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        不同級別子宮頸病變與lncRNA HOTTIP和H19單核苷酸多態(tài)性的關(guān)系研究

        2022-05-07 02:57:02王春桃葛安興吳紅雁張學(xué)艷袁紅香程艷萍馮延璐陸欣苑梁戈玉
        中國癌癥雜志 2022年4期
        關(guān)鍵詞:研究

        王春桃,葛安興,吳紅雁,張學(xué)艷,楊 圣,袁紅香,程艷萍,馮延璐,陸欣苑,梁戈玉

        1.江蘇醫(yī)藥職業(yè)學(xué)院,江蘇 鹽城 224001;2.環(huán)境醫(yī)學(xué)工程教育部重點實驗室,東南大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,江蘇 南京 210009;3.鹽城市第一人民醫(yī)院放療科,江蘇 鹽城 224001

        子宮頸癌是女性常見的惡性腫瘤,其發(fā)病率和死亡率在全球女性中排名第四[1]。據(jù)統(tǒng)計,每年約有50萬新病例,大多發(fā)生在發(fā)展中國家[2]。子宮頸癌的發(fā)生是經(jīng)過宮頸上皮內(nèi)瘤變(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)到子宮頸癌兩個階段的多因素多步驟長期共同作用的過程,是遺傳和環(huán)境因素相互作用的結(jié)果[3]。盡管子宮頸癌的診斷和治療已經(jīng)取得了一定進展,但晚期復(fù)發(fā)、耐藥等導(dǎo)致子宮頸癌患者的死亡率仍然較高[4]。因此,進一步探索子宮頸癌發(fā)生、發(fā)展的分子機制至關(guān)重要。長鏈非編碼 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)具有眾多生物學(xué)功能,通過調(diào)控不同層面基因表達(dá),參與多種腫瘤的形成[5-7]。HOTTIP 是從HOXA族5′遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)錄的一類lncRNA,位于染色體7p15.2位點,在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展和遷移過程中發(fā)展重要的調(diào)控作用[8]。H19是人類最早發(fā)現(xiàn)的lncRNA,是一種母系胚胎基因,位于人類染色體11 p15.5,全長2.3 kb,具有高度保守性和同源性,在正常成人組織中通常表達(dá)下調(diào),但在癌組織中高表達(dá)[9]。lncRNA HOTTIP和H19的差異性表達(dá)均參與子宮頸癌的發(fā)生、發(fā)展[10-11]。單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)作為基因組中最廣泛的序列遺傳變異類型,具有遺傳數(shù)量大、分布廣、穩(wěn)定性強等特點,是公認(rèn)的“第三代基因遺傳標(biāo)記”,在癌癥的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮著重要作用[12]。

        近年來,研究[13-14]發(fā)現(xiàn),lncRNA的SNP在腫瘤的易感性和干預(yù)腫瘤發(fā)展及預(yù)后機制中發(fā)揮重要作用,可作為腫瘤的生物標(biāo)志物。目前,HOTTIP rs2067087、H19 rs2839698和H19 rs2107425的SNP與子宮頸病變易感性的相關(guān)性研究較少。本研究選取HOTTIP rs2067087、H19 rs2839698和H19 rs2107425,結(jié)合研究對象的臨床資料,分析它們與不同級別子宮頸病變患者發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性,旨在為子宮頸癌的預(yù)防和診斷提供參考。

        1 資料和方法

        1.1 調(diào)查對象

        選擇2018年11月—2020年12月江蘇鹽城市第一人民醫(yī)院子宮頸病變患者345例作為子宮頸病變組,入組標(biāo)準(zhǔn):經(jīng)病理學(xué)檢查確診子宮頸病變,未經(jīng)過放療及化療,無腫瘤史,有相關(guān)的臨床信息者。子宮頸病變組年齡28 ~ 75歲。另收集360例同期住院的無宮頸疾病的非腫瘤患者為健康對照,年齡16~89歲。本研究經(jīng)患者知情同意自愿進行,所有研究對象均知曉并簽署了知情同意書,并通過醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn)。

        1.2 基因分型檢測

        抽取所有研究對象外周靜脈血2 mL,用EDTA-2Na抗凝管收集,使用全血基因組DNA試劑盒(美國Promega公司)提取全血DNA,操作嚴(yán)格按照說明書步驟要求,存放于-80 ℃冰箱保存。采用NanoDrop 1000型紫外分光光度計(Thermo,美國) 測定DNA濃度和純度。采用TaqMan-MGB實時熒光定量PCR法進行基因分型,HOTTIPrs2067087上游引物:5′-CCTCCAAGTGGCATTGTAAAACT-3′,下游引物:5′-CCAGTATGTAAAACCGCCTTCAA-3′;H19 rs2839698上游引物:5′-TAACCAAAAG TGACCGGGATGAAT-3′,反向引物:5′-TGG AGGGGCTAGCTCGAG-3′;H19 rs2107425下游引物:5′-TTCGCCCGTGGAAACGT-3′,下游引物:5′-GATAATGCCCGACCTGAAGATC-3′。PCR擴增反應(yīng)體系為10 μL反應(yīng)混合液,PCR條件為95 ℃ 10 min;95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,40個循環(huán);60 ℃ 30 s。隨機抽取8%的樣本進行兩次分型,以確?;蚍中偷臏?zhǔn)確性。

        1.3 統(tǒng)計學(xué)處理

        本研究采用SPSS 23.0軟件。兩獨立樣本t檢驗比較計量資料。健康對照組實際頻數(shù)與預(yù)計頻數(shù)之間的偏差采用Hardy-Weinberg平衡檢驗;子宮頸病變組和健康對照組的HOTTIPrs2067087、H19 rs2839698及rs2107425等位基因頻率和基因型分布通過χ2檢驗比較;3個位點基因多態(tài)性與子宮頸病變之間的關(guān)聯(lián)性應(yīng)用非條件logistic回歸分析,以比值比(odds ratio,OR)及95% CI評估相對危險度。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 調(diào)查對象的基本特征

        本研究共納入子宮頸病變患者345例,平均年齡(49.6±9.8)歲,其中,宮頸上皮內(nèi)瘤變患者220例,按臨床分期分類發(fā)現(xiàn),低級別鱗狀上皮內(nèi)病變(low-grade squamous intraepithelial lesions,LSIL)66例,高級別鱗狀上皮內(nèi)病變(high-grade squamous intraepithelial lesions,HSIL)154例。子宮頸癌患者125例,按病理學(xué)類型分為鱗癌患者103例,腺癌患者22例;按國際婦產(chǎn)科聯(lián)盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,F(xiàn)IGO)(2018)臨床分期分為Ⅰ期41 例,Ⅱ期84例。對照組360例,平均(50.3±14.0)歲。均為漢族女性,兩組年齡分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。

        2.2 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425位點基因分型結(jié)果

        HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425的SNP基因分型結(jié)果是由該樣本的SNP區(qū)段擴增測序后總reads數(shù)中等位基因頻度或等位基因比例所決定的(圖1)。HOTTIPrs2067087擴增測序總reads數(shù)中,C的頻度0.8以上,則該樣本的基因型判定為野生基因CC型;C的頻度0.2以下,對應(yīng)的等位基因G的頻度在0.8以上,則該樣本判定為純合突變基因GG型;C的頻度0.2~0.8,對應(yīng)的等位基因G的頻度從0.8至0.2之間,則該樣本判定為雜合突變基因CG型。同樣的原理得到H19 rs2839698和rs2107425的基因分型,具體分型如下:H19 rs2839698分型為野生基因CC型、雜合突變基因CT型和純合突變基因TT型;H19 rs2107425分型為野生基因CC 型、雜合突變基因CT型和純合突變基因TT型。

        圖1 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425等位基因頻度Fig.1 Genotyping of HOTTIP rs2067087,H19 rs2839698 and H19 rs2107425

        2.3 Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗

        HOTTIPrs2067087在健康對照組中基因型頻率分別是CC基因型(36.9%),CG基因型(49.2%)和GG基因型(13.9%);H19 rs2839698分別是CC基因型(54.2%),CT基因型(38.1%)和TT基因型(7.8%);H19 rs2107425的3種基因型頻率分別為CC基因型(33.3%)、CT基因型(46.7%)和TT基因型(20.0%)。Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗結(jié)果顯示P>0.05,表明基因型分布頻率具有群體代表性(表1)。

        表1 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425多態(tài)性位點基因型Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗Tab.1 Hardy-Weinberg genetic balance test of HOTTIP rs2067087,H19 rs2839698,and H19 rs2107425 polymorphism

        2.4 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425 SNP與子宮頸病變的關(guān)系

        HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425基因型及等位基因頻率在子宮頸病變組和健康對照組中的分布見表2。結(jié)果表明,與健康對照組相比,HOTTIPrs2067087的GG基因型分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。在隱性模型中,與CC+CG基因型相比,GG基因型患者發(fā)生子宮頸病變的頻率顯著增加 (OR=1.522,95% CI:1.021 ~ 2.269,P=0.039)。與C等位基因相比,G等位基因在子宮頸病變組中的頻率明顯高于健康對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=1.252,95% CI:1.012 ~ 1.549,P=0.038)。研究結(jié)果未發(fā)現(xiàn)H19 rs2839698、rs2107425與子宮頸病變之間具有相關(guān)性(P>0.05)。

        表2 子宮頸病變組與健康對照組基因型及等位基因頻數(shù)分布Tab.2 Distribution of genotype and allele frequency in cervical lesion group and healthy control group

        2.5 不同年齡HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425基因型分布情況

        分析不同年齡HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與子宮頸病變的關(guān)系,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與不同年齡組的子宮頸病變具有相關(guān)性(表3)。

        表3 不同年齡HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與宮頸病變相關(guān)性Tab.3 Correlation between HOTTIP rs2067087,H19 rs2839698,rs2107425 and cervical lesions at different ages

        2.6 不同級別子宮頸病變中HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425基因型分布情況

        將子宮頸病變組進一步分為CIN組和子宮頸癌組,分別分析3個SNP位點與CIN組、子宮頸癌組發(fā)病風(fēng)險的相關(guān)性。結(jié)果顯示,與健康對照組相比,CIN組的HOTTIPrs2067087 GG基因型分布差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。CIN組中,與CC+CG基因型相比,GG基因型發(fā)生CIN的風(fēng)險顯著增高(OR=1.730,95% CI:1.117-2.680)。在H19 rs2839698的子宮頸癌組的隱性模型中,與CC+CT型相比,TT基因型患者發(fā)生子宮頸癌的風(fēng)險低于健康對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(OR=0.292,95% CI:0.087 ~ 0.976,P=0.046)。此外,未發(fā)現(xiàn)H19 rs2107425基因型及等位基因與子宮頸癌及CIN具有相關(guān)性(表4)。

        表4 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425基因型及等位基因在CIN組、宮頸癌組及健康對照組中的分布Tab.4 Distribution of genotype and allele frequency of HOTTIP rs2067087,H19 rs2839698,rs2107425 among CIN group,cervical cancer group and control group

        2.7 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與子宮頸癌臨床進展的相關(guān)性

        2.7.1 不同病理學(xué)類型分層分析

        分析不同病理類型的子宮頸癌患者HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425基因型分布頻率,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與不同病理學(xué)類型子宮頸癌相關(guān)(P>0.05,表5)。

        表5 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與不同病理類型的宮頸癌的相關(guān)性Tab.5 Correlation between HOTTIP rs2067087,H19 rs2839698,rs2107425 and different pathological types of cervical cancer

        2.7.2 不同臨床分期分層分析

        分析HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與子宮頸癌臨床分期的相關(guān)性,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)HOTTIPrs2067087和H19 rs2839698、rs2107425與子宮頸癌分期具有相關(guān)性(P>0.05,表6)。

        表6 HOTTIP rs2067087和H19 rs2839698 s2107425與不同臨床分期的宮頸癌的相關(guān)性Tab.6 Correlation between HOTTIP rs2067087,H19 rs2839698,H19 rs2107425 and cervical cancer of different clinical stages

        3 討 論

        子宮頸癌是多因素、多步驟導(dǎo)致的疾病,其發(fā)病機制目前尚未完全明確。尋找潛在的診斷和預(yù)測指標(biāo)對提高子宮頸癌患者的生存率具有重要意義。LncRNA被發(fā)現(xiàn)參與生長發(fā)育、細(xì)胞增殖、分化和凋亡等各種機體調(diào)節(jié)過程,并與多種腫瘤密切相關(guān)[15]。SNP作為最常見的基因突變類型,在子宮頸癌的遺傳易感性中起重要作用[16]。本研究收集了705名研究對象,包括345例子宮頸病變者和360名健康對照的血液標(biāo)本及相關(guān)臨床信息,旨在探討HOTTIPrs2067087、H19 rs2839698及H19 rs2107425基因多態(tài)性與子宮頸癌易感性的關(guān)系。

        HOTTIP作為一種新發(fā)現(xiàn)的lncRNA,與人類多種腫瘤的易感性、生長、增殖及預(yù)后密切相關(guān)[17-18]。然而,目前關(guān)于HOTTIP基因多態(tài)性與腫瘤易感性的研究較少。Wang等[14]研究lncRNA HOTTIP SNP與胃癌風(fēng)險和預(yù)后的關(guān)系發(fā)現(xiàn),HOTTIPrs2067087的GC+GG基因型使胃癌的患病風(fēng)險增加1.35倍,攜帶CC基因型的女性更易患胃癌,提示rs2067087基因型可能是胃癌篩查中一項具有潛在有意義的檢測,尤其是對女性而言。該研究團隊在先前的研究[18]中也發(fā)現(xiàn),HOTTIPrs2067087的SNP能使肝癌的患病風(fēng)險增加1.20倍,提示HOTTIPSNP可能作為肝癌患病風(fēng)險和預(yù)后的生物標(biāo)志物。Lv等[19]分析發(fā)現(xiàn),與GG基因型相比,攜帶HOTTIPrs2067087的CC基因型患結(jié)直腸癌的風(fēng)險提高了1.7倍,但未發(fā)現(xiàn)其與結(jié)直腸癌患者總生存期之間的關(guān)聯(lián)。本研究首次進行HOTTIPrs2067087與子宮頸病變及臨床特征關(guān)系的研究,結(jié)果表明,GG基因型攜帶者可增加子宮頸病變的風(fēng)險;進一步分析發(fā)現(xiàn),該位點的GG基因型主要增加了CIN的發(fā)病風(fēng)險,提示該位點的GG基因型可作為CIN的早期篩查及診斷依據(jù)。同時,未發(fā)現(xiàn)HOTTIPrs2067087與子宮頸癌病理學(xué)類型、臨床分期相關(guān)。

        H19是lncRNA中的一員,參與哺乳動物早期胚胎發(fā)育,其表達(dá)量在組織器官成熟后逐漸下調(diào)。lncRNA H19表達(dá)在多種惡性腫瘤組織中重新上調(diào),對于腫瘤的進展、轉(zhuǎn)移發(fā)揮重要作用[17]。近年來研究[10,20]發(fā)現(xiàn),lncRNA H19與子宮頸癌的發(fā)生、發(fā)展、治療和預(yù)后密切相關(guān)。進一步的研究發(fā)現(xiàn),H19基因多態(tài)性也可能與腫瘤易感性相關(guān)。目前已有關(guān)于H19 rs2839698 SNP與腫瘤易感性的相關(guān)報道。Yang等[21]的研究也發(fā)現(xiàn),rs2839698 T等位基因攜帶者及CT+TT基因型的個體患胃癌的風(fēng)險顯著增加,rs2839698 CT+TT基因型與H19 mRNA的高表達(dá)顯著相關(guān)。Wu等[22]的研究發(fā)現(xiàn),H19 rs2839698 T等位基因使肝細(xì)胞癌的發(fā)病風(fēng)險增加29.1%。Liu等[23]的meta分析發(fā)現(xiàn),無論是亞洲人群還是高加索人群,H19 rs2839698多態(tài)性都與癌癥易感性顯著相關(guān)。另有研究[24]表明,H19 rs2839698多態(tài)性降低了中國漢族人群結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險,尤其是在不吸煙、不飲酒、年齡≥60歲的人和超重的人(BMI≥24)中。但是,Hashemi等[25]進行的一項meta分析未發(fā)現(xiàn)H19 rs2839698 G> A基因多態(tài)性與總癌癥風(fēng)險有顯著相關(guān)性。H19 rs2839698與子宮頸病變的相關(guān)文獻較少,Huang等[26]關(guān)于H19 rs2839698多態(tài)性與子宮頸癌易感性的研究顯示,雖然H19 rs2839698 TT與子宮頸癌的一些較差的臨床病理學(xué)參數(shù)相關(guān),但不能可靠地預(yù)測患者的存活率。本研究探索了H19 rs2839698 SNP與子宮頸病變組發(fā)病風(fēng)險及臨床進展之間的關(guān)系,結(jié)果發(fā)現(xiàn),與CC+CT型相比,H19 rs2839698的TT基因型發(fā)生子宮頸癌的風(fēng)險減少了70.8%。本研究人群位于中國大陸中部地區(qū),研究對象間存在地域差異,行為生活方式也不盡相同,可能導(dǎo)致子宮頸癌易感性的差異。

        目前關(guān)于H19 rs2107425 SNP與腫瘤易感性的研究結(jié)論并不一致。Liu等[23]進行的一項meta分析發(fā)現(xiàn),H19 rs2107425與亞洲人的癌癥易感性增加有關(guān);而與高加索人群的癌癥發(fā)病風(fēng)險降低相關(guān)。Wang等[13]的研究發(fā)現(xiàn),H19 rs2107425 CT+TT基因型與表皮生長因子受體野生型肺腺癌患者的腫瘤進展?fàn)顟B(tài)相關(guān)。Wu等[22]對359例肝細(xì)胞癌患者和1 190名對照進行的研究表明,H19 rs2107425 TT基因型與肝細(xì)胞癌的發(fā)病風(fēng)險顯著降低相關(guān)。Yang等[27]研究發(fā)現(xiàn),攜帶H19 rs2107425 CT+TT基因型的尿路上皮細(xì)胞癌患者發(fā)生肌肉浸潤性腫瘤的風(fēng)險較高,進一步的臨床分析發(fā)現(xiàn),rs2107425 CT+TT基因型與年齡大于65歲的尿路上皮細(xì)胞癌患者較差的疾病特異性生存率相關(guān)。H19與子宮頸病變關(guān)系的研究較少,Huang等[28]對134例浸潤性子宮頸癌患者、101例CIN患者和325名對照者進行研究,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)H19 rs2107425基因多態(tài)性與子宮頸癌發(fā)病風(fēng)險相關(guān)。本研究探索了H19 rs2107425 SNP與子宮頸病變(子宮頸癌及CIN)發(fā)病風(fēng)險及臨床進展之間的關(guān)聯(lián),結(jié)果未發(fā)現(xiàn)H19 rs2107425 SNP與子宮頸病變易感性及臨床進展之間的關(guān)系,與上述Huang等[28]的結(jié)論一致。

        綜上所述,通過病例對照研究,本研究結(jié)果表明HOTTIPrs2067087 GG基因型與中國漢族人群子宮頸病變風(fēng)險病變增加顯著相關(guān)。進一步的分析發(fā)現(xiàn),主要與CIN的發(fā)病風(fēng)險相關(guān),GG基因型攜帶者CIN的發(fā)病風(fēng)險增加了73.0%。而H19 rs2839698與子宮頸癌的發(fā)病風(fēng)險相關(guān),TT基因型攜帶者發(fā)生子宮頸癌的風(fēng)險減少了70.8%。未發(fā)現(xiàn)H19 rs2107425與子宮頸癌及CIN發(fā)病風(fēng)險相關(guān)。未發(fā)現(xiàn)HOTTIPrs2067087、H19 rs2839698 和H19 rs2107425基因多態(tài)性與子宮頸癌臨床病理學(xué)特征的相關(guān)性。

        利益沖突聲明:所有作者均聲明不存在利益沖突。

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