肖玉娟 甘美裕 林俊杰 莊峙廈 何少貴 傅 奇
(廈門華廈學院環(huán)境與公共健康學院,廈門 361024)
DHA是一種具有多種生理功能的多不飽和脂肪酸[1-3],在食品、藥品以及飼料等領域得到廣泛應用[4-6]。DHA的主要來源包括深海魚類和微生物[7],其中利用微生物發(fā)酵生產(chǎn)DHA由于生產(chǎn)周期短、產(chǎn)量高、培養(yǎng)條件簡單、可規(guī)模化生產(chǎn)等優(yōu)點,已成為DHA最主要的來源之一[8-10]。
破囊壺菌科(Thraustochytriaceae)包括Aurantiochytrium、Schizochytrium、Oblongichytrium等屬[11],其中Aurantiochytrium和Schizochytrium屬的多個種可以生產(chǎn)DHA[12, 13],2010年,我國批準了Schizochytrium屬生產(chǎn)的DHA藻油作為新資源食品(衛(wèi)計委2010年第3號令)。Chang等[14]的研究表明,Aurantiochytrium屬菌種與Schizochytrium屬菌種相比,在培養(yǎng)基利用和脂肪酸生產(chǎn)上具有自身的特色和優(yōu)勢,同一屬的不同菌株在DHA表達上也有較大的差異,篩選產(chǎn)DHA的不同種類破囊壺菌具有一定的研究價值。
1 材料與方法
1.1.1 樣本
分離菌株樣本為腐木,采集于廈門市集美區(qū)紅樹林,置于4 ℃冷藏[15]。
1.1.2 試劑
2216E(液體);2216E瓊脂;葡萄糖(食品級);酵母浸粉;海水晶;谷氨酸鈉、維生素B1、維生素B12、泛酸鈣、氨水(25%~28%)、乙醇、石油醚:分析純,DHA甲酯標準品(色譜純);真菌DNA提取試劑盒;ITS擴增引物ITS1: 5’-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3’、ITS4: 5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’。
Aeris-bg096型PCR儀,HE99型核酸電泳儀,211B型搖床,LRH-250型生化培養(yǎng)箱,Quanta450型掃描電鏡,GC-2010plus型島津氣相色譜,GUJS-50L型發(fā)酵罐,BL-18X型真空冷凍干燥器。
1.3.1 樣品處理
取腐木25 g加入225 mL 2216E液體培養(yǎng)基拍打均質(zhì),4層紗布過濾后,于外加3%葡萄糖的2216E瓊脂平板稀釋涂布,28 ℃培養(yǎng)72 h,取細胞直徑顯著大于釀酒酵母的球狀菌菌落劃線純化[15]。
1.3.2 細胞形態(tài)觀察
純化后的菌株接種至添加3%葡萄糖的2216E液體培養(yǎng)基,28 ℃培養(yǎng)48 h,0.22 μm濾膜過濾收集細胞,取濾膜進行掃描電鏡觀察細胞形態(tài)。
1.3.3 菌種鑒定
用真菌基因組DNA抽提試劑盒,提取菌株的總DNA;用ITS引物擴增(具體的引物序列),所得PCR產(chǎn)物電泳純化后進行測序。
ITS擴增條件:94 ℃預變性4 min;94 ℃變性45 s,55 ℃退火55 s,72 ℃延伸60 s,共35個循環(huán);72 ℃延伸10 min。
將測序結(jié)果在Genbank進行比對,選擇相似度較高的菌種序列,分別用BioEdit[16]和Clustal X[17]進行比對和編輯,取有效區(qū)間,采用最大簡約算法,用Paup* 4.0構(gòu)建進化樹[18, 19],選擇AspergillusnigerATCC 16888[20]作為外群。
1.3.4 發(fā)酵
由于破囊壺菌對氧、補料和pH控制要求較高,為了保證脂肪酸組成分析結(jié)果與工業(yè)生產(chǎn)過程相一致,使用50 L發(fā)酵罐進行菌體培養(yǎng),并結(jié)合文獻報道與預實驗結(jié)果選擇發(fā)酵條件。
種子培養(yǎng)基使用成品2216E液體培養(yǎng)基加入3%葡萄糖,30 ℃,180 r/min培養(yǎng)48 h。
發(fā)酵培養(yǎng)基[21, 22]:葡萄糖 5 g/L,酵母浸粉 5 g/L,谷氨酸鈉 10 g/L,MgSO4·7H2O 2 g/L,海水晶 12 g/L,維生素B10.009 5 g/L,維生素B120.000 15 g/L,泛酸鈣 0.003 2 g/L。
50 L發(fā)酵罐中初始裝液量為25 L;接種量為10%;發(fā)酵溫度為30 ℃;4h后流加飽和葡萄糖溶液,控制發(fā)酵液殘?zhí)窃? g/L,96 h停止補料;10%磷酸和氨水控制pH在5.5~6.5;初始攪拌速度為200 r/min,初始通氣比為1∶0.5,通過調(diào)節(jié)攪拌速度和通氣量控制溶解氧(DO)在12 h內(nèi)不低于20、40 h內(nèi)不低于5,40 h后保持在0左右[23];98 h放罐,每4 h取樣測發(fā)酵液殘?zhí)?,? h取樣檢測發(fā)酵液中生物量及細胞中的總脂肪酸和DHA含量。
1.3.5 生物量、殘?zhí)桥c油脂檢測
生物量:取發(fā)酵液100 mL于8 000 r/min離心,棄上清液后,去離子水振蕩洗滌2次,真空冷凍干燥2 d稱質(zhì)量。
殘?zhí)牵篋NS法測定發(fā)酵液中葡萄糖[24]。
總脂肪:按照GB 5009.168—2016《食品中脂肪酸的測定》酸水解法測定總脂肪。
脂肪酸測定:提取的總脂肪按照GB 5009.168—2016《食品中脂肪酸的測定》皂化并甲酯化后,按照外標法測定DHA[25]。
從海水腐木中篩選得到一株球狀真菌,菌落白色、濕潤,編號為HX2019010,細胞形態(tài), HX2019010細胞掃描電鏡圖如圖1所示,放大倍數(shù)為6 000倍,左側(cè)為年輕細胞,右側(cè)中褶皺較多的細胞為老齡細胞。
圖1 HX2019010細胞掃描電鏡圖
菌株HX2019010 ITS序列經(jīng)測序拼接后,得到460 bp有效序列,于Genbank進行比對發(fā)現(xiàn)該序列與Aurantiochytrium、Schizochytrium、Thraustochytrium等破囊壺菌科菌株相似度相對較高。選擇相似度較高的菌株ITS序列構(gòu)建進化樹, 基于ITS序列的進化樹如圖2所示。
樹長為2 290,一致性指數(shù)(CI)為0.527,保留指數(shù)(RI)為0.774,同性指數(shù)(HI)為0.473。各分枝自展值較高,樹形結(jié)構(gòu)可靠,其中HX2019010菌株與Aurantiochytrium聚合在一枝。但值得注意的是該菌株ITS序列與Genbank中現(xiàn)有ITS序列全序列相似度較低,相似度最高的AurantiochytriumlimacinumIMB177、AurantiochytriumlimacinumIMB181菌株也僅有部分區(qū)域相似度達92%,不足以判定為同一個種,因此,結(jié)合細胞形態(tài),初步鑒定為Aurantiochytriumsp. HX2019010。ITS序列上傳至Genbank,序列號為MN931688。
發(fā)酵過程中pH、DO、殘?zhí)?、生物量、總脂肪和DHA含量曲線, 菌株HX2019010發(fā)酵曲線如圖3所示,此批曲線僅用于標示后續(xù)用于脂肪酸組成分析所用細胞的制備過程,不代表最優(yōu)發(fā)酵條件。
圖2 基于ITS序列的進化樹
從圖3可以看出,菌株HX2019010在此培養(yǎng)條件下快速生長并合成DHA,接種后8 h左右進入對數(shù)生長期,56 h后細胞中脂肪大量積累。98 h發(fā)酵后,生物量可達108.27 g/L;干細胞中總脂肪含量達26.26%,發(fā)酵液中脂肪含量達28.43 g/L;DHA占細胞干質(zhì)量的8.47%,發(fā)酵液中DHA含量達9.17 g/L。
圖3 菌株HX2019010發(fā)酵曲線
從總脂肪與DHA增長曲線可以看出,后期總脂肪和DHA都在積累,但DHA在脂肪酸中的比例有所降低,與裂殖壺菌發(fā)酵過程中后期DHA大量積累有顯著差異[26-28],可能系培養(yǎng)條件更有利于Aurantiochytriumsp. HX2019010積累其他脂肪酸組分或不利于其他脂肪酸向DHA轉(zhuǎn)化,后續(xù)將繼續(xù)對其發(fā)酵條件進行優(yōu)化。
發(fā)酵罐中培養(yǎng)48 h和98 h的Aurantiochytriumsp. HX2019010細胞離心、洗滌,真空冷凍干燥48 h后,按照GB 5009.168—2016外標法進行測定,脂肪酸含量以每100 g干細胞中的脂肪酸質(zhì)量計,Aurantiochytriumsp. HX2019010脂肪酸組成見表1。Aurantiochytriumsp. HX2019010細胞主要脂肪酸組成為棕櫚酸(35.57%~37.41%)、DHA(32.25%~45.86%)和肉豆蔻酸(7.43%~9.22%)。發(fā)酵98 h后細胞中各種脂肪酸含量普遍高于48 h細胞,總脂肪酸含量增加103.42%,其中棕櫚酸增加93.37%,肉豆蔻酸增加152.35%,DHA增加43.07%。在發(fā)酵后期,DHA積累相對較少,表明DHA的合成受到抑制,可能與氧、有機氮源和生物素供應不足以及培養(yǎng)溫度有關(guān)[29]。
菌株Aurantiochytriumsp. HX2019010胞內(nèi)脂肪酸中DHA比例波動較大,較高值可達45.86%,高于商業(yè)化生產(chǎn)DHA的裂殖壺菌SchizochytriumlimacinumSR21中DHA比例(32%~40%),但胞內(nèi)總油脂含量較低[23]。與牟桐等[30]篩選的6株破囊壺菌相比,飽和脂肪酸棕櫚酸和肉豆蔻酸含量較高,但總油脂產(chǎn)量也較高。與李晶晶等[31]篩選的破囊壺菌Sw7菌株脂肪酸組成較為相似,總脂肪酸含量較低,但發(fā)酵液中細胞密度顯著較高。
表1 Aurantiochytrium sp. HX2019010脂肪酸組成
綜合分析,菌株Aurantiochytriumsp. HX2019010在發(fā)酵罐中可實現(xiàn)高密度發(fā)酵,且DHA占總脂肪酸含量較高,DHA產(chǎn)量顯著高于已報道的Aurantiochytrium屬菌株[29],具有進一步研究的價值,但細胞中油脂含量較低,且發(fā)酵后期DHA積累較少,有待于進一步優(yōu)化發(fā)酵條件。
從廈門市集美區(qū)海水腐木中篩選得到一株產(chǎn)DHA的球狀真菌HX2019010,經(jīng)ITS序列比對與系統(tǒng)發(fā)育分析,結(jié)合掃描電鏡觀察,初步鑒定為Aurantiochytriumsp. HX2019010。該菌株在50 L發(fā)酵罐中可實現(xiàn)較高密度的發(fā)酵,98 h培養(yǎng)后發(fā)酵液中生物量可達108.27 g/L,脂肪含量達28.43 g/L,DHA含量達9.17 g/L。細胞中脂肪酸主要成分為棕櫚酸、DHA和肉豆蔻酸,含量與比例受發(fā)酵時間或培養(yǎng)條件的影響,其中DHA占總脂肪酸的32.25%~45.86%,具有進一步研究的價值。該菌株ITS序列與Genbank中現(xiàn)有破囊壺菌序列存在較大差異,不排除其為Aurantiochytrium新種的可能性,有待進行全基因組平均核苷酸一致性(Average Nucleotide Identity, ANI)分析。