王小亞 饒永超 陳大海 唐 宏 林家棟 張福平* 施曉麗*
(1.貴州大學(xué)高原山地動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室,貴陽550025;2.貴州省動物遺傳育種與繁殖重點實驗室;貴陽550025;3.貴州大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院,貴陽550025;4.貴州大學(xué)科研雞場,貴陽550025)
賴氨酸(Lys)是單胃動物飼糧中的必需氨基酸,也稱為“生長性氨基酸”,主要參與酶、多肽激素和蛋白質(zhì)的合成;賴氨酸也可作為一種生酮氨基酸,參與葡萄糖的代謝;此外,賴氨酸的添加量對體內(nèi)氨基酸的平衡和其他氨基酸的吸收利用也產(chǎn)生影響[1-2]。而賴氨酸缺乏會造成氮平衡失調(diào)、食欲下降、皮下脂肪含量減少、氨基酸代謝受損等不良影響[3-4]。有研究發(fā)現(xiàn),在基礎(chǔ)飼糧中添加適量的賴氨酸可促進籠養(yǎng)蛋雛鴨的生長發(fā)育,進而提高其采食量[5]。陳志敏等[6]報道,飼糧賴氨酸水平顯著影響肉仔雞采食量。家禽在飼養(yǎng)過程中采食行為受到不同因素的影響,如葡萄糖、脂肪和氨基酸等因素決定采食量,而采食和能量消耗主要受外部環(huán)境、激素以及營養(yǎng)物質(zhì)等信號分子共同調(diào)控,其調(diào)控過程極其復(fù)雜[7-8]。家禽采食行為的調(diào)節(jié)主要由外周組織和中樞神經(jīng)控制。外周組織通過感受器反映體內(nèi)營養(yǎng)代謝,并通過分泌多種肽和類固醇激素來調(diào)節(jié)采食;中樞神經(jīng)系統(tǒng)在哺乳動物和家禽的攝食行為中有重要作用,包括下丘腦和腦干[9-10],下丘腦作為最關(guān)鍵的調(diào)控中樞,通過多種促食行為和抑食神經(jīng)肽的共同作用來調(diào)節(jié)采食。中樞神經(jīng)和外周組織在受到營養(yǎng)物質(zhì)和環(huán)境因素的刺激后會產(chǎn)生多種信號分子(如神經(jīng)肽、激素和代謝產(chǎn)物),這些信號分子在下丘腦的特定神經(jīng)元亞群中啟動信號級聯(lián),與特定的受體結(jié)合形成信號通路,從而在細胞水平上調(diào)控家禽采食和能量消耗等生理作用[11]。
轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)技術(shù)被廣泛應(yīng)用于挖掘畜禽潛在候選基因和生物學(xué)通路。例如,Jehl等[12]研究發(fā)現(xiàn),下丘腦作為雞采食的調(diào)節(jié)中樞,低能量水平飼糧對脂肪和肝臟組織轉(zhuǎn)錄組無作用,但對下丘腦轉(zhuǎn)錄組有很大作用,說明低能量水平飼糧影響下丘腦釋放、膽固醇合成和突觸活動的表達,揭示了下丘腦與營養(yǎng)水平的調(diào)節(jié)關(guān)系。Lv等[13]研究表明,添加高劑量染料木黃酮可降低雛雞的采食量,導(dǎo)致雞下丘腦苦味受體的一些差異表達基因下調(diào),從而改變雞對甜味的感知,激活苦味受體信號通路。Yang等[14]利用RNA-Seq技術(shù)研究發(fā)現(xiàn),部分候選基因和信號通路與地方雞飼料利用效率有關(guān),如血管細胞黏附分子1(vascular cell adhesion molecule 1,VCAM1)、組織蛋白酶S(cathepsin,CTSS)和Toll樣受體4(Toll-like receptor 4,TLR4)等是影響飼料利用效率的候選基因,而細胞黏附分子(cell adhesion molecules,CAMs)和氧化磷酸化(oxidative phosphorylation,OXPHOS)是導(dǎo)致飼料利用效率差異的主要通路。上述有關(guān)雞采食量轉(zhuǎn)錄組分析已被廣泛研究,取得了一定進展。近年來,賴氨酸是營養(yǎng)學(xué)領(lǐng)域的一個熱門話題,盡管此前已有相關(guān)研究,但大多數(shù)關(guān)于賴氨酸的研究多集中于肉雞賴氨酸的需要量、生產(chǎn)性能等方面[15-17]。貴州黃雞作為一個肉蛋兼用型品種,其氨基酸需要量低于快大型肉雞和肉用的黃羽肉雞,所以貴州黃雞對賴氨酸需要量不同于這些雞種。因此,本研究旨在通過RNA-Seq技術(shù)對飼喂不同賴氨酸水平飼糧的貴州黃雞下丘腦組織進行測序研究,深入了解賴氨酸調(diào)控貴州黃雞采食量的分子機制,挖掘與其采食量相關(guān)的關(guān)鍵基因和調(diào)控通路。
選取健康的1日齡貴州黃雞雛雞400羽,隨機分為4組,每組5個重復(fù),每個重復(fù)20羽。各組分別飼喂賴氨酸水平為0.7%、0.9%、1.1%和1.3%的試驗飼糧。試驗期6周。試驗飼糧組成及營養(yǎng)水平見表1。
試驗前育雛舍全面消毒,封閉48 h,通風1周。采用網(wǎng)上籠養(yǎng),每籠20只。每天08:00、14:00、20:00進行人工飼喂,自由飲水。舍內(nèi)紅外燈供熱,第1周舍內(nèi)溫度平均為32~35 ℃,之后每周降溫2~3 ℃,4周后常溫飼養(yǎng),雞舍相對濕度保持在60%~65%,試驗雞嚴格按照標準常規(guī)免疫進行。記錄好1~6周齡的采食量,計算平均日采食重:
平均日采食重=[(飼料總添加量-
飼料總剩余量)/試驗天數(shù)]/20。
1.3.1 樣品選擇與采集
以不同賴氨酸水平飼糧飼喂到6周齡的貴州黃雞為研究對象,根據(jù)平均日采食量結(jié)果,選取1~6周齡平均日采食量差異極顯著(P<0.01)的0.9%賴氨酸水平組(b組)和1.3%賴氨酸水平組(d組)進行測序,從這2組試驗雞只中各挑選活潑健康的3只雞進行挫骨處死,共6只雞。置于冰上打開頭顱,迅速取出下丘腦,沖洗后裝入無酶離心管中,置于液氮中暫存,轉(zhuǎn)入-80 ℃超低溫冰箱保存,用于RNA提取。
表1 試驗飼糧組成及營養(yǎng)水平(風干基礎(chǔ))
1.3.2 測序分析
用Trizol法提取下丘腦組織總RNA,純化后對總RNA完整性和濃度進行檢測,檢測合格后,構(gòu)建文庫,先使用Qubit 2.0 Fluorometer進行初步定量,隨后使用Agilent 2100 bioanalyzer對文庫的插入片段進行檢測,插入片段符合預(yù)期后,實時熒光定量PCR(qRT-PCR)對文庫有效濃度進行準確定量(文庫有效濃度>2 nmol/L),建庫合格后,采用Illumina HiSeqTM2000平臺進行上機測序。對原始數(shù)據(jù)進行過濾、質(zhì)控,同時,對有效數(shù)據(jù)(clean data)進行Q20、Q30和GC含量計算。使用HISAT2 v2.0.5軟件將過濾后有效讀數(shù)與雞參考基因組(Gallus_gallus_5.0)進行比對,獲取序列的比對效率和序列在參考基因組上的定位信息。使用DESeq2軟件進行差異表達分析(每個組3個重復(fù))。利用Cuffdiff軟件進行定量分析,通過以每千個堿基的片段每百萬片段映射的轉(zhuǎn)錄本(fragments per kilobase of transcript per million fragments mapped,F(xiàn)PKM)值來表示基因的表達水平,根據(jù)各樣品所有基因的FPKM值計算皮爾遜相關(guān)系數(shù)(Pearson correlation coefficient,R2),繪制成熱圖,可直觀評估組間或組內(nèi)樣品的重復(fù)相關(guān)性。以|log2(差異倍數(shù))|>0且P<0.05為標準篩選差異表達基因。采用Cluster Profile軟件對差異基因集進行GO功能富集分析,利用KOBAS 2.0軟件篩選KEGG數(shù)據(jù)庫中(http://www.genome.jp/kegg/)差異基因富集到信號通路,以P<0.05作為差異顯著性的閾值。
1.3.3 測序結(jié)果的qRT-PCR驗證
為了進一步驗證測序結(jié)果,隨機挑選了6個差異表達基因進行qRT-PCR驗證,檢驗測序結(jié)果的可靠性。使用Primer 5.0軟件設(shè)計qPCR引物,以β-肌動蛋白(β-actin)作為相對基因定量的內(nèi)參基因,引物委托上海生工生物工程股份有限公司合成。反應(yīng)體系20 μL:10 μL Taq PCR Master Mix,7 μL ddH2O,上、下游引物各1 μL,cDNA 1 μL。反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性2 min,95 ℃變性15 s,72 ℃延伸60 s,共40個循環(huán);并采用2-ΔΔCt法計算不同組中基因的表達量。基因引物信息見表2。
表2 基因引物信息
平均日采食量數(shù)據(jù)利用SPSS 20.0軟件進行單因素方差分析(one-way ANOVA),采用Duncan氏法對組間差異進行多重比較,結(jié)果以“平均值±標準差”表示,P<0.05表示差異顯著,P<0.01表示差異極顯著。
以|log2(差異倍數(shù))|>0且P<0.05為標準篩選差異表達基因。采用Cluster Profile軟件對差異基因集進行GO功能富集分析,利用KOBAS 2.0軟件篩選KEGG數(shù)據(jù)庫中差異基因富集到信號通路,以P<0.05作為差異顯著性的閾值。
由表3可知,4個組1~2周齡平均日采食量差異不顯著(P>0.05)。0.7%、0.9%、1.1%賴氨酸水平組3~4周齡平均日采食量極顯著高于1.3%賴氨酸水平組(P<0.01),0.9%、1.1%賴氨酸水平組顯著高于0.7%賴氨酸水平組(P<0.05)。0.7%、0.9%、1.1%賴氨酸水平組5~6周齡平均日采食量極顯著高于1.3%賴氨酸水平組(P<0.01),0.9%、1.1%賴氨酸水平組顯著高于0.7%賴氨酸水平組(P<0.05)。0.7%、0.9%、1.1%賴氨酸水平組1~6周齡平均日采食量極顯著高于1.3%賴氨酸水平組(P<0.01)。
構(gòu)建b組和d組各3個下丘腦組織樣品的文庫,原始數(shù)據(jù)過濾后,獲得了各個樣品測序有效序列、有效堿基數(shù)、錯誤率及GC、Q20、Q30含量(表4)。每個樣品產(chǎn)出的原始數(shù)據(jù)均在43 519 236以上,共獲得262 700 782個有效序列和39.41 G有效堿基數(shù),其中,各個樣品測序錯誤率均為0.03%,Q20、Q30含量分別在97%、93%以上,GC含量均在49.78%以上。由表5可知,每個樣品所產(chǎn)的測序讀數(shù)比對到雞參考基因組上比對率均大于89%,比對到唯一位置的比對率在88%以上,比對到多個位置的比對率占1.4%~1.7%。上述結(jié)果證明RNA-Seq數(shù)據(jù)的質(zhì)量良好。
表3 飼糧賴氨酸水平對1~6周齡貴州黃雞平均日采食量的影響
表4 測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計
表5 6個樣品測序數(shù)據(jù)與參考基因組比對結(jié)果
通過盒形圖展示6個樣品基因表達水平的分布情況。結(jié)果表明,每個樣品的基因表達量最大值均大于14,上四分位在4~5,中位數(shù)接近4,下四分位在1~2,最小值為0;即6個樣品的基因表達量趨于一致(圖1-A)。此外,通過計算2組樣品內(nèi)或樣品間R2,組內(nèi)樣品R2均在0.90以上(圖1-B),說明2組間表達模式的相似度較好,證明試驗樣品選擇較合理,增加了后續(xù)試驗的可靠性。
本研究以|log2(差異倍數(shù))|>0且P<0.05為篩選差異基因的標準,共篩選到2 006個差異表達基因,其中,1 275個基因表達上調(diào),731個基因表達下調(diào)(圖2-A),前20個差異表達基的因如表6所示。對差異表達基因進行聚類分析,繪制聚類熱圖(圖2-B),從圖中看出組內(nèi)兩兩樣品基因的表達量基本趨于一致,說明生物學(xué)重復(fù)性較好;2組間樣品則存在差異基因表達變化,此外,顏色越紅代表基因的表達量越高,顏色越藍代表基因的表達量越低。
FPKM:每千個堿基的片段每百萬片段映射的轉(zhuǎn)錄本 fragments per kilobase of transcript per million fragments mapped;R2:皮爾遜相關(guān)系數(shù) Pearson correlation coefficient。
圖2 差異表達基因分析
表6 前20個差異表達的基因
續(xù)表6基因IDGene ID基因名稱Gene nameslog2差異倍數(shù)log2FCP值P-valueENSGALG00000005733WNT8B-2.640<0.001ENSGALG00000003193CRABP-Ⅰ-1.902<0.001ENSGALG00000043234HBA1-1.085<0.001ENSGALG00000032452GAS71.765<0.001ENSGALG00000036587LHX4-3.810<0.001ENSGALG00000015141GDA2.721<0.001ENSGALG00000041459DDIT4-1.227<0.001ENSGALG00000033517VSX2-3.630<0.001ENSGALG00000006648SPECC1L1.266<0.001
利用GOseq對b組與d組的差異表達基因進行富集分析,由圖3可知,在GO功能注釋中分子功能(molecular function,MF)有27個,占21%;細胞組成(cellular component,CC)有38個,占32%;生物過程(biological process,BP)有55個,占47%。差異表達基因主要在調(diào)節(jié)神經(jīng)過程、投射神經(jīng)元形態(tài)發(fā)生、負調(diào)控神經(jīng)發(fā)生等生物學(xué)過程極顯著富集,上述注釋到GO功能中可能與采食行為相關(guān)的有可卡因和安非他明調(diào)控轉(zhuǎn)錄前肽(carcinine transporter prepropeptide,CARTPT)、前阿黑皮素原(proopiomelanocortin,POMC)、刺鼠相關(guān)蛋白(agouti-related protein,AgRP)、神經(jīng)肽Y(neuropeptide Y,NPY)4個候選基因。
通過KEGG信號通路富集分析,共富集到139條信號通路,選取了富集最顯著的前20個通路,以散點圖形式展示(圖4)。其中,顯著富集的KEGG通路有19條通路,共篩選到磷脂酰肌醇信號系統(tǒng)、叉頭框轉(zhuǎn)錄因子O(forkhead box O,F(xiàn)oxO)信號傳導(dǎo)途徑、哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信號通路、絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信號通路及神經(jīng)活性配體-受體相互作用、脂肪細胞因子信號通路6條通路可能影響雞的采食量,涉及到166個差異表達基因(表7)。其中,KEGG通路富集到神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路上的差異表達基因最多,共有43個差異表達基因。
選取食欲素神經(jīng)肽前體(hypocretin neuropeptide precursor,HCRT)、AgRP、NPY、豬鏈球菌2型(strictosidine synthase 2,SS2)、膽囊收縮素A受體(cholecystokinin A receptor,CCKAR)、CARTPT6個基因進行qRT-PCR驗證。結(jié)果表明,qRT-PCR驗證結(jié)果與RNA-Seq表達量變化模式一致(圖5),說明測序數(shù)據(jù)可靠。
家禽采食量是控制生產(chǎn)效率的重要因素之一,食物的攝入與動物的健康和生產(chǎn)效率密切相關(guān)。下丘腦是家禽采食最重要的部位,可通過感應(yīng)、整合不同外周組織來實現(xiàn)對家禽采食的控制,從而調(diào)節(jié)采食的分子機制[18]。在哺乳動物中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多抑制和促進采食的食欲神經(jīng)肽,類似的功能也在家禽中得到驗證。研究表明,飼糧中適宜賴氨酸水平可顯著提高家禽的生長速度和采食量[19]。相對于雛雞,強烈的攝食行為是提高雛雞采食量的前提[20]。在本研究中,飼糧賴氨酸水平由0.7%增加到1.3%,貴州黃雞4個組的1~6周齡平均日采食量均呈先升后降的趨勢,尤其是0.9%賴氨酸水平組極顯著高于1.3%賴氨酸水平組,這種差異可能是由于不同賴氨酸水平導(dǎo)致采食量的變化,或者受遺傳因素的影響,說明賴氨酸水平過高或缺乏均會影響家禽采食量?;诖耍疚倪x取采食量差異極顯著的0.9%賴氨酸水平組(b組)和1.3%賴氨酸水平組(d組)的6周齡貴州黃雞進行研究。
regulation of neurogenesis:調(diào)節(jié)神經(jīng)發(fā)生;neuron projection morphogenesis:投射神經(jīng)元形態(tài)發(fā)生;positive regulation of synaptic transmission:突觸傳遞正調(diào)控;plasma membrane bounded cell projection morphogenesis:質(zhì)膜的細胞形態(tài)發(fā)生投影;cell projection morphogenesis:細胞形態(tài)發(fā)生投影;negative regulation of cell development:細胞發(fā)育的負調(diào)控;glutamate receptor signaling pathway:谷氨酸受體信號通路;negative regulation of neurogenesis:負調(diào)控的神經(jīng)發(fā)生;cell part morphogenesis:細胞形態(tài)發(fā)生部分;negative regulation of nervous system development:神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育的負調(diào)控;postsynaptic specialization:突觸后特化;receptor complex:受體復(fù)合物;inner mitochondrial membrane protein complex:線粒體膜內(nèi)蛋白復(fù)合物;postsynaptic density:突觸后致密物;asymmetric synapse :不對稱突觸;neuron to neuron synapse:神經(jīng)元對神經(jīng)元突觸;synapse part:突觸部分;respiratory chain complex:呼吸鏈復(fù)合物;plasma membrane receptor complex:質(zhì)膜受體復(fù)合物;respiratory chain:呼吸鏈;GTPase binding:GTP酶結(jié)合區(qū);small GTPase binding:小GTP酶結(jié)合;Ras GTPase binding:RAS GTP酶的結(jié)合;guanyl-nucleotide exchange factor activity:鳥嘌呤核苷酸交換因子;cation transmembrane transporter activity:陽離子跨膜轉(zhuǎn)運活性;Rab GTPase binding:Rab GTP酶的結(jié)合;Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity:RHO鳥嘌呤核苷酸交換因子;dynein intermediate chain binding:動力蛋白中間鏈結(jié)合;glutamate receptor activity:谷氨酸受體活性;NADH dehydrogenase activity:NADH脫氫酶活性;MF:分子功能molecular function;BP:生物過程 biological process;CC:細胞組成 cellular component。
通過GO功能注釋分析發(fā)現(xiàn),表達上調(diào)的基因主要富集在投射神經(jīng)元形態(tài)發(fā)生、負調(diào)控神經(jīng)發(fā)生、神經(jīng)肽信號傳導(dǎo)途徑等生物學(xué)過程,如AgRP、NPY、POMC、CART等神經(jīng)元在中樞神經(jīng)系統(tǒng)內(nèi)軸突投射得更廣,說明差異表達基因影響著家禽下丘腦對采食量的控制。有研究表明,下丘腦弓狀核(ARC)中的NPY/AgRP神經(jīng)元共同調(diào)控γ-氨基丁酸(gamma-aminobutyric acid,GABA),這些神經(jīng)元在促進采食方面起著重要作用[21]。通過KEGG通路分析,富集到神經(jīng)活性配體-受體相互作用這條通路的差異表達基因最多,而脂肪細胞因子信號通路是AgRP的關(guān)鍵通路;在這2條通路中篩選到NPY、AgRP、CARTPT、POMC4個基因可能與不同賴氨酸水平調(diào)控雞的采食量有關(guān)。Li等[22]對注射外源性脂肪素雛雞的下丘腦進行測序,發(fā)現(xiàn)與采食相關(guān)的差異表達基因顯著富集在神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路,且脂肪素可能通過POMC/促腎上腺皮質(zhì)激素釋放激素(corticotropin-releasing hormone,CRH)和NPY/AgRP通路來增加或者抑制采食量。這說明該通路對家禽采食調(diào)控極其重要。Bahry等[23]研究表明,下丘腦注射NPY可降低熱應(yīng)激對雛雞采食量的影響,從而提高雛雞的采食量。激活A(yù)gRP神經(jīng)元可以快速地誘導(dǎo)小鼠采食和減少能量消耗,最終增加脂肪儲存;反之,抑制饑餓小鼠的AgRP神經(jīng)元活性會減少采食量[24]。本研究發(fā)現(xiàn),與d組相比,b組NPY和AgRP基因表達量顯著表達上調(diào),采食量也隨之提高。NPY參與GO功能注釋到神經(jīng)肽信號途徑和神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路,AgRP富集到脂肪細胞因子信號通路;說明適宜賴氨酸水平組可能通過上調(diào)NPY/AgRP表達來促進雛雞的攝食量,從而通過神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路和脂肪細胞因子信號通路來調(diào)控雛雞的采食。
圖4 差異表達基因KEGG通路富集分析散點圖(前20個)
表7 可能與采食量相關(guān)差異表達基因的富集通路
NPY:神經(jīng)肽Y neuropeptide Y;HCRT:食欲素神經(jīng)肽前體 hypocretin neuropeptide precursor;AgRP:刺鼠相關(guān)蛋白 agouti-related protein;CCKAR:膽囊收縮素A受體 cholecystokinin A receptor;CARTPT:可卡因和安非他明調(diào)控轉(zhuǎn)錄前肽 carcinine transporter prepropeptide;SS2:豬鏈球菌2型 strictosidine synthase 2。
CARTPT是CART前肽,CART和POMC屬于一種厭食性神經(jīng)肽,在動物的采食和能量平衡調(diào)節(jié)中起著重要的作用[25]。CART可作用于下丘腦和胃腸道來降低食欲和飼料消化率,抑制采食量[26-27]。CART與POMC神經(jīng)元起相互協(xié)調(diào)作用,其主要在下丘腦ARC中表達,在調(diào)節(jié)葡萄糖代謝和能量消耗方面發(fā)揮作用[28]。Alamshah等[29]給大鼠灌胃L-苯丙氨酸(L-Phe)后,在1 h內(nèi)大鼠采食量顯著下降,表明氨基酸對采食量的影響可能與胃腸道飽感激素有關(guān)。在肉雞中,飼糧中賴氨酸水平過高會使肉雞的采食量、生長發(fā)育、腹脂沉積等下降[30]。在本研究中,b組的CARTPT和POMC基因表達量顯著高于d組,被富集到GO功能中進食行為和神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路,但b組采食量低于d組,表明雛雞食欲的下降可能與CARTPT、POMC基因表達下調(diào)有關(guān)。
mTOR是一種絲氨酸或蘇氨酸蛋白激酶,可參與營養(yǎng)信號、體內(nèi)的基因轉(zhuǎn)錄、蛋白質(zhì)翻譯起始等多個生物學(xué)過程[31]。陳盼盼[32]發(fā)現(xiàn)FoxO信號傳導(dǎo)途徑和mTOR信號通路與蛋白質(zhì)代謝和調(diào)控采食量有關(guān);且mTOR基因表達量在飼糧賴氨酸缺乏時明顯受到抑制,反之,mTOR基因表達量提高,肌肉發(fā)育不良,說明mTOR信號通路與不同賴氨酸水平有一定關(guān)系。在MAPK信號通路中,脂聯(lián)素可通過該通路來促進脂肪酸氧化和葡萄糖的吸收,對胰島素抑制有改善功能。磷脂酰肌醇信號通路是一種細胞跨膜信號系統(tǒng),如促食因子是通過磷脂酰肌醇信號通路完成對采食的調(diào)節(jié)[33]。有研究報道,饑餓素對采食的調(diào)控是通過激活磷脂酰肌醇信號途徑后鈣離子(Ca2+)濃度的升高,從而啟動雷帕霉素靶蛋白復(fù)合物1(rapamycin target protein complex 1,mTORC1)/核糖體S6激酶1(ribosomal S6 kinase 1,S6K1)通路完成[34]。在本試驗中,磷脂酰肌醇信號途徑、FoxO信號傳導(dǎo)途徑、mTOR信號通路、MAPK信號通路4條通路都顯著富集,說明這些通路可能共同調(diào)控貴州黃雞采食量。
① 0.7%、0.9%、1.1%賴氨酸水平組1~6周齡平均日采食量極顯著高于1.3%賴氨酸水平組。
② 不同水平賴氨酸可能通過下丘腦組織NPY、AgRP、CARTPT和POMC等相關(guān)基因的表達,作用于神經(jīng)活性配體-受體相互作用通路和脂肪細胞因子信號通路,以此來調(diào)控貴州黃雞的采食量。