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        不同試劑盒檢測錦鯉皰疹病毒效果比較

        2021-08-21 02:07:38黃炳熾彭家杰胡健聲洪偉彬莫鉆蘭黃潔瑩
        養(yǎng)殖與飼料 2021年8期
        關鍵詞:皰疹病毒錦鯉試劑

        李 敏 黃炳熾 彭家杰 胡健聲 洪偉彬 莫鉆蘭 黃潔瑩

        廣東省東莞市動物疫病預防控制中心,廣東東莞523000

        錦鯉皰疹病毒病,是由錦鯉皰疹病毒(Koi her?pevirus,KHV)所引起的致死率80%~100%的流行性疾病,僅感染錦鯉、鯉及其變種[1-4]。該病被我國列在《一、二、三類動物疫病病種名錄》中的二類疫病,世界動物衛(wèi)生組織(OIE)將其列為必須申報的疫病[5]。1998年,該病首次由德國和以色列學者發(fā)現(xiàn),中國香港于2001年發(fā)生首例,隨后在印度尼西亞、日本等東南亞國家相繼發(fā)生,現(xiàn)已流行于世界各地[6-7]。

        水產(chǎn)行標《SC/T 7212.1-2011》作為此次錦鯉皰疹病毒病病原檢測能力測試的依據(jù)和實驗室檢測的主要方法,屬于傳統(tǒng)聚合酶鏈式反應(PCR),具有靈敏度高、準確率高等優(yōu)點,但在實際應用中,需要TK、Sph基因PCR、電泳和產(chǎn)物測序,存在檢測時間長、操作繁瑣且易污染、不能準確定量等問題。熒光定量PCR 檢測耗時短、操作簡便、能定量等優(yōu)點被廣泛應用于病原體檢測[8-10],越來越多商品化的熒光定量PCR 試劑盒被研發(fā)出來。因此,本試驗擬通過此次病原檢測能力測試的樣本來驗證不同廠家生產(chǎn)的試劑盒的性能。

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        1)樣品。樣品編號為K34-1、K34-2、K34-3、K34-4,由中國檢驗檢疫科學研究院提供,4 份樣品均為魚內(nèi)臟組織勻漿上清樣品,采用凍存管包裝。本次試驗使用的陽性標準物質(zhì)由中國檢驗檢疫科學研究院提供。

        2)試劑。海洋動物組織基因組DNA 提取試劑盒(批號:S8107)、PCR MasterMix(批號:KT201-02)購自天根公司;引物(批號:211044344)由生工生物工程(上海)股份有限公司合成;DL1000 DNA Mark?er(批號:ATG1607A)購自TaKaRa;50×TAE(批號:690674223)、gelred 核酸染料(批號:BS354B)購自biosharp;瓊脂糖(批號:E24567B127)購自biofroxx;3種商品化的錦鯉皰疹病毒實時熒光PCR 檢測試劑盒分別來自不同生產(chǎn)廠家,用A(批號:200603)、B(批號:67052)、C(批號:JC0069202006)來代替。

        3)儀器設備。生物安全柜、梯度PCR 儀、水平電泳系統(tǒng)、凝膠成像儀、熒光PCR 儀、實時熒光定量PCR儀。

        1.2 方 法

        1)采用本次能力測試要求的方法檢測。按照中國檢驗檢疫科學研究院下發(fā)的《能力測試作業(yè)指導書》,結合水產(chǎn)行業(yè)標準《鯉皰疹病毒檢測方法第1 部分:錦鯉皰疹病毒》(SC/T 7212.1-2011)進行試驗及鑒定。

        ①核酸提取。參照天根DNA 提取試劑盒的說明書提取KHV核酸。

        ②PCR 反應。試驗所需的KHVTK基因、Sph基因所需的特異性引物,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,根據(jù)實際用滅菌水稀釋成10 mmol/L儲藏液,-20 ℃保存?zhèn)溆?,引物序列和反應程序見?。按PCR MasterMix 說明書標示的反應體系配制反應液,分裝到0.2 mL PCR 管,分別加入相應體積的陰性對照、待檢樣品和陽性對照,做好記錄。混勻后離心,進行PCR 擴增反應,陽性標準物質(zhì)由中國檢驗檢疫科學研究院提供。

        表1 KHV PCR檢測所需的引物、反應程序

        ③瓊脂糖凝膠電泳。凝膠用1×TAE 電泳緩沖液配制0.01%的瓊脂糖(含10 000*superRed 核酸染料)平板,凝固后放入水平電泳槽,使電泳緩沖液剛好淹沒膠面。將上述5μL PCR產(chǎn)物加入點樣孔,使用DNA 1 000作對照。110 V 電泳約25 min,放置凝膠成像儀中觀察電泳片段的數(shù)量和位置。

        ④核酸測序。將KHVTK基因、Sph基因PCR產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司進行測序。

        2)商品化的錦鯉皰疹病毒實時熒光定量PCR檢測。以本次參測盲樣為樣品,從市場上選取3家不同廠家生產(chǎn)的實時熒光定量PCR檢測試劑盒檢測(由A、B、C代替)進行試驗與分析,3種試劑盒的試驗成立標準、結果判定標準各不相同(詳見表2)。按照各自試劑盒說明書配置熒光PCR反應體系,依次加入陰性對照、樣品核酸和陽性對照,加樣后及時蓋緊管蓋,做好標記,混勻后離心,按照各自的反應程序擴增。

        表2 不同試劑盒的反應體系、反應時間、試驗成立和結果判定標準

        2 結果與分析

        按照中國檢驗檢疫科學研究院下發(fā)的《能力測試作業(yè)指導書》,結合水產(chǎn)行業(yè)標準《鯉皰疹病毒檢測方法第1 部分:錦鯉皰疹病毒》(SC/T 7212.1-2011)對樣品進行檢測。檢測結果顯示:樣品K34-2、K34-3 為KHV 核酸陽性,樣品K34-1 和K34-4 核酸陰性,檢測結果為滿意。

        2.1 按本次能力測試要求的方法檢測的結果

        如圖1所示:樣品K34-2、K34-3的TK、Sph基因的PCR 產(chǎn)物分別出現(xiàn)了409 bp 片段和292 bp 片段,并將PCR 產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司進行測序,測序同源性比對表明:該基因序列與Genbank 登錄的鯉皰疹病毒3 型T 鏈的全基因序列MG925491.1 有99%的同源性(表3)。樣品K34-1 和K34-4 未出現(xiàn)DNA 片段。樣品K34-1 和K34-3的TK 基因和Sph 基因根據(jù)《鯉皰疹病毒檢測方法SC/7212.1-2011》綜合判定:測試樣品k34-2 和k34-3均為KHV陽性。

        表3 PCR產(chǎn)物的測序結果

        圖1 PCR產(chǎn)物電泳圖譜

        2.2 商品化的錦鯉皰疹病毒實時熒光qPCR結果

        各試驗陰、陽對照符合說明書的試劑成立標準,試驗均成立。試驗發(fā)現(xiàn):B、C試劑未檢出陽性樣品;A試劑的擴增曲線圖中呈現(xiàn)2條陽性對照擴增曲線,其中,一條擴增曲線為KHV陽性對照,另一條擴增曲線為CyHV-2(鯉皰疹病毒)陽性對照,A 試劑檢測出K34-2 和K34-3 這兩條擴增曲線,其Ct 值分別為19.84、19.57,因此可判K34-2 和K34-3 為KHV 核酸陽性。A試劑檢測的結果與能力測試結果一致(圖2)。

        圖2 不同試劑的擴增曲線圖

        3 討 論

        23~25 ℃是KHV 發(fā)病的最適溫度,但有研究發(fā)現(xiàn):KHV 已具備在平均溫度3 ℃的冰下繁殖的能力[11]且尿液是KHV的主要傳播途徑[2]。KHV潛伏期長、傳染性強、致死率高,且缺乏對KHV有效的治療方案和預防措施。為了加強水生動物防疫系統(tǒng)實驗室能力建設,提升實驗室對水生動物病原檢測的能力,越來越多的實驗室配備了熒光定量PCR 儀,具備開展熒光定量PCR 檢測的條件。實時熒光定量PCR 技術由美國Applied Biosystems 公司于1996年推出,具有特異性強、靈敏度高、準確可靠、無污染、實時性好且能實現(xiàn)多重反應等特點[21]。隨著檢測技術的不斷發(fā)展,許多商品化的錦鯉皰疹病毒實時熒光定量PCR 檢測試劑盒已被研發(fā)。本試驗選取3 種試劑盒,以此次病原檢測能力測試的樣本為檢測對象進行試劑比對發(fā)現(xiàn):3 種檢測試劑的試驗均成立,只有A 與能力測試結果一致。因此,選用商品化試劑盒時,試劑比對尤為重要。

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