關(guān)淑仙,黃輝躍,汪仁全,王相權(quán),王仕林,榮飛雪,楊杰智, 鐘光躍,周海燕,陳新媛,李 明,黃書盈
(四川省內(nèi)江市農(nóng)業(yè)科學(xué)院,四川內(nèi)江 641000)
由于大多數(shù)育種單位多年的定向育種,導(dǎo)致小麥的遺傳基礎(chǔ)日益狹窄,抵御風(fēng)險的能力逐漸下降[1-2]。評價材料的遺傳多樣性有利于小麥育種親本的選擇,從而避免使用同一骨干親本。在遺傳分析中,分子標記是常用的工具。這些分子標記能方便和快捷地跟蹤一些優(yōu)良性狀/基因,但是分子標記不能反映染色體區(qū)段的具體結(jié)構(gòu)變異。而植物染色體核型分析是研究植物染色體數(shù)量及結(jié)構(gòu)變異、形態(tài)結(jié)構(gòu)特征和物種起源與進化關(guān)系的重要方法,在植物育種中具有重要應(yīng)用價值[3-6]。近年來,在植物染色體核型分析中越來越多的研究采用某些克隆重復(fù)序列或寡核苷酸序列為探針,利用熒光原位雜交技術(shù)(FISH)技術(shù)建立FISH核型圖。FISH技術(shù)是一種根據(jù)堿基互補配對原則,使帶有熒光物質(zhì)的探針與目標DNA接合,最后用熒光顯微鏡可直接觀察目標DNA所在的位置。近幾年利用FISH技術(shù),在小麥染色體結(jié)構(gòu)變異和外源染色體識別方面已經(jīng)有很多報道[7-8]。利用寡核苷酸探針和FISH技術(shù),可以反映不同小麥品種(系)的染色體結(jié)構(gòu)差異[9]。Tang等[10]利用寡核苷酸序列探針pTa535和pSc119.2,清晰地識別了小麥A、B和D基因組染色體,并建立了中國春的標準FISH核型圖。Huang等[9 ]利用一系列寡核苷酸序列探針,對373個栽培品種及骨干親本進行FISH分析,發(fā)現(xiàn)了大量的多態(tài)類型和結(jié)構(gòu)變異,并根據(jù)FISH核型對其進行分類。蒽 瑋等[11]通過對南麥號系列小麥品種進行FISH核型分析,明確了南麥號系列小麥品種及其親本的染色體結(jié)構(gòu)特點。因此,利用基于寡核苷酸探針的FISH技術(shù),可以快速、方便地分析小麥親本及其衍生系的染色體結(jié)構(gòu)差異,進而跟蹤親本染色體結(jié)構(gòu)在衍生系中的變異情況。內(nèi)麥系列品種(系)是由四川省內(nèi)江市農(nóng)業(yè)科學(xué)院選育的高產(chǎn)且高抗條銹病品種(系),連續(xù)多年遴選為四川省及全國主導(dǎo)品種,在長江上游區(qū)廣泛種植,取得顯著的社會經(jīng)濟效益。本研究利用內(nèi)麥號系列品種(系)進行染色體核型分析,研究這些材料的染色體結(jié)構(gòu)變異情況,以期為小麥育種提供更為直觀的遺傳變異參考。
21份普通小麥(AABBDD,2n=42)材料(表1),均由四川省內(nèi)江市農(nóng)業(yè)科學(xué)院選育。中國春(CS)作為FISH核型的對照。
每份材料隨機選取5粒種子,置于濕潤濾紙的培養(yǎng)皿中,4 ℃過夜(約24 h),露白后轉(zhuǎn)移到 23 ℃恒溫培養(yǎng)箱中。待根長達到1~2 cm時剪取,用一氧化二氮密封處理4 h,之后用乙酸固定5~10 min,70%乙醇保存[13]。取根尖2~3 mm部分,在纖維素酶/果膠酶溶液(2∶1,w/w)中酶解,得到的懸浮液滴到載玻片上,于顯微鏡下鏡檢并拍照[12]。
熒光原位雜交過程參照Hao等[13]的方法進行,所有材料的FISH核型分析參照Tang等[9]的標準。利用TAMRA(6-carboxytetramethylrhodamine)和6-FAM(6-carboxy-fluorescein)分別標記的寡核苷酸pTa535和pSc119.2作為探針(pTa535和pSc119.2探針能清晰識別普通小麥A、B和D基因組所有染色體),對所有材料進行FISH核型分析。pTa535和pSc119.2兩種重復(fù)序列最初分別來源于普通小麥和黑麥。pTa535和pSc119.2兩種寡核苷酸探針均由上海生工生物工程股份有限公司合成。
利用pSc119.2和pTa535探針對21份材料和中國春根尖細胞進行原位雜交分析,建立了FISH標準核型圖(圖1)。從pSc119.2的FISH帶型看,有5份材料(內(nèi)麥482、內(nèi)麥0821、內(nèi)麥919、內(nèi)麥071和內(nèi)麥854)含1RS/1BL易位染色體。這5份1RS/1BL易位系材料在之間的試驗中高抗條銹病,為今后培育高抗條銹病材料提供了新的育種資源。
所有材料的B基因組染色體以及2D和4D染色體上都有pSc119.2信號。A基因組染色體上的pSc119.2信號有7種類型:1、1A、2A、5A和6A染色體上均有pSc119.2信號(內(nèi)麥366); 2、4A、5A和6A染色體上均有pSc119.2信號(內(nèi)麥9號、杏麥2號、靖麥19、內(nèi)麥2889、內(nèi)麥836和內(nèi)麥316);3、5A和6A染色體上均有pSc119.2信號(內(nèi)麥5348); 4、4A和6A染色體上均有pSc119.2信號(內(nèi)麥482);5、4A和5A染色體上均有pSc119.2信號(中國春、內(nèi)麥561、內(nèi)麥919、內(nèi)麥071和內(nèi)麥673); 6、僅5A染色體上有pSc119.2信號(內(nèi)麥416、內(nèi)麥866和內(nèi)麥101);7、僅4A染色體上有pSc119.2信號(內(nèi)麥0821、內(nèi)麥538、內(nèi)麥7538、內(nèi)麥854和內(nèi)麥5348)。以上結(jié)果說明,A基因組染色體遺傳變異較豐富,尤其是在5A染色體上。在D基因組中,pSc119.2信號還出現(xiàn)在1D(內(nèi)麥673和內(nèi)麥101) 和3D(內(nèi)麥482、內(nèi)麥0821、內(nèi)麥538、內(nèi)麥7538、內(nèi)麥854、內(nèi)麥510、內(nèi)麥561、內(nèi)麥919、內(nèi)麥071、內(nèi)麥673、內(nèi)麥416和內(nèi)麥866)染色體上。pSc119.2信號在1D、2D、3D和4D染色體的變異類型只有1~2種(圖2),說明D基因組染色體遺傳變異低。所有B染色體上都有pSc119.2信號,但變異類型也只有1~2種(5B和6B染色體除外)(圖2),說明B基因組染色體遺傳變異較低。pTa535在所有材料的D基因組染色體、除5A外的其他A基因組染色體以及3B、6B和7B染色體上分別有強、較強和弱信號。同時,在中國春和內(nèi)麥101的5A染色體長臂上有較強的pTa535信號。pSc119.2和pTa535探針信號表明,A基因組染色體有較高的變異,而B和D基因組染色體有較低的變異。所以在今后的育種過程中,選擇雜交親本時要注意B和D基因組染色體的遺傳變異,這樣才能豐富育成品種的遺傳多樣性。
表1 21份材料的來源及審定情況Table 1 Source and approval status of the 21 materials
在21份小麥材料中共鑒定出49種染色體多態(tài)類型(圖2)。A基因組染色體多態(tài)類型數(shù)量最多(22種),其次是B基因組(14種)和D基因組(13種)。所有材料每條染色體上多態(tài)類型出現(xiàn)頻率最高的被認定為類型1(5A除外),其頻率范圍為29%~100%,平均約83%。類型1是每條染色體上最占優(yōu)勢的類型。每條染色體上多態(tài)類型頻率次于類型1的被認定為類型2,頻率為 5%~38%,平均約19%。類型2是每個染色體上第二常見的類型,有一定的選擇優(yōu)勢。每條染色體除類型1和類型2外,其他多態(tài)類型頻率為5%~19%,平均約8%。這些較低頻率的染色體多態(tài)類型可能在適應(yīng)特定環(huán)境的品種中具有 優(yōu)勢。
在A基因組染色體中,5A和6A染色體分別有7種和4種變異類型,而其余染色體都不超過3種。在B基因組染色體中,5B染色體有4種變異類型,其余染色體都不超過3種。在D基因組染色體中,變異類型最高的是3D染色體(3種),其余染色體的變異類型為1~2種(圖2)。以上結(jié)果表明,不同染色體的變異類型數(shù)量不一致,推測在育種過程中變異類型數(shù)量多的染色體在不斷進化,而沒有變異或者變異少的染色體比較保守。5B、6B、3D和7D染色體的同源染色體之間存在不對稱核型(圖2)。pSc119.2信號分別在一條5B染色體的長臂和一條6B染色體的短臂上消失,pTa535信號分別在一條3D染色體的長臂和一條7D染色體的短臂上消失。以上染色體的不對稱核型可能是由染色體結(jié)構(gòu)變異引起。
根據(jù)A、B和D基因組染色體的FISH核型類型,把21份材料分為16類(表2)。其中內(nèi)麥538、內(nèi)麥7538和內(nèi)麥510的FISH核型一致;靖麥19、內(nèi)麥2889和內(nèi)麥836的FISH核型一致;內(nèi)麥919和內(nèi)麥071的FISH核型一致。其他材料的FISH核型都不一致。內(nèi)麥538、內(nèi)麥7538與內(nèi)麥510的親本不同,但其FISH核型一致,這說明它們的雜交親本的遺傳背景可能相似。內(nèi)麥5348與內(nèi)麥101的親本相同,但其FISH核型卻不一致,說明親本一樣的衍生系后代在染色體結(jié)構(gòu)上可能會發(fā)生變異(表1和表2)。
構(gòu)建植物染色體FISH核型圖,在植物的分類、進化以及育種研究中具有重要意義[14-15]。Huang等[9]根據(jù)373個小麥栽培品種及骨干親本的高清FISH核型,鑒定出167種染色體多態(tài)類型。同時在148個品種中發(fā)現(xiàn)14種染色體結(jié)構(gòu)變異類型,包括易位、倒位和缺失等。在染色體多態(tài)類型方面,本研究結(jié)果與Huang等[9]結(jié)果一致,多態(tài)類型的數(shù)量都是A基因組>B基因組>D基因組。本研究只發(fā)現(xiàn)49種染色體多態(tài)類型,可能是研究材料比較少的原因造成的。本研究只發(fā)現(xiàn)5B、6B、3D和7D染色體上均出現(xiàn)核型不對稱的現(xiàn)象。原因可能是所用探針只有pSc119.2和pTa535,而這兩個探針不能識別出更多的染色體的結(jié)構(gòu)變異。
FISH核型對小麥的分類以及親本的追溯起到重要作用[9,11]。本研究選取21份內(nèi)麥系列小麥品種(系)材料,根據(jù)它們的雜交親本了解雜交后代染色體結(jié)構(gòu)變異,結(jié)果發(fā)現(xiàn),雜交組合親本相同的后代品種FISH核型不一致,可能是由于染色體結(jié)構(gòu)變異造成的[11];同時也發(fā)現(xiàn),雜交組合親本不同的后代品種FISH核型一致,可能是親本FISH核型一致或者是遺傳背景相似[9]。21份材料根據(jù)A、B和D基因組染色體的FISH核型將這些材料分成了16類,說明這些材料遺傳多樣性較高,并且一些品種(系)有自己獨特的FISH核型[7]。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),在這16類中很多只是在少數(shù)染色體(5A、6A、5B、6B和1D等)上有信號差異,同時每條染色體多態(tài)類型出現(xiàn)頻率最高的占比29%~100%,其他類型占比5%~38%(圖 2),在育種過程中,一些染色體有選擇優(yōu)勢,而其他染色體較保守[9]。本研究結(jié)果表明,F(xiàn)ISH技術(shù)可以推測小麥品種系譜,反映染色體之間的交換重組關(guān)系。因此,可以建立內(nèi)麥系列小麥品種(系)染色體FISH核型,從染色體結(jié)構(gòu)水平來反映品種間的遺傳多樣性,從而推斷小麥品種(系)的演變過程。
表2 21份小麥材料A、B、D基因組的FISH核型類型Table 2 FISH karyotypes of A,B and D genomes of the 21 wheat materials
綜上所述,利用FISH技術(shù)可以反映小麥品種(系)的染色體結(jié)構(gòu)差異,進行染色體跟蹤,可以明確小麥染色體結(jié)構(gòu)組成及遺傳背景,為下一步的分子標記育種提供可靠的參考。