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        基于ISSR分子標記的湖北野生夏枯草遺傳資源分析

        2021-10-21 02:47:30董元火白雪依廖新安夏恒建張文才王圣軍彭仕梅郭雙喜
        農(nóng)業(yè)與技術(shù) 2021年19期
        關(guān)鍵詞:資源

        董元火白雪依廖新安夏恒建張文才王圣軍彭仕梅郭雙喜

        (1.江漢大學生命科學學院/湖北省漢江流域特色生物資源保護開發(fā)與利用工程技術(shù)研究中心,湖北 武漢 430056;2.湖北省蘄春縣科學技術(shù)和經(jīng)濟信息局,湖北 蘄春 435399;3.李時珍醫(yī)藥集團有限公司,湖北 蘄春 435399;4.蘄春縣中醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展中心,湖北 蘄春 435399)

        2021年7月9日,習近平總書記主持召開中央全面深化改革委員會第二十次會議,審議通過了《種業(yè)振興行動方案》。會議強調(diào)必須推進種業(yè)振興,必須把民族種業(yè)搞上去,把種源安全提升到關(guān)系國家安全的戰(zhàn)略高度,實現(xiàn)種業(yè)科技自立自強、種源自主可控。

        種質(zhì)資源,又稱遺傳資源或基因資源,是培育作物和中藥材優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)的物質(zhì)基礎,是維系國家食物和藥品安全的重要保證[1]。中醫(yī)藥作為我國獨特的衛(wèi)生資源,在經(jīng)濟社會發(fā)展和促進人類健康中發(fā)揮著重要作用。種質(zhì)資源是中藥材生產(chǎn)的源頭,種質(zhì)的優(yōu)劣對中藥材產(chǎn)量和質(zhì)量有決定性作用[1]。種質(zhì)資源的遺傳多樣性是其影響中藥材質(zhì)量的根本內(nèi)在機理,研究保存物種的遺傳多樣性對其種質(zhì)資源的保護與利用以及育種有重要意義[2]。保護遺傳多樣性是生物多樣性保護工作中最根本的任務,也是實現(xiàn)可持續(xù)利用發(fā)展戰(zhàn)略的基本保障。

        夏枯草(Prunella vulgaris L.)隸屬唇形科夏枯草屬,因“夏至后即枯”得名,是常見傳統(tǒng)中藥之一。干燥果穗是主要的藥用部位,干燥果穗入藥稱“夏枯球”,全草入藥稱“夏枯草”。有清熱明目、瀉肝火、清熱散結(jié)、降壓、降糖、抗菌、抗炎、抗過敏、抗病毒及增強免疫力等功效[3]。2011年已被湖北省科技廳列為全省優(yōu)先發(fā)展的3大主要優(yōu)勢品種之一[4]。蘄春夏枯草,為國家地理標志產(chǎn)品,是蘄春精準脫貧的重要產(chǎn)業(yè)。

        目前,夏枯草的研究主要涉及藥材鑒別、化學成分、藥理作用、產(chǎn)品開發(fā)、生態(tài)學和種植等方面[4,5-10],而夏枯草野生遺傳資源的狀況和評價研究報道相對較少,董元火等[11]基于迷迭香酸的含量評價了湖北夏枯草野生種質(zhì)資源。中藥材野生品與栽培品的研究表明,野生與栽培藥材既存在差異又體現(xiàn)共性;野生品與栽培品既有質(zhì)量差異大的品種,如丹參、天麻、魚腥草等[12-14],又有質(zhì)量等同的品種,如防風、黃芩等[15,16],這與種質(zhì)資源密不可分。種質(zhì)資源是藥材生產(chǎn)的源頭,種質(zhì)的優(yōu)劣對產(chǎn)量和質(zhì)量具有決定性的影響。本研究擬基于ISSR分子標記的遺傳多樣性評價野生夏枯草種質(zhì)資源,為夏枯草種質(zhì)資源保護和品種改良、中藥材品質(zhì)的提高奠定基礎,助力夏枯草產(chǎn)業(yè)在鄉(xiāng)村振興中發(fā)揮重要作用。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        本研究的材料分別采自湖北的武漢、蘄春、襄陽和崇陽4個地方。根據(jù)研究所需,保證取樣間距5m以上,隨機采取夏枯草幼嫩葉片并用硅膠保存。提取夏枯草干燥葉片中的DNA,保存于-20℃冰箱中。由于襄陽和崇陽種群相對較小,因此該兩種群所取樣本較少。具體樣品數(shù)及相關(guān)信息見表1。

        表1 基于ISSR分析的4個野生夏枯草種群的樣品信息

        1.2 試驗方法

        1.2.1 夏枯草基因組DNA的提取及檢測

        采用改進的CTAB法[17]提取夏枯草葉片中的基因組DNA。采用瓊脂糖凝膠電泳和核酸蛋白分析儀(Eppendorf BioPhotometer plus,Eppendorf AG,Hamburg,Germany)分別測定其純度和濃度,選取260/280處OD值在1.8~1.9的DNA樣品進行ISSR-PCR擴增及分析。

        1.2.2 ISSR-PCR擴增

        從4個夏枯草種群中分別取1個DNA樣品,共選取4個DNA樣品進行引物篩選,所用ISSR引物是加拿大哥倫比亞大學公布設計的序列,具體見表2。PCR擴增后,對比可重復性、多態(tài)性及清晰度后,篩選確定擴增效果良好的引物。采用的PCR擴增儀為PTC-100TMthermocycler(MJ Research,Inc)。PCR反應體系參考廖麗等[18]研究方法,并作適當改進。

        ISSR-PCR反應體系(25μL):含有13μL雙蒸水,2.5μL(2.5mmol·L-1)dNTP,2.5μL 10×PCR Buffer(含10mmol·L-1Tris-HCl,1.5mmol·L-1MgCl2和50mmol·L-1KCl),1.0μL(25mmol·L-1)MgCl2,0.5μL Taq Polymerase,1.5μL引物(25pmol),4μL模版DNA。

        PCR反應參數(shù):94℃預變性5min;接35個循環(huán),每個循環(huán)為94℃變性30s,53℃復性(退火)45s,72℃延伸1.5min;最后72℃延伸7min。

        DNA樣品PCR擴增完成后,進行瓊脂糖凝膠電泳,再經(jīng)紫外凝膠成像系統(tǒng)檢測。

        1.2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析

        將ISSR-PCR產(chǎn)物電泳所有的條帶進行統(tǒng)計,同一位點條帶有標記為1,無標記為0。采用POPGENE32軟件[19]進行數(shù)據(jù)分析,主要統(tǒng)計參數(shù)包括多態(tài)位點百分率(PPB)、Nei′s基因多樣性(Ht)、Shannon′s信息指數(shù)(I)、遺傳一致性和遺傳距離。采用MEGA7.0.26軟件,基于Nei′s的遺傳距離,構(gòu)建4個種群的UPGMA聚類圖。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 ISSR有效引物

        從50個引物中,根據(jù)可重復性、多態(tài)性及清晰度,篩選確定擴增效果良好的9個引物,具體見表2。

        表2 ISSR引物序列以及每條引物擴增帶的情況

        2.2 PCR擴增結(jié)果

        利用篩選出的引物對夏枯草所有21個樣品進行PCR擴增,用瓊脂糖凝膠電泳系統(tǒng)檢測顯示,其檢測部分結(jié)果如圖1所示。

        圖1 引物809對部分DNA樣品擴增的ISSR電泳圖

        2.3 遺傳多樣性

        根據(jù)凝膠電泳圖譜條帶,采用POPGENE32分析顯示,武漢種群內(nèi)(WHX)和蘄春種群(QCX)多態(tài)性位點(PPB)分別為78.95%和75.44%,2個種群的遺傳多樣性比較高,而崇陽種群(CYX)遺傳多樣性最低,多態(tài)性位點為43.86%,具體見表3。4個種群總共的多態(tài)性位點為98.25%,物種水平Nei′s基因多樣性(Ht)和Shannon′s信息指數(shù)(I)分別為0.37和0.54。QCX和WHX種群間的遺傳一致性最大(0.8972),與2個種群間遺傳距離最小的結(jié)果相吻合。CYX與QCX種群間的遺傳一致性最小(0.7323),與之相適應的二者間的遺傳距離性最大(0.3115),其結(jié)果也相互應證。基于Nei′s的遺傳距離UPGMA聚類圖顯示崇陽種群(CYX)單獨分為一支,具體見圖2。

        表3 基于ISSR標記分析的4個夏枯草種群遺傳多樣性水平

        表4 4個種群的Nei氏遺傳一致性和遺傳距離

        圖2 基于Nei′s遺傳距離的4個野生夏枯草種群的

        3 討論與結(jié)論

        種質(zhì)資源遺傳多樣性是利用基因資源的基礎和引種、栽培及資源保護的基礎。從資源保護和利用的角度,必須要盡量多地保留遺傳多樣性[20]。在本研究中,ISSR分析顯示武漢種群內(nèi)多態(tài)性位點有78.95%,蘄春種群內(nèi)多態(tài)性位點有75.44%,襄陽種群內(nèi)多態(tài)性位點有52.63%,崇陽種群內(nèi)多態(tài)性位點為43.86%,表明武漢和蘄春的野生夏枯草的遺傳多樣性較高。因此,要更好地保護其高的遺傳多樣性種群,同時,在開展夏枯草“野轉(zhuǎn)家”種植時應該優(yōu)選考慮蘄春和武漢各種群夏枯草種植及技術(shù)研究,有效解決因長期人工大規(guī)模種植導致的產(chǎn)量和品質(zhì)下降的問題。4個種群總共的多態(tài)性位點有98.25%,物種水平Nei′s基因多樣性(Ht)和Shannon′s信息指數(shù)(I)分別為0.37和0.54,表明夏枯草在物種水平存在高水平的遺傳多樣性,具體見表3。與沈宇峰等[21]利用AFLP分子標記技術(shù)研究的夏枯草種質(zhì)資源遺傳多樣性中揭示的多態(tài)位點百分率93.91%結(jié)果相似,這說明基于ISSR分子標記的遺傳多樣性分析結(jié)果相對比較可靠,該技術(shù)可以有效運用在大多數(shù)植物的遺傳多樣性分析中。物種適應環(huán)境和保持進化潛力的物質(zhì)基礎是遺傳變異,一個物種的分布廣泛與否、種質(zhì)資源豐富與否都與該物種自身的遺傳多樣性有關(guān)。本研究顯示,武漢種群和蘄春的夏枯草的多態(tài)位點百分率高,表明遺傳多樣性較高,遺傳資源豐富,而崇陽夏枯草多態(tài)位點百分率最低,為43.86%,遺傳多樣性最低,遺傳資源相對不豐富,與崇陽夏枯草種群較小(種群面積20~30m2)有關(guān)。因此,要通過種群更新、恢復、擴繁及野生種質(zhì)資源交流,提高其遺傳多樣性。

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