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        1株粘質(zhì)沙雷氏菌噬菌體的分離和鑒定

        2021-05-06 08:59:58肖小平陳依玲張仁利
        關(guān)鍵詞:實(shí)驗(yàn)

        肖小平,陳依玲,張仁利

        粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratiamarcescens)是一種腐生菌,在水和土壤中常見,也經(jīng)常污染動(dòng)、植物性食品[1]。粘質(zhì)沙雷氏菌是一種臨床上常見的機(jī)會(huì)病原菌[2],醫(yī)護(hù)人員被污染的手被認(rèn)為是其主要的傳播媒介[3-5]。在機(jī)體免疫力低下的時(shí)候可以引起肺部感染、敗血癥等疾病[1,6-9]。由于臨床上抗生素的濫用和不合理使用,粘質(zhì)沙雷氏菌對多種抗生素具有耐藥,給感染控制和治療帶來挑戰(zhàn)[10-11]。除此之外,很多媒介昆蟲的幼蟲階段生活在水中,粘質(zhì)沙雷氏菌在這些昆蟲的腸道中也大量存在,促進(jìn)疾病傳播[6,12-14]。噬菌體(Phage)是細(xì)菌內(nèi)寄生生物,在自然界也是分布廣泛。噬菌體侵染細(xì)菌后可以快速增殖并裂解宿主菌[15],目前臨床上也有用噬菌體用于治療的嘗試[16]。因此分離針對粘質(zhì)沙雷氏菌的噬菌體對防治粘質(zhì)沙雷氏菌感染具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        1.1.1主要試劑和儀器 LB營養(yǎng)肉湯(028324,廣東環(huán)凱微生物科技有限公司)、瓊脂(028990,廣東環(huán)凱微生物科技有限公司)、上層LB培養(yǎng)基(20 g LB營養(yǎng)肉湯加7 g瓊脂溶于1L蒸餾水)、下層LB培養(yǎng)基(20 g LB營養(yǎng)肉湯加15 g瓊脂溶于1 L蒸餾水)、全溫振蕩培養(yǎng)箱(Shel lab)、II級A2型生物安全柜(Telstar Bio-II-A)、低溫離心機(jī)(Eppendorf centrifage 5417R)、單孔水浴鍋(JuLBO ED-27)。

        1.1.2實(shí)驗(yàn)用菌種 粘質(zhì)沙雷氏菌(Sm01、Baz01、CICC22004、CGMCC1.2818、BNCC107931)、大腸桿菌(TH12641)、金黃色葡萄球菌(780)、綠膿桿菌(Pseudomonassp. SQ-7)均為實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.2噬菌體的分離和培養(yǎng) 取深圳某河邊污水,4 000 r/min離心15 min,用0.22 μm的濾膜過濾除菌,將濾液裝入無菌培養(yǎng)瓶。取4 mL過濾后的上清,加入200 μL的對數(shù)期宿主菌培養(yǎng)液,放置37 ℃,220 r/min培養(yǎng)箱培養(yǎng)3 h,用微孔濾膜過濾得到噬菌體原液。

        1.3噬菌體原液單層平板驗(yàn)證實(shí)驗(yàn) 準(zhǔn)備兩塊1.5% LB瓊脂平板,取宿主菌培養(yǎng)物100 μL滴至平板正中央, 用無菌的涂布棒將菌液均勻地涂開;待其晾干后,取上述噬菌體原液100 μL滴于其中一塊板,用無菌的涂布棒將液體均勻地涂開;待自然晾干后,置于37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)10 h。

        1.4噬菌體雙層平板噬菌斑實(shí)驗(yàn) 將噬菌體原液10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6倍比稀釋,取相應(yīng)的幾個(gè)梯度的噬菌體稀釋液各0.1 mL與宿主菌液0.2 mL充分混勻,鋪雙層瓊脂平板, 37 ℃恒溫培養(yǎng)10 h左右,對每個(gè)瓊脂平皿進(jìn)行噬菌斑計(jì)數(shù)。根據(jù)稀釋的倍數(shù)計(jì)算得到的噬菌體初始濃度即得噬菌體效價(jià)。在雙層瓊脂平板上挑取噬菌斑形狀大小一致,單個(gè)獨(dú)立的噬菌斑,用無菌的接種針穿刺選好的噬菌斑,接入3 mL LB 肉湯培養(yǎng)基,輕微攪拌幾次,加入0.2 mL 含有粘質(zhì)沙雷氏菌菌液,搖勻之后在室溫靜置1 h,37 ℃培養(yǎng)12 h, 4 ℃下12 000×g 離心30 min, 用0.22 μm的濾膜過去除菌,上清液4 ℃保存, 獲得的單一噬菌體。

        1.5噬菌譜實(shí)驗(yàn) 選擇粘質(zhì)沙雷氏菌的5個(gè)菌株和大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、綠膿桿菌進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。準(zhǔn)備1.5% LB瓊脂平板,每組2塊;取100 μL細(xì)菌和100 μL噬菌體混合,鋪雙層瓊脂平板,對照組加入等量的PBS,置于37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)10 h。

        1.6蚊蟲腸道內(nèi)裂解實(shí)驗(yàn) 埃及伊蚊(洛克菲勒株)飼養(yǎng)于低溫照明培養(yǎng)箱,保持26 ℃~28 ℃恒溫、80%濕度,按照文獻(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)方法進(jìn)行飼養(yǎng)[17]。選取羽化5~7 d的雌性埃及伊蚊,首先給蚊蟲飼喂含有抗生素的10%蔗糖溶液(20 U青霉素、20 mg鏈霉素/mL),連續(xù)飼喂3 d,每24 h更換。飼喂3 d后將含有抗生素的蔗糖溶液撤走,在溫度28 ℃,濕度80%的條件下讓其饑餓24 h。然后飼喂帶有粘質(zhì)沙雷氏菌Sm01的蔗糖溶液。連續(xù)飼喂3 d。將上述蚊蟲分成兩組,其中一組只飼喂蔗糖溶液,另外一組飼喂添加了噬菌體SHENZHEN01(107PFU/mL)的蔗糖溶液。18 h后每組挑選4~5只蚊蟲進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。先用75%的乙醇溶液清洗蚊蟲表面3次,無菌PBS清洗1次,接著在體視顯微鏡下解剖蚊蟲的中腸,放入裝有400 μL PBS的無菌的EP管中,用無菌的研磨棒進(jìn)行研磨, 稀釋103~105倍涂板,37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)12 h。

        2 結(jié) 果

        2.1噬菌體平板驗(yàn)證和單一性篩選實(shí)驗(yàn) 在單層平板實(shí)驗(yàn)中,涂有菌液的區(qū)域長出均勻的粘質(zhì)沙雷氏菌,涂有加入噬菌體菌液的區(qū)域沒有菌落出現(xiàn)。由此判斷,該噬菌體能夠裂解粘質(zhì)沙雷氏菌,而且噬菌體原液中含有滴度較高的烈性噬菌體(圖1A)。單一性噬菌體通過雙層平板實(shí)驗(yàn)獲得,噬菌斑經(jīng)過多次穿刺培養(yǎng)后,分離得到單一的噬菌體,該噬菌體邊緣清晰,噬斑直徑約1 mm (培養(yǎng)10 h)(圖1B),我們將該噬菌體命名為SHENZHEN01,保藏在廣東省微生物菌種保藏中心,編號為61140。

        A:粘質(zhì)沙雷氏菌噬菌體單層平板實(shí)驗(yàn);B: 噬菌體單一性篩選。圖1 噬菌體噬斑實(shí)驗(yàn)Fig.1 Single layer plate plaque formation experiment

        2.2噬菌體裂解譜實(shí)驗(yàn) 進(jìn)一步確認(rèn)SHENZHEN01噬菌體的裂解譜。我們首先選擇粘質(zhì)沙雷氏菌的5個(gè)菌株(Sm01、Baz01、CICC22004、CGMCC1.2818、BNCC107931)進(jìn)行雙層平板實(shí)驗(yàn),將噬菌體原液按照1∶1 、1∶10、1∶100、1∶1 000、1∶10 000進(jìn)行稀釋,將噬菌體和粘質(zhì)沙雷氏菌一起通過雙層瓊脂平板驗(yàn)證。結(jié)果發(fā)現(xiàn)SHENZHEN01噬菌體對Sm01和Baz01有明顯的裂解能力,對其他3株粘質(zhì)沙雷氏菌沒有裂解作用(圖2A)。另外,我們驗(yàn)證了SHENZHEN01噬菌體對其他種類細(xì)菌的裂解能力,將噬菌體原液和粘質(zhì)沙雷氏菌(S.marcescens) Sm01、大腸桿菌(E.coli)TH12641、金黃色葡萄球菌(S.aureus)780、綠膿桿菌(P.aeruginosa)SQ-7一起通過雙層瓊脂平板驗(yàn)證。結(jié)果表明,SHENZHEN01噬菌體不能裂解大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、綠膿桿菌(圖2B)。這些結(jié)果表明噬菌體SHENZHEN01的裂解作用有菌株特異性。

        2.3蚊蟲腸道內(nèi)裂解實(shí)驗(yàn) 蚊蟲經(jīng)過消毒處理,取中腸研磨進(jìn)行涂板計(jì)數(shù)。單獨(dú)飼喂抗生素的蚊子(Mock組)中腸涂在LB 固體平板上幾乎不長細(xì)菌,表明抗生素處理是成功的;飼喂了粘質(zhì)沙雷氏菌Sm01的蚊子中腸涂板可見大量細(xì)菌生長,表明粘質(zhì)沙雷氏菌Sm01可以在蚊子中腸成功定植(Serratia marcescens組);而飼喂了噬菌體SHENZHEN01的蚊子中腸涂板幾乎沒有細(xì)菌生長(Serratia marcescens+phage組),表明飼喂的噬菌體在蚊子體內(nèi)也能裂解細(xì)菌(圖3A), 通過平板計(jì)數(shù)顯示飼喂了噬菌體的蚊子腸子中的粘質(zhì)沙雷氏菌明顯減少(圖3B),充分表明這個(gè)噬菌體在蚊蟲體內(nèi)也是有活性的,可以在體內(nèi)裂解宿主細(xì)菌。

        A:5株粘質(zhì)沙雷氏菌與不同稀釋度的噬菌體混合涂雙層瓊脂平板;B:四種細(xì)菌分別和噬菌體混合涂雙層瓊脂平板圖2 噬菌體裂解譜實(shí)驗(yàn)Fig.2 Bacteriophage lysis spectrum

        A: 蚊蟲腸道內(nèi)噬菌體裂解能力;B: 蚊蟲飼喂噬菌體后腸道粘質(zhì)沙雷氏菌計(jì)數(shù)。Mock組為飼喂含有抗生素的10%蔗糖溶液,3 d后,只飼喂蔗糖溶液;Serratia marcescens組飼喂含有抗生素的10%蔗糖溶液,3 d后,飼喂帶有粘質(zhì)沙雷氏菌Sm01的蔗糖溶液,連續(xù)飼喂3 d;Serratia marcescens+phage組為飼喂含有抗生素的10%蔗糖溶液,3 d后,飼喂添加了噬菌體SHENZHEN01(107 PFU/mL)的蔗糖溶液。18 h后每組挑選4~5只蚊蟲進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。圖3 噬菌體在蚊蟲腸道內(nèi)裂解實(shí)驗(yàn)Fig.3 Phage lysis in mosquitoes gut

        3 討 論

        粘質(zhì)沙雷氏菌是臨床上一種重要的條件致病菌[2],屬于革蘭氏陰性菌。在自然界,粘質(zhì)沙雷氏菌在培養(yǎng)的時(shí)候呈現(xiàn)白色、粉紅、玫瑰紅3種顏色,我們采用的粘質(zhì)沙雷氏菌來自于蚊蟲腸道[14],呈現(xiàn)白色。粘質(zhì)沙雷氏菌在臨床上可以引起腦膜炎、肺部感染等疾病[6-9],耐藥性的出現(xiàn)使這種菌很容易發(fā)生院內(nèi)感染,對人的健康產(chǎn)生巨大威脅[10-11]。噬菌體不會(huì)感染人,只感染特異的細(xì)菌,在水產(chǎn)養(yǎng)殖和耐藥菌感染治療方面具有光明的應(yīng)用前景,越來越多的研究尋找特異性的噬菌體來解決細(xì)菌耐藥的治療問題[18]。我們利用埃及伊蚊來源的粘質(zhì)沙雷氏菌為宿主,從污水中分離得到1株噬菌體SHENZHEN01,通過單層平板實(shí)驗(yàn)就可以直接鑒定其裂解能力。由于噬菌體對細(xì)菌的裂解能力具有特異性和高效性。我們對噬菌體SHENZHEN01的裂解譜進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)SHENZHEN01只對粘質(zhì)沙雷氏菌Sm01和Baz01有效,對其他3株粘質(zhì)沙雷氏菌、大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、綠膿桿菌均無裂解作用。

        粘質(zhì)沙雷氏菌不僅可以定植到皮膚表面,也可以定植到腸道[2,14,19]。由于動(dòng)物或者昆蟲體內(nèi)環(huán)境與體外環(huán)境的差異,只有高效而且能夠耐受體內(nèi)環(huán)境的噬菌體才有可能走向應(yīng)用,目前已經(jīng)報(bào)道的痢疾噬菌體可以在體內(nèi)應(yīng)用于相關(guān)疾病的治療[20]。在這里,我們初步研究了噬菌體SHENZHEN01在蚊蟲腸道內(nèi)的裂解效果,結(jié)果表明該噬菌體在蚊蟲腸道里仍然能夠發(fā)揮裂解作用,這些研究為后續(xù)SHENZHEN01的應(yīng)用提供重要的基礎(chǔ)。

        噬菌體由于其感染的特異性,在水產(chǎn)養(yǎng)殖、耐藥菌感染、院內(nèi)特殊病房如燒傷感染等方面具有極大應(yīng)用價(jià)值。噬菌體用于治療也有本身的缺點(diǎn),如噬菌譜窄、產(chǎn)生細(xì)菌耐藥性、給藥方式?jīng)]有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)等[21]。尋找更多的噬菌體,應(yīng)用噬菌體雞尾酒療法是一個(gè)有效的辦法[22]。噬菌體在自然界具有多樣性,種類繁多,國家層面也需要加大對噬菌體治療的基礎(chǔ)研究投入,建成全國性甚至世界性的噬菌體庫,資源共享,噬菌體治療的價(jià)值才能顯現(xiàn)出來。

        利益沖突:無

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