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        mop1突變減低DNA甲基化水平進而改變了玉米染色體重組頻率

        2021-03-22 03:09:44
        三農(nóng)資訊半月報 2021年3期
        關鍵詞:著絲粒同源突變體

        (2021.2.18 Plant Biotechnology Journal )

        植物中,減數(shù)分裂是細胞分裂的一種特殊類型,在這種分裂過程中,一輪DNA 復制與兩輪染色體分離結(jié)合在一起。在減數(shù)分裂前期,一個關鍵的步驟是同源重組,它促進同源配對并產(chǎn)生交叉。減數(shù)分裂重組是由拓撲異構(gòu)酶樣蛋白 SPO11-1和 SPO11-2以及一些輔助蛋白引起的 DNA 雙鏈斷裂(DSBs)啟動的。DSBs隨后被加工成單鏈DNA尾,介導同源鏈間的入侵,作為同源重組的結(jié)果,形成了交叉和非交叉。減數(shù)分裂重組是產(chǎn)生遺傳多樣性和保證同源染色體精確分離的基本過程。雖然人們對調(diào)節(jié)重組的遺傳因素了解很多,但是對于表觀遺傳因素,比如DNA甲基化,卻知之甚少。

        近期,國際著名雜志PNAS在線發(fā)表了美國邁阿密大學和普渡大學合作的“The mop1 mutation affects the recombination landscape in maize”研究型論文。研究人員發(fā)現(xiàn),在玉米中,mop1突變可以去除CHH甲基化,這種甲基化在染色體臂和著絲粒周圍區(qū)域都緊鄰頻繁重組的位點。

        研究人員為了了解RdDM在減數(shù)分裂重組中的作用,研究了擬南芥同源突變體mop1和lbl1(Leafbladeless1)的重組頻率,并與野生型或雜合同科進行了比較。研究發(fā)現(xiàn),在許多生物體中,減數(shù)分裂重組沿染色體分布不均勻,大多數(shù)周著絲粒區(qū)域的重組受到抑制,因此,將10條玉米染色體分離成具有代表性的染色體臂和著絲點區(qū)域,根據(jù)之前的遺傳標記確定的基因和轉(zhuǎn)座子密度以及基因組每MB的重組頻率。通過比較,有9對在mop1突變體中增加了重組。增長最快的是8號、5號和4號染色體。與此相反,mop1突變體10條玉米染色體著絲點周圍區(qū)域的重組率均勻降低,對10、8、5號染色體的影響較大??偟膩碚f,mop1突變增加了染色體臂的減數(shù)分裂重組頻率,但降低了染色體著絲粒周圍區(qū)域的減數(shù)分裂重組頻率。

        然后,研究人員研究了關于mop1突變體影響整個現(xiàn)象的原因,通過抗體免疫定位發(fā)現(xiàn)在mop1突變體中,不會顯著改變Crossover(交叉)前體的總數(shù),而是導致重組向染色體末端區(qū)域重新分配,更頻繁地出現(xiàn)在染色體臂上。為了解釋在mop1突變體中發(fā)生重組變化的原因,研究人員進行了高通量全基因組亞硫酸鹽定序(WGBS)測定,并觀察到CG和CHG的甲基化在著絲粒區(qū)域比在染色體臂中更高。相反,CHH甲基化在著絲點周圍區(qū)域低于野生型花藥染色體臂。此外,我們觀察到所有10條染色體的mop1突變體的CG和CHG甲基化輕微下降,但CHH甲基化明顯下降。另外,為了研究另外一個轉(zhuǎn)錄后沉默途徑----PTGS也被研究人員進行類相似的研究,發(fā)現(xiàn)PTGS途徑中的重要基因lbl1突變對減數(shù)分裂重組沒有全局性的影響。

        總的來說,我們對影響玉米mop1和lbl1的兩個典型突變體的重組頻率進行了研究。我們證明,mop1突變體對CHH甲基化的去除導致重組向染色體遠端區(qū)域重新分配,遠離著絲粒包膜區(qū)域。盡管mop1突變體對DNA甲基化水平有相對微妙的影響,但是觀察到了對重組頻率的重要影響,提示RdDM在玉米減數(shù)分裂重組中的重要作用。值得注意的是,CHH的丟失可能引起基因附近上游和下游區(qū)域CHG甲基化的進一步丟失,這也可能導致mop1突變體重組頻率的變化。另外我們發(fā)現(xiàn)一些基因中有許多在依賴mop1的側(cè)翼區(qū)域隱藏有CHH島,這表明,這些區(qū)域的基因在RdDM在提供基因和相鄰TE之間的邊界方面所起的作用并沒有根本的不同。

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