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        蛋白質(zhì)組學(xué)在唐氏綜合征產(chǎn)前篩查中的應(yīng)用

        2021-06-29 08:00:34趙晟隆張為遠(yuǎn)
        醫(yī)學(xué)綜述 2021年11期
        關(guān)鍵詞:唐氏羊水組學(xué)

        趙晟隆,張為遠(yuǎn)

        (首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京婦產(chǎn)醫(yī)院圍產(chǎn)醫(yī)學(xué)部,北京100026)

        唐氏綜合征是活產(chǎn)兒中最常見的非整倍體常染色體疾病,由第21號染色體的三倍體引起,表型累及身體多個系統(tǒng),尤其是骨骼、肌肉和心血管系統(tǒng),患者通常有身材矮小、肌張力低下、寰樞椎不穩(wěn)定、神經(jīng)元密度降低、腦發(fā)育不全、智力障礙和先天性心臟病(尤其是房室間隔缺損)等。唐氏綜合征患者還易并發(fā)甲狀腺功能減退、自身免疫性疾病、阻塞性睡眠呼吸暫停、癲癇、聽力和視力障礙、血液系統(tǒng)疾病(包括白血病)、復(fù)發(fā)感染、焦慮癥和早發(fā)性阿爾茨海默病等疾?。?-2]。全球唐氏綜合征患病率為7∶5 000;新生兒唐氏綜合征發(fā)病率為1∶1 000[3];中國新生兒唐氏綜合征發(fā)病率為1∶800[4]。目前,唐氏綜合征的表型癥狀難以治愈,導(dǎo)致患病個體及其家庭的生活質(zhì)量受到嚴(yán)重影響。因此,明確的產(chǎn)前篩查結(jié)果是診斷胎兒唐氏綜合征的重要線索?,F(xiàn)對母血、羊水、胎盤和臍血中的蛋白質(zhì)組學(xué)研究及其在唐氏綜合征產(chǎn)前篩查中的應(yīng)用予以綜述。

        1 蛋白質(zhì)組學(xué)簡介

        染色體異常導(dǎo)致基因表達(dá)量和質(zhì)的差異,基因通過其所表達(dá)的蛋白質(zhì)發(fā)揮對生命體的調(diào)控功能,蛋白質(zhì)變化是生命功能失常的直接因素,隨著研究的不斷深入,蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)運(yùn)而生[5]。蛋白質(zhì)組學(xué)為“一種細(xì)胞、組織或有機(jī)體所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)”,已被作為研究胎兒狀況和妊娠相關(guān)疾病的平臺,如胎兒非整倍體、早產(chǎn)、子癇前期、宮內(nèi)感染和胎兒窘迫[6]。目前,需要通過一種更安全、更快速的替代有創(chuàng)羊膜腔穿刺術(shù)的非侵入性方法,并利用其獲得的生物樣本材料[如母體各種體液樣本(如血漿、血清、尿液、宮頸黏液、陰道分泌物、唾液和羊水)和胎兒樣本(如胎盤滋養(yǎng)細(xì)胞、胎膜和臍血)]尋找妊娠相關(guān)病理標(biāo)志物[7]。

        2 蛋白質(zhì)組學(xué)的方法和技術(shù)

        根據(jù)標(biāo)本的性質(zhì)進(jìn)行樣品分離、制備和破碎,且肽和蛋白質(zhì)水平的分離步驟可能有所不同。鑒定蛋白質(zhì)組學(xué)所使用的標(biāo)記策略和總體方法匯總見表1。

        表1 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)及其功能

        2.1 雙向凝膠電泳 雙向凝膠電泳是利用蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)和分子質(zhì)量兩項(xiàng)獨(dú)立的物理化學(xué)參數(shù)來分離復(fù)雜的蛋白質(zhì)混合物。等電聚焦是通過電流通過時形成電壓梯度的電解質(zhì)溶液來實(shí)現(xiàn)[8]。在電場的作用下,蛋白質(zhì)根據(jù)電荷遷移到pH值與蛋白質(zhì)等電點(diǎn)相匹配的電解質(zhì)區(qū)域。蛋白質(zhì)在第一個維度被電荷分離,而在第二個維度則根據(jù)它們的質(zhì)量不同而被分離,分子量分離是基于電場作用下蛋白質(zhì)遷移速率的差異,通過聚丙烯酰胺凝膠中的電泳來實(shí)現(xiàn)的[6]。

        2.2 質(zhì)譜法 質(zhì)譜是研究蛋白質(zhì)混合物最有效的方法之一,適用于特定研究任務(wù)的高通量色譜-質(zhì)譜分析策略在蛋白質(zhì)形式研究方法中占據(jù)核心地位。根據(jù)研究目的將基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)方法分為適合篩選研究的鳥槍法以及用于分析特定蛋白質(zhì)形式的靶向性方法[9]。在典型的蛋白質(zhì)組學(xué)研究中,在質(zhì)譜前行色譜分離,其允許在一個由兩個接觸的非混合相組成的系統(tǒng)中分離多肽,其中一個相通常相對于另一個相是流動的,即固定相移動[10]。

        2.3 酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA) ELISA是一種基于蛋白質(zhì)畸變定位的方法,被用來鑒定病理生理?xiàng)l件。通過固定在固體表面的抗原與添加酶偶聯(lián)抗體之間的相互作用來測量酶活性的波動,酶活性的波動與樣品中的抗原抗體濃度成正比。ELISA基于固定的蛋白質(zhì)(抗體)功能活性以及高度特異性的抗體-酶復(fù)合物相互作用兩個原則[11]。

        3 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選唐氏綜合征標(biāo)志物

        胎兒發(fā)育異常反映在完整細(xì)胞、核酸(DNA和信使RNA)、多肽、蛋白質(zhì)和酶等方面,它們在孕期保持著動態(tài)平衡,以維持正常的生理功能;胎兒發(fā)育異常會破壞這種固有平衡,引起蛋白質(zhì)表達(dá)水平的改變[12]。既往有學(xué)者嘗試?yán)没蚪M學(xué)探索新的負(fù)責(zé)表達(dá)生理變異的基因,但由于人類蛋白質(zhì)組研究的復(fù)雜性,研究進(jìn)展并不令人滿意[13]。近年蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)才被用于妊娠研究,如通過識別正常胎兒和異常胎兒蛋白質(zhì)的差異可能揭示特定疾病的發(fā)生途徑,以加深對胎兒發(fā)育的認(rèn)識和了解[14]。

        3.1 母血特異性蛋白的篩選 早在2007年,Nagalla等[15]采用多種互補(bǔ)的蛋白質(zhì)組學(xué)方法(包括熒光二維凝膠電泳、二維液相色譜-色譜聚焦、多維蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)和基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜多肽圖譜)對56例唐氏綜合征篩查陽性孕婦[包括20例妊娠早期(孕11~13周)、36例妊娠中期(孕15~18周)]和56名正常妊娠女性的血清樣本進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),妊娠早期和中期的母體血清學(xué)樣本中分別有28種和26種蛋白的表達(dá)水平存在差異,其中孕早期19種、孕中期16種,孕早期和孕中期共有的蛋白10種。

        基于質(zhì)譜計(jì)數(shù)的多維蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)數(shù)據(jù)定量分析的蛋白有α1-酸性糖蛋白、血清淀粉樣蛋白A、內(nèi)α-胰蛋白酶抑制劑重鏈H4、血管緊張素原、載脂蛋白C-Ⅰ、纖維蛋白、血小板堿性蛋白、甲狀腺素運(yùn)載蛋白、載脂蛋白D和妊娠特異性糖蛋白。理論上,蛋白質(zhì)組學(xué)可以識別單一、高度選擇性的疾病生物標(biāo)志物。然而,經(jīng)目前反復(fù)研究證實(shí),單個分子與特定疾病表型關(guān)聯(lián)的確定不足以詳細(xì)評估病理或有效預(yù)測疾病結(jié)果。相反,雖然覆蓋疾病復(fù)雜性的生物標(biāo)志物(橫切面或縱切面)組合對個體間的變化不敏感,但更適合描述或代表疾病情況[16]。蔣瀅等[17]對7份確診唐氏綜合征胎兒的孕中期(14~20周)母體血清和同期7份正常胎兒母體血清行二維凝膠電泳顯示,唐氏綜合征組母體血清中表達(dá)差異1.5倍以上的蛋白質(zhì)點(diǎn)29個,其中19個表達(dá)上調(diào)、10個表達(dá)下調(diào);且經(jīng)質(zhì)譜分析有12個蛋白質(zhì)與差異表達(dá)2倍以上的8個蛋白質(zhì)點(diǎn)匹配,該組蛋白可能與載脂肪蛋白類、絲氨酸蛋白酶類、β2糖蛋白類、激肽原類和補(bǔ)體C3類等有關(guān);經(jīng)蛋白質(zhì)印跡驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),脫氧鳥苷三磷酸酶和β2糖蛋白1在唐氏綜合征胎兒孕中期母體血清中高表達(dá)。

        由于雙向凝膠電泳的局限性,現(xiàn)代蛋白質(zhì)組學(xué)研究大多采用電子噴霧質(zhì)譜進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,并主要依靠同位素標(biāo)記相對和絕對定量技術(shù)進(jìn)行定量分析,現(xiàn)已證明該系統(tǒng)非常有效[18]。López Uriarte等[3]采用納米升級超高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)分析不同組別(10例未妊娠、10例正常妊娠、9例唐氏綜合征妊娠)女性血清標(biāo)本蛋白水平的差異發(fā)現(xiàn),未妊娠女性血清標(biāo)本中有10種蛋白質(zhì),正常妊娠女性血清標(biāo)本中有8種蛋白質(zhì),而唐氏綜合征胎兒孕婦血清標(biāo)本有42種蛋白質(zhì)(包括C4b結(jié)合蛋白α鏈、間α-解密蛋白抑制劑重鏈H1、血液結(jié)合素、載脂蛋白E、激肽原1,亞型CRA-b、β2糖蛋白1、α1-酸性糖蛋白、補(bǔ)體因子H等);妊娠兩組女性血清中均含有大量的蛋白質(zhì),其中35種蛋白質(zhì)一致。

        基因調(diào)控是了解疾病機(jī)制的關(guān)鍵,因此利用同位素標(biāo)記相對和絕對定量技術(shù)進(jìn)行蛋白質(zhì)定量有助于同時鑒定和定量蛋白質(zhì)[19]。Zhao等[20]使用同位素標(biāo)記相對和絕對定量技術(shù)對10名未妊娠女性、10名正常妊娠女性和10例唐氏綜合征胎兒妊娠母體血清蛋白水平的變化進(jìn)行定量分析發(fā)現(xiàn),唐氏綜合征胎兒組和正常胎兒組的11種蛋白質(zhì)血清水平比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,其中6種蛋白質(zhì)水平上調(diào)、5種蛋白質(zhì)水平下調(diào),4種蛋白質(zhì)(妊娠特異性β1糖蛋白、組織蛋白酶D、血清淀粉樣蛋白A2和血清淀粉樣蛋白A)可能與唐氏綜合征相關(guān)。

        3.2 羊水標(biāo)志物的篩選 自20世紀(jì)50年代以來,羊水細(xì)胞被廣泛應(yīng)用于胎兒畸形的產(chǎn)前診斷。妊娠中期的羊水細(xì)胞數(shù)量為10~1 000個/μL,其通過產(chǎn)生的多種因子(細(xì)胞因子、脂質(zhì)和前列腺素等)應(yīng)答來自自分泌、旁分泌和內(nèi)分泌的信號[21]。由于上述內(nèi)分泌因子均在羊水中產(chǎn)生,羊水中含有大量根據(jù)基因型構(gòu)成和母胎調(diào)節(jié)而表達(dá)的蛋白質(zhì),此類蛋白質(zhì)包括酶、結(jié)構(gòu)蛋白、熱激蛋白和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白等,其構(gòu)成的平衡是孕期胎兒健康發(fā)育所必需的,而蛋白質(zhì)構(gòu)成的不平衡可導(dǎo)致妊娠并發(fā)癥的發(fā)生,這為疾病研究提供了新的視角[22-23]。

        目前唐氏綜合征主要通過測定甲胎蛋白、人絨毛膜促性腺激素和二聚體抑制素A水平進(jìn)行篩查,通常在妊娠15周左右進(jìn)行,假陰性率為22%~25%[24]。微陣列可在細(xì)胞水平上發(fā)現(xiàn)信使RNA表達(dá)的變化,但并不能提供關(guān)于細(xì)胞蛋白質(zhì)組的全面信息[25]。因此,需要更有效的直接測量蛋白質(zhì)表達(dá)的方法,基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜技術(shù)目前仍是測量蛋白質(zhì)表達(dá)的最有力工具[26-28]。但也有其他技術(shù)(如強(qiáng)陽離子交換)用于唐氏綜合征的蛋白質(zhì)檢測和分析[29]。Liu等[30]對妊娠18~22周產(chǎn)前診斷高危唐氏綜合征者行羊膜穿刺術(shù)檢測羊水細(xì)胞中的蛋白質(zhì)水平,結(jié)果顯示,唐氏綜合征羊水細(xì)胞18例,染色體正常羊水細(xì)胞20例;并采用雙向凝膠電泳和電子噴霧質(zhì)譜進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)了41個差異蛋白,在唐氏綜合征羊水細(xì)胞中有6種蛋白質(zhì)(鈣黏蛋白、核磷蛋白、延伸因子-1β、組織蛋白酶D、血小板活化因子乙酰水解酶IB亞基β和14-3-3蛋白β/α)表達(dá)水平顯著上調(diào)。免疫印跡法證實(shí),核磷蛋白和組織蛋白酶D在唐氏綜合征羊水中高表達(dá);此外,基因劑量效應(yīng)是導(dǎo)致唐氏綜合征表型不同的原因之一,由于基因數(shù)量較大,很難清楚地了解位于第21號染色體上的基因與唐氏綜合征表型之間的聯(lián)系[31]。這些蛋白質(zhì)都不是由第21號染色體上的基因編碼,唐氏綜合征由減數(shù)分裂不分離(約占95%)和體細(xì)胞有絲分裂錯誤(約占5%)所致[32]。

        3.3 臍血特異性蛋白質(zhì)篩選 臍血由全血中的所有元素(紅細(xì)胞、白細(xì)胞、血漿和血小板)組成。通常認(rèn)為,最接近疾病原發(fā)部位標(biāo)本(臍血和胎盤細(xì)胞、組織和體液)中的潛在生物標(biāo)志物水平最高,故通過臍血檢測可診斷多種妊娠期胎兒疾病。文錦麗等[33]應(yīng)用同位素標(biāo)記相對和絕對蛋白定量法篩選出506種唐氏綜合征胎兒臍血差異表達(dá)蛋白質(zhì),其中24中蛋白質(zhì)的表達(dá)水平比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,16種蛋白質(zhì)表達(dá)水平上調(diào),8種蛋白質(zhì)表達(dá)水平下調(diào),以基質(zhì)蛋白-3、胸腺肽β10和骨橋蛋白變化最明顯。

        臍血取材相對困難,但可直接反映胎兒蛋白表達(dá)的差異。Sui等[34]采用同位素標(biāo)記相對和絕對定量技術(shù)與基因本體論分析研究6例唐氏綜合征孕婦和11名健康孕婦臍血蛋白水平的變化,結(jié)果顯示,與唐氏綜合征相關(guān)的蛋白質(zhì)有19種,其中13種表達(dá)上調(diào)、6種表達(dá)下調(diào),結(jié)合相關(guān)研究結(jié)論明確載脂蛋白E、補(bǔ)體因子B、淀粉樣蛋白P成分、Matrin-3和骨橋蛋白5種蛋白質(zhì)與唐氏綜合征相關(guān),且前3種蛋白質(zhì)在唐氏綜合征中顯著上調(diào)。

        3.4 尿液標(biāo)志物的篩選 尿液和尿多肽是潛在疾病生物標(biāo)志物的重要來源。目前可檢測到的尿液蛋白質(zhì)和多肽數(shù)量超過10萬,且仍在增多[35]。在健康人中,70%的尿多肽/蛋白來自腎臟和尿路,其余30%的尿多肽/蛋白由腎小球血液超濾產(chǎn)生[36],因此,尿液不僅能反映泌尿生殖系統(tǒng)的信息,還可能反映遠(yuǎn)處器官的信息。Iles等[37]運(yùn)用電子噴霧質(zhì)譜技術(shù)發(fā)現(xiàn),唐氏綜合征組尿液在11 000~12 000質(zhì)譜掃描范圍(m/z)存在一個額外質(zhì)譜峰,而6 000~8 000 m/z的質(zhì)譜強(qiáng)度降低。根據(jù)上述特點(diǎn),可辨別妊娠12~14周8例唐氏綜合征樣本與39例正常樣本,但其對妊娠15~17周時唐氏綜合征樣本的辨別力較差,僅辨別出10個唐氏綜合征樣本中的7個??梢姡瑧?yīng)用尿液樣本篩查唐氏綜合征的檢出率較高,假陽性率較低。Shan等[38]用弱陽離子交換磁珠對23例唐氏綜合征孕婦和30名核型正常孕婦的尿液進(jìn)行電子噴霧質(zhì)譜分析,兩組6種多肽的水平發(fā)生了顯著變化,其質(zhì)譜掃描范圍分別為1 022.1、1 032.1、1 099.5、1 155.9、1 306.6和2 365.6 m/z;以上述候選多肽為基礎(chǔ),建立唐氏綜合征與對照組分類模型的靈敏度為95.7%,特異度為70.0%,受試者工作特征曲線下面積為0.909(95%CI 0.835~0.984)。1 099.5 m/z和1 155.9 m/z的多肽峰分別為α1抗胰蛋白酶和熱激蛋白β1的部分序列,為胎兒唐氏綜合征產(chǎn)前篩查無創(chuàng)性生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)和開發(fā)提供了可能的方向。

        3.5 胎盤特異性蛋白質(zhì)的篩選 胎盤是妊娠期間多種蛋白質(zhì)和細(xì)胞因子變化的來源,對于胎盤組織蛋白質(zhì)表達(dá)情況的研究既基礎(chǔ)又直觀,并可避免母體外周血細(xì)胞對研究結(jié)果的干擾。閆麗宇等[39]采用二維熒光差異凝膠電泳技術(shù)在10例唐氏綜合征孕婦胎盤組織中發(fā)現(xiàn)352個差異表達(dá)蛋白質(zhì)點(diǎn),其中有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的蛋白質(zhì)點(diǎn)為56個,對其三維豐度比值在1.5倍以上的17個差異蛋白質(zhì)點(diǎn)行質(zhì)譜鑒定,其中12個蛋白質(zhì)點(diǎn)上調(diào),5個蛋白質(zhì)點(diǎn)下調(diào);最終確定10種蛋白質(zhì)可匹配,其中差異表達(dá)最明顯的4種蛋白質(zhì)為銅鋅超氧化物歧化酶1、熱激蛋白27、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)分子伴侶29、過氧化物酶6。

        4 小 結(jié)

        基于質(zhì)譜和生物信息學(xué)技術(shù),蛋白質(zhì)組學(xué)研究已經(jīng)成為發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物的有力平臺。新的生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)有助于疾病診斷,并有望用于唐氏綜合征產(chǎn)前篩查和診斷。目前,蛋白質(zhì)組學(xué)方法仍存在局限性,其所發(fā)現(xiàn)的候選標(biāo)記的性能在不同研究或?qū)嶒?yàn)室不能重現(xiàn),且驗(yàn)證候選標(biāo)志物有效性的進(jìn)一步研究有限。未來仍需要通過建立生物樣本處理的標(biāo)準(zhǔn)化程序、利用定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)提高重復(fù)性、結(jié)合生物信息學(xué)分析選擇最佳的生物標(biāo)志物、擴(kuò)大臨床驗(yàn)證研究并加強(qiáng)多中心合作等方式對蛋白質(zhì)組學(xué)的應(yīng)用進(jìn)行深入研究。

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