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        草魚Rab1A基因的克隆表達(dá)、抗體制備及對微囊藻毒素-LR的響應(yīng)

        2021-09-13 07:28:22阮記明梁惜梅林長高隗黎麗
        核農(nóng)學(xué)報 2021年9期
        關(guān)鍵詞:草魚鯉魚克隆

        何 麗 劉 林 阮記明 周 穎 梁惜梅 林長高 隗黎麗

        (江西農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,江西 南昌 330045)

        在真核生物中,小分子三磷酸鳥苷(guanosine triphosphate,GTP)結(jié)合蛋白家族是一類能夠結(jié)合GTP的蛋白質(zhì),該家族包括Ras、Rho、Rab (ras-associated binding-GTPase)、Sar/Arf 和Ran 5 個亞家族,Rab 是其中最大的亞家族[1],它編碼的蛋白質(zhì)以單體的形式存在,一般由200~210 個氨基酸組成,包含高度保守的GTPase 結(jié)構(gòu)域、GTP/GDP 結(jié)合結(jié)構(gòu)域和可變的N 端和C 端[2]。Rab 蛋白不僅對維持正確的細(xì)胞穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要,而且對特定的細(xì)胞功能也非常重要[3]。不同的Rabs 蛋白是突觸囊泡運(yùn)輸?shù)闹匾{(diào)節(jié)因子,在細(xì)胞增殖分子或是凋亡中發(fā)揮重要作用[4-5]。Rab 蛋白由鳥苷酸交換因子(guanine nucleotide exchange factor,GEFs)激活[6],其活性受到GTP 結(jié)合形式(活性狀態(tài))和GDP 結(jié)合形式(非活性狀態(tài))的嚴(yán)格調(diào)控[7],激活的Rab 蛋白通過招募外殼蛋白、激酶、磷酸酶等效應(yīng)分子觸發(fā)下游膜運(yùn)輸事件[8-9]。

        在人類中發(fā)現(xiàn)的Rab 蛋白至少有60 種[10],其中,Rab1A 蛋白作為Ras 超家族的一員,最初被描述為高爾基體(Golgi-resident) Rab,參與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)到高爾基體的運(yùn)輸[11]。有研究表明,Rab1A 蛋白作為分子開關(guān)還可調(diào)節(jié)其他類型的細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn)事件,如早期內(nèi)吞囊泡的運(yùn)動[12]。Rab1A 蛋白作為一種高度保守的蛋白質(zhì),已在158 種不同生物體中被發(fā)現(xiàn)[13],但在魚類中報道較少[14]。草魚(Ctenopharygodon idella)屬鯉形目鯉科,是我國一種重要的淡水養(yǎng)殖魚類,2018年的總產(chǎn)量達(dá)到了5.5×109kg,占淡水養(yǎng)殖魚類總產(chǎn)量的21.63%[15]。近年來,由于投餌以及養(yǎng)殖密度的增加,極易造成養(yǎng)殖池塘的富營養(yǎng),從而導(dǎo)致藍(lán)藻水華的暴發(fā),隨之釋放到水環(huán)境中的微囊藻毒素(microcystins,MCs)對草魚會產(chǎn)生一定的脅迫。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的MCs 有100 多種異構(gòu)體,其中最普遍且毒性較大的為微囊藻毒素-LR (microcystins-LR,MC-LR)[16]。

        前期對MC-LR 誘導(dǎo)后的草魚肝臟進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,發(fā)現(xiàn)Rab1A基因有差異表達(dá)[17]。在此基礎(chǔ)上,本研究對Rab1A基因全長進(jìn)行克隆、構(gòu)建原核表達(dá)載體、制備多克隆抗體,并從轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平分析Rab1A經(jīng)MCs 異構(gòu)體中的MC-LR 誘導(dǎo)后的表達(dá)變化,旨在為進(jìn)一步探索草魚Rab1A基因在響應(yīng)MC-LR 脅迫中的作用提供理論基礎(chǔ),為深入研究草魚Rab1A 蛋白的結(jié)構(gòu)和功能提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        草魚購自江西省南昌神龍漁業(yè)公司養(yǎng)殖基地,體重22.13±2.17 g,體長12.09±1.33 cm。草魚暫養(yǎng)于實(shí)驗室中,持續(xù)充氧,水溫20±0.2℃,光周期同自然光,暫養(yǎng)期間投喂商品飼料,日投餌量按體重的2%計算,早晚各1 次。暫養(yǎng)2 周后,取健康無傷的3 尾草魚,先尾靜脈取血,隨后分離鰓、皮膚、肌肉、肝、脾、腸道、體腎、心臟以及頭腎置于液氮中保存,用于草魚Rab1A組織分布特征分析。隨后將120 尾草魚隨機(jī)分組,包括1 個對照組和3 個處理組,每組設(shè)置3 個重復(fù),每個重復(fù)包括10 尾魚,經(jīng)腹腔注射染毒,MC-LR劑量分別為0、25、75 和100 μg·kg-1,對照組注射等量生理鹽水,試驗期間沒有魚死亡。注射96 h 后,分別從各不同劑量的處理組和對照組中分別取6 尾魚分離肝臟樣品置于液氮保存,用于Rab1A基因及蛋白表達(dá)分析。

        1.2 草魚Rab1A 基因cDNA 的克隆

        取出保存于液氮中的肝臟用TRIzol (美國Invitrogen 公司)提取RNA,隨后用Super SMARTTMPCR cDNA Synthesis Kit (美國Clontech 公司)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA 模板。根據(jù)草魚轉(zhuǎn)錄組測序的序列設(shè)計擴(kuò)增草魚Rab1A基因的PCR 引物(Rab1A-MF:5′-GACTATTT ATTCAAGCTG-3′,Rab1A-MR:5′-TCAGCAGCAGCCTCC AGA-3′),以肝臟cDNA 模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,獲得Rab1A基因的中間片段。再根據(jù)得到的中間片段設(shè)計3′cDNA 末端快速擴(kuò)增技術(shù)(rapid amplication of cDNA ends,RACE)(RC3-1:5′-CCAACGTGGAGCAGGCCTT C-3′,RC3-2:5′-ATGGGCCCCGGAGCCACAGC-3′)和5′-RACE(RC5-1:5′-GATGGTCTTTCCGTCT-3′,RC5-2:5′-TCCACACCAATAGTGCTAAT-3′,RC5-3:5′-GTGTC ATCTGCAAATCGG-3′)的特異性引物,根據(jù)SMARTTMcDNA Amplication Kit (美國Clontech 公司)的說明書進(jìn)行3′RACE 和5′ RACE 擴(kuò)增,分別獲得3′末端和5′末端序列,再與中間序列拼接得到Rab1A基因cDNA全長序列。

        1.3 草魚Rab1A 基因cDNA 序列及系統(tǒng)進(jìn)化分析

        利用生物信息學(xué)在線工具對草魚Rab1A基因進(jìn)行分析。利用NCBI(https:/ /www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/) 查找開放閱讀框(open reading frame,ORF),并采用BLAST (http:/ /www.ncbi.nlm.nih.gov/)進(jìn)行序列同源性分析,采用Expasy (http:/ /us.expasy.org/tools/protparam.Html)進(jìn)行蛋白質(zhì)理化性質(zhì)的分析,跨膜結(jié)構(gòu)和信號肽預(yù)測分別采用Phyre2(http:/ /www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/) 和SignalP (http:/ /www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-4.1)進(jìn)行分析,結(jié)構(gòu)域使用SMART (http:/ /smart.embl-heidelberg.de/)進(jìn)行分析,氨基酸序列的比對用ClustalW1.81 軟件分析。從 GenBank 下載黃顙魚(Tachysurus fulvidraco)(XP027030811.1)、 電 鰻(Electrophorus electricus)( XP026873392.1 )、 斑馬魚 (Danio rerio)( NM001007161.1 )、 鯉魚 (Cyprinus carpio)( KF737068.1 )、 非洲爪蟾 (Xenopus laevis)(AAH45014.1)、西部錦龜(Chrysemys picta bellii)(XP005287289.1)、人(Homo sapiens)(EAW99923.1)和小鼠(Mus musculus)(BAE30098.1)氨基酸序列,采用Mega7.0 軟件的鄰接(neighbor-joining,NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        1.4 草魚Rab1A 基因組織分布及MC-LR 對其表達(dá)的影響

        取保存于液氮中健康草魚的鰓、皮膚、肌肉、肝臟、脾臟、腸道、體腎、心臟、頭腎、血液以及經(jīng)不同劑量MC-LR 處理96 h 后的肝臟組織,先用TRIzol 提取RNA,采用RevertAidTMFirst Strand cDNA Synthesis Kit(美國Promega 公司)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA 模板。根據(jù)獲得的草魚Rab1A基因cDNA 序列設(shè)計熒光定量引物(Rab1A-F:5′-AAGTCTTGCCTTCTTCTCCGAT-3′,Rab1A-R:5′-ACCTCTCTTGCCCTGCTGTATC-3′),采用實(shí)時熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRTPCR)方法檢測草魚Rab1A基因在不同組織中的表達(dá)水平以及MC-LR 染毒后的草魚肝臟中Rab1A基因的表達(dá)變化。其中,檢測Rab1A基因在不同組織中的表達(dá)的內(nèi)參基因為β-actin(F: 5′-CCTTCTTGGGTAGGAG TCTTG-3′,R:5′-AGAGTATTTACGCTCAGGTGGG-3′),分析MC-LR 對Rab1A基因表達(dá)的內(nèi)參基因為甘油醛-3-磷酸脫氫酶( glyceraldehyde - 3phosphate dehydrogenase,GAPDH) (F:5′-AACTGAATCCTCTGTG TATCC-3′,R: 5′-GTCCGTTGTTGACCTCACCT-3′),qRT-PCR 方法參考文獻(xiàn)[18]。

        1.5 草魚Rab1A 原核表達(dá)載體構(gòu)建及多克隆抗體制備

        根據(jù)獲得草魚Rab1A基因ORF 序列,設(shè)計引物(F: 5′-ATGAATCCCGAATATGAC-3′,R:5′-GCAGCAG CCTCCAGATGCA-3′),以肝臟cDNA 作為模板,進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增得到的產(chǎn)物亞克隆到pMD-18-T 并轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α。經(jīng)培養(yǎng),取單克隆測序獲得表達(dá)正確的Rab1A序列。隨后選擇重組表達(dá)蛋白表達(dá)載體pGEX-4T-1,對載體和Rab1A基因的序列的限制性酶切位點(diǎn)進(jìn)行分析,選擇BamHⅠ和SalⅠ作為載體構(gòu)建的連接位點(diǎn),在1~202 aa 這段序列內(nèi)設(shè)計添加BamHⅠ和SalⅠ限制性酶切位點(diǎn)(下劃線標(biāo)出)的引物(F:5′-CGGTAGCCATGAATCCCGAATATGAC-3′,R:5′-ACGCGTCGACTCAGCAGCAGCCTCCAGA-3′)。分別用BamHⅠ和SalⅠ對pGEX-4T-1 和pMD-18-TRab1A雙酶切,瓊脂糖凝膠電泳檢測,酶切產(chǎn)物經(jīng)純化后,再將Rab1A基因片段連接至pGEX-4T-1 載體,隨后將連接產(chǎn)物pGEX-4T-1-Rab1A轉(zhuǎn)化至BL21(DE3)中,挑選陽性菌落再次測序驗證,獲得pGEX-4T-1-Rab1A重組表達(dá)載體。將測序正確的菌液繼續(xù)培養(yǎng),加入0.8 mol·L-1異丙基硫代半乳糖苷(isopropyl-beta-Dthiogalactopyranosidem,IPTG)在37℃誘導(dǎo)4 h,將誘導(dǎo)完的菌液超聲破碎,分離上清與沉淀,進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel,SDS-PAGE)分析,然后再將從上清獲得的蛋白進(jìn)行純化。先后4 次皮下注射純化的蛋白免疫新西蘭兔子,于第1 次免疫52 d 后采血獲得抗血清。采用酶聯(lián)免疫(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)法檢測抗血清效價,測定時以抗原包被液作為空白對照,未免疫的新西蘭大白兔血清作為陰性對照。以純化的重組蛋白為抗原,抗血清作為一抗(1 ∶1000 稀釋),用稀釋3 000倍HRP 標(biāo)記山羊抗兔IgG 為二抗,采用Western blot 進(jìn)行特異性檢測分析。

        1.6 微囊藻毒素對草魚Rab1A 蛋白表達(dá)的影響

        取保存于液氮中的經(jīng)MC-LR 染毒的肝臟樣品,提取蛋白。蛋白樣品先用BCA 蛋白檢測試劑盒(武漢塞維爾生物科技有限公司)定量,隨后加入5×Loading buffer,充分混勻,沸水浴10 min 變性。蛋白樣品經(jīng)12%SDS-PAGE 電泳,考馬斯亮藍(lán)染色。采用電轉(zhuǎn)移系統(tǒng)轉(zhuǎn)至聚偏氟乙烯(polyvinylidene fluoride,PVDF)膜(美國Millipore 公司)上,然后將膜浸沒在5%脫脂牛奶中室溫封閉2 h。采用前述方法獲得的一抗[兔多抗Rab1A(1 ∶1000 稀釋),選擇兔多抗GAPDH(武漢博士德生物工程有限公司)作為內(nèi)參蛋白]孵育(4℃,8 h),倒掉一抗稀釋液,用吐溫20 Tris 緩沖液(Tris buffered solution tween-20,TBST)洗滌3 次(每次10 min),然后用稀釋3 000 倍HRP 標(biāo)記山羊抗兔的二抗(武漢塞維爾生物科技有限公司)孵育(25℃,40 min),再用TBST 洗滌3 次(每次10 min),最后采用增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光(enhanced chemi luminescence,ECL)法顯影、曝光并拍照。

        1.7 數(shù)據(jù)分析

        數(shù)據(jù)均以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示,Rab1A基因在不同組織中的相對表達(dá)以及MC-LR 對Rab1A蛋白表達(dá)的影響均采用One-way ANOVA 分析(SPSS 16.0),統(tǒng)計學(xué)顯著性水平設(shè)定P<0.05 表示差異顯著。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 草魚Rab1A 基因全長cDNA 序列特征分析

        根據(jù)草魚轉(zhuǎn)錄組測序得到一段長約570 bpRab1A基因的序列,設(shè)計引物對該段序列進(jìn)行驗證并在NCBI上進(jìn)行BLAST 分析,進(jìn)一步確定為草魚Rab1A基因cDNA 的中間序列,隨后通過RACE 法擴(kuò)增草魚Rab1A基因的5′末端和3′末端序列,分別獲得了長度為151 bp和234 bp 大小的產(chǎn)物。經(jīng)序列拼接獲得草魚Rab1A基因cDNA 全長序列,其在NCBI 的GenBank 登錄號為MG797687。草魚Rab1A基因全長806 bp,包括5′非編碼區(qū)和3′非編碼區(qū),分別為56 bp 和141 bp,ORF 為609 bp。對其編碼氨基酸序列預(yù)測分析,發(fā)現(xiàn)草魚Rab1A含有202 個氨基酸,分子量為22.34 kDa,理論等電點(diǎn)為5.93。采用signalP4.1 和Phyer2 在線分析未發(fā)現(xiàn)信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)。SMART 在線軟件分析發(fā)現(xiàn)在9~172 aa處為Rab 蛋白功能結(jié)構(gòu)域,也具有Rab 蛋白家族成員的5 個保守的共有序列元件,分別為GDSGVGKS (15~22 aa)、T (40 aa)、DTAG(63~66 aa)、NKCD (121~124 aa)和SAK (151~153 aa) (圖1)。Rab1A基因編碼的蛋白質(zhì)中還存在GTP/Mg2+結(jié)合位點(diǎn),分別為D (16 aa)、GVGKSC (18~23 aa)、Y(33 aa)、NK(121~122 aa)、D(124 aa)、SAK(151~153 aa),GDP 解離抑制因子(GDP dissociation inhibitor,GDI)作用位點(diǎn)包括IG(41~42 aa)、D (44 aa)、WD(62~63 aa)、F(70 aa)、T(72 aa)、TSS(74 ~ 76 aa) 和R (79 aa),開關(guān)Ⅰ(Switch Ⅰ:YTESYISTIGVDFK,33 ~ 46 aa) 和開關(guān)Ⅱ(Switch Ⅱ:GQERFRTITSSYY,66~78 aa) (圖1)。

        2.2 草魚Rab1A 氨基酸同源性與系統(tǒng)進(jìn)化分析

        草魚Rab1A氨基酸與鯉魚和斑馬魚Rab1A氨基酸的相似性非常高,達(dá)99%。應(yīng)用MEGA7.0 軟件構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹表明草魚Rab1A與鯉魚、斑馬魚、黃顙魚和電鰻等魚類的Rab1A氨基酸聚為一大支,其中與鯉魚的關(guān)系最近,而鳥類、哺乳動物和兩棲動物等的Rab1A聚為另一大支(圖2)。

        2.3 草魚Rab1A 基因組織分布特征分析

        對草魚頭腎、脾臟、體腎、皮膚、肌肉、肝臟、腸道、血液、心臟以及鰓9 種組織中Rab1A基因的表達(dá)進(jìn)行qRT-PCR 分析,發(fā)現(xiàn)草魚Rab1A基因在所有檢測的組織中均有表達(dá),其中在血液中的表達(dá)量最為豐富,其次為鰓、心臟、肝臟和肌肉等,在頭腎中表達(dá)量相對較低。以相對表達(dá)量最低的頭腎作為參照進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)血液、鰓、心臟、肝臟和肌肉中Rab1A基因的表達(dá)量顯著高于頭腎中的表達(dá)量(P<0.05) (圖3)。

        2.4 Rab1A 重組蛋白的表達(dá)與純化

        根據(jù)克隆獲得的Rab1A基因序列,構(gòu)建重組表達(dá)載體pGEX-4T-1-Rab1A并轉(zhuǎn)入到表達(dá)宿主菌BL21,隨后采用0.8 mmol·L-1IPTG 誘導(dǎo)4 h,然后破菌分析蛋白表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)在50 kDa 左右位置有特異性蛋白條帶(圖4)。通過可溶性分析發(fā)現(xiàn),該蛋白在包涵體中表達(dá)。采用不同濃度的尿素溶解,發(fā)現(xiàn)包涵體用8 mol·L-1尿素溶解時,可以獲得大量重組蛋白。

        2.5 Rab1A 蛋白多克隆抗體效價測定及其特異性檢測

        將純化的pGEX-4T-1-Rab1A重組蛋白分4 次免疫新西蘭大白兔(第二、三、四次免疫分別與第一次間隔12、26 和40 d),在距離第一次免疫52 d 后,采血收集血清,獲得Rab1A 蛋白的多克隆抗體。對獲得的Rab1A多克隆抗體血清采用ELISA 進(jìn)行效價測定,結(jié)果顯示,多克隆抗體的效價達(dá)1 ∶512 000 以上(圖5)。采用Western blot 方法進(jìn)行抗原檢測,得到一條約50 kDa 的目的條帶,同時也發(fā)現(xiàn)有些小于50 kDa 的非特異性條帶,然而隨著一抗?jié)舛鹊南陆?,非特異條帶也逐漸減少(圖6)。

        2.6 微囊藻毒素-LR 對草魚肝臟Rab1A 基因和蛋白表達(dá)的影響

        分別采用qRT-PCR 和Western blot 檢測Rab1A基因和蛋白的表達(dá)變化,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Rab1A基因和蛋白的表達(dá)在100 μg·kg-1劑量組中顯著被抑制(P<0. 05),其他劑量組中其表達(dá)變化不顯著(P>0. 05) (圖7)。

        3 討論

        本研究從草魚肝臟組織中克隆得到Rab1A基因cDNA 全長,經(jīng)在線分析可知草魚Rab1A 氨基酸含有1 個Rab 結(jié)構(gòu)域和5 個G box 結(jié)構(gòu)(G1-G5 box),其中G1 box 是一個磷酸結(jié)合環(huán)(P-loop),G2 box 由蘇氨酸殘基組成,這個區(qū)域與開關(guān)Ⅰ區(qū)域重疊,稱為效應(yīng)區(qū)域[19]。另外,G3 box 與開關(guān)Ⅱ區(qū)域重疊[20]。Rab 結(jié)構(gòu)域是Rab 蛋白家族共有的保守區(qū),G 結(jié)構(gòu)域是GTP結(jié)合和水解區(qū)域[21],分析發(fā)現(xiàn)草魚Rab1A 具有GTP/GDP 和Mg2+作用位點(diǎn),這與之前的報道相似[22-23],表明草魚Rab1A 符合Rab 蛋白家族保守的特征。此外,草魚Rab1A 的C 末端為CC 模式,符合已報道的C 末端的最末幾個氨基酸的幾種模式(C、CC、CXC、CCXX、CXXX 和CCXXX 型)[1]。根據(jù)NCBI 數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)進(jìn)行氨基酸同源性分析,草魚Rab1A與鯉魚等魚類的Rab1A聚為一類,并且與鯉魚等Rab1A的相似性達(dá)到了99%。上述結(jié)果說明克隆所獲得草魚Rab1A屬于Rab 家族,且Rab1A保守性非常高。

        大多數(shù)Rab 蛋白沒有組織特異性,如Rab6A在凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)的心臟、肝胰腺、腸道、胃、鰓、肌肉和血液等組織中的表達(dá)沒有明顯的組織特異性,但在肝胰腺中的表達(dá)量比其他組織高[24];Rab11 在羅氏沼蝦(Macrobrachium rosenbergii)的肝胰腺、肌肉、腸道等組織中的表達(dá)量相對較高,在鰓、心臟、胃、血液等組織中少量表達(dá),沒有明顯組織特異性[25]。Zhao 等[14]通過熒光定量檢測分析發(fā)現(xiàn)鯉魚4種Rab1A剪接異構(gòu)體(Rab1A1、Rab1A2、Rab1A3 和Rab1A4)在腦、皮膚、鰓、血液、腎臟、肌肉、肝臟、脾臟、腸道和心臟中都有表達(dá),其中鯉魚Rab1A3 和Rab1A4在鰓、腎、皮膚、血液和腦中的表達(dá)高于肝、脾、腸、心臟和肌肉中的表達(dá),尤其在鰓中的表達(dá)量高,而鯉魚Rab1A1 在血液中的表達(dá)量最高,鯉魚Rab1A2 在肝臟中的表達(dá)量最高。本研究發(fā)現(xiàn)草魚Rab1A在血液、鰓中的表達(dá)量相對較高,與鯉魚Rab1A3 的表達(dá)方式有一定的相似[14],這可能與草魚Rab1A和鯉魚Rab1A3的同源關(guān)系近有關(guān)。今后可進(jìn)一步研究草魚Rab1A的剪接異構(gòu)體,了解其不同間接異構(gòu)體的組織表達(dá)特征以及其功能差異等。

        草魚Rab1A經(jīng)克隆和重組表達(dá)后,獲得重組表達(dá)蛋白分子量約為50 kDa (其中載體的分子量為27 kDa),因此,構(gòu)建的重組蛋白表達(dá)正確,這為后期功能研究奠定了基礎(chǔ),但本研究制備的多克隆抗體有一些非特異性條帶,隨著一抗?jié)舛鹊南陆?,非特異條帶也逐漸減少甚至消失,這說明制備的抗體的特異性可以滿足試驗需要。囊泡運(yùn)輸是細(xì)胞內(nèi)物質(zhì)運(yùn)輸?shù)闹匾绞?,目前研究發(fā)現(xiàn),Rab 蛋白作為囊泡運(yùn)輸?shù)姆肿娱_關(guān),在囊泡的形成、轉(zhuǎn)運(yùn)、粘附、錨定和融合等過程中起著重要作用[26-27]。Rab1A除了具有囊泡運(yùn)輸功能之外,在信號傳導(dǎo)[28]、細(xì)胞遷移[29]、自噬調(diào)節(jié)[30]以及癌癥的發(fā)生[31]等方面均具有重要作用。此外,Rab 基因在應(yīng)激反應(yīng)中也具有潛在作用,如在細(xì)菌感染[32]和污染物暴露等情況下[33]。對草魚Rab1A的結(jié)構(gòu)分析結(jié)果表明其高度保守,這也說明草魚Rab1A蛋白可能也具有其他物種Rab1A的功能。

        近年來,活性氧(reactive oxygen species,ROS)在MC-LR 誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡中所起的重要作用已有較多報道[34-35],Rab 蛋白與ROS 之間的相互作用也引起了人們的關(guān)注。Rab 蛋白似乎可以調(diào)節(jié)ROS 的產(chǎn)生和消除,有報道表明Rab 蛋白可通過清除ROS,從而在植物的脅迫應(yīng)答中發(fā)揮作用[36],同時,ROS 也是GTPases 的上游調(diào)節(jié)因子[37],對Rab 蛋白起到一定的調(diào)節(jié)作用。較多證據(jù)表明,MC-LR 可以誘導(dǎo)ROS 的產(chǎn)生并且可通過調(diào)節(jié)PP1 和PP2A 的活性來干擾氧化還原平衡從而誘導(dǎo)機(jī)體細(xì)胞凋亡的產(chǎn)生[38-40]。本研究通過qRT-PCR 以及Western blot 檢測分析發(fā)現(xiàn)MC-LR誘導(dǎo)草魚96 h 后,肝臟中Rab1A基因和蛋白的表達(dá)在MC-LR 25 和75 μg·kg-1劑量組變化不顯著(P>0.05),但在100 μg·kg-1劑量組中的草魚肝臟Rab1A顯著下調(diào)(P<0.05)。本研究前期通過TUNEL 等方法發(fā)現(xiàn)100 μg·kg-1劑量的MC-LR 可顯著誘導(dǎo)肝臟細(xì)胞凋亡的產(chǎn)生[41]。這說明高劑量的MC-LR 可能通過抑制Rab1A的表達(dá)促進(jìn)ROS 的產(chǎn)生,從而引起細(xì)胞凋亡,但這種推測還需要開展Rab1A干擾實(shí)驗等進(jìn)一步驗證。

        4 結(jié)論

        本研究克隆了草魚Rab1A基因,系統(tǒng)分析了其序列特點(diǎn)、組織表達(dá)特征,顯示草魚Rab1A基因保守性強(qiáng)且在血液中表達(dá)高。制備的多克隆抗體效價高且有較好的特異性,可用于相關(guān)的檢測研究。此外,較高劑量的MC-LR 可抑制Rab1A基因和蛋白的表達(dá),提示Rab1A在草魚應(yīng)對MC-LR 脅迫時參與了反應(yīng)。本研究為后續(xù)深入探討Rab1A的功能以及在MC-LR 脅迫過程中的作用機(jī)制提供了參考。

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