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        肺炎克雷伯菌莢膜血清型、毒力基因和耐藥性研究*

        2021-07-29 02:25:24張漢園
        關(guān)鍵詞:耐藥

        施 瑜,王 震,張漢園,李 瑩

        江蘇省鎮(zhèn)江市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院檢驗(yàn)科,江蘇鎮(zhèn)江 212000

        肺炎克雷伯菌(KPN)是人和動(dòng)物消化道及呼吸道的正常菌群,也是臨床重要的機(jī)會(huì)致病菌。近3年來(lái)CHINET細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)網(wǎng)的數(shù)據(jù)顯示,KPN已經(jīng)成為臨床占比第二位的致病菌,對(duì)碳青霉烯類抗菌藥物的耐藥率在腸桿菌科中為最高,在25.00%以上[1-3]。根據(jù)KPN在瓊脂平板上的黏液性質(zhì)可分為經(jīng)典型肺炎克雷伯菌(cKP)和高黏液肺炎克雷伯菌(HvKP),HvKP因其攜帶更多的毒力基因,具有比cKP更高的毒力,往往會(huì)引起較為嚴(yán)重的肺炎、敗血癥、眼內(nèi)炎、壞死性筋膜炎和各臟器的膿腫等多部位的感染,嚴(yán)重者可導(dǎo)致死亡[4-5],呈現(xiàn)出高毒力、高致病的特性。KPN的毒力因子包括莢膜多糖抗原、鐵攝入系統(tǒng),菌毛的黏附作用等,包括有rmpA、magA、wcaG、fimH、kfu、Aero等毒力基因,這些毒力基因的表達(dá)都大大增加了KPN的侵襲力。本次研究重點(diǎn)對(duì)本院2019年1-9月臨床分離的KPN的黏液表型、莢膜血清型、毒力基因和耐藥性的相互關(guān)系進(jìn)行分析,現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 資料與方法

        1.1標(biāo)本來(lái)源 收集本院2019年1-9月臨床分離的非重復(fù)菌株。所有菌株均經(jīng)珠海迪爾的DL-96Ⅱ細(xì)菌鑒定系統(tǒng)鑒定為KPN,菌種保存于-80 ℃超低溫醫(yī)用冰箱中。藥敏結(jié)果參照美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(CLSI)提供的(M100-S28)的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)判讀。

        1.2儀器與試劑 3110型CO2恒溫培養(yǎng)箱(美國(guó)Thermo公司),-80 ℃超低溫醫(yī)用冰箱(海爾公司)、高速低溫離心機(jī)(湖南湘儀公司),金屬干式加熱儀(Labnet公司),mini 1610 PCR擴(kuò)增儀(杭州朗基公司),EPS-600電泳儀(上海天能公司),紫外線凝膠成像儀(美國(guó)Bio-Rad公司);哥倫比亞血平板和中國(guó)藍(lán)平板(上海科瑪嘉公司),Premix TaqTM Version 2.0 plus dye、DL2000 DNA標(biāo)志物、瓊脂糖均購(gòu)自日本Taraka公司,GoldviewⅠ型核酸染色劑(北京索萊寶科技有限公司)。

        1.3方法

        1.3.1菌株復(fù)蘇、轉(zhuǎn)種、分純和鑒定 將保存于-80 ℃超低溫冰箱的菌種復(fù)蘇,轉(zhuǎn)種于血平板,35 ℃培養(yǎng)18 h,挑取血平板上單個(gè)菌落進(jìn)行純培養(yǎng),分純后的菌落經(jīng)DL-96Ⅱ細(xì)菌鑒定儀鑒定為KPN,并進(jìn)行藥敏試驗(yàn)。所有鑒定均嚴(yán)格按照《全國(guó)臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》第四版操作。

        1.3.2質(zhì)控菌株 大腸埃希菌(ATCC25922)、肺炎克雷伯菌(ATCC700603) 均購(gòu)自江蘇省臨床檢驗(yàn)中心。

        1.3.3黏液絲試驗(yàn)(ST) 用接種環(huán)蘸取菌落向上挑起,重復(fù)兩次。如黏液絲不能挑起或長(zhǎng)度小于5 mm,判定為ST陰性;如黏液絲長(zhǎng)度等于或超過(guò)5 mm則判定為ST陽(yáng)性,即高黏液表型菌(HvKP)[6]。

        1.3.4DNA模板制備 1.5 mL的EP管中加入400 μL SDS裂解液,用接種環(huán)挑取適量菌落于裂解液中混勻。置于金屬干式加熱儀中100 ℃加熱20 min,12 000 r/min,4 ℃高速離心10 min,上清液即為DNA模板,置于-20 ℃?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.5莢膜血清型和毒力基因檢測(cè) 采用PCR法擴(kuò)增K1、K2、K5、K20、K54、K57 6種主要莢膜血清型和rmpA、magA、wcaG、fimH、kfu、Aero 6種毒力基因。引物委托寶日醫(yī)生物技術(shù)(北京)有限公司合成。PCR反應(yīng)體系為50 μL:Premix Taq plus酶25 μL,上、下游引物(10 μmol/L)各1 μL,DNA模板5 μL,ddH2O 18 μL。擴(kuò)增條件:95 ℃,預(yù)變性3 min、94 ℃變性40 s、50~59 ℃退火40 s、72 ℃延伸60 s、經(jīng)35個(gè)循環(huán),最后72 ℃延伸10 min。引物序列參考文獻(xiàn)[6-9]、退火溫度和產(chǎn)物長(zhǎng)度見(jiàn)表1。取 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物10 μL進(jìn)行1.50%瓊脂糖凝膠電泳120 V 80 min,在紫外凝膠成像儀上觀察結(jié)果。

        表1 KPN的莢膜血清型和毒力基因引物序列

        續(xù)表1 KPN的莢膜血清型和毒力基因引物序列

        1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用Whonet 5.6軟件對(duì)細(xì)菌耐藥進(jìn)行統(tǒng)計(jì),采用SPSS25.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。計(jì)數(shù)資料采用菌株數(shù)和百分率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1莢膜血清型和毒力基因分布 93株KPN中6種莢膜血清型和6種毒力基因均有檢出。其中K2型檢出率最高,為21.50%(20/93),其次是K1型占13.98%(13/93),K57型占8.60%(8/93),K20型和K54型均占3.24%(3/93),K5型占1.08%(1/93)。毒力基因中fimH占比最高,為96.80%(90/93);其次是rmpA和Aero,均為64.52%(60/93);magA僅在K1型中檢出;wcaG僅在K1和K54型中檢出。同時(shí)檢測(cè)到6種毒力基因的KPN菌株為13.98%(13/93),全部出現(xiàn)在K1型中;同時(shí)檢出4種和3種毒力基因的分別為11.83%(11/93)和33.33%(31/93),主要見(jiàn)于K2、K20、K54、K57型中;rmpA+fimH+Aero的組合最為多見(jiàn),占33.33%(31/93),有22株KPN只檢出1種毒力基因fimH。有2株KPN未檢測(cè)到上述6種莢膜血清型和6個(gè)毒力基因。見(jiàn)表2。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物見(jiàn)圖1。

        表2 93株KPN的莢膜血清型和毒力基因的檢測(cè)結(jié)果[n(%)]

        2.2不同黏液表型KPN的莢膜血清型與毒力基因比較 ST陽(yáng)性株,即HvKP占51株(54.84%),6種莢膜血清型在HvKP中均有檢出,為78.43%(40/51);ST陰性株(cKP)為42株(45.16%),除了K5和K57型,其余4種血清型在cKP中均有檢出,為19.05%(8/42),主要莢膜血清型在不同黏液表型的檢出率比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。毒力基因rmpA、wcaG和Aero在HvKP的檢出率明顯高于cKP,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),magA、fimH和kfu在二者的構(gòu)成比比較,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。HvKP中同時(shí)攜帶3種以上毒力基因者為86.27%(44/51),高于cKP的26.19%(11/42),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)表3。

        表3 不同黏液表型KPN的莢膜血清型與毒力基因檢測(cè)結(jié)果[n(%)]

        2.3不同黏液表型菌的藥敏比較 除氨芐西林對(duì)KPN的耐藥率為100.00%外,HvKP對(duì)常見(jiàn)抗菌藥物的耐藥率均低于cKP,沒(méi)有發(fā)現(xiàn)對(duì)亞胺培南、美羅培南、派拉西林/他唑巴坦、慶大霉素和阿米卡星耐藥的菌株。除亞胺培南和美羅培南外,其他12種常見(jiàn)抗菌藥物在兩者之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)表4。

        注:M為DL2000 DNA標(biāo)志物;1~6泳道分別為K1、K2、K5、K20、K54、K57血清型,片段長(zhǎng)度分別是1 283、641、280、741、881、1 037 bp;7~12泳道分別是毒力基因wcaG、fimH、kfu、magA、rmpA和Aero,片段長(zhǎng)度分別是169、688、797、1 283、536、556 bp。

        表4 不同黏液表型KPN對(duì)抗菌藥物的耐藥情況[n(%)]

        續(xù)表4 不同黏液表型KPN對(duì)抗菌藥物的耐藥情況[n(%)]

        2.4多重耐藥菌與黏液表型、莢膜血清型和毒力基因的相關(guān)性比較 93株KPN中,檢出20株多重耐藥菌,其中產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶(ESBLS)的KPN 18株(19.35%),耐碳青霉烯類抗菌藥物的KPN 2株(2.15%),多重耐藥菌在黏液表型、主要莢膜血清型、rmpA、magA、wcaG、Aero的檢出率均明顯高于耐藥菌,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)表5。

        表5 耐藥菌與敏感菌的莢膜血清型和毒力基因比較[n(%)]

        3 討 論

        自從20世紀(jì)80年代臺(tái)灣地區(qū)報(bào)道了可引起多處非傳統(tǒng)部位感染的HvKP以來(lái)[10],越來(lái)越多的研究發(fā)現(xiàn)HvKP相較cKP而言,其細(xì)菌的黏液表型特征、致病特點(diǎn)都有很大的差異[11]。其主要特征是可引起健康人群、沒(méi)有基礎(chǔ)疾病的亞太人群的感染,同時(shí)具有從原始感染部位轉(zhuǎn)移至其他組織器官,從而導(dǎo)致遠(yuǎn)端、不常見(jiàn)部位如眼和軟組織等處的感染,這在非免疫缺陷患者革蘭陰性桿菌的感染中非常罕見(jiàn)[12]。本次研究中,HvKP占54.85%,cKP占45.16%,本次分離的KPN以高黏液表型為主。

        莢膜多糖(CPS)被認(rèn)為是KPN最重要的毒力因子之一,CPS親水并帶有負(fù)電荷,與同樣帶有負(fù)電荷的吞噬細(xì)胞之間存在靜電相斥現(xiàn)象,可以阻滯和抵抗宿主吞噬細(xì)胞的吞噬和消化作用。根據(jù)CPS抗原的不同,可將KPN分為82個(gè)血清型[13],其中K1、K2、K5、K20、K54、K57型莢膜血清型與HvKP密切相關(guān),是最常見(jiàn)的、毒力最強(qiáng)的型別,具有更強(qiáng)的致病性[14]。本次研究中6種莢膜血清型都有檢出,其中以K2型為主(21.50%),其次是K1型(13.98%)和K57型(8.60%)。K1/K2/K57型在HvKP的檢出率(70.59%)明顯高于cKP(11.90%),K57型只出現(xiàn)在HvKP中,與上海地區(qū)相似[15]。雖然K1/K2型主要見(jiàn)于高黏液表型中,但是在非黏液表型也有少量檢出,所以僅僅通過(guò)ST試驗(yàn)可能會(huì)漏檢高產(chǎn)毒菌株,檢測(cè)人員需要通過(guò)PCR檢測(cè)莢膜血清型和毒力基因才能更好地篩選出產(chǎn)毒菌株。

        6種毒力基因在13株K1型菌中全部都有檢出;其他5個(gè)型別同時(shí)攜帶3~4種毒力基因者(82.86%)明顯高于未分型者(30.95%);HvKP組中同時(shí)攜帶3種以上毒力基因者(86.27%)明顯高于cKP組(30.95%)。此次研究證實(shí)了高毒力血清型攜帶有更多的毒力基因;K1型毒力相較其他莢膜血清型而言,毒力更強(qiáng)。攜帶有多種毒力基因的K1型與侵襲性綜合征(尤其在肝膿腫)密切相關(guān)[10],實(shí)驗(yàn)室需要加強(qiáng)對(duì)K1型KPN的監(jiān)控。

        本次研究發(fā)現(xiàn),fimH在6種毒力基因中的檢出率最高,為 96.80%;其次是rmpA和Aero,均為64.52%,magA檢出率最低。fimH主要編碼Ⅰ型菌毛(TIP)蛋白[16],fimH主要介導(dǎo)細(xì)菌的TIP與上皮細(xì)胞的甘露糖受體結(jié)合,使KPN黏附于宿主細(xì)胞上,同時(shí)還介導(dǎo)生成生物膜[17],因?yàn)椴粎⑴c黏液的形成,所以在HvKP株(98.04%)和cKP株(96.24%)的分布沒(méi)有差異,與相關(guān)報(bào)道一致[18]。rmpA作為黏液表型調(diào)節(jié)基因,屬于轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子家族,在多種莢膜血清型的合成中起到正向調(diào)控作用[15],形成高黏液表型,rmpA基因存在于219×103大質(zhì)粒上,CHEN等[19]發(fā)現(xiàn)該毒力質(zhì)粒上還同時(shí)表達(dá)包括Aero在內(nèi)的多種毒力基因,HvkP株含有此毒力質(zhì)粒,可協(xié)同調(diào)控HvKP毒力的形成,增加KPN的侵襲力;Aero編碼的是鐵載體中最為重要的氣桿菌素,可與宿主轉(zhuǎn)鐵蛋白中Fe3+結(jié)合形成螯合物,通過(guò)細(xì)胞膜上特定的鐵蛋白受體進(jìn)入細(xì)菌體內(nèi),從而干擾宿主體內(nèi)的鐵代謝,此外鐵載體還可以催化產(chǎn)生自由基,造成宿主組織細(xì)胞的損傷[20]。本次研究發(fā)現(xiàn),所有rmpA陽(yáng)性的菌株Aero也同時(shí)陽(yáng)性,在HvKP株的檢出率(96.08%)明顯高于在cKP中的檢出率(26.19%),在6種血清型的檢出率(95.83%)明顯高于非分型組(31.11%),提示rmpA和Aero是KPN的主要毒力基因。magA是黏液相關(guān)基因,僅存在于K1型的質(zhì)粒上,編碼K1型特異性的Wzy聚合酶[21],是K1型莢膜生成的主要調(diào)控因子;wcaG編碼的基因產(chǎn)物是CPS中的巖藻糖,ZHENG等[22]發(fā)現(xiàn)wcaG不僅參與CPS的合成,還是KPN形成生物膜的一個(gè)獨(dú)立危險(xiǎn)因素。本次研究發(fā)現(xiàn),magA基因僅存在于K1型菌,證實(shí)了K1型和magA具有相關(guān)性,而wcaG基因只存在于K1和K54型中,與報(bào)道一致[23]。kfu編碼磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)的一些成分,有助于KPN攝入Fe3+,增強(qiáng)了KPN毒力[24]。

        細(xì)菌耐藥方面,除了氨芐西林、亞胺培南和美羅培南的耐藥率在兩組KPN無(wú)差異外,HvKP的耐藥率明顯低于cKP。除了對(duì)氨芐西林的耐藥率為100.00%外,HvKP對(duì)其他抗菌藥物的耐藥率均較低,僅有1株HvKP產(chǎn)ESBLS,這株產(chǎn)ESBLS的HvKP為K2型,毒力基因的模式是rmpA+fimH+Aero。cKP中產(chǎn)ESBLS的檢出率為40.47%,只有1株為K20型,其余為未分型血清型,大多數(shù)只檢出1種毒力基因fimH;cKP中檢出2株CRE,均為未分型血清型,毒力基因的模式均為fimH+kfu。劉盼盼[25]研究發(fā)現(xiàn),經(jīng)亞胺培南體外誘導(dǎo)HvKP產(chǎn)生耐藥后,其高黏液表型消失、rmpA等毒力基因丟失、小鼠致死率下降、大多數(shù)毒力基因表達(dá)下調(diào)。本次研究中,多重耐藥菌的莢膜血清型的檢出率明顯低于敏感菌,除了fimH和kfu,其余4種毒力基因均存在明顯差異,究其原因,可能是KPN在獲得耐藥基因的同時(shí)丟失了質(zhì)粒上的毒力基因,導(dǎo)致毒力基因的表達(dá)發(fā)生改變,從而引起表型和毒力的變異。

        綜上所述,本次研究的KPN以HvKP為主,K1、 K2和K57型是本院常見(jiàn)的莢膜血清型,K1型所攜帶的毒力基因最多;rmpA和Aero是KPN的主要毒力基因;HvKP攜帶的莢膜血清型和毒力基因均明顯高于cKP,但是耐藥率明顯低于cKP。本次研究還發(fā)現(xiàn)了1株產(chǎn)ESBLS的高產(chǎn)毒菌,這種高產(chǎn)毒多重耐藥菌一旦侵入機(jī)體將會(huì)為臨床的治療帶來(lái)極大地挑戰(zhàn),因此必須引起高度重視,應(yīng)深入對(duì)此類菌株研究。

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