謝曉佩,王 琦,孔新平,吳慶俠*,董海龍,李家奎,曾江勇
(1.西藏農(nóng)牧學(xué)院 動物科學(xué)學(xué)院,西藏 林芝 860000;2.西藏自治區(qū)農(nóng)科院 畜牧獸醫(yī)研究所,西藏 拉薩 850000)
近年來,益生菌(Probiotics)制劑受到了眾多關(guān)注并獲得了廣泛的研制及應(yīng)用,以避免使用抗生素帶來的DNA污染、細(xì)菌耐藥性、甚至超級細(xì)菌等危害。2001年世界衛(wèi)生組織(WHO)和世界糧農(nóng)組織(FAO)將益生菌定義為攝入一定數(shù)量后對宿主健康有益的活菌[1]。益生菌具有改善動物胃腸道平衡、促進動物生長、提高飼料利用率、增進動物健康、改善畜產(chǎn)品品質(zhì)和養(yǎng)殖環(huán)境等作用[2]。由于飼料加工貯藏運輸過程中需要對菌體進行滅活處理,所以提高益生菌制品的穩(wěn)定性很重要。芽孢菌因特殊的結(jié)構(gòu)決定了其特殊的物理性質(zhì),抗逆性強,存活率高,易生長,是無毒、無殘留、無污染的綠色添加劑。枯草芽孢桿菌作為飼料添加劑的兩種芽孢桿菌之一,具有廣闊的發(fā)展前景和巨大的生態(tài)效益和社會效益[3]。牦牛生長環(huán)境特殊,牦牛用益生菌最好分離自健康牦牛[4]。本試驗采集西藏林芝健康牦牛的新鮮糞便,分離并篩選出具備較好耐受性的牦牛源枯草芽孢桿菌,為牦牛專用益生菌制劑的研發(fā)提供參考。
Milli-O○RAdvantage A10○R超純水系統(tǒng)-超純水機,高壓滅菌鍋,恒溫恒濕培養(yǎng)箱(購自上海博訊實業(yè)有限公司),生化培養(yǎng)箱,恒溫水浴鍋,磁力攪拌器(購自金壇市盛藍儀器制造有限公司),超凈工作臺(購自江蘇蘇靜集團),離心機(購自美國Thermo公司),搖床(購自河南兄弟儀器設(shè)備有限公司),顯微鏡(購自日本OLYMPUS公司),梯度PCR儀(購自日本TAKARA公司),電泳儀,凝膠成像系統(tǒng)(購自杭州朗基科學(xué)儀器有限公司)等。
MRS培養(yǎng)基,LB培養(yǎng)基,普通營養(yǎng)肉湯(NB)培養(yǎng)基,麥康凱培養(yǎng)基,各濃度酒精,3%雙氧水,牛肉膏,Kovac氏試劑,瓊脂糖,細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(離心柱型),二甲苯等由西藏農(nóng)牧學(xué)院獸醫(yī)樓提供??焖俑锾m氏染色液,芽孢染色液,細(xì)菌藥敏紙片,糖類生化反應(yīng)管,明膠液化培養(yǎng)基,豬膽鹽,硫化氫微量發(fā)酵管,Simmons枸櫞酸鹽等由杭州濱和微生物試劑有限公司提供。通用引物由武漢擎科創(chuàng)新生物有限公司提供。
適量采取健康牦牛的新鮮糞便,分裝加入到經(jīng)滅菌冷卻后的營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基中,置于搖床中37 ℃預(yù)培養(yǎng)15 min,然后經(jīng)80 ℃水浴處理15 min,每5 min震蕩搖勻一次[5-6],可初步篩選過濾掉部分雜菌。然后于離心機中以4 000 r/min的轉(zhuǎn)速離心15 min,吸取上層液體,接種于營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基,于搖床中37 ℃倒置培養(yǎng)24 h。
用移液槍吸取適量營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基中的培養(yǎng)物,用接種針分別涂布于選擇培養(yǎng)基、MRS瓊脂培養(yǎng)基、LB營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基,進行劃線分離培養(yǎng),于恒溫培養(yǎng)箱37 ℃培養(yǎng)24 h。挑選在培養(yǎng)基上形態(tài)疑似枯草芽孢桿菌的單菌落,涂片,染色,顯微鏡觀察。經(jīng)多次分離培養(yǎng),得出牦牛源枯草芽孢桿菌在選擇培養(yǎng)基上的生長狀況最好。之后從選擇培養(yǎng)基上挑取疑似枯草芽孢桿菌的單個菌落,多次接種于選擇培養(yǎng)基上劃線分離,純化培養(yǎng)。
經(jīng)純化培養(yǎng)和多次涂片染色鏡檢后,挑取選擇培養(yǎng)基上疑似枯草芽孢桿菌的單菌落接種于營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基、選擇液體培養(yǎng)基、MRS液體培養(yǎng)基、LB液體培養(yǎng)基中進行增菌培養(yǎng)。經(jīng)多次培養(yǎng),得出枯草芽孢桿菌在營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基上的生長狀況最好。之后顯微鏡觀察細(xì)菌形態(tài),確定液體培養(yǎng)物為純培養(yǎng)物,不含雜菌。
1.5.1 形態(tài)學(xué)鑒定 做細(xì)菌抹片,分別采用革蘭氏染色、孔雀石綠染色、芽孢染色,置油鏡觀察。
1.5.2 生化鑒定 根據(jù)《獸醫(yī)微生物學(xué)實驗指導(dǎo)》實驗七“細(xì)菌的生化試驗”對分離細(xì)菌進行常規(guī)的生理生化鑒定[7]。(1)糖類分解試驗:用移液槍吸取枯草芽孢桿菌的24 h純液體培養(yǎng)物,分別接種至葡萄糖、麥芽糖、蔗糖、乳糖、半乳糖、甘露糖、甘露醇、蕈糖、菊糖等糖類生化反應(yīng)管中,37 ℃培養(yǎng)24 h。(2) 吲哚試驗:以接種環(huán)將選擇培養(yǎng)基上枯草芽孢桿菌的純培養(yǎng)物接種于滅菌處理后的Dunham氏蛋白胨水溶液中,37 ℃培養(yǎng)48 h,向培養(yǎng)液中加入2~3 mL二甲苯,搖勻,靜置片刻,然后沿試管壁加人2 mL Kovac氏試劑。(3) VP試驗:取枯草芽孢桿菌的24 h純培養(yǎng)物,用無菌接種環(huán)接種于葡萄糖蛋白胨水培養(yǎng)基中,于37 ℃培養(yǎng)48~72 h。取出后在培養(yǎng)液中先加0.6 mLVP試劑甲液,再加乙液0.2 mL,充分混勻。放在試管架上,靜置15 min后培養(yǎng)液呈紅色者為陽性,不變色為陰性。(4)枸櫞酸鹽利用試驗:取適量枯草芽孢桿菌的24 h純液體培養(yǎng)物,用移液槍接種至枸櫞酸鹽生化管中,37 ℃培養(yǎng)48 h。(5)硫化氫試驗:用移液槍吸取適量枯草芽孢桿菌的24 h純液體培養(yǎng)物,接種至硫化氫生化管中,37 ℃培養(yǎng)24 h。(6)過氧化氫酶試驗:用接種環(huán)勾取枯草芽孢桿菌的單一菌落,置于干凈的玻片中央,加一滴3%雙氧水于菌落上,立即觀察有無氣泡出現(xiàn)。(7)脲酶試驗:用移液槍吸取適量枯草芽孢桿菌的24 h純液體培養(yǎng)物,接種至尿素生化管中,37 ℃培養(yǎng)24 h。(8)淀粉水解試驗:將枯草芽孢桿菌劃線接種于3%可溶性淀粉瓊脂平板上,37 ℃培養(yǎng)24 h。取出平板,在菌落處滴加少許碘液,觀察滴加碘液處的培養(yǎng)基顏色是否變藍。(9)硝酸鹽還原試驗:用移液槍吸取適量枯草芽孢桿菌的24 h純液體培養(yǎng)物,接種至硝酸鹽(還原)生化管中,37℃培養(yǎng)24 h。再分別滴加3~5滴VP甲液和VP乙液,若30 s內(nèi)出現(xiàn)紅色即為陽性。若不變紅,加入少量的鋅渣然后變紅的為陰性。(10)明膠液化試驗:取枯草芽孢桿菌的純培養(yǎng)物,用接種針或接種環(huán)穿刺接種于明膠培養(yǎng)基中,22 ℃培養(yǎng)24 h。觀察培養(yǎng)基的液化狀態(tài),觀察時,將其倒置,然后用手指輕輕彈動玻管,觀察是否有液體流動,有則為陽性,無則為陰性。
1.5.3 分子鑒定 (1)提取DNA:按照細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(TIANamp Bacteria DNA Kit)(離心柱型)說明書操作。(2)PCR擴增:枯草芽孢桿菌的16s rRNA 擴增引物采用通用引物,正向引物為27F:5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',反向引物為1492R:5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3'[8]。PCR反應(yīng)體系(50 μL):2×Es Taq MasterMix(Dye), 25 μL;Forward Primer,10 um,2 μL;Reverse Primer,10 um,2 μL;Template DNA,2 μL;雙蒸水(ddH2O),19 μL。以提取的DNA為模板,按以上PCR反應(yīng)體系依次加入模板DNA和其他試劑,置于PCR儀中開始擴增。擴增條件為:預(yù)變性,94 ℃,2 min;變性,94 ℃,30 s;退火,55~65 ℃,30 s;延伸,72 ℃,30 s;25~35個循環(huán);終延伸,72 ℃,2 min[9]。PCR反應(yīng)產(chǎn)物用瓊脂糖凝膠電泳檢測。(3)分子檢測:將以上試驗所得的疑似枯草芽孢桿菌送由生工生物工程(武漢)股份有限公司進行16s rRNA測序。(4)16s rRNA系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建及同源性分析:將所測得的16s rRNA序列用NCBI中的BLAST網(wǎng)站與GenBank數(shù)據(jù)庫進行同源性分析,運用MEGA 4 軟件進行序列同源性分析并制作系統(tǒng)發(fā)育樹[10]。
配置50%濃度的甘油,高溫高壓滅菌后,按50%甘油:菌液為1:1的比例充分混合,先置于-20 ℃冰箱24 h,然后置于-80 ℃冰箱保存[11]。
1.7.1 牦牛源枯草芽孢桿菌的抑菌試驗 對復(fù)蘇的4株牦牛源枯草芽孢桿菌的12 h培養(yǎng)物進行3 500 r/min離心5 min。將指示菌大腸埃希菌(血清型為O111)、金黃色葡萄球菌(ATCC29213)復(fù)蘇,指示菌菌液濃度稀釋至1 cfu/L。分別取已稀釋好的大腸埃希菌(血清型為O111)菌液0.4 mL和金黃色葡萄球菌菌液0.4 mL,用滅菌的三角環(huán)均勻涂布在NA培養(yǎng)基上,用鑷子取出已被滅菌的牛津杯,輕輕放在已涂布過大腸桿菌O111菌液和金黃色葡萄球菌菌液的NA培養(yǎng)基上,每個培養(yǎng)基上放4只牛津杯,注意4只牛津杯的分布位置要均勻。然后將其放入4 ℃冰箱中,30 min后取出。分別吸取0. 25 mL離心后的Yak-KC1,Yak-KC5,Yak-KC6,Yak-KC7的上清液,然后分別注入4個牛津杯中,先將其放入4 ℃冰箱擴散24 h,然后接著將其放入37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,觀察有無抑菌圈產(chǎn)生,用游標(biāo)卡尺精準(zhǔn)測量抑菌圈直徑。該試驗操作3次,取平均值。
1.7.2 人工腸液耐受性試驗 細(xì)菌復(fù)蘇后,離心收集菌體,用營養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基重懸至108CFU/mL,加入1%的胰蛋白酶,37 ℃培養(yǎng)1 h,10倍倍比稀釋,涂布于選擇培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)24 h,采用平板稀釋法計數(shù)[12]。
1.7.3 豬膽鹽試驗 配制含有豬膽鹽溶液的選擇培養(yǎng)基,濃度分別為0.03 g/100 mL,0.10 g/100 mL,0.20 g/100 mL和0.30 g/100 mL。高溫高壓滅菌后,接種枯草芽孢桿菌的純培養(yǎng)物,37 ℃培養(yǎng)24 h,計算其存活率[13]。
1.7.4 高溫耐受性試驗 將枯草芽孢桿菌菌液分別置于85 ℃、90 ℃、95 ℃、100 ℃水浴鍋30 min,以室溫下未水浴加熱的為對照組。重復(fù)3次,計算其存活率[14]。
試驗重復(fù)3次。所得試驗數(shù)據(jù)用SPSS17.0軟件進行單因素方差分析,試驗結(jié)果用“平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差”表示(P<0.05為差異顯著,P<0.01為差異極顯著)。
由圖1可以看出,培養(yǎng)基菌落形態(tài)為圓形或不規(guī)則,表面粗糙[15],呈白色至黃色;革蘭氏染色為陽性;孔雀石綠染色芽孢呈綠色,菌體呈紅色;芽孢染色液染色菌體呈藍色,芽孢不著色。
圖1 枯草芽孢桿菌形態(tài)學(xué)鑒定A. 選擇培養(yǎng)基菌落形態(tài);B. 革蘭氏染色(10×100);C. 孔雀石綠水溶液染色(10×100);D. 芽孢染色(10×100)Fig. 1 Morphological identification of Bacillus SubtilisA.colony morphology of selected medium;B. gram staining(10×100);C. staining with malachite green water solution(10×100);D. spore staining(10×100)
4株分離株生理生化鑒定結(jié)果見表1。由表1可知,葡萄糖、蔗糖、麥芽糖等生化管與試驗菌株反應(yīng)由紫色變?yōu)辄S色,結(jié)果為陽性,過氧化氫酶試驗、淀粉水解試驗、明膠液化試驗等結(jié)果均為陽性,與趙小琪等[16]的《豬源性芽孢桿菌的篩選與鑒定》結(jié)果一致,初步鑒定4株菌均屬于芽孢桿菌屬。芽孢位于菌體中央或次極端,形狀為橢圓形,淀粉水解、吲哚試驗、明膠水解、硝酸鹽還原、產(chǎn)氣、VP試驗、菊糖、甘露醇、蕈糖(海藻糖)、水楊苷等試驗結(jié)果,均符合《臨床微生物學(xué)手冊》,初步鑒定為枯草芽孢桿菌[17]。鑒定結(jié)果見表1。
由圖2可見,基因組 DNA 瓊脂糖凝膠檢測結(jié)果,顯示試驗菌的PCR條帶在1 500 bp左右,與預(yù)期結(jié)果一致[18]。
西藏牦牛源枯草芽孢桿菌分離株16s rRNA系統(tǒng)進化分析見圖3。由圖3可知,10個序列的進化樹的進化距離為0.0020,說明各序列之間的同源性較近,包括10個序列的系統(tǒng)發(fā)育樹顯示1個分支。由圖4可知,Yak-KC1,Yak-KC5,Yak-KC6,Yak-KC7之間的同源性在98.4%~99.5%,試驗菌和數(shù)據(jù)庫的相關(guān)菌株的同源性均高于98.1%,且最高達到99.6%,其中Yak-KC7與標(biāo)準(zhǔn)株枯草芽孢桿菌(GU902972.1)處于較近位置。結(jié)合生理生化結(jié)果,鑒定Yak-KC1,Yak-KC5,Yak-KC6,Yak-KC7均為枯草芽孢桿菌。
表1 4株分離株生理生化鑒定結(jié)果Table 1 Physiological and biochemical identification results of 4 isolates
圖2 基因組DNA瓊脂糖凝膠檢測結(jié)果 Fig. 2 Agarose gel test results of genomic DNA M. DNA Marker DL 2000;1. Yak-KC1,2. Yak-KC5;3. Yak-KC6;4. Yak-KC7
2.4.1 抑菌試驗 4株牦牛源枯草芽孢桿菌對大腸埃希氏菌(血清型為O111)和金黃色葡萄球菌都具有抑菌作用,但抑菌效果不同。對金黃色葡萄球菌,Yak-KC9的抑菌效果最佳,抑菌直徑最大達到26 mm;其次是Yak-KC1,Yak-KC5,Yak-KC7,抑菌直徑分別達到(16±1)mm,(20±2)mm,(20±1)mm。對大腸埃希氏菌(血清型為O111),Yak-KC9的抑菌效果最佳,抑菌直徑達到(25±1)mm;其次是Yak-KC1,Yak-KC5,Yak-KC7,抑菌直徑分別達到(17±1)mm,(22±2)mm,(20±2)mm。Yak-KC9對金黃色葡萄球菌的抑菌效果極顯著高于Yak-KC1(P<0.01),顯著高于Yak-KC7(P<0.05),與Yak-KC5差異不顯著。對大腸埃希氏菌的抑菌效果,Yak-KC9極顯著高于Yak-KC1(P<0.01),顯著高于Yak-KC1和Yak-KC5(P<0.05)。
圖4 西藏牦牛源枯草芽孢桿菌分離株(Yak-KC1,Yak-KC5,Yak-KC6,Yak-KC7)16s rRNA同源性分析Fig. 4 Homology analysis of 16s rRNA isolates of yak-derived Bacillus subtilis from Tibet (yak-kc1, yak-kc5, yak-kc6, yak-kc7)
2.4.2 人工腸液耐受性試驗結(jié)果 由表2可知,4個菌株在人工腸液環(huán)境下存活率達到74.5%以上,均有較好的人工腸液耐受能力(P>0.05)。同比,Yak-KC7的人工腸液耐受性最佳。
表2 4株枯草芽孢桿菌在人工腸液環(huán)境下的存活率Table 2 Survival rate of 4 Bacillus subtilis strains in artificial intestinal fluid environment %
2.4.3 豬膽鹽試驗試驗結(jié)果 由表3可知,隨膽鹽濃度上升,4株枯草芽孢桿菌的存活率下降,同比,豬膽鹽試驗中Yak-KC7的耐受性最佳。
表3 不同濃度豬膽鹽環(huán)境下枯草芽孢桿菌的存活率Table 3 Survival rate of Bacillus subtilis under different concentrations of pig bile salts[19]
2.4.4 高溫耐受試驗結(jié)果 由表4可知,菌株在85 ℃ 條件下存活率明顯高于100 ℃條件下的存活率,并隨著溫度的上升存活率下降明顯[20],同比,Yak-KC7的高溫耐受性最佳。
表4 不同溫度下枯草芽孢桿菌的存活率Table 4 Survival rate of Bacillus subtilis at different temperatures
枯草芽孢桿菌能調(diào)解腸道菌群平衡,改善動物腸道的健康狀況,提高動物的生產(chǎn)性能,提高動物的免疫力,因為枯草芽孢桿菌特有的益生效果,能保護腸道黏膜組織,所以枯草芽孢桿菌是一種重要的腸道益生菌[21]。
本試驗中 ,從形態(tài)學(xué)鑒定及生化試驗結(jié)果均符合《臨床微生物學(xué)手冊》“表26-1芽孢桿菌屬、土壤芽孢桿菌屬和類芽孢桿菌屬部分種的鑒別特征”中對枯草芽孢桿菌的特征鑒定。形狀為橢圓形或稍長,PCR擴增條帶位置在1 500 bp左右,16s rRNA測序同源性比較結(jié)果高達99.6%,鑒定為枯草芽孢桿菌。
枯草芽孢桿菌在動物體內(nèi)發(fā)揮益生性的前提是必需具備良好的腸液、膽鹽耐受性;作為飼料中抗生素的優(yōu)良替代益生菌的前提是,在飼料加工過程中接受高溫滅活處理后仍具備活性的能力[22]。本試驗設(shè)普通培養(yǎng)基為對照組,人工腸液、豬膽鹽、高溫處理培養(yǎng)基為試驗組。研究結(jié)果表明,Yak-KC1、Yak-KC5、Yak-KC6、Yak-KC7在人工腸液環(huán)境下的存活率均超過75%;在豬膽鹽環(huán)境中的存活率隨豬膽鹽濃度的上升而下降,存活率范圍在49.8%~85.8%;在高溫環(huán)境下,隨溫度上升菌株存活率明顯下降,85 ℃的存活率顯著高于100 ℃的存活率,范圍在11.3%~90.6%之間。4個菌株均具有一定的腸液、膽鹽、高溫耐受性,Yak-KC7的耐受性最好。