許 靜 高 琳 馬 磊 洪馬林 黃凈怡 趙 盼
乳腺癌是最常見的女性惡性腫瘤之一,占全部惡性腫瘤的12.2%。三陰性乳腺癌(triple negative breast cancer, TNBC)占乳腺浸潤性癌的15%~20%,發(fā)病年齡較輕,其惡性度高、侵襲性強(qiáng)、易早期轉(zhuǎn)移、預(yù)后差,在分子遺傳學(xué)、病理組織學(xué)及臨床特征方面與雌激素受體(estrogen receptor, ER)、孕激素受體(progesterone receptor, PR)及人類表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor-2, HER-2)陽性的乳腺癌相比存在顯著差異。有證據(jù)顯示,長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和微小RNA(microRNA,miRNA)等生物活性分子參與乳腺癌的發(fā)展過程,但目前在三陰性乳腺癌中未見報(bào)道。lncRNA是長度大于200個(gè)核苷酸的非編碼RNA,包括癌基因和抑癌基因,在腫瘤中存在差異性表達(dá),能夠通過調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖、凋亡及促進(jìn)血管新生,影響腫瘤的發(fā)生和轉(zhuǎn)移。小核RNA宿主基因17(small nucleolar RNA host gene 17,SNHG17)貯存于lncRNA和非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū),是蛋白質(zhì)合成機(jī)制中關(guān)鍵的組成部分,在消化系統(tǒng)結(jié)直腸癌的進(jìn)展和侵襲等方面起決定性作用。本研究旨在研究SNHG17在三陰性乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞系及癌組織中的表達(dá)情況,構(gòu)建SNHG17高表達(dá)細(xì)胞模型,探討對(duì)細(xì)胞增殖、克隆、遷移及侵襲等的影響,為探究三陰性乳腺癌新的診療靶標(biāo)提供研究基礎(chǔ)。
1.1 材料
1.1.1 組織來源 收集2018年1月至2019年12月深圳市人民醫(yī)院病理科經(jīng)手術(shù)切除并通過免疫組化驗(yàn)證均為ER/PR/HER-2陰性的三陰性乳腺癌組織標(biāo)本40例為研究對(duì)象,患者年齡35~56歲,平均(41.95±4.79)歲,患者術(shù)前均未接受放化療,同時(shí)將同一患者的癌旁組織標(biāo)本作為對(duì)照組,所有病例經(jīng)病理科主任醫(yī)師復(fù)核診斷結(jié)果。本研究由我院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn),患者簽署知情同意書。
1.1.2 細(xì)胞與試劑 人三陰性乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞系購于中國科學(xué)院上海細(xì)胞生物所;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)引物購于上海吉瑪公司;探針由上海生工有限公司構(gòu)建合成;提取總RNA試劑、Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑盒及qRT-PCR試劑盒均購自Invitrogen公司;胎牛血清及DMEM培養(yǎng)基購自HyClone公司;Transwell遷移小室購于德國Merck Millipore公司;Transwell侵襲小室購自美國康寧公司。
1.2 方法
1.2.1 SNHG17RNA原位雜交 將癌旁正常組織和癌組織經(jīng)4%多聚甲醛固定,組織經(jīng)脫水、包埋、制片。使用上海生物工程公司合成的地高辛標(biāo)記DNA探針,探針序列為(5’-3’):AGTCTCCCATGTCTGGACCCCGAATCTTG。在組織切片滴加100 μL DNA探針雜交液,37℃預(yù)雜交2 h,85℃變性5 min,冷卻,37℃雜交過夜。加入抗地高辛-抗血清堿性磷酸酶復(fù)合物(以抗體稀釋液1∶1 000稀釋),4℃孵育過夜,硝基四氮唑藍(lán)/5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸鹽(nitrotetrazolium blue/chloride5-bromo-4-chloro-3-indolyl phosphate,NBT/BCIP)避光顯色4 h。磷酸甘油封片,顯微鏡下觀察。堿性磷酸酶標(biāo)記的原位雜交(in situ hybridization,ISH)顯色藍(lán)紫色為陽性。結(jié)果判斷:于200倍光鏡下觀察計(jì)數(shù),ISH使用堿性磷酸酶標(biāo)記后顯色陽性為藍(lán)色。原位雜交的染色評(píng)分:每個(gè)樣本隨機(jī)選擇4~6張切片中10個(gè)視野,評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)按照,①密度評(píng)分。無為0分;弱為1分;中等為2分;強(qiáng)為3分;②比例評(píng)分。0%為0分,1%~25%為1分,26%~50%為2分,51%~5%為3分,76%~100%為4分。最后按照密度評(píng)分×比例評(píng)分計(jì)算染色評(píng)分。
1.2.2 構(gòu)建SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒 將pHBLV-CMV-MCS-EF1-Zsgreen1-T2A-puro質(zhì)粒作為空載體為陰性對(duì)照組,將SNHG17 DNA片段與pHBLV-CMV-MCS-EF1-Zsgreen1-T2A-puro質(zhì)粒連接,進(jìn)行基因重組。構(gòu)建SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒,并進(jìn)行一代測序驗(yàn)證質(zhì)粒(LV012-h-SNHG17)是否構(gòu)建成功。
1.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染 在含10%FBS的DMEM培養(yǎng)基中,于37℃、5%CO環(huán)境內(nèi),培養(yǎng)MDA-MB-231細(xì)胞,24孔板內(nèi)接種細(xì)胞數(shù)2×10個(gè)/孔,根據(jù)LipofectamineM 2000試劑盒說明書轉(zhuǎn)染LV012-h-SNHG17質(zhì)粒及pHBLV-CMV-MCS-EF1-Zsgreen1-T2A-puro質(zhì)粒到細(xì)胞中,6 h后換無血清培養(yǎng)基培養(yǎng)48 h,使用eppendorf 高速離心機(jī),800 g離心力,室溫離心3~5 min,收集細(xì)胞。
1.2.4 qRT-PCR實(shí)驗(yàn) MDA-MB-231細(xì)胞轉(zhuǎn)染LV012-h-SNHG17質(zhì)粒48 h后,按照TRIzol試劑盒提取各組細(xì)胞的總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA。hSNHG17引物序列:上游5’-TTCTCACCGTGAATCTCTTGG-3’,下游5’-AGATTGAACAGTGGATCCGG-3’。hβ-ACTIN引物序列:上游5’-ACCTTCTACAATGAGCTGCG-3’,下游5’-CCTGGATAGCAACGTACATGG-3’。按照qRT-PCR說明書進(jìn)行PCR反應(yīng),條件為:95℃預(yù)變性10 min,95℃ 35 s,62℃ 35 s,72℃ 5 min,連續(xù)40個(gè)循環(huán),每組均設(shè)置4個(gè)平行反應(yīng)復(fù)孔。分析qRT-PCR的擴(kuò)增及熔解曲線,計(jì)算目的基因的相對(duì)表達(dá)量=2。
1.2.5 CCK-8法檢測細(xì)胞增殖能力 設(shè)空白對(duì)照組、陰性對(duì)照組及SNHG17過表達(dá)組,陰性對(duì)照組MDA-MB-231細(xì)胞轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒,SNHG17過表達(dá)組MDA-MB-231細(xì)胞轉(zhuǎn)染SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒,每組5個(gè)復(fù)孔,37℃,5%CO培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),使用Lipofectamine 2000進(jìn)行轉(zhuǎn)染24 h后收集細(xì)胞,取每孔4×10個(gè)細(xì)胞接種于96孔板內(nèi)同時(shí)每孔加入10 μL CCK-8試劑,在12、24、48、72小時(shí)分別觀察MDA-MB-231細(xì)胞的增殖能力,用酶標(biāo)儀檢測450 nm的吸光度(A)值并記錄。
1.2.6 平板克隆形成 MDA-MB-231細(xì)胞分別轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒和SNHG17質(zhì)粒48 h后取各組細(xì)胞,離心后分別接種每孔3×10個(gè)細(xì)胞于6孔細(xì)胞板內(nèi),每組3個(gè)復(fù)孔,于37℃、5%CO培養(yǎng)14 d,每隔3 d更換培養(yǎng)液,觀察細(xì)胞克隆數(shù)量,以PBS洗滌細(xì)胞,4%甲醛15 min,加入0.1%結(jié)晶紫20 min,雙蒸水漂洗并干燥,鏡下計(jì)數(shù)>50個(gè)克隆并記錄,克隆形成率=(有效克隆數(shù)/接種細(xì)胞數(shù))×100%,重復(fù)實(shí)驗(yàn)3次。
1.2.7 Transwell細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn) 用0.25%胰蛋白酶消化轉(zhuǎn)染24 h后的各組MDA-MB-231細(xì)胞,每孔加入1×10個(gè)/400 μL細(xì)胞于DMEM無血清培養(yǎng)基中,把Transwell小室放入24孔板,Transwell小室上室中加入100 μL懸液,下室中加入500 μL 10% FBS DMEM,每組3個(gè)復(fù)孔,培養(yǎng)于37℃、5%CO環(huán)境中24 h。取出小室,PBS清洗2次,用棉棒擦去未遷移的上層細(xì)胞,使用4%多聚甲醛將遷移細(xì)胞固定30 min,滴加0.1%的結(jié)晶紫染液,PBS漂洗,干燥后,取5個(gè)高倍視野觀察并計(jì)數(shù),結(jié)晶紫染色細(xì)胞數(shù)即遷移細(xì)胞數(shù),實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次取平均數(shù)。
1.2.8 Transwell細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn) 把Matrigel基質(zhì)和DMEM培養(yǎng)液按1∶5比例混合,加于Transwell上室,制做人工基底膜,滴加DMEM培養(yǎng)液,37℃、5%CO濕度溫箱培養(yǎng),后續(xù)步驟按照細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn)操作,顯微鏡下計(jì)數(shù)遷移到小室底面的細(xì)胞,計(jì)數(shù)結(jié)晶紫染色細(xì)胞數(shù)(侵襲細(xì)胞數(shù)),實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次取平均數(shù)。
F
=31.103,P
<0.001)。見圖1。注:A為癌旁正常乳腺組織(原位雜交),B為乳腺癌組織(原位雜交);箭頭為SNHG17陽性表達(dá)。
2.2 成功構(gòu)建SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒 一代測序堿基序列完全匹配。見圖2。
注:A為陰性對(duì)照組過表達(dá)質(zhì)粒示意圖,B為SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒示意圖,C為一代測序圖譜。
2.3 qRT-PCR檢測 實(shí)驗(yàn)分3組,每組均設(shè)4個(gè)復(fù)孔,使用qRT-PCR方法分別檢測MDA-MB-231細(xì)胞轉(zhuǎn)染SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒和陰性對(duì)照組質(zhì)粒后,SNHG17 RNA的差異性表達(dá)情況。與陰性對(duì)照組和空白對(duì)照組相比,SNHG17過表達(dá)組的SNHG17的表達(dá)水平(23.394±3.469)較陰性對(duì)照組(1.000±0.000)和空白對(duì)照組(1.000±0.000)升高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F
=7.708,P
=0.008),空白對(duì)照組與陰性對(duì)照組相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
>0.05)。2.4 CCK-8檢測SNHG17過表達(dá)對(duì)MDA-MB-231細(xì)胞增殖的影響 各組細(xì)胞在加入CCK8試劑后第12、24、48和72小時(shí)分別測量吸光度值記錄,SNHG17過表達(dá)組、陰性對(duì)照組和空白對(duì)照組數(shù)據(jù)滿足球形假設(shè)檢驗(yàn)(P
=0.694),采用重復(fù)測量方差分析結(jié)果顯示,與陰性對(duì)照組和空白對(duì)照組相比,SNHG17過表達(dá)組的MDA-MB-231細(xì)胞增殖活性升高,兩組間比較MDA-MB-231細(xì)胞增殖活性差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
<0.05),空白對(duì)照組與陰性對(duì)照組比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
>0.05)。不同檢測時(shí)間之間MDA-MB-231細(xì)胞增殖活性差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
<0.05);組間與時(shí)間之間存在交互作用,組間差異隨時(shí)間變化而增加,且差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
<0.05)。見表1。表1 CCK8檢測不同時(shí)間各組MDA-MB-231細(xì)胞增殖情況
2.5 克隆形成率的情況比較 SNHG17過表達(dá)組MDA-MB-231細(xì)胞的克隆細(xì)胞數(shù)[(291.401±29.282)個(gè)]較陰性對(duì)照組的克隆細(xì)胞數(shù)[(22.601±2.701)個(gè)]和空白對(duì)照組的克隆細(xì)胞數(shù)[(20.402±2.913)個(gè)]增加,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F
=5.162,P
<0.001);空白對(duì)照組與陰性對(duì)照組相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
>0.05)。見圖3。注:A為空白對(duì)照組,B為陰性對(duì)照組,C為SNHG17過表達(dá)組。
2.6 SNHG17促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞遷移及侵襲 與陰性對(duì)照組和空白對(duì)照組比較,SNHG17過表達(dá)組MDA-MB-231細(xì)胞遷移和侵襲數(shù)目均增加,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
<0.001),空白對(duì)照組與陰性對(duì)照組相比,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
>0.05)。結(jié)晶紫染色細(xì)胞顯示紫色,見圖4和表2。注:A為陰性對(duì)照組細(xì)胞遷移情況,B為空白對(duì)照組細(xì)胞遷移情況,C為SNHG17過表達(dá)組細(xì)胞遷移情況,D為陰性對(duì)照組細(xì)胞侵襲情況,E為空白對(duì)照組細(xì)胞侵襲情況,F(xiàn)為SNHG17過表達(dá)組細(xì)胞侵襲情況。
表2 各組MDA-MB-231細(xì)胞遷移和侵襲數(shù)目比較
目前研究發(fā)現(xiàn)在基因組轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中l(wèi)ncRNA大約占98%,其中包括癌基因和抑癌基因,在不同腫瘤的發(fā)病過程中,對(duì)其下游基因發(fā)揮調(diào)控作用,lncRNA表達(dá)失調(diào)能夠調(diào)節(jié)腫瘤的發(fā)生和轉(zhuǎn)移,如HOTAIR、LINC00152、H19、HULC、GHET1、MALAT1和GACAT3等已被證實(shí)在三陰性乳腺癌中表達(dá)下調(diào),與患者不良預(yù)后密切相關(guān)。深入探索和開發(fā)可用的lncRNA生物標(biāo)志物對(duì)腫瘤患者的診斷及治療具有重要意義。
小核RNA(snoRNAs)貯存于lncRNA和非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)。研究表明,snoRNAs的宿主基因在調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)和腫瘤發(fā)生方面發(fā)揮關(guān)鍵作用,lncRNA SNHG17就是宿主基因中重要的一員,儲(chǔ)存于核內(nèi)20號(hào)染色體p12。一項(xiàng)研究提示,高表達(dá)SNHG17的胃癌患者60個(gè)月內(nèi)總生存期和無病生存期均降低。Zhang等研究表明,SNHG17通過對(duì)p15和p57進(jìn)行表觀遺傳沉默來促進(jìn)胃癌的進(jìn)展,在胃癌組織和細(xì)胞中表達(dá)上調(diào),SNHG17可促進(jìn)GC細(xì)胞增殖、侵襲、遷移,并抑制細(xì)胞凋亡,從而發(fā)揮癌基因作用。另有研究發(fā)現(xiàn),SNHG17能夠被STAT3誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),以促進(jìn)黑色素瘤細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,最終通過PI3K-AKT信號(hào)傳導(dǎo)促進(jìn)腫瘤的發(fā)展;同時(shí)基因擴(kuò)增驅(qū)動(dòng)的lncRNA SNHG17可促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌(non-small-cell carcinoma, NSCLC)細(xì)胞的增殖活性和遷移能力,表明其作為NSCLC中生物標(biāo)志物的潛在價(jià)值。
本研究通過對(duì)40例三陰性乳腺癌患者腫瘤組織進(jìn)行堿性磷酸酶標(biāo)記的原位雜交檢測發(fā)現(xiàn),SNHG17在三陰性乳腺癌組織中的表達(dá)水平明顯高于癌旁正常組織。將SNHG17 DNA片段與pHBLV-CMV-MCS-EF1-Zsgreen1-T2A-puro質(zhì)粒連接,構(gòu)建SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒模型,并進(jìn)行一代測序驗(yàn)證堿基序列完全匹配,質(zhì)粒構(gòu)建成功。通過轉(zhuǎn)染SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒于MDA-MB-231細(xì)胞內(nèi),并進(jìn)行qRT-PCR檢測,發(fā)現(xiàn)SNHG17過表達(dá)組與對(duì)照組相比,細(xì)胞中SNHG17RNA的表達(dá)量升高。利用CCK8細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)并經(jīng)重復(fù)測量資料的方差分析得出,轉(zhuǎn)染SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒組MDA-MB-231細(xì)胞增殖活性較陰性對(duì)照組和空白對(duì)照組都有顯著升高。平板克隆形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果也表明SNHG17過表達(dá)后,克隆細(xì)胞數(shù)較對(duì)照組明顯增加。上述實(shí)驗(yàn)表明,SNHG17在三陰性乳腺癌細(xì)胞增殖中發(fā)揮促進(jìn)作用。Shao等的研究報(bào)道顯示,lncRNA可以與miRNA形成分子海綿,競爭結(jié)合靶基因而發(fā)揮作用。通過調(diào)控miRNA的表達(dá),使miRNA與其下游靶基因的結(jié)合受到干擾,從而使可能的靶基因得到表達(dá),相當(dāng)于發(fā)揮了“競爭性內(nèi)源RNA”的作用。同時(shí)本研究發(fā)現(xiàn),將IncRNA SNHG17過表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞后,進(jìn)行Transwell細(xì)胞遷移和侵襲實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示SNHG17過表達(dá)組MDA-MB-231細(xì)胞遷移和侵襲數(shù)目較陰性對(duì)照組和空白對(duì)照組增加,表明SNHG17在乳腺癌中發(fā)揮癌基因的作用。因此需要進(jìn)一步通過生物信息學(xué)技術(shù),推測SNHG17與miRNA互補(bǔ)的結(jié)合位點(diǎn),從而探討其下游靶基因的調(diào)控作用。
綜上所述,SNHG17在三陰性乳腺癌組織和MDA-MB-231細(xì)胞系中高表達(dá),并可促進(jìn)腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,SNHG17所涉及的分子信號(hào)通路有待進(jìn)一步探討。