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        哈密瓜脫氫抗壞血酸還原酶基因的鑒定及冷脅迫表達(dá)分析

        2022-02-16 09:26:58周發(fā)科楊新泉單春會(huì)唐鳳仙
        食品科學(xué) 2022年2期
        關(guān)鍵詞:哈密瓜結(jié)果表明元件

        宋 文,張 琴,寧 明,周發(fā)科,楊新泉,單春會(huì),唐鳳仙

        (石河子大學(xué)食品學(xué)院,新疆特色果蔬貯藏加工教育部工程研究中心,新疆 石河子 832000)

        哈密瓜(Cucumis melovar.saccharinus)屬于葫蘆科黃瓜屬甜瓜亞屬的一個(gè)品種,得名于清代康熙年間,古稱 “甘瓜”、“甜瓜”,維吾爾語稱“庫拱”[1-2]。新疆栽培哈密瓜已有4 000多年的歷史,不僅是我國甜瓜栽培歷史最悠久、種植面積最大、品種資源最豐富、品質(zhì)最佳的地區(qū),也是世界甜瓜種植基地之一,其在吐哈盆地獨(dú)特的地理、生態(tài)條件下,通過世代相傳的特殊栽培技術(shù),形成了哈密瓜特有的品質(zhì)[2]。新疆哈密瓜不僅美味可口,而且營養(yǎng)豐富,富含糖分、果膠物質(zhì)、纖維素、蘋果酸、維生素以及鈣、磷、鐵等元素,適宜于腎病、胃病、咳嗽痰喘、貧血和便秘患者。作為我國新疆地區(qū)主要的經(jīng)濟(jì)作物之一,哈密瓜對(duì)當(dāng)?shù)亟?jīng)濟(jì)發(fā)展起重要作用。由于新疆地域遼闊、交通運(yùn)輸不便,因此低溫貯藏是使用廣泛的果蔬保鮮方式之一[3]。然而長時(shí)間的低溫貯藏會(huì)導(dǎo)致哈密瓜發(fā)生冷害,加快哈密瓜表皮的凹陷、褐變以及腐爛,從而影響經(jīng)濟(jì)效益[4]。因此從分子生物學(xué)角度研究哈密瓜的耐冷機(jī)制對(duì)提高哈密瓜耐冷性具有重要意義。

        冷脅迫是影響植物生長發(fā)育的主要環(huán)境因素之一,會(huì)刺激植物在體內(nèi)產(chǎn)生并積累活性氧、丙二醛、過氧化氫等有毒物質(zhì),破壞細(xì)胞質(zhì)膜,引起細(xì)胞內(nèi)代謝紊亂,最后導(dǎo)致細(xì)胞與組織的死亡,從而影響植物的生長[5-6]。植物在進(jìn)化過程中產(chǎn)生了一系列復(fù)雜的保護(hù)機(jī)制適應(yīng)環(huán)境脅迫對(duì)其產(chǎn)生的影響,其中谷胱甘肽(reduced glutathione,GSH)抗氧化系統(tǒng)屬于植物體內(nèi)氧自由基清除體系的主要防御措施之一[7]。

        谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶(glutathione S-transferase,GST)是一種多功能酶,可以催化GSH和疏水及親電底物的共價(jià)結(jié)合,形成共軛物,隔離在液泡或轉(zhuǎn)移到質(zhì)外體,從而對(duì)內(nèi)源和外來有害物質(zhì)進(jìn)行降解,以達(dá)到降低細(xì)胞損害程度的作用[8-9]。典型的GST蛋白含有兩個(gè)功能位點(diǎn):一個(gè)是N-末端結(jié)構(gòu)域中的GSH結(jié)合位點(diǎn)(G-位點(diǎn)),另一個(gè)是C-末端共底物結(jié)合結(jié)構(gòu)域(H-位點(diǎn))[10]。通常GST被分為7 類,包括Tau(GSTU)、Phi(GSTF)、Lambda(GSTL)、Theta(GSTT)、Zeta(GSTZ)、四氯氫醌脫鹵素酶(tetrachlorohydroquinone dehalogenase,TCHQD)和脫氫抗壞血酸還原酶(dehydroascorbate reductase,DHAR)[11]。作為植物特有的一類GST,DHAR可將GSH作為還原劑,催化脫氫抗壞血酸(dehydroascorbic acid,DHA)還原為抗壞血酸(ascorbic acid,AsA),從而保護(hù)植物組織免受活性氧的損害[12]。

        前期研究發(fā)現(xiàn),與不耐冷型哈密瓜相比,耐冷型哈密瓜GST相關(guān)差異蛋白在冷脅迫初期顯著上調(diào)表達(dá)[3]。本研究在生物信息學(xué)的基礎(chǔ)上對(duì)哈密瓜DHAR基因(CmDHAR)進(jìn)行鑒定分析,隨后利用實(shí)時(shí)反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time reverse transcription-polymerase chain reaction,real-time RT-PCR)技術(shù)分析冷脅迫下的基因表達(dá)情況,以期為進(jìn)一步揭示DHAR基因在哈密瓜抵御冷脅迫過程中參與的反應(yīng)機(jī)理奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        耐冷型哈密瓜“伽師瓜-310”(JS)與不耐冷型哈密瓜“金皇后-308”(GE)果實(shí),2019年7—9月采購自新疆石河子121團(tuán)農(nóng)場。樣品成熟度為八成熟、大小均勻、無機(jī)械損傷及病蟲害。采后套泡沫網(wǎng)套直接置于(0.5±0.5)℃冷庫中貯藏0、6、12、18、24 d,從果實(shí)赤道周圍3個(gè)位置的外表皮內(nèi)層1~2 mm處采集果肉1.2~1.5 g并立即用液氮冷凍,隨后保藏于-80 ℃超低溫冰箱。每個(gè)品種每次實(shí)驗(yàn)選取3個(gè)果實(shí),進(jìn)行3 次生物學(xué)重復(fù)。

        Plant DHAR ELISA檢測試劑盒、Plant AsA ELISA檢測試劑盒 上海優(yōu)選生物科技有限公司;UNlQ-10柱式Trizol總RNA抽提試劑盒 生工生物工程(上海)股份有限公司。

        1.2 儀器與設(shè)備

        WD-2102A多功能酶標(biāo)儀 美國伯騰儀器有限公司;HC-2518R高速冷凍離心機(jī) 安徽中科中佳儀器有限公司;ZXRD-7080恒溫鼓風(fēng)干燥箱 河北潤創(chuàng)科技開發(fā)有限公司;LightCycler480 II型熒光定量PCR儀瑞士Rotkreuz公司;FA201S萬分之一分析天平 上海天平儀器廠。

        1.3 方法

        1.3.1CmDHAR基因生物信息學(xué)分析

        從哈密瓜數(shù)據(jù)庫Cucurbit Genomics Database(http://cucurbitgenomics.org)中獲取哈密瓜(Melon(DHL92)genome 3.5.1)的氨基酸序列及結(jié)構(gòu)文件。從擬南芥(Arabidopsis thaliana)數(shù)據(jù)庫TAIR(https://www.arabidopsis.org)獲取擬南芥DHAR(AtDHAR)的氨基酸序列及結(jié)構(gòu)文件。從EnsemblPlants(http://plants.ensembl.org/index.html)獲取水稻(Oryza sativa Japonica)DHAR(OsDHAR)的氨基酸序列及結(jié)構(gòu)文件。隨后通過與擬南芥和水稻DHAR氨基酸序列進(jìn)行多序列比對(duì)、篩選,鑒定得到了哈密瓜的DHAR基因。

        通過NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov)中的Protein BLAST工具鑒定篩選獲得CmDHAR的可靠性。利用在線工具CD-search(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)鑒定CmDHAR基因的保守功能域;利用ExPASy(http://web.expasy.org/protparam/)對(duì)CmDHAR成員編碼蛋白的分子質(zhì)量、等電點(diǎn)和氨基酸長度進(jìn)行分析;使用Softberry(www.softberry.com)對(duì)CmDHAR成員進(jìn)行亞細(xì)胞定位;使用Clustal Omega(https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/)進(jìn)行多序列比對(duì)分析;使用MEGA7軟件,采用鄰比法(Neighborjoining,NJ)構(gòu)建物種間系統(tǒng)進(jìn)化樹;使用MCScanX和TBTools(https://github.com/CJ-Chen/TBtools)完成共線性分析[13];使用MEME(http://meme-suite.org)對(duì)CmDHAR功能基序進(jìn)行分析;使用PlantCare(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)對(duì)CmDHAR順式作用元件進(jìn)行預(yù)測;使用STRING(https://string-db.org/cgi/input.pl)對(duì)CmDHAR與哈密瓜其他GST家族蛋白之間的相互作用進(jìn)行分析;SWISSMODEL(https://swissmodel.expasy.org/interactive)用于對(duì)CmDHAR的蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測;使用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)軟件對(duì)CmDHAR進(jìn)行分析[14]。

        1.3.2 CmDHAR活力及AsA含量測定

        設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)品孔和樣本孔后按照ELISA檢測試劑盒使用說明書進(jìn)行操作,在450 nm波長下使用酶標(biāo)儀測定OD值,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算樣品CmDHAR活力及AsA含量。

        1.3.3 哈密瓜總RNA提取

        采用UNlQ-10柱式Trizol總RNA抽提試劑盒分別從哈密瓜表皮內(nèi)層1~2 mm處的果肉提取總RNA。使用Primer Premier 5.0軟件設(shè)計(jì)引物,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成(表1)。

        表1 Real-time RT-PCR序列Table 1 List of primer sequences used for real-time RT-PCR

        1.3.4CmDHAR基因的real-time RT-PCR驗(yàn)證

        以GAPDH(LOC103484230)為內(nèi)參基因,選取CmDHAR基因,通過real-time RT-PCR對(duì)其在冷脅迫下的基因表達(dá)水平進(jìn)行測定。利用SYBRGreen染料法在ABI2700系統(tǒng)上開展real-time RT-PCR檢測。反應(yīng)條件如下:95 ℃預(yù)變性3 min,95 ℃變性5 s;60 ℃退火30 s,65 ℃延伸25 s(40 個(gè)循環(huán)),進(jìn)行3 組生物學(xué)重復(fù),基因的表達(dá)量采用2-ΔΔCt方法計(jì)算。

        1.4 數(shù)據(jù)分析

        使用Excel 2016、SPSS 19.0和Origin軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)處理和圖形繪制。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 CmDHAR基因的基本信息

        將篩選獲得的2個(gè)CmDHAR基因,根據(jù)GST系統(tǒng)命名法分別命名為CmDHAR1(MELO3C020204T1)與CmDHAR2(MELO3C023826T1)。由表2可知,2個(gè)CmDHAR基因編碼蛋白氨基酸的長度分別為CmDHAR1(297 aa)與CmDHAR2(206 aa),等電點(diǎn)分別為CmDHAR1(8.67)與CmDHAR2(5.99),分子質(zhì)量分別為CmDHAR1(33 082.9 Da)與CmDHAR2(22 891.6 Da)。亞細(xì)胞定位結(jié)果表明,2個(gè)CmDHAR基因主要位于葉綠體中。染色體定位顯示CmDHAR1位于哈密瓜6號(hào)染色體,CmDHAR2位于哈密瓜10號(hào)染色體。此外,CD-search結(jié)果表明,2個(gè)哈密瓜CmDHAR均包含可以結(jié)合GSH的GST-N末端功能結(jié)構(gòu)域(CmDHAR1:1~297;CmDHAR2:3~203)。

        表2 哈密瓜及其他物種DHAR基因基本信息Table 2 Physicochemical properties of DHAR genes in Hami melon and other species

        2.2 CmDHAR系統(tǒng)進(jìn)化與多序列比對(duì)分析

        基于NJ構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,CmDHAR1與Q8LE52AtDHAR2為直系同源基因;CmDHAR2與Q9FWR4AtDHAR1為直系同源基因。結(jié)果表明,相比于OsDHAR,CmDHAR與AtDHAR之間的同源性更高(圖1)。

        圖1 CmDHAR的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig. 1 Phylogenetic tree of CmDHAR

        基于系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,將CmDHAR的氨基酸序列與AtDHAR和OsDHAR的氨基酸序列進(jìn)行多序列比對(duì)分析。圖2表明,CmDHAR基因與AtDHAR和OsDHAR基因之間的氨基酸序列保守性較高,說明CmDHAR與AtDHAR和OsDHAR在抵御脅迫過程中具有類似的功能[15-16]。此外,在CmDHAR的蛋白中還找到了12個(gè)GSH結(jié)合位點(diǎn)(G-site)與9 個(gè)磷酸化位點(diǎn)。

        圖2 哈密瓜與其他DHAR的蛋白氨基酸序列比對(duì)分析Fig. 2 Multiple sequence alignments of DHAR from Hami melon and other species

        2.3 CmDHAR基因結(jié)構(gòu)分析

        由圖3可知,CmDHAR基因包含6個(gè)外顯子與6個(gè)保守基序,這與Q8LE52AtDHAR2和水稻DHAR的基因結(jié)構(gòu)相似,再次證明DHAR基因的高度保守性,說明它們?cè)诠δ苌暇哂幸欢ǖ南嗨菩訹17]。除了CmDHAR2,其他DHAR均包含motif 5,表明在進(jìn)化過程中CmDHAR2缺失了這段氨基酸序列,也說明CmDHAR在進(jìn)化過程中會(huì)存在一定的差異[18]。

        圖3 哈密瓜與其他植物DHAR的基因結(jié)構(gòu)(A)與功能基序(B)預(yù)測Fig. 3 Gene structure (A) and motif (B) prediction of DHAR in Hami melon and other plants

        PlantCare預(yù)測結(jié)果表明CmDHAR基因包含10 種順式作用元件(表3),它們可以分為3 大類:脅迫相關(guān)作用元件(WUN-motif、MBS與W box)、植物激素作用元件(TCA-element、TGA-element、TGACG-motif與CGTCA-motif)及光反應(yīng)作用元件(GT1-motif、I-box與MRE)[19-20]。CmDHAR1包括TGA-element、TGACG-motif、CGTCA-motif等植物激素作用元件與光反應(yīng)作用元件GT1-motif和MRE。有研究表明植物激素、光合作用等在調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育、抵御脅迫方面起到關(guān)鍵作用[5,21]。CmDHAR2包括脅迫相關(guān)作用元件WUN-motif、MBS和W box,植物激素作用元件TCA-element及光反應(yīng)作用元件I-box。其中WUN-motif作用元件與抵御冷脅迫相關(guān)[22],MBS作用元件是抗逆因子MYB的結(jié)合位點(diǎn)[23]。綜上所述,推測CmDHAR在抵御脅迫方面發(fā)揮著重要作用。

        表3 哈密瓜CmDHAR基因順式作用元件Table 3 Cis-elements of CmDHAR genes in Hami melon

        2.4 CmDHAR共線性分析

        為進(jìn)一步了解DHAR的進(jìn)化關(guān)系,利用MCScanX和TBtools軟件對(duì)葫蘆科植物的DHAR基因進(jìn)行共線性分析。圖4說明CmDHAR基因與其他葫蘆科植物中的DHAR基因之間存在明顯的共線性關(guān)系。哈密瓜與西瓜存在1 對(duì)同源基因?qū)?,與黃瓜存在2 對(duì)同源基因?qū)?,與西葫蘆、筍瓜和南瓜之間各存在3 對(duì)同源基因?qū)Γf明在物種進(jìn)化過程中,哈密瓜與西葫蘆、筍瓜和南瓜更為接近。此外,CmDHAR2與其他5個(gè)物種至少存在1 對(duì)同源基因?qū)?,推測CmDHAR2在這6個(gè)物種分化前已經(jīng)存在,也證明CmDHAR2在進(jìn)化過程中十分重要。

        圖4 哈密瓜與其他物種DHAR的共線性分析Fig. 4 Synteny analysis of DHAR from Hami melon and other species

        非同義突變頻率(Ka)與同義突變頻率(Ks)的比值結(jié)果表明,8 對(duì)同源基因?qū)Φ腒a/Ks<1,說明它們?cè)谶M(jìn)化過程中發(fā)生了純化選擇,避免了對(duì)自身不利的變異(表4)[24-25]?;虮对鰰r(shí)間估算結(jié)果表明,這8 對(duì)同源基因?qū)Ρ对龅臅r(shí)間大約發(fā)生在0.65~3.5百萬年前。

        表4 哈密瓜及其他物種DHAR基因復(fù)制分析Table 4 Duplication analysis of DHAR genes in Hami melon and other species

        2.5 CmDHAR的蛋白互作分析

        蛋白質(zhì)之間通過相互作用在生物體內(nèi)行使其相應(yīng)的生物學(xué)功能[26]。蛋白-蛋白網(wǎng)絡(luò)互作分析結(jié)果表明(圖5),CmDHAR成員與其他哈密瓜GST成員之間相互作用效果明顯。因此推測,在響應(yīng)脅迫過程中,DHAR可以有效調(diào)節(jié)其他家族蛋白共同發(fā)揮作用,參與一系列生化反應(yīng)幫助哈密瓜抵御脅迫。CmDHAR與其他哈密瓜GST家族蛋白的具體互作機(jī)制將在日后進(jìn)行深入研究。

        圖5 CmDHAR及其他GST家族蛋白之間互作網(wǎng)絡(luò)圖Fig. 5 Protein-protein interaction networks of CmDHAR with other CmGST members in Hami melon

        2.6 CmDHAR三級(jí)模型的預(yù)測

        蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果表明CmDHAR主要包括α-螺旋、無規(guī)卷曲、延伸鏈和β-轉(zhuǎn)角4 種構(gòu)象,其中在CmDHAR1中:α-螺旋(43.10%)、無規(guī)卷曲(42.76%)、延伸鏈(10.44%)和β-轉(zhuǎn)角(3.70%);在CmDHAR2中:α-螺旋(45.63%)、無規(guī)卷曲(38.83%)、延伸鏈(9.71%)與β-轉(zhuǎn)角(5.83%)。

        基于同源建模法,在SWISS-MODEL中以毛果楊DHAR(ID:5mye.1.A;5n9u.1.A)為模板[27],分別預(yù)測了CmDHAR1與CmDHAR2的蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu),其中CmDHAR2與5n9u.1.A的序列相似性為73.53%,GMQE為0.80,QMEAN為-2.69,說明模板能較好地?cái)M合CmDHAR2的三維結(jié)構(gòu)[28]。ProQ三級(jí)模型質(zhì)量評(píng)估結(jié)果表明CmDHAR2的LGscore為4.375,MaxSub為0.366,證明模型預(yù)測的可靠性較高[29]。圖6表明,CmDHAR2蛋白主要由α-螺旋(紫色)、無規(guī)卷曲(白色)、延伸鏈(黃色)和β-轉(zhuǎn)角(青色)構(gòu)成。在CmDHAR2蛋白中找到了12個(gè)GST-N末端功能結(jié)構(gòu)域的GSH結(jié)合位點(diǎn)(G-site),包括20C、22F、25R、44L、47K、58G、59K、60V、61P、72D、73S與202K。其中,20C、22F、25R、72D和73S 位于α-螺旋;58G、59K 與202K位于無規(guī)卷曲;60V與61P 位于延伸鏈;44L與47K位于β-轉(zhuǎn)角。22F參與疏水互作;25R、60V、61P、72D與73S構(gòu)成氫鍵;47K構(gòu)成鹽橋。這12個(gè)G-sites均位于CmDHAR2蛋白的表面,有利于CmDHAR2與GSH的結(jié)合[19]。

        圖6 CmDHAR2蛋白質(zhì)三級(jí)模型預(yù)測Fig. 6 Deduced 3D structure of CmDHAR2

        2.7 CmDHAR基因響應(yīng)冷脅迫的表達(dá)分析

        由圖7可知,低溫貯藏對(duì)GE的影響更大。在冷藏第12天時(shí),GE表皮開始出現(xiàn)褐變并產(chǎn)生凹陷,隨著貯藏時(shí)間的延長,GE的冷害程度越來越嚴(yán)重。相比于GE,JS在第18天表皮開始產(chǎn)生凹陷,受冷害影響的程度較小。由此可知,在響應(yīng)低溫脅迫時(shí),JS與GE內(nèi)部抵御氧化脅迫體系的差異性決定了它們?cè)谫A藏過程中品質(zhì)變化的差異性。

        圖7 低溫貯藏過程中哈密瓜外觀狀態(tài)Fig. 7 Appearance of Hemi melon fruits after cold storage

        DHAR與AsA循環(huán)系統(tǒng)在植物抵御氧化脅迫過程中具有重要作用[30]。從圖8可以看出,隨著貯藏時(shí)間的延長,耐冷型JS和不耐冷型GE果實(shí)中CmDHAR活力呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢。在0~12 d,JS中的CmDHAR活力均高于GE,且在第12天時(shí)差異極顯著(P<0.01),隨后酶活力逐漸降低。在GE中,CmDHAR活力在第18天達(dá)到最高值,隨后活力下降(圖8)。AsA含量隨貯藏時(shí)間延長逐漸降低,但其在JS中的含量高于GE,說明在響應(yīng)低溫脅迫過程中,AsA扮演著重要角色[31]。結(jié)果表明,CmDHAR活力快速、高水平的表達(dá)有利于提升哈密瓜對(duì)低溫環(huán)境的適應(yīng)能力,從而降低冷害的損傷,能夠較好地維持哈密瓜的商品價(jià)值[32]。

        圖8 低溫貯藏過程中CmDHAR活力和AsA含量的變化Fig. 8 Effect of cold storage on CmDHAR activity and AsA content in Hemi melon

        利用real-time RT-PCR驗(yàn)證哈密瓜CmDHAR1與CmDHAR2基因在冷脅迫下的表達(dá)情況(圖9)。隨著貯藏時(shí)間的延長,CmDHAR1和CmDHAR2均為上調(diào)表達(dá)。與GE相比,CmDHAR1與CmDHAR2在JS中的相對(duì)表達(dá)量更高,說明CmDHAR基因在響應(yīng)冷脅迫過程中的重要性,它的大量表達(dá)可以延緩冷害發(fā)生[33]。

        圖9 低溫貯藏過程中CmDHAR基因表達(dá)的變化Fig. 9 Effect of cold storage on the expression levels of CmDHAR genes

        2.8 CmDHAR GSEA

        基于基因表達(dá)結(jié)果,使用GSEA對(duì)CmDHAR進(jìn)行功能注釋,結(jié)果表明CmDHAR的高表達(dá)與結(jié)構(gòu)分子活性、大分子復(fù)合物、細(xì)胞膜封閉內(nèi)腔以及抗氧化活性等生物學(xué)功能顯著關(guān)聯(lián)(圖10)。GSEA結(jié)果說明在冷脅迫下,CmDHAR可以通過參與上述生物學(xué)過程調(diào)節(jié)生化反應(yīng),從而響應(yīng)冷脅迫。

        圖10 CmDHAR 基因GSEA功能富集結(jié)果Fig. 10 GSEA analysis of CmDHAR genes

        3 討 論

        DHAR屬于GST中的一類抗氧化酶,具有谷胱甘肽依賴性硫醇轉(zhuǎn)移酶和DHAR活性,是AsA循環(huán)系統(tǒng)的關(guān)鍵組成部分,參與氧化還原穩(wěn)態(tài),可以清除氧化應(yīng)激下產(chǎn)生的活性氧自由基[34-35]。Noshi等[36]研究發(fā)現(xiàn)AtDHAR1在擬南芥抵御光氧化脅迫中起關(guān)鍵作用。Dixon等[35]認(rèn)為AtDHAR參與氧化還原反應(yīng),并且在清除活性氧自由基過程中發(fā)揮重要作用。Ushimaru等[37]將水稻中OsDHAR1基因提取并在擬南芥中進(jìn)行表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)與野生品種(空白對(duì)照組)相比,導(dǎo)入OsDHAR1基因的擬南芥耐鹽性有所提高。Yin Guangkun等[38]研究發(fā)現(xiàn)OsDHAR1活力的下降會(huì)導(dǎo)致水稻更容易受到活性氧的損害。Loi等[30]對(duì)馬鈴薯進(jìn)行外源施加霉菌毒素處理,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明處理組的DHAR、DHA及GSH含量有所提升,表明馬鈴薯DHAR在參與響應(yīng)氧化脅迫的過程中發(fā)揮重要作用。

        本研究對(duì)2個(gè)CmDHAR基因進(jìn)行鑒定并研究了冷脅迫下的酶活力及基因表達(dá)水平,確定了CmDHAR基因在響應(yīng)冷脅迫過程中扮演重要角色。根據(jù)CmDHAR在染色體的分布位置將其分別命名為CmDHAR1和CmDHAR2。CmDHAR1位于哈密瓜6號(hào)染色體,CmDHAR2位于哈密瓜10號(hào)染色體。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果表明CmDHAR基因與AtDHAR基因的同源性更高。多序列比對(duì)結(jié)果表明CmDHAR基因的GST-N末端功能結(jié)構(gòu)域在進(jìn)化過程中序列保守性較高,因此更有利于G-site與GSH的結(jié)合[39-40]。CmDHAR基因與擬南芥和水稻中參與抗氧化過程的DHAR基因的氨基酸序列保守性較高,說明CmDHAR基因在抵御脅迫過程中具有相似的功能?;蚪Y(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明CmDHAR包含6個(gè)外顯子、6個(gè)保守基序、3大類順式作用元件,由于結(jié)構(gòu)上是保守的,再次證明CmDHAR與擬南芥和水稻DHAR具有相似的功能[15-16]。共線性分析說明在葫蘆科植物中,哈密瓜與西葫蘆、筍瓜和南瓜在物種進(jìn)化過程中更為接近,同源基因?qū)Ρ对龅臅r(shí)間大約發(fā)生在0.65~3.5百萬年前。蛋白互作分析表明CmDHAR成員與其他哈密瓜GST成員之間聯(lián)系緊密,說明CmDHAR在調(diào)節(jié)各類蛋白共同發(fā)揮作用方面發(fā)揮重要作用[23,41]。蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果表明CmDHAR2主要由α-螺旋、無規(guī)卷曲、延伸鏈和β-轉(zhuǎn)角等結(jié)構(gòu)構(gòu)成。鑒定到的12個(gè)GSH結(jié)合位點(diǎn)位于蛋白質(zhì)表面,這在結(jié)構(gòu)上更有助于CmDHAR2與GSH的結(jié)合。冷脅迫下,耐冷型JS中的CmDHAR活力、AsA含量及CmDHAR基因表達(dá)量明顯高于不耐冷型GE。GSEA功能富集分析顯示CmDHAR通過參與一系列生物學(xué)過程響應(yīng)冷脅迫,表明其在哈密瓜響應(yīng)冷脅迫的機(jī)制中十分重要。未來將會(huì)對(duì)CmDHAR基因在冷脅迫過程中的具體代謝及調(diào)控機(jī)制做進(jìn)一步研究。

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