李田田, 程重陽, 許俊杰, 張 猛, 孟顥光, 耿月華
(1.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,鄭州 450000; 2.臨沂大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山東臨沂 276005)
河南省地處暖溫帶,是我國的主要平原地帶,地表形態(tài)復(fù)雜多樣,土壤中含有豐富的真菌物種資源,也是我國小麥的主產(chǎn)區(qū)[1]. 在河南小麥病害中以小麥赤霉病和小麥莖基腐病為主,這兩種病害的主要病原菌均為鐮刀菌屬. 鐮刀菌屬(Fusarium Link)因大型分生孢子為鐮刀形而得名,兼寄生或腐生生活,廣泛存在于自然界土壤中. 鐮刀菌屬可引起多種植物病害[2],如禾谷鐮刀菌(F.graminearum)可引起小麥的赤霉病,導(dǎo)致小麥根腐、穗腐[3];木賊鐮刀菌(F.equiseti)可引起火龍果果柄腐爛?。?];藤倉鐮刀菌(F.fujikuroi)可引起水稻惡苗病、百香果果實(shí)和葉部病害、甘蔗梢腐?。?];層出鐮刀菌(F.proliferatum)可引起小麥莖基腐病、水稻和玉米穗部及葉鞘腐爛,也可引起大白菜枯萎?。?-9];腐皮鐮刀菌(F.solani)可引起大豆根腐病、甘薯莖基部根腐?。?0];尖孢鐮刀菌(F.oxysporum)可引起番茄枯萎病、香蕉枯萎病、香蘭草莖腐病、西瓜猝倒病等一系列枯萎和莖基腐?。?1-13]等. 由此可見,鐮刀菌屬是植物病原真菌中的重要類群之一. 目前,由于鐮刀菌屬中不同物種形態(tài)特征差異不大,造成對其分類鑒定一直存在很大爭議[14].
鐮刀菌以產(chǎn)生有毒次生代謝產(chǎn)物而聞名,這些次生代謝產(chǎn)物因?qū)游?、人類和植物?gòu)成很大健康威脅而被認(rèn)為是十大最具經(jīng)濟(jì)和科學(xué)價(jià)值的植物病原屬[15]. 鐮刀菌物種復(fù)合體包括許多“隱形”物種,其中很多不受《藻類、真菌和植物國際命名規(guī)范》的標(biāo)準(zhǔn)限制. 目前,對于小麥相關(guān)鐮刀菌的研究大多集中在小麥病原性或者是內(nèi)生性的鐮刀菌,很少有關(guān)注小麥生長期間土壤中鐮刀菌物種數(shù)量的研究.
本研究調(diào)查了河南省部分地區(qū)小麥田土壤中鐮刀菌的種類,采集河南省部分地區(qū)小麥田土壤樣品進(jìn)行調(diào)查,利用翻譯延伸因子TEF1-α的基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)合形態(tài)學(xué)分析對鐮刀菌種進(jìn)行鑒定. 翻譯延伸因子TEF1-α的基因在鐮刀菌屬中以單拷貝的形式存在,在比較密切相關(guān)的物種之間顯示出高水平的序列多態(tài)性[16]. 因此,可以用該基因標(biāo)記來分析鐮刀菌屬的遺傳進(jìn)化關(guān)系,從而進(jìn)一步探明鐮刀菌與小麥病害之間的關(guān)系,為小麥病害防治提供理論基礎(chǔ).
實(shí)驗(yàn)樣品來自河南省鄭州、焦作、安陽、濟(jì)源、周口等不同地區(qū)小麥種植季節(jié)的小麥田土壤樣品,活菌株與DNA樣品保存于河南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病理學(xué)標(biāo)本室.
采集樣品:首先將土壤表面的枯枝落葉、雜質(zhì)和表層土去除,取2~10 cm處的土壤約100 g,同一地區(qū)多點(diǎn)采集. 將采集的土壤樣品充分混合,取一定量的混合土壤樣品裝入自封袋中,帶回實(shí)驗(yàn)室分離鑒定,也可短期保存在4 ℃冰箱中[17].
稀釋平板法處理樣品:取200 μL的土壤懸浮液在水瓊脂-麥稈培養(yǎng)基涂板,25 ℃培養(yǎng)14 d左右. 將平板放在體視鏡下觀察,挑取單孢至PDA培養(yǎng)基上進(jìn)行培養(yǎng)、純化并保存. 對菌株進(jìn)行顯微形態(tài)特征觀察,用添加康乃馨葉片的PD培養(yǎng)基25 ℃,150 r/min搖培2 d,制作玻片,觀察孢子形態(tài)和產(chǎn)孢結(jié)構(gòu)并拍照[18].
菌株DNA的提?。簩⒕暝赑DA培養(yǎng)基上25 ℃培養(yǎng)3 d,取0.5 cm2大小的菌塊于2 mL離心管中,加一顆滅菌鋼珠,采用改良CTAB法提取菌株的DNA.
TEF1-α基因序列獲?。荷舷掠我镄蛄蠩F-1:ATGGGTAAGGARGACAAGAC和EF-2:GGARGTACCAGTSATCATGTT[19],所用引物由上海生工生物股份有限公司合成提供. 反應(yīng)體系為20 μL 體系,包括ddH2O 7.5 μL,2x Taq Mix 9.5 μL,模板DNA 1 μL(50~100 ng·μL-1),正反向引物各1 μL(10 μmol·L-1). 擴(kuò)增程序?yàn)?4 ℃預(yù)變性3 min,94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán),72 ℃最終延伸7 min,4 ℃終止.
2.1.1 層出鐮刀菌Fusarium proliferatum(Matsush.)Nirenberg ex Gerlach & Nirenberg,Mitt. biol. BundAnst.Ld-u.Forstw.169:38(1982);Cephalosporium proliferatum Matsush.,Microfungi of the Solomon Islands and Papua-New Guinea(Osaka):11(1971) 層出鐮刀菌形態(tài)特征見圖1. 在PDA 上,7 d 直徑達(dá)到4.6 cm,菌落白色,菌絲棉絮狀,背面為白色至淺紫色;菌落氣生菌絲呈棉絮狀,白色,可產(chǎn)生大型分生孢子和小型分生孢子,不產(chǎn)生分生孢子座;大型分生孢子散生于氣生菌絲中,較直,薄壁,足細(xì)胞不明顯,頂細(xì)胞彎曲,通常有3~5個(gè)隔膜,大小27~58 μm×2.5~5.0 μm;產(chǎn)生大量小型分生孢子,串生,有時(shí)呈假頭狀著生,橢圓形或棍棒形,不分隔,大小5.0~15.5 μm×1.5~4.5 μm,不產(chǎn)生厚垣孢子.
圖1 層出鐮刀菌的顯微形態(tài)結(jié)構(gòu)圖Fig.1 The morphology structure of Fusarium proliferatum(HN17064)
2.1.2 腐皮鐮刀菌Fusarium solani(Mart.)Sacc.,Michelia2(No.7):296(1881);Fusisporium solani Mart.1842 腐皮鐮刀菌形態(tài)特征見圖2. 在PDA培養(yǎng)基7 d 直徑達(dá)5 cm,菌落從白色到淺黃色,邊緣顏色較淺. 在后期培養(yǎng)基上會出現(xiàn)許多墨綠色黏狀物質(zhì);菌落背面產(chǎn)生黃色色素,有明顯的輪紋產(chǎn)生;分生孢子從產(chǎn)孢瓶體產(chǎn)生,單瓶梗產(chǎn)孢,瓶梗較長;有3種類型分生孢子,小型分生孢子比較多,卵形或倒梨形、橢圓形,0~1 個(gè)隔膜,多1 個(gè)隔膜,6~9 μm×2.5~3.5 μm;大型分生孢子鐮刀形或者紡錘形,兩端頓,略彎曲,1~3個(gè)隔膜,10~30 μm×2.5~5 μm;厚垣孢子圓形,單生或串生.
2.1.3 富士鐮刀菌Fusarium fujikuroi Nirenberg,Mitt. biol.BundAnst.Ld-u.Forstw.169:32(1976);Alysidium verticillioides(Sacc.)Kuntze[as‘verticilliodes’],Revis.gen.pl.(Leipzig)3(3):442(1898);Fusarium moniliforme J.Sheld.,Nebraska Agric.Exp.Stat.Rep.17:23(1904);Fusarium moniliforme var. fici Caldis,Hilgardia 2:295(1927);Fusarium sacchari var.subglutinans(Wollenw.& Reinking)Nirenberg,Mitt.biol.BundAnst.Ld-u. Forstw.169:53(1976);Fusarium verticillioides(Sacc.)Nirenberg,Mitt.biol.BundAnst.Ld-u.Forstw.169:26(1976);Gibberella fujikuroi(Sawada)S.Ito,in Ito&Kimura,Hokkaido Agric.Exp.Sta.Rep.,No.27:28(1919);Gibberella moniliformis Wineland,J.Agric.Res.,Washington 28:909(1924);Oospora verticillioides Sacc.,Syll.fung.(Abellini)4:14(1886);Fusarium verticillioides(Sacc.)Nirenberg,Mitt.biol.BundAnst.Ld-u.Forstw.169:26(1976) 富士鐮刀菌形態(tài)特征見圖3. 在PDA培養(yǎng)基上,菌落顏色初期白色,微發(fā)黃,氣生菌絲棉絮狀至氈狀;產(chǎn)孢瓶梗多單生;可產(chǎn)生大型分生孢子和小型分生孢子,小型分生孢子呈卵形,無隔膜,大小4~8 μm×1.3~4 μm;大型分生孢子量少,有3~5隔膜,呈鐮刀形,大小26.0~39.5 μm×3.5~7.5 μm;不產(chǎn)生厚垣孢子.
圖2 腐皮鐮刀菌的顯微形態(tài)結(jié)構(gòu)圖Fig.2 The morphology structure of Fusarium solani(HN17038)
圖3 富士鐮刀菌的顯微形態(tài)結(jié)構(gòu)圖Fig.3 The morphology structure of Fusarium fujikuroi(HN17126)
本研究中鐮刀菌屬菌株共24株,3個(gè)種. 通過TEF1-α基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖4),利用引物EF-1/EF-2進(jìn)行PCR擴(kuò)增,測序結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫里面進(jìn)行比對,用MEGA6.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,外群為Saccharomyces cerevisiae(NM001178466.1),與鐮刀菌屬的各個(gè)物種的遺傳距離較遠(yuǎn). 從系統(tǒng)發(fā)育樹上來看,分離出的菌株與層出鐮刀菌(F.Proliferatum)、腐皮鐮刀菌(F.Solani)和富士鐮刀菌(F.Fujikuroi)遺傳距離比較近,所以鑒定HN17018、HN17042、HN17063、HN17064、HN17085、HN17092、HN17138、HN17271、HN17379、HN17548、HN17562、HN17588 和HN17603 為層出鐮刀菌(F. proliferatum),HN17038、HN17531、HN17566、HN17599 和HN17602鑒定為腐皮鐮刀菌(F.solani),HN17001、HN17126和HN17601鑒定為富士鐮刀菌(F.fujikuroi).
圖4 利用最大似然法對鐮刀菌屬的TEF1-α基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.4 Phylogenetic tree constructed from the TEF1-α gene of Fusarium using the maximum likelihood method
鐮刀菌是子囊菌的一個(gè)形式屬,該屬是很多植物的病原菌、內(nèi)生菌或者腐生菌. 以往描述鐮刀菌的所有種類都是在形態(tài)學(xué)和生物學(xué)特征相結(jié)合的基礎(chǔ)上定義的,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的普及和多個(gè)基因片段的測序和評估,系統(tǒng)發(fā)育數(shù)據(jù)在鐮刀菌分類上的作用越來越大. 該屬大多數(shù)物種產(chǎn)生一系列次生代謝物,這些代謝物在化學(xué)形式上差異很大. 鐮刀菌屬從1809年最初的描述到Wollenweber 和Reinking 發(fā)表的Die Fusarien,共描述了1000多個(gè)分類群. Wollenweber和Reinking將所有這些分類群整合成16個(gè)部分,包含65個(gè)種,55個(gè)變種和22 個(gè)型,并形成了一個(gè)分類框架[20]. 在接下來的大約50 年里,分類學(xué)爭論主要集中在現(xiàn)有形態(tài)特征(分生孢子)的相對重要性上. 系統(tǒng)發(fā)育物種的概念都被用于物種描述. 目前的實(shí)踐大多是尋找一個(gè)基因,其序列可以作為診斷工具,最好是對屬內(nèi)的每一個(gè)物種都有效,TEF1-α基因目前是鐮刀菌分類上應(yīng)用最廣泛的基因[16].
通過對焦作、安陽、濟(jì)源、周口、鄭州等地小麥田地土樣的分離培養(yǎng),鑒定出3種鐮刀菌,并通過形態(tài)學(xué)觀察和分子鑒定,鑒定出它們分別是層出鐮刀菌(F.proliferatum)、腐皮鐮刀菌(F.solani)和富士鐮刀菌(F.fujikuroi).本研究得到的3種鐮刀菌均可以作為病原菌侵染植物,引起不同植物發(fā)病. 此次分離得到的3種鐮刀菌屬于土壤絲孢真菌,對開發(fā)新的功能菌株和維護(hù)土壤生態(tài)平衡起著積極的作用,也對探究鐮刀菌對小麥的致病性強(qiáng)弱以及找到寄生性和腐生性鐮刀菌的聯(lián)系具有一定的意義.