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        粳稻種質(zhì)資源稻瘟病抗性及抗性基因分析

        2022-04-06 01:22:12鄒拓耿雷躍張薇杜琪孟令啟張啟星
        中國稻米 2022年2期

        鄒拓 耿雷躍 張薇 杜琪 孟令啟 張啟星

        (1 河北省農(nóng)林科學(xué)院濱海農(nóng)業(yè)研究所,河北 唐山 063299;2 唐山市水稻育種重點實驗室,河北 唐山 063000;*第一/通訊作者:549282738@qq.com)

        稻瘟病是水稻的主要病害之一,由真菌病原體(Magnaporthe oryzae)引起。1919年在印度首次發(fā)現(xiàn)稻瘟病,造成當(dāng)年水稻減產(chǎn)4%左右[1]。在隨后的稻瘟病發(fā)生過程中,僅僅在印度東部地區(qū)就造成水稻減產(chǎn)50%左右[2-3]。稻瘟病菌具有多樣性,以致一個抗病品種在生產(chǎn)上使用3~5年就喪失抗性[4-6]。有研究表明,全球每年由于稻瘟病造成的水稻減產(chǎn)量可以滿足6 000 萬人口的糧食需求,導(dǎo)致的直接經(jīng)濟(jì)損失高達(dá)50 億美元[7-8]。因此,篩選并應(yīng)用新的抗病種質(zhì)資源,有助于培育廣譜、持久的抗稻瘟病新品種。

        近年來,隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,越來越多的稻瘟病抗性基因被定位,在已定位的約100個稻瘟病抗性基因中有28個被成功克隆[9-10]。本研究中,利用Pi37、Pib、Pi9、Pigm、Pid3、Piz、Pi36、Pi5、Pia、Pikh、Pik 和 Pita基因的特異性分子標(biāo)記對參試粳稻資源進(jìn)行抗病基因型鑒定。其中,Pib 來自品種BL1,對日本大多數(shù)稻瘟病菌小種有抗性,對中國的菌株ZB13 和ZC15 也表現(xiàn)抗病反應(yīng)[11];Pita 對稻瘟病菌菌株 ZN57 和 ZN61 表現(xiàn)抗病[12];Pia 對江蘇省生理小種表現(xiàn)為強(qiáng)抗性[13]。

        本研究中利用現(xiàn)有的粳稻資源,通過表型評價與基因型鑒定相結(jié)合的方式,分析基因型與其抗病反應(yīng)的關(guān)系,找到有效的抗病基因或聚合基因型,篩選到對本地區(qū)稻瘟病小種具有較強(qiáng)抗性的種質(zhì)資源,對今后抗稻瘟病水稻育種具有重要意義。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        共用到157 份粳稻材料,具體信息如表1。2019年4月至10月種植于河北省農(nóng)林科學(xué)院濱海農(nóng)業(yè)研究所試驗基地。

        表1 粳稻資源信息

        1.2 實驗方法

        1.2.1 抗病基因分子檢測

        水稻分蘗高峰期取葉片樣品,存放至-20℃冰箱。水稻基因組DNA 的提取按上海植物生理研究所的TPS 抽提法稍加修改。Pi37、Pib、Pi9、Pigm、Pid3、Piz、Pi36、Pi5、Pia、Pikh、Pik 和 Pita 等 12個基因的引物序列及擴(kuò)增產(chǎn)物信息如表2,引物由北京擎科生物公司代為合成。PCR 的反應(yīng)體系總體積 20 μl,其中包括0.2 μl dNTP(10 mM),2.0 μl 10×PCR buffer(含 15 mM MgCl2),引物各 1.5 μl ,0.1 μl Taq 酶(5 U/μl),2 μl 材料基因組DNA,其余體積量由ddH2O 補(bǔ)齊。PCR 反應(yīng)程序:94℃預(yù)變性 5 min;94℃變性 45 s,55℃退火 45 s,72℃延伸45 s;72℃,延伸5 min(括號部分為35個循環(huán))。待溫度降至25℃,移至4℃冰箱待用。利用1%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行擴(kuò)增片段的分離,在凝膠成像系統(tǒng)下拍照讀帶。

        表2 抗稻瘟病基因分子標(biāo)記引物及擴(kuò)增片段信息

        1.2.2 田間誘發(fā)稻瘟病鑒定

        供試的 157 份材料于 4月20日播種,5月30日移栽,行株距20 cm×10 cm,每間隔10 份材料種植1 份麗江新團(tuán)黑谷并在鑒定圃周圍種植1 圈麗江新團(tuán)黑谷。鑒定圃內(nèi)防蟲不治病,增施氮肥,提高田間濕度,其余管理措施同大田。當(dāng)感病品種麗江新團(tuán)黑谷發(fā)病后確定稻瘟病誘發(fā)有效。7月26日至31日進(jìn)行田間葉瘟發(fā)病調(diào)查,8月20日開始調(diào)查穗瘟。調(diào)查方法及病級計算參照NY/T 2646-2014[14]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 粳稻資源田間感病情況

        據(jù)田間調(diào)查結(jié)果,在157 份材料中,表現(xiàn)為抗的2份、占比1.27%,中抗70 份、占比 44.59%,中感64 份、占比40.76%,感及高感共21 份、占比13.38%。可見,大多數(shù)種質(zhì)材料抗病綜合指數(shù)分布在中抗及中感水平間,表現(xiàn)為抗、感及高感的材料較少。參試材料中,葉瘟平均病級4.00,變異系數(shù)40.00%;穗瘟平均病級4.23,變異系數(shù)50.59%。

        2.2 12個抗病基因的檢測結(jié)果

        為明確不同基因型對本地區(qū)稻瘟病抗性表現(xiàn)情況,選擇抗性表現(xiàn)最好的和抗性表現(xiàn)最差的材料各20份,進(jìn)行抗稻瘟病基因分子檢測。通過比較表現(xiàn)極端的材料,找到材料中基因數(shù)量和基因型的差異與抗病性的關(guān)系。從圖1 可見,檢出頻率在15 次以上的有8個基因,其中Pid3 和Piz 基因檢出頻率最高,分別檢出40 次和34 次;檢出頻率在10 次以下的有4個基因,其中,Pi9 未檢出。

        圖1 12個抗病基因的檢測情況

        從表3 可見,40 份材料中,平均含有抗性基因5.2個;抗稻瘟病綜合指數(shù)表現(xiàn)為抗的材料中含有的抗病基因為5~8個,表現(xiàn)為感病的材料中,含有的抗病基因為2~5個。其中,ZY29 具有抗性基因最多,包含Pi5、Piz、Pik、Pikh、Pi37、Pid3、Pia、Pita 等 8個基因,抗病綜合指數(shù)為2.5,表現(xiàn)為中抗。ZY115 具有抗性基因數(shù)量最少,僅含Pi36、Pid3,抗病綜合指數(shù)為8.3,表現(xiàn)為高感。

        2.3 材料抗性與基因型及基因數(shù)量的關(guān)系

        通過對比抗病材料與感病材料的基因型看出(表3、圖2),抗病材料與感病材料相比,大多具有Pigm(5∶2)、Pia(18∶0)、Pita(5∶0)Pik(17∶4)、Pi5(12∶4)這 5個基因,括號中數(shù)字為具有此種基因抗病材料與感病材料的數(shù)量。由此可見,這5個基因在本地區(qū)對稻瘟病的抗病性起到一定作用。利用SPSS 對抗病基因數(shù)量與葉瘟病級進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果(表4)表明,材料中的抗病基因數(shù)量與稻瘟病綜合指數(shù)的相關(guān)系數(shù)為-0.844,在P=0.01 水平上達(dá)到負(fù)顯著性相關(guān)??梢?,含有更多抗性基因的水稻材料具有更好的稻瘟病抗性。

        圖2 抗病材料與感病材料在基因型上的差異

        表3 40 份材料的基因型及抗稻瘟病綜合指數(shù)

        表4 抗病綜合指數(shù)與抗病基因個數(shù)的相關(guān)性分析

        2.4 種植資源在抗病育種上的應(yīng)用

        從表 5 可見,ZY2、ZY13、ZY15 和 ZY21 等 4個種質(zhì)資源抗病性好,在株高、穗頸長、產(chǎn)量等性狀上能夠達(dá)到作為育種親本的要求。因此,育種者可利用這些材料通過分子標(biāo)記輔助選擇與常規(guī)育種手段相結(jié)合的方式,快速、準(zhǔn)確的選育聚合多個抗稻瘟病基因的新品種。

        表5 抗病材料的農(nóng)藝及產(chǎn)量性狀

        3 討論

        前人研究中,少有利用粳稻資源在冀東地區(qū)做稻瘟病抗性評價,而不同稻區(qū)稻瘟病生理小種自身也有高度的變異性,氣候條件也是影響稻瘟病發(fā)病的主要因素[22]。另外,病圃田間的誘發(fā)致病的生理小種是未知的混合小種, 而且不同位置的侵染菌種也可能不盡相同,加上小氣候差異等因素,所以田間誘發(fā)鑒定比人工接種鑒定的可靠性差些[23]。因此,本課題組利用157 份粳稻資源在河北省農(nóng)林科學(xué)院濱海農(nóng)業(yè)研究所試驗基地進(jìn)行田間感病試驗,重點結(jié)合本地區(qū)生態(tài)環(huán)境及稻瘟病生理小種評價材料的抗病性,再結(jié)合分子標(biāo)記對抗病基因鑒定,挖掘在冀東地區(qū)表現(xiàn)高抗性抗病基因,為冀東地區(qū)抗病育種提供有效的基因供體。

        本次用到的12個抗稻瘟病基因分布在第1、第2、第 6、第 8、第 9、第 11 和第 12 染色體上,全部已經(jīng)克隆,效應(yīng)及位點比較明確[9-10]。試驗中,用到的標(biāo)記大多為功能標(biāo)記。目前定位到的抗性基因除以上7 條染色體外,還存在于第4、第5、第7 和第10 染色體上,但其定位基因較少,未有基因簇的出現(xiàn)[24]。因此,本次選擇的基因具有一定的代表性和準(zhǔn)確性。

        本研究中,通過對病級和抗病基因數(shù)量進(jìn)行相關(guān)性分析,得到病級與基因數(shù)量成負(fù)向極顯著,因此聚合更多的抗性基因會提高品種的抗病性,這與張羽提出的稻瘟病抗性也屬于數(shù)量性狀,隨著抗性基因數(shù)目的增多,品種的抗病性呈上升趨勢一致[25]。

        4 結(jié)論

        對157份粳稻資源進(jìn)行稻瘟病抗性自然誘發(fā)鑒定,對稻瘟病表現(xiàn)為抗的有2 份、表現(xiàn)為中抗的有70份。結(jié)合稻瘟病基因檢測,對比抗病材料與感病材料基因型得到 Pigm、Pia、Pita、Pik、Pi5 等 5個對冀東地區(qū)稻瘟病有明顯抗病作用的抗性基因,且聚合的抗病基因越多,材料的抗病能力越高。進(jìn)一步結(jié)合農(nóng)藝及產(chǎn)量性狀得到 ZY2、ZY13、ZY15 和 ZY21 這 4個種質(zhì)資源可作為抗稻瘟病育種中的抗病親本。

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