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        抗弧菌光合細菌的分離鑒定及對氨氮和亞硝態(tài)氮的降解特性

        2021-10-23 02:28:56王雨婷周榮翔李霽虹周婷婷陳文才湯曼利馬桂珍許建和
        南方水產(chǎn)科學 2021年5期

        王雨婷,周榮翔,李霽虹,張 瑤,周婷婷,陳文才,彭 云,湯曼利,馬桂珍,許建和

        (1. 江蘇海洋大學環(huán)境與化學工程學院,江蘇 連云港 222000; 2. 江蘇海洋大學食品科學與工程學院,江蘇 連云港 222000; 3. 永清縣農(nóng)業(yè)農(nóng)村局種植業(yè)技術(shù)推廣站,河北 廊坊 065000;4. 江蘇海洋大學海洋科學與水產(chǎn)學院,江蘇 連云港 222000)

        弧菌病是常見的水產(chǎn)養(yǎng)殖病害[1]。近年來隨著水產(chǎn)養(yǎng)殖品種的增加和養(yǎng)殖規(guī)模的擴大,尤其是高密度養(yǎng)殖使水體自身調(diào)節(jié)能力降低,弧菌病害和氨氮 (NH4+-N) 過量對水產(chǎn)養(yǎng)殖的負面影響越來越嚴重,有關(guān)水產(chǎn)養(yǎng)殖過程中弧菌病防治和水體污染治理的研究備受關(guān)注[2]。目前主要采用化學、物理手段進行弧菌病的防治,但物理手段會造成水體二次污染,化學手段會導致病原菌的抗藥性,打破水域生態(tài)平衡,而生物手段則彌補了化學手段的不足,這類生態(tài)友好型的治理手段已成研發(fā)熱點[3],生產(chǎn)上亟需更多的微生物制劑用于水產(chǎn)病害和水污染治理[4]。

        光合細菌 (Photosynthetic bacteria, PSB) 是在厭氧條件下以光為能源,以二氧化碳 (CO2) 或有機物為碳源,進行不生氧光合作用的原核生物[5]。目前所知的光合細菌可分為著色桿菌科、外硫紅螺菌科、紫色非硫細菌、綠色硫細菌、多細胞絲狀綠細菌、螺旋桿菌科、含細菌葉綠素的專性好氧菌7大類群,其中在水產(chǎn)養(yǎng)殖方面應用最多的為紫色非硫細菌[6-8]。光合細菌將水體中的有機物轉(zhuǎn)化為自身生長所需的能量,與病原微生物形成競爭關(guān)系,從而成為優(yōu)勢菌群,抑制病原菌的生長繁殖[9],降低水產(chǎn)養(yǎng)殖病害的發(fā)生率,而且光合細菌所含的營養(yǎng)物質(zhì)能夠提高養(yǎng)殖魚蝦的免疫力,大幅提升其產(chǎn)量[10]。光合細菌作為生防菌株,已有研究主要針對其能夠高效降解水體中的三態(tài)氮、硫化氫等有害物質(zhì)[11],而對同時具有弧菌拮抗作用和降解NH4+-N、亞硝態(tài)氮 (NO2?-N) 復合功能的光合細菌的研究較少。本研究通過分離篩選對弧菌具有抑制作用并能降解NH4+-N 和 NO2?-N 的優(yōu)良光合細菌,以期為水產(chǎn)養(yǎng)殖病害的生物防治和養(yǎng)殖水污染治理提供優(yōu)良菌株。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 供試培養(yǎng)基 光合細菌富集培養(yǎng)基為氯化鈉 (NaCl) 2 g,七水硫酸鎂 (MgSO4·7H2O) 0.2 g,氯化銨 (NH4Cl) 1 g,磷酸二氫鉀 (KH2PO4) 1.75 g,乙酸鈉 (CH3COONa) 3 g,酵母粉 1 g,蒸餾水1 000 mL,pH 7.0,滅菌后加入 2 g 碳酸氫鈉(NaHCO3)。光合細菌分離培養(yǎng)基為光合細菌富集培養(yǎng)基添加1.7%瓊脂。光合細菌發(fā)酵培養(yǎng)基為LB培養(yǎng)基。弧菌的培養(yǎng)及抑菌作用測定培養(yǎng)基為2216E 培養(yǎng)基 (蛋白胨 5 g、酵母膏 1 g、磷酸高鐵0.01 g,瓊脂 20 g,陳海水 1 000 mL,pH 8.0)。NH4+-N 降解培養(yǎng)基為 NaCl 2 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,硫酸銨[(NH4)2SO4] 0.2358 g,KH2PO41.75 g,CH3COONa 3 g,酵母粉 1 g,蒸餾水 1 000 mL,pH 7.0,滅菌后加入 2 g NaHCO3(NH4+-N 質(zhì)量濃度為 50 mg·L?1)。NO2?-N降解培養(yǎng)基為 NaCl 2 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,NaNO20.246 4 g,KH2PO41.75 g,CH3COONa 3 g,酵母粉 1 g,蒸餾水 1 000 mL,pH 7.0,滅菌后加入 2 g NaHCO3(NO2?-N 質(zhì)量濃度為 50 mg·L?1)。檸檬酸鹽利用培養(yǎng)基為NaCl 2 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,NH4Cl 1 g,KH2PO41.75 g,檸檬酸鈉 3 g,蒸餾水 1 000 mL,pH 7.0,滅菌后加入 2 g NaHCO3。

        1.1.2 病原菌 副溶血弧菌 (Vibrio parahemolyticus)、鰻弧菌 (V. anguillarum)、創(chuàng)傷弧菌 (V. vulnificus) 由本實驗室保藏提供。

        1.2 樣品的采集與富集

        從連云港海域海州灣、車牛山島、灌河入??诘葏^(qū)域采集海水樣品20個,海泥樣品4個,從南通市如東、啟東地區(qū)海域采集海水樣品4個,海泥樣品2個。

        取5 mL樣品于25 mL富集培養(yǎng)基中,置于50 mL螺口離心管中,再加5 mL無菌液狀石蠟,30 ℃,2 000 lx 光照條件下富集培養(yǎng),至培養(yǎng)物出現(xiàn)不同顏色。取1 mL培養(yǎng)物接種于新的富集培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng),重復3~4次,得到深色培養(yǎng)液。

        1.3 海洋光合細菌的分離純化

        采用雙層平板涂布法和雙層平板劃線法。取不同的樣品富集液,進行梯度稀釋,分別取不同樣品 10?4、10?5、10?6稀釋濃度的稀釋液 0.2 mL 涂布于光合細菌分離培養(yǎng)基平板上,用一層融化后冷卻至約45 ℃的分離培養(yǎng)基覆蓋,靜置凝固后,30 ℃光照條件下培養(yǎng)4 d。挑取紅色、紫色、棕色和綠色等不同顏色菌落至新的分離培養(yǎng)基的平板上進行三區(qū)劃線,進一步純化,至在顯微鏡下觀察菌體形態(tài)一致。

        1.4 海洋光合細菌對弧菌的抑制作用測定

        1.4.1 光合細菌菌懸液的制備 將分離得到的光合細菌菌株接種于裝有25 mL LB液體培養(yǎng)基的50 mL離心管內(nèi),加入5 mL滅菌石蠟,在30 ℃、光照強度 2 000 lx 下培養(yǎng) 4 d,菌液用無菌液體培養(yǎng)基調(diào)整光密度 (OD660 nm) 相等且 OD660 nm≥1.5。

        1.4.2 對弧菌的抑菌作用測定 采用牛津杯法。將在2216E培養(yǎng)基斜面上培養(yǎng)24 h的供試3種弧菌用無菌生理鹽水洗下,制備成濃度為107個·mL?1的菌懸液,取0.1 mL菌懸液涂布在2216E培養(yǎng)基平板上。在距離培養(yǎng)皿邊緣1.5 cm處的含菌平板四周均勻放置牛津杯,每個牛津杯中注入200 μL光合細菌不同菌株濃度為107個·mL?1的菌懸液,以等量的無菌培養(yǎng)基為對照,28 ℃恒溫培養(yǎng)48 h,觀察測定抑菌圈直徑。每個菌株3個重復。

        1.5 不同光合細菌菌株降解NH4+ -N和NO2? -N作用測定

        1.5.1 標準工作曲線制作 分別采用靛酚藍分光光度法和鹽酸萘乙二胺分光光度法 (GB/T 11889—1989) 測定溶液中 NH4+-N 和 NO2?-N 質(zhì)量濃度。分別以 NH4+-N 質(zhì)量濃度和 NO2?-N 質(zhì)量濃度為橫坐標,OD637 nm和 OD538 nm為縱坐標,制作標準曲線,建立回歸方程。

        1.5.2 降解率測定 將光合細菌菌懸液 (OD660 nm≥1.5) 按10%的接種量接入裝有25 mL液體降解培養(yǎng)基的50 mL離心管中,加入5 mL滅菌石蠟,每個菌株3個平行,在30 ℃、光照強度2 000 lx下靜置培養(yǎng) 4 d。發(fā)酵液于 4 ℃、5 000 r·min?1條件下離心20 min,取上清液,測定不同菌株上清液的吸光值,根據(jù)標準曲線計算不同菌株發(fā)酵液中的氮質(zhì)量濃度,以未接種的培養(yǎng)基作為對照,計算不同菌株的降解率。

        式中:R為降解率;Ct為對照濃度;C0為處理濃度。

        1.6 抑菌并高效降解NH4+ -N和NO2? -N光合細菌菌株的初步鑒定

        1.6.1 形態(tài)學觀察 將篩選出的抑菌并高效降解NH4+-N 和 NO2?-N 的光合細菌菌株接種于光合細菌分離培養(yǎng)基上,在30 ℃、光照強度2 000 lx下靜置培養(yǎng)4 d,通過解剖鏡觀察培養(yǎng)基上菌落形態(tài)及顏色,挑取單菌落,進行革蘭氏染色和鞭毛染色,顯微鏡觀察菌體大小、形態(tài)和染色結(jié)果。

        1.6.2 生理生化試驗 挑取菌株 3個單菌落至含2 mL無菌水的離心管中,振蕩均勻并制成0.5麥氏濁度的均一菌懸液,吸取50~100 μL菌懸液接種至不同的生化管中,按照說明書于不同條件下培養(yǎng),觀察反應管的顯色結(jié)果,將顯色結(jié)果與《結(jié)果詮釋表》比對,確定反應結(jié)果,以大腸桿菌為對照菌。

        檸檬酸鹽利用試驗:將光合細菌菌懸液(OD660 nm≥1.5) 按 10% 的接種量接入裝有 25 mL檸檬酸鹽利用培養(yǎng)基的50 mL離心管中,加入5 mL滅菌石蠟,在 30 ℃、2 000 lx 下靜置培養(yǎng) 4 d,觀察培養(yǎng)基顏色變化,確認菌株是否生長。

        根據(jù)形態(tài)觀察和生理生化反應結(jié)果,對照《伯杰細菌鑒定手冊》《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》對菌株進行初步鑒定。

        1.6.3 16S rDNA 序列分析 將 P-3菌株樣品送至上海生工生物工程有限公司,測定菌株的16S rDNA序列。所得的基因序列拼接完整后與NCBI數(shù)據(jù)庫中的已知序列進行BLAST比對,選取近源序列,采用MEGA 7.0軟件構(gòu)建16S rDNA基因序列系統(tǒng)發(fā)育樹。

        2 結(jié)果

        2.1 海洋光合細菌的富集

        在光照厭氧條件下30個不同樣品多次富集培養(yǎng),有6個樣品出現(xiàn)了顏色變化,分離自灌河入海口海泥 (A) 為棕色,車牛山島海水 (B) 和南通如東海泥 (C) 均為深紅色,南通啟東海水 (D) 和連云港高公島表層海水 (E) 為紅色,海州灣海水 (F) 為綠色 (圖1),其他樣品渾濁,未變色。

        圖1 富集篩選培養(yǎng)后的培養(yǎng)液A. 灌河入??诤D?;B. 車牛山島海水;C. 南通如東海泥;D. 南通啟東海水;E. 連云港高公島表層海水;F. 海州灣海水。Figure 1 Culture medium after enrichment and screeningA. Sea mud of the river empties into the sea; B. Cheniushan Island sea water; C. Sea mud of Rudong, Nantong; D. Sea water of Qidong,Nantong; E. Surface water of Gaogong Island, Lianyungang;F. Sea water of Haizhou Bay.

        2.2 海洋光合細菌的分離純化

        將富集的30個樣品涂布于光合細菌平板上,從連云港高公島海域海水分離純化得到了橙紅色的P-1菌株,從南通如東海泥中分離得到紅色的P-2菌株,從連云港車牛山島海域海水分離得到深紅色P-3菌株。3個菌株的形態(tài)特征見表1、圖2和圖3,符合光合細菌的特征。

        圖2 菌株P(guān)-1形態(tài)特征觀察a. 菌落特征;b. 菌株形態(tài)。Figure 2 Morphological characteristics of P-1 straina. Colony characteristics; b. Strain morphology.

        圖3 菌株P(guān)-2形態(tài)特征觀察a. 菌落特征 (15×);b. 菌株形態(tài)。Figure 3 Morphological characteristics of P-2 straina. Colony characteristics (15×); b. Strain morphology.

        表1 分離得到的3個光合細菌菌株的形態(tài)特征Table 1 Morphological characteristics of three isolates of photosynthetic bacteria

        2.3 光合細菌菌株對3種弧菌的抑制作用

        菌株P(guān)-3對3種弧菌均有抑制作用,對鰻弧菌的抑菌圈較明顯,抑菌圈平均直徑為 (5.26±0.03)mm。菌株P(guān)-1、P-2在平板對峙試驗中,牛津杯周圍基本上未現(xiàn)抑菌圈,說明這2株菌對副溶血弧菌、鰻弧菌和創(chuàng)傷弧菌沒有拮抗作用 (表2、圖4)。

        圖4 不同光合細菌菌液對副溶血弧菌 (a)、鰻弧菌 (b) 和創(chuàng)傷弧菌 (c) 的抑菌效果Figure 4 Antibacterial effect of against V. parahemolyticus (a), V. anguillarum (b) and V. vulnificus (c)

        表2 不同光合細菌菌株對弧菌的抗菌效果Table 2 Antibacterial effect of strains against Vibrios

        2.4 具有抑菌作用的光合細菌菌株降解NH4+ -N和NO2? -N 作用的測定

        將光合細菌菌液加入含 50 mg·L?1NH4+-N、NO?2-N降解培養(yǎng)基中,光照厭氧條件30 ℃培養(yǎng)4 d,測定發(fā)酵液的吸光值,并通過回歸方程計算氮濃度,結(jié)果見表3。3株菌株降解氮的能力較強,其中菌株P(guān)-2的NH4+-N降解率最高 (93.39%),菌株P(guān)-3的 NO2?-N 降解率最高 (94.98%)。

        表3 3株海洋光合細菌對氨氮和亞硝態(tài)氮的降解率Table 3 Ammonia nitrogen and nitrite nitrogen degradation rate of three marine photosynthetic bacteria

        2.5 抑菌并高效降解NH4+ -N和NO2? -N光合細菌菌株的鑒定

        根據(jù)不同菌株抑菌作用、NH4+-N 和 NO?2-N 降解作用結(jié)果,菌株P(guān)-3對3種弧菌的抑制作用以及對 NO2?-N 的降解作用最強,同時對 NH4+-N 的降解率較高,作為高效抑菌降解 NH4+-N 和 NO2?-N 的優(yōu)良菌株進行初步鑒定。

        2.5.1 形態(tài)學觀察 菌落形態(tài)為紅色圓球狀,邊緣整齊,表面低突 (圖5);該菌為革蘭氏陰性菌,細胞短桿狀,大小為 (1.34~1.62) × (0.33~0.59) μm,單根極生鞭毛 (圖6-a);菌株P(guān)-3在光照厭氧條件下,培養(yǎng)液呈深紅色 (圖6-b)。

        圖5 菌株P(guān)-3形態(tài)特征a. 菌落特征 (25×);b. 菌株形態(tài)。Figure 5 Morphological characteristics of P-3 straina. Colony characteristics (25×); b. Strain morphology.

        圖6 菌株P(guān)-3鞭毛染色 (a) 和液體培養(yǎng)物 (b)Figure 6 Flagella stained (a) and liquid culture (b) of P-3 strain

        2.5.2 生理生化特性 菌株 P-3在麥芽糖、阿拉伯糖生化鑒定管顏色變?yōu)辄S色、陽性,葡萄糖管顏色無變化,說明該菌具有分解阿拉伯糖和麥芽糖的能力,不能利用葡萄糖作為碳源;尿素酶、賴氨酸脫羧酶、精氨酸雙水解酶實驗呈陽性,表明菌株P(guān)-3能分解氨基酸使其脫羧生成胺;苯丙氨酸、肌醇試驗為陰性;檸檬酸鈉作為唯一碳源培養(yǎng)4 d,培養(yǎng)液顏色變?yōu)榧t色,為陽性,表明菌株P(guān)-3可以利用檸檬酸鹽 (表 4)。

        表4 菌株P(guān)-3生理生化試驗結(jié)果Table 4 Physiological and biochemical characteristics of P-3 strain

        根據(jù)形態(tài)觀察結(jié)果和生理生化試驗,參照《伯杰細菌系統(tǒng)鑒定手冊》和《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》對菌株P(guān)-3進行初步鑒定。

        在厭氧光照條件下培養(yǎng)物為深紅色的光合細菌有紅假單胞菌屬、紅螺菌屬和紅微菌屬,紅螺菌屬菌體為螺旋狀,不具有脫氮能力,生境為淡水環(huán)境;紅微菌屬菌體為卵圓形至檸檬狀,依靠周生鞭毛運動,且不能利用檸檬酸鹽為碳源;紅假單胞菌屬的菌體為球形或桿狀,單根極生鞭毛運動,不能利用葡萄糖,可以利用檸檬酸鹽且具有脫氮作用,生境為海水環(huán)境,菌株P(guān)-3細胞形態(tài)、生理生化特性等與紅螺菌屬和紅微菌屬不同,而與紅假單胞菌屬的形態(tài)和生理生化特性一致,初步認為菌株P(guān)-3為紅假單胞菌 (Rhodopseudomonassp.,表 5)。

        2.5.3 菌株 P-3 16S rDNA 序列分析 將菌株 P-3的16S rDNA基因序列與NCBI中的序列進行比對,選取同屬內(nèi)同源相似性較高的不同菌株的16S rDNA序列,采用MEGA 7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,菌株P(guān)-3的16S rDNA與多株沼澤紅假單胞菌(R. palustris) 的相似性為99.31%,結(jié)果見圖7。

        圖7 基于P-3菌株的16S rDNA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 7 Phylogenetie tree of P-3 strain based on 16S rDNA gene sequences

        3 討論

        有學者認為光合細菌具有類胡蘿卜素[12-13]、細菌葉綠素[14]等光合色素,在光照培養(yǎng)條件下,其培養(yǎng)液大多呈紅色、紫色或者綠色等[5],如張小倩等[15]從遼河入海口篩選出1株產(chǎn)紅色色素能力較強的紅假單胞菌屬菌株,王蕊等[16]從凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei) 池塘水樣、底泥中分離到1株類胡蘿卜素含量較高的糞紅假單胞菌 (R.faecalis)。本研究分離到的3株光合細菌厭氧培養(yǎng)液顏色均為紅色,與已有的研究中菌液顏色相符,利用這一特性初步篩選菌株,有助于尋找到更多的光合菌株資源。

        弧菌屬是水產(chǎn)養(yǎng)殖中一種常見的細菌性病原[17-18],目前用于弧菌病的拮抗菌主要有乳酸菌[19]、芽孢桿菌[20]、光合細菌[21]等。張信娣等[22]研究發(fā)現(xiàn)球形紅假單胞菌X3在平板擴散法中對水產(chǎn)致病菌有微弱的抑制作用。本研究中的沼澤紅假單胞菌對副溶血弧菌、鰻弧菌和創(chuàng)傷弧菌均具有拮抗作用,與張信娣等[22]的研究結(jié)果相似。

        光合細菌可以吸收水體中的NH4+-N、硝態(tài)氮(NO3?-N) 和 NO2?-N,起到改善水質(zhì)、修復水環(huán)境的作用[23-25]。目前對改善養(yǎng)殖環(huán)境的光合細菌種類研究頗多,如海洋著色菌 (Marichromatium gracile)[26]、紅假單胞菌[27]、類球紅細菌 (Rhodobacter sphaeroides)[28]、沙氏外硫紅螺菌 (Ectothiorhodospira shaposhnikovii)[29]等,這些光合菌降解效率各不相同。本試驗分離篩選得到的菌株P(guān)-3與金春英等[30]和劉珍珠等[31]研究的沼澤紅假單胞菌降解效果相近。金春英等[30]分離出1株沼澤紅假單胞菌CQV97,其對不同質(zhì)量濃度的 NH4+-N 和 NO2?-N 最大去除率分別為35%~96%和46.850%~99.998%;劉珍珠等[31]從冰川前緣原生裸地土壤中分離出1株為沼澤紅假單胞菌LG,菌株對NH+4-N的轉(zhuǎn)化率最高為65.71%,對NO3?-N的轉(zhuǎn)化率為95.58%,已有的研究表明光合細菌在養(yǎng)殖水體的NH4+-N和亞硝酸鹽降解中發(fā)揮了重要作用。

        本試驗分離篩選得到的菌株P(guān)-3在NH4+-N和NO?2-N質(zhì)量濃度為50 mg·L?1時,對NH+4-N和NO?2-N的降解率分別達89.68%和94.98%,同時對副溶血弧菌、鰻弧菌和創(chuàng)傷弧菌均具有抑制作用,具有復合功能,表現(xiàn)出潛在的開發(fā)應用前景。

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