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        基于能譜CT的材料組分彩色表征研究

        2021-11-11 06:08:06孔慧華連祥媛潘晉孝
        光譜學(xué)與光譜分析 2021年11期
        關(guān)鍵詞:小鼠

        孔慧華, 連祥媛, 陳 平, 潘晉孝

        1.中北大學(xué)理學(xué)院,山西 太原 030051 2.信息探測與處理山西省重點實驗室,山西 太原 030051

        引 言

        基于光子計數(shù)探測器(photon-counting detector, PCD)的X射線能譜CT,通過設(shè)置能譜閾值,可以同時獲取多個窄譜通道的投影數(shù)據(jù),在材料組分識別方面具有優(yōu)異表現(xiàn)[1-2]。然而,由于窄譜通道中光子數(shù)驟減,噪聲水平增加,顯著降低了分解材料圖像的信噪比,影響了能譜CT的實際應(yīng)用。因此,降低能譜CT的重建噪聲對提高材料分解精度具有重要的現(xiàn)實意義。

        在能譜CT中,每個窄譜通道中的圖像都可以通過稀疏變換,如離散余弦變換和字典等被稀疏表示?;谌儾?total variation, TV)最小化和字典學(xué)習(xí)(dictionary learning, DL)的圖像重建算法已被成功應(yīng)用于CT[3-4]和能譜CT中[5-6]。對于能譜CT,不同能譜通道的重建圖像具有很強的相關(guān)性。許多算法同時考慮了圖像的稀疏性和不同能譜通道之間圖像的相關(guān)性,將低秩先驗信息、多通道梯度向量或張量與圖像稀疏性結(jié)合起來,有效提高了重建圖像的質(zhì)量[7-8]。

        在材料分解和識別方面,目前主要有前處理和后處理兩種方法。這些方法雖然可以對材料組分進行定量分析,但需要知道探測器響應(yīng)或者被分析材料的先驗信息。主成分分析(principal components analysis, PCA)是一種很好的多元數(shù)據(jù)分析技術(shù),可以應(yīng)用于任意維度的圖像數(shù)據(jù),因此可以用來處理多能譜CT數(shù)據(jù)[9]。

        基于以上分析,首先在能譜CT圖像稀疏性的基礎(chǔ)上,融入窄譜圖像間的相關(guān)性,提出一種多約束窄譜CT迭代重建算法。然后利用PCA估計能譜信息,通過對各個主成分圖像進行分析,將其函數(shù)映射為彩色圖像的R,G,B分量,最后獲取材料組分的彩色表征。

        1 多約束窄譜CT迭代重建算法

        能譜CT將X射線寬能譜分布劃分成多個不相重疊的窄譜通道,一次掃描可以得到多個窄譜通道的投影數(shù)據(jù){PE},每個通道對應(yīng)一個窄譜圖像fE。窄譜CT圖像重建可表示為

        (1)

        式(1)中,A=(aij)I×J是投影矩陣,I表示投影射線總數(shù),J表示圖像像素總數(shù);fE是窄譜重建圖像;PE是窄譜投影數(shù)據(jù)。為了處理方便,重建圖像fE=(fj)J×1也可以表示為fE=(fm,n)M×N,其中M,N為圖像的行與列,其相互關(guān)系可表示為式(2)

        fj=fm,n,j=(m-1)×N+n,

        1≤m≤M,1≤n≤N,J=M×N

        (2)

        為了充分利用窄譜CT圖像的稀疏性以及窄譜通道間圖像的相關(guān)性,將圖像的TV,DL和圖像塊之間的相關(guān)系數(shù)(image patch correlation coefficient,IPCC)整合到重建算法中,提出一種基于先驗信息的多約束窄譜CT迭代重建方法,記為TV-DL-IPCC,目標函數(shù)的定義如式(3)

        (3)

        式(3)中,μ,λ,β為平衡保真項與正則化項的參數(shù),Φ1(fE),Φ2(fE),Φ3(fE)分別定義為式(4)—式(6)

        Φ1(fE)?‖fE‖TV

        (4)

        (5)

        (6)

        Φ1(fE)表示圖像fE的TV范數(shù),表達式為

        (7)

        Φ2(fE)表示圖像fE的基于字典學(xué)習(xí)的正則化項,圖像塊EjfE是由算子Ej∶RJ→RNd從fE中提取的尺寸為Nd=nd×nd的小圖像塊,其左上角位置為第j個像素。字典D∈RNd×K是一個矩陣,每一列dk∈RNd稱為一個原子,k=1,2,…,K。一般來說,字典是冗余的,即Nd?K。αj是在字典D下圖像塊EjfE的稀疏表示,γj為基于字典學(xué)習(xí)的正則化參數(shù)。

        對企業(yè)i來說,在積分交易價格pφ一定時,βi越大意味著研發(fā)效率越低,企業(yè)續(xù)航技術(shù)研發(fā)的積極性越低。然而,當積分交易價格提高時,企業(yè)續(xù)航技術(shù)研發(fā)的積極性提高,通過續(xù)航能力提升獲取積分進而出售獲利。當企業(yè)間進行研發(fā)合作時,目標函數(shù)是總體利潤最大化,因而會考慮本企業(yè)對另一企業(yè)的技術(shù)溢出,溢出率越高,花費相同的成本可以更大程度地提高汽車產(chǎn)品的續(xù)航能力;而在進行研發(fā)競爭時,企業(yè)只考慮自身的利潤最大化,不考慮本企業(yè)對另一企業(yè)的技術(shù)溢出。

        Φ3(fE)表示能譜圖像之間的相關(guān)性,式(6)中相關(guān)系數(shù)前面取負號,是為了與TV和DL正則化項中的非零系數(shù)最小化一致。雖然不同能譜通道下的重建圖像{fE}的衰減系數(shù)并不相同,但其結(jié)構(gòu)信息卻是高度相關(guān)的。因此,在能譜CT重建中可以用已知的高質(zhì)量重建圖像f先驗作為參考,發(fā)揮先驗信息的作用來約束所有能譜通道的重建圖像。選擇fE和f先驗的相關(guān)系數(shù)作為衡量通道之間圖像相關(guān)性的正則化項。為了保證微小結(jié)構(gòu)的相似性,采用塊策略,類似于字典學(xué)習(xí),首先在窄譜圖像和先驗圖像中提取塊EjfE和Ejf先驗,分別記為u=(umn)nd×nd和v=(vmn)nd×nd,則圖像塊之間的相關(guān)系數(shù)ρ可以表達為式(8)

        (8)

        目標函數(shù)(3)可以利用交替最小化迭代方法求解,將其分為兩個子問題,第一個子問題為[見式(9)]

        (9)

        第二個子問題為[見式(10)]

        (10)

        第一個子問題的求解通過圖像重建和字典學(xué)習(xí)兩個步驟完成。在圖像重建階段,采用Split-Bregman算法求解不可微正則化問題,首先引入輔助變量,將目標函數(shù)分為L1范數(shù)和L2范數(shù)兩部分,然后采用Bregman算法求解。在字典學(xué)習(xí)階段,為了盡量減小先驗信息對重建圖像質(zhì)量的影響,采用局部自適應(yīng)字典,對重建后的圖像進行字典學(xué)習(xí)。式(9)的具體求解流程見參考文獻[10]。

        (11)

        (12)

        注意,若(3)式中只含正則化項Φ1(fE),則為TV算法;若只含Φ2(fE),則為DL算法,若只含Φ3(fE),則為IPCC算法。

        2 基于主成分分析的材料組分彩色表征

        PCA將一組高度相關(guān)的變量轉(zhuǎn)換為少數(shù)幾個互不相關(guān)的綜合變量,可以最大限度地表示數(shù)據(jù)中的方差。本研究感興趣的是將能譜CT數(shù)據(jù)中不同類別材料之間的對比方差最大化,因此選取主成分對窄譜CT圖像進行分析。

        將每一個窄譜通道的重建圖像fEl看做一個含有J個分量的向量Cl,l=1,2,…,L,所有窄譜通道下的圖像{fE1,fE2,…,fEL}構(gòu)成矩陣C,其中clj表示第l個能譜通道下第j個像素的衰減系數(shù)。主成分分析首先計算這組數(shù)據(jù)的協(xié)方差矩陣S=(sij)L×L;然后計算協(xié)方差矩陣的特征值和對應(yīng)的特征向量,設(shè)其特征值為λ1≥λ2≥…≥λL,對應(yīng)的特征向量為ξi=(ξi1,ξi2,…,ξiL),i=1,2,…,L。則第i(1≤i≤L)個主成分圖像PCA-i見式(13)主成分圖像

        zi=ξi1fE1+ξi2fE2+…+ξiLfEL

        (13)

        第一主成分在不同材料對比度上有最大方差,其余主成分的方差依次減少。最后建立主成分圖像與R,G和B色彩分量之間的映射關(guān)系,獲取各組分的彩色表征。

        3 實驗部分

        本研究的主要目的是對材料組分進行彩色表征,將通過仿真實驗和實際實驗驗證提出算法的有效性。為了驗證所提出的多約束窄譜CT迭代重建算法的性能,選擇TV,DL和IPCC算法作為比較算法。所有的算法都是用Matlab和C++的混合編程模式實現(xiàn)的,接口在Matlab中,大規(guī)模計算部分在C++中實現(xiàn),并通過MEX函數(shù)進行編譯。

        3.1 仿真實驗

        仿真實驗選取由MOBY軟件生成的數(shù)字小鼠胸腔切片作為測試模型,模型尺寸為20 mm×20 mm,分辨率為512×512。實驗中,采用等距扇形束掃描,掃描半徑為100 mm,位于物體中心的虛擬探測器長度為20 mm,共有320個探測器單元。設(shè)置電壓為50 kVp,將該寬能譜分為三個能譜通道: {17 keV—28 keV},{29 keV—35 keV},{36 keV—50 keV}。每個通道內(nèi)光子數(shù)為10萬,生成具有泊松分布的噪聲投影數(shù)據(jù),其期望是相應(yīng)的無噪聲情況下接收到的光子數(shù)。在[0,21π]內(nèi)均勻采樣,采集的投影視角數(shù)為360。利用歸一化均方根誤差(normalized root mean square error, NRMSE)、結(jié)構(gòu)相似度(structural similarity, SSIM)和峰值信噪比(peak signal to noise ratio, PSNR)對算法的性能進行定量評價。

        TV-DL-IPCC算法中的參數(shù)是在窄譜通道中通過實驗使其性能最優(yōu)獲取的。為了便于比較,TV,DL和IPCC算法中使用與TV-DL-IPCC算法相同的參數(shù),同時每個通道都使用相同的參數(shù),其中μ=100,λ=20,β=10,η=0.02。在IPCC和TV-DL-IPCC算法中,將噪聲投影下采用Split-Bregman(SB)算法[11]重建的寬譜圖像作為先驗圖像,如圖1(a)所示,該圖像與寬譜下無噪聲重建圖像相比較,其數(shù)量性評價指標為NRMSE=0.018 8,SSIM=0.999 8,PSNR=50.470 4。

        圖1 先驗圖像

        TV,DL,IPCC和TV-DL-IPCC算法在三個能譜通道下經(jīng)過20次迭代的重建結(jié)果如圖2所示。從圖2可以看出,IPCC算法邊緣重建效果很好但沒有去噪的功能,TV和DL都可以去除噪聲。由于TV假設(shè)圖像是分片光滑的,導(dǎo)致重建圖像存在塊狀偽影,而因為DL是逐圖像塊進行處理的,所以平滑效果較好但容易將微弱細節(jié)平滑掉。TV-DL-IPCC算法不僅可以有效去除噪聲還能加強邊緣和細節(jié)的重建。

        圖2 四種算法下小鼠胸腔的重建圖像

        表1給出了TV,DL,IPCC和TV-DL-IPCC算法在三個能譜通道下的NRMSE,SSIM和PSNR值。從表1可以看出,與其他方法相比TV-DL-IPCC具有較小的NRMSE,較大的SSIM和PSNR。

        表1 四種算法在三個能譜通道下小鼠胸腔重建圖像的數(shù)量性評價指標

        為獲取材料組分的彩色表征,首先對TV-DL-IPCC算法重建的三個能譜通道下的CT圖像進行主成分分析,圖3(a),(b)和(c)給出了三個主成分的圖像。第一主成分圖像包含了能譜CT圖像的99.00%的信息量,表示三個能譜通道CT圖像的平均,如圖3(a)所示;第二主成分圖像在骨骼上取值為負,碘對比劑上取值為正,且包含了少量的背景噪聲,如圖3(b)所示;第三主成分圖像在碘對比劑上取值為負,且包含了大量的背景噪聲,如圖3(c)所示。通過分析發(fā)現(xiàn)背景噪聲在零附近波動,為了去掉背景噪聲,且突出骨骼和碘對比劑,對第二和第三主成分圖像中的像素值進行平方,得到主成分函數(shù)的圖像,如圖3(d)和(e)所示。然后分別將圖3(a),(d)和(e)映射為彩色圖像的G,R和B顏色分量,得到小鼠胸腔各組分的彩色表征,如圖4所示。

        圖3 小鼠胸腔的主成分分析圖像

        從圖4可以看出,由IPCC算法獲取的彩色CT圖像邊緣清晰但噪聲明顯,TV,DL和TV-DL-IPCC算法下的能譜CT圖像都很好地實現(xiàn)了材料組分的彩色表征,背景是黑色,軟組織是綠色,骨骼根據(jù)其硬度在綠色到黃色之間,碘對比劑是紫色。其中TV算法下的彩色表征有一些塊狀偽影,DL算法下的彩色表征有效去除了塊狀偽影,但胸腔內(nèi)的個別軟組織也被平滑掉了,而TV-DL-IPCC算法下的彩色表征不僅有效抑制了噪聲,且邊緣、細節(jié)清晰。從圖4(a—d)中還可以看到提出的彩色映射函數(shù)很好地去除了圖像中的背景噪聲。

        圖4 四種重建算法下小鼠胸腔材料組分的彩色表征

        3.2 臨床前小鼠實驗

        為了進一步驗證提出算法在實際應(yīng)用中的有效性,將一組真實的小鼠臨床前能譜CT投影用于算法的測試。該組數(shù)據(jù)由美國俞恒永博士所在團隊提供,采用新西蘭Medipix3探測器[12]。實驗用的電壓為120 kVp,電流為175 mA。從探測源到系統(tǒng)中心的距離為158 mm,到探測器的距離為255 mm。整個能譜范圍內(nèi)收集了13個能譜通道的投影數(shù)據(jù),處理后的投影圖像分辨率為360×512,重建圖像的分辨率為512×512。在IPCC和TV-DL-IPCC算法中,使用SB算法重建的寬譜圖像作為先驗圖像,如圖1(b)所示。與模擬仿真實驗類似,算法中使用的參數(shù)是通過實驗優(yōu)化獲取的,且用于所有能譜通道,其中μ=100,λ=50,β=5,η=0.02。

        圖5(a—d)分別給出了TV,DL,IPCC和TV-DL-IPCC算法在能譜通道1,6,13下經(jīng)過20次迭代的重建結(jié)果。由圖5(a—d)分別可以看到與仿真實驗相似的結(jié)果,TV重建圖像存在塊狀偽影,DL算法具有較好的去噪效果,IPCC重建圖像邊緣清晰,但對圖像的噪聲無能為力。而TV-DL-IPCC算法結(jié)合了TV,DL和IPCC的優(yōu)點,在圖像邊緣保持以及去噪方面明顯優(yōu)于其他算法。

        圖5 四種算法下臨床前小鼠的重建圖像

        對能譜通道1,6和13重建的CT圖像進行主成分分析,得到的三個主成分圖像如圖6(a),(b)和(c)所示。第一主成分圖像包含了能譜CT圖像的99.49%的信息量,表示三個能譜通道CT圖像的平均;第二主成分圖像在骨骼上取值為正,且包含了少量的背景噪聲;第三主成分圖像包含了大量的背景噪聲。為了去掉背景噪聲,且突出骨骼,對第二和第三主成分圖像中的像素值分別進行平方和四次方,得到主成分函數(shù)的圖像,如圖6(d)和(e)所示。然后分別將圖6的(a),(d)和(e)映射為彩色圖像的G,R和B顏色分量,得到臨床前小鼠各組分的彩色表征,分別如圖7(a—d)所示。

        圖6 臨床前小鼠的主成分分析圖像

        圖7 四種重建算法下臨床前小鼠材料組分的彩色表征

        由圖7(a—d)可以看出通過主成分分析,四種算法下的能譜CT圖像都很好地實現(xiàn)了材料組分的彩色表征,背景是黑色,軟組織是綠色,骨骼根據(jù)其硬度在綠色到黃色之間,且很好地去掉了重建圖像中的背景噪聲。從圖7(d)可以看到TV-DL-IPCC算法下的彩色表征不僅邊緣清晰,且有效去除了噪聲的影響。同時從圖7(a)中可以看出TV算法中的塊狀偽影在彩色映射過程中也被去掉了。

        4 結(jié) 論

        在能譜CT中,每個能譜通道的重建圖像都可以被稀疏表示,不同能譜通道下的重建圖像具有很強的相關(guān)性。利用這些先驗信息可以有效地提高重建圖像的質(zhì)量,本研究將TV,DL與IPCC約束項相結(jié)合,提出了一種多約束窄譜CT迭代重建算法。實驗結(jié)果表明,該算法在去噪的同時,很好地保留了圖像的邊緣和細節(jié)特征。為了實現(xiàn)CT圖像組分的彩色表征,采用主成分分析的方法對能譜CT圖像進行處理,通過建立主成分圖像與彩色圖像R,G,B分量之間的映射關(guān)系,最終獲取各材料組分的彩色表征。實驗結(jié)果表明該方法在獲取彩色表征的同時,還可以有效去除噪聲的影響。

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