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        儲糧害蟲網(wǎng)翅鱗蟲齒的形態(tài)與DNA條形碼鑒定

        2021-12-15 01:19:54鄧溫歆崔紀(jì)翔馮士騫陳明華李志紅
        糧食儲藏 2021年4期
        關(guān)鍵詞:條形碼形態(tài)學(xué)物種

        鄧溫歆 崔紀(jì)翔 馮士騫 粟 耘 陳 暄 陳明華 張 濤 李志紅

        (1 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護學(xué)院植物生物安全系 100193) (2 北京市昌平糧食收儲庫 102200) (3 國家糧食和物資儲備局科學(xué)研究院 100037)

        嚙總目(Psocodea)中部分物種是全球廣泛關(guān)注的倉儲害蟲,它們危害儲糧,極大降低了糧食的品質(zhì)[1,2]。此外,該類害蟲可傳播病原微生物,導(dǎo)致儲糧污染嚴(yán)重,并可能導(dǎo)致人類產(chǎn)生過敏反應(yīng)[3,4]。因此,嚙蟲被認(rèn)為是全球食品安全的一種生物風(fēng)險[5]。危害儲糧的嚙蟲主要屬于書虱科(Liposcelididae)的書虱屬(Liposcelis)和竊蟲齒科(Trogiidae)的鱗蟲齒屬(Lepinotus)[6]。截至目前,鱗蟲齒屬已報道12種[7];其中,網(wǎng)翅鱗蟲齒(LepinotusreticulatusEnderlein)在中國云南省及浙江省已有記錄[8,9];其在浙江省為野外記錄,在云南省為糧庫環(huán)境中的記錄。嚙蟲可隨糧食的運輸而擴散,作為儲糧害蟲防治的基礎(chǔ)性工作,嚙蟲種類的準(zhǔn)確鑒定尤為重要。

        由于儲糧嚙蟲個體微小、近似種之間的形態(tài)差異細(xì)微,基于傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)的種類鑒定需要一定的專業(yè)知識與技巧[10]。隨著分子生物技術(shù)的快速發(fā)展,DNA條形碼被運用于生物物種鑒定,基于mtDNA COΙ條形碼,可快速、準(zhǔn)確鑒定出未知動物樣品的種類[11]。其中,F(xiàn)olmer等[12]設(shè)計了可擴增無脊椎動物mtDNA COΙ基因的通用引物,已被廣泛應(yīng)用。針對網(wǎng)翅鱗蟲齒,2012年中國農(nóng)業(yè)大學(xué)報道了網(wǎng)翅鱗蟲齒在中國的新紀(jì)錄[8,9];此外,Mohammad Arif等[13]基于普通PCR、SYBR Green qPCR以及HDA(helicase dependent amplification)的方法,對網(wǎng)翅鱗蟲齒的COΙ基因進(jìn)行擴增,更加快速、靈敏地鑒定出該物種。到目前為止,在NCBI網(wǎng)站中,鱗蟲齒屬中包括網(wǎng)翅鱗蟲齒(Lepinotusreticulatus)及帕特鱗蟲齒(Lepinotuspatruelis)兩個物種,共12條mtDNA COΙ基因序列可供下載并使用。除此之外,竊蟲齒亞目中包括竊蟲齒科、跳蟲齒科和鱗蟲齒科均有代表性的物種的mtDNA COΙ基因序列可供下載并使用。

        本研究基于形態(tài)學(xué)與DNA條形碼相結(jié)合的方法,對采集自北京市昌平區(qū)某糧庫的嚙蟲樣品進(jìn)行了鑒定,鑒定結(jié)果為網(wǎng)翅鱗蟲齒。本研究實現(xiàn)了對網(wǎng)翅鱗蟲齒的快速、準(zhǔn)確鑒定,是該蟲在北京地區(qū)的首次報道。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        研究所用嚙蟲樣品于2019年6月采集自北京市昌平區(qū)某糧庫的準(zhǔn)低溫稻谷倉。樣品液浸于100%乙醇,置于-20℃冰箱保存于中國農(nóng)業(yè)大學(xué)植物檢疫與入侵生物學(xué)實驗室(CAUPQL)。

        1.2 儀器與設(shè)備

        K-400L體視顯微鏡:香港生產(chǎn);CX31光學(xué)顯微鏡:日本生產(chǎn);EOS500D相機:日本生產(chǎn);H2O3-PROIII金屬浴儀:北京生產(chǎn);Q5000核酸濃度檢測儀;Veriti TM 96-well Thermal Cycler (ABI USA)型PCR儀:美國產(chǎn)。

        1.3 試驗方法

        1.3.1 形態(tài)學(xué)鑒定 形態(tài)學(xué)整體照片使用液浸樣品,浸泡在100%酒精中,于OLYMPUS CX31顯微鏡下鏡檢并使用Canon EOS500D進(jìn)行拍照。細(xì)節(jié)照片使用活蟲壓制玻片標(biāo)本,方法為將樣品浸泡于乳酸6 h,充分釋放內(nèi)容物,取出后用清水漂洗。在載玻片中央滴1滴霍氏液并將樣品置于霍氏液中。在體視顯微鏡下,用解剖鑷整姿后蓋上蓋玻片。靜置10 min,玻片標(biāo)本于70℃金屬浴上加熱5 min。待自然風(fēng)干兩周后于OLYMPUS CX31顯微鏡下鏡檢并使用Canon EOS500D拍攝重要形態(tài)學(xué)特征照片。照片標(biāo)尺基于ImageJ 1.8.0添加[14]。

        相關(guān)形態(tài)學(xué)鑒定特征參考梁飛揚等[8]。

        1.3.2 DNA提取 對嚙蟲樣品的基因組DNA提取選用TIANamp Micro DNA Kit試劑盒,參照試劑盒的使用說明進(jìn)行單頭提取,共提取4頭樣蟲。應(yīng)用Quawell Q5000核酸濃度檢測儀檢測所提取DNA的濃度和純度,并置于-70℃保存。

        1.3.3 PCR擴增及序列測定 選取mtDNA中的COΙ基因作為DNA條形碼進(jìn)行PCR擴增。擴增引物參考Folmer等[12],LCO1490(5′-GGTCAATCATAAAGATATATTGG-3′),HCO2198(5′-TAAACTTCAGG-GTGAAAAAATCA-3′)。PCR反應(yīng)在Veriti TM 96-well Thermal Cycler型PCR儀中完成。PCR體系選用25 μL體系:2×Taq PCR MasterMix 12.5 μL,ddH2O 9.5 μL,前、后引物各1.0 μL 及基因組DNA模板1.0 μL。擴增條件為:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30sec-52℃退火30sec-72℃延伸30sec為1個循環(huán),共設(shè)置35次循環(huán),72℃補齊10 min,14℃保存PCR產(chǎn)物[15,16]。針對PCR產(chǎn)物,使用1.5%瓊脂糖1×Tris Acetate-EDTA凝膠電泳,使用Gene Green Nucleic Acid Dye為染色劑,選用D2000 Marker為參考條帶長度,在Gel Logic 212 PRO型紫外燈下檢測PCR產(chǎn)物的擴增結(jié)果。全部PCR產(chǎn)物由北京進(jìn)行雙端一代測序。

        1.3.4 序列分析 所測序列基于Chromas檢測其質(zhì)量[17],并應(yīng)用MEGA 7拼接并去除引物序列[18]。應(yīng)用MEGA 7基于MUSCLE將所測序列與同源序列進(jìn)行比對后剪切至合適長度[20],上傳剪切后序列至GenBank獲得Accession number?;贜CBI中BLAST功能與nt數(shù)據(jù)庫進(jìn)行相似性比對。GenBank中下載網(wǎng)翅鱗蟲齒同屬及相關(guān)物種的同源序列(表1),竊蟲齒亞目中每個屬選取1個物種作為代表,用于系統(tǒng)發(fā)育樹分析。由于11條已知網(wǎng)翅鱗蟲齒的COΙ序列之間相似度高于96%,因此隨機選取一條COΙ序列作為該種的代表參與系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建。參考Yoshizawa等[19],粉蟲齒亞目的嗜蟲書虱和嗜卷書虱被選取為外群用于進(jìn)行竊蟲齒亞目相關(guān)倉儲害蟲的系統(tǒng)發(fā)育分析。應(yīng)用MEGA 7基于Kimura 2-Parameter模型對COΙ序列進(jìn)行對偶遺傳距離計算,并構(gòu)建Neighbor-joining(NJ)系統(tǒng)發(fā)育樹,設(shè)置自我檢測1000次,結(jié)果標(biāo)注于拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相應(yīng)節(jié)點旁。

        表1 網(wǎng)翅鱗蟲齒及相關(guān)物種用于系統(tǒng)發(fā)育分析的相關(guān)序列信息

        2 結(jié)果與分析

        2.1 形態(tài)鑒定結(jié)果

        嚙蟲樣品玻片標(biāo)本顯示,該樣品雌蟲體長約1 mm(圖1a)。頭紅褐色,胸部和腹部為黃褐色,無單眼和頭蓋縫臂。復(fù)眼上具2根剛毛,其中一剛毛僅剩毛窩(圖1b)。內(nèi)顎葉頂端具2齒,外側(cè)為大齒,內(nèi)側(cè)為小齒(圖1c)。該樣品僅具1對前翅,翅脈網(wǎng)格狀,多毛(圖1a,d),無后翅。后足脛節(jié)具2尖刺(圖1e),跗節(jié)3節(jié),第一跗節(jié)上無刺。近肛門處,肛側(cè)板上具一長剛毛(圖1f)。雌蟲生殖突外瓣發(fā)達(dá),具幾根細(xì)小剛毛,頂端具一長剛毛(圖1g),無受精囊。以上形態(tài)特征與已有描述相符,基于形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果,所采集的嚙蟲樣品可被鑒定為網(wǎng)翅鱗蟲齒。

        a成蟲背面觀

        b復(fù)眼

        c內(nèi)顎葉頂端

        d前翅

        e后足脛節(jié)、跗節(jié)

        f肛側(cè)板

        g生殖突外瓣

        2.2 分子鑒定結(jié)果

        PCR產(chǎn)物經(jīng)凝膠電泳檢測結(jié)果如圖2所示,COΙ基因擴增結(jié)果條帶清晰,片段長度約為700 bp。

        注:M為D2000 Marker,1~4為4頭樣蟲,5為陰性對照

        經(jīng)測序得到長度為683 bp的高質(zhì)量COΙ序列4條(MW134455-MW134458)。其與已知網(wǎng)翅鱗蟲齒的mtDNA COΙ序列的BLAST結(jié)果如表2所示,E value為0,相似度為97.26%~99.24%?;贙imura 2-Parameter模型對COΙ序列進(jìn)行對偶遺傳距離計算結(jié)果見表3,樣品與已知網(wǎng)翅鱗蟲齒同源序列間K2P對偶遺傳距離范圍最小,為0.012~0.020。在基于鄰接法(NJ)構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中,4頭嚙蟲樣品均與已知網(wǎng)翅鱗蟲齒樣品聚在同一支(圖3),能夠與竊蟲齒亞目其他種群明顯區(qū)分?;谝陨辖Y(jié)果,所采集的嚙蟲樣品為網(wǎng)翅鱗蟲齒。

        表2 基于COΙ條形碼的嚙蟲樣品與網(wǎng)翅鱗蟲齒的BLAST結(jié)果

        表3 基于COΙ條形碼的嚙蟲樣品與相關(guān)物種對偶遺傳距離計算結(jié)果

        圖3 鄰接法(NJ)構(gòu)建嚙蟲樣品及其相關(guān)物種系統(tǒng)發(fā)育樹

        3 討論

        網(wǎng)翅鱗蟲齒是一種個體微小、短翅、能夠孤雌生殖的倉儲害蟲[21-23],也能在室外的地面垃圾、鳥類及哺乳動物巢中,甚至鳥類羽毛中偶然發(fā)現(xiàn)該蟲[9]。本研究基于形態(tài)學(xué)鑒定方法,對采集自北京市昌平區(qū)某糧庫的嚙蟲樣品進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察,并對其形態(tài)學(xué)特征進(jìn)行了詳細(xì)描述,樣品被鑒定為網(wǎng)翅鱗蟲齒。同時,基于DNA條形碼鑒定方法,嚙蟲樣品的mtDNA COΙ條形碼序列被測定,比對了相似度,并被基于Kimura 2-Parameter模型計算對偶遺傳距離,構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹。最終,分子鑒定結(jié)果支持形態(tài)學(xué)觀察結(jié)果,即所采集的嚙蟲樣品是網(wǎng)翅鱗蟲齒。

        DNA條形碼技術(shù)依據(jù)簡短且標(biāo)準(zhǔn)化的基因序列進(jìn)行物種鑒定,其準(zhǔn)確性的高低取決于已有基因庫的豐富程度[24]。mtDNA COΙ作為一種典型的模式條形碼,已較為廣泛地用于未知物種的分子鑒定[23]。鱗蟲齒屬的不同種類間,由于蟲體微小,形態(tài)特征差異細(xì)微,形態(tài)鑒定有較大難度。DNA條形碼鑒定可以克服嚙蟲處于不同生長階段,形態(tài)特征差別細(xì)微所導(dǎo)致的鑒定困難,即能夠快速、準(zhǔn)確地鑒定各蟲態(tài)的嚙蟲樣品。

        到目前為止,在NCBI網(wǎng)站中,鱗蟲齒屬僅有12條mtDNA COΙ基因序列可供下載與使用。在GenBank及BoldSystems等多種數(shù)據(jù)庫中,所包含鱗蟲齒屬的mtDNA COΙ序列具有一定的重合,但仍有部分序列未同步。此外,數(shù)據(jù)庫中上傳的mtDNA COΙ基因序列之間長度不一致,這可能為鱗蟲齒屬的準(zhǔn)確鑒定帶來不便。為進(jìn)一步提高DNA條形碼鑒定結(jié)果的準(zhǔn)確性,隨著鱗蟲齒屬在世界范圍內(nèi)新紀(jì)錄的增加,應(yīng)盡量增添該屬不同種和種群的mtDNA COΙ序列檢測結(jié)果,同時統(tǒng)一序列長度范圍并在多數(shù)據(jù)庫中同步更新,以提高多數(shù)據(jù)庫中該基因的豐富程度。

        針對網(wǎng)翅磷蟲齒的生物學(xué)特性、危害特點以及在糧庫中的發(fā)生規(guī)律和致害機制,有待進(jìn)一步研究。在本研究中,網(wǎng)翅磷蟲齒被發(fā)現(xiàn)于經(jīng)過熏蒸的準(zhǔn)低溫稻谷倉中。有學(xué)者曾針對其食物偏好性及種群增長特點進(jìn)行過報道[23]。為了實現(xiàn)儲糧嚙蟲的綠色可持續(xù)防治,未來應(yīng)進(jìn)一步加強網(wǎng)翅磷蟲齒對熏蒸劑和低溫的耐受能力及其機制的研究。

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