楊 陽(yáng) 張 迪 王 佳 黃程程 王有鵬
(1.黑龍江中醫(yī)藥大學(xué),黑龍江 哈爾濱 150040;2.黑龍江中醫(yī)藥大學(xué)附屬第二醫(yī)院,黑龍江哈爾濱 150001)
哮喘是兒童最常見(jiàn)的慢性呼吸系統(tǒng)疾病,其特征是慢性氣道炎癥、可逆性氣道阻塞、氣道重塑、黏液分泌增加和氣道高反應(yīng)性[1]。哮喘發(fā)作的常見(jiàn)誘因包括病毒感染、暴露于過(guò)敏原和(或)污染物、吸煙、突然的溫度變化、壓力和運(yùn)動(dòng)等[2-3]。目前,全球約有3.34億人和10%的兒童受到影響,構(gòu)成了嚴(yán)重的全球健康問(wèn)題[4-6]。近年哮喘的發(fā)病率不斷上升,預(yù)計(jì)2025年可達(dá)4億[7-8]。中醫(yī)中藥治療兒童疾病優(yōu)勢(shì)近年來(lái)受到重視,很多學(xué)者也開(kāi)始深入研究經(jīng)典方劑治療哮喘的作用機(jī)制,不但可以更好地治療疾病,還為醫(yī)學(xué)研究提供理論基礎(chǔ)。
溫膽湯最早記載于南北朝時(shí)期醫(yī)家姚僧垣的《集驗(yàn)方》[9-10],不同醫(yī)家對(duì)其方義闡釋不同,主要包括清熱化痰、解郁化痰、達(dá)膽和胃、和胃降膽以及分消走泄等功效?,F(xiàn)代醫(yī)家對(duì)溫膽湯的應(yīng)用非常廣泛,尤其在治療兒童疾病中應(yīng)用越來(lái)越多,對(duì)過(guò)敏性疾病的防治效果頗佳,已有臨床觀察證實(shí)溫膽湯加減可以治療兒童哮喘。有關(guān)實(shí)驗(yàn)對(duì)溫膽湯中的成分進(jìn)行測(cè)定,發(fā)現(xiàn)其中有部分成分可以用于治療哮喘[11]。筆者通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)溫膽湯主要成分治療哮喘進(jìn)行探討,通過(guò)構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),獲得溫膽湯治療哮喘可能的作用機(jī)制,為后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究提供理論依據(jù)。
1.1 獲取溫膽湯中主要中藥有效成分及藥物靶點(diǎn)使用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)篩選溫膽湯中主要藥物的活性化合物,分別輸入“半夏”“陳皮”“茯苓”“枳實(shí)”,篩選標(biāo)準(zhǔn)為:口服生物利用度(Oral bioavailability,OB)≥30%和類藥性(Drug like,DL)≥0.18。
1.2 檢索哮喘靶點(diǎn)基因 分別在Gene Cards(https://www.geneca-rds.org/)和在線人類孟德?tīng)栠z傳(OMIM,https://omim.org/)中輸入“asthma”進(jìn)行檢索,并將兩個(gè)表格進(jìn)行整合。
1.3 溫膽湯藥物活性成分-核心靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)和PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將“1.1”獲得的溫膽湯主要藥物的活性成分及核心靶點(diǎn)相關(guān)信息導(dǎo)入Cytoscape 3.6.1軟件,繪制溫膽湯活性成分-核心靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)。使用STRING平臺(tái)(https://string-db.org/)可以構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)。
1.4 GO分析 使用R語(yǔ)言軟件對(duì)溫膽湯主要藥物與哮喘的共作靶點(diǎn)進(jìn)行數(shù)據(jù)的處理,并得到GO分析的條形圖、氣泡圖。使用Perl將轉(zhuǎn)換的ID變成原始基因靶點(diǎn)。
1.5 KEGG通路富集分析及KEGG關(guān)系網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將獲得的ID轉(zhuǎn)換文本文件,運(yùn)行R語(yǔ)言得到KEGG通路富集分析的條形圖、氣泡圖及文本文件。使用perl對(duì)獲得的KEGG文本文件進(jìn)行操作,輸入Cytoscape 3.6.1軟件,繪制溫膽湯與哮喘直接的KEGG關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。
2.1 溫膽湯主要藥物的活性成分 經(jīng)過(guò)TCMSP篩選后得到溫膽湯主要藥物的有效活性成分52個(gè),其中半夏13個(gè),陳皮5個(gè),茯苓15個(gè),枳實(shí)22個(gè),陳皮、枳實(shí)共有3個(gè),整合后可獲取藥物有效活性成分作用靶點(diǎn)603個(gè)。
2.2 潛在靶點(diǎn)信息 通過(guò)Gene Cards獲得哮喘的靶點(diǎn)基因5 974個(gè),通過(guò)OMIM獲得哮喘靶點(diǎn)基因36個(gè),將已經(jīng)獲得的溫膽湯中活性成分作用的靶點(diǎn)基因取交集,可獲得兩者的共同靶點(diǎn)有131個(gè)。
2.3 溫膽湯主要藥物中活性成分-核心靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò) 應(yīng)用Cytoscape 3.6.1軟件,繪制溫膽湯主要藥物活性成分-核心靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)(如圖1),三角形代表靶點(diǎn),橢圓形代表活性成分,其中藍(lán)色代表半夏,綠色代表陳皮,紫色代表茯苓,黃色代表枳實(shí),紅色代表多味藥共同含有。連線越密集的節(jié)點(diǎn)越重要。將獲得的131個(gè)靶點(diǎn)輸入STRING數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),見(jiàn)圖2,并運(yùn)用R語(yǔ)言提取PPI網(wǎng)絡(luò)中度值中心性較高的前30位的核心基因,見(jiàn)圖3。
圖1 溫膽湯主要藥物中活性成分-核心靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
圖2 溫膽湯與哮喘靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)
圖3 PPI的核心基因
2.4 GO富集分析 分析經(jīng)R語(yǔ)言運(yùn)行后總共得到135個(gè)功能,獲取其中前20個(gè)的GO功能富集的條形圖和氣泡圖(見(jiàn)圖4、圖5):富集越是顯著顏色越偏紅色,富集越少顏色越偏藍(lán)色;橫坐標(biāo)表示富集數(shù)目。
圖4 溫膽湯治療哮喘候選靶點(diǎn)的GO富集條形圖
圖5 溫膽湯治療哮喘候選靶點(diǎn)的GO富集氣泡圖
2.5 KEGG通路富集分析及KEGG關(guān)系網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 使用R語(yǔ)言軟件對(duì)獲得的131個(gè)靶點(diǎn)基因進(jìn)行KEGG通路富集分析,運(yùn)行后得到30條通路。繪制顯著性前20的通路的條形圖和氣泡圖(見(jiàn)圖6、圖7):橫坐標(biāo)表示靶點(diǎn)數(shù),左邊表示通路名稱,通路上靶點(diǎn)數(shù)越多顏色越偏紅色,靶點(diǎn)數(shù)越少顏色越偏藍(lán)色。通過(guò)對(duì)富集前20的KEGG通路與基因之間的網(wǎng)絡(luò)圖(見(jiàn)圖8):三角形代表通路,橢圓形代表基因,線代表相互鏈接,圖形越大代表相互關(guān)聯(lián)數(shù)量越多。
圖6 溫膽湯-哮喘潛在靶點(diǎn)KEGG通路條形圖
圖7 溫膽湯-哮喘潛在靶點(diǎn)KEGG通路氣泡圖
圖8 溫膽湯治療哮喘的KEGG關(guān)系網(wǎng)絡(luò)
哮喘可歸為中醫(yī)學(xué)的“哮證”“喘證”等范疇。在《素問(wèn)·陰陽(yáng)別論》中“陰爭(zhēng)于內(nèi),陽(yáng)擾于外,魄汗未藏,四逆而起,起則熏肺,使人喘鳴”,對(duì)哮喘的病因和癥狀進(jìn)行描述。后世《金匱要略》“咳而上氣,喉中水雞聲”,進(jìn)一步對(duì)癥狀及治療進(jìn)行記載。近現(xiàn)代中醫(yī)學(xué)者對(duì)哮喘的認(rèn)識(shí)更深入,對(duì)病因病機(jī)的不斷完善,治療上面的選方用藥更系統(tǒng)化、多樣化、全面化。通過(guò)溫膽湯加味治療哮喘的臨床觀察可以看出,其治療哮喘具有一定的療效,但是對(duì)于機(jī)制的研究尚未廣泛開(kāi)展。
通過(guò)對(duì)溫膽湯中的有效成分進(jìn)行分析,部分化合物已經(jīng)證實(shí)具有治療哮喘的作用,尤其是一些與基因關(guān)聯(lián)較多的活性成分,比如木樨草素、β-谷甾醇、柚皮素、豆甾醇等。木樨草素具有抑制哮喘氣道重塑及抑制哮喘氣道炎癥的作用[12]。β-谷甾醇具有抑菌抗炎的作用,多個(gè)治療哮喘的藥物都含有此成分[13-14]。柚皮素具有止咳化痰平喘的作用[15]。豆甾醇對(duì)哮喘氣道炎癥具有調(diào)節(jié)作用[16]。
通過(guò)對(duì)溫膽湯與哮喘的PPI網(wǎng)絡(luò)分析,核心基因?yàn)锳kt1、MAPK3、IL-6、VEGFA、FOS、JUN、MAPK1等。查閱文獻(xiàn)可知,AKT1的磷酸化變化可能在治療哮喘的療效中起重要作用[17]。MAPK3與MAPK1在MAPK信號(hào)通路中具有重要的作用,與調(diào)控氣管平滑肌細(xì)胞炎癥基因表達(dá)的重要信號(hào)酶相關(guān)[18],MAPK信號(hào)通路與溫膽湯治療哮喘也具有相關(guān)性。IL-6近年被證實(shí)是哮喘的易感基因[19-20]。VEGFA在哮喘發(fā)病中起作用,如嗜酸性炎癥、杯狀細(xì)胞化生、氣道重塑以及氣道高反應(yīng)性,被認(rèn)為是哮喘發(fā)病的關(guān)鍵介質(zhì)之一[21]。FOS與JUN等基因都參與了哮喘的氣道炎癥、氣道重塑和氣道高反應(yīng)等,從而使哮喘誘發(fā)或嚴(yán)重[22]。已有文獻(xiàn)證明,溫膽湯對(duì)某些疾病的患者或?qū)嶒?yàn)動(dòng)物血清中的炎癥因子IL-6、VEGFA等有調(diào)節(jié)作用,可調(diào)節(jié)組織中FOS及JUN等基因的表達(dá)。目前關(guān)于溫膽湯治療哮喘的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究較少,分析獲得的基因?qū)⑹呛笃趯?shí)驗(yàn)的主要研究對(duì)象。
GO富集分析顯示GO功能富集后富集數(shù)目較多的有泛素樣蛋白連接酶結(jié)合、DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活活性,RNA聚合酶Ⅱ特異性、磷酸酶結(jié)合等。真核生物中泛素樣蛋白連接酶在許多細(xì)胞功能中起著核心作用,但目前針對(duì)其與哮喘的研究較少。磷酸酶是許多細(xì)胞信號(hào)傳遞的關(guān)鍵,可以激活信號(hào)通路,使其表現(xiàn)功能??赏茰y(cè)溫膽湯通過(guò)參與多途徑治療哮喘,尤其是在細(xì)胞免疫等方面。淋巴細(xì)胞的失衡是哮喘發(fā)病機(jī)制的主要原因之一,免疫細(xì)胞參與哮喘的發(fā)病、發(fā)生、發(fā)展及治療。合理選擇中藥復(fù)方可以更好地通過(guò)細(xì)胞免疫等方面改善哮喘癥狀,不但使中藥治療疾病效果更佳,還可以通過(guò)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)使中醫(yī)藥更具有說(shuō)服力和應(yīng)用空間。
KEGG富集通路分析顯示溫膽湯治療哮喘主要通路有PI3K-Akt信號(hào)通路、內(nèi)分泌抵抗、細(xì)胞凋亡、cAMP信號(hào)通路等通路為主;KEGG通路與基因之間的網(wǎng)絡(luò)圖中關(guān)聯(lián)數(shù)量較多的基因主要有MAPK3、MAPK1、Akt1等。其中,最新研究表明,通過(guò)靶向PI3K/Akt整合素軸的氣道上皮修復(fù)是治療兒童喘息和哮喘的新途徑[23]。哮喘發(fā)生主要的因素是氣道炎癥與氣道重塑及氣道高反應(yīng)等,PI3K-Akt通路不但可以減輕氣道炎癥,還可以抑制氣道重塑,從而改善哮喘癥狀。氣道細(xì)胞凋亡的積聚可能是導(dǎo)致氣道高反應(yīng)性的重要因素。凋亡細(xì)胞能否及時(shí)清除與哮喘的發(fā)生和病程有關(guān)[24]。研究發(fā)現(xiàn),cAMP信號(hào)通路在多系統(tǒng)及細(xì)胞代謝等方面發(fā)揮著重要作用,其中某些基因的異常表達(dá)與哮喘病理生理的變化過(guò)程具有重要關(guān)聯(lián)[25]。還有文獻(xiàn)表明,該通路可能是肺腸同治哮喘的物質(zhì)基礎(chǔ)之一[26]。
本文通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)溫膽湯治療哮喘進(jìn)展分析,推測(cè)其可能是通過(guò)多成分、多靶點(diǎn)、多通路的相互關(guān)系進(jìn)行作用,可進(jìn)一步針對(duì)其影響氣道重塑、信號(hào)傳導(dǎo)和免疫代謝等方面進(jìn)行實(shí)驗(yàn)證實(shí)。溫膽湯治療哮喘的作用機(jī)制PI3K-Akt、cAMP等信號(hào)通路可能有關(guān),作用于MAPK3、MAPK1、Akt1等相關(guān)受體。目前關(guān)于其中的機(jī)制研究較少,盡管以上結(jié)論是通過(guò)查閱數(shù)據(jù)庫(kù)所得,仍可為科研實(shí)驗(yàn)提供了新思路。本次獲得信號(hào)通路可能就是溫膽湯治療哮喘的主要通路,后期可通過(guò)實(shí)驗(yàn)對(duì)通路及相關(guān)因子進(jìn)行驗(yàn)證,以期為中醫(yī)藥的發(fā)展提供更好的基礎(chǔ)理論依據(jù),為中醫(yī)藥的蓬勃發(fā)展做貢獻(xiàn)。