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        長鏈非編碼RNA 作為川楝子急性肝毒性血清生物標(biāo)志物的研究

        2021-11-18 07:34:08季莉莉
        關(guān)鍵詞:川楝子毒性標(biāo)志物

        楊 睿,李 萍,張 偉,李 函,楊 凡,陸 賓,季莉莉*

        (1. 上海市浦東新區(qū)光明中醫(yī)醫(yī)院,上海 201399;2. 上海市浦東新區(qū)衛(wèi)生健康委員會監(jiān)督所,上海200135;3. 上海中醫(yī)藥大學(xué) 中藥研究所 中藥標(biāo)準(zhǔn)化教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中藥新資源與質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)綜合評價(jià)

        國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室,上海市復(fù)方中藥重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 201203)

        川楝子是臨床常用中藥,能舒肝瀉熱、行氣止痛、殺蟲,有小毒[1]。實(shí)驗(yàn)室前期研究參考川楝子臨床用法和用量,建立了肝毒性小鼠模型,并證實(shí)川楝子可以誘導(dǎo)顯著的急性肝毒性,其所含的川楝素(TSN)是主要的肝毒性成分[2-3]。但是目前川楝子肝毒性的機(jī)制尚不清楚,也并未尋找到可以快速、靈敏的檢測其肝毒性的生物標(biāo)志物。長鏈非編碼RNA(LncRNA)是一種長度大于200 核苷酸的內(nèi)源性非編碼RNA??焖佟⒏咄康?LncRNA 芯片檢測技術(shù)的發(fā)展,為它作為肝毒性生物標(biāo)志物提供了可能。本研究基于LncRNA,使用動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、基因芯片、RT-PCR、受試者工作特征曲線(Receiver operating characteristic curve,ROC)分析等方法,在川楝素給藥后小鼠血清中尋找表達(dá)差異明顯的可以指征中藥急性肝毒性的生物標(biāo)志物,以期為中藥肝毒性的研究打開新的思路,為中藥臨床安全使用提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 動(dòng)物

        SPF 級C57BL/6 小鼠,雄性,體質(zhì)量為18 ~ 20 g,購自上海斯萊克實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限責(zé)任公司,飼養(yǎng)于上海中醫(yī)藥大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物研究中心,飼養(yǎng)溫度:(22 ± 1) ℃,相對濕度:(65 ± 10)%,照明時(shí)間每天12 h。

        1.2 藥物、試劑與儀器

        TSN(川楝素,上海純優(yōu)生物科技有限公司,稱取其粉末用10%PG 溶液充分溶解后,配制成1 mg/mL 的溶液);PG(丙二醇,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);氯化鈉(國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);ALT 與AST 試劑盒(南京建成生物工程研究所);TRIzol(Invitrogen,美國Thermo 公司);異丙醇(國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司);SuperScriptTM III Reverse Transcriptase(Invitrogen,美國Thermo 公司);5× RT 緩沖液(Invitrogen,美國Thermo 公司);引物(上海英駿生物技術(shù)有限公司);2 × PCR master mix(美國Arraystar 公司);NanoDrop 2000(美國Thermo 公司)、Gene Amp PCR System 9700(Applied Biosystems,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)、ViiA 7 Realtime PCR System(Applied Biosystems,美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)等。

        1.3 動(dòng)物分組與處理

        空白對照組10 只;溶媒對照組(10% PG)10 只;TSN 6 h(10 mg/kg) 10 只;TSN 12 h(10 mg/kg)10只。待動(dòng)物體質(zhì)量在20 g 左右,給藥前禁食不禁水12 h,每隔6 h 給藥TSN 一次,總共兩次。灌胃給藥,0.1 mL/10 g。溶媒對照組給予相同體積的10%PG 溶液。于末次給藥12 h 后,禁食不禁水。12 h 后摘眼球取血和肝。

        1.4 血清肝生化指標(biāo)檢測

        血液經(jīng)靜置、離心、吸取上層血清、分裝后,按照試劑盒說明測定ALT、AST 活力。

        1.5 病理切片觀察肝組織

        固定于甲醛的肝大葉用石蠟包埋后進(jìn)行切片, 蘇木素?伊紅(HE)染色后在光學(xué)顯微鏡下觀察組織病理變化。

        1.6 LncRNA 基因芯片分析

        芯片技術(shù)服務(wù)委托上??党缮锕こ逃邢薰具M(jìn)行,采用 Arraystar 長鏈非編碼RNA 芯片( Mouse LncRNA Array V4.0) 技術(shù)分析各10 例PG 試劑對照組、TSN 6 h 組、TSN 12 h 組的外周血清中LncRNA差異表達(dá)譜,進(jìn)行差異基因分析,計(jì)算轉(zhuǎn)錄本間的顯著性水平(P值)及倍數(shù)變化。

        1.7 LncRNA 的RT-PCR

        血清提取總RNA:血清樣品按說明加入TRIzol試劑,依次進(jìn)行兩相分離、RNA 沉淀和清洗、重溶解沉淀等;RNA 質(zhì)量檢測:采取紫外吸收測定法,使用NanoDrop 2000 測定RNA 濃度和純度;RNA 合 成cDNA:使 用SuperScriptTM III Reverse Transcriptase 等按說明將RNA 逆轉(zhuǎn)錄為cDNA。設(shè)計(jì)引物:Primer 5.0 軟件。RT-PCR 檢測:使用2 ×PCR master mix、上下游引物等按說明進(jìn)行cDNA 的RT-PCR。引物信息見表1。

        表1 RT-PCR 所需引物Tab. 1 Primers for RT-PCR

        1.8 ROC 曲線分析

        使 用GraphPad Prism 5 軟 件 對ALT、AST 和候選LncRNA 生物標(biāo)志物的小鼠血清實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行ROC 曲線分析和作圖, 通過曲線下面積、敏感度、特異度等值來評估候選LncRNA生物標(biāo)志物的價(jià)值。

        1.9 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        用SPSS 20.0 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,計(jì)量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,多組間比較采用方差分析。以P< 0.05 為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 TSN 誘導(dǎo)C57BL/6 小鼠急性肝毒性

        動(dòng)物處理前,肉眼觀察小鼠的行為學(xué),TSN 給藥6 h 組和12 h 組的小鼠均出現(xiàn)少動(dòng)喜臥、對外界刺激反應(yīng)遲緩等現(xiàn)象。解剖后,這兩組肝臟顏色暗紅,局部呈斑點(diǎn)狀。血液學(xué)指標(biāo)如圖1 所示,與空白對照組和溶媒對照組相比,C57BL/6 小鼠在TSN 給藥12 h 后能夠提高血清ALT、AST 活力(P< 0.01);6 h 組能夠提高血清AST 活力(P< 0.05)。病理結(jié)果如圖2,空白對照組和溶媒對照組未見明顯變化;6 h 組見輕微肝內(nèi)出血;12 h 組可見明顯肝內(nèi)出血,炎性細(xì)胞浸潤和肝細(xì)胞壞死。提示TSN 給藥12 h(10 mg/kg)能顯著誘導(dǎo)急性肝毒性。

        圖1 TSN 誘導(dǎo)C57BL/6 小鼠急性肝毒性的ALT/AST 酶活力(±s,n = 10)Fig. 1 Activity of ALT / AST in acute hepatotoxicity induced by TSN in C57BL / 6 mice(±s,n = 10)

        圖2 TSN 誘導(dǎo)C57BL/6 小鼠急性肝毒性的病理結(jié)果Fig. 2 Pathological results of acute hepatotoxicity induced by TSN in C57BL / 6 mice

        2.2 TSN 給藥小鼠血清 LncRNA 芯片檢測結(jié)果

        在TSN 給藥12 h 組的LncRNA 芯片結(jié)果中,近3 萬個(gè)LncRNA 中有38 個(gè)LncRNA 差異變化(>10倍),見表2、圖3 所示。

        圖3 川楝素單次給藥12 h 基因芯片差異變化聚類圖(>10 倍)Fig. 3 Cluster diagram of gene chip difference changes after single administration of toosendanin for 12 h (> 10 fold)

        表2 川楝素在芯片中引起小鼠血清中差異變化的LncRNA(> 10 倍)Tab. 2 LncRNA in serum of mice induced by toosendanin in microarray(> 10 fold)

        2.3 RT-PCR 驗(yàn)證TSN 給藥小鼠血清中顯著變化的LncRNA

        從38 個(gè)差異變化的LncRNA 中,采用RTPCR 實(shí)驗(yàn)在TSN 給藥小鼠血清6 h 和12 h 組中驗(yàn)證13 個(gè)顯著變化15 倍以上且原始強(qiáng)度大于100的LncRNA。設(shè)計(jì)引物時(shí)發(fā)現(xiàn)其中Gm16596、Tmem178b、BC038906、Rdh11 等4 個(gè)LncRNA引物特異性欠佳,既能擴(kuò)增出LncRNA 條帶,又能擴(kuò)增出后面的mRNA 條帶,干擾mRNA 分別為NM_001364196.1(EmL1)、NM_001004182.4、XM_006535264.1/ NM_173370.3(Cds1)、NM_001362270,故無法開展后續(xù)試驗(yàn)。其余9 個(gè)LncRNA 的實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖4 所示,TSN 給藥小鼠血清6 h、12 h 組中有3 個(gè)下調(diào)LncRNA(AK017411、AK003718、XLOC_019815)通過了驗(yàn)證,它們的變化情況均與芯片結(jié)果一致,結(jié)果有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,且呈良好時(shí)效關(guān)系。提示AK017411、AK003718、XLOC_019815 為候選LncRNA 血清生物標(biāo)志物。

        圖4 RT-PCR 驗(yàn)證顯著變化LncRNA 在小鼠單次給藥TSN 6 h 與12 h血清中的表達(dá)(±s,n = 10)Fig. 4 RT-PCR confirmed the expression of LncRNA in serum of TSN in mice after single administration of TSN for 6 h and 12 h(±s,n = 10)

        2.4 ROC 曲線分析

        結(jié)果顯示如圖5、圖6、表3,在TSN 給藥造成顯著肝毒性的12 h 組中,3 個(gè)候選LncRNA 與肝毒性“金標(biāo)準(zhǔn)”ALT、AST 均能明確指示肝毒性,曲線下面積均為1;而在造成輕微肝毒性的6 h 組中,AK017411、AK003718、XLOC_019815 的評價(jià)結(jié)果略優(yōu)于ALT、AST,證明其具有良好敏感性。

        表3 候選LncRNA 生物標(biāo)志物與ALT、AST 的ROC 分析結(jié)果Tab. 3 ROC analysis results of candidate LncRNA biomarkers and ALT, AST

        圖5 血清TSN(6 h)組候選LncRNA 生物標(biāo)志物與ALT、AST 的ROC 曲線Fig. 5 ROC curve of candidate LncRNA biomarkers and ALT and AST in TSN (6 h) group

        圖6 血清TSN(12 h)組候選LncRNA 生物標(biāo)志物與ATL、AST 的ROC 曲線Fig. 6 ROC curve of candidate LncRNA biomarkers with ALT and AST in serum TSN (12 h) group

        2.5 AK017411、AK003718、XLOC_019815 可 以 作為指征川楝子誘導(dǎo)急性肝毒性的血清生物標(biāo)志物

        如圖7所示,3個(gè)LncRNA生物標(biāo)志物篩選的過程。

        圖7 指征川楝子誘導(dǎo)急性肝毒性的血清生物標(biāo)志物的篩選過程Fig. 7 Screening of serum biomarkers for acute hepatotoxicity induced by toosendan fruit

        3 討論

        四環(huán)三萜類化合物川楝素(TSN)不僅是川楝子公認(rèn)的主要活性成分,還是其肝毒性的主要物質(zhì)基礎(chǔ)[2-9]。灌胃小鼠、大鼠川楝素,其急性中毒的LD50分別為 244.2 mg/kg 和 120.7 mg/kg;對小鼠腹腔注射的 LD50為 13.44 mg/kg[10]。本研究前期研究參考川楝子臨床用法和用量,摸索建立的肝毒性小鼠模型中的劑量為10 mg/kg,給藥6 h 能造成輕微肝毒性,12 h 能造成顯著肝毒性,為后續(xù)實(shí)驗(yàn)打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

        傳統(tǒng)的肝毒性生物標(biāo)志物ALT 與AST 已經(jīng)應(yīng)用了近半世紀(jì),一直是臨床和科學(xué)研究中的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但由于在特異性和敏感性上存在許多局限性,不能完全滿足當(dāng)前藥物安全性評價(jià)的要求。因此,近幾年國內(nèi)外專家都致力于尋找和驗(yàn)證新的高靈敏度和高特異性的肝毒性生物標(biāo)志物,比如:GLDH、miR-122 等[11]。LncRNA 是一種內(nèi)源性非編碼RNA,長度大于200 個(gè)核苷酸單位,參與細(xì)胞內(nèi)多種過程調(diào)控,具有在種類、數(shù)量、功能上都不明確等特點(diǎn)。根據(jù)LncRNA在基因組上相對于蛋白編碼基因的位置,可以將其分為外顯子同義重疊、內(nèi)含子同義重疊、內(nèi)含子反義、天然反義、反向、基因間共6 種類型。同時(shí),快速、高通量的LncRNA 芯片檢測技術(shù)近年來得到了快速的發(fā)展,為其作為肝毒性生物標(biāo)志物進(jìn)行檢測提供了可能。已經(jīng)有學(xué)者開始研究將LncRNA應(yīng)用于一些疾病生物標(biāo)志物的尋找,并取得了一些進(jìn)展[12-14],但目前未見在肝毒性研究中的報(bào)道,特別是未見對于中藥肝毒性的研究。

        ROC 曲線常見于評估不同診斷試驗(yàn)對疾病的識別能力,將靈敏度與特異性以圖示方法結(jié)合在一起,可準(zhǔn)確反映某分析方法特異性和敏感性的關(guān)系,是試驗(yàn)準(zhǔn)確性的綜合代表。目前使用ROC 曲線來評估肝毒性生物標(biāo)志物的文獻(xiàn)報(bào)道較少,我們創(chuàng)新性地將候選生物標(biāo)志物與ALT、AST 共同評估,證明了候選生物標(biāo)志物的價(jià)值。

        AK017411[15]、AK003718[16]、XLOC_019815[17]均屬于基因間類型的LncRNA,長度分別為945、1 273、213 個(gè)核苷酸,均未見其功能注釋乃至肝毒性相關(guān)的報(bào)道,有極大的研究價(jià)值和潛力。

        4 結(jié)論

        本研究通過 LncRNA 芯片檢測,結(jié)合 RT-PCR驗(yàn)證和ROC 曲線評價(jià),從近30 000 個(gè) LncRNA 中篩選出這3 個(gè)LncRNA,均在6 h 和12 h 給藥小鼠的血清中發(fā)生明顯變化且具有時(shí)效關(guān)系,可作為指征川楝子誘導(dǎo)急性肝毒性的血清生物標(biāo)志物。希望本研究結(jié)果能為中藥肝毒性的研究打開新的思路,為中藥臨床安全使用提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

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