許金根,靳二輝,顧有方,王重龍,李慶崗*
(1.安徽科技學(xué)院動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)調(diào)控與健康安徽省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,安徽鳳陽(yáng) 233100;2.安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,安徽合肥 230031)
繁殖性狀是豬重要的經(jīng)濟(jì)性狀,對(duì)其遺傳改良可明顯提高產(chǎn)仔數(shù)和經(jīng)濟(jì)效益。在當(dāng)前由非洲豬瘟疫情導(dǎo)致國(guó)內(nèi)豬存欄量下降的背景下,提高產(chǎn)仔數(shù)對(duì)我國(guó)生豬產(chǎn)能恢復(fù)有積極意義。但豬的產(chǎn)仔數(shù)屬于低遺傳力性狀,通過(guò)常規(guī)育種措施遺傳進(jìn)展緩慢,可利用分子標(biāo)記輔助選擇加速豬繁殖性狀的改良進(jìn)程。雌激素受體(Estrogen Receptor,ESR)通過(guò)與雌激素結(jié)合而影響雌性動(dòng)物的生殖力、繁殖周期、胚胎發(fā)育等[1]。卵泡刺激素(Follicle-stimulating Hormone,F(xiàn)SH)具有促進(jìn)動(dòng)物顆粒細(xì)胞增生和卵泡液分泌,以及促進(jìn)雌激素合成與分泌等作用,由α和β亞基構(gòu)成,其生物學(xué)特異性由β亞基決定[2]。因此,ESR和FSHβ被認(rèn)為是調(diào)控豬產(chǎn)仔數(shù)的重要功能候選基因。研究發(fā)現(xiàn),ESR基因的PvuII多態(tài)位點(diǎn)與中外豬種(如:太湖豬、大白豬)的繁殖性狀相關(guān)[3-4],F(xiàn)SHβ基因的多態(tài)性與豬產(chǎn)仔數(shù)相關(guān)[5]。另外,也有研究者聯(lián)合分析ESR基因和FSHβ基因?qū)Σ煌i種繁殖性狀的影響[6-7]。巴克夏豬是肉質(zhì)優(yōu)良的國(guó)外瘦肉型豬種,屬毛色呈六端白的黑豬,與我國(guó)地方黑豬雜交可以生產(chǎn)兼有地方豬種風(fēng)味和適度瘦肉率的精品黑豬[8]?;魤酆谪i屬于淮豬的一個(gè)類群,具有繁殖力高、肉質(zhì)優(yōu)良、適應(yīng)性強(qiáng)等特點(diǎn),可用于純種或與巴克夏豬雜交生產(chǎn)優(yōu)質(zhì)黑豬肉[9]。國(guó)內(nèi)外研究者已對(duì)豬ESR基因和FSHβ基因多態(tài)性進(jìn)行大量檢測(cè),主要集中于國(guó)外的杜洛克豬、長(zhǎng)白豬、大白豬以及我國(guó)多個(gè)地方豬種,但對(duì)巴克夏豬和霍壽黑豬的研究較少。我國(guó)地方豬種的產(chǎn)仔數(shù)一般高于國(guó)外引進(jìn)豬種,是研究豬繁殖性能的寶貴實(shí)驗(yàn)材料。通過(guò)比較中外豬種繁殖性狀候選基因多態(tài)性的分布特征,不僅為解析兩者繁殖性能的遺傳差異提供理論依據(jù),還能為開(kāi)發(fā)分子標(biāo)記用于我國(guó)地方豬種及其雜交群體產(chǎn)仔數(shù)的輔助選擇積累基礎(chǔ)資料。因此,本實(shí)驗(yàn)通過(guò)檢測(cè)巴克夏豬、霍壽黑豬及其雜交后代ESR基因和FSHβ基因多態(tài)性,并研究這2 個(gè)基因多態(tài)性在不同豬群中的分布差異,為尋找提高豬繁殖性能的分子遺傳標(biāo)記奠定基礎(chǔ)。
1.1 實(shí)驗(yàn)材料 采集32 頭巴克夏豬、48 頭霍壽黑豬和105 頭雜交后代(巴克夏豬♂× 霍壽黑豬♀)的耳組織樣本,保存于75%酒精。
1.2 主要試劑和儀器 主要試劑:2×Taq PCR Master Mix、DNA Marker 購(gòu)自北京天根生化科技有限公司,限制性內(nèi)切酶PvuII 購(gòu)自NEB 公司。主要儀器:核酸蛋白濃度測(cè)定儀(美國(guó)Thermo Fisher 公司)、梯度PCR 儀(德國(guó)Eppendorf 公司)、凝膠電泳成像系統(tǒng)(美國(guó)Bio-Rad公司)、電泳儀(北京六一生物科技有限公司)。
1.3 基因組DNA 的提取 采用常規(guī)酚/ 氯仿法提取豬基因組DNA,用紫外分光光度計(jì)測(cè)定濃度后,將其稀釋到100 ng/μL,于4℃保存待用。
1.4 PCR 擴(kuò)增 豬ESR基因擴(kuò)增引物參照Short 等[10]設(shè)計(jì)、FSHβ基因擴(kuò)增引物參照趙要風(fēng)等[5]設(shè)計(jì),具體序列見(jiàn)表1。
表1 豬ESR 基因和FSHβ 基因PCR 擴(kuò)增引物
PCR 反應(yīng)體系:1 μL DNA,10 μL 2×Taq PCR Μaster Mix,上、下游引物各1 μL(10 mmol/mL),加ddH2O至終體積20 μL。PCR 擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性4 min;94℃變性40 s,58℃退火40 s,72℃延伸45 s,共35個(gè)循環(huán);72℃終延伸8 min。
1.5 基因多態(tài)性檢測(cè) 豬ESR基因的PCR產(chǎn)物酶切體系共10 μL:PCR 產(chǎn)物5 μL,限制性內(nèi)切酶PvuII(10 U/μL)0.5 μL,10×Buffer 1 μL,ddH2O 3.5 μL。37℃酶切4 h 后,經(jīng)3%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)進(jìn)行分型。豬FSHβ基因多態(tài)性由片段插入形成,PCR 產(chǎn)物直接經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)分型。
1.6 統(tǒng)計(jì)分析 用Popgene 32 軟件統(tǒng)計(jì)豬ESR、FSHβ的基因頻率、基因型頻率,以及遺傳多態(tài)性指標(biāo)。
2.1 豬ESR基因和FSHβ基因多態(tài)性檢測(cè)結(jié)果 豬ESR基因PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)PvuII 酶切后,產(chǎn)生等位基因A(120 bp)和B(55、65 bp),并檢測(cè)到AA、AB 和BB 基因型(圖1)。豬FSHβ基因經(jīng)PCR 擴(kuò)增產(chǎn)生等位基因A(500 bp)和B(220 bp),并檢測(cè)到AA、AB 和BB 基因型(圖2)。
圖1 豬ESR 基因PCR 產(chǎn)物Pvu II 酶切檢測(cè)
圖2 豬FSHβ 基因PCR 產(chǎn)物檢測(cè)
2.2 豬ESR基因多態(tài)性的基因型頻率和基因頻率 如表2 所示,巴克夏豬ESR基因僅檢測(cè)到AA 型;霍壽黑豬ESR基因檢測(cè)到3 種基因型,AB 和BB 型頻率高于AA 型,等位基因B 頻率高于A;巴克夏豬×霍壽黑豬ESR基因檢測(cè)到3 種基因型,AB 型頻率依次高于AA和BB 型,等位基因A 頻率高于B。
表2 豬ESR 基因的基因型頻率和基因頻率
2.3 豬FSHβ基因多態(tài)性的基因型頻率和基因頻率 如表3 所示,巴克夏豬FSHβ基因檢測(cè)到3 種基因型,BB 型頻率依次高于AB 和AA 型,等位基因B 頻率高于A;霍壽黑豬FSHβ基因檢測(cè)到3 種基因型,AB 型頻率高于BB 和AA 型,等位基因B 頻率略高于A;巴克夏豬× 霍壽黑豬FSHβ基因檢測(cè)到3 種基因型,AB型頻率依次高于BB 和AA 型,等位基因B 頻率高于A。
表3 豬FSHβ 基因的基因型頻率和基因頻率
2.4 豬ESR基因的遺傳多態(tài)性 如表4 所示,巴克夏豬沒(méi)有多態(tài);霍壽黑豬的純合度(0.595 7)高于雜合度(0.404 3),有效等位基因數(shù)為1.678 7,SNP 處于中度多態(tài)(0.25 表4 豬ESR 基因的遺傳多態(tài)性 2.5 豬FSHβ基因的遺傳多態(tài)性 如表5 所示,巴克夏豬的純合度(0.658 2)高于雜合度(0.341 8),有效等位基因數(shù)為1.519 3,SNP 處于中度多態(tài)(0.25 表5 豬FSHβ 基因的遺傳多態(tài)性 作為調(diào)控豬繁殖性狀的功能候選基因,ESR基因和FSHβ基因多態(tài)性已在國(guó)內(nèi)外多個(gè)豬種中進(jìn)行過(guò)檢測(cè)。本研究首次報(bào)道了霍壽黑豬、巴克夏豬×霍壽黑豬ESR基因和FSHβ基因的多態(tài)性。 本實(shí)驗(yàn)對(duì)ESR基因PvuII 酶切位點(diǎn)多態(tài)性分析表明,32 頭巴克夏豬僅檢測(cè)到AA 型,可能是因樣本量較少導(dǎo)致未檢測(cè)到AB 和BB 型;48 頭霍壽黑豬以AB和BB 型為主,等位基因B 頻率較高。蘭旅濤等[11]研究發(fā)現(xiàn),國(guó)外引進(jìn)品種杜洛克豬、長(zhǎng)白豬、大白豬ESR基因的PvuII 酶切位點(diǎn)都以AA 和AB 型為主,等位基因A 頻率較高。李明洲等[3]研究表明,我國(guó)地方品種成華豬、內(nèi)江豬、太湖豬ESR基因的PvuII 酶切位點(diǎn),均是AB 和BB 型為主,等位基因B 頻率較高。曹晶晶等[12]研究發(fā)現(xiàn),ESR基因PvuII 多態(tài)位點(diǎn)的基因頻率在9 個(gè)中外豬種中存在差異,總體上是國(guó)外豬種等位基因A 頻率占優(yōu)勢(shì),而我國(guó)地方豬種等位基因B 頻率占優(yōu)勢(shì)。本研究表明,ESR基因PvuII 位點(diǎn)國(guó)外品種巴克夏豬優(yōu)勢(shì)等位基因?yàn)锳,而地方品種霍壽黑豬優(yōu)勢(shì)等位基因?yàn)锽,這與上述研究結(jié)果較一致。同時(shí),本實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)105 頭巴克夏豬×霍壽黑豬ESR基因的AB 和AA型頻率高于BB 型,等位基因A 頻率高于B,這主要是由于霍壽黑豬導(dǎo)入巴克夏豬血統(tǒng),提高了等位基因A的頻率。另外,ESR基因的PvuII 酶切位點(diǎn)與豬產(chǎn)仔數(shù)的Meta 分析表明,豬產(chǎn)仔性狀的有利等位基因?yàn)锽,有利基因型為BB 型[13]。本研究中,巴克夏豬(產(chǎn)仔數(shù)低)與霍壽黑豬(產(chǎn)仔數(shù)高)ESR基因PvuII 位點(diǎn)基因頻率分布存在明顯不同,故推測(cè)該基因位點(diǎn)對(duì)霍壽黑豬的產(chǎn)仔性能有一定影響。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,霍壽黑豬、巴克夏豬× 霍壽黑豬ESR基因PvuII 位點(diǎn)均處于中度多態(tài),表明這2 個(gè)豬群該基因位點(diǎn)具有選育潛力?;魤酆谪i是分布在安徽省的優(yōu)良地方豬種,提高霍壽黑豬的產(chǎn)仔數(shù)有助于對(duì)其性能進(jìn)一步開(kāi)發(fā)和利用。巴克夏豬×霍壽黑豬雜交后代除了直接用于商品豬生產(chǎn),也可以將其留種用于二元母豬生產(chǎn)或以此為基礎(chǔ)開(kāi)展雜交育種培育黑豬新品系。因此,后期可以開(kāi)展ESR基因與霍壽黑豬、巴克夏豬×霍壽黑豬產(chǎn)仔數(shù)的相關(guān)性研究,從而提高霍壽黑豬純種繁育及其與巴克夏豬雜交群體的繁殖性能。 本研究對(duì)FSHβ基因多態(tài)性分析表明,巴克夏豬、霍壽黑豬、巴克夏豬×霍壽黑豬3 個(gè)群體中的FSHβ基因多態(tài)性均處于中度多態(tài),且都是AB 和BB 型頻率較高,等位基因B 頻率較高。蘇先敏等[14]研究表明,大白豬、長(zhǎng)白豬和杜洛克豬FSHβ基因均是BB 型占優(yōu)勢(shì),等位基因B 占優(yōu)勢(shì)。張曉東等[15]研究發(fā)現(xiàn),安慶六白豬、定遠(yuǎn)豬、皖南黑豬、皖南花豬4 個(gè)地方豬種FSHβ基因都以等位基因A 為優(yōu)勢(shì)。戴麗荷等[16]研究也表明,除臺(tái)系杜洛克豬和嵊縣花豬外,國(guó)外豬種(大約克豬、長(zhǎng)白豬、美系杜洛克豬)的等位基因B 頻率較高,而地方豬種(金華豬、嘉興黑豬、八眉豬、巴馬香豬)FSHβ基因都是等位基因A 占優(yōu)勢(shì)。本實(shí)驗(yàn)中,巴克夏豬和霍壽黑豬FSHβ基因頻率分布趨勢(shì)相同,均是等位基因B 頻率占優(yōu)勢(shì),巴克夏豬與上述國(guó)外引進(jìn)豬種研究結(jié)果相同,但霍壽黑豬與上述地方豬種研究結(jié)果不同,這可能是豬種遺傳背景差異造成的。趙要風(fēng)等[5]研究發(fā)現(xiàn),豬FSHβ基因插入產(chǎn)生的多態(tài)性,BB 型個(gè)體比AA 型平均每胎多產(chǎn)仔1.5 頭。甘乾福等[17]研究表明,杜洛克豬、長(zhǎng)白豬、大白豬FSHβ基因都以BB 基因型和等位基因B 占優(yōu)勢(shì),但該多態(tài)位點(diǎn)對(duì)初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)母豬的總產(chǎn)仔數(shù)無(wú)顯著影響。因此,F(xiàn)SHβ基因多態(tài)性能否用于霍壽黑豬及巴克夏豬×霍壽黑豬群體繁殖性能的選育,有待進(jìn)一步研究。 綜合上述研究結(jié)果可見(jiàn),調(diào)控豬產(chǎn)仔數(shù)的因素較多,除了ESR基因和FSHβ基因,可能還受其他基因影響[18]。 本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,巴克夏豬ESR基因Pvu II位點(diǎn)只檢測(cè)到AA 型,霍壽黑豬ESR基因檢測(cè)到3 種基因型,B 為優(yōu)勢(shì)等位基因,巴克夏豬× 霍壽黑豬ESR基因檢測(cè)到3 種基因型,A 為優(yōu)勢(shì)等位基因。巴克夏豬、霍壽黑豬、巴克夏豬×霍壽黑豬FSHβ基因均檢測(cè)到3 種基因型,都是B 為優(yōu)勢(shì)等位基因。3 討 論
4 結(jié) 論