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        基于深度學(xué)習(xí)與功能磁共振的人工智能前列腺癌診斷效能

        2021-05-26 02:53:24李凌昊胡怡音孟廣明黃子丹李致勛姜建
        關(guān)鍵詞:勾畫前列腺癌前列腺

        李凌昊,胡怡音,孟廣明,黃子丹,李致勛,姜建

        1.南昌大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,江西南昌 330027;2.南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院影像科,江西南昌 330006;3.南昌大學(xué)信息工程學(xué)院,江西南昌 330031;*通訊作者 姜建 jij2002cn@126.com

        前列腺良性增生與前列腺癌是中老年男性的常見疾病,我國前列腺癌發(fā)病率較高,且呈逐年上升趨勢(shì)[1]。常見的前列腺癌臨床診斷主要包括直腸指檢、前列腺特異性抗原(prostate-specific antigen,PSA)檢測及穿刺活檢。直腸指檢通過臨床醫(yī)師指觸的方式判斷前列腺體積大小,適用于初步診斷;PSA 水平易受炎癥影響,多次穿刺容易造成組織損傷。因此,盡管后兩者診斷前列腺癌準(zhǔn)確度較高,但仍存在誤差或不足。

        多功能磁共振成像發(fā)展迅速,為前列腺癌的診斷提供了有效的影像學(xué)途徑。擴(kuò)散加權(quán)成像(DWI)主要反映組織內(nèi)水分子的運(yùn)動(dòng)信息,進(jìn)而提示陽性組織區(qū)域,對(duì)前列腺癌的診斷有較高的參考價(jià)值,是目前臨床常用的診斷方法[2]。

        近年提出多個(gè)人工智能癌癥診斷與輔助檢測系統(tǒng)及模型,相關(guān)研究與實(shí)驗(yàn)證明人工智能在圖像識(shí)別上具有一定的優(yōu)勢(shì)[3-5]。深度學(xué)習(xí)由Hinton 等[6]于2006年首次提出,是一種基于無監(jiān)督學(xué)習(xí)和特征層次結(jié)構(gòu)的學(xué)習(xí)方法,在圖像的歸類分類、語音辨識(shí)等多個(gè)領(lǐng)域均有較好的表現(xiàn)[7]。卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(convolutional neural networks,CNN)是一個(gè)多層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),具有強(qiáng)魯棒性和容錯(cuò)能力,易于訓(xùn)練和優(yōu)化[8]。殘差網(wǎng)絡(luò)(residual network,ResNet)是He 等[9]提出的一類CNN,通過在每2 層增加1 個(gè)運(yùn)算通道,構(gòu)成1 個(gè)殘差塊,達(dá)成全網(wǎng)絡(luò)的跳躍連接,回避了由于各層參數(shù)過小且相乘導(dǎo)致的梯度下降問題與網(wǎng)絡(luò)退化問題[10]。

        本研究擬對(duì)人工智能在DWI 與表觀擴(kuò)散系數(shù)(ADC)圖像診斷上的效能進(jìn)行研究,對(duì)2 種模型與圖像的組合進(jìn)行評(píng)估,并利用ADC 圖像對(duì)ResNet 的定性分析能力進(jìn)行測試。

        1 資料與方法

        1.1 儀器與方法 采用西門子1.5T MR 系統(tǒng),患者取仰臥位,掃描范圍從髂棘掃描到恥骨聯(lián)合下緣。DWI采用快速自旋回波序列,視野180 mm×200 mm,層厚4 mm,層距1,TR 4100 ms,TE 91 ms,矩陣256×256,b 值取0、800、1600 s/mm2。由b=800 s/mm2自動(dòng)后處理重建ADC 圖像。

        1.2 數(shù)據(jù)處理 共收集1.5T MR 病例112 個(gè),其中經(jīng)過病理診斷為前列腺癌52 個(gè),病理結(jié)果陰性60 個(gè)。刪去伴有炎癥及影像特征不典型的圖像,其余圖像由3 名影像科醫(yī)師進(jìn)行人工標(biāo)記,標(biāo)注陽性特征范圍,由1 名泌尿系統(tǒng)影像學(xué)診斷專家審核,共處理陽性ADC 與DWI(b 值取1600 s/mm2)圖像各251 張。使用全部陽性圖片作為分割實(shí)驗(yàn)訓(xùn)練集。選用訓(xùn)練集樣本圖片320 張(陽性120 張,陰性200 張),測試組樣本圖片98 張(陽性22 張,陰性76 張)對(duì)ResNet通過ADC 圖像診斷前列腺癌性能進(jìn)行測試。人工組由2 名影像科醫(yī)師組成,對(duì)同組影像測試數(shù)據(jù)進(jìn)行判斷。使用人工勾畫區(qū)域?yàn)椤敖饦?biāo)準(zhǔn)”,對(duì)分割結(jié)果使用交并比指標(biāo)評(píng)價(jià)分割性能;對(duì)定性診斷結(jié)果使用交叉熵計(jì)算每個(gè)樣本的置信度。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 使用SPSS 22.0 軟件,繪制受試者工作特征(ROC)曲線,計(jì)算曲線下面積(AUC), 并判斷最佳臨界點(diǎn)。P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 CNN 分割性能測試 將上述數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練集輸入CNN 進(jìn)行訓(xùn)練。使用測試集進(jìn)行分割性能測試。測試準(zhǔn)確曲線見圖1,圖像趨勢(shì)明顯,且未出現(xiàn)明顯的震蕩現(xiàn)象,ADC 與DWI 圖像準(zhǔn)確度分別為61.34%和57.35%。

        圖1 CNN 學(xué)習(xí)測試曲線

        2.2 ResNet 分割性能測試 選用具有深度學(xué)習(xí)特性的ResNet 網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行訓(xùn)練,并對(duì)其性能進(jìn)行測試(圖2)。由圖2 可見,曲線趨勢(shì)明顯,未出現(xiàn)過擬合與震蕩現(xiàn)象。測試準(zhǔn)確度分別為60.05%、63.08%。同時(shí)發(fā)現(xiàn)ResNet 圖像在細(xì)節(jié)精度上明顯高于CNN,圖3 為同一測試圖像的分割結(jié)果,ResNet 圖像在邊界分割上明顯優(yōu)于CNN,且對(duì)有不同信號(hào)特點(diǎn)的前列腺正常組織結(jié)構(gòu)做出了一定的區(qū)分。對(duì)于轉(zhuǎn)移性癌組織區(qū)分,2 種模型分割圖像效果均不甚理想,對(duì)癌癥區(qū)域勾畫較為準(zhǔn)確,但無法區(qū)分是否為前列腺區(qū)域,如出現(xiàn)盆底肌轉(zhuǎn)移(圖4)。

        圖2 ResNet 學(xué)習(xí)測試曲線

        2.3 基于ResNet-ADC 區(qū)域分割的前列腺癌診斷 模型檢出22 張陽性樣本中的12 張,76 張陰性樣本中的56 張,診斷準(zhǔn)確度、敏感度和特異度分別為69.39%、54.50%和73.68%。人工組22 張陽性樣本全部檢出,76 張陰性樣本檢出71 張。根據(jù)人工智能判斷數(shù)據(jù)繪制ROC 曲線(圖5),AUC 為0.782。根據(jù)圖像所得最佳閾值為50.1%,此時(shí)模型準(zhǔn)確度達(dá)90.9%。

        圖3 男,61 歲,前列腺腺癌(Gleason 評(píng)分3+4=7 分)。A 為ADC 圖像,中心低信號(hào)區(qū)域?yàn)殛栃詤^(qū)域;B 為CNN 勾畫ADC區(qū)域;C 為ResNet 勾畫區(qū)域;D 為同層面DWI(b=1600 s/mm2)圖像;E 為CNN 勾畫DWI 區(qū)域;F 為ResNet 勾畫區(qū)域

        圖4 男,72 歲,前列腺腺癌(Gleason 評(píng)分4+4=8 分)。A 為1例有直腸轉(zhuǎn)移的前列腺癌ADC 圖像;B 為同層面DWI 圖像;C 為CNN 勾畫區(qū)域;D 中紅色區(qū)域?yàn)槿斯そM勾畫區(qū)域,藍(lán)色為ResNet 勾畫區(qū)域

        圖5 根據(jù)ResNet模型測試樣本置信度繪制ROC曲線

        3 討論

        目前應(yīng)用較廣的、準(zhǔn)確性較高的前列腺癌診斷方法主要有PSA檢測、直腸超聲引導(dǎo)病理穿刺和MRI。臨床上運(yùn)用最廣的是PSA,其具有極高的組織特異性,但敏感度高而特異性低。直腸超聲穿刺活檢是目前診斷前列腺癌的“金標(biāo)準(zhǔn)”,但在敏感度與準(zhǔn)確度上仍存在一定的局限性[11]。傳統(tǒng)MRI主要通過T2、ADC與DWI聯(lián)合使用進(jìn)行診斷,能獲得較上述3種方法更清晰、準(zhǔn)確的病灶,但在實(shí)際工作中,由于增生與移行區(qū)本身組織特點(diǎn)造成的復(fù)雜信號(hào)影,其對(duì)病灶的定位仍有一定的不足。

        人工智能影像診斷已在膠質(zhì)瘤、心血管疾病、肺結(jié)節(jié)、乳腺癌等多個(gè)領(lǐng)域有所突破[12-15]。與傳統(tǒng)的人工診斷相比,較成熟的人工智能診斷與分割優(yōu)勢(shì)在于:①在圖像特征如明暗度、圖像對(duì)比度等方面,人工智能的識(shí)別能力強(qiáng)于人眼識(shí)別;②回避了由于影像醫(yī)師經(jīng)驗(yàn)、熟練度、疲勞等主觀因素造成的誤診率;③數(shù)字信息存儲(chǔ)便于開展不同區(qū)域、不同領(lǐng)域的案例、數(shù)據(jù)交流合作。

        本實(shí)驗(yàn)勾畫的病例中含有位于移行區(qū)與外周帶的癌灶,且包括多個(gè)分級(jí)。分別使用CNN與ResNet學(xué)習(xí)圖像特征并進(jìn)行分割測試。結(jié)果顯示,2個(gè)模型在ADC圖像分割上準(zhǔn)確率相近,ResNet的DWI分割準(zhǔn)確率較CNN有一定的提高,提示盡管ADC與DWI圖像存在關(guān)聯(lián)性,但在訓(xùn)練模型價(jià)值上或仍存在一定的差異?;赗esNet-ADC區(qū)域分割的前列腺癌診斷調(diào)試至最佳閾值后,人工智能整體準(zhǔn)確率也可提升到較高水平。

        本研究發(fā)現(xiàn),深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)在MRI前列腺癌病灶分割上顯示出較大優(yōu)勢(shì),國內(nèi)外亦有多種思路與模型對(duì)此類問題進(jìn)行討論與研究。Yan等[16]提出的傳播深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),可以將多級(jí)特征提取的最佳組合納入一個(gè)模型中。使用的30個(gè)MR測試集樣本表現(xiàn)出較高的魯棒性與準(zhǔn)確率。To等[17]利用T2與ADC圖像構(gòu)建的3D深密集多徑CNN分割、鑒別前列腺癌,在2個(gè)獨(dú)立測試集中分別實(shí)現(xiàn)了95.11、89.01的Dice系數(shù)。本研究采用對(duì)大數(shù)據(jù)更為敏感的、建模較為成熟的CNN與ResNet深度學(xué)習(xí)模型,選用臨床工作常用掃描序列,結(jié)果有較強(qiáng)的可應(yīng)用性。

        本研究嘗試在預(yù)處理步驟中,對(duì)ADC圖像與DWI圖像進(jìn)行對(duì)比度調(diào)整并組合。但對(duì)于新生成的圖片,陽性區(qū)域的認(rèn)定、特征代表的臨床意義、診斷價(jià)值等問題尚未取得統(tǒng)一的意見與建議。而對(duì)于T2圖像與ADC或DWI的擬合,除存在上述問題外,由于掃描平面稍不同,還存在圖像對(duì)齊問題亟需解決。本研究著重實(shí)驗(yàn)分析了ADC與DWI(b=1600 s/mm2)的結(jié)果,但對(duì)同切面T2圖像亦進(jìn)行了實(shí)驗(yàn),結(jié)果差強(qiáng)人意,分析其主要原因?yàn)椋孩倥cADC及DWI相比,T2圖像的癌區(qū)域具體范圍更難標(biāo)記,尤其是移行區(qū)的癌變邊界,人工標(biāo)記精度存在較大波動(dòng)。②T2圖像下,前列腺內(nèi)部各區(qū)域信號(hào)值差異更為明顯,需要提取,學(xué)習(xí)的特征更多。因此對(duì)訓(xùn)練集樣本數(shù)目與質(zhì)量均提出了更高的要求。

        總之,深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò)在前列腺癌病灶分割和定性分析上均顯示出較大的優(yōu)勢(shì),具有一定的臨床實(shí)用性。

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