馬艷珍,吳芙蓉,張家富,凡 暢,黃少鵬,陳 森,姜 輝
1 安徽中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院 臨床研究實(shí)驗(yàn)中心,合肥 230031;2 中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)附屬第一醫(yī)院 藥劑科,合肥 230001
N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是發(fā)生在RNA腺嘌呤(A)堿基第6位氮原子上的甲基化,主要由甲基轉(zhuǎn)移酶(Writers)、去甲基化酶(Erasers)和相關(guān)結(jié)合蛋白(Readers)共同調(diào)控,參與RNA轉(zhuǎn)錄、剪接、加工、翻譯和衰變等多種生物學(xué)過(guò)程[1-3]。肝臟是調(diào)控機(jī)體新陳代謝的主要器官,m6A甲基化參與肝臟疾病的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程(圖1)。本文現(xiàn)簡(jiǎn)要綜述m6A甲基化在肝臟生理以及病理中的作用進(jìn)展情況。
注:NAFLD,非酒精性脂肪性肝??;HCC,肝細(xì)胞癌。
m6A甲基化是由Writers、Erasers和Readers所催化的一個(gè)動(dòng)態(tài)可逆過(guò)程。Writers主要包括甲基轉(zhuǎn)移酶樣3/14(methyltransferase-like 3/14,METTL3/14)、Wilms腫瘤相關(guān)蛋白(Wilms tumor 1-associating protein,WTAP)、和RNA結(jié)合基序蛋白15/15B(RNA binding motif protein 15/15B,RBM15/15B)等。WTAP與METTL3和METTL14的相互作用,是m6A甲基轉(zhuǎn)移酶催化過(guò)程中所需要的一個(gè)重要環(huán)節(jié)[4]。Erasers主要包括肥胖相關(guān)蛋白(Fat mass and obesity-associated protein,F(xiàn)TO)和ALKB同源蛋白5(Alkb homolog 5,ALKBH5)等[5]。FTO是首個(gè)被發(fā)現(xiàn)的去甲基化酶,并在體內(nèi)和體外都能去除m6A甲基化修飾[6]。m6A甲基化與去甲基化修飾后,需通過(guò)Readers的識(shí)別來(lái)使m6A發(fā)揮多樣的生物學(xué)功能,已知的Readers是YT521-B同源域(YT521-B homology,YTH)家族成員,主要分為m6A結(jié)合蛋白(YTH N6-methyladenosine RNA binding proteins,YTHDFs),如YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3等和含YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(YTH domain containing proteins,YTHDCs),如YTHDC1、YTHDC2等[7]。
m6A的動(dòng)態(tài)修飾在肝臟中具有組織特異性,與肝臟生長(zhǎng)發(fā)育密切相關(guān)。He等[8]對(duì)豬肝臟的新生期(0 d)、哺乳期(21 d)和成年期(2歲)三個(gè)發(fā)育階段所有m6A持續(xù)修飾的基因進(jìn)行功能富集分析發(fā)現(xiàn),m6A甲基化水平與基因表達(dá)之間呈負(fù)相關(guān)。
肝細(xì)胞色素P450(CYP450)在肝臟藥物代謝中起著重要作用。最近一項(xiàng)研究[9]發(fā)現(xiàn),m6A甲基化影響CYP450的表達(dá),敲低METTL3/14后肝細(xì)胞色素P4502C8(CYP2C8)表達(dá)上調(diào),敲低FTO后CYP2C8表達(dá)下調(diào)。另有報(bào)道[10],阿克曼菌和植物乳桿菌可影響單基因相關(guān)小鼠肝臟中特定的m6A甲基化,從而調(diào)控肝臟中脂質(zhì)、氨基酸代謝和胰島素信號(hào)傳導(dǎo)。
m6A甲基化在肝臟晝夜節(jié)律調(diào)節(jié)中發(fā)揮著獨(dú)特作用。有研究[11]表明,m6A甲基化參與了小鼠肝臟晝夜節(jié)律的調(diào)節(jié),METTL3耗竭抑制了RNA加工效率,導(dǎo)致晝夜節(jié)律周期延長(zhǎng)。然而,還需要進(jìn)一步的證據(jù)來(lái)支持晝夜節(jié)律是否可通過(guò)m6A甲基化介導(dǎo)肝臟生長(zhǎng)。
HBV是一種DNA病毒,研究表明HBV RNA中的m6A甲基化在病毒生命周期中起著雙重調(diào)節(jié)作用。敲除METTL3或METTL14可減少前基因組RNA(pregenomic RNA,pgRNA)的逆轉(zhuǎn)錄,但導(dǎo)致乙型肝炎核心蛋白(HBc)和HBV S蛋白(HBs)的上調(diào),同時(shí)YTHDF2或YTHDF3的敲除也顯著增加了HBs和HBc的表達(dá),表明m6A甲基化正向調(diào)節(jié)逆轉(zhuǎn)錄,負(fù)向調(diào)節(jié)HBV mRNA的穩(wěn)定性,導(dǎo)致病毒蛋白表達(dá)減少[12]。最新研究[13]發(fā)現(xiàn),HBV X蛋白(HBx)是一種在病毒轉(zhuǎn)錄和復(fù)制中起重要作用的調(diào)節(jié)蛋白,HBx與METTL3/14相互作用,在HBV感染過(guò)程中促進(jìn)了HBV cDNA和張力蛋白同源物染色體位點(diǎn)的招募。
HCV屬于黃病毒科的一種RNA病毒,是肝硬化和慢性肝炎的主要危險(xiǎn)因素。研究[14]表明,敲除METTL3和METTL14可在不影響病毒RNA復(fù)制的情況下,促進(jìn)病毒顆粒的產(chǎn)生,從而增加HCV的感染率;敲除FTO效果則相反,且YTHDF蛋白可重新定位到脂質(zhì)滴上,減少HCV病毒顆粒的產(chǎn)生。有趣的是,HCV RNA中的m6A甲基化可抑制或逃避維甲酸誘導(dǎo)基因1引起的天然免疫刺激[15]。此外,病毒感染期間激活的細(xì)胞信號(hào)通路,可通過(guò)改變m6A甲基化來(lái)調(diào)控病毒感染過(guò)程[16]。這些研究為m6A甲基化調(diào)控病毒生命周期提供了強(qiáng)有力的證據(jù)。
m6A甲基化在病毒性肝炎治療方面發(fā)揮著重要作用。最新研究[17]表明,HBx可上調(diào)METTL3的表達(dá),從而增加circ-ARL3的m6A甲基化;circ-ARL3基因敲除可抑制HBV和HCC的增殖和侵襲,靶向circ-ARL3/微核糖核酸(miR-126)軸可能是一種有前景的HBV治療方法。另有研究[18]表明,m6A甲基化和YTHDC2可通過(guò)與La抗原和其他因素相互作用來(lái)協(xié)助HCV內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)依賴的翻譯啟動(dòng),從而為干預(yù)感染過(guò)程提供了替代的治療途徑。目前的研究表明,m6A甲基化對(duì)HBV/HCV感染有負(fù)面調(diào)節(jié)作用,但對(duì)其他肝炎病毒的調(diào)控作用有待進(jìn)一步闡明。
NAFLD的特征是在沒(méi)有大量飲酒或其他已知肝病病史的情況下發(fā)生的肝脂肪變性[19]。有研究表明,F(xiàn)TO可通過(guò)抑制Wnt/β-連環(huán)蛋白信號(hào)通路,進(jìn)而影響豬肌內(nèi)前脂肪細(xì)胞的增殖和分化[20],F(xiàn)TO還可下調(diào)人肝癌細(xì)胞HepG2中m6A水平,降低線粒體含量并增加甘油三酯沉積,這為早期預(yù)防NAFLD的發(fā)展提供了新的思路[21]。另外,Runt相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子1(Runt-related transcription factor 1,RUNX1T1)能促進(jìn)脂肪細(xì)胞增殖,F(xiàn)TO可通過(guò)增強(qiáng)RUNX1T1的表達(dá)來(lái)介導(dǎo)脂肪生成[22]。Wu等[23]證實(shí)敲除FTO可延長(zhǎng)脂肪細(xì)胞分化早期的細(xì)胞周期進(jìn)程,從而抑制脂肪形成。此外,過(guò)表達(dá)FTO可增加脂肪細(xì)胞的脂質(zhì)積累并降低m6A甲基化的表達(dá)水平,過(guò)表達(dá)METTL3可抑制脂質(zhì)積聚并增加m6A甲基化水平[24],且METTL3也可利用脂肪酸合成酶m6A甲基化抑制肝臟胰島素敏感性,促進(jìn)脂肪酸代謝[25]。綜上所述,F(xiàn)TO在肝細(xì)胞脂肪代謝中起著至關(guān)重要的作用,可能是NAFLD的一個(gè)有前景的治療靶點(diǎn)。
m6A甲基化在NAFLD的治療方面起著重要作用。Chen等[26]研究證實(shí),青春期補(bǔ)充甲基供體甜菜堿可通過(guò)m6A依賴和YTHDF2介導(dǎo)的方式調(diào)節(jié)細(xì)胞周期來(lái)控制脂肪的形成。另外,甜菜堿還可糾正高脂飲食誘導(dǎo)的m6A低甲基化和高FTO表達(dá),這是由于甜菜堿對(duì)受損的脂肪組織功能起到了保護(hù)作用[27]。另有研究[28]表明,姜黃素可通過(guò)增加m6A甲基化水平,減輕脂多糖誘導(dǎo)的肝損傷和肝脂質(zhì)代謝紊亂。
肝纖維化是在病毒或各種損傷的持續(xù)作用下,肝臟發(fā)生的慢性炎癥和可逆修復(fù)反應(yīng),最終可發(fā)展為肝硬化、HCC[29]。研究[30]表明,在肝纖維化發(fā)展過(guò)程中,差異m6A甲基化主要富集于氧化應(yīng)激和細(xì)胞色素代謝相關(guān)環(huán)節(jié),而在肝纖維化逆轉(zhuǎn)過(guò)程中,差異m6A甲基化主要富集于免疫應(yīng)答和凋亡相關(guān)環(huán)節(jié)。
在肝纖維化治療方面,m6A甲基化也有重要作用。有研究[31]發(fā)現(xiàn),下調(diào)酸敏離子通道1a的表達(dá)后,METTL3依賴的m6A修飾水平和miR-350表達(dá)水平均降低,miR-350靶向芽胞受體酪氨酸激酶信號(hào)拮抗劑2,并進(jìn)一步降低磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B和細(xì)胞外調(diào)蛋白激酶通路相關(guān)蛋白的表達(dá),減輕肝纖維化程度。盡管如此,還需要更多的研究來(lái)確定m6A甲基化在肝纖維化中的調(diào)控作用及作用機(jī)制。
HCC是全球第四大致死腫瘤,嚴(yán)重威脅到人類的健康與壽命[32]。研究[33]表明,在體內(nèi),敲除METTL3可顯著抑制HCC的成瘤性;在體外,敲除METTL3可明顯降低HCC的增殖、遷移和集落形成。最近研究[34]發(fā)現(xiàn),METTL14通過(guò)調(diào)節(jié)前體miR-126來(lái)抑制HCC的轉(zhuǎn)移,敲除METTL14顯著增加了HCC的遷移和侵襲力,這表明METTL14的過(guò)表達(dá),具有抑制腫瘤轉(zhuǎn)移的能力。另外,miR-145通過(guò)靶向HCC中YTHDF2 mRNA 的3′-UTR來(lái)調(diào)控m6A水平,抑制HCC的增殖[35]。Li等[36]發(fā)現(xiàn)FTO通過(guò)介導(dǎo)M2型丙酮酸激酶去甲基化促進(jìn)HCC的發(fā)生發(fā)展,F(xiàn)TO敲除可上調(diào)m6A水平,從而阻止HCC的疾病進(jìn)程。最新一項(xiàng)研究[37]表明,ALKBH5作為一種腫瘤抑制因子,能通過(guò)m6A依賴性的方式降低HCC中LY6/PLAUR結(jié)構(gòu)域包含體1的表達(dá)。總而言之,m6A甲基化修飾的甲基化酶、去甲基化酶、結(jié)合蛋白都能通過(guò)調(diào)控相關(guān)因子參與HCC的發(fā)展過(guò)程。
m6A甲基化的調(diào)控蛋白在HCC治療方面存在很多潛在靶點(diǎn)。研究[38]表明,m6A 甲基化水平與HCC的預(yù)后密切相關(guān),YTHDF2、YTHDF1、METTL3和KIAA1429可能是HCC的潛在預(yù)測(cè)因子和治療靶標(biāo)。有研究[39]表明,敲除METTL3可降低轉(zhuǎn)錄因子叉頭蛋白3 mRNA的穩(wěn)定作用,從而增強(qiáng)HCC對(duì)索拉非尼的耐藥性,表明FOXO3是m6A甲基化在治療HCC中的重要靶標(biāo)。
作為肝臟病理過(guò)程中的重要因素,m6A甲基化在肝臟疾病中的生物學(xué)作用研究逐漸為學(xué)者所重視。然而,現(xiàn)在的研究大部分集中于m6A在HCC發(fā)病中的作用,對(duì)于調(diào)控其他肝臟疾病比如酒精性脂肪肝、肝硬化等的機(jī)制還不完全了解;并且大多數(shù)關(guān)于m6A在HCC中的研究都是在體外進(jìn)行,缺乏臨床相關(guān)證據(jù)。然而,隨著相關(guān)領(lǐng)域不斷深入研究,m6A甲基化對(duì)肝臟疾病的調(diào)控作用研究將會(huì)更加系統(tǒng)、深入,并將在各種肝臟疾病的診療中發(fā)揮重要作用。
利益沖突聲明:所有作者均聲明不存在利益沖突。
作者貢獻(xiàn)聲明:馬艷珍負(fù)責(zé)文獻(xiàn)收集及論文撰寫;吳芙蓉、凡暢、黃少鵬、陳森參與文獻(xiàn)的收集、篩選和整理工作;張家富負(fù)責(zé)論文的修改與校正;姜輝負(fù)責(zé)擬定寫作思路,指導(dǎo)撰寫文章并最后定稿。