霍明珠,張軼樂,徐家偉,史 昊,劉益棟,牛文彬
(鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院 生殖醫(yī)學(xué)中心 河南省生殖與遺傳重點實驗室,河南 鄭州 450052)
人類卵母細胞的發(fā)育開始于胚胎,然后停止于減數(shù)分裂前期的雙線期和偶線期,這種停滯可長達幾十年,此時期的卵母細胞稱為生發(fā)泡(germinal vesicle, GV)[1],進入青春期后可在促黃體生成素峰的作用下恢復(fù)減數(shù)分裂。生發(fā)泡的破裂(germinal vesicle breakdown, GVBD)和第一極體的排出標(biāo)志著卵母細胞核成熟[2],卵母細胞發(fā)育到減數(shù)第二次分裂中期停滯,受精后可繼續(xù)完成減數(shù)第二次分裂。任何時期的改變都有可能導(dǎo)致卵母細胞成熟障礙以及胚胎發(fā)育異?;蛲?。卵母細胞成熟障礙主要的臨床表現(xiàn)是產(chǎn)生未成熟的卵子,并且體外不能培養(yǎng)成熟而導(dǎo)致原發(fā)性不孕[3]。卵母細胞成熟缺陷4型(OMIM:617743)是一種以卵母細胞成熟停滯為特征的不育癥,卵母細胞可在生發(fā)泡期顯示成熟停滯,也可在減數(shù)分裂中期Ⅰ(meiotic metaphase Ⅰ, MI)或者卵母細胞受精失敗和早期胚胎停滯[4],其相關(guān)PATL2的突變是致病突變,但是目前關(guān)于PATL2遺傳突變圖譜尚不完全。本研究對1例原發(fā)不孕伴卵子成熟障礙患者進行全外顯子測序,對其父母進行Sanger測序驗證以及生物信息學(xué)分析探討遺傳學(xué)病因,為后續(xù)治療提供遺傳咨詢。
1.1.1 對象:患者,女,32歲。結(jié)婚9年,性生活正常,未避孕未孕9年,男方精液檢查正常?;颊邿o家族史?;颊叻謩e于2017、2018、2019年在鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院進行3次促排取卵,3次取卵情況總結(jié)(表1)。因卵子發(fā)育停滯在GV和MI時期,體外培養(yǎng)后仍不成熟,取消試管周期,顯微鏡下卵子形態(tài)(圖1)。本研究通過鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)(批準(zhǔn)號為KY-2021-0102),患者及家屬簽署相關(guān)知情同意書。
1.1.2 試劑:QIAamp DNA 純化mini試劑盒(QIAGEN,51306);MGIEasy外顯子組捕獲V5探針試劑套盒(深圳華大基因股份有限公司,1000007746)。
1.2.1 DNA的提?。翰杉颊呒案改竿庵苎獦樱捎肣IAamp DNA 純化mini試劑盒提取基因組DNA。
1.2.2 患者全外顯子組的測序(whole exome sequencing, WES):采用MGIEasy外顯子組捕獲V5探針試劑套盒制備測序文庫,首先將DNA 打斷并制備雜交文庫,然后通過外顯子芯片對目標(biāo)基因外顯子及臨近剪切區(qū)的 DNA 進行捕獲和富集,對捕獲文庫進行擴增和純化,最后使用 MGISEQ-2000 平臺對文庫進行高通量測序。
1.2.3 Sanger測序:根據(jù)WES結(jié)果對患者及父母進行Sanger測序驗證,針對PATL2(NM_001145112)第14及13外顯子,采用Primer3軟件(Primer3webversio n4.1.0)設(shè)計引物。c.1 289_1 291delTCC的上游引物:5′-CAGTGTGCTGAGGAGGTCTG-3′, 下游引物: 5′-GACTGTCCCCCAACTTACCC-3′;c.1 374A>G的上游引物:5′-AGTGCCTCTTAAAGTGGGGTC-3′,下游引物: 5′-AGAAACCGAAACTCTAGGGCA-3′。
表1 患者取卵情況表Table 1 Oocyte extraction of the patient
A.oocyte in germinal vesicle stage; B.oocyte in the first meiosis stage圖1 光學(xué)顯微鏡下患者卵母細胞形態(tài)Fig 1 Morphology of patient’s oocytes under light microscope(×200)
1.2.4 變異位點生物信息學(xué)分析:應(yīng)用SIFT、Polyphen及Mutation對變異位點進行蛋白功能預(yù)測,應(yīng)用UniProt(https://www.uniprot.org/)獲取PATL2的氨基酸序列,運用UCSF Chimera1.14軟件在PATL2編碼的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)圖上對c.1 374A>G(p.Ile458Met)變異位點標(biāo)記以及位點變異后所致蛋白結(jié)構(gòu)的變化圖,并繪制PATL2c.1 289_1 291del TCC(p.Leu430del)位點在蛋白質(zhì)中的位置。
患者PATL2第14外顯子存在c.1 374A>G(p.Ile458Met)的雜合變異,第13外顯子上存在c.1 289_1 291delTCC(p.Leu430del)的缺失變異。HGMD對這兩種變異位點暫無收錄。根據(jù)美國遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會 (American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)指南,c.1 374A>G(p.Ile458Met)變異被判斷為疑似致病變異(PM1+ PM2+ PP2+ PP4),c.1 289_1 291delTCC(p.Leu430del)變異(PM1+ PM2+ PM4+ PP4)同樣被評為疑似致病變異。SIFT、Polyphen及Mutation預(yù)測其對蛋白功能影響,結(jié)果提示為有害變異(表2)。
Sanger測序發(fā)現(xiàn)患者父親存在與患者PATL2第14外顯子上相同的雜合變異(c.1 374A>G),患者母親存在與患者PATL2第13外顯子上相同的缺失變異(c.1 289_1 291delTCC)(圖2)。
PATL2第14外顯子上c.1 374A>G(p.Ile458Met)變異,使第458位異亮氨酸變異為甲硫氨酸,并導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生變化(圖3),PATL2第13外顯子上c.1 289_1 291delTCC(p.Leu430del)的缺失變異使第430位亮氨酸缺失(圖4),突變位點均位于PAT1結(jié)構(gòu)域,所有的PATL1蛋白都有此結(jié)構(gòu)域,其主要影響mRNA結(jié)合。
PATL2蛋白是一種mRNA結(jié)合蛋白,在未成熟卵母細胞中特異性表達,抑制細胞內(nèi)轉(zhuǎn)錄后翻譯過程;隨著卵母細胞的成熟,PATL2的表達逐漸消失。在卵母細胞增殖過程中,卵母細胞中積累了大量增殖和成熟所需的穩(wěn)定的mRNA。大多數(shù)合成的mRNA被立即翻譯來支持卵母細胞的增殖和發(fā)育,但有30%的mRNA被儲存起來,用于隨后的翻譯、恢復(fù)減數(shù)分裂,而PATL2被視為與其他mRNA結(jié)合蛋白如CPEB[cytoplasmic polyadenylation element(CPE)-binding protein]和Xp54作用相關(guān),控制著mRNA的穩(wěn)定性[5-6]。PATL2中的致病變異大多集中在PATL2蛋白的PAT1結(jié)構(gòu)域(第252位至491位氨基酸),主要負責(zé)mRNA結(jié)合[7]。陳[8]等人對具有PATL2變異的原發(fā)不孕家系研究發(fā)現(xiàn)在卵母細胞成熟停滯患者中,PATL2變異使其蛋白表達減少,表明基因的表達水平對卵母細胞成熟有重要作用。
表2 PATL2位點變異預(yù)測表Table 2 Prediction of PATL2 locus variation
A,C.the patient and her father carried the mutation site of c.1 374A>G (p.Ile458Met);B,D.the patient and her mother carried the mutation site of c.1 289_1 291delTCC (p.Leu430del)
A.protein structure diagram without site mutation; B.protein structure diagram after mutation at this site c.1 374A>G(p.Ile458Met)
圖4 變異位點在蛋白的位置Fig 4 Position of the mutation site in the protein
本例患者所取的卵母細胞均處于GV期或MI期,且在體外培養(yǎng)后仍不成熟,全外顯子測序發(fā)現(xiàn)在第14和13外顯子存在c.1 374A>G(p.Ile458Met)及c.1 289_1 291delTCC(p.Leu430del)的復(fù)合雜合變異,該變異位于PAT1結(jié)構(gòu)域,使蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,致PATL2功能的缺失。Marie Christou等[9]對PATL2缺陷的小鼠卵母細胞進行測序?qū)嶒灒l(fā)現(xiàn)與卵母細胞成熟相關(guān)基因表達顯著下調(diào)。
卵母細胞成熟缺陷4型為常染色體隱性遺傳,患者父母均具有生育力,至于PATL2變異可能只限于影響女性生育能力,因為存在具有PATL2截斷變異的男性是具有生育能力的[4]。母親的缺失變異雖然具有生育力,但母親能把這種變異傳遞給子代,這也是具有卵母細胞GV阻滯的原發(fā)性不育女性中PATL2變異比例高的因素之一[10]。在非洲爪蟾卵母細胞中PATL2的過表達抑制了mRNA的翻譯,導(dǎo)致卵母細胞成熟障礙,而在多個卵母細胞成熟障礙的患者中發(fā)現(xiàn)PATL2的表達降低,說明PATL2表達上調(diào)或者下調(diào)都不能促進卵母細胞的成熟[8, 11-12]。
對于卵母細胞成熟障礙的患者,研究發(fā)現(xiàn)[13]對于TRIP13雙等位錯義致病變異導(dǎo)致卵母細胞成熟障礙,通過將TRIP13 cRNA注射到卵母細胞中可以促進卵母細胞的成熟。對本例患者,能否采用cRNA注射到卵母細胞的方式來治療由于[13]變異導(dǎo)致的卵母細胞成熟障礙需要進一步實驗來驗證,目前主要考慮供卵治療。