種毒力組合尚未見報道,還需要進一步深入探索對宿主的致病機制。由于羊源致病性攜帶毒力基因及對抗生素產(chǎn)生耐藥性,對病防治帶來困難,因此對其防治過程中應(yīng)注意科學用藥的同時,注意預防“超級耐藥細菌”向人的傳播。

        4 結(jié) 論

        陜西省羊養(yǎng)殖場致病性分離率較高,分離株多重耐藥現(xiàn)象嚴重,毒力基因分布廣泛,致病能力較強。因此,在規(guī)模化羊養(yǎng)殖場,應(yīng)謹慎使用抗生素,尤其是氨芐西林、氟苯尼考和磺胺異噁唑,同時應(yīng)加強羊源致病性的耐藥性及毒力基因監(jiān)測。

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