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        長鏈非編碼RNA HIF1A-AS1的研究現(xiàn)狀與進展

        2021-11-29 13:52:25林瑋鍵龍永福
        關(guān)鍵詞:研究

        肖 寧 ,林瑋鍵,龍永福

        (1.桂林醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院泌尿外科,廣西 桂林 541199;2.邵陽市中心醫(yī)院尿控學(xué)研究室,湖南 邵陽 422000)

        隨著高通量檢測方法的快速發(fā)展,大量非編碼RNA被發(fā)現(xiàn),其中70%的非編碼RNA被認(rèn)為是長鏈非編碼RNA(LncRNAs),其表達(dá)水平較低,但是與眾多生理功能相關(guān)[1]。雖然LncRNAs不編碼蛋白質(zhì),但LncRNAs在許多疾病發(fā)生和進展的生物過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。LncRNAHIF1A-AS1是一種自然反義RNA,位于人14號染色體低氧誘導(dǎo)因子-1α(HIF-1α)的反義鏈上,其成熟體長度為652 nt,它與其相應(yīng)正義RNA的部分序列存在互補關(guān)系,可能通過多種機制發(fā)揮調(diào)控正義RNA的表達(dá)[2]。近年來,越來越多的研究提示HIF1A-AS1不僅參與惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程,而且與一些器官組織的纖維化相關(guān),有望成為相關(guān)治療的新靶點。本研究現(xiàn)就LncRNA HIF1A-AS1的研究現(xiàn)狀與進展進行綜述。

        1 LncRNAs的定義和生物學(xué)功能

        隨著各項研究的深入,發(fā)現(xiàn)LncRNAs參與了細(xì)胞分化和生長,包括癌癥在內(nèi)的許多疾病的發(fā)病過程。根據(jù)LncRNAs與蛋白質(zhì)編碼基因在基因組中的相對位置,可分為正義LncRNA、反義LncRNA、雙向LncRNA、內(nèi)含子LncRNA、基因間LncRNA及增強子LncRNA[3]。目前為止,已發(fā)現(xiàn)LncRNAs在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因表達(dá)方面發(fā)揮重要作用。首先,LncRNAs通過染色質(zhì)修飾與重塑、組蛋白修飾及核小體定位改變在基因表達(dá)調(diào)控中起著至關(guān)重要的作用,在調(diào)節(jié)染色體重塑的機制中,SWI/SNF復(fù)合物是由多個亞基組成的染色體重組復(fù)合物,該復(fù)合物能驅(qū)動核小體定位的改變,LncRNAs可以與SWI/SNF復(fù)合物相互作用,改變?nèi)旧w結(jié)構(gòu),調(diào)節(jié)基因表達(dá);此外,LncRNAs還通過影響S-腺苷同型半胱氨酸水解酶的DNA甲基化、生長停滯、DNA損傷誘導(dǎo)的α-DNA去甲基化DNA損傷誘導(dǎo)基因45A(GADD45A)以及組蛋白與去乙?;?(SIRT6)的乙?;瘉碚{(diào)節(jié)染色質(zhì)的重塑。許多LncRNA通過與多硫抑制復(fù)合物2(PRC2)相互作用來調(diào)節(jié)組蛋白甲基化,從而改變?nèi)旧w的結(jié)構(gòu)和功能[4]。

        2 HIF1A-AS1的發(fā)現(xiàn)過程

        ZHU等[5]在腎非乳頭狀細(xì)胞癌中發(fā)現(xiàn)缺氧誘導(dǎo)因子-1α-反義鏈1(HIF1A-AS1)較癌旁組織明顯升高,通過逆轉(zhuǎn)錄-多聚酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)發(fā)現(xiàn)其編碼與HIF-1α信使3'-非編碼區(qū)(3′ UTR)在正常和低氧環(huán)境中的腎癌細(xì)胞系腎細(xì)胞癌22(RCC22)中均處于高表達(dá)狀態(tài),逐漸降低氧濃度也難以顯著提高其在RCC22中的表達(dá),但是其在淋巴細(xì)胞系、肝癌細(xì)胞系及卵巢癌細(xì)胞系的表達(dá)存在差異。在正常成人組織中存在HIF1A-AS1表達(dá),且胎兒表達(dá)更高,同時,在齲齒動物中也發(fā)現(xiàn)不同組織中(比目魚肌、心臟、大腦)HIF1A-AS1的不同表達(dá),由于其在哺乳動物轉(zhuǎn)錄的保守性,提示HIF1A-AS1在不同生理和病理發(fā)展過程中發(fā)揮著重要作用[6]。但僅提示HIF1A-AS1在腎癌組織與部分胚胎組織的表達(dá)異常,對于其功能的研究尚不充分。

        3 HIF1A-AS1與其正義RNAHIF-1α

        HIF1A-AS1與其正義RNAHIF-1α之間可能也存在相關(guān)調(diào)控,在正常胎兒和成人組織中的HIF1A-AS1中發(fā)現(xiàn)一些低氧反應(yīng)元件,可以誘導(dǎo)其低氧時表達(dá)升高,可能促進HIF-1α的降解;因此,HIF1A-AS1/HIF-1α在正常情況下可能是一個負(fù)反饋通路[7]。ACYA等[8]分別利用在氧應(yīng)激(2% H2O2)及正常環(huán)境下單獨培養(yǎng)心臟內(nèi)皮細(xì)胞(ECs)、聯(lián)合培養(yǎng)ECs和心肌細(xì)胞(CMs)所產(chǎn)生的培養(yǎng)基質(zhì),觀察CMs在不同培養(yǎng)基質(zhì)和不同氧應(yīng)激環(huán)境下的生存率和相關(guān)因子變化,模擬心肌缺血再灌注損傷后CMs的相關(guān)保護機制。他們發(fā)現(xiàn)HIF-1α是氧應(yīng)激下ECs對CMs的保護因子,而HIF1A-AS1卻呈現(xiàn)出相反效應(yīng),但是該效應(yīng)可以被ECs和CMs共同培養(yǎng)的相互作用所抵消,因此,HIF1A-AS1可能是HIF-1α在氧應(yīng)激下的一種調(diào)控方式,但是具體機制并未明確。GONG等[9]研究HIF-1α在牙周膜成纖維細(xì)胞(PDLCs)中對成骨分化的作用,發(fā)現(xiàn)HIF-1α、HIF1A-AS1及缺氧誘導(dǎo)因子-1α-反義鏈2(HIF1A-AS2)在低氧(2% O2)環(huán)境高表達(dá),而通過小分子RNA干擾(siRNA)抑制HIF-1α可下調(diào)HIF1A-AS1和HIF1A-AS2在牙周膜細(xì)胞(PDLCs)的表達(dá),但是只有抑制HIF1AAS2才能增加HIF-1α的表達(dá),提示在PDLCs中HIF-1α可以正性調(diào)控HIF1A-AS1和HIF1A-AS2,只有HIF1AAS2對HIF-1α有負(fù)反饋調(diào)控。

        4 HIF1A-AS1在各種疾病中的相關(guān)研究進展

        4.1 HIF1A-AS1與腫瘤疾病近年來,隨著LncRNAs作為潛在的非侵入性腫瘤檢測生物標(biāo)志物研究的不斷深入,發(fā)現(xiàn)LncRNAs對預(yù)測腫瘤患者復(fù)發(fā)具有一定的價值,相關(guān)研究表明HIF1A-AS1與多種腫瘤的臨床分期與預(yù)后相關(guān)[10]。高表達(dá)HIF1A-AS1的副神經(jīng)節(jié)瘤患者術(shù)后轉(zhuǎn)移率更高,其可能作為患者術(shù)后效果的預(yù)測指標(biāo)。CAYER等[11]檢測非轉(zhuǎn)移乳腺癌患者的HIF-1α、HIF1A-AS1及sHIF-1α的表達(dá),發(fā)現(xiàn)HIF1A-AS1作為預(yù)后指標(biāo)比HIF-1α更好,HIF1A-AS1可能在轉(zhuǎn)錄后水平負(fù)性調(diào)控HIF-1αmRNA,但是sHIF-1α表達(dá)卻隨HIF1A-AS1的增加而升高。TANTAI等[12]發(fā)現(xiàn)32例非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者中癌組織和血液的HIF1A-AS1和另一種長鏈非編碼核糖核酸X染色體失活特異性轉(zhuǎn)錄本基因(LncRNAXIST)都呈高表達(dá),治療后兩者表達(dá)均顯著降低,HIF1A-AS1的ROC曲線下面積(AUC)為0.876,XIST為0.834,兩者結(jié)合為0.931,提示HIF1A-AS1為NSCLC有價值的預(yù)測指標(biāo)。QING等[13]對比151名結(jié)直腸癌(CRC)患者和160名健康對照組,發(fā)現(xiàn)CRC患者血清中HIF1A-AS1表達(dá)明顯升高,其鑒別CRC的ROC曲線下AUC為0.96,其表達(dá)升高患者5年生存率僅為32.89%,而表達(dá)降低者為76.00%,通Kaplan-Meier和多因素Cox回歸分析均提示HIF1A-AS1是CRC患者有效的預(yù)后指標(biāo)。

        QIU等[14]學(xué)者發(fā)現(xiàn)40例卵巢癌(EOC)組織中HIF1A-AS1的mRNA較28例對照組表達(dá)增加,其中28例晚期EOC的表達(dá)較12例早期EOC更高;低氧環(huán)境(1% O2)培養(yǎng)EOC細(xì)胞系SKOV3和HO89,細(xì)胞中HIF1A-AS1表達(dá)增加,在培養(yǎng)2 h后最為明顯,然后逐漸降低;通過慢病毒抑制HIF1A-AS1表達(dá),可以通過下調(diào)Bcl-2,上調(diào)Bax、含半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶7(Caspase-7)和含半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶9(Caspase-9)在低氧環(huán)境下促進細(xì)胞凋亡和抑制增殖,在小鼠SKOV3細(xì)胞移植瘤上也證實了HIF1A-AS1的促癌效應(yīng)。口腔黏膜下纖維化(OSF)是口腔癌前病變,WANG等[15]發(fā)現(xiàn)口腔癌患者的HIF1A-AS1mRNA表達(dá)較正常者增高,檳榔堿可以導(dǎo)致HIF1A-AS1在BMFs的表達(dá)升高,通過PLV-RNAi下調(diào)HIF1A-AS1表達(dá),可以抑制由于檳榔堿誘導(dǎo)的BMFs的轉(zhuǎn)移能力增強,可能抑制其向fBMFs的轉(zhuǎn)化。提示HIF1A-AS1參與多種惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程,與許多促腫瘤因子存在相關(guān)調(diào)控,是潛在的預(yù)后指標(biāo)和治療靶點,有望成為潛在的診斷和評估預(yù)后的新的分子標(biāo)志物,對臨床診斷和治療存在一定的實用價值,但是對于具體分子通路、功能學(xué)研究以及臨床應(yīng)用研究尚有欠缺。

        4.2 HIF1A-AS1與非腫瘤疾病在以往的研究中發(fā)現(xiàn)HIF1A-AS1參與肝纖維化、動脈瘤和粥樣硬化形成機制,以及與心肌缺血再灌注保護等方面有關(guān)。ZHAO等[16]發(fā)現(xiàn)在胸腹主動脈瘤(TAA)患者血清中HIF1AAS1表達(dá)較正常者增高6倍,通過siRNA抑制HIF1AAS1可以通過增加Bcl-2和抑制含半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶3(Caspase-3)、含半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶8(Caspase-8)的表達(dá)逆轉(zhuǎn)棕櫚酸誘導(dǎo)的血管平滑肌細(xì)胞(VSMCs)凋亡。而在顱內(nèi)血管瘤(ICA)中,發(fā)現(xiàn)ICA患者血液中HIF1A-AS1表達(dá)高于正常對照組,其診斷ICA的ROC曲線下AUC為0.880,可以通過上調(diào)轉(zhuǎn)化生長因子-β(TGF-β)抑制VSMCs增殖,從而參與ICA的發(fā)生。

        肝星狀細(xì)胞(HSGs)在肝纖維化中起著關(guān)鍵作用,通過siRNA抑制HIF1A-AS1可以促進HSGs增殖和抑制其凋亡。此外,在與肝纖維化和慢性肝功能衰竭相關(guān)的Kupffer細(xì)胞(KCs)中,相關(guān)研究發(fā)現(xiàn)下調(diào)HIF1A-AS1可明顯抑制由腫瘤壞死因子-α(TNF-α)所致的KCs凋亡[17]。研究發(fā)現(xiàn)在65名粥樣硬化(AS)患者血漿中HIF1A-AS1表達(dá)高于68名健康者,與目前常見的AS外泌體標(biāo)記物CD9、CD63及TSG101相關(guān)性高(r = 0.875,均P<0.05),其診斷AS的ROC曲線下AUC為0.823,認(rèn)為HIF1A-AS1是AS的潛在生物標(biāo)記物[18]。XUE等[19]構(gòu)建大鼠心肌缺血再灌注模式,發(fā)現(xiàn)HIF1A-AS1可以作為內(nèi)源競爭RNA(ceRNA)結(jié)合miRNA-204,因此抑制HIF1A-AS1可以通過促進miRNA-204和抑制SOCS2表達(dá),減輕心肌缺血再灌注后心室重構(gòu),保護心肌功能。HIF1A-AS1參與器官組織纖維化的具體機制并未明確,多種促纖維化因子參與其中,深入研究HIF1A-AS1與纖維化疾病發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系,有助于纖維化疾病的早期診斷、預(yù)后分析與靶向治療。

        5 小結(jié)

        利用測序技術(shù)研究LncRNAs在疾病診斷、治療及預(yù)后中的作用引起人們的高度重視。LncRNAs可能主要通過其異常表達(dá)導(dǎo)致疾病發(fā)生,并可能與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及轉(zhuǎn)移有關(guān),從而增加癌癥相關(guān)疾病的死亡率。HIF1A-AS1不僅參與血管與臟器纖維化進程,還在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用,但是相較其他非編碼RNA的研究而言卻顯薄弱,其功能和相關(guān)通路仍未明晰。隨著生物信息學(xué)分析、RNApulldown、RNAEMSA、RNARIP及CHIP等技術(shù)成熟,HIF1A-AS1與相關(guān)RNA、DNA及蛋白的相互作用機制愈加清晰,將有助于HIF1A-AS1在腫瘤與纖維化疾病的相關(guān)通路及功能調(diào)控研究,明確其在相關(guān)疾病中的具體作用,使其有望成為新的診斷、預(yù)后指標(biāo)及治療靶點,為疾病的診斷、治療及預(yù)后評估提供新方向。

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