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        基于改進(jìn)的YOLOv3算法的乳腺超聲腫瘤識(shí)別

        2021-06-10 17:05:58徐立芳傅智杰莫宏偉
        智能系統(tǒng)學(xué)報(bào) 2021年1期
        關(guān)鍵詞:特征

        徐立芳,傅智杰,莫宏偉

        (1. 哈爾濱工程大學(xué) 工程訓(xùn)練中心,黑龍江 哈爾濱 150001; 2. 哈爾濱工程大學(xué) 自動(dòng)化學(xué)院,黑龍江 哈爾濱 150001)

        乳腺癌是女性中最常見的癌癥,也是全世界癌癥死亡的主要原因之一,其死亡率僅低于肺癌[1],根據(jù)美國(guó)癌癥協(xié)會(huì)(american cancer society)對(duì)2019年癌癥患者的統(tǒng)計(jì),在美國(guó)經(jīng)確診的浸潤(rùn)性乳腺癌有約268 600例新病例和非浸潤(rùn)性乳腺癌約62 930例新病例以及41 760例因乳腺癌死亡的病例,乳腺癌已經(jīng)影響了約12%美國(guó)女性日常生活[2],早期發(fā)現(xiàn)可以增加患者治療的機(jī)會(huì)進(jìn)而提高患者的生存率[3-4],因此,乳腺癌的篩查及早期診斷尤為重要,現(xiàn)階段,乳腺癌診斷的方法主要有:磁共振成像(magnetic resonance imaging, MRI)、正電子發(fā)射型計(jì)算機(jī)斷層顯像(positron emission computed tomography, PET)、超聲成像和X線攝影等,其中MRI和PET價(jià)格較為昂貴且具有輻射性[5];X線攝影只能對(duì)特定的斷面進(jìn)行診斷,靈敏度低[6];相比于MRI、PET和X線,超聲成像技術(shù)不僅價(jià)格低廉、不具有放射性,而且可以將各個(gè)斷面的絕大部分的病變區(qū)域顯示出來(lái),尤其針對(duì)亞洲年輕女性較為緊密的乳腺組織,超聲成像技術(shù)有著更好的檢測(cè)效果,更適合于對(duì)乳腺腫瘤進(jìn)行大規(guī)模的檢查[7-8]。

        雖然超聲成像已成為早期診斷的最受歡迎的檢測(cè)方式,但超聲檢測(cè)在實(shí)際應(yīng)用中仍然存在較多的困難:

        1) 超聲成像過(guò)程較為復(fù)雜容易造成嚴(yán)重的噪聲,同時(shí)鑒于乳腺腫瘤的浸潤(rùn)性,其對(duì)比度和分辨率比較低,邊界模糊;

        2) 由于超聲波頻率較高、纏頭能力強(qiáng),對(duì)于較多的小于10 mm的小腫瘤很難進(jìn)行準(zhǔn)確的鑒別;

        3) 超聲波束具有反射、折射等特點(diǎn),而不同人體的組織器官的聲阻抗具有較大差異,而極易導(dǎo)致超聲圖像生成偽像。

        然而,影像科醫(yī)生往往都是根據(jù)自己的工作經(jīng)驗(yàn)來(lái)分析超聲圖像,借助腫瘤的形狀、大小、能量、密度等相關(guān)的特征來(lái)分辨腫瘤良惡性,對(duì)于相同的一幅圖像,不同醫(yī)生的分析可能會(huì)有一定差異,不同時(shí)期圖像的屬性也有所不同,因此判讀結(jié)果也會(huì)不同,除此之外,乳腺超聲圖像的診斷工作較為復(fù)雜,特別對(duì)于中型和大型醫(yī)院病人較多、工作量較大的情況,單純依賴醫(yī)生診斷容易發(fā)生錯(cuò)誤診斷,這將大大影響病人的有效治療時(shí)間,給病人的生命財(cái)產(chǎn)造成嚴(yán)重的影響,基于以上原因,完全依賴醫(yī)生的人工處理容易由于疲勞而造成誤診率上升的現(xiàn)象[8],隨著人工智能相關(guān)理論的發(fā)展,基于深度學(xué)習(xí)的乳腺超聲腫瘤識(shí)別技術(shù)有著重要的研究?jī)r(jià)值和意義。

        1 相關(guān)工作

        目前乳腺腫瘤的識(shí)別方法主要可分為2類:乳腺腫瘤傳統(tǒng)識(shí)別方法以及基于深度學(xué)習(xí)的乳腺腫瘤識(shí)別方法。

        乳腺腫瘤傳統(tǒng)識(shí)別方法包含了乳腺超聲腫瘤圖像預(yù)處理、區(qū)域分割、特征提取和分類4步。由于先前的過(guò)程會(huì)影響后續(xù)過(guò)程,因此這些方法都需要非常精確地處理每一個(gè)步驟,按照是否強(qiáng)調(diào)分類和強(qiáng)調(diào)目標(biāo)感興趣區(qū)域(region of interest,ROI)提取將傳統(tǒng)方法分成2類,其中強(qiáng)調(diào)分類的方法通常需要人工手動(dòng)或半自動(dòng)獲取ROI區(qū)域,更加側(cè)重于開發(fā)區(qū)分良性惡性腫瘤的有效特征和分類器的選擇;而強(qiáng)調(diào)ROI區(qū)域提取的方法都是側(cè)重于開發(fā)更優(yōu)的圖像分割方法定位超聲腫瘤的ROI區(qū)域。

        Cai等[9]首先提取出 138 個(gè)病例的乳腺超聲圖像的 ROI 區(qū)域,之后提出了一種結(jié)合相位一致性和局部二值模式(local binary pattern, LBP) 特征的局部紋理描述符特征,最后采用 支持向量機(jī)(support vector machine, SVM)分類器來(lái)區(qū)分乳腺超聲圖像中的良惡性腫瘤;Huang等[10]首先利用分水嶺算法來(lái)獲取乳腺超聲圖像初始輪廓,然后采用最小化能量函數(shù)進(jìn)一步得到精確的腫瘤邊界,最后采用支持向量機(jī)對(duì)乳腺腫瘤超聲圖像做良惡性識(shí)別;Shahriar 等[11]將得到的超聲圖像先尋找輪廓,之后提取紋理和統(tǒng)計(jì)特征,最后采用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來(lái)分類;Menon等[12]首先采用基于局部區(qū)域的主動(dòng)輪廓法對(duì)預(yù)處理后的乳腺超聲圖像精確地確定 ROI 區(qū)域,接著提取紋理及形態(tài)等特征,最后采用 SVM 對(duì)其進(jìn)行分類。

        這些傳統(tǒng)的識(shí)別方法雖然在一定程度上實(shí)現(xiàn)了超聲腫瘤識(shí)別,但都基本需要進(jìn)行人工的特征提取,往往識(shí)別精度較低、魯棒性較差、通用性不強(qiáng),故很難應(yīng)用到實(shí)際的診斷中。

        近幾年,隨著深度學(xué)習(xí)的興起,部分研究人員又提出基于深度學(xué)習(xí)的方法來(lái)進(jìn)行腫瘤識(shí)別,例如:Xiao Ting等[13]提出采用深度遷移融合的方法來(lái)實(shí)現(xiàn)乳腺超聲腫瘤識(shí)別,其采用 Resnet50、Xception 和 Inception V3 這3種卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)提取的不同的特征進(jìn)行遷移融合,接著采用前向神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來(lái)分類。Han等[14]首先對(duì)獲取的 5 151 例患者的 7 408 張超聲圖像進(jìn)行了 ROI 區(qū)域人工提取,之后將其輸入到改進(jìn)后的 GoogLeNet 網(wǎng)絡(luò)中進(jìn)行特征提取和分類,結(jié)果顯示,AUC 大于 0.9,準(zhǔn)確性為 90%,靈敏度為 86%,特異度為 96%。梁舒和王恒立等[15-16]分別采用優(yōu)化后的 U-net 和全卷積網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行超聲乳腺腫瘤 ROI 區(qū)域的分割,最終在數(shù)據(jù)集上分別實(shí)現(xiàn)了 82.5% 、 83.48% 的準(zhǔn)確率。

        1、標(biāo)題完整,作者明確,多位作者分屬不同單位時(shí)作者與單位應(yīng)一一標(biāo)注,單位要求具體到科室,地市齊全,郵編正確。

        目前基于深度學(xué)習(xí)乳腺腫瘤識(shí)別方法,基本都是僅限于采用圖像分割的方法定位ROI區(qū)域或?qū)⒔o定的ROI區(qū)域分類為良性或惡性,而并不能同時(shí)實(shí)現(xiàn)對(duì)ROI區(qū)域的定位和對(duì)腫瘤的分類,給醫(yī)護(hù)人員的診斷帶了極大的不變,最近,Osman[17-18]提出采用基于改進(jìn)的 FCN-AlexNet 和基于改進(jìn)的Mask R-CNN 語(yǔ)義分割模型實(shí)現(xiàn)端到端的超聲腫瘤識(shí)別,同時(shí)執(zhí)行定位和分類,目前這種采用圖像分割的乳腺超聲腫瘤識(shí)別的方法,雖然較為精確地定位超聲腫瘤的邊界且實(shí)現(xiàn)了良惡性識(shí)別,但這種圖像語(yǔ)義分割的方法需要手動(dòng)標(biāo)注大量腫瘤分割的數(shù)據(jù)集,而制作分割數(shù)據(jù)集的過(guò)程非常繁瑣,極大地增加了專業(yè)醫(yī)生標(biāo)注的負(fù)擔(dān),因此并不適合大規(guī)模的應(yīng)用。

        2019年5月Shin等[19]在 IEEE Transac-tions on Medical Imaging 首次提出采用基于深度學(xué)習(xí)中的目標(biāo)檢測(cè)算法來(lái)同時(shí)實(shí)現(xiàn)乳腺超聲腫瘤的定位和分類,其采用Faster R-CNN算法并借助合作醫(yī)院所提供的數(shù)據(jù)集對(duì)模型進(jìn)行訓(xùn)練和測(cè)試,但由于Faster R-CNN算法檢測(cè)速率和檢測(cè)精度較低,無(wú)法直接應(yīng)用到實(shí)際中,因此本文仍沿著這一思路,首先使用檢測(cè)速率和精度均較高的YOLOv3算法進(jìn)行腫瘤識(shí)別,然后針對(duì)乳腺超聲腫瘤識(shí)別中的相關(guān)問(wèn)題對(duì)算法進(jìn)行改進(jìn)。

        2 傳統(tǒng)YOLOv3算法

        YOLOv3算法將目標(biāo)檢測(cè)問(wèn)題轉(zhuǎn)化為回歸問(wèn)題,合并分類和定位任務(wù)到一個(gè)步驟,直接預(yù)測(cè)物體的位置及類別,其包含了新特征提取網(wǎng)絡(luò)Darknet-53以及3種尺度的YOLO層,分別用于特征提取和與多尺度預(yù)測(cè),網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖1所示[20]。

        圖1 YOLOv3網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig. 1 YOLOv3 network structure

        其中Darknet-53層由1個(gè)卷積塊DBL和5個(gè)殘差塊Resn(n=1,2,4,8)組成,DBL是卷積(conv)、批規(guī)范化(BN)和激活函數(shù)(leaky relu)的集合,這也是YOLOv3中的最小組件,Resn中的n表示殘差網(wǎng)絡(luò)Res的個(gè)數(shù),而Res是2個(gè)DBL加上短連接(shortcut)組成,經(jīng)過(guò)Darknet-53網(wǎng)絡(luò)特征提取后,輸出大小為13×13×1 024特征圖,經(jīng)過(guò)上采樣與淺層特征圖拼接(見圖1中的concat),輸出3個(gè)尺度的特征圖用于YOLO層的檢測(cè)結(jié)果的預(yù)測(cè),也就是每個(gè)box負(fù)責(zé)對(duì)3個(gè)Anchor box進(jìn)行回歸,其預(yù)測(cè)結(jié)果包括目標(biāo)的中心位置x和y、寬高w和h、置信度以及類別,在YOLOv1版本中,x、y、w、h是直接預(yù)測(cè)物體實(shí)際值,預(yù)測(cè)值的微小變化都會(huì)被放大到整個(gè)圖像的范圍, 導(dǎo)致坐標(biāo)波動(dòng)較大, 預(yù)測(cè)不準(zhǔn)確,YOLOv3采用改進(jìn)后的算法求解預(yù)測(cè)值,之后通過(guò)對(duì)置信度設(shè)定閾值過(guò)濾掉低分的預(yù)測(cè)框,然后對(duì)剩下的預(yù)測(cè)框執(zhí)行非極大值抑制算法(non-maximum suppression, NMS)處理,得到網(wǎng)絡(luò)最終的預(yù)測(cè)結(jié)果。

        3 改進(jìn)的YOLOv3算法

        盡管YOLOV3在目標(biāo)識(shí)別算法中表現(xiàn)優(yōu)異,但乳腺超聲腫瘤圖像相對(duì)其他圖像而言,邊界更加模糊、噪聲更大、對(duì)比度更低,導(dǎo)致特征更難提取,更容易出現(xiàn)錯(cuò)誤識(shí)別和遺漏目標(biāo)的問(wèn)題,本節(jié)針對(duì)乳腺超聲圖像特征難提取的問(wèn)題,從3個(gè)角度對(duì)YOLOv3的特征提取網(wǎng)絡(luò)DarkNet-53進(jìn)行改進(jìn)并進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,以提高網(wǎng)絡(luò)圖像特征的提取能力。

        3.1 殘差模塊設(shè)計(jì)

        YOLOv3中的Residual殘差模塊結(jié)構(gòu)在特征提取過(guò)程中參考了ResNet結(jié)構(gòu),ResNet克服了梯度消失問(wèn)題,增強(qiáng)了特征表達(dá)力,本節(jié)中,為了擴(kuò)大每個(gè)網(wǎng)絡(luò)層的感受野,提取更加有效的特征,充分利用單層內(nèi)的特征,考慮通過(guò)改進(jìn)ResNet網(wǎng)絡(luò)多樣性角度來(lái)改進(jìn)網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),提出將SE (sequeze and excitation)模塊和Res2Net 2種網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行融合組成SE-Res2Net以改進(jìn)原始的ResNet結(jié)構(gòu)。

        SE模塊是2017年由胡杰[21]提出的,SE模塊則是從卷積的通道特征角度通過(guò)局部的感受野將深度信息和空間信息進(jìn)行融合,其結(jié)構(gòu)如圖2所示。SE模塊可分為Squeeze和Excitation 2個(gè)部分,其中X為輸入,F(xiàn)tr為卷積操作,U為卷積輸出,其特征圖大小為W×H×C,其首先將卷積后的特征圖U送到Squeeze中,對(duì)其沿著通道方向采用一個(gè)全局平均池化操作對(duì)特征圖進(jìn)行壓縮,將整個(gè)輸入的二維平面變成一個(gè)實(shí)數(shù),采用這個(gè)實(shí)數(shù)來(lái)表示整個(gè)二維平面的特征信息,輸出 1 ×1×C的特征圖,之后將其送入Excitation中,用于增強(qiáng)卷積層通道間的相互依賴性,Excitation模塊在2個(gè)全連接網(wǎng)絡(luò)中采用了通道的壓縮,第1個(gè)全連接網(wǎng)絡(luò)通道數(shù)變成原來(lái)的C/r,其中r為壓縮的倍數(shù),第2個(gè)全連接網(wǎng)絡(luò)將通道數(shù)變成C,2個(gè)全連接網(wǎng)絡(luò)不僅增加了網(wǎng)絡(luò)非線性,而且通過(guò)縮放倍數(shù)也實(shí)現(xiàn)了降低參數(shù)量的效果,接著將Excitation的輸出經(jīng)過(guò)一個(gè)激活函數(shù)將權(quán)值縮放到0 ~1,最后將權(quán)值乘以最初輸入的特征圖U的各個(gè)通道中,實(shí)現(xiàn)對(duì)特征的重新分配。

        圖2 SE模塊網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig. 2 Network structure of SE block

        SE模塊具有遷移性強(qiáng)的特點(diǎn),可以嵌入到任何的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中,為最大化利用提取到的超聲影像中的乳腺腫瘤特征,本節(jié)將其與Res2Net[22]結(jié)合組成SE-Res2Net,Res2Net是2019年的IEEE國(guó)際計(jì)算機(jī)視覺與模式識(shí)別會(huì)議提出的新網(wǎng)絡(luò),網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖3(b)所示,Res2Net結(jié)構(gòu)采用新的卷積方式來(lái)代替ResNet中3×3卷積,首先采用一個(gè)1×1卷積核將輸入的特征圖分成4個(gè)特征子圖,每個(gè)特征子圖均對(duì)應(yīng)一個(gè)3×3卷積 (第1個(gè)特征子圖除外),將每個(gè)特征子圖與上一個(gè)特征子圖對(duì)應(yīng)的卷積的輸出的和作為該子圖對(duì)應(yīng)的3×3卷積的輸入,然后將4個(gè)通道的特征圖進(jìn)行融合,顯然Res2Net中每個(gè)特征子圖下的3×3卷積均可利用之前的特征,并且它的輸出可以獲得更大的感受野,其在單層內(nèi)增加了尺度,擴(kuò)大了感受野范圍,更好地利用了上下文信息,充分結(jié)合上下文信息可以令分類器更容易檢測(cè)出具體目標(biāo),同時(shí)使用多尺度的方法來(lái)提取特征使得網(wǎng)絡(luò)的整體語(yǔ)義表征能力更加出色,特征表現(xiàn)力更強(qiáng),最后在1×1卷積之后融合SE模塊,能進(jìn)一步結(jié)合SE模塊的優(yōu)點(diǎn):對(duì)通道特征進(jìn)行重新加權(quán),抑制無(wú)用的特征,充分利用了單層中的特征。

        圖3 殘差網(wǎng)絡(luò)和SE-Res2Net網(wǎng)絡(luò)Fig. 3 Residual network and SE-Res2Net network

        3.2 下采樣模塊設(shè)計(jì)

        DarkNet-53在每個(gè)殘差模塊前均會(huì)有一個(gè)步長(zhǎng)為2,大小為3×3的卷積核做下采樣,DarkNet-53中一共有5個(gè)這樣的卷積操作,該模塊容易造成特征丟失,會(huì)在一定程度上影響識(shí)別的性能,因此本節(jié)綜合考慮各種因素,引入類似Inception的結(jié)構(gòu)Downsample下采樣模塊來(lái)改進(jìn)DarkNet-53的下采樣結(jié)構(gòu),其首先采用多個(gè)1×1的卷積核將特征圖擴(kuò)展,之后采用池化層和幾個(gè)不同大小的卷積核來(lái)做下采樣,接著將下采樣后的特征圖進(jìn)行融合,這種融合與ResNet殘差網(wǎng)絡(luò)的融合不一樣,其只是通道的融合,特征圖的尺寸不會(huì)發(fā)生改變,最后使用1×1濾波器來(lái)降低尺寸,將其尺寸變成整個(gè)Downsample下采樣模塊輸入模塊的一半,如圖4所示。

        圖4 Downsample下采樣模塊Fig. 4 Downsample network

        3.3 殘差密集網(wǎng)絡(luò)Res-DenseNet

        DarkNet-53每次下采樣輸出特征圖后,均會(huì)進(jìn)入一個(gè)Residual的殘差模塊,3.1節(jié)將網(wǎng)絡(luò)中的ResNet替換為SE-Res2Net,3.2節(jié)將3×3的下采樣模塊替換為Downsample模塊,為進(jìn)一步提高網(wǎng)絡(luò)的特征提取能力,在前文基礎(chǔ)上,本節(jié)引入殘差網(wǎng)絡(luò)ResNet和密集連接網(wǎng)絡(luò)DenseNet并將其合并為殘差密集連接網(wǎng)絡(luò)Res-DenseNet,為了方便描述改進(jìn)后的網(wǎng)絡(luò),本節(jié)以第5個(gè)Residual的殘差模塊為例解釋這一過(guò)程,如圖5所示,其由一個(gè)Downsample下采樣模塊和4個(gè)殘差網(wǎng)絡(luò)Res2Net組成,輸入特征圖尺寸是26×26×512,先經(jīng)過(guò)一個(gè)Downsample進(jìn)行下采樣特征圖變成13×13×1 024,連續(xù)經(jīng)過(guò)4個(gè)SE-Res2Net后輸出。

        圖5 原始?xì)埐钅K網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)Fig. 5 Network structure of original residual module

        在引入密集連接網(wǎng)絡(luò)DensetNet和ResNet后,改進(jìn)后的Res-DenseNet網(wǎng)絡(luò)如圖6所示,殘差密集網(wǎng)絡(luò)Res-DenseNet在DenseNet網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)上引入ResNet,以充分利用圖像的特征,前面所有模塊的輸出均作為下一個(gè)模塊的輸入,這樣越靠后的模塊,特征數(shù)量就會(huì)越多,容易造成特征的冗余,為了消除冗余,提取更加高效的特征,在最后一個(gè)模塊后加入1×1卷積進(jìn)行降維,隨著網(wǎng)絡(luò)深度的增加,特征的增多,會(huì)造成網(wǎng)絡(luò)難以訓(xùn)練,因此借鑒殘差連接的思想,將殘差密集網(wǎng)絡(luò)中的所有模塊均當(dāng)作ResNet中的卷積層,將Downsample下采樣的輸出與當(dāng)前模塊的輸出進(jìn)行像素相加,這樣不僅實(shí)現(xiàn)了內(nèi)部特征上的融合,而且還會(huì)加快網(wǎng)絡(luò)的收斂速度,除此之外,就參數(shù)上講,添加1×1卷積層,對(duì)網(wǎng)絡(luò)總參數(shù)量幾乎沒有影響。

        顯然,整個(gè)網(wǎng)絡(luò)輸入特征圖尺寸是26×26×512,在經(jīng)過(guò)下采樣模塊后,特征圖是13×13×1 024,先將所有SE-Res2Net模塊的輸出都兩兩進(jìn)行了連接,使得網(wǎng)絡(luò)中每一層輸出都接受它前面所有層的特征作為輸入,則每個(gè)SE-Res2Net輸出后,經(jīng)過(guò)特征拼接,輸出特征圖大小分別為13×13×1 280、13×13×1 536、13×13×1 792、13×13×2 048,考慮到最后一個(gè)殘差網(wǎng)絡(luò)SE-Res2Net輸出后,經(jīng)過(guò)特征拼接,特征圖維度是經(jīng)過(guò)下采樣后特征圖維度的2倍,采用一個(gè)conv1進(jìn)行特征降維輸出13×13×1 024的特征圖,之后借鑒殘差網(wǎng)絡(luò)ResNet對(duì)應(yīng)通道像素相加的思想,將第一個(gè)conv3下采樣輸出的特征圖與經(jīng)過(guò)conv1特征降維后的特征圖進(jìn)行對(duì)應(yīng)通道像素的相加,最后輸出大小為13×13×1 024的特征圖。

        圖6 Res-DenseNet網(wǎng)絡(luò)Fig. 6 Res-DenseNet Network

        4 實(shí)驗(yàn)與分析

        本文在Ubuntu 16.04操作系統(tǒng)下完成軟件環(huán)境平臺(tái)的搭建和實(shí)驗(yàn),GPU選用NVIDIA Ge-Force 1080Ti,軟件:Python (3.6);keras ≥ 2.1.5;tensorflow-gpu (≥ 1.4.1)。

        4.1 數(shù)據(jù)集

        本文實(shí)驗(yàn)采用的乳腺超聲數(shù)據(jù)是由專業(yè)醫(yī)生從相關(guān)醫(yī)院的數(shù)據(jù)庫(kù)選取從2015-2019年不同年齡層次、地區(qū)和人種的2 011例原始病例,共計(jì)有13 586張?jiān)紙D像,圖像大小為768×576,如圖7所示,經(jīng)過(guò)專業(yè)醫(yī)生篩選剔除后,得到含有腫瘤的有效圖片共計(jì)3 259例,其中良性患者共計(jì)1 199例,惡性患者共計(jì)2 060例,考慮到雖然原始圖像邊框中含有較多的標(biāo)注信息,如影像保存時(shí)間、超聲探頭發(fā)射頻率、探測(cè)深度和部位,同時(shí)標(biāo)注位置不固定,但為了提高算法的魯棒性,方便實(shí)際應(yīng)用,本實(shí)驗(yàn)不再進(jìn)行人工的區(qū)域裁剪,而是直接使用經(jīng)過(guò)篩選的原始圖片作為目標(biāo)圖片。

        圖7 超聲乳腺腫瘤原始圖像Fig. 7 Original ultrasound images of breast tumor

        該數(shù)據(jù)庫(kù)中除了包含有圖像信息外,還提供了所有病例的病理診斷結(jié)果,其良惡性均經(jīng)過(guò)活檢證實(shí),經(jīng)過(guò)專業(yè)醫(yī)生借助ImageLab軟件結(jié)合病例信息對(duì)進(jìn)行腫瘤位置和類別標(biāo)注,生成的PASCAL VOC格式的文件構(gòu)建了本實(shí)驗(yàn)所需的乳腺腫瘤數(shù)據(jù)集,考慮到數(shù)據(jù)集較小,直接將數(shù)據(jù)集按照3∶1∶1分成訓(xùn)練集、驗(yàn)證集和測(cè)試集,其中訓(xùn)練集1 955張,良性719張、惡性1 236張;測(cè)試集652張,良性240張、惡性412;驗(yàn)證集652張,良性240張、惡性412,如表1所示。

        表1 乳腺超聲數(shù)據(jù)集劃分Table 1 Dividing breast ultrasound data sets

        4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析

        本文采用了與YOLOv3[20]相同的損失函數(shù),整體的損失函數(shù)由3部分組成:類別誤差、置信度誤差以及目標(biāo)框誤差。為了加快網(wǎng)絡(luò)的訓(xùn)練速度和防止過(guò)擬合,本文采用Adma算法來(lái)做梯度優(yōu)化,其中設(shè)置初始學(xué)習(xí)率為0.001,每100次迭代后學(xué)習(xí)率衰減為原來(lái)的1/10,沖量為0.9,衰減系數(shù)為0.0 002,epoch設(shè)置為25,batch size設(shè)置為8,之后對(duì)原始的YOLOv3和不同配置的YOLOv3算法在預(yù)訓(xùn)練模型上進(jìn)行訓(xùn)練,不同配置的YOLOv3算法見表2所示,其中YOLOv3(1)表示在原YOLOv3算法上引入SE-Res2Net網(wǎng)絡(luò),YOLOv3(2)表示在原YOLOv3上引入SE-ResNet和Downsample下采樣模塊,YOLOv3(3)表示在YOLOv3上引入SE-Res2Net、Downsample下采樣模塊和殘差密集網(wǎng)絡(luò),最后通過(guò)查準(zhǔn)率?查全率(precision-recall,PR)曲線、精度均值(average precision, AP)和平均精度均值(mean average precision, mAP)評(píng)價(jià)模型的性能。

        表2 不同配置的YOLOv3算法Table 2 YOLOV3 algorithm with different configurations

        1) AP和mAP

        待訓(xùn)練完成后將模型分別在測(cè)試集測(cè)試,得到良性樣本的PR曲線和惡性樣本的PR曲線如圖8、9所示,之后通過(guò)計(jì)算PR曲線下的面積可得到良惡性樣本的AP,YOLOv3(1)良惡性AP相對(duì)YOLOV3算法提高1.59%和1.73%,其mAP提高1.66%,這是因?yàn)镽es2Net在單層內(nèi)增加了尺度,充分利用了單層內(nèi)的特征;YOLOv3(2)良惡性AP相對(duì)于YOLOv3(1)提高了1.18%和3.08%,mAP提高2.13%,這是由于DownSample模塊在一定程度上克服了3×3下采樣容易丟失特征的缺陷;YOLOV3(3)良惡性AP相對(duì)于YOLOv3(2)提高了0.99%和0.56%,mAP提高0.775%,這是由于殘差密集網(wǎng)絡(luò)充分利用了前面所有層特征;YOLOv3(3)相對(duì)YOLOv3良惡性AP提高了3.76%和5.37%,mAP提高了4.56%,證實(shí)了本文在引入Res2Net、DownSample模塊和殘差密集網(wǎng)絡(luò)后,YOLOv3模型的整體性能得到較大的提升。

        圖8 測(cè)試集上良性樣本的PR曲線Fig. 8 PR curves of benign samples on test set

        圖9 測(cè)試集上惡性樣本的PR曲線Fig. 9 PR curves of malignant samples on test set

        表3 乳腺超聲數(shù)據(jù)集劃分Table 3 Dividing breast ultrasound data sets %

        2)平均IOU

        除了以上評(píng)價(jià)指標(biāo)外,本文還引入平均重疊度(intersection over union, IOU)來(lái)判定腫瘤的定位誤差,4種算法的在測(cè)試集上結(jié)果如圖10所示,顯然,在訓(xùn)練集上的4種算法平均IOU明顯高于測(cè)試集上對(duì)應(yīng)算法的平均IOU,YOLOV3、YOLOV3(1)、YOLOV3(2)和YOLOV3(3)算法在測(cè)試集和訓(xùn)練集上平均IOU依次增加,這也證實(shí)了本文在引入Res2Net、DownSample模塊和殘差密集網(wǎng)絡(luò)后,YOLOv3特征提取能力更強(qiáng)。

        4.3 實(shí)際測(cè)試效果

        從數(shù)據(jù)庫(kù)中隨機(jī)抽取一個(gè)惡性樣本,采用改進(jìn)后的YOLVO3算法進(jìn)行識(shí)別,如圖11所示,YOLOV3、YOLOV3(1)、YOLOV3(2)和YOLOV3(3)算法均將其識(shí)別為惡性,識(shí)別的置信度分別為95.39%、97.652%、99.31%和99.97%;從數(shù)據(jù)庫(kù)中隨機(jī)抽取一個(gè)良性樣本,如圖12所示,YOLOV3、YOLOV3(1)、YOLOV3(2)和YOLOV3(3)算法均將其識(shí)別為惡性,識(shí)別的置信度分別為97.28%、98.48%、98.89%和99.97%,顯然本文在引入Res2Net、DownSample模塊和殘差密集網(wǎng)絡(luò)后,YOLOV3特征提取能力更強(qiáng)。with applications, 2012, 64(5): 1153–1162.

        圖10 訓(xùn)練集和測(cè)試集上的平均IOUFig. 10 Average IOU on training set and test set

        圖11 惡性測(cè)試樣本效果展示Fig. 11 Malignant test sample effect display

        圖12 良性測(cè)試樣本效果展示Fig. 12 Benign test sample effect display

        5 結(jié)束語(yǔ)

        針對(duì)傳統(tǒng)乳腺超聲腫瘤識(shí)別方法均采用人工提取的特征逐步實(shí)現(xiàn)ROI區(qū)域定位和腫瘤分類往往識(shí)別精度低、魯棒性較差且通用性不強(qiáng),目前基于深度學(xué)習(xí)的方法又僅限于腫瘤ROI區(qū)域的定位或?qū)o定的腫瘤ROI區(qū)域進(jìn)行分類,本文提出采用深度學(xué)習(xí)中的YOLOv3算法同時(shí)實(shí)現(xiàn)了對(duì)良惡性的分類和腫瘤ROI區(qū)域的定位,同時(shí)針對(duì)乳腺腫瘤識(shí)別中的問(wèn)題對(duì)算法進(jìn)行了改進(jìn),經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)證明,在引入Res2Net、DownSample模塊和殘差密集網(wǎng)絡(luò)后YOLOv3算法有著更高的檢測(cè)精度,其在測(cè)試集上mAP達(dá)到0.795 9,平均IOU達(dá)到0.825 9,相比于傳統(tǒng)的YOLOv3算法分別提高了4.56%和2.35%,今后可進(jìn)一步優(yōu)化算法提高檢測(cè)精度。

        經(jīng)專業(yè)醫(yī)生鑒定,采用改進(jìn)后的YOLOv3算法不僅同時(shí)實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤ROI區(qū)域的定位和良惡性的分類,而且取得了較好的檢測(cè)效果,使得人工智能應(yīng)用更接近實(shí)際操作環(huán)境,有效提升基層醫(yī)生診斷能力,降低專科醫(yī)生工作強(qiáng)度,有著極大的應(yīng)用價(jià)值。

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