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        兩例輸入性新冠肺炎患者核酸檢測(cè)結(jié)果分析*

        2021-10-12 09:03:48于翔翔楊煥森高玉朋朱曉露
        黑龍江醫(yī)藥 2021年17期
        關(guān)鍵詞:感染者核酸試劑盒

        于翔翔,楊煥森,毛 柯,于 其,高玉朋,朱曉露

        連云港市疾病預(yù)防控制中心,江蘇 連云港 222000

        新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)是引起新冠肺炎(COVID-19)的病原體,在2020年1月首次被我國(guó)學(xué)者鑒定[1-2],SARS-CoV-2屬于冠狀病毒科(Coronaviridae)β屬成員之一,RNA病毒,基因組全長(zhǎng)30 kb左右,外有囊膜,狀如“王冠”,有典型冠狀病毒特征,核苷酸序列與一種蝙蝠來(lái)源的冠狀病毒的同源性達(dá)86.9%~89.0%[3]。2019年12月新冠疫情暴發(fā),疫情迅速擴(kuò)散至世界各地,2020年3月11日,世衛(wèi)組織宣布新冠疫情已經(jīng)構(gòu)成全球性大流行[4]。近期境外輸入性病例增多[5],本研究選取連云港地區(qū)兩例SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陽(yáng)性入境人員的結(jié)果進(jìn)行比較,分析患者排毒規(guī)律及病毒傳染性強(qiáng)弱問(wèn)題,為以后新冠疫情的防控提供數(shù)據(jù)支持。

        1 資料與方法

        1.1 病例來(lái)源

        兩例新冠患者資料來(lái)自本中心2020年3月—5月收檢的病例,患者全部收治于連云港市傳染病定點(diǎn)醫(yī)院—第四人民醫(yī)院。本研究的病例采用咽拭子標(biāo)本中檢測(cè)出SARS-CoV-2核酸陽(yáng)性作為臨床確診COVID-19的依據(jù),相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)參考《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第七版)》[6]。兩例患者的相關(guān)臨床資料,見(jiàn)表1。

        表1 兩例新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)患者臨床病例資料情況

        1.2 資料收集

        對(duì)兩病例進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查分析,中心流調(diào)專(zhuān)員對(duì)病例開(kāi)展個(gè)案流行病學(xué)調(diào)查,收集資料的主要內(nèi)容包括患者一般情況、發(fā)病時(shí)間、流行病學(xué)史、癥狀等,資料真實(shí)準(zhǔn)確,具體方法參照《新型冠狀病毒感染的肺炎病例流行病學(xué)調(diào)查方案》[7]。

        1.3 樣品采集

        對(duì)兩例患者進(jìn)行咽拭子采集,送本中心進(jìn)行核酸檢測(cè),具體步驟參照《新型冠狀病毒肺炎防控方案(第四版)》[8]。

        1.4 檢測(cè)方法

        咽拭子的核酸提取使用碩士自動(dòng)核酸提取儀,提取試劑使用儀器配套核酸提取試劑,試劑批號(hào)20200324。核酸提取完成后,用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR方法進(jìn)行核酸檢測(cè),熒光PCR儀型號(hào)appliedbiosystems QuantiStudio 7 Pro,核酸檢測(cè)試劑使用兩種:伯杰生物科技股份有限公司生產(chǎn)的2019新冠狀病毒ORF1ab/N基因核酸檢測(cè)試劑盒(雙重?zé)晒釶CR法,批號(hào)20200309A)(簡(jiǎn)稱(chēng)“伯杰”)、中山大學(xué)達(dá)安基因股份有限公司生產(chǎn)的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法,批號(hào)2020019)(簡(jiǎn)稱(chēng)“達(dá)安”),具體步驟參照儀器及試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作,見(jiàn)表2。

        2 結(jié)果

        2.1 確診COVID-19病例1在確診治療及隨訪過(guò)程中新型冠狀病毒檢測(cè)結(jié)果分析

        本研究中病例1患者臨床癥狀為輕型,從第1次新型冠狀病毒核酸陽(yáng)性確診到連續(xù)兩次核酸陰性出院,周期是17天?;颊叱鲈汉蟮?天隨訪采集咽拭子檢測(cè)核酸,出現(xiàn)單通道陽(yáng)性(ORF1ab陽(yáng)性,Ct值37)情況,緊接著在隨后一天,也就是第8天采集咽拭子核酸檢測(cè),結(jié)果陰性,按照方案要求,此病例未計(jì)入出院后復(fù)陽(yáng)病例。出院第13天隨訪采樣檢測(cè),結(jié)果仍為陰性,見(jiàn)表3。

        表3 病例1在診療過(guò)程中新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)核酸檢測(cè)結(jié)果

        2.2 新型冠狀病毒無(wú)癥狀感染者病例2的核酸檢測(cè)結(jié)果分析

        病例2患者無(wú)臨床癥狀,在入境人員集中核酸篩查中檢測(cè)出新型冠狀病毒核酸陽(yáng)性,屬于無(wú)癥狀感染者。從第1次核酸陽(yáng)性確診到連續(xù)兩次核酸陰性出隔離點(diǎn),周期為44天。連續(xù)多天采樣,患者咽拭子中病毒核酸檢測(cè)Ct值由低變高,說(shuō)明咽拭子標(biāo)本中病毒載量由多變少,見(jiàn)表4。

        表4 病例2在診療過(guò)程中新型冠狀病毒核酸檢測(cè)結(jié)果

        3 討論

        2019年12月出現(xiàn)流行的SARS-CoV-2是β屬冠狀病毒成員之一[9-10],是引起新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的病原體。自2019年12月以來(lái),新型冠狀病毒出現(xiàn),并迅速擴(kuò)散到世界各地,引發(fā)大流行[4]。對(duì)新型冠狀病毒的研究雖有一定成績(jī),但在病毒檢測(cè)、COVID-19患者治療及無(wú)癥狀感染者防控等方面仍需深入探索。近期,入境歸國(guó)人員增加,多地出現(xiàn)入境人員中SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陽(yáng)性情況,引起專(zhuān)家學(xué)者的注意。本研究選取了近期入境人員中兩例SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陽(yáng)性患者進(jìn)行分析,通過(guò)檢測(cè)結(jié)果分析患者體內(nèi)SARS-CoV-2變化趨勢(shì),初步探討SARS-CoV-2感染患者后的不同情況及治療防控過(guò)程中可能遇到的問(wèn)題。

        兩例患者均是2020年3月入境人員,在集中核酸篩查過(guò)程中被檢測(cè)出新型冠狀病毒核酸陽(yáng)性,病例1有輕微臨床癥狀,屬輕型患者;病例2無(wú)明顯臨床癥狀,被認(rèn)為是無(wú)癥狀感染者。兩人檢出核酸陽(yáng)性后,分別被傳染病定點(diǎn)醫(yī)院收治入院。兩例患者首次新冠病毒核酸檢測(cè)陽(yáng)性時(shí)間均為2020年3月25日,均無(wú)基礎(chǔ)疾病。從1次SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陽(yáng)性確診到轉(zhuǎn)陰(連續(xù)兩次核酸檢測(cè)陰性)周期分別是:16天、43天,這表示兩例患者體內(nèi)清除病毒時(shí)間不同。有相關(guān)研究表明[11],新型冠狀病毒感染人體后,確診后的排毒時(shí)間最短為8天,中位排毒時(shí)間為20天,最長(zhǎng)可達(dá)37天。本研究中病例1排毒時(shí)間為16天,病例2排毒時(shí)間更是長(zhǎng)達(dá)43天,比報(bào)道中的最長(zhǎng)排毒時(shí)間還要長(zhǎng)6天。推測(cè)患者根據(jù)自身免疫情況清除病毒的時(shí)間不盡相同,患者癥狀輕重跟排毒時(shí)間無(wú)關(guān),反而無(wú)癥狀的感染者排毒時(shí)間更長(zhǎng)一些,不過(guò)這個(gè)結(jié)論需要更多數(shù)據(jù)支持。

        對(duì)本研究中兩例患者核酸檢測(cè)結(jié)果Ct值進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)在確診初期,SARS-CoV-2核酸檢測(cè)Ct值偏低,病例1首診ORF1ab/N雙通道Ct值為30/30,病例2首診ORF1ab/N雙通道Ct值為28/18,這表明在病程初期,患者體內(nèi)病毒含量高。之后的連續(xù)監(jiān)測(cè)過(guò)程中兩病例的核酸檢測(cè)Ct值均逐步升高,至病程末期,核酸檢測(cè)變?yōu)殛幮?,這表明在COVID-19及無(wú)癥狀感染的整個(gè)過(guò)程中,采集的標(biāo)本中病毒核酸含量越來(lái)越低,患者體內(nèi)病毒載量逐漸減弱到可檢測(cè)水平,推測(cè)隨著病程進(jìn)展,患者的傳染水平也逐漸降低。

        病例1在出院后第7天隨訪過(guò)程中出現(xiàn)SARS-CoV-2核酸檢測(cè)單通道陽(yáng)性(ORF1ab/N,37/—),緊接著第8天隨訪過(guò)程中SARS-CoV-2核酸檢測(cè)雙通道陰性(ORF1ab/N,—/—),按照方案要求,核酸檢測(cè)單通道陽(yáng)性者需重復(fù)檢測(cè),兩次均為陽(yáng)性者才可作為陽(yáng)性確診依據(jù),雖然病例1在出院隨訪過(guò)程中出現(xiàn)1次單通道陽(yáng)性情況,但緊鄰的第2天采樣檢測(cè)為陰性,未列入出院后陽(yáng)轉(zhuǎn)病例,但當(dāng)日核酸檢測(cè)結(jié)果熒光曲線起跳明顯,是典型“S”型曲線,分析原因可能是因?yàn)榛颊唧w內(nèi)依然攜帶病毒,只是處于低排毒水平,又或者是因?yàn)椴蓸尤藛T手法不同,采到的病毒含量在試劑檢出限水平徘徊。

        病例2在首次核酸檢測(cè)陽(yáng)性后被隔離治療觀察,之后的43天中咽拭子核酸檢測(cè)一直為陽(yáng)性,本病例是目前疫情期間連云港地區(qū)所有核酸檢測(cè)陽(yáng)性患者中排毒時(shí)間最長(zhǎng)的病例,對(duì)本病例的研究有特殊意義??v觀病例2的整個(gè)核酸檢測(cè)過(guò)程,Ct值從最初確診的雙通道陽(yáng)性28/18,到中期4月9日(29/29)、4月12日(31/32)、4月16日(34/34),再到后期4月27日(35/36)、4月30日(35/36)、5月6日(37/36),Ct值逐步升高,直至變成陰性。Ct值變化反映標(biāo)本中病毒含量情況,也間接反映患者排毒情況。表4中Ct值的變化提示隨著患者感染病毒時(shí)間的延長(zhǎng),體內(nèi)病毒載量逐漸降低,推測(cè)相應(yīng)的傳染性也會(huì)降低,但對(duì)于病程后期患者的傳染性高低還需流行病學(xué)數(shù)據(jù)的支持,因此對(duì)康復(fù)期及無(wú)癥狀感染者的密切接觸人群的監(jiān)測(cè)非常重要。

        本中心在疫情期間承擔(dān)全市部分初篩工作和全部陽(yáng)性患者核酸復(fù)核工作,在檢測(cè)過(guò)程中遇到假陰性問(wèn)題,筆者認(rèn)為在感染過(guò)程中,隨著患者自身免疫反應(yīng)及外界藥物治療,患者體內(nèi)病毒載量降低,疾病進(jìn)展過(guò)程中身體各部分排毒量不同,可能造成鼻拭子、咽拭子及肛拭子核酸檢測(cè)陰陽(yáng)性結(jié)果不同。對(duì)檢測(cè)結(jié)果產(chǎn)生假陰性的可能進(jìn)行分析:(1)標(biāo)本采集不合格,在標(biāo)本采集過(guò)程中未能采集足夠量的人體細(xì)胞,致使病毒含量低于試劑盒檢出限;(2)試劑盒靈敏度問(wèn)題,本研究中使用過(guò)兩種核酸檢測(cè)試劑盒,其中伯杰品牌中PCR循環(huán)數(shù)為40個(gè)循環(huán),達(dá)安品牌中PCR循環(huán)數(shù)為45個(gè)循環(huán),循環(huán)數(shù)越多相應(yīng)的收集熒光信號(hào)越強(qiáng),靈敏度越高,但相應(yīng)的特異性會(huì)降低,在病例2的檢測(cè)中曾同時(shí)使用這兩種試劑檢測(cè),在病程后期,出現(xiàn)兩種試劑盒核酸檢測(cè)結(jié)果不一致的情況,其中達(dá)安檢測(cè)陽(yáng)性,伯杰檢測(cè)陰性,這提示檢測(cè)結(jié)果跟試劑盒的靈敏度有關(guān);(3)與患者排毒情況有關(guān),隨著病程進(jìn)展,患者排毒量越來(lái)越低,造成采集的標(biāo)本中病毒含量處于檢測(cè)限邊緣;(4)與反復(fù)凍融標(biāo)本有關(guān),對(duì)于病毒含量低的標(biāo)本會(huì)出現(xiàn)第1次弱陽(yáng),凍融之后第二次檢測(cè)陰性的結(jié)果,這可能跟反復(fù)凍融破壞了標(biāo)本中的病毒核酸有關(guān)。

        現(xiàn)有研究表明,病毒的傳播能力一般與其對(duì)宿主的致病性呈負(fù)相關(guān),隨著傳播持續(xù),病毒基因組會(huì)朝提高傳播能力并降低致病性的趨勢(shì)進(jìn)化[12],大部分新出現(xiàn)的病毒一般具有致病性強(qiáng)和傳播能力弱,第一代病毒的首批感染者死亡率高的情況,但本次疫情新型冠狀病毒對(duì)人類(lèi)有很好的適應(yīng)性,并能在人與人間高效傳播,推測(cè)基礎(chǔ)傳染數(shù)R0在2~3之間。本次新冠疫情一開(kāi)始,我國(guó)就采取了強(qiáng)有力的防控措施,這在一定程度上減緩新冠病毒全球擴(kuò)散趨勢(shì)。本研究中病例2感染的新型冠狀病毒對(duì)患者無(wú)明顯致病性,但排毒天數(shù)長(zhǎng)達(dá)43天,這符合病毒朝低致病性進(jìn)化的規(guī)律,至于是否具有高傳播能力還需進(jìn)一步監(jiān)測(cè)。本次新冠疫情中的新型冠狀病毒屬于RNA病毒,基因組具有較高的突變率,容易出現(xiàn)跨種族傳播情況,病毒一旦突破種族屏障,容易引起大流行。

        本研究中兩例SARS-CoV-2核酸檢測(cè)陽(yáng)性患者均是3月入境人員,病例1有輕微臨床癥狀,屬輕型患者;病例2無(wú)明顯臨床癥狀,被認(rèn)為是無(wú)癥狀感染者。通過(guò)對(duì)整個(gè)病程及出院隨訪核酸檢測(cè),發(fā)現(xiàn)不同患者清除體內(nèi)新冠病毒的時(shí)間不盡相同,患者癥狀輕重跟排毒時(shí)間無(wú)關(guān),反而無(wú)癥狀的感染者排毒時(shí)間更長(zhǎng)一些,在COVID-19及無(wú)癥狀感染的整個(gè)過(guò)程中,采集的標(biāo)本中病毒核酸含量越來(lái)越低,患者體內(nèi)病毒載量逐漸減弱到可檢測(cè)水平,推測(cè)隨著病程進(jìn)展患者的傳染水平也逐漸降低,但對(duì)于病程后期患者的傳染性高低還需流行病學(xué)數(shù)據(jù)的支持,因此對(duì)康復(fù)期及無(wú)癥狀感染者的密切接觸人群的監(jiān)測(cè)非常重要。另外,本研究中病例2感染的新型冠狀病毒對(duì)患者無(wú)明顯致病性,但排毒天數(shù)長(zhǎng)達(dá)43天,這符合病毒朝低致病性進(jìn)化的規(guī)律。

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