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        藏羊源枯草芽孢桿菌的分離鑒定與生物學(xué)特性

        2022-02-08 05:30:10徐淑琴馬祥兆陳曉慧賀曉龍冶貴生
        中國獸醫(yī)雜志 2022年12期

        徐淑琴 , 馬祥兆 , 陳曉慧 , 賀 曦 , 賀曉龍 , 冶貴生

        (1.青海大學(xué)農(nóng)牧學(xué)院 , 青海 西寧 810016 ; 2.青海省動物疾病病原診斷與綠色防控技術(shù)研究重點實驗室 , 青海 西寧 810016)

        藏羊是青藏高原的特色畜種之一,對惡劣環(huán)境具有較強的適應(yīng)性,采食粗飼草類后主要通過瘤胃微生物的復(fù)雜且多方面的協(xié)調(diào)方式進行發(fā)酵和降解[1]。而纖維降解菌作為瘤胃微生物中的優(yōu)勢菌群,主要分泌與纖維降解相關(guān)的酶來發(fā)揮降解纖維素的作用,進一步促進對飼草的利用率[2]。其中,芽孢桿菌中就可產(chǎn)生內(nèi)切纖維素酶、外切纖維素酶、葡萄糖苷酶等纖維素活性酶,這些酶具有穩(wěn)定性好、抗逆性強、產(chǎn)酶活性高等優(yōu)勢[3]。

        枯草芽孢桿菌(Bacillussubtilis)早在1989年被美國食品與藥物管理局批準使用,隨后在1999年我國農(nóng)業(yè)部也批準使用該菌,其是目前公認的安全菌株[4]??莶菅挎邨U菌具有代謝產(chǎn)物種類多、抑菌活性強、抑菌譜廣、能激活免疫、促進生長等功能特性[5]??莶菅挎邨U菌通過對營養(yǎng)和空間位點的競爭、分泌抗菌物質(zhì)及溶菌作用在生物防治方面發(fā)揮著重要的作用[6],作為益生菌還具有改善腸道環(huán)境、產(chǎn)生多種消化酶和營養(yǎng)物質(zhì)、提高動物免疫力等優(yōu)勢,因此在畜牧養(yǎng)殖業(yè)中被廣泛使用[7]。研究表明,來源于動物胃腸道的益生菌能夠更好地發(fā)揮菌株在消化道內(nèi)的定植及胃腸道益生功效[8]。因此,本試驗利用選擇性培養(yǎng)基從藏羊瘤胃內(nèi)容物中分離篩選出可降解纖維素的芽孢菌株,并對其生物學(xué)特性進行研究,以期為藏羊源益生菌的開發(fā)及其在畜牧生產(chǎn)上的應(yīng)用提供候選菌株。

        1 材料與方法

        1.1 樣品及菌株來源 藏羊瘤胃內(nèi)容物樣品采自青海省海北藏族自治州某養(yǎng)殖場。指示菌株:金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌、沙門菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌,均為本實驗室自行分離保存菌株。

        1.2 主要試劑 纖維素剛果紅培養(yǎng)基、胰蛋白胨大豆肉湯、LB肉湯、MH瓊脂、四聯(lián)式牛津杯、革蘭染色液試劑盒、細菌微量生化鑒定管,均購自青島海博生物技術(shù)有限公司;藥敏紙片,購自杭州微生物試劑有限公司;細菌基因組DNA提取試劑盒,購自天根生化科技(北京)有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1 降解纖維素芽孢桿菌的分離篩選 取新鮮瘤胃內(nèi)容物于胰蛋白胨大豆肉湯過夜增菌培養(yǎng)。挑取菌液于纖維素剛果紅培養(yǎng)基上劃線分離培養(yǎng);于37 ℃培養(yǎng)24 h,觀察菌落顏色,選取紅色菌落進行革蘭染色鏡檢。

        1.3.2 分離菌株生化鑒定 根據(jù)分離菌株的菌落和菌體形態(tài),參照參考文獻[9]進行糖醇類發(fā)酵試驗、氧化酶試驗、觸酶試驗、甲基紅(MR)試驗、V-P試驗、吲哚試驗等生化試驗。

        1.3.3 分離菌株分子生物學(xué)鑒定 用細菌基因組DNA提取試劑盒提取分離菌株全基因組DNA,采用細菌16S rDNA通用引物通過PCR方法擴增分離菌株16S rDNA[10]。30 μL PCR反應(yīng)體系:模板1 μL,2×PCR Mix 15 μL,上、下游引物各1 μL,ddH2O 12 μL。PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,35個循環(huán);72 ℃延伸5 min,最后4 ℃保存。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR擴增產(chǎn)物,對陽性產(chǎn)物測序并將序列通過BLAST比對,利用MEGA 7.0軟件,采用Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。

        1.3.4 分離菌株抑菌試驗 將活化好的指示菌稀釋成濃度為108CFU/mL的菌懸液,吸取100 μL均勻涂布于LB瓊脂平板上。將培養(yǎng)24 h的分離菌株12 000 r/ min離心10 min,取上清200 μL注入牛津杯內(nèi),于4 ℃放置12 h后移至37 ℃培養(yǎng)箱靜置培養(yǎng)12 h,用游標卡尺測量抑菌圈直徑。

        1.3.5 分離菌株生長曲線的測定 調(diào)整活化好的菌液細菌濃度為108CFU/mL,按1%的接種量接種,37 ℃、180 r/min搖床振蕩孵育,每隔2 h取樣1次,測定0~24 h菌液OD600 nm值,以O(shè)D600 nm值為縱坐標,時間為橫坐標,繪制分離菌株生長曲線。

        1.3.6 分離菌株藥敏試驗 采用K-B紙片擴散法檢測分離菌株對30種常用抗菌藥的敏感性[11]。

        1.3.7 分離菌株耐高溫試驗 分離菌株按1%接種量接種于LB液體培養(yǎng)基中,處理組分別在40、60 ℃和80 ℃水浴30 min,空白對照組為37 ℃,平板計數(shù)后按公式(1)計算菌株存活率。

        菌株存活率/%=(處理組活菌數(shù)÷空白對照組活菌數(shù))×100%

        (1)

        1.3.8 分離菌株耐酸試驗 處理組取分離菌株按1%接種量接種到pH調(diào)整為3.0、4.0、7.0、8.0的LB液體培養(yǎng)基中,空白對照組為原液,180 r/min 37 ℃恒溫培養(yǎng),分別在4 h和24 h進行平板計數(shù),按照公式(1)計算菌株存活率。

        2 結(jié)果

        2.1 降解纖維素芽孢桿菌的分離篩選 菌株在纖維素剛果紅培養(yǎng)基上菌落呈粉紅色,紋狀皺褶,表面不平整,邊緣不整齊分離(圖1A);鏡檢結(jié)果顯示,分離菌株革蘭染色呈藍紫色革蘭陽性菌,直桿狀,芽孢近端生,橢圓,孢囊不膨大(圖1B),將其命名為BS1-ql。

        圖1 分離菌株的形態(tài)特性Fig.1 Morphology characteristics of the isolated strainA:菌落形態(tài); B:菌體形態(tài) (100×)A:Colony morphology; B:Mycelial morphology (100 ×)

        2.2 分離菌株生化鑒定 分離菌株BS1-ql能發(fā)酵甘露醇、山梨醇、水楊苷、木糖、葡萄糖、果糖、蔗糖,不能發(fā)酵棉子糖、麥芽糖、松三糖等,不形成吲哚,能水解淀粉、還原硝酸鹽、利用西蒙氏枸櫞酸鹽,不能利用丙酸鹽,在7%氯化鈉、pH 5.7生長管中可生長,氧化酶試驗、觸酶試驗、V-P試驗呈陽性,甲基紅反應(yīng)為陰性(表1),均符合芽孢桿菌的生化鑒定特征。

        表1 分離菌株的生化鑒定Table 1 Biochemical identification of the isolated strain

        2.3 分離菌株分子生物學(xué)鑒定 通過PCR從細菌基因組DNA中擴增出目的片段,經(jīng)過電泳分析PCR產(chǎn)物的大小與預(yù)期一致(圖2)。分離株BS1-ql序列與參考芽孢桿菌16S rDNA序列相似度達96%以上(圖3)。分離株BS1-ql與枯草芽孢桿菌同源性為100%,并與之聚為一簇(圖4)。結(jié)合生化和分子生物學(xué)鑒定結(jié)果,綜合判定分離菌株為枯草芽孢桿菌。

        圖2 分離菌株的PCR擴增Fig.2 PCR amplification of the isolated strainM:DL2 000 DNA Marker; 1:分離菌株; N:陰性對照M:DL2 000 DNA Marker; 1:Isolated strain; N:Negative control

        圖3 分離菌株16S rDNA同源性比對Fig.3 16S rDNA homology comparison of the isolated strain

        圖4 分離菌株系統(tǒng)進化樹Fig.4 Phylogenetic tree of the isolated strain▲:本試驗分離菌株▲:Strain isolated in this study

        2.4 分離菌株抑菌試驗 分離菌株BS1-ql上清液對沙門菌、金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌分離菌株的抑菌圈直徑分別為8.72、14.50、6.00 mm和27.72 mm,表明枯草芽孢桿菌分離菌株分泌的抗菌物質(zhì)對這4種致病菌有不同程度的抑制能力,其中對金黃色葡萄球菌和產(chǎn)氣莢膜梭菌的抑制作用最為明顯。

        2.5 分離菌株生長曲線的測定 由圖5可知,分離菌株BS1-ql在0~2 h生長速度較慢,處于延滯期;2 h后生長迅速,OD600 nm值迅速升高進入對數(shù)生長期;6 h后生長變緩,逐步進入穩(wěn)定期;20 h后分離菌株的生長量下降,進入衰亡期。

        2.6 分離菌株藥敏試驗 如2表所示,分離菌株BS1-ql對四環(huán)素和多黏菌素B表現(xiàn)為中度敏感,對青霉素、頭孢曲松、卡那霉素、多西環(huán)素、呋喃唑酮、新霉素等28種抗菌藥物均表現(xiàn)為敏感。

        2.7 分離菌株耐高溫試驗 如圖6所示,分離菌株BS1-ql在40 ℃水浴30 min后存活率達90.32%,隨著水浴溫度的升高,菌株存活率呈直線下降趨勢,但仍能存活;菌株在60 ℃、80 ℃水浴培養(yǎng)24 h的存活率與水浴30 min的存活率相比,明顯增大,分別為38.75%和58.75%,說明分離菌株BS1-ql具備一定的耐高溫能力。

        圖6 分離菌株對不同溫度的耐受性Fig.6 Tolerance of the isolated strain to different temperature

        2.8 分離菌株耐酸試驗 分離菌株在pH 2.0的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)4 h和24 h后,用平板涂布法檢測不到存活菌株;在pH 7.0、pH 8.0的LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)4 h的存活率分別為1.39%和1.11%,培養(yǎng)24 h后菌株存活率有所升高,分別為7.50%和3.70%。說明培養(yǎng)環(huán)境的酸堿性對分離菌株BS1-ql的生長有直接影響,pH越小存活率越低,對堿性環(huán)境有一定的抵抗力。

        圖7 分離株對不同酸度的抗逆性Fig.7 Tolerance of the isolated strain to different acidity

        3 討論

        青藏高原作為特殊的生態(tài)系統(tǒng),孕育了性能優(yōu)良的藏羊品種[12],藏羊在進化的過程中,瘤胃內(nèi)已經(jīng)形成了獨特的微生物。瘤胃微生物主要由細菌、原蟲、厭氧真菌和少量的噬菌體組成,其中細菌的種類和數(shù)量最為豐富,根據(jù)功能差異可分為纖維降解菌、蛋白質(zhì)降解菌和脂肪降解菌等,這些菌群在瘤胃中發(fā)揮不同的功能[13]。其中纖維降解菌主要是通過產(chǎn)生各類酶與纖維素相互作用,進而轉(zhuǎn)化成機體可分解吸收的分子。本試驗選用纖維素剛果紅培養(yǎng)基為選擇性培養(yǎng)基對藏羊瘤胃微生物進行篩選,得到纖維素降解菌,結(jié)合生化試驗和16S rDNA PCR擴增進行鑒定。此方法通過表型特征與基因鑒定相結(jié)合,操作簡單便捷,能快速有效地篩選出目標細菌,且能夠準確鑒定分離菌株的親緣關(guān)系和分類地位。

        枯草芽孢桿菌不僅可以產(chǎn)生多種酶提高以粗飼草為主的反芻動物的飼料消化率[14],還可以通過分泌抑菌物質(zhì)、產(chǎn)生揮發(fā)性物質(zhì)、競爭作用等對動植物致病菌產(chǎn)生明顯的抑制作用[15]。辛國芹等[16]、Lu等[17]研究表明,枯草芽孢桿菌發(fā)酵液對大腸埃希菌、沙門菌、腸球菌和金黃色葡萄球菌有較好的抑菌效果。本試驗結(jié)果與已有報道結(jié)果一致,此外本試驗分離的藏羊源枯草芽孢桿菌上清液對沙門菌、金黃色葡萄球菌、大腸埃希菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌均有一定的抑制作用,其中對金黃色葡萄球菌和產(chǎn)氣莢膜梭菌抑制較為顯著。藏羊源枯草芽孢桿菌分離菌株延滯期較短,2~6 h為對數(shù)生長期,能夠在較短時間內(nèi)達到最大生長量,有助于縮短發(fā)酵時間,可降低生產(chǎn)成本。本試驗分離的枯草芽孢桿菌菌株生長特性與滿麗莉等[18]從中國豆豉中和袁宗勝等[19]從毛竹體內(nèi)分離篩選出的枯草芽孢桿菌不同,可能是由于菌株來源不同、存在種內(nèi)差異的原因。本試驗分離的菌株對四環(huán)素和多肽類多黏菌素B表現(xiàn)為中度敏感,且對β內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類和大環(huán)內(nèi)酯類抗菌藥等絕大多數(shù)臨床用藥有良好的敏感性,這與杜漢宇等[20]、劉曉燕等[21]的報道相似,說明分離菌株可能不存在耐藥基因,因此在應(yīng)用時攜帶或轉(zhuǎn)移耐藥基因的風(fēng)險較低。通過耐高溫和耐酸試驗發(fā)現(xiàn),與陳曦等[22]報道的豬腸源枯草芽孢桿菌的耐高溫結(jié)果相同的是分離菌株隨著水浴溫度的升高,存活率明顯下降,不同的是分離菌株在水浴處理30 min后的存活率較低,而在培養(yǎng)24 h后菌株存活率大幅度上升;與白海等[23]研究報道的綿羊源枯草芽孢桿菌于pH 2.0處理2.5 h后存活率會下降至43.9%不同,本試驗分離得到的藏羊源枯草芽孢桿菌在酸性環(huán)境下存活率較低,但對中性偏堿的環(huán)境具有一定的抵抗力;可能是由于菌株來源不同使得其生物學(xué)特性有所不同,造成了耐受性的差異性。

        綜上所述,枯草芽孢桿菌作為高原生境孕育的獨特的芽孢桿菌資源,具有良好的生物學(xué)特性,有望成為青海藏羊源微生態(tài)制劑開發(fā)的潛在候選菌株。

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