孫彭亮,蔡萬蒼,劉世熙**,曹秋娥,王 毅
(1.云南大學(xué)化學(xué)科學(xué)與工程學(xué)院,云南 昆明650091;2.西安瑞聯(lián)新材料股份有限公司,陜西 西安710077)
質(zhì)譜技術(shù)因具有檢測精確度高、分析速度快、靈敏度高等優(yōu)點,已成為分析科學(xué)中不可或缺的分析工具之一[1-2].它是將被測物質(zhì)離子化,按離子的質(zhì)荷比分離,測量各種離子譜峰的強度而實現(xiàn)分析目的的一種分析方法[2].在發(fā)展分離分析技術(shù)的同時,如何解讀質(zhì)譜、從質(zhì)譜中正確提取數(shù)據(jù)、把質(zhì)譜的裂解規(guī)律與化合物的結(jié)構(gòu)聯(lián)系起來仍然是當(dāng)今分析化學(xué)中面臨的一個巨大挑戰(zhàn)與瓶頸問題.而在質(zhì)譜分析中,把難于分析的樣品轉(zhuǎn)化為與其化學(xué)結(jié)構(gòu)相似的衍生物,使其質(zhì)譜圖更易解析稱為樣品的衍生化[3].三甲基硅烷衍生物因其獨特的化學(xué)性質(zhì)使得其在質(zhì)譜分析領(lǐng)域中受到高度的重視.然而,對于該類衍生物的性質(zhì)及應(yīng)用的研究已有諸多報道[4-7],其中N-甲基-N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺(MSTFA)是目前使用最廣泛的三甲基硅烷衍生化試劑之一[8-11],對該類衍生化試劑的研究有助于對三甲基硅烷衍生物質(zhì)譜圖的特征離子峰進行歸屬.通過對其反應(yīng)機理的探究,能夠指導(dǎo)合成和開發(fā)具有特異性功能的新型衍生化試劑,進一步拓展現(xiàn)有試劑的應(yīng)用范圍,建立現(xiàn)有試劑新的衍生化方法,降低樣品的前處理難度和復(fù)雜度.王毅等[12]通過譜圖分析對MSTFA及其含氟衍生物的質(zhì)譜重排反應(yīng)進行了研究.但到目前為止,通過理論計算對其質(zhì)譜裂解反應(yīng)機理及裂解反應(yīng)競爭關(guān)系的研究尚無文獻報道.
質(zhì)譜圖的橫坐標是碎片離子的質(zhì)荷比(m/z),縱坐標為碎片離子的豐度[13].離子的豐度越高,表明生成該離子的裂解反應(yīng)越有利,而這又與分子的結(jié)構(gòu)相關(guān)聯(lián)[14-16].影響碎片離子豐度的基本因素一般包括產(chǎn)物的穩(wěn)定性、空間因素和鍵的不穩(wěn)定性.在質(zhì)譜分析中,分子裂解的方式很多,包括σ斷裂、α斷裂、i斷裂、重排反應(yīng)、置換反應(yīng)和消除反應(yīng)等[17-18].其中骨架重排反應(yīng)較為特殊,其產(chǎn)生的碎片離子的歸屬難以確定,往往造成對分子結(jié)構(gòu)的錯誤判斷,所以對骨架重排反應(yīng)裂解機理的研究相當(dāng)重要[19-22].然而,只利用質(zhì)譜圖分析推導(dǎo)反應(yīng)機理的過程往往缺乏理論數(shù)據(jù)的支持,而這可以通過理論計算為其提供更有力的解釋和說明.Gaussian是一款成熟的量子化學(xué)軟件包,是目前在科研領(lǐng)域應(yīng)用最廣泛的計算化學(xué)軟件,其中包含了海量的理論算法和計算精度[23-25].在質(zhì)譜裂解反應(yīng)機理研究方面,由于較高的計算精度,密度泛函理論被廣泛應(yīng)用[2,26-29].
本文的目的是提供一種新的、普遍適用的從頭計算質(zhì)譜預(yù)測方法,用以預(yù)測碎片路徑和質(zhì)譜數(shù)據(jù).基于此,本文使用Gaussian09,采用密度泛函理論(DFT)方法,在6-311G**基組下對MSTFA及其含氟衍生物的裂解機理進行系統(tǒng)研究.并基于對可能碎片的鍵級、自然電荷和能量的直接計算,解析α斷裂和i斷裂的競爭關(guān)系,同時分析對質(zhì)譜圖中碎片峰豐度造成影響的因素,并研究此類重排特征離子的生成途徑,以期為經(jīng)過N-甲基-N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺衍生化后的質(zhì)譜產(chǎn)物歸屬及同類化合物的質(zhì)譜解析提供理論指導(dǎo).
本文使用Gaussian09[30],采用密度泛函的理論方法,在使用廣泛的B3LYP/6-311G**[31]水平下對MSTFA骨架重排反應(yīng)路徑上的各駐點(反應(yīng)物Ⅰ,分子離子Ⅱ,中間體Ⅲ,產(chǎn)物Ⅳ、Ⅴ)進行了結(jié)構(gòu)的優(yōu)化,得到的幾何構(gòu)型如圖1所示.對優(yōu)化后的各駐點結(jié)構(gòu)同樣在B3LYP/6-311G**水平下對其進行振動分析,結(jié)果顯示各穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)均不存在虛頻振動,這表明了優(yōu)化結(jié)構(gòu)的正確性.同時,也在B3LYP/6-311G**水平下對N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺電荷中心誘導(dǎo)的α斷裂反應(yīng)、重排反應(yīng)和i斷裂反應(yīng)的各個駐點進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化與振動分析,結(jié)果也顯示了各穩(wěn)定結(jié)構(gòu)均不存在虛頻振動,這也表明了優(yōu)化結(jié)構(gòu)的正確性,其得到的幾何構(gòu)型如圖2所示.由于Gaussian09內(nèi)置的NBO3.0在功能和精度上有所欠缺,所以本文使用了NBO 6.0[32-33],對分子進行了自然鍵軌道(NBO)分析,對各駐點進行布局分析,得到了反應(yīng)物、分子離子、中間體及產(chǎn)物的成鍵方式和原子電荷分布.
圖1 MSTFA重排反應(yīng)各駐點(反應(yīng)物Ⅰ,分子離子Ⅱ,中間體Ⅲ,產(chǎn)物Ⅳ,Ⅴ)的優(yōu)化后幾何構(gòu)型Fig.1 Optimized geometry of the stationary points(ReactantⅠ,Molecular IonⅡ,IntermediateⅢ,ProductⅣ,Ⅴ)of MSTFA rearrangement reaction.
圖2 MSTFA電荷中心誘導(dǎo)的i斷裂反應(yīng)產(chǎn)物Ⅵ和產(chǎn)物Ⅶ優(yōu)化幾何構(gòu)型Fig.2 Optimized geometry of I-cleavage reaction Product VI and Product VII induced by MSTFA charge center.
2.1 質(zhì)譜重排反應(yīng)
2.1.1 分子離子的形成 質(zhì)譜裂解反應(yīng)的第一步是在電子轟擊下分子離子的形成,在質(zhì)譜儀中分子會優(yōu)先失去整個體系中電離能最低的電子[17,23,34].反應(yīng)物與分子離子相比較,其差別在于反應(yīng)物分子不帶電荷且自旋多重度為1,而分子離子帶電數(shù)為1且自旋多重度為2.從優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)分析可以發(fā)現(xiàn)化合物在失去一個電子后,幾何構(gòu)型發(fā)生了變化.通過能量計算得到,由于幾何構(gòu)型的變化使得分子離子的能量高于反應(yīng)物的能量874.72 kJ/mol,反應(yīng)需要較高的能量.但在質(zhì)譜儀中,在電子轟擊的環(huán)境下完全能夠提供反應(yīng)所需的能量.而對于結(jié)構(gòu)優(yōu)化后的反應(yīng)物及分子離子進行NBO布局分析,得到的反應(yīng)物的自然電荷分布及部分成鍵信息可見支撐信息表1(見網(wǎng)站http://www.yndxxb.ynu.edu.cn),得到的分子離子的自然電荷分布及成鍵信息可見支撐信息表2(見網(wǎng)站http://www.yndxxb.ynu.edu.cn).
對比支撐信息表1及表2中的自然電荷分布,得知反應(yīng)物中N原子的自然電荷為-0.81398,而分子離子中N原子的自然電荷為-0.43933,可以初步判定電荷中心定域在雜原子N上.由于分子離子失去了一個電子,存在一個未成對單電子,自旋多重度為2,所以體系為開殼層體系.眾所周知,電子軌道分為α自旋軌道和β自旋軌道,而從計算結(jié)果可得知,這個單電子在α軌道上.從布局分析中也可以得到N原子的雜化方式為sp2雜化,在反應(yīng)物的N原子中存在一對孤對電子(LP,N2),電子占據(jù)數(shù)為1.661 48,全部來自于原子的p軌道.在分子離子中,α軌道上N原子存在1個未成對電子,電子占據(jù)數(shù)為0.910 76.但在β軌道上N原子不存在孤對電子.結(jié)果進一步確定在質(zhì)譜儀中化合物受到電子轟擊后,N原子p軌道上的孤對電子中的一個電子被脫去.
2.1.2 游離基中心誘導(dǎo)的α斷裂 首先,在形成分子離子后,定域在N上的游離基中心就會誘導(dǎo)發(fā)生α斷裂,使得Si上相連的甲基脫去,生成甲基自由基及一個偶電子離子(中間體Ⅲ),其偶電子離子所帶電荷數(shù)為1,自旋多重度為1.在MSTFA的質(zhì)譜圖中,存在m/z184的碎片離子[12],即分子離子脫去甲基后形成的中間體Ⅲ.三甲基硅衍生物的質(zhì)譜圖中均會出現(xiàn)[M-15]+特征離子碎片,一般會被用于確認分子離子峰.其次,對中間體的幾何構(gòu)型進行分析,Si―N鍵鍵長0.17098 nm,是標準的硅氧雙鍵鍵長.C(13),C(9),C(7),C(3)幾乎在一個平面上,進一步驗證Si和N之間存在π鍵.通過能量計算,得到α斷裂反應(yīng)的產(chǎn)物總能量高于反應(yīng)物總能量的122.44 kJ/mol,相比于分子離子的生成,α斷裂所需的能量較少.最后,對結(jié)構(gòu)優(yōu)化后的中間體進行NBO布局分析,得到的自然電荷分布及部分成鍵信息示于支撐信息表3(見網(wǎng)站http://www.yndxxb.ynu.edu.cn).
布局分析的計算結(jié)果表明Si原子和N原子均不存在孤對電子,說明其價電層的電子均已成鍵.從成鍵性質(zhì)分析,Si和N之間存在2個鍵.一個是由雜化軌道上的電子形成的σ鍵,一個是由2個原子的p軌道上的電子形成的π鍵.且電子很大程度偏向N原子,π鍵上的一對電子89.54%歸屬于N原子. 對比支撐信息中的表1、表2及表3的自然電荷分布,得知中間體中Si原子自然電荷為2.01077,相比于分子離子中Si原子的1.720 12和反應(yīng)物中Si原子的1.765 57有明顯的提高.中間體中的N原子的自然電荷為-0.915 05,明顯低于分子離子中N原子的自然電荷-0.43933,但這與反應(yīng)物的自然電荷值相近.通過數(shù)據(jù)對比,得出α斷裂反應(yīng)后,分子離子中N原子上的正電荷轉(zhuǎn)移到了Si原子上.正電荷的轉(zhuǎn)移,促使下一步反應(yīng)能夠進行的活化中心得以形成[35].最后從NBO布局分析的結(jié)果來看,中間體應(yīng)該存在共振現(xiàn)象,其共振結(jié)構(gòu)式示于圖3.
圖3 化合物Ⅲ的共振結(jié)構(gòu)式Fig.3 Resonancestructure formula of compound Ⅲ.
2.1.3 骨架重排 我們對骨架重排反應(yīng)進行詳細研究,發(fā)現(xiàn)是F原子進攻帶正電的Si原子,形成了F―Si鍵,同時造成N―Si鍵的斷裂,生成了1個偶電子離子和1個中性分子.計算得到,產(chǎn)物總能量高于反應(yīng)物總能量185.52 kJ/mol.結(jié)構(gòu)優(yōu)化得到的產(chǎn)物Ⅳ中N―C(6)鍵長為0.145 96 nm,是標準的氮氧雙鍵的鍵長. O―C(6)鍵的鍵長為0.13930 nm,O―C(8)鍵的鍵長為0.140 98 nm,C(6)―O―C(8)的鍵角為61.75°,可以得出產(chǎn)物Ⅳ中存在一個三元環(huán).通過結(jié)構(gòu)優(yōu)化分析,可以推斷出反應(yīng)得到的中性分子(產(chǎn)物Ⅳ)為N-(3,3-二氟環(huán)氧乙烷-2-亞基)甲胺,偶電子離子(產(chǎn)物V)為氟代二甲基硅正離子,則產(chǎn)物Ⅴ對應(yīng)m/z77的離子峰.最后對產(chǎn)物Ⅳ進行NBO布局分析,得到的自然電荷分布及成鍵信息可見支撐信息中表4(見網(wǎng)站http://www.yndxxb.ynu.edu.cn).從產(chǎn)物Ⅳ的布局分析結(jié)果來看,N原子的自然電荷數(shù)為-0.453 61,這與分子離子中N原子的電荷數(shù)相近,而且高于反應(yīng)物與中間體中N原子的電荷數(shù).這種現(xiàn)象的產(chǎn)生是由于N―Si鍵斷裂而在N原子和C(6)原子之間形成了1個π鍵.Si原子的電負性小于C原子,中間體Ⅲ中硅氮雙鍵的成鍵電子分別有82.56%和89.54%歸屬于N原子,而在產(chǎn)物Ⅳ中形成氮碳雙鍵的電子分別僅有57.93%和58.61%歸屬于N原子.
從產(chǎn)物的幾何構(gòu)型及自然電荷分布分析,骨架重排反應(yīng)的裂解機理是電負性較大的F在斷開F―C(8)鍵時帶走了成鍵的2個電子,進而進攻Si正離子.在F-Si鍵形成的同時,迫使Si―N鍵發(fā)生斷裂,成鍵的一對電子全部轉(zhuǎn)移到N原子上.這使得C(8)帶1個單位正電荷,N帶1個單位負電荷.而N上的一對電子轉(zhuǎn)移使得氮氧之間形成1個π鍵,促使O―C(6)之間的1個鍵斷裂,成鍵的一對電子轉(zhuǎn)移到O和C(8)之間使其成鍵,所以在產(chǎn)物Ⅳ中存在1個三元環(huán).其反應(yīng)歷程見圖4.
圖4 MSTFA骨架重排反應(yīng)歷程Fig.4 Reaction processof MSTFA skeleton rearrangement.
2.2 電荷中心誘導(dǎo)的i斷裂對MSTFA電荷中心誘導(dǎo)的i斷裂的反應(yīng)產(chǎn)物Ⅵ和反應(yīng)產(chǎn)物Ⅶ進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化,得到的幾何構(gòu)型見圖2.從分子結(jié)構(gòu)和電荷分析得到電荷中心和游離基中心都被定域在N原子上.除了發(fā)生游離基中心誘導(dǎo)的α斷裂外,也可發(fā)生由電荷中心誘導(dǎo)的i斷裂;而與電荷中心相連的N―Si鍵的一對成鍵電子全部被正電荷吸引,促使單鍵發(fā)生斷裂,電荷發(fā)生轉(zhuǎn)移,從而反應(yīng)生成1個偶電子離子和1個自由基.其生成的偶電子離子為三甲基硅正離子,在MSTFA的質(zhì)譜圖中對應(yīng)m/z73的離子峰.產(chǎn)物Ⅵ經(jīng)結(jié)構(gòu)優(yōu)化后,N―C(2)鍵的鍵長為0.1 43 49 nm,N―C(6)鍵的鍵長為0.1 36 64 nm,推測應(yīng)都為單鍵.而產(chǎn)物Ⅵ不帶電荷,且自旋多重度為2,則可以初步推斷出游離基中心定域在N上.對產(chǎn)物Ⅵ進行NBO布局分析,可以得到N原子價電層上存在3個未成鍵電子,α自旋軌道上存在1個單電子,來自于p軌道.還有一對孤對電子,分別存在于α自旋軌道和β自旋軌道上,來自于雜化軌道,并且最終得到的自然電荷分布及成鍵性質(zhì)可見支撐信息中表5(見網(wǎng)站http://www.yndxxb.ynu.edu.cn).
2.3 碎片離子的豐度
2.3.1 產(chǎn)物穩(wěn)定性對豐度的影響 王毅等[13]通過對N-甲基-N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺及N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺的質(zhì)譜圖解析,發(fā)現(xiàn)重排反應(yīng)產(chǎn)生的m/z77碎片離子峰的豐度均很高,推斷α斷裂后重排反應(yīng)具有很強的競爭力,且2個質(zhì)譜圖中i斷裂產(chǎn)生的m/z73碎片峰的豐度差異很大,但原文并未解釋說明.因此,我們將從能量的角度來預(yù)測離子的豐度,對影響質(zhì)譜圖豐度的因素進行系統(tǒng)探究.因為,離子碎裂反應(yīng)所產(chǎn)生的產(chǎn)物(包括產(chǎn)生的中性游離基,離子,中性分子)越穩(wěn)定,反應(yīng)就越容易進行[18,36-37].我們利用Gaussian09進行振動分析,得到的各個駐點能量相關(guān)數(shù)據(jù)示于表1.
2.3.2 電荷分布對豐度的影響 除了產(chǎn)物的穩(wěn)定性,分子的電荷分布也能決定反應(yīng)的方向[13].α斷裂是由游離基中心誘導(dǎo)的鍵斷裂,而i斷裂是電荷中心誘導(dǎo)的鍵斷裂.由于MSTFA及其衍生物,發(fā)生α斷裂均產(chǎn)生甲基自由基,發(fā)生i斷裂均產(chǎn)生氟代二甲基硅正離子.所以,我們推測決定反應(yīng)競爭能力的是電荷中心和游離基中心定域的雜原子(O/N).因為雜原子的電荷數(shù)越大,就定域在雜原子上的游離基越不活潑,越不利于穩(wěn)定雜原子上的正電荷,i斷裂反應(yīng)就越有優(yōu)勢.然而,化學(xué)環(huán)境不同會造成雜原子所帶電荷數(shù)不同.因此,通過對N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺分子離子的NBO布局分析獲得的自然電荷分布如表2所示.
表1 各駐點能量相關(guān)數(shù)據(jù)Tab.1 Energy related data of each stationary point
從表2的自然電荷分布可知,MSTFA分子離子中N所帶電荷數(shù)為-0.439 33,N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺分子離子中N所帶電荷數(shù)為-0.87994.由此我們推論,MSTFA質(zhì)譜圖中m/z73碎片峰的豐度相比于N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺應(yīng)更大,這與王毅等[12]得到的質(zhì)譜圖分析一致.然而,以上例子不足以說明推論的正確性.所以,我們通過對由氣相色譜-質(zhì)譜法得到的MSTFA衍生化產(chǎn)物2-乙基-2-氟丁酸(化合物a)、2-氟-2-甲基丙酸(化合物b)、三氟乙酸(化合物c)相對應(yīng)的質(zhì)譜圖依次解析,可以推論化合物分子離子中電荷中心定域的雜原子O的電荷數(shù)大小應(yīng)是 c<a<b.因此,我們對化合物a、b、c的分子離子進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化、振動分析,并且使用NBO6.0軟件進行布局分析,將得到的電荷分布結(jié)果示于表3、表4、表5.從NBO布局分析結(jié)果中,可以得到化合物a分子離子中電荷中心定域的雜原子O所帶電荷數(shù)為-0.70254;化合物b分子離子中O的電荷數(shù)為-0.693 28;化合物c分子離子中O的電荷數(shù)為-0.87356.因此,我們所得到的結(jié)果與猜想相同,可以證明推論的正確性.
表2 N-(三甲基硅烷)三氟乙酰胺分子離子的自然電荷分布Tab.2 Natural charge distribution of N-(trimethylsilane)trifluoroacetamide molecular ions
本文通過在質(zhì)譜圖解析的基礎(chǔ)上,采用DFT方法,對MSTFA及其含氟衍生物在質(zhì)譜中裂解反應(yīng)機理進行了深入的研究.分別對各駐點進行結(jié)構(gòu)優(yōu)化、振動分析和能量的計算,以及使用NBO6.0,對各駐點進行了布局分析.最終發(fā)現(xiàn),由于分子離子的電荷中心及游離基中心均定域在與Si原子相連的雜原子N(O)上,且雜原子的α自旋軌道上存在1個單電子,所以在游離基中心誘導(dǎo)下分子離子會發(fā)生α斷裂,在Si和N(O)上形成1個π鍵.而且有正電荷轉(zhuǎn)移到Si上,形成的產(chǎn)物存在共振現(xiàn)象.因此,α斷裂后會發(fā)生骨架重排反應(yīng),形成偶電子離子氟代二甲基硅正離子(m/z77)和1個中性分子.然而,中性分子中N原子和相鄰C之間生成1個σ鍵和1個π鍵,且分子中存在1個三元環(huán).分子離子生成后,除了發(fā)生α斷裂以外也可發(fā)生由電荷中心誘導(dǎo)的i斷裂,生成偶電子離子三甲基硅正離子(m/z73)和1個自由基,且自由基中雜原子N(O)的價電層上存在3個未成鍵電子.因此,MSTFA及其含F(xiàn)衍生物的α裂解和i裂解存在競爭關(guān)系.而且由于電荷中心及游離基中心均定域在與Si相連的雜原子N(O)上,所以雜原子的電荷數(shù)越大,定域在雜原子上的游離基越不活潑,越不利于穩(wěn)定雜原子上的正電荷,i斷裂反應(yīng)就越有優(yōu)勢,從而質(zhì)譜圖中m/z73碎片峰的豐度就越大.
表3 化合物a分子離子的自然電荷分布Tab.3 Natural chargedistribution of compound a molecular ions
表4 化合物b分子離子的自然電荷分布Tab.4 Natural chargedistribution of compound b molecular ions
表5 化合物c分子離子的自然電荷分布Tab.5 Natural charge distribution of compound c molecular ions
致謝:感謝國家自然科學(xué)基金(21465025)和化學(xué)化工國家級實驗教學(xué)示范中心(云南大學(xué))的經(jīng)費支持,以及云南大學(xué)高性能計算中心提供的一些計算資源及技術(shù)支持.