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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對接的黃芪散治療2型糖尿病機制探討

        2022-03-29 08:11:12邢菊玲劉芬馮萌黃天來周欣欣
        關(guān)鍵詞:靶點黃芪受體

        邢菊玲,劉芬,馮萌,黃天來,周欣欣

        (廣州中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院,廣東廣州 510006)

        糖尿病是因胰島素分泌和(或)作用缺陷而導(dǎo)致血糖水平升高的一種復(fù)雜的代謝性疾病。糖尿病在全球患病率不斷攀升,我國為糖尿病的高發(fā)地區(qū)[1-5]。根據(jù)發(fā)病機制不同,糖尿病可分為1型糖尿病和2型糖尿病[2-3],而2型糖尿病作為主要的糖尿病類型,占糖尿病患者的90%以上。2型糖尿病是指由遺傳和環(huán)境因素相互作用而引起的一種代謝異常綜合征,以慢性高血糖為主要特征,具有起病隱匿、潛伏期長的特點[4]。目前,針對2型糖尿病的治療西醫(yī)多采用羅格列酮、二甲雙胍等調(diào)脂類藥物,一方面可以增加肝臟、肌肉、脂肪組織對胰島素的敏感性,另一方通過減少糖原生成,增加葡萄糖外周利用而降低血糖,但長時間用藥會造成肝腎功能和消化系統(tǒng)的損傷,效果不夠理想[6]。

        糖尿病歸屬于中醫(yī)學(xué)“消渴”病的范疇,常表現(xiàn)為乏力、多飲、多食、多尿等癥狀,臨床多采用生津止渴、益氣養(yǎng)陰、輸津澀精等方法予以治療。大量研究表明,中藥在改善2型糖尿病療效顯著,具有多環(huán)節(jié)、多靶點以及多途徑用藥價值,且用藥后安全性較高[7]。復(fù)方黃芪散出自北宋《圣濟總錄》,由黃芪、葛根、桑白皮(1∶2∶1)組成,原文記載其可“治三消渴疾,肌膚瘦弱,飲水不止,小便不利”。方中:黃芪補氣生津以止渴,善治氣虛津虧的消渴證;葛根升發(fā)清陽,鼓舞脾胃清陽之氣上升而生津止渴,輸津液以溉五臟而滋陰清熱,生用善治陰虛消渴;桑白皮甘寒瀉火,滋陰潤燥,以甘寒之性制黃芪稍熱之性,以益氣生津,善治氣陰不足消竭;三藥配伍共奏益氣健脾、滋陰清熱、生津止渴功效,三消并治,標(biāo)本兼顧。本課題組前期研究[8-12]表明,黃芪散可改善2型糖尿病模型大鼠糖脂代謝紊亂、調(diào)節(jié)內(nèi)外源性脂代謝失衡及提高胰島素敏感性,降低體質(zhì)系數(shù),起到降脂和減肥作用,同時可以改善糖尿病性心肌病和糖尿病性的骨質(zhì)疏松。但中藥復(fù)方組方成分復(fù)雜,藥效物質(zhì)基礎(chǔ)不明確,且相關(guān)機制解釋較困難,因此,本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對黃芪散活性成分及其作用靶點進行“分子-靶點-通路-疾病”的多層次網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,闡明黃芪散治療2型糖尿病可能存在的分子機制,以期為今后黃芪散治療2型糖尿病的研究提供新的思路和方法?,F(xiàn)將研究結(jié)果報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 黃芪散活性化合物及靶標(biāo)蛋白的篩選通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺[13](TCMSP)(http://tcmspw.com/tcmsp.php),以“黃芪”“葛根”“桑白皮”為關(guān)鍵詞檢索黃芪散中的化學(xué)成分,篩選出口服生物利用度(OB)≥30%[14]和類藥性(DL)≥0.18[15]的化學(xué)成分作為活性成分及相關(guān)靶標(biāo)蛋白。

        1.2 活性成分潛在靶點反向預(yù)測首先通過有機小分子生物活性數(shù)據(jù)庫PubChem(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/search/)搜索“1.1”項篩選的活性成分,得到簡化分子線性輸入規(guī)范SMILES(simplified molecular input line entry specification),再將各分子的SMILES式輸入Swiss Target Prediction在線網(wǎng)址(http://www.swisstargetprediction.ch/[16]),種屬設(shè)置為Homo sapiens(Human),Probability≥0.85,得到所選成分潛在靶點的預(yù)測結(jié)果,將TCMSP得到的靶標(biāo)蛋白和反向預(yù)測得到的潛在靶點匯總,得到最后的成分靶標(biāo)。

        1.3 疾病靶點的篩選通過人類基因數(shù)據(jù)庫GeneCards(http://www.genecards.org/)和在線人類孟德爾遺傳(OMIM)數(shù)據(jù)庫(http://www.omim.org/),以“type 2 diabetes”“T2DM”和“diabetes mellitus type 2”為關(guān)鍵詞進行檢索,得到與2型糖尿病相關(guān)的基因,其中GeneCards數(shù)據(jù)庫以相關(guān)性分數(shù)(relevance score)≥30[17]作為篩選條件,將篩選結(jié)果歸納整理得到2型糖尿病疾病的靶標(biāo)。

        1.4 藥物靶點與疾病靶點標(biāo)準(zhǔn)化及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建通過靶點標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)庫UniProt(https://www.uniprot.org/)分別上傳上述得到的藥物成分靶點與疾病靶點的名稱(target name),蛋白種屬設(shè)置為Homo sapiens(Human),獲取其靶點的標(biāo)準(zhǔn)基因名。并通過Cytoscape 3.6.1軟件(http://www.cytoscape.org/)構(gòu)建化合物成分-靶點網(wǎng)絡(luò),分析化合物和靶點間的度(Degree)值。

        1.5 蛋白質(zhì)相互作用(PPI)的構(gòu)建及其核心網(wǎng)絡(luò)的篩選首先通過Venny 2.1軟件將標(biāo)準(zhǔn)化的成分靶點與疾病靶點取交集,得到交叉共有的靶蛋白基因名,即潛在靶點,再將潛在靶點導(dǎo)入在線網(wǎng)站STRING 10.5(https://string-db.org[18]),選 用Multiple Proteins工具,種屬設(shè)置為Homo sapiens(Human),獲取PPI關(guān)系,根據(jù)最高級篩選條件“highest confidence(≥0.9)”,得到聯(lián)系最緊密的PPI網(wǎng)絡(luò),并保存TSV格式文件。將文件中的node1、node2、combined score整理導(dǎo)入Cytoscape 3.6.1軟件進行網(wǎng)絡(luò)拓撲結(jié)構(gòu)分析。網(wǎng)絡(luò)中靶點大小和顏色可反映節(jié)點Degree值。并通過軟件的Merge功能將上述的成分-靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)與蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)合并,得到疾病-成分-靶點網(wǎng)絡(luò),利用插件Network Analyzer分析網(wǎng)絡(luò)節(jié)點Degree值,計算基因靶點的平均值,篩選出節(jié)點Degree值高于平均值的節(jié)點作為核心靶點。

        1.6 基因本體論(GO)生物過程和京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析將上述篩選出的核心靶點導(dǎo)入DAVID數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/[19]),種屬設(shè)置為Homo sapiens(Human),靶基因名選擇官方名稱(Office-gene-symbol),進行GO生物學(xué)過程富集分析和KEGG信號通路富集分析。以P<0.05作為篩選條件,選取符合條件的GO生物過程和KEGG通路,并根據(jù)P值從小到大排序,選擇P值在前20位的通路進行可視化處理。

        1.7 分子對接利用MOE(Molecular Operating Environment)2015軟件對黃芪散的部分核心靶點與主要活性成分進行分子對接。通過PubChem CID(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pccompound)下載包括quercetin、kaempferol等15個活性成分的三維結(jié)構(gòu),導(dǎo)入MOE軟件進行能量優(yōu)化,并保存為MDB文件作為之后分子對接的配體。通過PDB數(shù)據(jù)庫(https://www.rcsb.org/)下載ESR1和JUN的3D晶體結(jié)構(gòu)(PDBID:1A52和5FV8,分辨率:2.8?和1.99?),導(dǎo)入Moe軟件,刪除不相關(guān)的配體與水分子,并基于AMBER10:EHT力場和R-field隱式溶劑模型,通過LigX模塊優(yōu)化蛋白的質(zhì)子化狀態(tài)及氫原子的位置,保存作為分子對接的受體,之后,通過MOE軟件中的對接模塊Dock預(yù)測受體與配體之間的的結(jié)合能力,并通過London dG和GBVI/WSA dG打分函數(shù)對活性成分與靶標(biāo)蛋白相互作用進行評分。對接打分越低(即能量越低),表示結(jié)合構(gòu)型越穩(wěn)定。

        2 結(jié)果

        2.1 活性化合物的篩選通過TCMSP數(shù)據(jù)庫檢索得到黃芪散化學(xué)成分共299個,其中,黃芪87個,葛根18個,桑白皮194個,以O(shè)B≥30%和DL≥0.18篩選后,獲得黃芪散的活性成分共50個(見表1),其中,黃芪19個、葛根4個、桑白皮32個。其中,白樺脂酸(mairin)、山柰酚(kaempferol)和槲皮素(quercetin)為黃芪-桑白皮所共有,刺芒柄花素(formononetin)為黃芪-葛根所共有,beta-谷甾醇(beta-sitosterol)為葛根-桑白皮所共有。

        表1 黃芪散活性成分篩選結(jié)果Table 1 Screening results of active ingredients of Huangqi San

        2.2 化學(xué)成分靶點預(yù)測結(jié)果通過TCMSP平臺,共得到成分靶標(biāo)924個(黃芪448個、葛根68個、桑白皮408個),通過Swiss Target Prediction服務(wù)器篩選補充得到170個,結(jié)合TCMSP和Swiss Target Prediction刪除重復(fù)基因后共得到成分靶點基因246個。

        2.3 疾病靶點預(yù)測結(jié)果通過GeneCards數(shù)據(jù)庫檢索2型糖尿病的關(guān)鍵詞,共得到10 777個與2型糖尿病相關(guān)的基因,經(jīng)過篩選最終得到580個。通過OMIM數(shù)據(jù)庫補充基因83個,最后得到663個疾病候選靶點基因。

        2.4 成分-藥物靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建將上述50個藥物活性成分與246個成分靶點輸入Excel文件并進行屬性編排,導(dǎo)入Cytoscape 3.6.1軟件得到黃芪散活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖,圖中橢圓代表藥物作用的靶點,長方形代表藥物活性成分,三角形代表藥物,共得到287個節(jié)點,2 748條邊,見圖1。網(wǎng)絡(luò)中的50個化合物中有12個未參與網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,因此節(jié)點由246個基因、38個藥物活性成分和3個藥物組成,而每條邊則表示不同節(jié)點與節(jié)點之間的相互作用關(guān)系,可見一個藥物對應(yīng)多種成分,一種成分對應(yīng)多個靶點,反過來一個靶點也對應(yīng)多種成分,從而更加直觀地體現(xiàn)了中藥復(fù)方多成分、多靶點的特點。在網(wǎng)絡(luò)中,一個節(jié)點與其他節(jié)點的連線越多,節(jié)點Degree值越大,其化合物或者靶點在網(wǎng)絡(luò)中作用也越關(guān)鍵。黃芪散成分-靶點網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點Degree值>20的靶點有PTGS2、PTGS1、PPARG、PRSS1、AR、NOS2、NCOA2、ESR1、RXRA、ACHE、SCN5A、ESR2、GSK3B、ADRB2、GABRA1和PGR,節(jié)點Degree值>20的成分有槲皮素(quercetin)、山柰酚(kaempferol)、刺芒柄花素(formononetin)、beta-谷甾醇(beta-sitosterol)、7-O-甲基異丙醇胺(7-O-methylisomucronulatol)、異鼠李素(isorhamnetin)、桑根酮F(sanggenone F)和桑辛素(moracin D)等。

        圖1 黃芪散活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖Figure 1 Active ingredient-target network diagram of Huangqi San

        (續(xù)表1)

        2.5 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建通過Uniport得到成分與疾病靶標(biāo)蛋白的標(biāo)準(zhǔn)基因名,導(dǎo)入Venny 2.1軟件繪制韋恩圖(見圖2),得到成分和疾病共有潛在靶點98個。主要有誘導(dǎo)型一氧化氮合酶2(NOS2)、前列腺素G/H合成酶1(PTGS1)、前列腺素G/H合成酶2(PTGS2)、雌激素受體1(ESR1)、過氧化物酶體增殖因子活化受體γ(PPARG)、絲裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、糖原合酶激酶3β(GSK3B)、白細胞介素6(IL6)、乙酰膽堿酯酶(ACHE)等。將得到的98個潛在靶點導(dǎo)入STRING平臺,設(shè)置“highest confidence≥0.9”,得到PPI網(wǎng)絡(luò),并下載導(dǎo)出TSV格式文件,將文件中的node1、node2、combined score信息整理導(dǎo)入Cytoscape 3.6.1軟件進行網(wǎng)絡(luò)拓撲結(jié)構(gòu)分析,見圖3,節(jié)點Degree和節(jié)點之間的combined score可分別反映靶點大小和顏色及邊的粗細,該網(wǎng)絡(luò)有88個節(jié)點,361條邊組成。通過Cytoscape 3.6.1軟件的Merge功能將成分-靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)與PPI網(wǎng)絡(luò)合并,得到疾病-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖(見圖4,Degree值越大,節(jié)點越大),并利用插件Network Analyzer分析網(wǎng)絡(luò)節(jié)點Degree。Degree值越大,則節(jié)點越大。網(wǎng)絡(luò)中共有284個節(jié)點和953條邊,其中,38個是成分節(jié)點,246個是基因節(jié)點,成分節(jié)點和基因節(jié)點的平均Degree值為15.58和5.34,成分節(jié)點Degree值大于平均Degree值 的 有quercetin(193),kaempferol(64)、7-Omethylisomucronulatol(32)、isorhamnetin(30)、Formononetin(27)、beta-sitosterol(26)、3,9-di-O-methylnissolin(19)、hederagenin(16)、(6aR,11aR)-9,10-dimethoxy-6a,11a-dihydro-6Hbenzofurano[3,2-c]chromen-3-ol(18)9個成分,基因節(jié)點Degree值大于平均Degree值的有包括ESR1(37)、JUN(34)、PTGS2(34)、AKT1(34)、MAPK14(31)等在內(nèi)的75個基因,見表2。

        表2 黃芪散關(guān)鍵基因的基本信息Table 2 Basic information of key genes of Huangqi San

        圖2 黃芪散治療2型糖尿病的活性成分靶點-疾病靶點韋恩圖Figure 2 Venn diagram of targets of active ingredientdisease in Huangqi San for treatment of T2DM

        圖3 黃芪散治療2型糖尿病共有靶點的PPI網(wǎng)絡(luò)Figure 3 PPI network of common targets in Huangqi San for treatment of T2DM

        圖4 黃芪散治療2型糖尿病的疾病-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)Figure 4 Disease-component-target network in Huangqi San for treatment of T2DM

        2.6 GO生物過程和KEGG通路富集分析利用DAVID數(shù)據(jù)庫,將上述得到的75個靶蛋白基因上傳并進行GO生物過程及KEGG信號通路的富集分析。以P<0.05作為篩選條件,共得到了113個GO條目,并按照P值從小到大的順序,選取前20個GO生物過程分析條目,主要包括類固醇激素受體活性、蛋白酪氨酸激酶活性、核受體活性、泛素蛋白連接酶結(jié)合、生長因子受體結(jié)合、細胞因子活性等生物過程,具體結(jié)果見表3。另外,KEGG結(jié)果分析,共富集到157條信號通路(P<0.05),按照P值從小到大的順序篩選前20條,主要涉及到糖尿病并發(fā)癥晚期糖基化終末產(chǎn)物(AGEs)-晚期糖基化終末產(chǎn)物受體(RAGE)信號通路、流體剪應(yīng)力與動脈粥樣硬化、乳腺癌、結(jié)直腸癌、乙型肝炎、丙型肝炎肺炎、缺氧誘導(dǎo)因子1(HIF-1)信號通路、IL-17信號通路、腫瘤壞死因子(TNF)信號通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信號通路等,見圖5~圖6。此外,KEGG結(jié)果還包含一些常見的治療糖尿病的信號通路,如胰島素抵抗(insulin resistance)通路、AMPK信號通路、MAPK信號通路、PPAR信號通路和Toll樣受體信號通路等。

        圖5 基因本體論(GO)分析氣泡圖Figure 5 Bubble charts of gene ontology(GO)analysis

        圖6 京都基因與基因組百科全書(KEGG)分析氣泡圖Figure 6 Bubble charts of Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)analysis

        2.7 分子對接本研究基于PPI網(wǎng)絡(luò)中Degree值較大的前2個核心靶點與15個活性成分進行能量匹配,根據(jù)對接打分選取最優(yōu)構(gòu)型,見表4。其平均對接打分為-5.54 kcal/mol,可見大部分配體均能與受體很好地結(jié)合,其中,異鼠李素(isorhamnetin)與ESR1對接打分最低,為-7.25 kcal/mol。異鼠李素(ID:5281654)結(jié)構(gòu)見圖7-A。ESR1蛋白結(jié)構(gòu)見圖7-B。docking后活性位點及相互作用關(guān)系見圖7-C和圖7-D:圖7-C中異鼠李素顯示為黃色,周圍活性口袋的氨基酸顯示為綠色,條帶顏色為白色;圖7-D中,綠色代表具疏水性的氨基酸,紫色代表極性作用不帶電荷或帶正負的氨基酸。因此可見,異鼠李素周圍存有Met421、Ile424、Phe404、Met434、leu428、leu391、leu349、leu346、leu387、leu384、Met388、leu525等疏水基團,Thr347、Gly521、His524等極性不帶電氨基酸殘基,Glu353極性帶負電的氨基酸和Arg394極性帶正電的氨基酸,表明較多的疏水性氨基酸在空間位置上包圍在化合物周圍,以范德華力為主導(dǎo)影響兩者相互作用,并且還與氨基酸殘基His524和Glu353產(chǎn)生氫鍵作用及l(fā)eu387的PI鍵作用。

        表4 受體與配體的對接打分Table 4 The docking score of receptors and ligands

        圖7 異鼠李素與ESR1相互作用的分子對接示意圖Figure 7 Molecular docking diagram of isorhamnetin interaction with ESR1

        3 討論

        網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是由英國鄧迪大學(xué)藥理學(xué)家Hopkins于2007年在Nature Bioteehnology雜志中首次提出,并定義為一門以系統(tǒng)生物學(xué)和多項藥理學(xué)為理論基礎(chǔ),利用生物分子網(wǎng)絡(luò)分析方法,選取特定節(jié)點進行藥物設(shè)計和靶點分析的藥理學(xué)分支學(xué)科[20-21]。隨著人類物質(zhì)文明的高度發(fā)展,生活方式的改變,以及老齡化進程的加劇,人類疾病譜發(fā)生了很大的變化,以腫瘤、心血管疾病和糖尿病等為代表的慢性復(fù)雜病已成為威脅人類健康的重要因素。這些復(fù)雜疾病及并發(fā)癥的發(fā)生和發(fā)展過程往往涉及機體的多個臟腑、多個靶點、多個基因以及多個信號通路[22],因此,傳統(tǒng)“一個藥物、一個靶標(biāo)、一種疾病”的藥物理念已經(jīng)難以達到很好的治療目的。而網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)具有“多基因、多靶點”的特點,同時中藥及其復(fù)方為多成分、多途徑、多靶點協(xié)同作用,這正與復(fù)雜疾病的治療理念想吻合,因此探索中藥及復(fù)方與多靶點多基因之間的復(fù)雜網(wǎng)狀關(guān)系,在闡述復(fù)雜疾病的發(fā)病機制及治療靶標(biāo)的研究方面具有重要的價值。黃芪散作為治療消渴病的經(jīng)典古方,秉承中醫(yī)藥的君臣佐使觀念和臟腑經(jīng)絡(luò)學(xué)說,三味藥相互配伍,相輔相成,相得益彰。因此,本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)構(gòu)建黃芪散-2型糖尿病的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,逐步分析了其活性成分、調(diào)控的靶點基因和體內(nèi)發(fā)生的生物過程和信號通路,系統(tǒng)整體地解釋了黃芪散在治療2型糖尿病中的作用。

        本研究結(jié)果顯示,黃芪散的有效活性成分為38個,發(fā)揮治療2型糖尿病的關(guān)鍵成分有槲皮素、山柰酚、刺芒柄花素、beta-谷甾醇等。有研究表明,槲皮素能降低2型糖尿病大鼠的血糖,其機制可能與其降低機體氧化應(yīng)激水平,抑制胰島細胞凋亡有關(guān)[23],還能通過激活胰腺組織中成纖維細胞生長因子21(FGF21)/AMPK信號通路來減輕大鼠外周胰島素抵抗[24]。山柰酚可以通過抑制胰島β細胞凋亡,促進增殖,保護胰島β細胞功能、改善胰島素敏感性以及調(diào)節(jié)胞內(nèi)甲狀腺激素代謝相關(guān)酶的活性,增加能量消耗來改善脂代謝紊亂,降低血糖[25]。另外,Oza等[26]的研究也表明,刺芒柄花素不僅可以改善糖尿病大鼠的葡萄糖耐量、胰島素敏感性和血脂狀況,還可以顯著地降低血液中的糖血紅蛋白,提高大鼠的肝糖原水平,同時,還可以保護胰島β細胞免受壞死和萎縮的影響。本研究結(jié)果與上述報道相符,說明黃芪散在治療2型糖尿病時具有多成分共同作用的特點。

        本研究疾病-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)結(jié)果表明黃芪散有效成分可能是通過ESR1、JUN、PTGS2、AKT1、MAPK14等75個藥物成分與疾病的共同靶點起作用。郭姣教授于2017年首次提出“糖脂代謝?。℅lucolipid Metabolic Disease,GLMD)”概念,即糖脂代謝是一種以糖、脂代謝紊亂為特征,由遺傳、環(huán)境、精神等多種因素參與的疾病,以神經(jīng)內(nèi)分泌失調(diào)、胰島素抵抗、氧化應(yīng)激、炎癥、腸道菌群失調(diào)為核心病理,以高血糖、血脂失調(diào)、非酒精性脂肪肝、超重、高血壓及動脈粥樣硬化等單一或合并出現(xiàn)為主要臨床表現(xiàn)特點,需要綜合一體化治療[27]。因此,對今后的抗糖尿病的藥物提出了更高更全面的要求,不只是要單方面地降低血糖,同時還要具有調(diào)節(jié)內(nèi)分泌失調(diào),抗胰島素抵抗,抗炎抗氧化等作用。本研究中發(fā)現(xiàn),黃芪散的核心靶點與上述糖脂代謝病的核心病理均密切相關(guān),這些靶點可以大致分為六大類:一是神經(jīng)內(nèi)分泌因子類,有雄激素受體(AR)、雌激素受體α(ESR1)、雌激素受體β(ESR2)、類固醇受體激活蛋白(NCOA1、NCOA2)和綿羊孕酮受體(PGR);二是胰島素抵抗類,有胰島素受體(INSR)、過氧化物酶體增殖物激活受體α(PPARA)、過氧化物酶體增殖因子活化受體γ(PPARG)、胰島素樣生長因子1受體(IGF1R)、胰島素樣生長因子結(jié)合蛋白3(IGFBP3)、胰島素樣生長因子2(IGF2);三是血管因子類,有一氧化氮合酶(NOS2、NOS3)、信號傳導(dǎo)轉(zhuǎn)錄激活因子1(STAT1)、血管內(nèi)皮細胞黏附分子1(VCAM1)、血管內(nèi)皮生長因子A(AVEGFA)、血管內(nèi)皮生長因子受體(KDR)、細胞間黏附分子1(ICAM1)、基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)家族的基質(zhì)金屬蛋白酶MMP2和MMP9,以及調(diào)控誘導(dǎo)血管生成的調(diào)節(jié)因子MAPK家族(MAPK1、MAPK14、MAPK18);四是炎癥因子類,包括BCL-2基因家族中的細胞凋亡促進基因(BAX、BCL2、BCL2L1)、白細胞介素(IL10、IL2、IL4、IL6、IL1A、IL1B),腫瘤壞死因子家族CD40LG及趨化因子CCL2;五是癌癥類,有RAF1、RB1、MYC、JUN癌基因以及與胃癌密切相關(guān)的SERPINE1;六是激酶及調(diào)節(jié)細胞生長、分裂、增殖、分化等生物過程的核基因類,有乙酰膽堿酯酶(ACHE)、β2腎上腺素能受體(ADRB2)、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶1(AKT1)、糖原合成酶激酶3β(GSK3B)、絲氨酸蛋白酶1(PRSS1)、表皮細胞生長因子(EGF、EGFR、ERBB2)和核受體亞家族3C組成員1(NR3C1)。同樣,GO富集分析表明黃芪散涉及體內(nèi)的多個生物過程,因此,說明黃芪散在治療2型糖尿病時具有多靶點、多途徑協(xié)同作用的特點。

        KEGG通路富集分析共得到了157條信號通路,其中AMPK通路、胰島素抵抗通路[28]、PPARα通路[12]、p53通路[29]均已在實驗中得到驗證,與本課題組前期研究結(jié)果一致,反映了本研究數(shù)據(jù)的可靠性。根據(jù)P值篩選到的前20條核心通路與2型糖尿病發(fā)病機制最密切,其中多條通路與2型糖尿病的并發(fā)癥相關(guān),且已經(jīng)被實驗或臨床研究驗證。例如,孔莫維等[30]研究表明,糖尿病與諸多的癌癥(乳腺癌、膀胱癌、前列腺癌、結(jié)直腸癌等)均存在相互關(guān)系,與普通人群相比,糖尿病患者患癌癥的風(fēng)險會大大增加,可能機制在于糖尿病患者長期的高血糖狀態(tài)為腫瘤細胞存活及轉(zhuǎn)移提供了充足的條件,胰島素抵抗與高胰島素血癥狀態(tài)則通過促進胰島素樣生長因子(IGF)及其受體的高表達,發(fā)揮促進腫瘤細胞增殖及抗凋亡作用,糖尿病導(dǎo)致的慢性炎癥狀態(tài)也增加了腫瘤的發(fā)生風(fēng)險[31]。另外,患有乙肝或丙肝的患者也更容易發(fā)生糖尿病,可能機制是肝炎病毒感染后,隨著患病的時間不斷延長,患者的肝臟損傷程度不斷加重,機體葡萄糖代謝受到明顯影響,同時胰島素敏感性降低,容易出現(xiàn)胰島素抵抗、高胰島素血癥等,最終誘發(fā)糖尿病[32-33]。β-皰疹病毒亞科的雙鏈DNA病毒巨細胞病毒(CMV)與2型糖尿病也存在一定的相關(guān)性,胰島β細胞的功能失調(diào)被認為是誘發(fā)糖尿病的主要發(fā)病機制[34]。AGE-RAGE信號通路參與糖尿病的諸多并發(fā)癥,在糖尿病腎病中,AGEs-RAGE信號通路激活下游關(guān)鍵因子如NF-κB、VGEF、TGF-β1、MCP-1等基因,從而延緩糖尿病腎病的進展[35]。在糖尿病難愈合創(chuàng)面中,AGEs可通過兩個途徑(受體途徑、非受體途徑)發(fā)揮作用,受體途徑占主導(dǎo)地位,即通過與內(nèi)皮細胞等細胞膜上受體RAGE結(jié)合,激發(fā)多種細胞因子形成與釋放,改變機體神經(jīng)和血管的病理損傷[36]。在糖尿病神經(jīng)病變中,AGE的累積可能引起周圍神經(jīng)組織血液流速減慢,導(dǎo)致外周神經(jīng)缺血缺氧,因此清除循環(huán)的AGE可預(yù)防AGE對組織的損傷[37]。大量研究還表明IL-17信號通路、HIF-1信號通路、PI3K-Akt信號通路、流體剪應(yīng)力與動脈粥樣硬化、TNF信號通路在糖尿病的發(fā)生發(fā)展中亦發(fā)揮重要作用[38-42]。本研究結(jié)果結(jié)合已有報道發(fā)現(xiàn),黃芪散可以通過干預(yù)以上多條通路來發(fā)揮治療作用,同時也表明,疾病的調(diào)控機制存在復(fù)雜且相互交叉的關(guān)系。

        分子對接驗證結(jié)果表明,通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選出的關(guān)鍵成分與核心靶點ESR1和JUN均有較為穩(wěn)定的結(jié)合,其中,異鼠李素與ESR1的對接打分最低,相互作用越強,化合物構(gòu)象也愈穩(wěn)定,且相較于二甲雙胍,異鼠李素與ESR1打分最接近,表明異鼠李素在激活ESR1上表現(xiàn)出與二甲雙胍相類似的作用。

        綜上所述,本研究運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接技術(shù),初步篩選和分析了黃芪散治療2型糖尿病的相關(guān)靶點,并探討了黃芪散治療2型糖尿病的潛在分子機制。但本研究仍存在一些不足,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于大數(shù)據(jù)背景進行的研究,具體機制尚需要進一步通過實驗加以驗證。本研究發(fā)現(xiàn),黃芪散的核心靶點中抗炎因子占較大比例,但關(guān)于黃芪散的抗炎作用還未見報道,因此提出假設(shè):黃芪散可能通過抑制炎癥因子分泌,參與抗炎抗氧化達到治療2型糖尿病的作用。另外,黃芪散在調(diào)控血管增生方面也占有很大的優(yōu)勢,可進一步探索黃芪散在治療2型糖尿病合并心血管疾病方面的作用,后期本課題組將針對性地開展相關(guān)體內(nèi)、體外實驗進行驗證。

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