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        基于聚類分析方法的皮膚病學(xué)研究熱點(diǎn)分析

        2022-01-20 02:08:50祝琳琳崔雷
        關(guān)鍵詞:可視化研究

        祝琳琳,崔雷

        (1.沈陽市第七人民醫(yī)院皮膚科,沈陽 110003;2.中國(guó)醫(yī)科大學(xué)健康管理學(xué)院情報(bào)學(xué)教研室,沈陽 110122)

        皮膚病學(xué)作為研究皮膚及其相關(guān)疾病的科學(xué),其內(nèi)容不僅涉及正常皮膚及附屬器的結(jié)構(gòu)和功能,還囊括了各種皮膚病及附屬器官疾病的病因、發(fā)病機(jī)制、臨床表現(xiàn)、診斷和防治等內(nèi)容[1]。為了進(jìn)一步了解此領(lǐng)域當(dāng)前的研究熱點(diǎn),本研究采用皮膚病研究論文高頻主題詞進(jìn)行共詞聚類分析的方法,獲得當(dāng)前國(guó)際上皮膚病學(xué)的研究熱點(diǎn),為廣大專業(yè)人員提供參考信息。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        本研究分析材料來自PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/),該數(shù)據(jù)庫(kù)由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館的國(guó)家生物技術(shù)信息中心開發(fā)維護(hù)。首先通過《期刊引用報(bào)告》(Journal Citation Reports,JCR)數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.lib.wh.sdu.edu.cn/dn/database490.html)獲取皮膚病學(xué)相關(guān)領(lǐng)域2018年影響因子最高的4種期刊:《JAMA Dermatology》 《Journal of the American Academy of Dermatology》 《The British Journal of Dermatology》 《The Journal of Investigative Dermatology》。在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索4種期刊近2年發(fā)表的所有文獻(xiàn),檢索策略為“JAMA Dermatology”[Journal] OR“Journal of the American Academy of Dermatology”[Journal] OR“The British Journal of Dermatology”[Journal]OR“The Journal of Investigative Dermatology”[Journal]AND“2018/01/01”[PDAT]:“2019/09/30”[PDAT]。并以XML格式下載文獻(xiàn)記錄。

        1.2 方法

        對(duì)從PubMed獲取的相關(guān)文獻(xiàn)記錄,應(yīng)用書目共現(xiàn)分析系統(tǒng)(bibliographic item co-occurrence matrix builder,BICOMB)2.0進(jìn)行數(shù)據(jù)提取與統(tǒng)計(jì),統(tǒng)計(jì)字段為主要主題詞/副主題詞,兩兩統(tǒng)計(jì)它們?cè)谕黄撐闹谐霈F(xiàn)的次數(shù),并截取出現(xiàn)頻次>15次者為高頻詞,從而形成主要主題詞/副主題詞-來源文獻(xiàn)矩陣。2個(gè)主要主題詞/副主題詞在眾多的文章中同時(shí)出現(xiàn)的頻率越高,說明它們之間關(guān)系越密切。以TXT格式輸入至gCLUTO軟件中進(jìn)行系統(tǒng)聚類分析,通過分析不同聚類類別主要主題詞/副主題詞,以及各個(gè)類別相對(duì)應(yīng)的代表性文獻(xiàn),獲得目前皮膚病學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。

        將主要主題詞/副主題詞應(yīng)用BICOMB生成主要主題詞/副主題詞相關(guān)文獻(xiàn)詞篇矩陣。

        2 結(jié)果

        2.1 皮膚病研究高頻主題詞

        共檢索出相關(guān)文獻(xiàn)5 136篇,截取出現(xiàn)頻次>15次的38個(gè)主要主題詞/副主題詞形成高頻詞表[2-3],見表1。相關(guān)文獻(xiàn)詞篇矩陣每一類中的主題詞以及代表性論文見表2。

        表1 近2年皮膚病研究論文高頻主要主題詞/副主題詞(頻次>15)Tab.1 High frequency major subject headings/sub-heading(frequency > 15)

        表2 詞篇矩陣Tab.2 Term paper matrix

        2.2 高頻主題詞聚類分析結(jié)果

        應(yīng)用gCLUTO軟件進(jìn)行系統(tǒng)聚類分析,得到高頻詞的聚類結(jié)果(圖1)、高頻詞聚類的可視化矩陣(圖2)及高頻詞聚類可視化山丘圖(圖3)??梢暬仃嚕▓D2)中,縱軸表示高被引論文,橫軸表示這些論文之間的距離。圖3可視化山丘圖中,數(shù)據(jù)矩陣被聚成4類,可視化山丘將4個(gè)類群顯示為4個(gè)山丘。山丘的高度與類內(nèi)相似性成正比,體積與類群包含的對(duì)象數(shù)量成正比。合成的高斯曲線相加在一起形成可視化山丘的地形。山丘的顏色與類內(nèi)偏差成比例,紅色代表變異低,藍(lán)色代表變異度高。

        圖1 高頻詞聚類結(jié)果Fig.1 Clustering results of high frequency words

        圖2 高頻詞聚類的可視化矩陣Fig.2 Visual matrix of high frequency word clustering

        3 討論

        通過高頻詞聚類結(jié)果(圖1)、高頻詞聚類的可視化矩陣(圖2)以及高頻詞聚類的可視化山丘圖(圖3)發(fā)現(xiàn),將所得數(shù)據(jù)聚成4類后,聚類效果較好,通過閱讀各個(gè)類別對(duì)應(yīng)的描述度較高的來源文獻(xiàn)進(jìn)一步了解每類的內(nèi)容,將皮膚病學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)主要分為4類。

        圖3 高頻詞聚類的可視化山丘圖Fig.3 Visual hill map of high frequency word clustering

        第一類為皮膚病的藥物治療、療效評(píng)價(jià)及安全情況的研究。對(duì)Cluster 0中相關(guān)代表性文獻(xiàn)及類標(biāo)簽文獻(xiàn)的分析結(jié)果顯示,高頻主題詞主要聚集于皮膚科藥物治療,尤其是特應(yīng)性皮炎(atopic dermatitis,AD)和慢性銀屑病生物制劑治療的效果、安全性,該類研究[4-7]對(duì)指導(dǎo)臨床工作有實(shí)際意義。AD是一種復(fù)雜的慢性炎癥性疾病,中重度AD在治療上存在挑戰(zhàn)。Dupilumab治療中重度AD在療效及耐受性方面值得被肯定[8]。目前針對(duì)AD的其他生物制劑也在臨床研發(fā)中,如Tralokinumab(白細(xì)胞介素-13)及Nemolizumab(白細(xì)胞介素-31受體)等[9],這些研究為未來拓寬AD的治療提供了新的前景。銀屑病是一種常見的慢性免疫介導(dǎo)的炎癥性疾病,嚴(yán)重影響患者的社會(huì)心理和情感健康,重癥銀屑病的患者通常接受光療、全身性藥物治療(甲氨蝶呤、環(huán)孢菌素b、阿維A等)和生物制劑治療等。

        第二類為黑色素瘤的遺傳學(xué)、流行病學(xué)等方面的研究。對(duì)Cluster 1中的相關(guān)高被引文獻(xiàn)進(jìn)行分析,4篇代表性文獻(xiàn)[10-13]均是基于對(duì)黑色素瘤的研究,如突變對(duì)黑色素瘤的影響以及使用遺傳學(xué)方法進(jìn)行黑色素瘤風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)。通過全基因組關(guān)聯(lián)研究,已經(jīng)鑒定出與黑色素瘤相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)。然而,這些SNP對(duì)黑色素瘤發(fā)展的綜合影響仍不清楚。與良性痣相比,黑色素瘤的BRAF突變率較低,這與BRAF突變可能是導(dǎo)致黑色素細(xì)胞增殖而不是惡性轉(zhuǎn)化的基因概念是一致的[13]。

        第三類為黑色素瘤的危險(xiǎn)因素、回歸預(yù)后、生存率和死亡率等方面的研究。對(duì)Cluster 2中相關(guān)高被引文獻(xiàn)及類標(biāo)簽文獻(xiàn)的分析結(jié)果顯示,黑色素瘤多為黑色素細(xì)胞惡變而來的腫瘤,惡性程度高,對(duì)黑色素瘤患者的生存預(yù)后分析具有十分重要的臨床意義[14-17]。經(jīng)典的因素(厚度、潰瘍、年齡)均對(duì)預(yù)后有影響[14]。皮膚痣數(shù)量增多顯著增加了黑素瘤死亡的風(fēng)險(xiǎn)。痣的數(shù)目在臨床實(shí)踐中可能作為預(yù)測(cè)黑素瘤死亡風(fēng)險(xiǎn)的獨(dú)立預(yù)后因素。

        第四類為人乳頭瘤病毒與皮膚腫瘤的關(guān)系及皮膚腫瘤的影像學(xué)診斷方面的研究。主要包括識(shí)別臨床和皮膚鏡特征,組織病理學(xué)診斷皮膚腫瘤,評(píng)估惡性腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)[18-21]。皮膚鏡檢查被認(rèn)為是檢測(cè)黑色素瘤的重要工具,在臨床上發(fā)現(xiàn)黑色素瘤之前就可揭示出它的不對(duì)稱性,幫助臨床醫(yī)生更早地識(shí)別黑色素瘤。

        綜上所述,本研究通過共詞聚類分析方法,分析了當(dāng)前皮膚病學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。目前皮膚病學(xué)的研究熱點(diǎn)主要集中在以下3個(gè)方向:(1)對(duì)各種生物制劑治療皮膚病的效果評(píng)價(jià)安全情況;(2)對(duì)黑色素瘤的遺傳學(xué)、危險(xiǎn)因素、流行病學(xué)、生存預(yù)后、發(fā)病率與死亡率等方面的研究;(3)應(yīng)用皮膚鏡等影像技術(shù)診斷皮膚腫瘤,評(píng)估惡性皮膚腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)。本研究結(jié)果為把握皮膚病學(xué)的研究現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢(shì)奠定了基礎(chǔ),為臨床工作和未來的研究提供了方向。

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