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        2011—2020年上海地區(qū)腸球菌屬細(xì)菌耐藥性變遷

        2022-05-26 03:41:42朱德妹胡付品周春妹王傳清應(yīng)春妹曹文俊莊亦暉蔡金鳳袁軼群0李妮婭劉慶中孫康德瞿躍紅潘秋輝張灝旻衛(wèi)穎玨0孫景勇婁加陶袁應(yīng)華張?chǎng)┭?/span>侯偉偉0余方友吳亞洲陳君灝王海英楊樂(lè)園李志蘭云0胡海清沈振華錢(qián)敏健唐群力汪瑞忠范惠清0戴俊華鄧燕燕侯彥強(qiáng)蓉0劉淑芬徐玉梅
        中國(guó)感染與化療雜志 2022年2期
        關(guān)鍵詞:耐藥

        辛 玲,郭 燕,朱德妹,胡付品,周春妹,王傳清,應(yīng)春妹,曹文俊,莊亦暉,方 毅,蔡金鳳,林 勇,袁軼群0,朱 旻,湯 瑾,李妮婭,劉慶中,張 泓,孫康德,瞿躍紅,潘秋輝,張灝旻,衛(wèi)穎玨0,孫景勇,劉 瑛,孫 晴,李 麗,奚 衛(wèi),婁加陶,袁應(yīng)華,張?chǎng)┭悖?建,侯偉偉0,余方友,周 浩,吳亞洲,胡 駿,喬 昀,陳君灝,王海英,楊樂(lè)園,李志蘭,劉 云0,胡海清,王 敏,沈振華,李 娜,錢(qián)敏健,龔 煒,唐群力,汪瑞忠,趙 芳,范惠清0,黃 韻,張 立,戴俊華,鄧燕燕,侯彥強(qiáng),林 勇,沈 穩(wěn),孫 杰,胡 江,王 蓉0,劉淑芬,徐玉梅

        腸球菌作為醫(yī)院內(nèi)感染的條件致病菌,已從低毒力的良性共生菌發(fā)展為醫(yī)學(xué)上重要的多重耐藥菌,造成嚴(yán)重的公共健康威脅[1]。CHINET 2020年監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)顯示,腸球菌屬細(xì)菌在革蘭陽(yáng)性菌中的分離率僅次于金黃色葡萄球菌,居第二位[2],因此,對(duì)其進(jìn)行長(zhǎng)期耐藥性監(jiān)測(cè)獲得的結(jié)果對(duì)臨床抗感染治療具有重要意義。本研究總結(jié)2011—2020年上海地區(qū)腸球菌屬細(xì)菌耐藥性,為指導(dǎo)臨床合理使用抗菌藥物提供依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 細(xì)菌來(lái)源 收集2011年1月1日—2020年12月31日上海市細(xì)菌真菌耐藥監(jiān)測(cè)網(wǎng)62所臨床醫(yī)學(xué)機(jī)構(gòu)常規(guī)送檢標(biāo)本中分離獲得的腸球菌屬臨床分離株,剔除同一患者相同部位的重復(fù)菌株,按監(jiān)測(cè)網(wǎng)要求的統(tǒng)一技術(shù)方案進(jìn)行腸球菌屬細(xì)菌對(duì)抗菌藥物的敏感性試驗(yàn)。

        1.1.2 試驗(yàn)材料 抗菌藥物藥敏試驗(yàn)中使用的抗菌藥物紙片主要為英國(guó)OXOID公司和美國(guó)BBL公司產(chǎn)品,儀器法使用的商品化板條為法國(guó)生物梅里埃公司VITEK、美國(guó)BD公司Phoenix等的產(chǎn)品。萬(wàn)古霉素和利奈唑胺E試驗(yàn)條為法國(guó)生物梅里埃公司和中國(guó)溫州康泰公司產(chǎn)品。培養(yǎng)基紙片法藥敏試驗(yàn)用MH瓊脂為英國(guó)OXOID公司產(chǎn)品。

        1.2 方法

        1.2.1 試驗(yàn)方法 藥敏試驗(yàn)按上海市細(xì)菌真菌耐藥監(jiān)測(cè)網(wǎng)技術(shù)方案,采用自動(dòng)化儀器法或紙片擴(kuò)散法進(jìn)行藥敏測(cè)定,萬(wàn)古霉素或利奈唑胺不敏感菌株進(jìn)行菌種鑒定后再采用E試驗(yàn)條復(fù)核最低抑菌濃度(MIC)。質(zhì)控菌株為糞腸球菌ATCC 29212。

        1.2.2 結(jié)果判斷 結(jié)果判斷參照2020年美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(CLSI)M100文件推薦的判斷標(biāo)準(zhǔn)[3]。

        1.2.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 藥敏數(shù)據(jù)采用WHONET 5.6軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

        2 結(jié)果

        2.1 細(xì)菌分布

        2.1.1 菌種分布 2011—2020年上海地區(qū)62所臨床醫(yī)療機(jī)構(gòu)共分離到腸球菌屬細(xì)菌113 391株,其中糞腸球菌54.5%(61 770/113 391),屎腸球菌40.1%(45 423/113 391),其他腸球菌5.4%。歷年糞腸球菌在當(dāng)年腸球菌屬細(xì)菌中的占比從2011年的50.5%上升至2020年的52.9%,歷年屎腸球菌在當(dāng)年腸球菌屬細(xì)菌中的占比從2011年的44.3%鋸齒狀下降至2020年的41.0%。見(jiàn)表1。

        表1 2011—2020年上海地區(qū)腸球菌屬菌種分布Table 1 Species distribution of Enterococcus isolates over the period from 2011 to 2020 in Shanghai[n(%)]

        2.1.2 標(biāo)本分布 該菌屬細(xì)菌主要分離自尿液標(biāo)本(59.9%,67 967/113 391)、膽汁和胸腹水等標(biāo)本(10.5%)、血液標(biāo)本(7.9%)、傷口標(biāo)本(4.4%)、呼吸道標(biāo)本(3.9%)等。其中尿液標(biāo)本中糞腸球菌和屎腸球菌為主,分別占54.7%(37 182/67 967) 和42.6%(28 954/67 967)。糞腸球菌在膽汁和胸腹水、血液、傷口、呼吸道、腦脊液與生殖道標(biāo)本中的檢出數(shù)量均高于屎腸球菌。見(jiàn)表2。

        表2 2011—2020年萬(wàn)古霉素和利奈唑胺耐藥腸球菌分布Table 2 Species distribution of vancomycin-resistant and linezolid-resistant Enterococcus isolates over the period from 2011 to 2020% (n/N)

        2.2 腸球菌屬細(xì)菌對(duì)抗菌藥物的敏感率和耐藥率

        2.2.1 歷年腸球菌對(duì)抗菌藥物的敏感性 除利奈唑胺外,糞腸球菌對(duì)其他抗菌藥物的歷年耐藥率均較屎腸球菌低,并基本呈下降趨勢(shì)。屎腸球菌對(duì)氨芐西林、左氧氟沙星和呋喃妥因的歷年耐藥率呈上升趨勢(shì),對(duì)高濃度慶大霉素的耐藥率由2011年的60.3%下降至2020年的39.8%。糞腸球菌和屎腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素歷年耐藥率分別為0~1.9%和0.2%~3.5%,對(duì)利奈唑胺的歷年耐藥率分別為0~1.8%和0~0.8%。見(jiàn)表3。其他腸球菌屬細(xì)菌(包括鳥(niǎo)腸球菌、鉛黃腸球菌、鶉雞腸球菌和堅(jiān)韌腸球菌等)對(duì)抗菌藥物的敏感性見(jiàn)表4。

        表3 2011—2020年上海地區(qū)糞腸球菌和屎腸球菌對(duì)抗菌藥物耐藥率的變遷Table 3 Resistant rates of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium to antimicrobial agents in Shanghai from 2011 to 2020(%)

        表4 2011—2020年上海地區(qū)其他腸球菌屬細(xì)菌對(duì)抗菌藥物的敏感率和耐藥率Table 4 Susceptibility of other Enterococcus species to antimicrobial agents in Shanghai from 2011 to 2020 (%)

        2.2.2 不同科室分離腸球菌的耐藥率 ICU患者送檢標(biāo)本分離的糞腸球菌對(duì)氨芐西林、呋喃妥因和左氧氟沙星的耐藥率均高于門(mén)急診和非ICU患者送檢標(biāo)本中分離菌株的耐藥率,見(jiàn)表5。糞腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素和利奈唑胺的耐藥率均<2%。門(mén)急診患者送檢標(biāo)本中分離的糞腸球菌較屎腸球菌對(duì)利奈唑胺的耐藥率更高。

        表5 2011—2020年門(mén)急診患者與住院患者糞腸球菌和屎腸球菌對(duì)抗菌藥物的耐藥率Table 5 Resistance rates of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium to antimicrobial agents in various departments from 2011 to 2020(%)

        541株萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌(VRE)包括萬(wàn)古霉素耐藥屎腸球菌434株和萬(wàn)古霉素耐藥糞腸球菌107株。其中434株萬(wàn)古霉素耐藥屎腸球菌主要集中在ICU(95株,21.9%)、急診科(24株,5.5%)與血液科(23株,5.3%),而107株萬(wàn)古霉素耐藥糞腸球菌主要集中在泌尿外科(8株,7.5%)、ICU (5株,4.7%)與血液科(5株,4.7%)。

        2.2.3 三級(jí)醫(yī)院與二級(jí)醫(yī)院腸球菌對(duì)抗菌藥物的敏感率和耐藥率 結(jié)果顯示,三級(jí)醫(yī)院送檢標(biāo)本分離的糞腸球菌對(duì)氨芐西林、呋喃妥因和利奈唑胺的耐藥率均高于二級(jí)醫(yī)院,對(duì)其他抗菌藥物的耐藥率均低于二級(jí)醫(yī)院。三級(jí)醫(yī)院送檢標(biāo)本分離的屎腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素的耐藥率高于二級(jí)醫(yī)院,對(duì)其他抗菌藥物的耐藥率均低于二級(jí)醫(yī)院。見(jiàn)表6。

        表6 2011—2020年上海地區(qū)三級(jí)醫(yī)院與二級(jí)醫(yī)院分離腸球菌對(duì)抗菌藥物的敏感率和耐藥率Table 6 Susceptibility of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium to antimicrobial agents in tertiary and secondary hospitals in Shanghai from 2011 to 2020(%)

        3 討論

        2011—2020年上海地區(qū)腸球菌耐藥性監(jiān)測(cè)顯示以下特點(diǎn):①糞腸球菌是腸球菌屬中最常見(jiàn)的細(xì)菌,占54.5%;屎腸球菌是第二常見(jiàn)細(xì)菌,占40.1%。②糞腸球菌主要分離自門(mén)診患者標(biāo)本,其次為非ICU住院患者與ICU患者標(biāo)本;屎腸球菌亦主要分離自門(mén)診患者送檢標(biāo)本,其次為ICU患者與非ICU住院患者標(biāo)本。③尿液標(biāo)本是腸球菌分離率最高的標(biāo)本,其次為膽汁、胸腹水和血液標(biāo)本。④除利奈唑胺外,屎腸球菌對(duì)其他抗菌藥物的耐藥率均高于糞腸球菌;糞腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素和利奈唑胺的歷年耐藥率分別為0~1.9%和0~1.8%;屎腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素和利奈唑胺的歷年耐藥率分別為0.2%~3.5%和0~0.8%。⑤分離自ICU患者的糞腸球菌對(duì)氨芐西林、呋喃妥因和左氧氟沙星的耐藥率均高于分離自門(mén)急診和非ICU患者。除利奈唑胺外,分離自ICU、門(mén)急診、非ICU患者的屎腸球菌對(duì)抗菌藥物的耐藥率均較糞腸球菌高。⑥糞腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素的耐藥率和屎腸球菌對(duì)利奈唑胺的耐藥率,三級(jí)醫(yī)院均低于二級(jí)醫(yī)院。

        萬(wàn)古霉素等糖肽類(lèi)藥物一直是治療腸球菌屬細(xì)菌感染的有效藥物,但隨著這些抗菌藥物在臨床應(yīng)用,對(duì)其耐藥菌株所致感染呈增多趨勢(shì)。1988年法國(guó)報(bào)告了第1例萬(wàn)古霉素耐藥腸球菌之后,1997—2016年全球范圍內(nèi)屎腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素的耐藥率出現(xiàn)上升趨勢(shì),其中美國(guó)高達(dá)21.0%,歐洲為9.9%[1]。本組資料顯示,屎腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素的歷年耐藥率為0.2%~3.5%,低于上述報(bào)道中數(shù)據(jù)。同時(shí),本組資料亦顯示萬(wàn)古霉素耐藥糞腸球菌在2011年腸球菌屬細(xì)菌中檢出率為1.9%,此后一直維持在≤0.2%的水平;而萬(wàn)古霉素耐藥屎腸球菌在2011年腸球菌屬細(xì)菌中的檢出率達(dá)到最高(3.5%),在2020年腸球菌屬細(xì)菌中檢出率為0.2%,但整體呈下降趨勢(shì)。此外,2015—2016年我國(guó)北京、杭州、武漢等主要城市三級(jí)甲等醫(yī)院住院患者分離出的腸球菌中,萬(wàn)古霉素耐藥糞腸球菌和屎腸球菌檢出率分別為0.4%和1.6%[4],2017—2018年萬(wàn)古霉素耐藥糞腸球菌和屎腸球菌檢出率分別為0.3%和1.1%[5],本組資料的結(jié)果均低于上述報(bào)道中數(shù)據(jù)。

        2011—2020年糞腸球菌對(duì)利奈唑胺和萬(wàn)古霉素的耐藥率呈鋸齒狀變化,其中對(duì)利奈唑胺的耐藥率自2017年起逐漸上升至2020年的1.8%,而對(duì)萬(wàn)古霉素的耐藥率,除2011年為1.9%,其余年份均為≤0.2%。2011—2020年屎腸球菌對(duì)利奈唑胺耐藥率同樣呈鋸齒狀變化,除2011年為0.8%,其余年份均≤0.4%;屎腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素的耐藥率2011年為3.5%,近年呈逐漸下降趨勢(shì)。文獻(xiàn)報(bào)道,腸球菌對(duì)萬(wàn)古霉素的耐藥機(jī)制是攜帶vanA、vanB或vanM基因,其中vanA是亞洲最常見(jiàn)的VRE類(lèi)型。2006—2014年上海地區(qū)分離的VRE菌株對(duì)利奈唑胺均敏感[6]。有文獻(xiàn)報(bào)道,腸球菌對(duì)唑烷酮類(lèi)藥物的常見(jiàn)耐藥機(jī)制包括23S rRNA 的G2576T突變或cfr基因介導(dǎo)的殘基甲基化[1],由此提示腸球菌屬細(xì)菌對(duì)萬(wàn)古霉素和利奈唑胺不會(huì)存在交叉耐藥,除非細(xì)菌同時(shí)具有這兩類(lèi)抗菌藥物的耐藥機(jī)制。2011—2020年,上海地區(qū)共出現(xiàn)29株對(duì)萬(wàn)古霉素和利奈唑胺均耐藥的腸球菌(糞腸球菌13株、屎腸球菌16株),這些菌株在下屬監(jiān)測(cè)單位是否均按方案進(jìn)行復(fù)測(cè),現(xiàn)已無(wú)法考證,但在筆者實(shí)驗(yàn)室中采用肉湯微量稀釋法對(duì)萬(wàn)古霉素或利奈唑胺耐藥菌株復(fù)測(cè)時(shí),均未發(fā)現(xiàn)細(xì)菌對(duì)該兩藥交叉耐藥的結(jié)果。因此建議實(shí)驗(yàn)室需加強(qiáng)對(duì)VRE和利奈唑胺耐藥腸球菌(LRE) 的耐藥監(jiān)測(cè),一旦發(fā)現(xiàn)此類(lèi)菌株,應(yīng)按照CLSI要求進(jìn)行菌種復(fù)測(cè)和藥敏試驗(yàn)確認(rèn)后,送至中心實(shí)驗(yàn)室進(jìn)一步確證試驗(yàn)。此外,還可開(kāi)展分子生物學(xué)研究,檢測(cè)是否具有萬(wàn)古霉素或利奈唑胺耐藥基因。臨床上可根據(jù)細(xì)菌的藥敏結(jié)果,將萬(wàn)古霉素或利奈唑胺作為治療LRE或VRE感染的選擇。

        本組數(shù)據(jù)中分離自尿液標(biāo)本的糞腸球菌對(duì)磷霉素和萬(wàn)古霉素的耐藥率分別為5.8%和0.1%,提示磷霉素對(duì)臨床分離腸球菌具有良好的抗菌活性。磷霉素主要用于泌尿道、皮膚及軟組織、腸道等部位的感染[7],細(xì)菌對(duì)磷霉素和其他抗菌藥物間不產(chǎn)生交叉耐藥,故在臨床上廣泛應(yīng)用時(shí)也要關(guān)注隨之出現(xiàn)的耐藥菌株。目前CLSI指南中只針對(duì)尿液標(biāo)本分離的糞腸球菌有明確的紙片法藥敏折點(diǎn)供臨床微生物實(shí)驗(yàn)室參考,臨床上在使用磷霉素治療腸球菌屬細(xì)菌感染時(shí),建議將其作為單一療法或與其他抗菌藥物聯(lián)用[8]。

        綜上所述,2011—2020年上海地區(qū)臨床分離的腸球菌屬細(xì)菌主要以糞腸球菌和屎腸球菌為主,對(duì)目前沿用的大多數(shù)抗菌藥物仍保持較好敏感性,但本次監(jiān)測(cè)結(jié)果中出現(xiàn)了對(duì)利奈唑胺或萬(wàn)古霉素耐藥的腸球菌屬細(xì)菌,提示仍需加強(qiáng)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè),特別是一線抗感染藥物,臨床上需結(jié)合細(xì)菌的藥敏結(jié)果合理用藥。

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