肖紅艷, 方 芳, 顧 林
(天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院乳腺二科,國(guó)家腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心,天津市腫瘤防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津市惡性腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心,乳腺癌防治教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津 300060)
絕大多數(shù)與乳腺癌相關(guān)的死亡是由于轉(zhuǎn)移到遠(yuǎn)處器官,例如肺和骨骼[1]。腫瘤細(xì)胞經(jīng)歷遺傳和表觀遺傳變化以獲得轉(zhuǎn)移能力[2]。組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(histone acetyltransferases,HATs)是表觀遺傳學(xué)研究最廣泛的一類酶,通過組蛋白上乙?;某练e來修飾染色質(zhì)[3]。重要的是,HAT 酶的調(diào)節(jié)顯著改變了正常的基因表達(dá),并與包括癌癥在內(nèi)的幾種疾病的發(fā)展有關(guān)[4-5]。盡管在過去幾十年中描述了許多HATs 在基因調(diào)控和腫瘤發(fā)生中的作用,但其中一些酶的功能在很大程度上仍然未知,如N 末端乙?;D(zhuǎn)移酶(N-terminal acetyltransferases,NATs)主要修飾蛋白質(zhì)或多肽的 N 端 α-氨基[6]。N-α-乙酰基轉(zhuǎn)移酶D(N-α-acetyltransferase D,NATD)屬于NATs 家族成員之一,具有GCN5相關(guān)乙酰轉(zhuǎn)移酶超家族的保守序列基序,使其能專一地介導(dǎo)組蛋白H4和H2A的Nt乙?;?,并在不同類型惡性腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過程中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用[7]。最近的一項(xiàng)研究表明,NATD 是侵襲性肝癌亞型潛在預(yù)后標(biāo)志物[8]。此外,NATD 在肝細(xì)胞癌組織中顯示下調(diào),并且異位NATD 表達(dá)使肝癌細(xì)胞系對(duì)藥物誘導(dǎo)的凋亡敏感[9]。盡管有上述證據(jù),NATD在乳腺癌轉(zhuǎn)移中的作用仍不清楚。本研究發(fā)現(xiàn),腫瘤來源的NATD 通過抑制轉(zhuǎn)錄因子叉頭框蛋白A2(forkhead box protein A2,F(xiàn)OXA2)表達(dá)以促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移,并且該過程涉及腫瘤細(xì)胞上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transitions,EMT)發(fā)生。因此,NATD 可能成為乳腺癌的潛在治療靶點(diǎn)。
人細(xì)胞系MDA-MB-231 及其對(duì)肺轉(zhuǎn)移衍生物L(fēng)M2-4175(LM2)、MCF10CA1h 及其轉(zhuǎn)移性等基因系MCF10CA1a 均購(gòu)自 ATCC。MDA-MB-231 及 LM2 接種在含有10%胎牛血清(HyClone)和100 mg/L 青霉素/鏈霉素(Gibco)的 DMEM 培養(yǎng)液(HyClone)中生長(zhǎng)。MCF10 系列細(xì)胞系在補(bǔ)充有10 mg/L 胰島素、20 μg/L 表皮生長(zhǎng)因子、0.5 μg/L 氫化可的松、100μg/L 青霉素/鏈霉素和 20% 馬血清(HyClone)的DMEM/F12 培養(yǎng)液(HyClone)中生長(zhǎng)。每周使用第5~8代的細(xì)胞培養(yǎng)物測(cè)試支原體污染。
2.1 癌細(xì)胞中蛋白的質(zhì)譜分析 通過刮刀或胰蛋白酶處理收集培養(yǎng)的細(xì)胞,用裂解緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl、150 mmol/L NaCl、1% NP-40、0.5% 脫氧膽酸鈉、0.1% SDS 與磷酸酶和蛋白酶抑制劑)在冰上裂解 15 min,然后以 17 000×g離心 15 min。用BCA 蛋白質(zhì)測(cè)定試劑盒測(cè)量蛋白質(zhì)濃度。上樣30μg 的蛋白質(zhì),并在8%~12% SDS-PAGE 分離。每條泳道被切割成12個(gè)部分。將每個(gè)切片切成約1 mm×1 mm×1 mm的立方體,然后將凝膠片在100%乙腈中脫水15 min,通過SpeedVac 完全干燥,在50 μL 含有0.01 μg/μL 胰蛋白酶(Promega)的25 mmol/L 碳酸氫銨(Promega)中溶脹,并在37 ℃下孵育過夜。肽段用含5%甲酸的50%乙腈提取4 次。將所得肽段在MDLC 系統(tǒng)(Michrom Bioresources)與 Thermo Finnigan 2D 線性離子阱質(zhì)譜儀(Thermo)耦合上進(jìn)行納米LCMS/MS實(shí)驗(yàn)。所有數(shù)據(jù)文件都是通過對(duì)人類國(guó)際蛋白質(zhì)指數(shù)蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)(IPI. Human. v3.67.fasta)搜索 MS/MS 譜圖創(chuàng)建,使用 BioWorks 3.3 軟件套件中的TurboSEQUEST 程序,前體-離子質(zhì)量容差為2.0 amu,碎片離子質(zhì)量容差為0.8 amu。胰蛋白酶被設(shè)置為蛋白酶,允許有兩個(gè)缺失的切割位點(diǎn)。搜索的肽段和蛋白質(zhì)在Trans-Proteomic Pipeline(TPP)4.2 中使用默認(rèn)參數(shù)通過PeptideProphet1 和ProteinProphet2 進(jìn)行驗(yàn)證。ProteinProphet P 值大于0.9 且具有不少于3 種獨(dú)特肽段的蛋白質(zhì)被認(rèn)為是真正的鑒定。隨機(jī)IPI.HUMAN.v3.67.fasta 用作數(shù)據(jù)庫(kù)來估計(jì)蛋白質(zhì)識(shí)別的錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率。在我們的分析中,ProteinProphet 0.9的錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率<1%。將含有相同肽段的蛋白質(zhì)分組,每組中只剩下一種概率最高的蛋白質(zhì)。
2.2 質(zhì)粒構(gòu)建及轉(zhuǎn)染 將全長(zhǎng)人NATD 基因克隆到pMSCV 載體(Clontech)中以產(chǎn)生NATD表達(dá)質(zhì)粒。NATDshRNA(sh-NATD)質(zhì)粒購(gòu)自Sigma。所有質(zhì)粒均通過DNA 測(cè)序驗(yàn)證。將MDA-MB-231、LM2 細(xì)胞接種在6 孔板中,生長(zhǎng)至80%~90%匯合度并用X-tremeGENE HP DNA 轉(zhuǎn)染試劑(Roche)將這些質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到細(xì)胞中,以進(jìn)行NATD過表達(dá)和敲除。對(duì)于救援實(shí)驗(yàn),MDA-MB-231細(xì)胞與FOXA2和NATD過表達(dá)質(zhì)粒體共轉(zhuǎn)染48 h,收獲細(xì)胞用于后續(xù)分析。針對(duì)FOXA2過表達(dá)質(zhì)粒由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
2.3 人乳腺癌組織及免疫組化分析 石蠟包埋的原發(fā)腫瘤146 個(gè)從天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院獲得。分別對(duì)其中具有隨訪信息的樣本用于轉(zhuǎn)移(n=96)和具有總生存信息的樣本用于總生存(n=58)的Kaplan-Meier 分析。研究經(jīng)所有受試者的知情同意和醫(yī)院機(jī)構(gòu)的倫理委員會(huì)批準(zhǔn)研究。將石蠟固定的標(biāo)本切成4μm 厚,并附著在玻片上。然后將腫瘤組織切片在二甲苯中脫蠟并用梯度乙醇脫水。用蒸餾水沖洗后,在室溫下用3.0%過氧化氫阻斷組織過氧化物15 min??乖跈幟仕峋彌_液中用微波加熱修復(fù)。然后將載玻片冷卻至室溫。用PBS洗滌3次后,用抗NATD 抗體孵育載玻片。通過HRP 連接的Ⅱ抗顯示結(jié)合的Ⅰ抗。在倒置顯微鏡拍攝圖像。根據(jù)腫瘤的染色強(qiáng)度中值將樣本分為NATD 高表達(dá)組和低表達(dá)組并用于生存分析。
2.4 小鼠實(shí)驗(yàn) 從上海斯萊克實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限責(zé)任公司購(gòu)買了6~8 周齡Balb/c 雌性小鼠。小鼠被麻醉并向尾靜脈注射NATD過表達(dá)或敲除乳腺癌細(xì)胞(MDA-MB-231 和 LM2 細(xì)胞:2.5×105)用于肺轉(zhuǎn)移。對(duì)于生物發(fā)光成像(bioluminescence imaging,BLI),通過給小鼠腹腔注射底物D-熒光素(150 mg/kg),然后使用IVIS 光譜儀(PerkinElmer)監(jiān)測(cè)腫瘤細(xì)胞的全身擴(kuò)散,并在不同時(shí)間點(diǎn)使用BLI 測(cè)量了肺部轉(zhuǎn)移負(fù)擔(dān)。使用Living Image 2.50 分析BLI 圖像。通過人工繪制肺輪廓對(duì)應(yīng)區(qū)域內(nèi)BLI 信號(hào)的光子通量來測(cè)量肺轉(zhuǎn)移性腫瘤負(fù)擔(dān)。
2.5 微陣列分析技術(shù) 分別使用Affymetrix 人類基因2.0 ST 陣列對(duì)LM2 和MCF10CA1a 進(jìn)行基因表達(dá)微陣列分析,包括或不包括NATD敲除。使用默認(rèn)設(shè)置的R 軟件包“Oligo”對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,并使用魯棒多芯片平均算法(RMA)對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行歸一化。將對(duì)照組和NATD基因敲除組之間表達(dá)水平變化1.5倍或更大(t檢驗(yàn)P<0.05)的基因定義為差異表達(dá)基因。
2.6 反相蛋白質(zhì)陣列分析 將穩(wěn)定轉(zhuǎn)染或未轉(zhuǎn)染NATD敲除的LM2 和MCF10CA1a 的蛋白裂解物連續(xù)稀釋并排列在硝酸纖維素涂層的載玻片上。在上海伯豪生物技術(shù)有限公司對(duì)載玻片上的蛋白質(zhì)裂解物進(jìn)行反相蛋白質(zhì)陣列分析分析。通過標(biāo)準(zhǔn)化log2 轉(zhuǎn)化和以抗體為中心的中值來表示蛋白質(zhì)和磷蛋白的表達(dá)水平。使用Studentt檢驗(yàn)確定對(duì)照組和NATD基因敲除組之間的蛋白質(zhì)表達(dá)差異,雙側(cè)P<0.05。
2.7 高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析 RNA 結(jié)合蛋白免疫沉淀測(cè)序(RIP-seq)研究樣本均由上海伯豪生物技術(shù)有限公司在Illumina HiSeq 2500 進(jìn)行,單端讀取長(zhǎng)度為50 bp。使用hisat2 將深度測(cè)序數(shù)據(jù)與人類參考基因組版本38(GRCh38)比對(duì)。基因結(jié)構(gòu)注釋通過R 軟件包BioMart 從BioMart 數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)集hsapiens_Gene_ensembl 中提取。如果相應(yīng)基因具有多個(gè)異構(gòu)體,則使用最長(zhǎng)的異構(gòu)體,并將對(duì)齊的讀取擴(kuò)展到150 bp 以滿足平均片段大小。為了平衡峰值調(diào)用中內(nèi)含子的干擾,我們將基因結(jié)構(gòu)注釋從基于基因組的坐標(biāo)轉(zhuǎn)換為基于最長(zhǎng)異構(gòu)體的坐標(biāo)。每個(gè)基因每個(gè)窗口的讀取計(jì)數(shù)通過相應(yīng)基因所有窗口的中值讀取計(jì)數(shù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。RIP富集峰(窗口)通過FDR<0.05 和富集分?jǐn)?shù)的 log2 轉(zhuǎn)換≥1 確定。通過 Fisher 精確測(cè)試P值調(diào)整FDR,該值評(píng)估RIP和輸入樣本之間的差異窗口。通過(IP_C×Input_MedC)(/IP_MedC×Input_C)計(jì)算窗口富集分?jǐn)?shù)。IP_C:當(dāng)前峰值中RIP樣本的讀取計(jì)數(shù);IP_MedC:當(dāng)前異構(gòu)體上所有窗口中RIP 樣本的中值讀取計(jì)數(shù);Input_C:讀取當(dāng)前峰值中輸入樣本的計(jì)數(shù);Input_MedC:當(dāng)前異構(gòu)體上所有窗口中輸入樣本的中值讀取計(jì)數(shù)。每個(gè)基因中RIP-seq 的標(biāo)準(zhǔn)化分布是每個(gè)亞型中每個(gè)位點(diǎn)的讀取計(jì)數(shù),通過選取相應(yīng)亞型中所有位點(diǎn)的中值對(duì)讀取計(jì)數(shù)標(biāo)準(zhǔn)化。
2.8 細(xì)胞遷移和侵襲測(cè)定 在Transwell 室(BD Biosciences)中檢測(cè)細(xì)胞遷移能力。細(xì)胞接種在上室孵育24 h,將滲透到下表面的遷移細(xì)胞固定并用結(jié)晶紫(Sigma-Aldrich)染色。對(duì)于侵襲測(cè)定,基質(zhì)凝膠預(yù)涂在上室的聚碳酸酯膜上,其他同遷移能力測(cè)定。用BX-60顯微鏡(Olympus)觀察細(xì)胞。
2.9 免疫熒光測(cè)定 MDA-MB-231 細(xì)胞用指定的構(gòu)建體轉(zhuǎn)染并鋪在室載玻片上。細(xì)胞在3.7%甲醛中固定,并在室溫下用0.15%Triton X-100 滲透。然后洗滌細(xì)胞,用5% BSA 封閉并與抗E-鈣黏蛋白(1∶500,Cell signaling Technology)和抗N-鈣黏蛋白(1∶800,Cell signaling Technology)抗體在4 ℃溫育16 h。然 后 用 Alexa Fluor 488 和 Alexa Fluor 594 偶 聯(lián) II 抗(Thermo Fisher Scientific)探測(cè)細(xì)胞,用DAPI 染色并固定在顯微鏡載玻片上。使用Leica 共聚焦系統(tǒng)(Leica)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行成像。
2.10 Western blot 使用RIPA 裂解緩沖液(Abcam)從細(xì)胞中提取總蛋白。將50μg 細(xì)胞裂解物電泳并轉(zhuǎn)移到聚偏二氟乙烯(PVDF)膜(GE Healthcare)。然后封閉膜并用抗NATD(1∶1 000)、FOXA2(1∶800)、E-鈣粘蛋白(1∶2 000)、N-鈣粘蛋白(1∶1 000)、波形蛋白(1:500)和GAPDH(1∶5 000)抗體在4 ℃孵育過夜。洗滌膜并用HRP 偶聯(lián)的Ⅱ抗進(jìn)行探測(cè)。所有抗體均購(gòu)自Abcam。ECL 底物用于觀察印跡。用ImageJ軟件分析相對(duì)條帶強(qiáng)度。
本研究中的所有數(shù)據(jù)均使用SPSS 22.0 進(jìn)行分析,并表示為至少3 個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(mean±SD)。組間比較采用雙尾Student'st檢驗(yàn),多組間比較采用單向方差分析,兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn)。繪制Kaplan-Meier 生存曲線分析乳腺癌中NATD 表達(dá)對(duì)總體存活率、無轉(zhuǎn)移生存的影響,以及NATD過表達(dá)或敲減對(duì)小鼠的無轉(zhuǎn)移生存期的影響,組間比較采用Log-rank檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
質(zhì)譜組學(xué)分析顯示共有30 個(gè)蛋白在轉(zhuǎn)移腫瘤細(xì)胞中的表達(dá)上調(diào),其中NATD 是受調(diào)控的蛋白質(zhì)之一(圖1A)。此外,Western blot 也證實(shí)了NATD 蛋白在LM2 和MCF10CA1a 轉(zhuǎn)移腫瘤細(xì)胞中的表達(dá)高于MDA-MB-231 和MCF10CA1h 親本腫瘤細(xì)胞(圖1B)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證NATD 表達(dá)的臨床相關(guān)性,我們通過NATD 免疫組化染色分析了一組人類乳腺腫瘤(圖1C),發(fā)現(xiàn)原發(fā)腫瘤中較高的NATD 表達(dá)與患者的總生存期縮短(HR=3.673,95% CI=1.611~8.376,P=0.003)和無轉(zhuǎn)移縮短(HR=3.347,95%CI=1.740~6.438,P=0.001)有關(guān)(圖1D、E)。這些結(jié)果表明NATD與乳腺癌肺轉(zhuǎn)移之間呈正相關(guān)。
Figure 1. NATD expression was related to breast cancer cell metastasis. A:MS omics analysis heatmap of breast cancer cell lines with different metastatic ability;B:The expression of NATD protein in breast cancer cell lines with different metastatic ability was analyzed by Western blot(I:MDA-MB-231;II:LM2;III:MCF10CA1h;IV:MCF10CA1a);C:the low expression and high expression of NATD in breast cancer tissues were demonstrated by immunohistochemistry;D:comparison of overall survival rate between high and low expression of NATD in breast cancer(n=58);E:comparison of metastasis-free survival between high and low expression of NATD in breast cancer(n=96).圖1 NATD表達(dá)與乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移有關(guān)
然后我們探討了NATD 在肺轉(zhuǎn)移中的功能作用。分別在MDA-MB-231 細(xì)胞和LM2 細(xì)胞中過表達(dá)或敲減NATD,并通過Western blot 驗(yàn)證(圖2A)。將NATD 過表達(dá)的MDA-MB-231 細(xì)胞靜脈注射到小鼠體內(nèi),結(jié)果顯示,與pMSCV 對(duì)照組相比,NATD 過表達(dá)組顯著加劇了小鼠肺轉(zhuǎn)移負(fù)擔(dān)(圖2B、C)并縮短了動(dòng)物的存活期(圖2D)。相比之下,將NATD敲減的LM2 癌細(xì)胞靜脈注射到小鼠體內(nèi),減少了小鼠的肺定植并延長(zhǎng)了無轉(zhuǎn)移生存期(圖2E~G)。
Figure 2. NATD promoted lung metastasis of breast cancer. A:overexpression and knockdown of NATD in MDA-MB-231 and LM2 were verified by Western blot. B,C and D:MDA-MB-231 overexpressing NATD was injected intravenously for lung metastasis analysis. B:bioluminescence imaging(BLI)quantification and representative images(n=10);C:Lung surface nodules quantification and representative images(n=5);D:animal survival rate(n=8). E,F(xiàn) and G:intravenous injection of NATD knockdown LM2 for lung metastasis analysis. E:bioluminescence imaging(BLI)quantification and representative images(n=10);F:lung surface nodules quantification and representative images(n=5);G:animal survival rate(n=8).Mean±SD.**P<0.01 vs pMSCV group;△△P<0.01 vs sh-NC group.圖2 NATD促進(jìn)乳腺癌的肺轉(zhuǎn)移
為了研究NATD 在轉(zhuǎn)移中的分子機(jī)制,我們使用反相蛋白質(zhì)陣列分析了NATD敲減的LM2 和MCF10CA1a 轉(zhuǎn)移癌細(xì)胞的蛋白質(zhì)表達(dá),其涵蓋了主要信號(hào)通路中的蛋白質(zhì)標(biāo)記物。在分化表達(dá)的蛋白質(zhì)中,有34 個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生了顯著改變(22 個(gè)蛋白質(zhì)上調(diào),12個(gè)蛋白質(zhì)下調(diào))(圖3A)。接下來,在LM2細(xì)胞中進(jìn)行NATD RNA 免疫沉淀測(cè)序(RIP-seq),并在22 個(gè)上調(diào)蛋白質(zhì)中,發(fā)現(xiàn) 3 個(gè)基因(FOXA2、ABL1和MSH6)的mRNA 與NATD 蛋白結(jié)合(圖3B),表明它們是NATD 的直接目標(biāo)。已知FOXA2對(duì)腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移很重要;其他2 個(gè)基因在轉(zhuǎn)移中的功能目前尚未見報(bào)道。一致地,LM2 和MCF10CA1a 細(xì)胞中的NATD敲減也在體外上調(diào)這些基因的蛋白水平(圖3C)。
為了研究NATD 是否通過調(diào)節(jié)NATD 軸發(fā)揮作用,我們?cè)贛DA-MB-231 細(xì)胞中過表達(dá) NATD 和FOXA2。在NATD 過表達(dá)的MDA-MB-231 細(xì)胞中,F(xiàn)OXA2 表達(dá)明顯降低(圖4A)。然而,在NATD 過表達(dá)的MDA-MB-231 細(xì)胞中,F(xiàn)OXA2 過表達(dá)在一定程度下調(diào)NATD 表達(dá)和上調(diào) FOXA2 表達(dá)(圖 4A、B)。NATD 過表達(dá)介導(dǎo)的對(duì)MDA-MB-231 細(xì)胞侵襲和遷移的促進(jìn)作用被FOXA2 過表達(dá)逆轉(zhuǎn)(圖4C、D)。此外,免疫熒光和Western blot 印跡分析顯示,NATD 過表達(dá)介導(dǎo)MDA-MB-231 細(xì)胞的EMT 過程,而FOXA2過表達(dá)逆轉(zhuǎn)了NATD 對(duì)EMT 過程的誘導(dǎo)作用(圖4E~H)。這些數(shù)據(jù)提示NATD 可能通過調(diào)節(jié)FOXA2來抑制乳腺癌的EMT和轉(zhuǎn)移。
Figure 3. Identification of NATD targets by high-throughput reversed-phase protein array and RIP-Seq analysis. A:supervised hierarchical clustering analysis of the differential expression of 34 proteins identified by the high-throughput reverse-phase protein array between NATD knockdown LM2 and MCF10CA1a metastatic cancer cells;B:RNA immunoprecipitation sequencing(RIP-seq)showed the combination of NATD with a single mRNA of the transferred gene in LM2 cells[the normalized reading distribution of Input(blue)and NATD(red)along the mRNA];C:Western blot analysis of NATD protein expression levels in NATD knockdown LM2 and MCF10CA1a metastatic cancer cells.圖3 通過高通量反相蛋白質(zhì)陣列和RIP-Seq分析鑒定NATD靶標(biāo)
隨著早期診斷和全身治療的進(jìn)步,大多數(shù)早期非轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者被認(rèn)為有可能治愈[10]。然而,轉(zhuǎn)移性乳腺癌仍然被認(rèn)為是無法治愈的,死亡率很高[11]。因此,探索轉(zhuǎn)移機(jī)制是開發(fā)更有效的乳腺癌療法的關(guān)鍵。EMT 是轉(zhuǎn)移級(jí)聯(lián)反應(yīng)的第一步,以促進(jìn)癌細(xì)胞從原發(fā)腫瘤逃逸[12]。在這項(xiàng)研究中,我們證明NATD 可能通過下調(diào)FOXA2的表達(dá)來抑制乳腺癌的EMT 和轉(zhuǎn)移。與其他研究一致,我們的數(shù)據(jù)揭示了NATD/FOXA2 軸在EMT 和乳腺癌轉(zhuǎn)移中的重要作用,并表明NATD/FOXA2 軸是開發(fā)治療轉(zhuǎn)移性乳腺癌的潛在分子靶點(diǎn)。
Figure 4. FOXA2 overexpression can inhibit the EMT and metastasis of MDA-MB-231 cells. MDA-MB-231 cells were transfected with plasmids against NATD and/or FOXA2. A:the expression of NATD and FOXA2 protein were analyzed by Western blot(n=3);B:Transwell analysis of MDA-MB-231 cells(n=3);C:immunofluorescence detection of E-cadherin(green)and N-cadherin(red)immunofluorescence staining(n=3,×100);D:the expression of E-cadherin,N-cadherin and vimentin protein were analyzed by Western blot(n=3). Mean±SD.**P<0.01 vs control group;#P<0.05 vs NATD group.圖4 FOXA2過表達(dá)可抑制MDA-MB-231細(xì)胞的EMT和轉(zhuǎn)移
組蛋白修飾在基因調(diào)控中具有重要作用[13]。然而,即使這種修飾很豐富,并且相應(yīng)的NAT酶在真核生物中高度保守,但是組蛋白H4的N-α-末端乙?;墓δ苋匀徊淮_定[14]。最近發(fā)現(xiàn)NAT酶在幾種人類癌癥的發(fā)展和進(jìn)展中的關(guān)鍵作用突出了它們的重要臨床意義[15-16]。有研究證實(shí),NATA 復(fù)合物(Naa10p,NATA 復(fù)合物的催化亞基)與腫瘤有關(guān),并且對(duì)于維持增殖和確保各種癌細(xì)胞的存活至關(guān)重要[17]。由于NATD 催化活性僅限于組蛋白H4 和H2A,最近研究發(fā)現(xiàn)NATD 可通過不依賴p53 的機(jī)制在結(jié)直腸癌細(xì)胞中具有抗凋亡作用,并且NATD-KD 細(xì)胞對(duì)化療治劑表現(xiàn)出更高的敏感性[18]。此外,臨床觀察顯示,肺癌組織中的NATD 表達(dá)水平較鄰近的正常組織顯著升高,并且與患者的存活率呈負(fù)相關(guān),證實(shí)了NATD促進(jìn)肺癌進(jìn)展[7]。本研究擴(kuò)展了先前的研究發(fā)現(xiàn),證實(shí)了NATD 在轉(zhuǎn)移乳腺癌細(xì)胞中的表達(dá)高于親本癌細(xì)胞,并且NATD過表達(dá)的MDA-MB-231細(xì)胞顯著加劇了小鼠肺轉(zhuǎn)移負(fù)擔(dān)。相比之下,NATD敲減的LM2 細(xì)胞減少了小鼠的肺定植并延長(zhǎng)了無轉(zhuǎn)移生存期。這些發(fā)現(xiàn)證明了NATD 在乳腺癌中的促轉(zhuǎn)移作用。
最近研究證實(shí)組蛋白修飾與EMT 密切相關(guān)[19]。要進(jìn)行EMT,癌細(xì)胞需要獲得除遺傳變化以外的表觀遺傳變化[20]。這項(xiàng)研究通過高通量反相蛋白質(zhì)陣列RIP-Seq分析鑒定轉(zhuǎn)錄因子FOXA2為NATD靶標(biāo)。FOXA2 屬于轉(zhuǎn)錄因子的叉頭/翼狀螺旋家族[21],參與胚胎發(fā)育,并在來自三個(gè)胚層的多個(gè)成體組織中廣泛表達(dá)和發(fā)揮作用[22]。FOXA2在多種人類腫瘤中發(fā)揮作用,如肺癌、肝癌、前列腺癌、乳腺癌和胰腺癌,并且FOXA2 的持續(xù)表達(dá)通??梢苑乐股鲜瞿[瘤的進(jìn)展[23-25]。FOXA2 在正常人乳腺上皮細(xì)胞中表達(dá),但其表達(dá)因臨床乳腺癌樣本中FOXA2 基因甲基化增加而下調(diào),表明 FOXA2 影響乳腺癌進(jìn)展[26]。FOXA(HNF-3)是維持上皮標(biāo)志物E-cadherin表達(dá)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子之一,提示FOXA2 參與了EMT 的調(diào)控[27]。許多研究還證實(shí),F(xiàn)OXA2 通過抑制各種人類腫瘤(如胰腺癌、結(jié)直腸癌和肺癌)中的EMT,起到抑制腫瘤轉(zhuǎn)移的作用[28-30]。更重要的是,本研究中乳腺癌細(xì)胞中FOXA2的表達(dá)水平與NATD 的表達(dá)水平密切相關(guān),過表達(dá)NATD 通過抑制FOXA2 表達(dá)進(jìn)而誘導(dǎo)EMT 過程。這些發(fā)現(xiàn)確定了NATD 在基因表達(dá)調(diào)控中的新功能,并擴(kuò)展了我們對(duì)EMT 表觀遺傳調(diào)控的理解。在我們的結(jié)果中,F(xiàn)OXA2 是NATD 介導(dǎo)EMT 過程的直接表觀遺傳靶點(diǎn)。然而,考慮到NATD調(diào)節(jié)多個(gè)基因表達(dá)的能力,本研究不能完全排除由NATD 直接調(diào)節(jié)的其他基因有助于獨(dú)立于FOXA2表達(dá)的遷移和侵襲的可能性。
總之,在本研究中,我們首次證明NATD 通過控制FOXA2 介導(dǎo)的EMT 來促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移。我們的結(jié)果不僅揭示了乳腺癌轉(zhuǎn)移的新調(diào)控機(jī)制,而且為開發(fā)治療乳腺癌的新策略提供了潛在的靶點(diǎn)。根據(jù)我們的數(shù)據(jù),靶向NATD/FOXA2 軸可能是治療乳腺癌的新策略。