王 浦,陳 燁
(南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院消化內(nèi)科/廣東省南方消化疾病研究所,廣州 510515)
臨床上大劑量、多療程使用廣譜抗生素,以及激素、免疫制劑等濫用[1],破壞正常腸道菌群平衡,艱難梭菌(CD)趁勢(shì)迅速生長(zhǎng),產(chǎn)生毒素破壞腸黏膜屏障,引起艱難梭菌感染(CDI)及偽膜性腸炎,導(dǎo)致細(xì)菌易位,膿毒血癥,甚至多器官功能衰竭,給臨床帶來(lái)了極大的壓力與醫(yī)療支出[2-4]。
CD檢測(cè)方法有多種,但因培養(yǎng)條件及技術(shù)要求高、耗時(shí)長(zhǎng),不能用于臨床常規(guī)檢測(cè)[5]。目前,國(guó)內(nèi)外臨床廣泛采用酶免疫學(xué)試驗(yàn)(EIA),針對(duì)艱難梭菌A或B毒素進(jìn)行檢測(cè),可在2 h內(nèi)快速完成測(cè)定。但該方法存在交叉反應(yīng)、假陽(yáng)性率高、特異度差[6- 7]。臨床診療過(guò)程中,常常發(fā)現(xiàn)假陰性的例子,從而延誤患者的治療。利用分子生物學(xué)PCR 技術(shù)可檢測(cè)CD毒素基因,但不適合應(yīng)用于基層醫(yī)院及現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)。因此,尋找新型的穩(wěn)定性好、特異度高并且方便快捷的檢測(cè)手段一直是研究熱點(diǎn)[8-13]。GeneXpert C.difficile熒光定量PCR檢測(cè)系統(tǒng)(Cepheid,GX-XVI)可以特異性的檢測(cè)艱難梭菌tcdB基因,整合了傳統(tǒng)PCR檢測(cè)所需的3個(gè)步驟(樣品制備、擴(kuò)增和檢測(cè)),全程自動(dòng)化,方便快捷。研究表明,該技術(shù)檢測(cè)新鮮糞便標(biāo)本CD,靈敏度好、特異度高,是一種應(yīng)用前景很廣泛的CD檢測(cè)技術(shù)[13-16]。
CD常規(guī)要求糞便標(biāo)本取樣后30 min內(nèi)檢測(cè),因此局限了檢測(cè)區(qū)域,不利于大范圍開(kāi)展檢測(cè)及常規(guī)篩查。此外,有些醫(yī)療機(jī)構(gòu)不具備CD檢測(cè)設(shè)備及技術(shù),標(biāo)本需凍存后寄往相關(guān)單位進(jìn)行檢測(cè),也可能影響檢測(cè)結(jié)果[6]。本研究的目的是尋找一種快速有效的非新鮮腹瀉糞便標(biāo)本CD檢測(cè)技術(shù),通過(guò)比較GX-XVI及EIA對(duì)凍存標(biāo)本檢測(cè)的優(yōu)劣,提高凍存標(biāo)本的檢測(cè)水平,以期快速、便捷、準(zhǔn)確的用于臨床檢測(cè)、篩查、鑒定及預(yù)防CDI,擴(kuò)大CD檢測(cè)覆蓋范圍,對(duì)于基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)合理選擇用藥、提高療效、減緩細(xì)菌耐藥及控制院內(nèi)感染[17],減輕醫(yī)療壓力,具有重要意義。
標(biāo)本來(lái)源于2014年2月到2019年2月南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院住院患者共200份新鮮腹瀉糞便標(biāo)本(排出后立即取樣,厭氧運(yùn)送,0.5 h內(nèi)接種或保存)。入選標(biāo)準(zhǔn):年齡≥18歲的住院患者;60 d內(nèi)接受過(guò)抗生素治療或化療等藥物治療,住院后48 h后出現(xiàn)腹瀉,且24 h內(nèi)腹瀉次數(shù)≥3次,不成形大便(布里斯托分類5~7級(jí))。排除標(biāo)準(zhǔn):各種類型的感染性腹瀉,如細(xì)菌性痢疾、傷寒、食物中毒、原發(fā)性腹膜炎和阿米巴痢疾等;腸道功能性疾病,如腸易激綜合征等;其他有除抗生素以外明確原因的腹瀉,如乳糖不耐受等。剔除標(biāo)準(zhǔn):因儀器或人為因素導(dǎo)致無(wú)法完成整個(gè)試驗(yàn)過(guò)程的樣本;病例資料不全的樣本。本研究經(jīng)本院倫理委員會(huì)審核并通過(guò)(NFEC-2014-078)。
CD標(biāo)準(zhǔn)菌株 (VPI10463)來(lái)自蘭州微生物研究所饋贈(zèng)。難辨梭菌瓊脂基礎(chǔ),難辨梭菌培養(yǎng)基選擇添加劑,Eugon肉湯等CD液體、固體培養(yǎng)基及添加劑,購(gòu)自BD及OXOID公司。厭氧指示劑,API20A 快速生化鑒定試劑盒及革蘭染色液套裝,艱難梭菌毒素A/B 檢測(cè)試劑盒購(gòu)自生物梅里埃公司。保存液:甘油與Eugon肉湯按3/7比例混合。
1.3.1糞便標(biāo)本處理
取新鮮腹瀉糞便標(biāo)本,按標(biāo)準(zhǔn)操作流程(SOP),行CD分離培養(yǎng)及生化鑒定,PCR鑒定毒素。剩余糞便標(biāo)本加凍存液(1∶1)-80 ℃低溫冰箱保存1年以上。檢測(cè)時(shí),快速解凍,4 ℃靜置24 h,然后分別采用細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)(CCTA)、GX-XVI和EIA檢測(cè)CD。
1.3.2新鮮糞便標(biāo)本CD分離培養(yǎng)及生化鑒定
2 mL Eugon肉湯加入約0.2 mL新鮮糞便樣本,混勻;把大便懸浮液放在水浴鍋上80 ℃加熱10 min,然后降溫到室溫,放置5 min,取1滴加入艱難梭菌選擇液體培養(yǎng)基(CCMB-TAL)液體培養(yǎng)管中,35 ℃厭氧培養(yǎng)。培養(yǎng)5 d后觀察顏色變化,如CCMB-TAL培養(yǎng)基變色,表明可能有CD存在。另外吸取50 μL懸浮液加于新鮮配制的艱難梭菌選擇瓊脂(CCFA-HT)平板中,37 ℃厭氧培養(yǎng)72 h。如觀察到粗糙、邊緣不整齊疑似菌落,則純分后接種至普通血平板,37 ℃厭氧培養(yǎng)48 h。如耐氧試驗(yàn)無(wú)須氧菌生長(zhǎng),則革蘭染色涂片,油鏡下如看到較粗的革蘭染色陽(yáng)性,部分次極端有芽孢者懷疑為CD。取此單個(gè)菌落接種至血平板,以API20A行生化鑒定。經(jīng)生化鑒定后確定CD標(biāo)本,進(jìn)一步采用PCR技術(shù)檢測(cè)CD毒素。
1.3.3CCTA檢測(cè)非新鮮糞便標(biāo)本CD
解凍及靜置24 h后糞便標(biāo)本,按上述流程CMB-TAL培養(yǎng)5 d。取上述CMB-TAL培養(yǎng)基上清液,PBS稀釋,20 mL的上清液轉(zhuǎn)移到成纖維細(xì)胞,37 ℃,96孔板,5%二氧化碳環(huán)境,含有熱滅活10%胎牛血清的Eugon肉湯培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h,觀察細(xì)胞毒效應(yīng)。標(biāo)準(zhǔn)株VPI10463作為陽(yáng)性對(duì)照。
1.3.4GX-XVI檢測(cè)非新鮮糞便標(biāo)本CD
操作方法嚴(yán)格按照操作說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。
1.3.5EIA檢測(cè)非新鮮糞便標(biāo)本CD
使用艱難梭菌毒素A/B檢測(cè)試劑盒檢測(cè)CD毒素,操作方法嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。
1.3.6結(jié)果分析
比較新鮮及非新鮮糞便標(biāo)本CD檢出陽(yáng)性率,評(píng)估凍存及解凍后靜置對(duì)檢出率的影響。比較GX-XVI、EIA對(duì)非新鮮標(biāo)本CD的檢測(cè),評(píng)價(jià)其檢測(cè)效能。
采用SPSS20.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理。分類計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn),GX-XVI、EIA與CCTA的一致性采用McNemar及Kappa系數(shù)分析。GX-XVI及EIA的敏感度、特異度、約登指數(shù)(Youden),陽(yáng)性似然比及陰性似然比采用MedCalc13進(jìn)行分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
200份新鮮腹瀉糞便標(biāo)本經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)SOP富集培養(yǎng),PCR毒素鑒定,最終得到70例產(chǎn)毒CD菌株,見(jiàn)圖1。
A:偽膜性腸炎結(jié)腸鏡圖片,內(nèi)鏡下可見(jiàn)乙狀結(jié)腸散在淡黃色偽膜,黏膜充血易脆;B:偽膜性腸炎病理圖片(100×),黏膜固有層中性粒細(xì)胞浸潤(rùn),上皮細(xì)胞破損,黏膜表面有分泌物;C:CD臨床分離菌株,革蘭陽(yáng)性桿菌(Gram,1 000×);D:艱難梭菌 A/B 毒素基因(tcdA/tcdB)PCR 擴(kuò)增后瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果;M:分子量標(biāo)準(zhǔn)1 000 bp;tcdA:546 bp;tcdB:204 bp。
非新鮮糞便標(biāo)本分別采用CCTA、GX-XVI和EIA檢測(cè)CD。CCTA提示CD毒素陽(yáng)性標(biāo)本數(shù)為68份,與新鮮糞便標(biāo)本培養(yǎng)鑒定結(jié)果無(wú)差異(P=0.833,95%CI:0.692~1.579)。解凍后3種檢測(cè)方法陽(yáng)性率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=6.799,P=0.033),見(jiàn)表1。
表1 解凍后3種檢測(cè)方法陽(yáng)性率比較
非新鮮糞便標(biāo)本經(jīng)GX-XVI檢測(cè)確定65例毒素陽(yáng)性標(biāo)本。62例(31.0%)標(biāo)本為真陽(yáng)性,129例(64.5%)為真陰性。與CCTA相比,經(jīng)配對(duì)計(jì)量資料McNemar檢驗(yàn),兩種診斷結(jié)果無(wú)明顯差異(P=0.508),吻合系數(shù)Kappa=0.899,見(jiàn)表2。
表2 非新鮮樣本GX-XVI與CCTA陽(yáng)性情況比較(n)
非新鮮糞便標(biāo)本經(jīng)毒素EIA測(cè)定,陽(yáng)性標(biāo)本56例。52例(26.0%)標(biāo)本為真陽(yáng)性,128例(64.0%)為真陰性。與CCTA相比,經(jīng)配對(duì)計(jì)量資料McNemar檢驗(yàn),兩種診斷結(jié)果有明顯差異(P=0.001),吻合系數(shù)Kappa=0.516,見(jiàn)表3。
表3 非新鮮樣本EIA與CCTA陽(yáng)性情況比較(n)
采用醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件MedCalc13進(jìn)行分析,結(jié)果表明,對(duì)于非新鮮糞便標(biāo)本,與CCTA相比,GX-XVI檢測(cè)的靈敏度 91.18%(95%CI:81.8%~96.7%),特異度97.73%(95%CI:93.5%~99.5%),約登指數(shù)73.5%,陽(yáng)性似然比40.12(95%CI:13.1~123.1),陰性似然比0.090(95%CI:0.04~0.20)。相應(yīng)地,EIA檢測(cè)非新鮮糞便標(biāo)本CD靈敏度76.5%,特異度97.0%,約登指數(shù)73.5%。陽(yáng)性似然比25.5,陰性似然比為0.242。
分析臨床CD檢測(cè)陽(yáng)性率低的原因,可能和標(biāo)本未能及時(shí)送檢,以及臨床EIA檢測(cè)技術(shù)敏感性不足有關(guān),因此,設(shè)計(jì)本研究尋找能提高臨床CDI診斷陽(yáng)性率及準(zhǔn)確率的方法。采用凍存1年以上的腹瀉糞便標(biāo)本(凍存前已行細(xì)菌學(xué)培養(yǎng)及鑒定),復(fù)蘇后4 ℃靜置24 h,然后CCTA檢測(cè)CD,結(jié)果表明長(zhǎng)時(shí)間凍存及低溫靜置對(duì)CD檢出率無(wú)明顯影響。
分別采用GX-XVI及EIA對(duì)復(fù)蘇及靜置后糞便標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn),與CCTA相比,GX-XVI檢測(cè)CD靈敏度為91.18%,漏診少,特異度97.73%,說(shuō)明GX-XVI確定非患者的能力好,誤診少。Kappa值為0.899,基本達(dá)到與CCTA檢測(cè)結(jié)果相一致的水平。約登指數(shù)88.90%,說(shuō)明儀器診斷真實(shí)程度高,篩查能力強(qiáng)。陽(yáng)性似然比為40.12,遠(yuǎn)大于10.00,說(shuō)明GX-XVI能正確診斷非新鮮糞便樣本CD可能性大。GX-XVI陰性似然比為0.09,遠(yuǎn)小于1,錯(cuò)誤判斷陰性的可能性小。EIA檢測(cè)非新鮮標(biāo)本,特異度高,但靈敏度較差,容易出現(xiàn)假陰性,與CCTA結(jié)果一致性差。EIA特異度較高的原因,可能與標(biāo)本長(zhǎng)期凍存,以及靜置后雜菌死亡相關(guān)(CD在極端條件下形成芽孢,生存能力較強(qiáng)),交叉反應(yīng)概率變小。
因此,對(duì)于收集后不能立即送檢的糞便標(biāo)本,采用GX-XVI熒光定量PCR進(jìn)行檢測(cè),靈敏度好,特異度高,與CCTA檢測(cè)結(jié)果一致性好。且GX-XVI可同時(shí)檢測(cè)二元毒素基因及tcdC基因nt117位點(diǎn)缺失,對(duì)于監(jiān)測(cè)B1/NAP1/027暴發(fā)流行極為有意義。GX-XVI從準(zhǔn)備樣品到出結(jié)果,全程自動(dòng),對(duì)工作環(huán)境和操作人員無(wú)特殊要求,1 h內(nèi)就能檢測(cè)出結(jié)果,可以做到及時(shí)隔離治療CDI患者。同時(shí)避免了傳統(tǒng)培養(yǎng)分離鑒定及EIA檢測(cè)過(guò)程中研究人員與傳染性病原體長(zhǎng)期接觸,有效保護(hù)了醫(yī)務(wù)人員及科研人員身體健康,減少暴發(fā)流行危險(xiǎn)[13,18]。最后,GX-XVI大約需要50 min即可得出結(jié)果,方便快捷,適合大范圍的檢測(cè)。
綜上所述,GX-XVI可以用于大范圍的CDI診斷,有望用于臨床 CDI的篩查。對(duì)于預(yù)防CDI,指導(dǎo)臨床合理選擇用藥,提高基層醫(yī)療機(jī)構(gòu)CDI診療效率,減緩細(xì)菌耐藥,控制院內(nèi)感染播散,減輕醫(yī)療壓力具有重要意義,可作為臨床CDI常規(guī)篩查儀器。如果沒(méi)有該設(shè)備,或者缺乏熒光定量PCR技術(shù)條件,可考慮采用普通PCR結(jié)合EIA檢測(cè)非新鮮糞便標(biāo)本,彌補(bǔ)普通PCR特異度不足的問(wèn)題。