譚靜琳, 褚慶民, 李秋明
(1.廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院,廣東廣州 510405;2.廣州醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院,廣東廣州 510130)
風(fēng)濕性心臟?。╮heumatic heart disease,RHD)是A組溶血性鏈球菌感染所引起的自身免疫性疾病,主要累及二尖瓣,表現(xiàn)為瓣膜狹窄和關(guān)閉不全[1]。風(fēng)濕性心臟病在我國(guó)仍有較高的患病率,是導(dǎo)致慢性心力衰竭的主要心血管疾病之一[2-3]?,F(xiàn)代醫(yī)學(xué)對(duì)風(fēng)濕性心臟病的發(fā)病機(jī)制認(rèn)識(shí)確切,但無(wú)法根治,需長(zhǎng)期甚至終生服用抗生素治療,其中大部分患者仍不可避免地發(fā)展至心力衰竭階段。中醫(yī)學(xué)無(wú)風(fēng)濕性心臟病病名,根據(jù)心悸、關(guān)節(jié)紅腫熱痛等主要臨床癥狀,將其歸屬于“心痹”范疇?!饵S帝內(nèi)經(jīng)》提及“脈痹不已,復(fù)感于邪,內(nèi)舍于心”“心痹者,脈不通,煩則心下鼓,暴上氣而喘”。我院應(yīng)用麻黃加術(shù)湯加減治療風(fēng)濕性心臟病外感風(fēng)寒濕證的療效甚佳。從現(xiàn)代醫(yī)學(xué)病理角度發(fā)現(xiàn),無(wú)論是風(fēng)濕性心臟病的炎性滲出階段還是肉芽形成階段,均可予麻黃加術(shù)湯辨證使用[4]。但其作用機(jī)制尚不清楚。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)(network pharmacology)是基于藥理學(xué)及生物學(xué)等多學(xué)科的交叉理論,其可運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)及網(wǎng)絡(luò)分析等多項(xiàng)前沿技術(shù),揭示“方劑-成分-靶標(biāo)-疾病”之間復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,從多維度理解疾病的分子基礎(chǔ),預(yù)測(cè)藥物的藥理學(xué)潛在機(jī)制[5],為新藥研發(fā)或老藥新用提供新的思路。因此,本研究運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,分析麻黃加術(shù)湯干預(yù)風(fēng)濕性心臟病的有效藥性成分和可能的分子通路,以期為臨床用藥提供科學(xué)依據(jù),現(xiàn)將研究結(jié)果報(bào)道如下。
1.1數(shù)據(jù)庫(kù)與軟件來(lái)源中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(tái)(TCMSP)(https://tcmspw.com/tcmsp.php/);通用蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(UniProt)(https://www.uniprot.org/);在線(xiàn)人類(lèi)孟德?tīng)栠z傳數(shù)據(jù)庫(kù)(OMIM)(http://omim.org/);人類(lèi)基因數(shù)據(jù)庫(kù)(GeneCards)(http://www.genecards.org/);生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫(kù)(DAVID)(https://david.ncifcrf.gov/);STRING數(shù)據(jù)庫(kù)(https://string-db.org/);OmicShare網(wǎng)站(http://www.omicshare.com/tools);網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵傩苑治鲕浖﨏ytoscape 3.7.0。
1.2中藥活性成分的收集與篩選在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中,以“麻黃”“桂枝”“苦杏仁”“甘草”“白術(shù)”為關(guān)鍵詞,檢索獲取相關(guān)中藥化學(xué)成分信息,以類(lèi)藥性(drug-like,DL)≥0.18、口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%為條件對(duì)化學(xué)成分進(jìn)行篩選[6],獲取活性成分。OB代表口服藥物的活性或有效成分到達(dá)體循環(huán)并被吸收的程度和速度,OB值越高代表藥物生物活性分子的DL越好[7]。
1.3藥物作用靶標(biāo)與風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)的獲取應(yīng)用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中的靶標(biāo)預(yù)測(cè)功能搜集上述中藥的有效化學(xué)成分的靶標(biāo)蛋白,借助UniProt數(shù)據(jù)庫(kù),通過(guò)導(dǎo)入蛋白名稱(chēng)并限定物種為“人”,將檢索到的所有靶標(biāo)蛋白校正為Official Gene Symbol,得到靶標(biāo)蛋白所對(duì)應(yīng)的基因名[8]。通過(guò)輸入關(guān)鍵詞“rheumatic heart disease”,在數(shù)據(jù)庫(kù)OMIM與GeneCards中收集風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)。最后將各個(gè)藥物作用靶標(biāo)與疾病靶標(biāo)作比對(duì),篩出二者的共同靶標(biāo),得到麻黃加術(shù)湯對(duì)風(fēng)濕性心臟病的靶標(biāo)。
1.4活性成分-風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建將麻黃、桂枝、苦杏仁、甘草、白術(shù)的活性成分與風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)上傳到Cytoscape 3.7.0軟件中,構(gòu)建藥物活性成分-風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)。網(wǎng)絡(luò)中的節(jié)點(diǎn)表示靶標(biāo)或化合物,而邊則表示活性成分與風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)之間的相互作用。
1.5靶標(biāo)互作(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建在STRING數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索麻黃加術(shù)湯和風(fēng)濕性心臟病疾病的潛在靶標(biāo),物種選擇為“Homo Sapiens”,最低相互作用閾值設(shè)置為“Medium Confidence(中等置信度)”0.4[9],其余參數(shù)作默認(rèn)設(shè)置處理,獲得靶標(biāo)的相互作用關(guān)系。再通過(guò)Cytoscape 3.7.0軟件制作出PPI網(wǎng)絡(luò),使用Network Analyzer進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析,根據(jù)連接度調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)的大小,制作出PPI網(wǎng)絡(luò)。連接度即Degree,是指PPI網(wǎng)絡(luò)里節(jié)點(diǎn)所通過(guò)的邊的個(gè)數(shù)。Degree值越大代表此節(jié)點(diǎn)與其他節(jié)點(diǎn)的關(guān)系更緊密,在網(wǎng)絡(luò)中地位越重要。
1.6 GO功能富集分析與KEGG通路富集分析在數(shù)據(jù)庫(kù)DAVID中導(dǎo)入麻黃加術(shù)湯和風(fēng)濕性心臟病疾病的潛在靶標(biāo),選擇“OFFICE_GENE_SYMBOL”“Gene List”,種屬選為“Homo Sapiens”,再選取“Gene Ontology”下的“GOTERM_BP_DIRECT”以及“pathways”下的“KEGG_PATHWAY”進(jìn)行GO生物過(guò)程的富集分析以及KEGG通路分析。以P<0.01且從小到大排序作為篩選條件,選取符合條件的前20位的GO生物過(guò)程及KEGG通路。再應(yīng)用OmicShare云平臺(tái),進(jìn)行數(shù)據(jù)可視化處理。參考現(xiàn)有研究,篩選出與風(fēng)濕性心臟病治療相關(guān)的可能通路,與藥物相應(yīng)的活性成分構(gòu)建出“藥物-靶標(biāo)-通路-疾病”網(wǎng)絡(luò)圖。
2.1麻黃加術(shù)湯的藥物作用靶標(biāo)預(yù)測(cè)及分析以O(shè)B≥30%、DL≥0.18為篩選條件,共篩選出針對(duì)風(fēng)濕性心臟病的120個(gè)活性成分,其中,麻黃22個(gè),桂枝6個(gè),苦杏仁16個(gè),甘草88個(gè),白術(shù)4個(gè)(活性成分在藥物之間有重復(fù)),見(jiàn)表1(僅列舉25個(gè))。將該活性成分的靶標(biāo)輸入U(xiǎn)niProt數(shù)據(jù)庫(kù)后獲得相同數(shù)目基因靶標(biāo),將所有的基因靶標(biāo)與數(shù)據(jù)庫(kù)OMIM和GeneCards中涉及風(fēng)濕性心臟病的基因進(jìn)行匹配對(duì)比,最終獲得可能與風(fēng)濕性心臟病有關(guān)的靶標(biāo)103個(gè)。
表1 麻黃加術(shù)湯針對(duì)風(fēng)濕性心臟病活性成分的基本信息Table 1 Data of active ingredients from Mahuangjiazhu Decoction for rheumatic heart disease
(續(xù)表1)
2.2麻黃加術(shù)湯活性成分-風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建圖1結(jié)果顯示,此網(wǎng)絡(luò)共包括228個(gè)節(jié)點(diǎn)、975個(gè)邊。節(jié)點(diǎn)分別表示麻黃加術(shù)湯潛在的活性成分與作用靶標(biāo)。而圖中麻黃加術(shù)湯中多個(gè)靶標(biāo)可對(duì)應(yīng)相同的活性成分,一個(gè)靶標(biāo)也可與不同的活性成分相對(duì)應(yīng),可見(jiàn)麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病具有多成分、多靶標(biāo)的特點(diǎn)。圖1中,連接較多的節(jié)點(diǎn)在整個(gè)網(wǎng)絡(luò)中起到樞紐的作用,可能是核心活性成分或者關(guān)鍵靶點(diǎn),每個(gè)節(jié)點(diǎn)的大小根據(jù)Degree值來(lái)展示,經(jīng)Network Analyzer分析,Degree值排名前5位的中藥活性成分分別是槲皮素(quercetin)、木 犀 草 素(luteolin)、山 柰 酚(kaempferol)、柚皮素(naringenin)、甘草查爾酮A(licochalcone A)。排名前5位的靶標(biāo)分別是人前列腺素內(nèi)過(guò)氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2),雌激素受體1(estrogen receptor 1,ESR1),雄激素受體(androgen receptor,AR),一氧化氮合酶2(nitric oxide synthase 2,NOS2),過(guò)氧化物酶增生激活受體(peroxisome proliferative activated receptor gamma,PPARG)。
2.3靶標(biāo)PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建圖2結(jié)果顯示,共同靶標(biāo)PPI網(wǎng)絡(luò)共包括102個(gè)節(jié)點(diǎn)(已剔除1個(gè)游離節(jié)點(diǎn))、1 678個(gè)邊。圖中Degree值越大則節(jié)點(diǎn)顏色越深,且節(jié)點(diǎn)越接近圖中圓心。麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病的靶標(biāo)中Degree值排名前5位的靶標(biāo)為蛋白激酶Bα(protein kinase B alpha,PKBα,又稱(chēng)AKT1)、白細(xì)胞介素6(interleukin 6,IL-6)、絲裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3),血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA),白細(xì)胞介素8(interleukin 8,IL-8,又稱(chēng)CXCL8)。
圖2 麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病共同靶標(biāo)PPI網(wǎng)絡(luò)圖Figure 2 Protein-protein interaction network of rheumatic heart disease treated by Mahuangjiazhu Decoction
2.4 GO生物過(guò)程和KEGG通路富集分析圖3、4結(jié)果顯示:麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病GO生物過(guò)程存在化學(xué)刺激、氧化應(yīng)激、炎癥生成等多個(gè)條目;其KEGG富集通路有白細(xì)胞介素17(IL-17)信號(hào)通路、腫瘤壞死因子(TNF)信號(hào)通路、Toll樣受體(TLR)信號(hào)通路、輔助性T細(xì)胞17(Th17)細(xì)胞分化通路、T細(xì)胞受體(TCR)信號(hào)通路等。
圖3 活性成分對(duì)應(yīng)靶標(biāo)的GO生物過(guò)程分析Figure 3 GO biologicalprocess analysis of active ingredients-matched targets
圖4 活性成分對(duì)應(yīng)靶標(biāo)的KEGG通路富集分析Figure 4 KEGG signaling pathway enrichment analysis of active ingredient-matched target
2.5麻黃加術(shù)湯-風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)-KEGG通路網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建圖5結(jié)果顯示,麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病是一個(gè)涉及多個(gè)靶標(biāo)及通路的過(guò)程。通路主要涉及IL-17信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路、TLR信號(hào)通路、Th17細(xì)胞分化通路、TCR信號(hào)通路。
圖5 麻黃加術(shù)湯-風(fēng)濕性心臟病靶標(biāo)-KEGG通路網(wǎng)絡(luò)圖Figure 5 Network of Mahuangjiazhu Decoctionrheumatic heart disease target-KEGG signaling pathway
麻黃加術(shù)湯由麻黃、桂枝、苦杏仁、甘草、白術(shù)組成,方中:麻黃辛溫走散,祛風(fēng)以發(fā)表,功專(zhuān)開(kāi)阻除痹,其通脈鎮(zhèn)痛效果居諸藥之首。無(wú)論是經(jīng)方,還是后世之經(jīng)典方劑,凡治痹名方,其中皆有麻黃,且無(wú)問(wèn)寒熱虛實(shí)[10]。加白術(shù)以除濕而固里,又有桂枝和營(yíng)達(dá)衛(wèi),助麻黃以發(fā)表,杏仁疏肺降氣,導(dǎo)白術(shù)以宣中;更加甘草協(xié)和表里[11],行開(kāi)阻除痹之功。在麻黃加術(shù)湯活性成分-靶標(biāo)-疾病相互作用網(wǎng)絡(luò)中,槲皮素、木犀草素、山柰酚、柚皮素、甘草查爾酮A與風(fēng)濕性心臟病關(guān)聯(lián)性最高,且均屬黃酮類(lèi)化合物。幾乎每一種黃酮類(lèi)化合物都具有抗氧化活性,通過(guò)直接清除自由基、抑制活性氧簇(ROS)相關(guān)酶的產(chǎn)生,增加細(xì)胞分泌抗氧化介質(zhì),保護(hù)心肌細(xì)胞[12],通過(guò)清除自由基及降低促炎因子、上調(diào)抗炎因子,從而發(fā)揮抗炎作用[13]。其中,槲皮素在動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中已被證實(shí)具有較好的心肌細(xì)胞保護(hù)作用,可能與其強(qiáng)抗氧化活性相關(guān)[14];木犀草素也同樣被證實(shí)通過(guò)降低氧化應(yīng)激損傷、調(diào)節(jié)炎癥因子分泌、調(diào)控多條信號(hào)通路,從而緩解炎癥反應(yīng),保護(hù)心臟[15];山柰酚脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)抑制劑,抑制白三烯的產(chǎn)生、減輕炎癥反應(yīng)[16];低濃度的柚皮素可以減少前列腺素E2的生成,降低環(huán)氧合酶2(cyclooxygenase 2,COX-2)的表達(dá),而高濃度的柚皮素則可以抑制核因子-κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)的活化,從而減少炎癥反應(yīng)的發(fā)生[17];甘草查爾酮A則通過(guò)激活相關(guān)通路,抑制ROS導(dǎo)致的氧化應(yīng)激,保護(hù)心肌細(xì)胞[18]。
與藥物活性成分關(guān)聯(lián)最密切的靶標(biāo)分別是PTGS2、ESR1、AR、NOS2、PPARG。PTGS2是一種氧化應(yīng)激相關(guān)因子,與介導(dǎo)炎癥生成的前列腺素生物合成有關(guān)[19];ESR1為雌激素受體,與心力衰竭相關(guān)[20];而AR則為雄激素受體,研究發(fā)現(xiàn),AR在心肌中增加,與自身免疫性心肌炎進(jìn)展的時(shí)間有關(guān)[21];NOS2存在于免疫系統(tǒng)及心血管系統(tǒng)中,在細(xì)胞受到刺激后被激活,在炎癥和細(xì)胞損傷中起重要作用[22];PPARG參與體內(nèi)多種生理及病理過(guò)程,包括炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡及動(dòng)脈粥樣硬化等[23]。另一方面,風(fēng)濕性心臟病PPI網(wǎng)絡(luò)中靶標(biāo)AKT1、IL-6、CXCL8、MAPK3、VEGFA高表達(dá)。AKT1能促進(jìn)氧化應(yīng)激產(chǎn)生ROS和活性氮,導(dǎo)致大量自由基形成,進(jìn)而損傷細(xì)胞[24];IL-6與CXCL8屬于白細(xì)胞介素家族,是公認(rèn)的重要炎癥因子;MAPK3被證實(shí)與全身性炎癥患者,如膿毒癥患者的預(yù)后相關(guān)[25];VEGFA是血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子家族成員,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究表明,促進(jìn)VEGFA表達(dá)可產(chǎn)生心肌保護(hù)的作用[26]。提示當(dāng)麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病時(shí),方劑中的黃酮類(lèi)化合物與上述靶標(biāo)的調(diào)控密切相關(guān)。
經(jīng)GO與KEGG富集分析,在GO生物過(guò)程中,靶標(biāo)主要集中于化學(xué)刺激、氧化應(yīng)激、炎癥生成等作用;KEGG通路分析結(jié)果顯示,靶標(biāo)主要涉及IL-17、TNF、TLR、Th17、TCR等信號(hào)通路。研究證實(shí):關(guān)于IL-17信號(hào)通路,IL-17是T細(xì)胞誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)的早期啟動(dòng)因子,IL-17與受體結(jié)合后,可通過(guò)MAPK3途徑和NF-κB途徑,促進(jìn)釋放前炎性細(xì)胞因子來(lái)放大炎癥反應(yīng)[27];關(guān)于TNF信號(hào)通路,TNF-α抑制β-腎上腺素能受體,交感神經(jīng)激素的反饋增加,使促炎因子TNF-α升高,從而導(dǎo)致自我延續(xù)周期,而這種循環(huán)獨(dú)立于由損傷引起的促炎和抗炎反應(yīng),激活有害的信號(hào)通路機(jī)制,引發(fā)心肌肥大和心力衰竭[28];關(guān)于TLR信號(hào)通路,TLR通過(guò)不同的識(shí)別途徑活化多種免疫細(xì)胞,啟動(dòng)非特異性免疫應(yīng)答并激起適應(yīng)性免疫應(yīng)答以清除病原體,該通路在炎癥、免疫細(xì)胞調(diào)控、存活和增殖方面發(fā)揮著關(guān)鍵作用[29];關(guān)于Th17細(xì)胞分化通路,Th17細(xì)胞是由Th0細(xì)胞在IL-6和轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β(transforming growth factorβ,TGF-β)的刺激,以及白細(xì)胞介素21(interleukin 21,IL-21)的促進(jìn)下分化而成的,分化后促進(jìn)中性粒細(xì)胞的動(dòng)員、募集和活化,介導(dǎo)炎癥反應(yīng),因此它與自身免疫性疾病,感染性疾病以及腫瘤的發(fā)生均有密切的關(guān)系[30];關(guān)于TCR信號(hào)通路,TCR能特異性識(shí)別抗原提呈細(xì)胞表面MHC提呈的抗原肽,通過(guò)誘導(dǎo)TCR鄰近酪氨酸激酶活化,促進(jìn)信號(hào)傳遞復(fù)合物組裝,活化下游MAPK、PKC以及鈣離子等信號(hào)途徑,完成T細(xì)胞的活化,因此,TCR信號(hào)通路在細(xì)胞免疫方面起關(guān)鍵作用[31]??偟膩?lái)說(shuō),上述生物過(guò)程、通路及其相互作用,可能與風(fēng)濕性心臟病密切相關(guān)。
綜上所述,本研究揭示了麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病的主要機(jī)制可能是方劑中的黃酮類(lèi)化合物通過(guò)減低PTGS2、AKT1等介導(dǎo)的氧化應(yīng)激,減少NOS2、PPARG、IL-6、CXCL8、MAPK3等炎癥因子的表達(dá),干預(yù)IL-17、TNF、TLR、Th17、TCR等免疫與炎癥相關(guān)通路,從而發(fā)揮抗炎作用,保護(hù)心肌細(xì)胞。本課題組就麻黃加術(shù)湯治療風(fēng)濕性心臟病的關(guān)鍵靶標(biāo)、活性成分、關(guān)鍵信號(hào)通路及其復(fù)雜網(wǎng)狀相互作用關(guān)系進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘及深入探究,為進(jìn)一步進(jìn)行分子機(jī)制研究及臨床應(yīng)用提供了方向和依據(jù)。然而,本研究仍存在一定的局限性,例如中藥在實(shí)際應(yīng)用中的來(lái)源和劑量未能納入研究,今后仍需深入探討。