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        基于分層四叉樹(shù)的多分辨率數(shù)字巖心的表示與生成*

        2021-12-01 14:26:26陳國(guó)軍裴利強(qiáng)
        關(guān)鍵詞:模型

        陳國(guó)軍 裴利強(qiáng) 李 勝 姜 朕

        (中國(guó)石油大學(xué)(華東)計(jì)算機(jī)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院 青島 266580)

        1 引言

        數(shù)字巖心技術(shù)是通過(guò)特定技術(shù)對(duì)巖心進(jìn)行模擬,建立巖石三維數(shù)字化圖像,根據(jù)數(shù)字巖心技術(shù)生成的數(shù)字巖心模型能夠反映真實(shí)巖心微觀孔隙結(jié)構(gòu),模擬巖石物理屬性及實(shí)驗(yàn),可以精確地分析巖心各項(xiàng)特征和性質(zhì)。相比于傳統(tǒng)的巖石物理實(shí)驗(yàn),數(shù)字巖心技術(shù)快速簡(jiǎn)便,省時(shí)省力且結(jié)果精細(xì)等優(yōu)點(diǎn)。

        數(shù)字巖心的建模方法[1~5]根據(jù)建模數(shù)據(jù)的來(lái)源可以分為兩種:物理重建與數(shù)值重建,物理重建全部使用外部數(shù)據(jù)重建數(shù)字巖心,不通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬巖心的結(jié)構(gòu)元素;數(shù)值重建則部分依靠外部數(shù)據(jù),然后通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬出數(shù)字巖心。物理重建分為X射線(xiàn)掃描成像法和切片組合法等[6~8]。

        X射線(xiàn)CT技術(shù)出現(xiàn)和發(fā)展[9],促進(jìn)了數(shù)字巖心技術(shù)的發(fā)展,通過(guò)CT設(shè)備掃描,能夠獲得分辨率極高的巖心二維圖像,使得建立精細(xì)、準(zhǔn)確的數(shù)字巖心孔隙骨架結(jié)構(gòu)更加簡(jiǎn)單便易。

        數(shù)字巖心的表現(xiàn)形式有多種,體素模型、面模型、孔隙網(wǎng)絡(luò)模型[10]等,其中體素模型是對(duì)真實(shí)數(shù)字巖心進(jìn)行數(shù)據(jù)建模的一種直觀表示方式,用一系列規(guī)則尺寸的體元(如立方體和正十二面體等)來(lái)模擬巖心空間。建立體素模型數(shù)字巖心的一般步驟:首先將二維巖心切片預(yù)處理,分割巖心骨架和孔隙像素,疊加到三維場(chǎng)景中,根據(jù)每一層切片像素信息生成對(duì)應(yīng)的體素。體素模型模擬數(shù)字巖心的特點(diǎn)是簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確,便于進(jìn)行巖心孔隙骨架空間分布的研究。但體素?cái)?shù)字巖心容易帶來(lái)數(shù)據(jù)冗余、占用存儲(chǔ)空間大等問(wèn)題,難以在普通計(jì)算機(jī)上進(jìn)行快速生成和渲染,因此,需要采用和合理的數(shù)據(jù)組織方式。通常,數(shù)字巖心部分結(jié)構(gòu)需要較高分辨率與精度,以獲得更多的細(xì)節(jié)信息,而其余部分則不需高分辨率,難以平衡分辨率問(wèn)題。張晴等[11]分別對(duì)頁(yè)巖巖心采用高、低兩個(gè)分辨率獲取二維切片圖像,然后分別建立了二者的數(shù)字巖心,在低分辨率下建立的頁(yè)巖數(shù)字巖心,為了表征出內(nèi)部的納米級(jí)孔隙特征,選取特定的區(qū)域,在高分辨率下建立了相應(yīng)的數(shù)字巖心。崔利凱等[12]利用圖像配準(zhǔn)方法將不同分辨率下的巖心掃描圖像進(jìn)行空間配準(zhǔn),按照分辨率從高到低的順序進(jìn)行孔隙及骨架分割,構(gòu)建多尺度、多組分的數(shù)字巖心模型。有些研究[13~18]采用八叉樹(shù)的方式組織數(shù)據(jù),但八叉樹(shù)仍存在構(gòu)建較為耗時(shí),遍歷復(fù)雜,維護(hù)管理不方便等問(wèn)題,且在X、Y、Z三個(gè)方向上分辨率相同,在表示模型邊界時(shí)精確度不高,三個(gè)方向上尺寸相差較大的情況下造成了數(shù)據(jù)的冗余。劉亞靜[19]等對(duì)八叉樹(shù)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)進(jìn)行擴(kuò)展,將形體的邊界信息單獨(dú)存儲(chǔ),然后對(duì)三維礦體進(jìn)行重構(gòu),提升了模型的邊界精度。

        本文針對(duì)傳統(tǒng)的數(shù)字巖心建模方法造成的數(shù)據(jù)量過(guò)大,耗時(shí)過(guò)長(zhǎng),難以表示多分辨率等問(wèn)題,提出了分層四叉樹(shù)模型,在此模型基礎(chǔ)上建立多分辨率數(shù)字巖心體素模型,同時(shí)結(jié)合MC算法[20],生成數(shù)字巖心面模型。最后通過(guò)實(shí)驗(yàn)給出了分層四叉樹(shù)與普通方式以及八叉樹(shù)在性能上的對(duì)比。

        2 CT切片預(yù)處理

        通過(guò)射線(xiàn)掃描獲得的CT切片為灰度圖,像素灰度值分布為0~255,需要設(shè)置閾值,將孔隙和骨架進(jìn)行分割,以分別獲得骨架和孔隙數(shù)據(jù)。閾值分割方法實(shí)際上通過(guò)對(duì)比閾值將閾值兩邊的像素點(diǎn)灰度值二值化,設(shè)分割閾值為T(mén),像素點(diǎn)(i,j)的灰度值為f(i,j),若f(i,j)>T,則令其灰度值為255,否則為0,計(jì)算式如式(1)所示。

        閾值分割算法的關(guān)鍵是確定閾值,如果能確定一個(gè)合適的閾值就可準(zhǔn)確地將圖像分割開(kāi)來(lái)。閾值分割法主要分為全局和局部?jī)煞N,目前應(yīng)用的閉值分割方法都是在此基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的,比如最小誤差法、最大相關(guān)法、最大嫡法、矩量保持法、最大類(lèi)間方差法等,而應(yīng)用最廣泛的是最大類(lèi)間方差法。

        本文采用最大類(lèi)間方差法進(jìn)行計(jì)算閾值,再結(jié)合孔隙度,進(jìn)行閾值修正,最后根據(jù)閾值區(qū)分骨架和孔隙像素?cái)?shù)據(jù)。

        1)最大類(lèi)間方差

        最大類(lèi)間方差法OTSU[21~23]是一種自適應(yīng)閾值確定的方法,基于全局的二值化算法,它是根據(jù)圖像的灰度特性,將圖像分為前景和背景兩個(gè)部分。當(dāng)取最佳閾值時(shí),兩部分之間的差別應(yīng)該是最大的,在算法中所采用的衡量差別的標(biāo)準(zhǔn)就是較為常見(jiàn)的最大類(lèi)間方差。

        記T為前景與背景的分割閾值,前景點(diǎn)數(shù)占圖像比例為w0,平均灰度為u0;背景點(diǎn)數(shù)占圖像比例為w1,平均灰度為u1,圖像的總平均灰度為u,前景和背景圖像的方差,計(jì)算如式(2)所示。

        當(dāng)方差g最大時(shí),可以認(rèn)為此時(shí)前景和背景差異最大,此時(shí)的灰度T是最佳閾值。

        2)閾值修正

        采用最大類(lèi)間方差法計(jì)算得到的閾值,只是從概率角度計(jì)算得到的,用這個(gè)閾值進(jìn)行分割像素,導(dǎo)致孔隙像素個(gè)數(shù)較多,得到的孔隙度過(guò)大,為此需要進(jìn)行修正。

        根據(jù)巖心的孔隙度φ和最大類(lèi)間方差法計(jì)算得到的閾值為T(mén)0及巖心總的像素個(gè)數(shù)C。分別計(jì)算T=T0±di時(shí)的孔隙像素個(gè)數(shù)Ci/C和Ci/C,最終閾值取|φ-Ci/C|最小時(shí)的T作為閾值,如式(3)和(4)所示。

        3 分層四叉樹(shù)模型

        四叉樹(shù)和八叉樹(shù)[24]是分別用來(lái)描述二維空間和三維空間的樹(shù)狀數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),八叉樹(shù)每個(gè)節(jié)點(diǎn)下至多可以有八個(gè)節(jié)點(diǎn),通常把三維空間劃分為八個(gè)區(qū)域,區(qū)域的信息存儲(chǔ)在每個(gè)節(jié)點(diǎn)中,若細(xì)分區(qū)域中沒(méi)有信息或具有一樣的性質(zhì),則節(jié)點(diǎn)不再細(xì)分。四叉樹(shù)則用來(lái)表示二維空間。

        本文提出分層四叉樹(shù)模型,根據(jù)本文實(shí)際情況將四叉樹(shù)擴(kuò)展到三維空間,采用多層四叉樹(shù)的方式組織CT切片數(shù)據(jù),分層四叉樹(shù)結(jié)構(gòu)如圖1所示。

        圖1 分層四叉樹(shù)示意圖

        3.1 分層四叉樹(shù)模型定義

        每層CT切片生成一棵四叉樹(shù),由一個(gè)一維數(shù)組存儲(chǔ)每棵樹(shù)的根節(jié)點(diǎn)。四叉樹(shù)節(jié)點(diǎn)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)包含節(jié)點(diǎn)類(lèi)型、節(jié)點(diǎn)坐標(biāo)位置、節(jié)點(diǎn)的子節(jié)點(diǎn)指針等。

        四叉樹(shù)任一節(jié)點(diǎn)的子節(jié)點(diǎn)為四個(gè)或零個(gè),若節(jié)點(diǎn)范圍內(nèi)存在像素值不同的像素點(diǎn),即不滿(mǎn)足式(15),則節(jié)點(diǎn)細(xì)分為四個(gè)子節(jié)點(diǎn),子節(jié)點(diǎn)每個(gè)維度上 的 邊 長(zhǎng) 分 別 為L(zhǎng)1=(xmax-xmin)/2、L2=(ymaxymin)/2,若范圍內(nèi)像素值一致,即滿(mǎn)足式(5),則節(jié)點(diǎn)為葉節(jié)點(diǎn),節(jié)點(diǎn)中存儲(chǔ)范圍坐標(biāo)、子節(jié)點(diǎn)指針及節(jié)點(diǎn)像素屬性等信息,對(duì)于四叉樹(shù),所有葉節(jié)點(diǎn)滿(mǎn)足節(jié)點(diǎn)內(nèi)像素屬性一致。

        單層CT切片生成的四叉樹(shù)如圖2所示。

        圖2 單層CT切片四叉樹(shù)示意圖

        3.2 分層四叉樹(shù)模型擴(kuò)展

        分層四叉樹(shù)由于結(jié)構(gòu)特點(diǎn),其管理較為快速簡(jiǎn)便。遍歷:通過(guò)根節(jié)點(diǎn)數(shù)組直接獲得根節(jié)點(diǎn)指針,然后通過(guò)節(jié)點(diǎn)存儲(chǔ)的子節(jié)點(diǎn)指針進(jìn)行遍歷,直至滿(mǎn)足條件,對(duì)于樹(shù)T,其深度depth(T)=max{log2rmax,log2cmax};拆分:將待拆分節(jié)點(diǎn)根據(jù)節(jié)點(diǎn)范圍坐標(biāo)一分為四,得到新的四個(gè)葉節(jié)點(diǎn),對(duì)新的葉節(jié)點(diǎn)進(jìn)行賦值;合并:由于四叉樹(shù)節(jié)點(diǎn)子節(jié)點(diǎn)數(shù)要么為0要么為4,因此合并即為4個(gè)子節(jié)點(diǎn)合并,直接將4個(gè)子節(jié)點(diǎn)刪除,保留其父節(jié)點(diǎn)即可。

        4 數(shù)字巖心的多分辨率模型生成

        4.1 多分辨率擴(kuò)展

        首先由低分辨率CT切片數(shù)據(jù)建立四叉樹(shù)模型。

        通過(guò)高分辨率模板對(duì)低分辨率CT切片進(jìn)行修改時(shí),低分辨率CT切片孔隙、骨架像素點(diǎn)可能會(huì)發(fā)生翻轉(zhuǎn)變化,因此需要對(duì)四叉樹(shù)進(jìn)行相應(yīng)的修改擴(kuò)展。設(shè)擴(kuò)展切片號(hào)為n,模板所在行列值范圍為rmin~rmax,cmin~cmax。

        根據(jù)切片編號(hào)i從根節(jié)點(diǎn)數(shù)組中取出對(duì)應(yīng)四叉樹(shù)根節(jié)點(diǎn)RootNode=Slice(n);從根節(jié)點(diǎn)通過(guò)子節(jié)點(diǎn)指針進(jìn)行遍歷,比較子節(jié)點(diǎn)Si坐標(biāo)范圍與模板所在行列范圍,若滿(mǎn)足rmin>xmin,rmaxymin,cmax

        圖3 模板割分示意圖

        4.2 體素?cái)?shù)字巖心

        依據(jù)根節(jié)點(diǎn)數(shù)組,遍歷每一層切片(即每一棵四叉樹(shù)),根據(jù)節(jié)點(diǎn)屬性由式(6)判斷節(jié)點(diǎn)類(lèi)型,取出葉節(jié)點(diǎn)中存儲(chǔ)的坐標(biāo)信息,由xmin、xmax、ymin、ymax、z、z+1構(gòu)建立方體體元,同時(shí)根據(jù)節(jié)點(diǎn)屬性分別賦予骨架體元和孔隙體元不同渲染顏色。

        等值面的梯度分量在沿面的切線(xiàn)方向?yàn)榱?,所以,該點(diǎn)的梯度矢量的方向就代表了該點(diǎn)的法向方向[15]。為了方便后續(xù)等值面法線(xiàn)的計(jì)算,體元各頂點(diǎn)法向量通過(guò)差分公式計(jì)算:

        式中:Δx、Δy、Δz分別代表體元三個(gè)方向上的間距,此處Δx=Δy=Δz=1,gx、gy、gz分別代表坐標(biāo)點(diǎn)(i,j,k)三個(gè)方向上的梯度值,法向量為N。

        4.3 面數(shù)字巖心

        4.3.1 基于分層四叉樹(shù)的MC算法

        Marching Cubes算法是一種經(jīng)典的等值面提取算法,它的原理是在由一系列二維圖像組成的三維圖像庫(kù)中選取上下連續(xù)兩層相鄰8個(gè)像素點(diǎn)作為定點(diǎn)組成的立方體體元中,根據(jù)8個(gè)頂點(diǎn)的像素值生成三角形截面,即等值面。對(duì)體元中8個(gè)角點(diǎn)的像素值進(jìn)行判斷,如果頂點(diǎn)值為0,則說(shuō)明該頂點(diǎn)為孔隙點(diǎn),將該點(diǎn)標(biāo)記為0,如果頂點(diǎn)值為255,則說(shuō)明該點(diǎn)為骨架點(diǎn),標(biāo)記為1,遍歷體元8個(gè)頂點(diǎn),便得到孔隙、骨架點(diǎn)的分布情況,如果體元一條邊的兩個(gè)頂點(diǎn)屬性不一樣,那么截面一定經(jīng)過(guò)此邊,由此規(guī)律,可以找到體元中與截面三角形相交的邊,進(jìn)而分析出體元中截面的分布情況。體元頂點(diǎn)標(biāo)記只有0和1兩種情況,所以總共存在28=256種不同的體元。由旋轉(zhuǎn)和對(duì)稱(chēng)變換可知256種體元可以總結(jié)為15種。

        由分層四叉樹(shù)模型構(gòu)建體元:依據(jù)CT切片行列值坐標(biāo)i∈(rmin,rmax)、j∈(cmin,cmax),依次構(gòu)建體元的八個(gè)頂點(diǎn),對(duì)于體元頂點(diǎn)p(i,j,k),對(duì)分層四叉樹(shù)k進(jìn)行遍歷,得到葉節(jié)點(diǎn)N,若滿(mǎn)足xmin

        使用高分辨率模板對(duì)分層四叉樹(shù)模型進(jìn)行擴(kuò)展后,造成局部節(jié)點(diǎn)細(xì)分,分辨率變高,體元的構(gòu)建亦須相應(yīng)的改變。如圖4所示,節(jié)點(diǎn)N為擴(kuò)展節(jié)點(diǎn),將其進(jìn)行標(biāo)記,視為高分辨率節(jié)點(diǎn),構(gòu)建體元時(shí)須提高分辨率,然后遍歷其鄰接節(jié)點(diǎn)N1、N2、N3、N4、N5、N6,判斷節(jié)點(diǎn)N與鄰接節(jié)點(diǎn)交界處像素值是否一致,若與鄰接節(jié)點(diǎn)Ni像素不一致,則節(jié)點(diǎn)N與Ni間有等值面產(chǎn)生,構(gòu)建體元時(shí)須細(xì)分鄰接節(jié)點(diǎn)節(jié)點(diǎn)Ni,提高分辨率,將Ni進(jìn)行標(biāo)記,同時(shí)對(duì)Ni與其鄰接節(jié)點(diǎn)執(zhí)行上述操作;若與鄰接節(jié)點(diǎn)Ni像素一致,則停止標(biāo)記。至此,N節(jié)點(diǎn)及其周?chē)粯?biāo)記節(jié)點(diǎn)即為構(gòu)建體元時(shí)須細(xì)分節(jié)點(diǎn)。

        圖4 局部擴(kuò)展示意圖

        標(biāo)記完成后,進(jìn)行體元構(gòu)建時(shí),若p(i,j,k)位于被標(biāo)記節(jié)點(diǎn)起始位置,即高分辨率節(jié)點(diǎn),則此節(jié)點(diǎn)在構(gòu)建體元時(shí)須細(xì)分,此時(shí)以模板分辨率為體元邊長(zhǎng)進(jìn)行體元頂點(diǎn)的搜索構(gòu)建體元,查找等值面,至節(jié)點(diǎn)結(jié)束位置。

        4.3.2 截面頂點(diǎn)坐標(biāo)及法線(xiàn)計(jì)算

        本文體元頂點(diǎn)只有孔隙和骨架兩種屬性,為了計(jì)算方便,截面頂點(diǎn)直接取所在邊中點(diǎn),同時(shí)法線(xiàn)即所在邊頂點(diǎn)法線(xiàn)均值,如式(11)所示,其中N(i1,j1,k1),N(i2,j2,k2)分別為截面頂點(diǎn)所在邊兩端頂點(diǎn)法向量。

        5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析

        為了檢驗(yàn)算法效果及時(shí)間、存儲(chǔ)上的性能,本文的實(shí)驗(yàn)在Windows10平臺(tái)進(jìn)行,機(jī)器配置為E5-1620CPU,16G內(nèi)存,NVIDIA Quadro K2000圖形顯卡,開(kāi)發(fā)工具有VS2015,OpenCV開(kāi)發(fā)庫(kù),OpenGL圖形庫(kù),使用的數(shù)據(jù)為吉林某油藏儲(chǔ)層巖心CT掃描切片,圖像分辨率為995×968,數(shù)量為60張。采用本文方生成的數(shù)字巖心效果如圖5、圖6所示。

        圖5 數(shù)字巖心模型

        圖6 局部多分辨率擴(kuò)展前后對(duì)比圖

        除了采用上述提出算法進(jìn)行實(shí)例建模,實(shí)驗(yàn)還采用普通方法以及傳統(tǒng)的八叉樹(shù)對(duì)相同數(shù)據(jù)進(jìn)行建模實(shí)驗(yàn),與本文方法性能對(duì)比如表1、圖7、圖8所示。

        圖7 不同模型內(nèi)存占用對(duì)比

        圖8 體素?cái)?shù)字巖心總生成時(shí)間對(duì)比

        表1 不同方法性能對(duì)比

        結(jié)果表明,與普通方式相比,采用八叉樹(shù)以及分層四叉樹(shù),生成多尺度模型,能夠使體素量減少95%以上。與八叉樹(shù)相比,本文的分層四叉樹(shù)模型存儲(chǔ)空間占用減少30%左右,同時(shí)縮短了數(shù)字巖心模型重建耗時(shí)。

        6 結(jié)語(yǔ)

        實(shí)驗(yàn)證明,本文采用的方法建立的多分辨率數(shù)字巖心模型能夠精確地模擬顯示真實(shí)巖心的空間特征,同時(shí)優(yōu)化了傳統(tǒng)建模方法存在的數(shù)據(jù)冗余,存儲(chǔ)空間消耗大,建模耗時(shí)等缺點(diǎn)。多尺度數(shù)字巖心模型通過(guò)分層四叉樹(shù)組織,利于后續(xù)模型的維護(hù)及擴(kuò)展等操作。

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