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        血涂片自動(dòng)圖像掃描及識(shí)別系統(tǒng)在瘧疾檢測中的應(yīng)用

        2021-09-24 02:42:10張建明通信作者廣州國際旅行衛(wèi)生保健中心廣東廣州510635
        口岸衛(wèi)生控制 2021年4期
        關(guān)鍵詞:閱片瘧原蟲瘧疾

        吳 健 陳 嘉 顏 杰 張建明(通信作者) 廣州國際旅行衛(wèi)生保健中心(廣東,廣州,510635)

        鄧卓暉 裴福全 林榮幸 廣東省疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病研究所(廣東,廣州,511430)

        瘧疾是嚴(yán)重危害人類健康的重要寄生蟲病,2020 年世界衛(wèi)生組織《瘧疾報(bào)告》[1]數(shù)據(jù)顯示2019年全球瘧疾感染病例2.29 億,死亡病例40.9 萬。

        瘧疾預(yù)防的關(guān)鍵在于病例早發(fā)現(xiàn)、早治療。 隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步, 新的瘧疾檢測方法應(yīng)運(yùn)而生,但也存在一定的局限性,相對而言人工顯微鏡檢查法成本低、準(zhǔn)確度高,可以進(jìn)行蟲種鑒定,在瘧疾的診斷和治療中仍然有著不可替代的作用,一直是瘧疾診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”[2]。但是,顯微鏡檢查需要技術(shù)人員經(jīng)過專業(yè)的訓(xùn)練,積累長期的經(jīng)驗(yàn),具備純熟的技能,而且人工顯微鏡檢勞動(dòng)強(qiáng)度大,技術(shù)人員易產(chǎn)生疲勞而導(dǎo)致檢測結(jié)果受到影響。 本項(xiàng)目應(yīng)用人工智能技術(shù),開發(fā)可用于瘧原蟲血涂片自動(dòng)掃描存儲(chǔ)圖像信息、自動(dòng)識(shí)別瘧原蟲的自動(dòng)圖像掃描和識(shí)別系統(tǒng)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 瘧原蟲自動(dòng)圖像掃描及識(shí)別系統(tǒng)(以下簡稱系統(tǒng))

        1.1.2 瘧原蟲陰性及陽性薄血膜涂片 收集2017-2020 年10 月期間廣東省疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病研究所保存的來源于廣東省內(nèi)瘧疾確診病例的薄血膜涂片434 張,包括陽性薄血膜392 張,陰性薄血膜42 張。 陽性薄血膜包含惡性瘧原蟲252 例、卵形瘧原蟲73 例、間日瘧原蟲51 例、三日瘧原蟲8例以及混合感染8 例。

        1.2 方法

        1.2.1 薄血膜涂片自動(dòng)圖像采集 推片染色制作好的薄血膜涂片放置到專用玻片架上,在掃描區(qū)域滴加鏡油,玻片架每次可放5 張,設(shè)置相應(yīng)的掃描視野數(shù),放入玻片架,啟動(dòng)設(shè)備,自動(dòng)進(jìn)行圖像對焦、掃描和存儲(chǔ)。

        1.2.2 薄血膜自動(dòng)識(shí)別 系統(tǒng)利用人工智能軟件對所掃描的圖像進(jìn)行自動(dòng)識(shí)別,對判斷為瘧原蟲的圖像進(jìn)行標(biāo)注, 包括不同發(fā)育時(shí)期的瘧原蟲形態(tài)(環(huán)狀體、滋養(yǎng)體、裂殖體、配子體),并根據(jù)判斷結(jié)果進(jìn)行如下提示:

        1)目標(biāo)物少,需人工審閱;

        2)可確定為pf;

        3)pf 可能性較大;

        4)pv 或po 可能性較大;

        5)無提示。

        其中,提示第2)至4)即可判斷為鏡檢陽性。

        (注:pf 指惡性瘧原蟲,pv 指間日瘧原蟲,po 指卵形瘧原蟲,pm 指三日瘧原蟲)

        1.2.3 人工閱片

        1.2.3.1 人工鏡下閱片: 由閱片經(jīng)驗(yàn)豐富的專業(yè)技術(shù)人員按照常規(guī)方法進(jìn)行人工鏡下閱片,判斷是否感染瘧原蟲及所感染瘧原蟲種類。

        1.2.3.2 圖像人工審閱 調(diào)取系統(tǒng)自動(dòng)采集的每個(gè)薄血膜視野的圖像信息進(jìn)行人工審閱,首先審閱系統(tǒng)標(biāo)注且顯示出的瘧原蟲形態(tài),其次逐個(gè)審閱系統(tǒng)拍攝的每個(gè)視野圖像信息,綜合驗(yàn)證系統(tǒng)對瘧原蟲檢測的準(zhǔn)確性。

        2 結(jié)果

        2.1 閱片數(shù)量及無效原因

        人工及系統(tǒng)分別閱片434 張,其中有效薄血膜涂片308 張,無效薄血膜涂片126 張。 無效的原因主要為血涂片本身質(zhì)量問題, 最多見的是溶血,其次是薄血膜厚薄不均勻、染色過深造成染料團(tuán)塊沉積或過淺細(xì)胞未著色、雜質(zhì)過多、甲醇不純,細(xì)胞固定不佳、樣本保存不當(dāng),薄血膜劃痕較多等。

        2.2 系統(tǒng)自動(dòng)掃描時(shí)間

        經(jīng)統(tǒng)計(jì),系統(tǒng)自動(dòng)掃描時(shí)間為每張薄血膜涂片掃描500 個(gè)視野用時(shí)6min, 掃描1000 個(gè)視野用時(shí)9min。 系統(tǒng)自動(dòng)掃描時(shí)間包含了薄血膜涂片自動(dòng)圖像采集和薄血膜自動(dòng)識(shí)別時(shí)間。

        人工鏡下閱片時(shí)間根據(jù)薄血膜中瘧原蟲的密度、分布范圍、感染情況而有所不同,每張薄血膜涂片閱片時(shí)間可在3-30min 不等。

        2.3 系統(tǒng)對瘧原蟲識(shí)別的準(zhǔn)確性

        以人工鏡下閱片的診斷結(jié)果為金標(biāo)準(zhǔn),設(shè)置系統(tǒng)每張薄血膜自動(dòng)掃描500 個(gè)視野,并對識(shí)別出的瘧原蟲蟲體形態(tài)進(jìn)行標(biāo)注,人工審閱系統(tǒng)標(biāo)注的陽性圖像,認(rèn)為所有的標(biāo)注中,只要出現(xiàn)一個(gè)標(biāo)注是瘧原蟲即視為陽性,比較人工鏡下閱片與系統(tǒng)閱片的結(jié)果,見表1。

        表1 人工鏡下閱片與系統(tǒng)閱片結(jié)果比較

        經(jīng)卡方檢驗(yàn),人工鏡下閱片與系統(tǒng)閱片兩種方式對瘧原蟲陽性涂片檢出結(jié)果一致,兩種閱片方式檢出結(jié)果無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(Χ2=198.31,P=0.258),系統(tǒng)閱片對瘧原蟲陽性涂片的檢出率為96.3%。

        圖1 拍攝20×25 共500 個(gè)視野的總覽,“點(diǎn)擊獲取實(shí)時(shí)識(shí)別信息”可看到四種標(biāo)注形態(tài)。

        圖1 鏡下標(biāo)記瘧原蟲圖像

        圖2 為惡性瘧原蟲環(huán)狀體,系統(tǒng)對拍攝到的視野進(jìn)行識(shí)別,自動(dòng)標(biāo)注出環(huán)狀體形態(tài),以左側(cè)小圖顯示,點(diǎn)擊小圖可顯示大圖,如右側(cè)圖,紅框處為該環(huán)狀體。 系統(tǒng)支持回到該視野功能,點(diǎn)擊“回到”可返回視野位置,通過顯微鏡人工觀察。

        圖2 鏡下標(biāo)標(biāo)球狀體及放大圖

        2.4 系統(tǒng)對瘧原蟲蟲種識(shí)別的準(zhǔn)確性

        結(jié)果見表2。經(jīng)卡方檢驗(yàn),系統(tǒng)對不同種類瘧原蟲的蟲種鑒定能力有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異 (Χ2=14.328,P<0.001), 其中對惡性瘧原蟲的識(shí)別和蟲種鑒定能力最強(qiáng),鑒定正確率可達(dá)到90.9%。

        表2 系統(tǒng)對瘧原蟲蟲種的識(shí)別結(jié)果

        2.5 不同掃描視野數(shù)的檢測結(jié)果

        取低密度(密度小于1000/μL)瘧原蟲陽性薄血膜22 張,陰性薄血膜10 張,分別進(jìn)行500 視野/片和1000 視野/片掃描,結(jié)果如表3。

        表3 不同掃描視野數(shù)的檢測結(jié)果

        經(jīng)卡方檢驗(yàn), 進(jìn)行500 和1000 視野/片兩種不同視野數(shù)的掃描時(shí),瘧原蟲的陽性檢出率無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(Χ2=54.824,P=0.657)。

        3 討論

        隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,借助其快速、自動(dòng)的優(yōu)勢,結(jié)合數(shù)字圖像處理和模式識(shí)別的自動(dòng)識(shí)別研究正成為病原學(xué)臨床輔助診斷的新興方向。 自動(dòng)圖像識(shí)別系統(tǒng)是將傳統(tǒng)的人工識(shí)別與計(jì)算機(jī)圖像處理及模式識(shí)別相結(jié)合的技術(shù),通過采集大量圖像信息,對目標(biāo)圖像的顏色、紋理、形狀、染色特性等圖像特征進(jìn)行自動(dòng)提取和分析,根據(jù)人工智能算法進(jìn)行數(shù)據(jù)處理形成的一套識(shí)別系統(tǒng),可實(shí)現(xiàn)對各類病原體鏡下圖像的自動(dòng)分類識(shí)別。 在寄生蟲卵、抗酸桿菌等的臨床輔助診斷方面已有初步應(yīng)用[3-4]。

        瘧原蟲的自動(dòng)圖像識(shí)別系統(tǒng)通過自動(dòng)而快速地識(shí)別被瘧原蟲感染的細(xì)胞并鑒定所感染的瘧原蟲種類,在人力條件不允許的情況下,可以及時(shí)有效地檢出瘧疾病例,極大減少瘧疾診斷對技術(shù)人員的依賴,有利于有效控制瘧疾傳播,對瘧疾防控具有重要意義。 國外學(xué)者較早開展了相關(guān)研究,其研究表明通過利用專門的圖像處理和模式識(shí)別算法對顯微圖像進(jìn)行自動(dòng)處理是一種可行的自動(dòng)化診斷方法[5-8]。 國內(nèi),殷竹君等較早對100 張瘧原蟲血液涂片進(jìn)行識(shí)別簽定,總體識(shí)別率達(dá)90%[9]。

        本研究通過對大量即往瘧疾病例的薄血膜圖像掃描,分析提取其不同蟲種、蟲種不同生活周期的形態(tài)特征,應(yīng)用人工智能神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的自我學(xué)習(xí)功能,建立起一套瘧原蟲自動(dòng)識(shí)別系統(tǒng)。

        從檢測結(jié)果可以看出,自動(dòng)識(shí)別系統(tǒng)可以較為準(zhǔn)確地抓取到瘧原蟲的各類圖像,其陽性檢出率可達(dá)到96.3%;從瘧原蟲蟲種識(shí)別情況看,系統(tǒng)對各種瘧原蟲的辨識(shí)能力各不相同,其中以對惡性瘧原蟲的蟲種鑒定能力最強(qiáng),可以達(dá)到90%左右,但是對于間日瘧、卵形瘧、三日瘧、混合感染的鑒定能力不足,分析原因可能因?yàn)椋簮盒辕懺x感染在全球范圍內(nèi)都占絕大多數(shù)(90%以上),卵形瘧、間日瘧及三日瘧感染病例數(shù)占比很少,尤其三日瘧,因此能夠獲得的陽性涂片數(shù)量不足,可供系統(tǒng)學(xué)習(xí)的圖像數(shù)量有限。

        因?yàn)楸⊙ぶ械寞懺x蟲體形態(tài)特征明顯,易于識(shí)別和分辨, 而在厚血膜中形態(tài)特征不明顯,且因溶血而缺少了血細(xì)胞的參照, 更給識(shí)別增加難度,因此本研究主要針對薄血膜進(jìn)行,國內(nèi)外的研究也多是如此。 但Kaewkamnerd 等[10]也曾報(bào)道針對厚血膜開發(fā)的瘧原蟲自動(dòng)識(shí)別軟件,主要利用惡性瘧原蟲與間日瘧原蟲染色質(zhì)的大小進(jìn)行區(qū)分,結(jié)果其間日瘧鑒定準(zhǔn)確性為75%,惡性瘧鑒定準(zhǔn)確性則可達(dá)到90%。

        如何減少因薄血膜靈敏度低而造成的假陰性,尤其是血涂片中瘧原蟲密度低時(shí)(<1000/μL),是需要思考和解決的問題。 我們選取部分密度較低的血涂片,分別進(jìn)行500 視野與1000 視野的掃描,結(jié)果表明在增加掃描視野后, 檢出陽性率略有提高,但是經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,結(jié)果不具有顯著性差異,但不排除掃描視野數(shù)再增加后可能發(fā)生的變化。

        在對大量血涂片的圖像掃描研究中發(fā)現(xiàn),不同實(shí)驗(yàn)室的血涂片質(zhì)量參差不齊,所采用的染色方法也存在瑞氏染色和姬姆薩染色兩種不同,為圖像自動(dòng)識(shí)別帶來不便。 前期血涂片制備的標(biāo)準(zhǔn)化可明顯改善圖像的質(zhì)量,提高圖像識(shí)別的敏感性、準(zhǔn)確性,因此集合制片、染片和圖像掃描于一體的自動(dòng)化標(biāo)準(zhǔn)化設(shè)備是本項(xiàng)目后續(xù)的研究方向。

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