梁麗秀 裴玖玲 孫少杰 周 丹
(塔里木大學(xué)機械電氣化工程學(xué)院,新疆 阿拉爾 843300)
植物的根系是其重要的組成部分,除了可以起到固定植株外,從土壤中吸收營養(yǎng)物質(zhì),為植株的生長發(fā)育提供必要的養(yǎng)分也是其重要的作用。近年來有研究表明,植物根系的形態(tài)特征與其植株的生長發(fā)育等方面有著緊密的關(guān)聯(lián)。因此,研究植物根系的形態(tài)特征意義重大。圖像的分割應(yīng)用于植物根系的形態(tài)特征提取,可以在不破壞植物的前提下動態(tài)的研究根系對植物的生長發(fā)育的影響,目前圖像分割算法種類很多,但要準(zhǔn)確的提取出植物的根系特征,難度很大,而圖像分割前對圖像進(jìn)行預(yù)處理又是必不可少的一環(huán),對圖進(jìn)行增強處理,突出根系特征便于后續(xù)的提取,本文對自然光條件下采集到水稻根系進(jìn)行了預(yù)處理研究。
Daugman 在1985 年首次將二維Gabor 濾波函數(shù)應(yīng)用到了對圖像的濾波平滑中[1-2],二維Gabor 函數(shù)可以同時在時域和頻域獲得較高的分辨率,二維Gabor 濾波器是與人類的視覺系統(tǒng)最接近的一種描述。由于二維Gabor 濾波器針對圖像局部多方向結(jié)構(gòu)紋理特征的上處理上相對比較敏感,所以在處理具有紋理特征的圖像增強方面效果更好。Gabor 濾波器已經(jīng)在對血管造影和指紋識別的圖像增強中多有應(yīng)用[3-6]。
二維Gabor 函數(shù)是一個通過高斯函數(shù)變換得到的復(fù)正弦函數(shù), 具有不同的實部函數(shù)和虛部函數(shù),實部函數(shù)式偶Gabor 函數(shù),以此為濾波器對圖像的整體增強效果會較好,虛部是奇Gabor 函數(shù),以虛部為濾波器增強物體的邊緣更為適合。本文要對整個水稻根系進(jìn)行增強,因此采用了用Gabor 函數(shù)的實部,也就是偶Gabor 函數(shù)的濾波對圖像進(jìn)行處理。
濾波增強結(jié)果為Gabor 核函數(shù)與輸入圖像進(jìn)行卷積操作得到。
其中:G 為二維Gabor 核函數(shù),Img 為輸入圖像,out 為增強后的輸出圖像。
二維Gabor 的核函數(shù):
其中:x,y 為空間域像素的位置;ω0為濾波器的中心頻率;θ 為Gabor 核函數(shù)的方向;σ 為高斯函數(shù)標(biāo)準(zhǔn)方差,其中,ω0控制Gabor 濾波器的頻域尺度, 也就是Gabor 濾波器在頻域的中心位置;θ 控制Gabor 濾波器的方向。
σ 和ω0的關(guān)系為:
其中Wt是Gabor 濾波器的時域窗寬度,若σ 值固定,Wt與ω0成反比關(guān)系,若Wt過大則會導(dǎo)致濾波器的頻域窗ω0較小, 低頻特征會被增強, 最終會是圖像丟失跟多的細(xì)節(jié)。若Wt太小會導(dǎo)致,頻域窗ω0較大, 高頻特征會過多的唄增強, 更多的細(xì)節(jié)會凸顯出來,而細(xì)節(jié)中包含有大量的噪聲干擾信號,導(dǎo)致增強后的圖像噪聲干擾嚴(yán)重,所以選取合理的尺度參數(shù)可以調(diào)節(jié)增強效果。
圖1 為選取σ 為1 條件下選取選取10 個方向、16 個方向和36 個方向三種不同的方向參數(shù),對水稻根系圖像進(jìn)行增強處理的結(jié)果對比圖,由圖結(jié)果可以看出,36 個方向的增強結(jié)果根系整體增強效果較好,尤其是細(xì)小的根系被明顯增強了,方向選擇越多增強效果越好,但同時背景中的噪聲也被增強。
圖1 不同參數(shù)的Gabor 濾波結(jié)果
導(dǎo)向濾波是2013 年提出的一個新的濾波方法[7],相比雙邊濾波,導(dǎo)向濾波可以實現(xiàn)數(shù)據(jù)邊緣保留的特點,主要用來保持邊緣同時去除噪聲。導(dǎo)向濾波顧名思義是需要一幅圖像I 作為引導(dǎo)圖,通過I 對輸入圖像P 進(jìn)行濾波處理,利用引導(dǎo)圖像的紋理特征對輸入圖像進(jìn)行增強,濾波后可以獲得與引導(dǎo)圖I 具有相似紋理的圖像,多應(yīng)用圖像的去霧與摳圖和對醫(yī)學(xué)圖像的增強中[8-9]。濾波輸出的計算公式如下:
其中ωk為引導(dǎo)圖像I 的第K 個核函數(shù)窗口,|ω|為該函數(shù)窗口內(nèi)的總像素個數(shù),μk為圖像I 在窗口中的像素的均值,σ2k為I 的方差,ε 為平滑因子。
導(dǎo)向濾波可以用自身的輸入圖像作為引導(dǎo)圖,也可以是其他的圖像,或是用自身圖像的小窗口作為引導(dǎo)都是可以的,用自身的輸入圖像作為引導(dǎo)圖可以是引導(dǎo)濾波在圖像邊緣增強效果方面比較突出。引導(dǎo)圖像I 相比較于其他的濾波器,引導(dǎo)濾波器在細(xì)節(jié)上的濾波效果要更為突出。圖2 是采用MATLAB2016a 中自帶的導(dǎo)向濾波函數(shù)(imguidedfilter 函數(shù)),通過設(shè)置不同邊長的濾波窗口對根系圖像進(jìn)行濾波處理的結(jié)果對圖,如圖所示,濾波窗口取得越大,平滑效果越好,對噪聲的抑制能力越強,圖像也越模糊,導(dǎo)向濾波結(jié)果的邊緣保持能力要更好。
圖2 不同濾波窗口的導(dǎo)向濾波結(jié)果
自然光成像條件下采集的根系圖像包含有大量的噪聲,對這樣的圖像進(jìn)行分割處理難度較大,預(yù)處理的要求過高一些,本文采用了Gabor 濾波和導(dǎo)向濾波對圖像進(jìn)行了預(yù)處理研究,結(jié)果顯示,Gabor 濾波對根系整體增強效果較好,尤其是細(xì)小的根系被明顯增強了,但同時背景中的噪聲也被增強。而導(dǎo)向濾波結(jié)果的邊緣保持能力要更好,但圖像會更模糊。